Result of FASTA (omim) for pF1KB4697
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4697, 327 aa
  1>>>pF1KB4697 327 - 327 aa - 327 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5332+/-0.000357; mu= 15.2196+/- 0.022
 mean_var=84.0732+/-16.651, 0's: 0 Z-trim(114.7): 33  B-trim: 37 in 3/51
 Lambda= 0.139877
 statistics sampled from 24663 (24695) to 24663 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.29), width:  16
 Scan time:  7.550

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055220 (OMIM: 606404) voltage-dependent calcium ( 327) 2171 447.9 1.3e-125
NP_006069 (OMIM: 602911,614256) voltage-dependent  ( 323) 1271 266.3 6.3e-71
NP_006530 (OMIM: 606403) voltage-dependent calcium ( 315) 1061 223.9 3.5e-58
NP_114101 (OMIM: 606900) voltage-dependent calcium ( 425)  900 191.5 2.7e-48
XP_016884020 (OMIM: 602911,614256) PREDICTED: volt ( 237)  869 185.0 1.3e-46
NP_665810 (OMIM: 606405) voltage-dependent calcium ( 275)  450 100.5 4.1e-21
XP_016882582 (OMIM: 606899) PREDICTED: voltage-dep ( 275)  409 92.3 1.3e-18
NP_114102 (OMIM: 606899) voltage-dependent calcium ( 275)  409 92.3 1.3e-18
XP_005259181 (OMIM: 606899) PREDICTED: voltage-dep ( 305)  246 59.4 1.1e-08
NP_001139808 (OMIM: 611579) transmembrane protein  ( 223)  216 53.3 5.8e-07


>>NP_055220 (OMIM: 606404) voltage-dependent calcium cha  (327 aa)
 initn: 2171 init1: 2171 opt: 2171  Z-score: 2375.8  bits: 447.9 E(85289): 1.3e-125
Smith-Waterman score: 2171; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-327)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MVRCDRGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MVRCDRGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARGD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHFPEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTILLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHFPEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTILLLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 GGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKNHYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKNHYN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 YGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEKNKELRFKTKREFLKASSSSPYARMPSYRYRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEKNKELRFKTKREFLKASSSSPYARMPSYRYRR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 RRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTAASYSPDQEASF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTAASYSPDQEASF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       
pF1KB4 LQVHDFFQQDLKEGFHVSMLNRRTTPV
       :::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LQVHDFFQQDLKEGFHVSMLNRRTTPV
              310       320       

>>NP_006069 (OMIM: 602911,614256) voltage-dependent calc  (323 aa)
 initn: 971 init1: 551 opt: 1271  Z-score: 1394.4  bits: 266.3 E(85289): 6.3e-71
Smith-Waterman score: 1271; 59.3% identity (85.6% similar) in 327 aa overlap (5-327:5-323)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MVRCDRGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARGD
           :::.::::::.:::::::::.::.:::::::: . .:.  ... ..    .. .  
NP_006 MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRG-VCKTKSVSENE--TSKKNEEV
               10        20        30         40          50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHFPEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTILLLL
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NP_006 MTHSGLWRTCCLEGNFKGLCKQIDHFPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFM
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 GGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKNHYN
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NP_006 GGLCIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPS--KSDSKKNSYS
       120       130       140       150       160         170     

              190       200       210        220       230         
pF1KB4 YGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEKNKELRFKTK-REFLKASSSSPYARMPSYRYR
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NP_006 YGWSFYFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASA---ITRIPSYRYR
         180       190       200       210       220          230  

      240       250       260       270       280         290      
pF1KB4 -RRRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTA--ASYSPDQ
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NP_006 YQRRSRSSSRSTEPSHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDR
            240       250       260       270       280       290  

        300       310       320       
pF1KB4 EASFLQVHDFFQQDLKEGFHVSMLNRRTTPV
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NP_006 DNSFLQVHNCIQKENKDSLHSNTANRRTTPV
            300       310       320   

>>NP_006530 (OMIM: 606403) voltage-dependent calcium cha  (315 aa)
 initn: 1222 init1: 529 opt: 1061  Z-score: 1165.5  bits: 223.9 E(85289): 3.5e-58
Smith-Waterman score: 1221; 57.2% identity (81.7% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-315)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MVRCDRGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARGD
       :  ::::.:::.::.:::::::::.::.:::::::: . .:   . .  :.   :. .  
NP_006 MRMCDRGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRG-VCRTKSTS--DNETSRKNEEV
               10        20        30         40          50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHFPEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTILLLL
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NP_006 MTHSGLWRTCCLEGAFRGVCKKIDHFPEDADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFF
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 GGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKNHYN
       ::::..:....  ..:..:::::.::.::::::::::::::.:.:::...   :.:. :.
NP_006 GGLCVAASEFHRSRHNVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPGQR---DSKKSYS
       120       130       140       150       160          170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 YGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEKNKELRFKTKREFLKASSSSPYARMPSYRYRR
       :::::::::.:::.:: :::.::.:::::...:: :.. :::: :.   .::.: :::: 
NP_006 YGWSFYFGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRAKSHSEFLKKST---FARLPPYRYRF
          180       190       200       210       220          230 

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 RRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTAASYSPDQEASF
       :: ::::::::   :::.::.. :   .::  ..::.::::.: :.: ..  . :.. .:
NP_006 RR-RSSSRSTEPR-SRDLSPIS-KGFHTIPSTDISMFTLSRDPSKITMGTLLNSDRDHAF
              240        250        260       270       280        

              310       320       
pF1KB4 LQVHDFFQQDLKEGFHVSMLNRRTTPV
       :: :.   ...::..: .  :::::::
NP_006 LQFHNSTPKEFKESLHNNPANRRTTPV
      290       300       310     

>>NP_114101 (OMIM: 606900) voltage-dependent calcium cha  (425 aa)
 initn: 1246 init1: 868 opt: 900  Z-score: 988.1  bits: 191.5 E(85289): 2.7e-48
Smith-Waterman score: 1262; 63.5% identity (83.4% similar) in 307 aa overlap (4-290:15-320)

                          10        20        30        40         
pF1KB4            MVRCDRGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTM-
                     :..:.:.::::.::::::.::.:::.::::::. : ::: ::::  
NP_114 MESLKRWNEERGLWCEKGVQVLLTTVGAFAAFGLMTIAISTDYWLYTRALICNTTNLTAG
               10        20        30        40        50        60

        50                60        70        80        90         
pF1KB4 -DDGPPPR--------RARGDLTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHFPEDNDYDHDSSEY
        ::: : :        .  : ::::::::.::.::. .: : .:::::::.::::::.::
NP_114 GDDGTPHRGGGGASEKKDPGGLTHSGLWRICCLEGLKRGVCVKINHFPEDTDYDHDSAEY
               70        80        90       100       110       120

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB4 LLRIVRASSVFPILSTILLLLGGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVY
       :::.:::::.:::::.:::::::.:..:.:.:. : ::.:.:::::::::::::::.:::
NP_114 LLRVVRASSIFPILSAILLLLGGVCVAASRVYKSKRNIILGAGILFVAAGLSNIIGVIVY
              130       140       150       160       170       180

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB4 ISSNTGDPSDKRDEDKKNHYNYGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEKNKELRFKTKR
       ::.:.:.:. ::::.:::::.::::::::.::::.::..::::::::::...: . ... 
NP_114 ISANAGEPGPKRDEEKKNHYSYGWSFYFGGLSFILAEVIGVLAVNIYIERSREAHCQSRS
              190       200       210       220       230       240

     220              230          240       250       260         
pF1KB4 EFLKASS-------SSPYA--RMPSYRYR-RRRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAI
       ..:::..       :.: :  :.::::.: ::::::::::.: :::::.:: :    : .
NP_114 DLLKAGGGAGGSGGSGPSAILRLPSYRFRYRRRSRSSSRSSEPSPSRDASPGGPGGPG-F
              250       260       270       280       290          

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB4 PMGELSMYTLSREPLKVTTAASYSPDQEASFLQVHDFFQQDLKEGFHVSMLNRRTTPV  
          ..:::::::.: : ..::                                       
NP_114 ASTDISMYTLSRDPSKGSVAAGLAGAGGGGGGAVGAFGGAAGGAGGGGGGGGGAGAERDR
     300       310       320       330       340       350         

>>XP_016884020 (OMIM: 602911,614256) PREDICTED: voltage-  (237 aa)
 initn: 572 init1: 328 opt: 869  Z-score: 957.8  bits: 185.0 E(85289): 1.3e-46
Smith-Waterman score: 869; 60.5% identity (87.3% similar) in 228 aa overlap (104-327:15-237)

            80        90       100       110       120       130   
pF1KB4 GIYKGHCFRINHFPEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTILLLLGGLCIGAGRIYSR
                                     :::::.:::::.:::..:::::.:...:. 
XP_016                 MGLNWKNQALGCWAVRASSIFPILSVILLFMGGLCIAASEFYKT
                               10        20        30        40    

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB4 KNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKNHYNYGWSFYFGALSFI
       ..::.:::::.::.::::::::::::::.:.::::  ....::: :.:::::::::::::
XP_016 RHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPS--KSDSKKNSYSYGWSFYFGALSFI
           50        60        70          80        90       100  

           200       210        220       230        240       250 
pF1KB4 VAETVGVLAVNIYIEKNKELRFKTK-REFLKASSSSPYARMPSYRYR-RRRSRSSSRSTE
       .:: ::::::...:...:.::  ..  ..:.::.    .:.:::::: .:::::::::::
XP_016 IAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASA---ITRIPSYRYRYQRRSRSSSRSTE
            110       120       130          140       150         

             260       270       280         290       300         
pF1KB4 ASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTA--ASYSPDQEASFLQVHDFFQQ
        : :::.::.:.:  ...:  :.:::::::.:::..:.  :.:. :.. ::::::. .:.
XP_016 PSHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDNSFLQVHNCIQK
     160       170       180       190       200       210         

     310       320       
pF1KB4 DLKEGFHVSMLNRRTTPV
       . :...: .  :::::::
XP_016 ENKDSLHSNTANRRTTPV
     220       230       

>>NP_665810 (OMIM: 606405) voltage-dependent calcium cha  (275 aa)
 initn: 435 init1: 153 opt: 450  Z-score: 499.9  bits: 100.5 E(85289): 4.1e-21
Smith-Waterman score: 450; 30.8% identity (67.3% similar) in 260 aa overlap (1-253:1-251)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MVRCDRGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARGD
       :  : :    ::... :  ...:..::..::::::    . .:. . ....   . .   
NP_665 MSACGRKALTLLSSVFAVCGLGLLGIAVSTDYWLY----LEEGVIVPQNQSTEIKMS---
               10        20        30            40        50      

               70        80         90       100       110         
pF1KB4 LTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINH-FPEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTILLL
         :::::::: . :  .:.:: :.. .: ...   .:.  .:...:... ::..: ....
NP_665 -LHSGLWRVCFLAGEERGRCFTIEYVMPMNTQLTSESTVNVLKMIRSATPFPLVSLFFMF
             60        70        80        90       100       110  

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB4 LGGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKNHY
       .: .  . :.:  ... ... .::.:. .::: ..:...::::  .:   .: .: ....
NP_665 IGFILNNIGHIRPHRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISS-INDEMLNRTKDAETYF
            120       130       140       150        160       170 

     180         190       200        210       220         230    
pF1KB4 NY--GWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEK-NKELRFKTKREFLKA--SSSSPYARMP
       ::  :::: :.:.::...:..::..: ..... . :  .. .  : .   :. : :. . 
NP_665 NYKYGWSFAFAAISFLLTESAGVMSVYLFMKRYTAEDMYRPHPGFYRPRLSNCSDYSGQF
             180       190       200       210       220       230 

          240        250       260       270       280       290   
pF1KB4 SYRYRRRRSRSSSR-STEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTAASYS
        .     :.:: :  :.:::                                        
NP_665 LHPDAWVRGRSPSDISSEASLQMNSNYPALLKCPDYDQMSSSPC                
             240       250       260       270                     

>>XP_016882582 (OMIM: 606899) PREDICTED: voltage-depende  (275 aa)
 initn: 381 init1: 151 opt: 409  Z-score: 455.2  bits: 92.3 E(85289): 1.3e-18
Smith-Waterman score: 409; 31.9% identity (64.2% similar) in 254 aa overlap (1-247:1-244)

                10        20        30        40        50         
pF1KB4 MVRCD-RGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARG
       : .:. :.: .: .. ::  .. :..::..::::::    . .:: : ...    . :  
XP_016 MSHCSSRALTLLSSVFGA-CGLLLVGIAVSTDYWLY----MEEGTVLPQNQTTEVKMA--
               10         20        30            40        50     

      60        70        80          90       100       110       
pF1KB4 DLTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHF--PEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTIL
          :.:::::: . :  ::.:   ..:  :: :    ...: .:. ::... ::..: .:
XP_016 --LHAGLWRVCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVT-ENTENILKTVRTATPFPMVSLFL
              60        70        80         90       100       110

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB4 LLLGGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKN
       .. . .  . :.:  ... ... .::.:. .::: ..:...:::: . .  .. . ... 
XP_016 VFTAFVISNIGHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEVMNRPSSSEQY
              120       130       140       150       160       170

        180       190       200        210       220         230   
pF1KB4 -HYNYGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEK-NKELRFKTKREFLKA--SSSSPYARM
        :: ::::: :.: ::.. : .::..: .. ..  .:  .. .  : .   :. : :. .
XP_016 FHYRYGWSFAFAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRYAEEEMYRPHPAFYRPRLSDCSDYSGQ
              180       190       200       210       220       230

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pF1KB4 PSYRYRRRRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTAASYS
              ::.:: :                                              
XP_016 FLQPEAWRRGRSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC               
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>>NP_114102 (OMIM: 606899) voltage-dependent calcium cha  (275 aa)
 initn: 381 init1: 151 opt: 409  Z-score: 455.2  bits: 92.3 E(85289): 1.3e-18
Smith-Waterman score: 409; 31.9% identity (64.2% similar) in 254 aa overlap (1-247:1-244)

                10        20        30        40        50         
pF1KB4 MVRCD-RGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARG
       : .:. :.: .: .. ::  .. :..::..::::::    . .:: : ...    . :  
NP_114 MSHCSSRALTLLSSVFGA-CGLLLVGIAVSTDYWLY----MEEGTVLPQNQTTEVKMA--
               10         20        30            40        50     

      60        70        80          90       100       110       
pF1KB4 DLTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHF--PEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTIL
          :.:::::: . :  ::.:   ..:  :: :    ...: .:. ::... ::..: .:
NP_114 --LHAGLWRVCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVT-ENTENILKTVRTATPFPMVSLFL
              60        70        80         90       100       110

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB4 LLLGGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKN
       .. . .  . :.:  ... ... .::.:. .::: ..:...:::: . .  .. . ... 
NP_114 VFTAFVISNIGHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEVMNRPSSSEQY
              120       130       140       150       160       170

        180       190       200        210       220         230   
pF1KB4 -HYNYGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEK-NKELRFKTKREFLKA--SSSSPYARM
        :: ::::: :.: ::.. : .::..: .. ..  .:  .. .  : .   :. : :. .
NP_114 FHYRYGWSFAFAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRYAEEEMYRPHPAFYRPRLSDCSDYSGQ
              180       190       200       210       220       230

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pF1KB4 PSYRYRRRRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTAASYS
              ::.:: :                                              
NP_114 FLQPEAWRRGRSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC               
              240       250       260       270                    

>>XP_005259181 (OMIM: 606899) PREDICTED: voltage-depende  (305 aa)
 initn: 205 init1:  81 opt: 246  Z-score: 276.8  bits: 59.4 E(85289): 1.1e-08
Smith-Waterman score: 246; 31.2% identity (63.0% similar) in 173 aa overlap (1-168:1-163)

                10        20        30        40        50         
pF1KB4 MVRCD-RGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARG
       : .:. :.: .: .. :: . . :..::..::::::    . .:: : ...    . :  
XP_005 MSHCSSRALTLLSSVFGACGLL-LVGIAVSTDYWLY----MEEGTVLPQNQTTEVKMA--
               10        20         30            40        50     

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pF1KB4 DLTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHF--PEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTIL
          :.:::::: . :  ::.:   ..:  :: :    ...: .:. ::... ::..: .:
XP_005 --LHAGLWRVCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVT-ENTENILKTVRTATPFPMVSLFL
              60        70        80         90       100       110

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pF1KB4 LLLGGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYIS-SNTGD-PSDKRDEDK
       .. . .  . :.:  ... ... .::.:. .:    . . :. .  . :: ::       
XP_005 VFTAFVISNIGHIRPQRTILAFVSGIFFILSGGRRDVRVPVHQALRGGGDVPSTPGLLPP
              120       130       140       150       160       170

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB4 KNHYNYGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEKNKELRFKTKREFLKASSSSPYARMPS
                                                                   
XP_005 ASQRLLRLLGPVPAARGVAPRPEPLRHLQRRVHPNDAELPSRHQVPGPPAHLHLALLRPA
              180       190       200       210       220       230

>>NP_001139808 (OMIM: 611579) transmembrane protein 114   (223 aa)
 initn: 226 init1:  65 opt: 216  Z-score: 246.0  bits: 53.3 E(85289): 5.8e-07
Smith-Waterman score: 216; 27.7% identity (55.8% similar) in 224 aa overlap (7-220:7-220)

               10        20        30        40        50          
pF1KB4 MVRCDRGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDD--GPPPRRAR
             ::    . .::.. : :.: :::::.:   ...  . :.   .:  :   :   
NP_001 MRVHLGGLAGAAALTGALS-FVLLAAAIGTDFWYIIDTERLERTGPGAQDLLGSINRSQP
               10         20        30        40        50         

       60         70        80         90       100       110      
pF1KB4 GDLT-HSGLWRVCCIEGIYKGHCFRI-NHFPEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTI
         :. ::::::.: ...     :  . : :  .:    .::. :: .  .  ..  :: :
NP_001 EPLSSHSGLWRTCRVQS----PCTPLMNPFRLENVTVSESSRQLLTMHGTFVILLPLSLI
      60        70            80        90       100       110     

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pF1KB4 LLLLGGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRD--ED
       :...::.  :   .  .   ..: .::::. ... .. :: :::. ...   .     :.
NP_001 LMVFGGMT-GFLSFLLQAYLLLLLTGILFLFGAMVTLAGISVYIAYSAAAFREALCLLEE
         120        130       140       150       160       170    

              180       190       200       210       220       230
pF1KB4 K----KNHYNYGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEKNKELRFKTKREFLKASSSSPY
       :    .   ..:::. .: .:::.   .:.     ..   .:: .. ...          
NP_001 KALLDQVDISFGWSLALGWISFIAELLTGA----AFLAAARELSLRRRQDQAI       
          180       190       200           210       220          

              240       250       260       270       280       290
pF1KB4 ARMPSYRYRRRRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTAA




327 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 06:00:30 2016 done: Sat Nov  5 06:00:31 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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