Result of FASTA (omim) for pF1KE0896
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0896, 330 aa
  1>>>pF1KE0896 330 - 330 aa - 330 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2003+/-0.000433; mu= 22.5009+/- 0.027
 mean_var=102.7747+/-29.344, 0's: 0 Z-trim(111.3): 356  B-trim: 1142 in 1/48
 Lambda= 0.126512
 statistics sampled from 19350 (19855) to 19350 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.233), width:  16
 Scan time:  7.020

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1186 227.5 2.8e-59
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1186 227.5 2.8e-59
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1186 227.6 2.8e-59
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1147 220.4 3.9e-57
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1134 218.1   2e-56
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  933 181.4 2.2e-45
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  929 180.6 3.7e-45
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  919 178.8 1.3e-44
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  913 177.7 2.7e-44
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314)  877 171.2 2.7e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  869 169.7 7.3e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  847 165.7 1.2e-40
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  845 165.3 1.5e-40
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  845 165.3 1.5e-40
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  845 165.3 1.5e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  842 164.7 2.2e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  841 164.6 2.5e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  821 160.9 3.2e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  805 158.0 2.5e-38
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  788 154.9   2e-37
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  595 119.7 8.4e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  557 112.8   1e-24
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318)  253 57.3 5.2e-08
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444)  233 53.8 7.7e-07
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461)  233 53.9 7.9e-07
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389)  224 52.1 2.3e-06
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425)  224 52.2 2.4e-06
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425)  224 52.2 2.4e-06
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425)  224 52.2 2.4e-06
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360)  218 51.0 4.6e-06
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378)  218 51.0 4.7e-06
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387)  218 51.0 4.8e-06
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388)  218 51.0 4.8e-06
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398)  218 51.0 4.9e-06
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398)  218 51.0 4.9e-06
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411)  218 51.1   5e-06
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428)  218 51.1 5.1e-06
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326)  216 50.5 5.6e-06
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1  ( 326)  216 50.5 5.6e-06
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306)  208 49.0 1.5e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351)  208 49.1 1.6e-05
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413)  207 49.0   2e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339)  206 48.7   2e-05
NP_003766 (OMIM: 603751) sphingosine 1-phosphate r ( 384)  198 47.4   6e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323)  195 46.7   8e-05
NP_000785 (OMIM: 126449) D(1A) dopamine receptor [ ( 446)  195 46.9 9.5e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  193 46.5 0.00012
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  193 46.5 0.00012
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  193 46.5 0.00012
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  193 46.5 0.00012


>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (312 aa)
 initn: 1180 init1: 1180 opt: 1186  Z-score: 1185.3  bits: 227.5 E(85289): 2.8e-59
Smith-Waterman score: 1186; 56.2% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (22-329:5-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
                            ::..::.:::::::. :..: ::: .::.:::.:..:::
XP_011                  MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNL
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pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
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XP_011 LIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYF
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pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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XP_011 VFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLM
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pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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XP_011 APLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITC
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
       .:. . :  :::::::::::::.::::::.....::. : :..:.:... :.::: :. :
XP_011 TVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTP
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              310       320       330 
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL 
        ::::::::::: .: :: :  : :.. :  
XP_011 MLNPFIYSLRNRYLKGALKK--VVGRVVFSV
           290       300         310  

>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo   (312 aa)
 initn: 1180 init1: 1180 opt: 1186  Z-score: 1185.3  bits: 227.5 E(85289): 2.8e-59
Smith-Waterman score: 1186; 56.2% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (22-329:5-310)

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pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
                            ::..::.:::::::. :..: ::: .::.:::.:..:::
NP_036                  MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNL
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pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
       ::::..: :  :::::::::.:::..: ::. ...::::::   ..: ::. :::.:.::
NP_036 LIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYF
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pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
       ..::  .:: ::::::::..::.:.::::...:. :::::...  ::..:  .:.::::.
NP_036 VFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLM
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pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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NP_036 APLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITC
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
       .:. . :  :::::::::::::.::::::.....::. : :..:.:... :.::: :. :
NP_036 TVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTP
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pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL 
        ::::::::::: .: :: :  : :.. :  
NP_036 MLNPFIYSLRNRYLKGALKK--VVGRVVFSV
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>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (322 aa)
 initn: 1180 init1: 1180 opt: 1186  Z-score: 1185.1  bits: 227.6 E(85289): 2.8e-59
Smith-Waterman score: 1186; 56.2% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (22-329:15-320)

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pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
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XP_011        MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNL
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pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
       ::::..: :  :::::::::.:::..: ::. ...::::::   ..: ::. :::.:.::
XP_011 LIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYF
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pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
       ..::  .:: ::::::::..::.:.::::...:. :::::...  ::..:  .:.::::.
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pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
       .:. . :  :::::::::::::.::::::.....::. : :..:.:... :.::: :. :
XP_011 TVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTP
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pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL 
        ::::::::::: .: :: :  : :.. :  
XP_011 MLNPFIYSLRNRYLKGALKK--VVGRVVFSV
           300       310         320  

>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo   (312 aa)
 initn: 1122 init1: 1009 opt: 1147  Z-score: 1146.8  bits: 220.4 E(85289): 3.9e-57
Smith-Waterman score: 1147; 56.1% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (22-322:5-304)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
                            ::.  :.:::::.:: ::.: .:: .::.:::::.:::.
NP_002                  MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNV
                                10        20        30        40   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
       ::::::::: .::::.::::::::.::  :.. .:::::.:...... :::.:::.::::
NP_002 LIILAISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYF
            50        60        70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
       :. . .::: .::::::::::::: ::::.:.:::.:: :.:..::::.   .:.::::.
NP_002 LVSLVALDNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLM
           110       120       130       140       150       160   

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
       :::.::... : ...:.  .::..:::. ..:. ..:. : ... .:. ....::: :. 
NP_002 TRVTFCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIR
           170       180       190       200       210       220   

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
       :.. : : . ..::::::.::: .: ::::.:  ::: :  :::. ..: :.:.: :. :
NP_002 AILRIPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSV-KDSVATVMYAVVTP
           230       240       250       260        270       280  

              310       320       330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
        .:::::::::.::. :::.:.        
NP_002 MMNPFIYSLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
            290       300       310  

>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho  (312 aa)
 initn: 1148 init1: 1120 opt: 1134  Z-score: 1134.0  bits: 218.1 E(85289): 2e-56
Smith-Waterman score: 1134; 55.1% identity (81.4% similar) in 301 aa overlap (22-322:5-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
                            : : .: :::::::. :: ::.:::.::.:::::..:::
NP_001                  MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNL
                                10        20        30        40   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
       :::::.::: ::::::::::.:::..: :: :...::::..:...:. ::: :::.:.::
NP_001 LIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYF
            50        60        70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
       :.::.:.:. :::::::::.::::.::::.. :.: ::.:.. . : .    .:.: ::.
NP_001 LMMFAGMDTFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLM
           110       120       130       140       150       160   

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
        :..: .   :::..:.:. .::.:::.: .:.... .   :. . :.  :.::: .:  
NP_001 KRLTFSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVS
           170       180       190       200       210       220   

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
       ...:.::  :..:::::::::: :: ::::. .::::    :.:..  : :.:.: .. :
NP_001 SLMGMSSTKGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTP
           230       240       250       260       270       280   

              310       320       330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
        ::::::::::.:.: :: .:.        
NP_001 MLNPFIYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP 
           290       300       310   

>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor   (311 aa)
 initn: 942 init1: 917 opt: 933  Z-score: 935.7  bits: 181.4 E(85289): 2.2e-45
Smith-Waterman score: 933; 43.0% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (15-321:1-307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
                     :.  :.:: .. . :.:.:.:.::. . ..: . : .::.:..:::
NP_001               MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNL
                             10        20        30        40      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
       .::.    : ::::::::::.:::. : :.:..:::..:.:.    . :::.::. ::::
NP_001 FIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYF
         50        60        70        80        90       100      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
       .: .:  .  ::.::.::::.:.:.::::.. : :..: :.  . ::     . .:. . 
NP_001 VLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFT
        110       120       130       140       150       160      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
         : .:... . :..:.  :::.:.: ::::::: ..  . .:. .::.::. ::  :  
NP_001 FWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVR
        170       180       190       200       210       220      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
       :.. ..:  :  :.:.:::.:: .: ::.   : .:: :::  : .. .  :..: :. :
NP_001 AILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTP
        230       240       250       260       270       280      

              310       320       330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
       .:::.::.:::. .. :. .:         
NP_001 SLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE     
        290       300       310      

>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo   (308 aa)
 initn: 911 init1: 813 opt: 929  Z-score: 931.8  bits: 180.6 E(85289): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 929; 46.0% identity (76.2% similar) in 302 aa overlap (20-321:3-302)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
                          ..::: :..:::::::. :. . ::: ..::.::::..:::
NP_003                  MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNL
                                10        20        30        40   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
       :.:  .  : .::::::::: ::::.: ::..  .:. :... .....:... : :.: :
NP_003 LLISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLF
            50        60        70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
       .:.::  .  :::::.::::::::.::.: . :. ..:. .    :.     ... : ..
NP_003 FLIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFI
           110       120       130       140       150       160   

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
        :. . ....: :..:.  ::: :: .:::..:. :. ::...: .:..::. :: ::. 
NP_003 LRLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIV
           170       180       190       200       210       220   

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
       .:  ..:  :  :::::::::: ::.::::: . .:. : :  : ..:. ..:.: .. :
NP_003 TVVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTP
           230       240       250       260         270       280 

              310       320       330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
        :::.::::::.:.: :: :.         
NP_003 MLNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP   
             290       300           

>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo   (312 aa)
 initn: 944 init1: 919 opt: 919  Z-score: 921.9  bits: 178.8 E(85289): 1.3e-44
Smith-Waterman score: 919; 45.4% identity (73.8% similar) in 302 aa overlap (21-322:2-303)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
                           :::...  :::::.:: :  .  :: . :  ::.:.::: 
NP_009                    MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNT
                                  10        20        30        40 

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
       ::::  . ::.::.::::::.:::. : :::.. .:.::.:.   .. ::.  : .:...
NP_009 LIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFI
              50        60        70        80        90       100 

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
       .: .:  .  ::.:::.:::::.::::::.: . :.::  . .: ::.    ....:   
NP_009 FLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPST
             110       120       130       140       150       160 

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
        .. :: .. .  . :.  ::..:.: ::  ::... . ....:.::: ::. ::  : :
NP_009 LHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITW
             170       180       190       200       210       220 

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
       ::. :.:  :: :::.::.:::::: :::.:...::: : . :. :: .  ...: :  :
NP_009 AVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTP
             230       240       250       260       270       280 

              310       320       330 
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL 
       .:::.::.:::... .:. .:.         
NP_009 SLNPLIYTLRNKEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
             290       300       310  

>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep  (300 aa)
 initn: 938 init1: 913 opt: 913  Z-score: 916.1  bits: 177.7 E(85289): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 913; 46.1% identity (73.9% similar) in 295 aa overlap (21-315:2-296)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
                           :::...  :::::.:: :  .  :: . :  ::.:.::: 
XP_011                    MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNT
                                  10        20        30        40 

               70        80        90       100       110       120
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       .: .:  .  ::.:::.:::::.::::::.: . :.::  . .: ::.    ....:   
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       ::. :.:  :: :::.::.:::::: :::.:...::: : . :. :: .  ...: :  :
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       .:::.::.:::...:               
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NP_006                MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNI
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NP_006 GLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYF
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       .  :.  .. .::.::::::::::.:: :.. ::  .:  .. . ..  :  .:.:: . 
NP_006 FCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFA
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pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
         . .: ...: :..::   ::::.:.:: .:: .. :.:     . ...:..::  :. 
NP_006 FILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILL
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
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NP_006 SVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIP
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330 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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