Result of FASTA (ccds) for pF1KB4091
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4091, 480 aa
  1>>>pF1KB4091 480 - 480 aa - 480 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1919+/-0.00138; mu= 14.7640+/- 0.082
 mean_var=177.0357+/-34.595, 0's: 0 Z-trim(106.7): 154  B-trim: 11 in 1/50
 Lambda= 0.096393
 statistics sampled from 8969 (9139) to 8969 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.281), width:  16
 Scan time:  2.980

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5          ( 480) 3439 491.4 9.2e-139
CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5         ( 470) 2910 417.8 1.3e-116
CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15         ( 387) 1334 198.5 1.1e-50
CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15         ( 343) 1228 183.7 2.7e-46
CCDS45345.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15         ( 335)  929 142.1 8.8e-34
CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1              (2224)  924 142.5 4.4e-33
CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX             (2351)  884 137.0 2.2e-31
CCDS44026.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX             ( 216)  625 99.6 3.6e-21
CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10          ( 609)  539 88.2 2.7e-17
CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10          ( 644)  539 88.2 2.8e-17
CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10          ( 906)  539 88.4 3.4e-17
CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10           ( 923)  539 88.4 3.4e-17
CCDS46878.1 DCBLD2 gene_id:131566|Hs108|chr3       ( 775)  478 79.9 1.1e-14


>>CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5               (480 aa)
 initn: 3439 init1: 3439 opt: 3439  Z-score: 2604.7  bits: 491.4 E(32554): 9.2e-139
Smith-Waterman score: 3439; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MKRSVAVWLLVGLSLGVPQFGKGDICDPNPCENGGICLPGLADGSFSCECPDGFTDPNCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MKRSVAVWLLVGLSLGVPQFGKGDICDPNPCENGGICLPGLADGSFSCECPDGFTDPNCS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 SVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCEISEAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCEISEAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 NECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 NECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 RALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 EYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 CRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 CRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 QGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 QGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 VYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
              430       440       450       460       470       480

>>CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5              (470 aa)
 initn: 2897 init1: 2897 opt: 2910  Z-score: 2207.2  bits: 417.8 E(32554): 1.3e-116
Smith-Waterman score: 3348; 97.9% identity (97.9% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-470)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MKRSVAVWLLVGLSLGVPQFGKGDICDPNPCENGGICLPGLADGSFSCECPDGFTDPNCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MKRSVAVWLLVGLSLGVPQFGKGDICDPNPCENGGICLPGLADGSFSCECPDGFTDPNCS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 SVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCEISEAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNI
       :::::          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SVVEV----------GPCTPNPCHNGGTCEISEAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNI
                         70        80        90       100       110

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 NECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTH
              120       130       140       150       160       170

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 RALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSP
              180       190       200       210       220       230

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 EYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQV
              240       250       260       270       280       290

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 CRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDK
              300       310       320       330       340       350

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 QGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWT
              360       370       380       390       400       410

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 VYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
              420       430       440       450       460       470

>>CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15              (387 aa)
 initn: 1343 init1: 851 opt: 1334  Z-score: 1023.7  bits: 198.5 E(32554): 1.1e-50
Smith-Waterman score: 1339; 49.4% identity (72.6% similar) in 401 aa overlap (78-476:27-387)

        50        60        70        80        90        100      
pF1KB4 CECPDGFTDPNCSSVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCE-ISEAYRGDTFIGYVCK
                                     :. ::::::: :: ::.  :::.: .:.: 
CCDS10     MPRPRLLAALCGALLCAPSLLVALDICSKNPCHNGGLCEEISQEVRGDVFPSYTCT
                   10        20        30        40        50      

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB4 CPRGFNGIHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEG
       : .:. : ::.                                       ::  :::.:.
CCDS10 CLKGYAGNHCET--------------------------------------KCVEPLGLEN
         60                                              70        

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB4 GIISNQQITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRV
       : :.:.::.:::.. ...:::.: :  ::::. :..:::: . ::  ::::.:: :.: :
CCDS10 GNIANSQIAASSVRVTFLGLQHWVPELARLNRAGMVNAWTPSSNDDNPWIQVNLLRRMWV
       80        90       100       110       120       130        

        230       240       250        260       270       280     
pF1KB4 TGVITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGKTWA-MYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSF
       :::.::::.:..: ::.:..:.::: .:. .  .. :.  ....:  :: ..:. ..: :
CCDS10 TGVVTQGASRLASHEYLKAFKVAYSLNGHEFDFIHDVNKKHKEFV--GNWNKNAVHVNLF
      140       150       160       170       180         190      

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB4 TPPIKAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLN
         :..::::::::  :.  ::::.:::::::.::..:::.:.. : : :::::: ..: .
CCDS10 ETPVEAQYVRLYPTSCHTACTLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSSYKTWG
        200       210       220       230       240       250      

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB4 MDMFTWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFV
       . .:.:.:  :::::::. :::..:   ..:::::::    .:::::::::..:: ::::
CCDS10 LHLFSWNPSYARLDKQGNFNAWVAGSYGNDQWLQVDLGSSKEVTGIITQGARNFGSVQFV
        260       270       280       290       300       310      

         410       420       430       440       450       460     
pF1KB4 GSYKLAYSNDGEHWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYG
       .:::.:::::. .:: ::: .  ..:.: ::.:: .:.::... :: ::..:::: .:..
CCDS10 ASYKVAYSNDSANWTEYQDPRTGSSKIFPGNWDNHSHKKNLFETPILARYVRILPVAWHN
        320       330       340       350       360       370      

         470       480
pF1KB4 RITLRSELLGCTEEE
       ::.:: :::::    
CCDS10 RIALRLELLGC    
        380           

>>CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15              (343 aa)
 initn: 1224 init1: 851 opt: 1228  Z-score: 944.6  bits: 183.7 E(32554): 2.7e-46
Smith-Waterman score: 1228; 54.2% identity (80.7% similar) in 321 aa overlap (157-476:25-343)

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB4 PCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTHRALFGL
                                     .:  :::.:.: :.:.::.:::.. ...::
CCDS81       MPRPRLLAALCGALLCAPSLLVALECVEPLGLENGNIANSQIAASSVRVTFLGL
                     10        20        30        40        50    

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB4 QKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSPEYIKSY
       :.: :  ::::. :..:::: . ::  ::::.:: :.: ::::.::::.:..: ::.:..
CCDS81 QHWVPELARLNRAGMVNAWTPSSNDDNPWIQVNLLRRMWVTGVVTQGASRLASHEYLKAF
           60        70        80        90       100       110    

        250        260       270       280       290       300     
pF1KB4 KIAYSNDGKTWA-MYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQVCRRHC
       :.::: .:. .  .. :.  ...  : :: ..:. ..: :  :..::::::::  :.  :
CCDS81 KVAYSLNGHEFDFIHDVNKKHKE--FVGNWNKNAVHVNLFETPVEAQYVRLYPTSCHTAC
          120       130         140       150       160       170  

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB4 TLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDKQGKVN
       :::.:::::::.::..:::.:.. : : :::::: ..: .. .:.:.:  :::::::. :
CCDS81 TLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSSYKTWGLHLFSWNPSYARLDKQGNFN
            180       190       200       210       220       230  

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pF1KB4 AWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWTVYQDE
       ::..:   ..:::::::    .:::::::::..:: ::::.:::.:::::. .:: ::: 
CCDS81 AWVAGSYGNDQWLQVDLGSSKEVTGIITQGARNFGSVQFVASYKVAYSNDSANWTEYQDP
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pF1KB4 KQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
       .  ..:.: ::.:: .:.::... :: ::..:::: .:..::.:: :::::    
CCDS81 RTGSSKIFPGNWDNHSHKKNLFETPILARYVRILPVAWHNRIALRLELLGC    
            300       310       320       330       340       

>>CCDS45345.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15              (335 aa)
 initn: 933 init1: 441 opt: 929  Z-score: 720.0  bits: 142.1 E(32554): 8.8e-34
Smith-Waterman score: 1019; 41.4% identity (62.1% similar) in 401 aa overlap (78-476:27-335)

        50        60        70        80        90        100      
pF1KB4 CECPDGFTDPNCSSVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCE-ISEAYRGDTFIGYVCK
                                     :. ::::::: :: ::.  :::.: .:.: 
CCDS45     MPRPRLLAALCGALLCAPSLLVALDICSKNPCHNGGLCEEISQEVRGDVFPSYTCT
                   10        20        30        40        50      

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pF1KB4 CPRGFNGIHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEG
       : .:. : ::.                                       ::  :::.:.
CCDS45 CLKGYAGNHCET--------------------------------------KCVEPLGLEN
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pF1KB4 GIISNQQITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRV
       : :.:.::.:::.. ...:::.: :  ::::. :..:::: . ::  ::::.:: :.: :
CCDS45 GNIANSQIAASSVRVTFLGLQHWVPELARLNRAGMVNAWTPSSNDDNPWIQVNLLRRMWV
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pF1KB4 TGVITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGKTWA-MYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSF
       :::.::::.:..: ::.:..:.::: .:. .  .. :.  ....:  :: ..:. ..: :
CCDS45 TGVVTQGASRLASHEYLKAFKVAYSLNGHEFDFIHDVNKKHKEFV--GNWNKNAVHVNLF
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pF1KB4 TPPIKAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLN
         :..::::::::  :.  ::::.:::::::.::..:::.:.. : : :::::: ..: .
CCDS45 ETPVEAQYVRLYPTSCHTACTLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSSYKTWG
        200       210       220       230       240       250      

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pF1KB4 MDMFTWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFV
       . .:.:.:  :::::::. :::..:   ..::::.                         
CCDS45 LHLFSWNPSYARLDKQGNFNAWVAGSYGNDQWLQI-------------------------
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pF1KB4 GSYKLAYSNDGEHWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYG
                                  : ::.:: .:.::... :: ::..:::: .:..
CCDS45 ---------------------------FPGNWDNHSHKKNLFETPILARYVRILPVAWHN
                                        300       310       320    

         470       480
pF1KB4 RITLRSELLGCTEEE
       ::.:: :::::    
CCDS45 RIALRLELLGC    
          330         

>>CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1                   (2224 aa)
 initn: 934 init1: 420 opt: 924  Z-score: 707.4  bits: 142.5 E(32554): 4.4e-33
Smith-Waterman score: 924; 43.0% identity (68.2% similar) in 337 aa overlap (144-476:1897-2221)

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB4 IHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQ
                                     . :  .: :.:..    :.:.  ::::..:
CCDS12 GSFKTLEMKASKPGWWLLNTEVGENQRAGMQTPFLIMDRDCRM----PMGLSTGIISDSQ
       1870      1880      1890      1900          1910      1920  

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pF1KB4 ITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWT----AAENDRWPWIQINLQRKMRVTGV
       : ::      : :  : :  ::::. :  :::.    :::    ::::...:... .::.
CCDS12 IKASE-----F-LGYWEPRLARLNNGGSYNAWSVEKLAAEFASKPWIQVDMQKEVIITGI
                 1930      1940      1950      1960      1970      

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pF1KB4 ITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPI
        :::::.  .  :   . .:::..  .: ..: ..: . : : :: : .:   :.: :::
CCDS12 QTQGAKHYLKSCYTTEFYVAYSSNQINWQIFKGNSTRNVMYFNGNSDASTIKENQFDPPI
       1980      1990      2000      2010      2020      2030      

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pF1KB4 KAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMF
        :.:.:. :     . :::.:: :::..::: ::::..:.:.. ::::::. ..   :. 
CCDS12 VARYIRISPTRAYNRPTLRLELQGCEVNGCSTPLGMENGKIENKQITASSFKKSWWGDY-
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pF1KB4 TWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYK
        ::: .:::. ::.:::: .  :...:::..:::   :.:.::::: :...  ..: :: 
CCDS12 -WEPFRARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLEIDLLKIKKITAIITQGCKSLSSEMYVKSYT
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pF1KB4 LAYSNDGEHWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITL
       . ::..: .:  :. ...  ::.:.:: ..  : :: ..::: .: ::..: .:   :.:
CCDS12 IHYSEQGVEWKPYRLKSSMVDKIFEGNTNTKGHVKNFFNPPIISRFIRVIPKTWNQSIAL
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     470       480
pF1KB4 RSELLGCTEEE
       : ::.::    
CCDS12 RLELFGCDIY 
         2220     

>>CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX                  (2351 aa)
 initn: 769 init1: 399 opt: 884  Z-score: 677.1  bits: 137.0 E(32554): 2.2e-31
Smith-Waterman score: 884; 44.9% identity (67.4% similar) in 325 aa overlap (157-480:2039-2349)

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB4 PCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTHRALFGL
                                     ::. :::. .: : . :::::.     .: 
CCDS35 PSKAGIWRVECLIGEHLHAGMSTLFLVYSNKCQTPLGMASGHIRDFQITASGQ----YG-
     2010      2020      2030      2040      2050      2060        

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB4 QKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSPEYIKSY
        .: :  :::. .: ::::.. :   . ::...:   : . :. ::::..  :  ::...
CCDS35 -QWAPKLARLHYSGSINAWSTKEP--FSWIKVDLLAPMIIHGIKTQGARQKFSSLYISQF
           2070      2080        2090      2100      2110      2120

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pF1KB4 KIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQVCRRHCT
        : :: ::: :  :. ..:.  ::: ::.:..    : :.::: :.:.::.:     . :
CCDS35 IIMYSLDGKKWQTYRGNSTGTLMVFFGNVDSSGIKHNIFNPPIIARYIRLHPTHYSIRST
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        310       320       330       340        350       360     
pF1KB4 LRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMF-TWEPRKARLDKQGKVN
       :::::.::.:..:: ::::.:  :.: :::::: :     .:: :: : ::::  ::. :
CCDS35 LRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISDAQITASSYFT----NMFATWSPSKARLHLQGRSN
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pF1KB4 AWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWTVYQDE
       ::    :. ..:::::.    ::::. :::.:..   ..:  . .. :.::..::..   
CCDS35 AWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQGVKSLLTSMYVKEFLISSSQDGHQWTLF--F
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pF1KB4 KQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE  
       .. : :::::: :. :   : .:::. .:..:: : ::  .:.:: :.:::  ..  
CCDS35 QNGKVKVFQGNQDSFTPVVNSLDPPLLTRYLRIHPQSWVHQIALRMEVLGCEAQDLY
         2300      2310      2320      2330      2340      2350 

>>CCDS44026.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX                  (216 aa)
 initn: 629 init1: 259 opt: 625  Z-score: 493.5  bits: 99.6 E(32554): 3.6e-21
Smith-Waterman score: 625; 47.2% identity (69.3% similar) in 212 aa overlap (270-480:9-214)

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB4 PEYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQ
                                     :: ::.:..    : :.::: :.:.::.: 
CCDS44                       MRIQDPGKVFFGNVDSSGIKHNIFNPPIIARYIRLHPT
                                     10        20        30        

     300       310       320       330       340        350        
pF1KB4 VCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMF-TWEPRKARL
           . ::::::.::.:..:: ::::.:  :.: :::::: :     .:: :: : ::::
CCDS44 HYSIRSTLRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISDAQITASSYFT----NMFATWSPSKARL
       40        50        60        70        80            90    

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pF1KB4 DKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEH
         ::. :::    :. ..:::::.    ::::. :::.:..   ..:  . .. :.::..
CCDS44 HLQGRSNAWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQGVKSLLTSMYVKEFLISSSQDGHQ
          100       110       120       130       140       150    

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pF1KB4 WTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTE
       ::..   .. : :::::: :. :   : .:::. .:..:: : ::  .:.:: :.:::  
CCDS44 WTLF--FQNGKVKVFQGNQDSFTPVVNSLDPPLLTRYLRIHPQSWVHQIALRMEVLGCEA
            160       170       180       190       200       210  

      480  
pF1KB4 EE  
       ..  
CCDS44 QDLY
           

>>CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10               (609 aa)
 initn: 464 init1: 194 opt: 539  Z-score: 424.1  bits: 88.2 E(32554): 2.7e-17
Smith-Waterman score: 634; 32.1% identity (54.3% similar) in 492 aa overlap (12-479:133-586)

                                  10        20         30        40
pF1KB4                    MKRSVAVWLLVGLSLGVPQFGKGDICDPN-PCENGGICLPG
                                     :.:.    : .:  :. :    .: :  ::
CCDS31 FCGKIAPPPVVSSGPFLFIKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPG
            110       120       130       140       150       160  

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pF1KB4 LADG-SFSCECPDGFTDPNCSSVV-EVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCEISEAYRGD
       . .    : ::      :. : .. :  : . :: :  :       .:  :. ..    :
CCDS31 FPEKYPNSLECTYIVFVPKMSEIILEFESFDLEPDSNPP-------GGMFCRYDRLEIWD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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