Result of FASTA (ccds) for pF1KE0983
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0983, 588 aa
  1>>>pF1KE0983 588 - 588 aa - 588 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5730+/-0.000944; mu= 8.7868+/- 0.055
 mean_var=227.9386+/-54.422, 0's: 0 Z-trim(112.6): 515  B-trim: 546 in 2/51
 Lambda= 0.084950
 statistics sampled from 12697 (13353) to 12697 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.41), width:  16
 Scan time:  3.500

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30999.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1          ( 588) 4014 505.5 7.8e-143
CCDS31000.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1          ( 568) 3825 482.3 7.1e-136
CCDS8978.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12          ( 601) 2323 298.2 1.9e-80
CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12          ( 528) 2321 297.9 2.1e-80
CCDS8530.1 DYRK4 gene_id:8798|Hs108|chr12          ( 520) 1237 165.1   2e-40
CCDS13653.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21        ( 754)  975 133.1 1.2e-30
CCDS13654.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21        ( 529)  972 132.6 1.2e-30
CCDS42926.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21        ( 584)  972 132.6 1.3e-30
CCDS42925.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21        ( 763)  972 132.8 1.6e-30
CCDS12543.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19        ( 629)  951 130.1 8.2e-30
CCDS46075.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19        ( 589)  871 120.3   7e-27
CCDS12544.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19        ( 601)  871 120.3 7.1e-27
CCDS75666.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7         (1171)  627 90.7 1.1e-17
CCDS75667.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7         (1198)  627 90.7 1.1e-17
CCDS868.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1          (1075)  626 90.6 1.1e-17
CCDS867.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1          (1210)  626 90.6 1.2e-17
CCDS41634.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11        (1194)  615 89.3 3.1e-17
CCDS7884.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11         (1215)  615 89.3 3.1e-17
CCDS4488.1 PRPF4B gene_id:8899|Hs108|chr6          (1007)  577 84.5   7e-16
CCDS12555.1 HIPK4 gene_id:147746|Hs108|chr19       ( 616)  572 83.6 7.8e-16
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22        ( 364)  506 75.3 1.5e-13
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360)  482 72.3 1.2e-12
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360)  481 72.2 1.3e-12
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5            ( 346)  473 71.2 2.4e-12
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 307)  471 70.9 2.6e-12
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22        ( 367)  458 69.4 8.9e-12
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12           ( 303)  454 68.8 1.1e-11
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          ( 960)  461 70.3 1.3e-11
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          (1030)  461 70.3 1.3e-11
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 357)  448 68.2 2.1e-11
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 379)  448 68.2 2.1e-11
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9         ( 346)  444 67.7 2.8e-11
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14         ( 276)  440 67.1 3.4e-11
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 583)  445 68.1 3.6e-11
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6             ( 623)  445 68.1 3.8e-11
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 648)  445 68.1 3.9e-11
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14          ( 358)  440 67.2 4.1e-11
CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14            ( 419)  441 67.4 4.1e-11
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7            ( 326)  437 66.8 4.9e-11
CCDS81854.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14           ( 418)  438 67.0 5.3e-11
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6            ( 632)  441 67.6 5.4e-11
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12           ( 298)  434 66.4   6e-11
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2        ( 315)  433 66.3 6.8e-11
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 335)  430 65.9 9.1e-11
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17          ( 305)  429 65.8 9.3e-11


>>CCDS30999.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1               (588 aa)
 initn: 4014 init1: 4014 opt: 4014  Z-score: 2677.8  bits: 505.5 E(32554): 7.8e-143
Smith-Waterman score: 4014; 100.0% identity (100.0% similar) in 588 aa overlap (1-588:1-588)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MGGTARGPGRKDAGPPGAGLPPQQRRLGDGVYDTFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEPPPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MGGTARGPGRKDAGPPGAGLPPQQRRLGDGVYDTFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEPPPPR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 RLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTIQSDGISDSEKCSPTVSQGKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTIQSDGISDSEKCSPTVSQGKS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQALKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGPNAKKRHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQALKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGPNAKKRHG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 VIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQYVALKMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQYVALKMV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 RNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLYELIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLYELIK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 KNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVIDFGSSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVIDFGSSC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 FEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGDQLAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGDQLAC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 MMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRGPPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRGPPGS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 KDWGTALKGCDDYLFIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTIDKVSGKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KDWGTALKGCDDYLFIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTIDKVSGKR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580        
pF1KE0 VVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETNGSIPLCSVLPKLIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETNGSIPLCSVLPKLIS
              550       560       570       580        

>>CCDS31000.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1               (568 aa)
 initn: 3825 init1: 3825 opt: 3825  Z-score: 2552.8  bits: 482.3 E(32554): 7.1e-136
Smith-Waterman score: 3825; 99.5% identity (100.0% similar) in 565 aa overlap (24-588:4-568)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MGGTARGPGRKDAGPPGAGLPPQQRRLGDGVYDTFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEPPPPR
                              ...::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31                     MKWKEKLGDGVYDTFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEPPPPR
                                   10        20        30        40

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 RLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTIQSDGISDSEKCSPTVSQGKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTIQSDGISDSEKCSPTVSQGKS
               50        60        70        80        90       100

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQALKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGPNAKKRHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQALKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGPNAKKRHG
              110       120       130       140       150       160

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 VIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQYVALKMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQYVALKMV
              170       180       190       200       210       220

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 RNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLYELIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLYELIK
              230       240       250       260       270       280

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 KNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVIDFGSSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVIDFGSSC
              290       300       310       320       330       340

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 FEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGDQLAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGDQLAC
              350       360       370       380       390       400

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 MMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRGPPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRGPPGS
              410       420       430       440       450       460

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 KDWGTALKGCDDYLFIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTIDKVSGKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KDWGTALKGCDDYLFIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTIDKVSGKR
              470       480       490       500       510       520

              550       560       570       580        
pF1KE0 VVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETNGSIPLCSVLPKLIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETNGSIPLCSVLPKLIS
              530       540       550       560        

>>CCDS8978.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12               (601 aa)
 initn: 2225 init1: 2174 opt: 2323  Z-score: 1557.7  bits: 298.2 E(32554): 1.9e-80
Smith-Waterman score: 2333; 61.7% identity (83.2% similar) in 564 aa overlap (47-588:40-601)

         20        30        40        50           60        70   
pF1KE0 GAGLPPQQRRLGDGVYDTFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEP---PPPRRLNMTTEQFTGDH
                                     :.:  .:  :   :: :  : ..   :   
CCDS89 APAAYPTGRGGDSAVRQLQASPGLGAGATRSGVGTGPPSPIALPPLRASNAAAAAHTIGG
      10        20        30        40        50        60         

            80                 90        100       110       120   
pF1KE0 TQHFLDG---------GEMKVEQLFQEFGNRKSN-TIQSDGISDSEKCSPTVSQGKSSDC
       ..: ..          :...:.:::.. .:...  : : .:..   : .  :   .. : 
CCDS89 SKHTMNDHLHVGSHAHGQIQVQQLFEDNSNKRTVLTTQPNGLTTVGKTGLPVVPERQLDS
      70        80        90       100       110       120         

           130              140       150       160       170      
pF1KE0 LNTVKSNSSSKAP-------KVVPLTPEQALKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGPNAK
       ..  ...:.:          :..:.:::::.::: ..:::.:. ::..::::::.: :::
CCDS89 IHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPEIYFLGLNAK
     130       140       150       160       170       180         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE0 KRHGVIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQYVA
       ::.:. :::::::::: .:.:..::.::.::::::::.:::::::::...::::..:.::
CCDS89 KRQGMTGGPNNGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKGSFGQVVKAYDHKVHQHVA
     190       200       210       220       230       240         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE0 LKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLY
       ::::::::::::::::::::::::.:::: ..::::::::.::::::.::.:::::..::
CCDS89 LKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENFTFRNHICMTFELLSMNLY
     250       260       270       280       290       300         

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE0 ELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVIDF
       ::::::::::::. ::::::.:::: :::::::.::::::::::::::..:::. :::::
CCDS89 ELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLDALHKNRIIHCDLKPENILLKQQGRSGIKVIDF
     310       320       330       340       350       360         

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE0 GSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGD
       ::::.:.:..:::::::::::::.:::.::. :::.::.:::::::::: ::.:::::::
CCDS89 GSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPIDMWSLGCILAELLTGYPLLPGEDEGD
     370       380       390       400       410       420         

        420       430       440       450       460       470      
pF1KE0 QLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRG
       :::::.::::::  :::. ::::: :..::: ::::.::: .:: ::: :::::::: ::
CCDS89 QLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNFVSSKGYPRYCTVTTLSDGSVVLNGGRSRRGKLRG
     430       440       450       460       470       480         

        480       490       500       510       520       530      
pF1KE0 PPGSKDWGTALKGCDDYLFIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTIDKV
       :: :..::.::::::: ::..:::.::.:::..:.::.:::::::. . .:.:  : .:.
CCDS89 PPESREWGNALKGCDDPLFLDFLKQCLEWDPAVRMTPGQALRHPWLRRRLPKP-PTGEKT
     490       500       510       520       530       540         

        540       550       560         570       580        
pF1KE0 SGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANL--MSETNGSIPLCSVLPKLIS
       : ::... ..:. .. :::::  . :.::..::  :...::.:   .:::::.:
CCDS89 SVKRITESTGAITSI-SKLPPPSSSASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS
      550       560        570       580       590       600 

>>CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12               (528 aa)
 initn: 2249 init1: 2174 opt: 2321  Z-score: 1557.0  bits: 297.9 E(32554): 2.1e-80
Smith-Waterman score: 2321; 63.7% identity (86.0% similar) in 535 aa overlap (64-588:1-528)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE0 TFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEPPPPRRLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFG
                                     :. .  .:.:..     :...:.:::.. .
CCDS89                               MNDHLHVGSHAH-----GQIQVQQLFEDNS
                                             10             20     

            100       110       120       130              140     
pF1KE0 NRKSN-TIQSDGISDSEKCSPTVSQGKSSDCLNTVKSNSSSKAP-------KVVPLTPEQ
       :...  : : .:..   : .  :   .. : ..  ...:.:          :..:.::::
CCDS89 NKRTVLTTQPNGLTTVGKTGLPVVPERQLDSIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQ
          30        40        50        60        70        80     

         150       160       170       180       190       200     
pF1KE0 ALKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGPNAKKRHGVIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHL
       :.::: ..:::.:. ::..::::::.: :::::.:. :::::::::: .:.:..::.::.
CCDS89 AMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPEIYFLGLNAKKRQGMTGGPNNGGYDDDQGSYVQVPHDHV
          90       100       110       120       130       140     

         210       220       230       240       250       260     
pF1KE0 AYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQYVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDK
       ::::::::.:::::::::...::::..:.::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS89 AYRYEVLKVIGKGSFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDK
         150       160       170       180       190       200     

         270       280       290       300       310       320     
pF1KE0 TGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLYELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDA
        ..::::::::.::::::.::.:::::..::::::::::::::. ::::::.:::: :::
CCDS89 DNTMNVIHMLENFTFRNHICMTFELLSMNLYELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLDA
         210       220       230       240       250       260     

         330       340       350       360       370       380     
pF1KE0 LHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVIDFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSR
       ::::.::::::::::::::..:::. :::::::::.:.:..:::::::::::::.:::.:
CCDS89 LHKNRIIHCDLKPENILLKQQGRSGIKVIDFGSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGAR
         270       280       290       300       310       320     

         390       400       410       420       430       440     
pF1KE0 YSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINS
       :. :::.::.:::::::::: ::.::::::::::::.::::::  :::. ::::: :..:
CCDS89 YGMPIDMWSLGCILAELLTGYPLLPGEDEGDQLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNFVSS
         330       340       350       360       370       380     

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE0 KGIPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRGPPGSKDWGTALKGCDDYLFIEFLKRCLHW
       :: ::::.::: .:: ::: :::::::: :::: :..::.::::::: ::..:::.::.:
CCDS89 KGYPRYCTVTTLSDGSVVLNGGRSRRGKLRGPPESREWGNALKGCDDPLFLDFLKQCLEW
         390       400       410       420       430       440     

         510       520       530       540       550       560     
pF1KE0 DPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTIDKVSGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKL
       ::..:.::.:::::::. . .:.:  : .:.: ::... ..:. .. :::::  . :.::
CCDS89 DPAVRMTPGQALRHPWLRRRLPKP-PTGEKTSVKRITESTGAITSI-SKLPPPSSSASKL
         450       460        470       480       490        500   

           570       580        
pF1KE0 KANL--MSETNGSIPLCSVLPKLIS
       ..::  :...::.:   .:::::.:
CCDS89 RTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS
           510       520        

>>CCDS8530.1 DYRK4 gene_id:8798|Hs108|chr12               (520 aa)
 initn: 1395 init1: 1237 opt: 1237  Z-score: 839.1  bits: 165.1 E(32554): 2e-40
Smith-Waterman score: 1402; 52.6% identity (76.8% similar) in 409 aa overlap (128-531:23-414)

       100       110       120       130       140       150       
pF1KE0 NTIQSDGISDSEKCSPTVSQGKSSDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQALKQYKHHLTAY
                                     :.. .:   . : ::  .::: .:..:. :
CCDS85         MPASELKASEIPFHPSIKTQDPKAEEKSPKKQKVTLTAAEALKLFKNQLSPY
                       10        20        30        40        50  

       160       170       180       190       200       210       
pF1KE0 EKLEIINYPEIYFVGPNAKKRHGVIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGK
       :. ::..: :..:.: .:::   .    .. ..::  : :..: .::.:::::::. :::
CCDS85 EQSEILGYAELWFLGLEAKKLDTAPEKFSKTSFDDEHGFYLKVLHDHIAYRYEVLETIGK
             60        70        80        90       100       110  

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE0 GSFGQVARVYDHKLRQYVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLES
       :::::::.  :::  . ::::..::.::::.::  :..::: :.:.:: ...::.:: . 
CCDS85 GSFGQVAKCLDHKNNELVALKIIRNKKRFHQQALMELKILEALRKKDKDNTYNVVHMKDF
            120       130       140       150       160       170  

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE0 FTFRNHVCMAFELLSIDLYELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLK
       : :::: :..::::.:.::::.:.:.:::::...::.:. :.:. :. :  .::::::::
CCDS85 FYFRNHFCITFELLGINLYELMKNNNFQGFSLSIVRRFTLSVLKCLQMLSVEKIIHCDLK
            180       190       200       210       220       230  

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE0 PENILLKHHGRSSTKVIDFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGC
       ::::.: ..:..:.:::::::::.:.::.::::::::::.::.:::  :.. ::.::.::
CCDS85 PENIVLYQKGQASVKVIDFGSSCYEHQKVYTYIQSRFYRSPEVILGHPYDVAIDMWSLGC
            240       250       260       270       280       290  

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE0 ILAELLTGQPLFPGEDEGDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYCSVTTQ
       : ::: :: ::::::.: .::::.::.::.::  ... ..: . :..:::.:.  ..:..
CCDS85 ITAELYTGYPLFPGENEVEQLACIMEVLGLPPAGFIQTASRRQTFFDSKGFPK--NITNN
            300       310       320       330       340         350

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE0 ADGRVVLVGGRSRRGKKRGPPGSKDWGTALKGCDDYLFIEFLKRCLHWDPSARLTPAQAL
                    ::::: :  :::   .::  :   :..::.::: :.:: :.:: :::
CCDS85 -------------RGKKRYPD-SKDLTMVLKTYDTS-FLDFLRRCLVWEPSLRMTPDQAL
                            360       370        380       390     

       520            530       540       550       560       570  
pF1KE0 RHPWISKSV-----PRPLTTIDKVSGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSE
       .: :: .:      ::: :                                         
CCDS85 KHAWIHQSRNLKPQPRPQTLRKSNSFFPSETRKDKVQGCHHSSRKADEITKETTEKTKDS
         400       410       420       430       440       450     

>>CCDS13653.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21             (754 aa)
 initn: 925 init1: 470 opt: 975  Z-score: 663.7  bits: 133.1 E(32554): 1.2e-30
Smith-Waterman score: 975; 37.4% identity (66.7% similar) in 444 aa overlap (105-537:48-485)

           80        90       100       110       120       130    
pF1KE0 QHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTIQSDGISDSEKCSPTVSQGKSSDCLNTVKSNSSSK
                                     :::..  . . :.  ..   :  .  .. .
CCDS13 APSFSFHAAGLQMAGQMPHSHQYSDRRQPNISDQQVSALSYSDQIQQPLTNQRRMPQTFR
        20        30        40        50        60        70       

          140         150       160       170       180       190  
pF1KE0 APKVVPLTPEQA--LKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGPNAKKRHGVIGGPNNGGYDD
        : ..::   ..  .: :::   .:   .   . .      . ::.. :     : ::::
CCDS13 DPATAPLRKLSVDLIKTYKHINEVYYAKKKRRHQQGQGDDSSHKKERKVY----NDGYDD
        80        90       100       110       120           130   

            200       210       220       230       240       250  
pF1KE0 ADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQYVALKMVRNEKRFHRQAAE
        .  ::    ..   :::. ..:::::::::...::.  ...::.:...:.: :  ::  
CCDS13 DNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQI
           140       150       160       170       180       190   

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pF1KE0 EIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLYELIKKNKFQGFSVQLV
       :.:.:: ..:.:   .. ..:. . : ::::.:..::.:: .::.:.....:.: :..:.
CCDS13 EVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLT
           200       210       220       230       240       250   

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pF1KE0 RKFAQSILQSLD--ALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVIDFGSSCFEYQKLYTYI
       :::::..  .:   :  . .::::::::::::: .  ::. :..::::::   :..: ::
CCDS13 RKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYI
           260       270       280       290       300       310   

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pF1KE0 QSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGDQLACMMELLGMPPP
       ::::::.::..::  :.  ::.::.::::.:. ::.::: : .: ::.  ..:.::.:: 
CCDS13 QSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPA
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pF1KE0 KLLEQSKRAKYFINSKGIPRYC-SVTTQADGRVVLVGGRSRR-----GKKRGPPGSKDWG
       ..:.:. .:. :...  .:    ..    ::.       .:.     : . : ::..  :
CCDS13 HILDQAPKARKFFEK--LPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAG
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pF1KE0 TALKGCDDYL-FIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTIDKVSGKRVVN
        . .   ::: : ... : : .::..:. :  ::.: ...:.. .  .: ..::      
CCDS13 ESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKKTADEGTNTSNSVSTSPAME
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pF1KE0 PASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETNGSIPLCSVLPKLIS               
                                                                   
CCDS13 QSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDPTHQHRHSGGHFTAAVQAMDCETHSPQVRQ
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>>CCDS13654.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21             (529 aa)
 initn: 980 init1: 470 opt: 972  Z-score: 663.5  bits: 132.6 E(32554): 1.2e-30
Smith-Waterman score: 972; 36.4% identity (66.0% similar) in 473 aa overlap (90-537:38-494)

      60        70        80        90       100          110      
pF1KE0 RRLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTI---QSDGISDSEKCS-PTV
                                     .....:.. .:   : ...: :.. . : .
CCDS13 SACKPSSVRLAPSFSFHAAGLQMAGQMPHSHQYSDRRQPNISDQQVSALSYSDQIQQPLT
        10        20        30        40        50        60       

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pF1KE0 SQGKSSDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQA--LKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGP
       .:   .  .   .  .. . : ..::   ..  .: :::          ::  :.:..  
CCDS13 NQVMPDIVMLQRRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKH----------IN--EVYYA--
        70        80        90       100                   110     

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pF1KE0 NAKKRHGVIGGPN----------NGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQV
       . :.::    : .          : :::: .  ::    ..   :::. ..:::::::::
CCDS13 KKKRRHQQGQGDDSSHKKERKVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQV
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pF1KE0 ARVYDHKLRQYVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNH
       ...::.  ...::.:...:.: :  ::  :.:.:: ..:.:   .. ..:. . : ::::
CCDS13 VKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNH
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pF1KE0 VCMAFELLSIDLYELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLD--ALHKNKIIHCDLKPENI
       .:..::.:: .::.:.....:.: :..:.:::::..  .:   :  . .:::::::::::
CCDS13 LCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENI
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pF1KE0 LLKHHGRSSTKVIDFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAE
       :: .  ::. :..::::::   :..: ::::::::.::..::  :.  ::.::.::::.:
CCDS13 LLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVE
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pF1KE0 LLTGQPLFPGEDEGDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYC-SVTTQADG
       . ::.::: : .: ::.  ..:.::.:: ..:.:. .:. :...  .:    ..    ::
CCDS13 MHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEK--LPDGTWNLKKTKDG
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pF1KE0 RVVLVGGRSRR-----GKKRGPPGSKDWGTALKGCDDYL-FIEFLKRCLHWDPSARLTPA
       .       .:.     : . : ::..  : . .   ::: : ... : : .::..:. : 
CCDS13 KREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPY
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pF1KE0 QALRHPWISKSVPRPLTTIDKVSGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETN
        ::.: ...:.. .  .: ..::                                     
CCDS13 YALQHSFFKKTADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGASAISCSSWLVRH  
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>>CCDS42926.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21             (584 aa)
 initn: 925 init1: 470 opt: 972  Z-score: 663.0  bits: 132.6 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 972; 36.4% identity (66.0% similar) in 473 aa overlap (90-537:38-494)

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pF1KE0 RRLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTI---QSDGISDSEKCS-PTV
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CCDS42 SACKPSSVRLAPSFSFHAAGLQMAGQMPHSHQYSDRRQPNISDQQVSALSYSDQIQQPLT
        10        20        30        40        50        60       

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pF1KE0 SQGKSSDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQA--LKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGP
       .:   .  .   .  .. . : ..::   ..  .: :::          ::  :.:..  
CCDS42 NQVMPDIVMLQRRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKH----------IN--EVYYA--
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pF1KE0 NAKKRHGVIGGPN----------NGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQV
       . :.::    : .          : :::: .  ::    ..   :::. ..:::::::::
CCDS42 KKKRRHQQGQGDDSSHKKERKVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQV
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pF1KE0 ARVYDHKLRQYVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNH
       ...::.  ...::.:...:.: :  ::  :.:.:: ..:.:   .. ..:. . : ::::
CCDS42 VKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNH
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pF1KE0 VCMAFELLSIDLYELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLD--ALHKNKIIHCDLKPENI
       .:..::.:: .::.:.....:.: :..:.:::::..  .:   :  . .:::::::::::
CCDS42 LCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENI
           240       250       260       270       280       290   

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pF1KE0 LLKHHGRSSTKVIDFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAE
       :: .  ::. :..::::::   :..: ::::::::.::..::  :.  ::.::.::::.:
CCDS42 LLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVE
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pF1KE0 LLTGQPLFPGEDEGDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYC-SVTTQADG
       . ::.::: : .: ::.  ..:.::.:: ..:.:. .:. :...  .:    ..    ::
CCDS42 MHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEK--LPDGTWNLKKTKDG
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pF1KE0 RVVLVGGRSRR-----GKKRGPPGSKDWGTALKGCDDYL-FIEFLKRCLHWDPSARLTPA
       .       .:.     : . : ::..  : . .   ::: : ... : : .::..:. : 
CCDS42 KREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPY
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pF1KE0 QALRHPWISKSVPRPLTTIDKVSGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETN
        ::.: ...:.. .  .: ..::                                     
CCDS42 YALQHSFFKKTADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDP
             480       490       500       510       520       530 

>>CCDS42925.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21             (763 aa)
 initn: 925 init1: 470 opt: 972  Z-score: 661.6  bits: 132.8 E(32554): 1.6e-30
Smith-Waterman score: 972; 36.4% identity (66.0% similar) in 473 aa overlap (90-537:38-494)

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pF1KE0 RRLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTI---QSDGISDSEKCS-PTV
                                     .....:.. .:   : ...: :.. . : .
CCDS42 SACKPSSVRLAPSFSFHAAGLQMAGQMPHSHQYSDRRQPNISDQQVSALSYSDQIQQPLT
        10        20        30        40        50        60       

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pF1KE0 SQGKSSDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQA--LKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGP
       .:   .  .   .  .. . : ..::   ..  .: :::          ::  :.:..  
CCDS42 NQVMPDIVMLQRRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKH----------IN--EVYYA--
        70        80        90       100                   110     

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pF1KE0 NAKKRHGVIGGPN----------NGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQV
       . :.::    : .          : :::: .  ::    ..   :::. ..:::::::::
CCDS42 KKKRRHQQGQGDDSSHKKERKVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQV
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pF1KE0 ARVYDHKLRQYVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNH
       ...::.  ...::.:...:.: :  ::  :.:.:: ..:.:   .. ..:. . : ::::
CCDS42 VKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNH
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pF1KE0 VCMAFELLSIDLYELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLD--ALHKNKIIHCDLKPENI
       .:..::.:: .::.:.....:.: :..:.:::::..  .:   :  . .:::::::::::
CCDS42 LCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENI
           240       250       260       270       280       290   

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pF1KE0 LLKHHGRSSTKVIDFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAE
       :: .  ::. :..::::::   :..: ::::::::.::..::  :.  ::.::.::::.:
CCDS42 LLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVE
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KE0 LLTGQPLFPGEDEGDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYC-SVTTQADG
       . ::.::: : .: ::.  ..:.::.:: ..:.:. .:. :...  .:    ..    ::
CCDS42 MHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEK--LPDGTWNLKKTKDG
           360       370       380       390         400       410 

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pF1KE0 RVVLVGGRSRR-----GKKRGPPGSKDWGTALKGCDDYL-FIEFLKRCLHWDPSARLTPA
       .       .:.     : . : ::..  : . .   ::: : ... : : .::..:. : 
CCDS42 KREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPY
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pF1KE0 QALRHPWISKSVPRPLTTIDKVSGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETN
        ::.: ...:.. .  .: ..::                                     
CCDS42 YALQHSFFKKTADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDP
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CCDS12 LPDVRLLPRRLPLAFRDATSAPLRKLSVDLIKTYKHINEVYYAKKKRRAQQAPPQDSSNK
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       :.. :.    : :::: .  ::    ..   :::. ..:::::::::...:::. .. ::
CCDS12 KEKKVL----NHGYDDDNHDYIVRSGERWLERYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDHQTQELVA
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pF1KE0 LKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLY
       .:...:.: :  ::  :.:.:: ....:   .. ..:. . : ::::.:..::::: .::
CCDS12 IKIIKNKKAFLNQAQIELRLLELMNQHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFELLSYNLY
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pF1KE0 ELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLD--ALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVI
       .:.....:.: :..:.::.::..  .:   :  . .::::::::::::: .  ::. :..
CCDS12 DLLRNTHFRGVSLNLTRKLAQQLCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIV
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pF1KE0 DFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDE
       ::::::   :..: ::::::::.::..::. :.  ::.::.::::.:. ::.::: : .:
CCDS12 DFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGTPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGSNE
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pF1KE0 GDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRA-KYFINSKGIPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRR--
        ::.  ..:.::.::  .:.:. .: :::    :     ..    . :    :  .::  
CCDS12 VDQMNRIVEVLGIPPAAMLDQAPKARKYFERLPGGGW--TLRRTKELRKDYQGPGTRRLQ
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CCDS12 EVLGVQTGGPGGRRAGEPGHSPADYLRFQDLVLRMLEYEPAARISPLGALQHGFFRRTAD
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CCDS12 EATNTGPAGSSASTSPAPLDTCPSSSTASSISSSGGSSGSSSDNRTYRYSNRYCGGPGPP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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