Result of FASTA (ccds) for pF1KB6634
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6634, 440 aa
  1>>>pF1KB6634 440 - 440 aa - 440 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5222+/-0.000705; mu= 14.0904+/- 0.043
 mean_var=178.1286+/-57.971, 0's: 0 Z-trim(114.6): 190  B-trim: 1685 in 2/49
 Lambda= 0.096096
 statistics sampled from 14712 (15146) to 14712 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.465), width:  16
 Scan time:  3.690

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440) 2977 424.8 8.5e-119
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 432)  608 96.3 6.2e-20
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 445)  608 96.3 6.4e-20
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 479)  608 96.4 6.7e-20
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  600 95.2 1.3e-19
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  600 95.2 1.4e-19
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  600 95.3 1.4e-19
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  600 95.3 1.4e-19
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  581 92.6 8.1e-19
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7           ( 357)  565 90.3 3.4e-18
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 360)  543 87.2 2.9e-17
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 378)  543 87.2   3e-17
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 387)  543 87.3   3e-17
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5            ( 388)  543 87.3   3e-17
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 411)  543 87.3 3.1e-17
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 428)  543 87.3 3.2e-17
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477)  490 80.0 5.6e-15
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13          ( 471)  489 79.9 6.1e-15
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  486 79.3 6.7e-15
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  477 78.3 2.1e-14
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  472 77.4 2.9e-14
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  471 77.3 3.3e-14
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  453 74.7 1.6e-13
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  453 74.8 1.7e-13
CCDS801.1 GPR61 gene_id:83873|Hs108|chr1           ( 451)  452 74.7 2.1e-13
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  447 74.2 3.9e-13
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  413 69.3 8.9e-12
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  410 68.9 1.2e-11
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  404 68.1 2.1e-11
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4            ( 477)  404 68.1 2.2e-11
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX          ( 458)  395 66.8   5e-11
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11          ( 460)  393 66.6 6.1e-11


>>CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1                  (440 aa)
 initn: 2977 init1: 2977 opt: 2977  Z-score: 2246.2  bits: 424.8 E(32554): 8.5e-119
Smith-Waterman score: 2977; 100.0% identity (100.0% similar) in 440 aa overlap (1-440:1-440)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MVPEPGPTANSTPAWGAGPPSAPGGSGWVAAALCVVIALTAAANSLLIALICTQPALRNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MVPEPGPTANSTPAWGAGPPSAPGGSGWVAAALCVVIALTAAANSLLIALICTQPALRNT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLNALYGRWVLARGLCLLWTAFDVMCCSASILNLCLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLNALYGRWVLARGLCLLWTAFDVMCCSASILNLCLI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALALVLGAWSLAALASFLPLLLGWHELGHARPPVPGQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALALVLGAWSLAALASFLPLLLGWHELGHARPPVPGQC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 RLLASLPFVLVASGLTFFLPSGAICFTYCRILLAARKQAVQVASLTTGMASQASETLQVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 RLLASLPFVLVASGLTFFLPSGAICFTYCRILLAARKQAVQVASLTTGMASQASETLQVP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 RTPRPGVESADSRRLATKHSRKALKASLTLGILLGMFFVTWLPFFVANIVQAVCDCISPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 RTPRPGVESADSRRLATKHSRKALKASLTLGILLGMFFVTWLPFFVANIVQAVCDCISPG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LFDVLTWLGYCNSTMNPIIYPLFMRDFKRALGRFLPCPRCPRERQASLASPSLRTSHSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LFDVLTWLGYCNSTMNPIIYPLFMRDFKRALGRFLPCPRCPRERQASLASPSLRTSHSGP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 RPGLSLQQVLPLPLPPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTAQLLLPGEATQDPPLPTRAAAAVNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 RPGLSLQQVLPLPLPPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTAQLLLPGEATQDPPLPTRAAAAVNF
              370       380       390       400       410       420

              430       440
pF1KB6 FNIDPAEPELRPHPLGIPTN
       ::::::::::::::::::::
CCDS19 FNIDPAEPELRPHPLGIPTN
              430       440

>>CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10                (432 aa)
 initn: 411 init1: 229 opt: 608  Z-score: 471.3  bits: 96.3 E(32554): 6.2e-20
Smith-Waterman score: 630; 32.1% identity (59.1% similar) in 389 aa overlap (8-366:53-432)

                                      10        20                 
pF1KB6                        MVPEPGPTANSTPAWGAGPPSAPGGSGW---------
                                     ::. .:.: : ::.  .: :          
CCDS74 EVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDA-PPDNASGCGEQINYGRVEK
             30        40        50        60         70        80 

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB6 --VAAALCVVIALTAAANSLLIALICTQPALRNTSNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLN
         ... : ..  :: :.: :..  .:    ::. ::...:::  .:: :...::: . ..
CCDS74 VVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVT
              90       100       110       120       130       140 

         90        100       110       120       130       140     
pF1KB6 ALYG-RWVLARGLCLLWTAFDVMCCSASILNLCLISLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALA
        : : .:.... .: .. :.:::::.:::..::.::.:::: :  :: : .:..      
CCDS74 DLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAK
             150       160       170       180       190       200 

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB6 LVLGAWSLAALASFLPLLLGWHELGHARPPVPGQCRLLASLPFVLVASGLTFFLPSGAIC
       ..:..: :.:  . :: :.:: . .     :   : .  .. ... .....:..: ... 
CCDS74 MILSVWLLSASIT-LPPLFGWAQ-NVNDDKV---CLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVML
             210        220        230          240       250      

         210       220       230           240       250       260 
pF1KB6 FTYCRILLAARKQAVQVASLTTGMASQASETL----QVPRTPRPGVESADSRRLATKHSR
       : : .:  ::::.:..      :.     ...     . .  .   : :.  ::  :: :
CCDS74 FMYYQIYKAARKSAAK--HKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVEECANLSRL-LKHER
        260       270         280       290       300        310   

                    270       280            290       300         
pF1KB6 KAL-------KASLTLGILLGMFFVTWLPFFVAN-----IVQAVCDCISPGLFDVLTWLG
       : .       ::. ::::..: : : :::::. .     :  . :.::   .  .. :::
CCDS74 KNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLG
           320       330       340       350       360       370   

     310       320       330       340       350         360       
pF1KB6 YCNSTMNPIIYPLFMRDFKRALGRFLPCPRCPRERQASLAS--PSLRTSHSGPRPGLSLQ
       : :: .::.:: .: ::.. .   .: :     .:. : :.   .:. ..   :: . : 
CCDS74 YANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVL 
           380       390       400       410       420       430   

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB6 QVLPLPLPPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTAQLLLPGEATQDPPLPTRAAAAVNFFNIDPAE

>>CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10                (445 aa)
 initn: 411 init1: 229 opt: 608  Z-score: 471.2  bits: 96.3 E(32554): 6.4e-20
Smith-Waterman score: 637; 32.3% identity (59.2% similar) in 390 aa overlap (8-367:53-433)

                                      10        20                 
pF1KB6                        MVPEPGPTANSTPAWGAGPPSAPGGSGW---------
                                     ::. .:.: : ::.  .: :          
CCDS74 EVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDA-PPDNASGCGEQINYGRVEK
             30        40        50        60         70        80 

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB6 --VAAALCVVIALTAAANSLLIALICTQPALRNTSNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLN
         ... : ..  :: :.: :..  .:    ::. ::...:::  .:: :...::: . ..
CCDS74 VVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVT
              90       100       110       120       130       140 

         90        100       110       120       130       140     
pF1KB6 ALYG-RWVLARGLCLLWTAFDVMCCSASILNLCLISLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALA
        : : .:.... .: .. :.:::::.:::..::.::.:::: :  :: : .:..      
CCDS74 DLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAK
             150       160       170       180       190       200 

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB6 LVLGAWSLAALASFLPLLLGWHELGHARPPVPGQCRLLASLPFVLVASGLTFFLPSGAIC
       ..:..: :.:  . :: :.:: . .     :   : .  .. ... .....:..: ... 
CCDS74 MILSVWLLSASIT-LPPLFGWAQ-NVNDDKV---CLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVML
             210        220        230          240       250      

         210       220       230           240       250       260 
pF1KB6 FTYCRILLAARKQAVQVASLTTGMASQASETL----QVPRTPRPGVESADSRRLATKHSR
       : : .:  ::::.:..      :.     ...     . .  .   : :.  ::  :: :
CCDS74 FMYYQIYKAARKSAAK--HKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVEECANLSRL-LKHER
        260       270         280       290       300        310   

                    270       280            290       300         
pF1KB6 KAL-------KASLTLGILLGMFFVTWLPFFVAN-----IVQAVCDCISPGLFDVLTWLG
       : .       ::. ::::..: : : :::::. .     :  . :.::   .  .. :::
CCDS74 KNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLG
           320       330       340       350       360       370   

     310       320       330       340       350         360       
pF1KB6 YCNSTMNPIIYPLFMRDFKRALGRFLPCPRCPRERQASLAS--PSLRTSHSGPRPGLSLQ
       : :: .::.:: .: ::.. .   .: :     .:. : :.   .:. ..   :: . ::
CCDS74 YANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLQ
           380       390       400       410       420       430   

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CCDS74 NADYCRKKGHDS                                                
           440                                                     

>>CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10                (479 aa)
 initn: 411 init1: 229 opt: 608  Z-score: 470.8  bits: 96.4 E(32554): 6.7e-20
Smith-Waterman score: 634; 32.2% identity (58.5% similar) in 407 aa overlap (8-378:53-450)

                                      10        20                 
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                                     ::. .:.: : ::.  .: :          
CCDS74 EVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDA-PPDNASGCGEQINYGRVEK
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         30        40        50        60        70        80      
pF1KB6 --VAAALCVVIALTAAANSLLIALICTQPALRNTSNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLN
         ... : ..  :: :.: :..  .:    ::. ::...:::  .:: :...::: . ..
CCDS74 VVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVT
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pF1KB6 ALYG-RWVLARGLCLLWTAFDVMCCSASILNLCLISLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALA
        : : .:.... .: .. :.:::::.:::..::.::.:::: :  :: : .:..      
CCDS74 DLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAK
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       ..:..: :.:  . :: :.:: . .     :   : .  .. ... .....:..: ... 
CCDS74 MILSVWLLSASIT-LPPLFGWAQ-NVNDDKV---CLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVML
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       : : .:  ::::.:..      :.     ...     . .  .   : :.  ::  :: :
CCDS74 FMYYQIYKAARKSAAK--HKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVEECANLSRL-LKHER
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pF1KB6 KAL-------KASLTLGILLGMFFVTWLPFFVAN-----IVQAVCDCISPGLFDVLTWLG
       : .       ::. ::::..: : : :::::. .     :  . :.::   .  .. :::
CCDS74 KNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLG
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pF1KB6 YCNSTMNPIIYPLFMRDFKRALGRFLPCPRCPRERQASLAS--PSLRTSHSGPRPGLSLQ
       : :: .::.:: .: ::.. .   .: :     .:. : :.   .:. ..   :: . :.
CCDS74 YANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLR
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pF1KB6 ----QVL--PLPLPPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTAQLLLPGEATQDPPLPTRAAAAVNFF
           .::  :   :: :                                           
CCDS74 ACTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDHHNWLADKMLTTVEKKVMIHD              
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>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (429 aa)
 initn: 489 init1: 246 opt: 600  Z-score: 465.3  bits: 95.2 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 600; 31.8% identity (62.6% similar) in 358 aa overlap (8-347:5-352)

               10        20           30        40        50       
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              ..:.. . .   : ::   . .  ... :  .: . . .: :.:  .  .  :
CCDS60    MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILSVACHRHL
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       ........:.: ..::..  .:.: . .  . : :...: .: .:.: ::.::.:::..:
CCDS60 HSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGL
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       :.::.:::. .  ::::   .:  :.:  .: .:.:. . :. ::. ::      : :.:
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pF1KB6 GQ---CRLLASLPFVLVASGLTFFLPSGAICFTYCRILLAARKQAVQVAS-LTTGMASQA
        .   :..     .:: ..  .:.:: . :   :::. ..:....  . : : :  ... 
CCDS60 EDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGLKTDKSDSE
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       . ::.. :   :    :. :: ..     ::  : ::.  ::. ::::..: : . ::::
CCDS60 QVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRL-LKFSREK-KAAKTLGIVVGCFVLCWLPF
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       :..  . .    ..:.  .: .. :::: :: .::::::   ..::.:.   :   .:  
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       ..:.:                                                       
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>>CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (455 aa)
 initn: 489 init1: 246 opt: 600  Z-score: 465.1  bits: 95.2 E(32554): 1.4e-19
Smith-Waterman score: 600; 31.8% identity (62.6% similar) in 358 aa overlap (8-347:5-352)

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              ..:.. . .   : ::   . .  ... :  .: . . .: :.:  .  .  :
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       ........:.: ..::..  .:.: . .  . : :...: .: .:.: ::.::.:::..:
CCDS60 HSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGL
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       :.::.:::. .  ::::   .:  :.:  .: .:.:. . :. ::. ::      : :.:
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        .   :..     .:: ..  .:.:: . :   :::. ..:....  . : : :  ... 
CCDS60 EDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGLKTDKSDSE
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       . ::.. :   :    :. :: ..     ::  : ::.  ::. ::::..: : . ::::
CCDS60 QVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRL-LKFSREK-KAAKTLGIVVGCFVLCWLPF
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       :..  . .    ..:.  .: .. :::: :: .::::::   ..::.:.   :   .:  
CCDS60 FLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVLRI-QCLC
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       ..:.:                                                       
CCDS60 RKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFSSMPRGS
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>>CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (466 aa)
 initn: 489 init1: 246 opt: 600  Z-score: 464.9  bits: 95.3 E(32554): 1.4e-19
Smith-Waterman score: 600; 31.8% identity (62.6% similar) in 358 aa overlap (8-347:5-352)

               10        20           30        40        50       
pF1KB6 MVPEPGPTANSTPAWGAGPPSAP---GGSGWVAAALCVVIALTAAANSLLIALICTQPAL
              ..:.. . .   : ::   . .  ... :  .: . . .: :.:  .  .  :
CCDS60    MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILSVACHRHL
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pF1KB6 RNTSNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLNALYGRWVLARGLCLLWTAFDVMCCSASILNL
       ........:.: ..::..  .:.: . .  . : :...: .: .:.: ::.::.:::..:
CCDS60 HSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGL
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       :.::.:::. .  ::::   .:  :.:  .: .:.:. . :. ::. ::      : :.:
CCDS60 CIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPLF-GW------RQPAP
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CCDS60 EDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGLKTDKSDSE
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       . ::.. :   :    :. :: ..     ::  : ::.  ::. ::::..: : . ::::
CCDS60 QVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRL-LKFSREK-KAAKTLGIVVGCFVLCWLPF
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pF1KB6 FVANIVQAVCDCISPG--LFDVLTWLGYCNSTMNPIIYPLFMRDFKRALGRFLPCPRCPR
       :..  . .    ..:.  .: .. :::: :: .::::::   ..::.:.   :   .:  
CCDS60 FLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVLRI-QCLC
      290       300       310       320       330       340        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB6 ERQASLASPSLRTSHSGPRPGLSLQQVLPLPLPPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTAQLLLPG
       ..:.:                                                       
CCDS60 RKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFSSMPRGS
       350       360       370       380       390       400       

>>CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8               (475 aa)
 initn: 489 init1: 246 opt: 600  Z-score: 464.8  bits: 95.3 E(32554): 1.4e-19
Smith-Waterman score: 600; 31.8% identity (62.6% similar) in 358 aa overlap (8-347:5-352)

               10        20           30        40        50       
pF1KB6 MVPEPGPTANSTPAWGAGPPSAP---GGSGWVAAALCVVIALTAAANSLLIALICTQPAL
              ..:.. . .   : ::   . .  ... :  .: . . .: :.:  .  .  :
CCDS34    MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILSVACHRHL
                  10        20        30        40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB6 RNTSNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLNALYGRWVLARGLCLLWTAFDVMCCSASILNL
       ........:.: ..::..  .:.: . .  . : :...: .: .:.: ::.::.:::..:
CCDS34 HSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGL
        60        70        80        90       100       110       

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB6 CLISLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALALVLGAWSLAALASFLPLLLGWHELGHARPPVP
       :.::.:::. .  ::::   .:  :.:  .: .:.:. . :. ::. ::      : :.:
CCDS34 CIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPLF-GW------RQPAP
       120       130       140       150       160              170

          180       190       200       210       220        230   
pF1KB6 GQ---CRLLASLPFVLVASGLTFFLPSGAICFTYCRILLAARKQAVQVAS-LTTGMASQA
        .   :..     .:: ..  .:.:: . :   :::. ..:....  . : : :  ... 
CCDS34 EDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGLKTDKSDSE
              180       190       200       210       220       230

           240           250            260       270       280    
pF1KB6 SETLQVPRTPRP----GVESADSR-----RLATKHSRKALKASLTLGILLGMFFVTWLPF
       . ::.. :   :    :. :: ..     ::  : ::.  ::. ::::..: : . ::::
CCDS34 QVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRL-LKFSREK-KAAKTLGIVVGCFVLCWLPF
              240       250       260         270       280        

          290       300         310       320       330       340  
pF1KB6 FVANIVQAVCDCISPG--LFDVLTWLGYCNSTMNPIIYPLFMRDFKRALGRFLPCPRCPR
       :..  . .    ..:.  .: .. :::: :: .::::::   ..::.:.   :   .:  
CCDS34 FLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVLRI-QCLC
      290       300       310       320       330       340        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB6 ERQASLASPSLRTSHSGPRPGLSLQQVLPLPLPPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTAQLLLPG
       ..:.:                                                       
CCDS34 RKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFSSMPRGS
       350       360       370       380       390       400       

>>CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5                 (413 aa)
 initn: 497 init1: 319 opt: 581  Z-score: 451.3  bits: 92.6 E(32554): 8.1e-19
Smith-Waterman score: 581; 30.9% identity (63.4% similar) in 350 aa overlap (28-368:32-370)

                  10        20        30        40            50   
pF1KB6    MVPEPGPTANSTPAWGAGPPSAPGGSGWVAAALCVVIALTAAA----NSLLIALICT
                                     ::.. . .:..: . :    : :.:. :  
CCDS42 GQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQERDEVWVVG-MGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAK
              10        20        30         40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 QPALRNTSNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLNALYGRWVLARGLCLLWTAFDVMCCSAS
          :....:.:..::  .::..::.:.: .  . :.  :...   : .::..::.: .::
CCDS42 FERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTAS
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 ILNLCLISLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALALVLGAWSLAALASFLPLLLGWHELGHAR
       : .::.:..:::. : ::..:.  .:  .: ...: .: ...:.::::. . :..  : .
CCDS42 IETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQE
              130       140       150       160       170       180

               180       190       200       210       220         
pF1KB6 P----PVPGQCRLLASLPFVLVASGLTFFLPSGAICFTYCRILLAARKQAVQVASLTTGM
                 : ....  .....: ..:..:   . :.: :..  :..: .:  . . : 
CCDS42 AINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQ-LQKIDKSEGR
              190       200       210       220        230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB6 ASQASETLQVPRTPRPGVESADSRRLATKHSRKALKASLTLGILLGMFFVTWLPFFVANI
         ....  :: .  : :     . : ..:   :  ::  ::::..: : . :::::..::
CCDS42 F-HVQNLSQVEQDGRTG----HGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNI
     240        250           260       270       280       290    

     290        300       310       320       330       340        
pF1KB6 VQAVCDC-ISPGLFDVLTWLGYCNSTMNPIIYPLFMRDFKRALGRFLPCPRCPRERQASL
       :... :  :   .. .:.:.:: :: .::.::     ::. :. ..: : :  :    . 
CCDS42 VHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIY-CRSPDFRIAFQELL-CLR--RSSLKAY
          300       310       320        330       340          350

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB6 ASPSLRTSHSGPRPGLSLQQVLPLPLPPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTAQLLLPGEATQDP
       ..    ....: . :  ..:                                        
CCDS42 GNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTND
              360       370       380       390       400       410

>>CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7                (357 aa)
 initn: 488 init1: 249 opt: 565  Z-score: 440.0  bits: 90.3 E(32554): 3.4e-18
Smith-Waterman score: 565; 31.3% identity (62.3% similar) in 329 aa overlap (20-335:31-353)

                          10        20           30        40      
pF1KB6            MVPEPGPTANSTPAWGAGPPSAPGGSGW---VAAALCVVIALTAAANSL
                                     ::.:  : .   . . :  ..: : : : :
CCDS59 MDLPVNLTSFSLSTPSPLETNHSLGKDDLRPSSPLLSVFGVLILTLLGFLVAATFAWNLL
               10        20        30        40        50        60

         50        60        70        80        90        100     
pF1KB6 LIALICTQPALRNTSNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLNALYGR-WVLARGLCLLWTAF
       ..: :    ... . . ...:. .::..:. .::: .... : :: : :.: :: :: : 
CCDS59 VLATILRVRTFHRVPHNLVASMAVSDVLVAALVMPLSLVHELSGRRWQLGRRLCQLWIAC
               70        80        90       100       110       120

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB6 DVMCCSASILNLCLISLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALALVLGAWSLAALASFLPLLLG
       ::.::.::: :.  :.::::  :   ..: ::     . ...  .:.:.:. :. :::.:
CCDS59 DVLCCTASIWNVTAIALDRYWSITRHMEYTLRTRKCVSNVMIALTWALSAVISLAPLLFG
              130       140       150       160       170       180

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB6 WHELGHARPPVPGQCRLLASLPFVLVASGLTFFLPSGAICFTYCRILLAARKQAVQVASL
       :   :..      .:..     ... ..  .:.::  .. :.: .:  ::.    .:.: 
CCDS59 W---GETYSEGSEECQVSREPSYAVFSTVGAFYLPLCVVLFVYWKIYKAAK---FRVGSR
                 190       200       210       220          230    

         230       240       250               260       270       
pF1KB6 TTGMASQASETLQVPRTPRPGVESADSRRLA--------TKHSRKALKASLTLGILLGMF
        :. .:  ::...:  . .        :. .        : . .:  .:.: .:::.:.:
CCDS59 KTNSVSPISEAVEVKDSAKQPQMVFTVRHATVTFQPEGDTWREQKEQRAALMVGILIGVF
          240       250       260       270       280       290    

       280       290       300        310       320       330      
pF1KB6 FVTWLPFFVANIVQAVCDCISPGLF-DVLTWLGYCNSTMNPIIYPLFMRDFKRALGRFLP
        . :.:::...... .:.:  :... ... :::: :: .::.::  : .... :.  :. 
CCDS59 VLCWIPFFLTELISPLCSCDIPAIWKSIFLWLGYSNSFFNPLIYTAFNKNYNSAFKNFFS
          300       310       320       330       340       350    

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB6 CPRCPRERQASLASPSLRTSHSGPRPGLSLQQVLPLPLPPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTA
                                                                   
CCDS59 RQH                                                         
                                                                   




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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