seq1 = pF1KE0930.tfa, 1155 bp seq2 = pF1KE0930/gi568815595r_141852516.tfa (gi568815595r:141852516_142095142), 242627 bp >pF1KE0930 1155 >gi568815595r:141852516_142095142 (Chr3) (complement) 1-125 (100000-100123) 99% -> 126-173 (101558-101605) 100% -> 174-336 (116461-116623) 100% -> 337-480 (120952-121095) 100% -> 481-549 (125002-125070) 100% -> 550-701 (131180-131331) 100% -> 702-868 (135303-135469) 100% -> 869-974 (142127-142232) 100% -> 975-1155 (142447-142627) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGATTATAAGCACACCACAGAGACTAACCAGTTCAGGAAGTGTTCTGAT |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100000 A GATTATAAGCACACCACAGAGACTAACCAGTTCAGGAAGTGTTCTGAT 50 . : . : . : . : . : 51 TGGGAGTCCATATACCCCTGCACCAGCAATGGTTACTCAGACACACATAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100049 TGGGAGTCCATATACCCCTGCACCAGCAATGGTTACTCAGACACACATAG 100 . : . : . : . : . : 101 CAGAAGCTACTGGCTGGGTCCCTGG TGATAGAAAACGGGCT |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 100099 CAGAAGCTACTGGCTGGGTCCCTGGGTA...TAGTGATAGAAAACGGGCT 150 . : . : . : . : . : 142 AGAAAATTTATAGACTCTGATTTTTCAGAAAG TAAACGAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 101574 AGAAAATTTATAGACTCTGATTTTTCAGAAAGGTG...TAGTAAACGAAG 200 . : . : . : . : . : 183 CAAAAAAGGAGATAAAAATGGGAAAGGCTTGAGACACTTTTCAATGAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116470 CAAAAAAGGAGATAAAAATGGGAAAGGCTTGAGACACTTTTCAATGAAAG 250 . : . : . : . : . : 233 TGTGTGAGAAAGTTCAACGAAAAGGTACAACATCGTACAATGAAGTCGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116520 TGTGTGAGAAAGTTCAACGAAAAGGTACAACATCGTACAATGAAGTCGCT 300 . : . : . : . : . : 283 GATGAGCTGGTGTCAGAGTTCACCAATTCAAATAACCATTTGGCTGCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116570 GATGAGCTGGTGTCAGAGTTCACCAATTCAAATAACCATTTGGCTGCTGA 350 . : . : . : . : . : 333 TTCG GCTTATGATCAGAAGAACATTAGGCGAAGAGTTTATG ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116620 TTCGGTA...CAGGCTTATGATCAGAAGAACATTAGGCGAAGAGTTTATG 400 . : . : . : . : . : 374 ATGCTTTAAATGTGCTAATGGCAATGAACATAATTTCAAAGGAAAAAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120989 ATGCTTTAAATGTGCTAATGGCAATGAACATAATTTCAAAGGAAAAAAAA 450 . : . : . : . : . : 424 GAAATCAAGTGGATTGGCCTGCCTACCAATTCTGCTCAGGAATGTCAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121039 GAAATCAAGTGGATTGGCCTGCCTACCAATTCTGCTCAGGAATGTCAGAA 500 . : . : . : . : . : 474 TCTGGAG ATAGAGAAGCAGAGGCGGATAGAACGGATAAAGC |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 121089 TCTGGAGGTA...AAGATAGAGAAGCAGAGGCGGATAGAACGGATAAAGC 550 . : . : . : . : . : 515 AGAAGCGGGCCCAGCTGCAAGAACTTCTCCTACAG CAAATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 125036 AGAAGCGGGCCCAGCTGCAAGAACTTCTCCTACAGGTA...CAGCAAATC 600 . : . : . : . : . : 556 GCTTTCAAAAACCTGGTACAGAGAAATCGACAAAATGAGCAGCAAAACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131186 GCTTTCAAAAACCTGGTACAGAGAAATCGACAAAATGAGCAGCAAAACCA 650 . : . : . : . : . : 606 GGGCCCGCCGGCTCTGAACTCTACCATTCAGCTGCCATTCATAATCATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131236 GGGCCCGCCGGCTCTGAACTCTACCATTCAGCTGCCATTCATAATCATCA 700 . : . : . : . : . : 656 ATACAAGCAGAAAAACAGTCATAGATTGCAGCATCTCCAGTGACAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 131286 ATACAAGCAGAAAAACAGTCATAGATTGCAGCATCTCCAGTGACAAGTG. 750 . : . : . : . : . : 702 GTTTGAGTATCTTTTCAATTTTGACAACACCTTTGAGATCCATGA ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131336 ..CAGGTTTGAGTATCTTTTCAATTTTGACAACACCTTTGAGATCCATGA 800 . : . : . : . : . : 747 TGACATAGAAGTACTAAAGCGGATGGGAATGTCGTTTGGCCTGGAGTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135348 TGACATAGAAGTACTAAAGCGGATGGGAATGTCGTTTGGCCTGGAGTCAG 850 . : . : . : . : . : 797 GCAAATGCTCTCTGGAGGATCTGAAACTTGCGAAATCCCTGGTGCCAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135398 GCAAATGCTCTCTGGAGGATCTGAAACTTGCGAAATCCCTGGTGCCAAAG 900 . : . : . : . : . : 847 GCTTTAGAAGGTTATATCACAG ATATCTCCACAGGACCTTC ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 135448 GCTTTAGAAGGTTATATCACAGGTA...TAGATATCTCCACAGGACCTTC 950 . : . : . : . : . : 888 TTGGTTAAATCAGGGACTACTTCTGAACTCTACCCAATCAGTTTCAAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 142146 TTGGTTAAATCAGGGACTACTTCTGAACTCTACCCAATCAGTTTCAAATT 1000 . : . : . : . : . : 938 TAGACCTGACCACTGGTGCCACCTTACCCCAGTCAAG TGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 142196 TAGACCTGACCACTGGTGCCACCTTACCCCAGTCAAGGTA...TAGTGTA 1050 . : . : . : . : . : 979 AACCAAGGGTTATGCTTGGATGCAGAAGTGGCCTTAGCAACTGGGCAGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 142451 AACCAAGGGTTATGCTTGGATGCAGAAGTGGCCTTAGCAACTGGGCAGTT 1100 . : . : . : . : . : 1029 CCTGGCCCCAAACAGTCACCAGTCCAGCAGTGCGGCCTCTCACTGCTCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 142501 CCTGGCCCCAAACAGTCACCAGTCCAGCAGTGCGGCCTCTCACTGCTCCG 1150 . : . : . : . : . : 1079 AGTCCCGAGGCGAGACCCCCTGTTCGTTCAATGATGAAGATGAGGAAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 142551 AGTCCCGAGGCGAGACCCCCTGTTCGTTCAATGATGAAGATGAGGAAGAT 1200 . : . : . 1129 GATGAGGAGGATTCCTCCTCCCCAGAA ||||||||||||||||||||||||||| 142601 GATGAGGAGGATTCCTCCTCCCCAGAA