Result of FASTA (omim) for pF1KE0856
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0856, 316 aa
  1>>>pF1KE0856 316 - 316 aa - 316 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1080+/-0.000498; mu= 16.9425+/- 0.031
 mean_var=97.7789+/-24.764, 0's: 0 Z-trim(108.6): 349  B-trim: 923 in 1/48
 Lambda= 0.129704
 statistics sampled from 16205 (16703) to 16205 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.196), width:  16
 Scan time:  6.900

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  884 176.5 6.1e-44
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312)  855 171.1 2.6e-42
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312)  855 171.1 2.6e-42
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322)  855 171.1 2.7e-42
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314)  794 159.7 7.2e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  783 157.6   3e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  783 157.7 3.1e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  781 157.3 3.9e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  781 157.3 3.9e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  781 157.3 3.9e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312)  780 157.1 4.4e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  758 152.9 7.5e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  758 153.0 7.6e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  746 150.7 3.6e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312)  740 149.6 7.9e-36
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  737 149.0 1.2e-35
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  728 147.3 3.7e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  726 146.9 4.7e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  722 146.2 8.1e-35
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  717 145.3 1.5e-34
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  557 115.4 1.6e-25
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  554 114.8 2.4e-25
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382)  220 52.4 1.8e-06
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382)  220 52.4 1.8e-06
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465)  203 49.3 1.8e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325)  201 48.7 1.9e-05
NP_071429 (OMIM: 607448) neuropeptide FF receptor  ( 430)  202 49.1   2e-05
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389)  201 48.8 2.1e-05
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392)  201 48.8 2.1e-05
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397)  201 48.8 2.1e-05
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400)  201 48.8 2.1e-05
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403)  201 48.9 2.1e-05
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406)  201 48.9 2.2e-05
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414)  201 48.9 2.2e-05
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418)  201 48.9 2.2e-05
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420)  201 48.9 2.2e-05
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446)  201 48.9 2.3e-05
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369)  200 48.6 2.3e-05
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493)  201 48.9 2.4e-05
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493)  201 48.9 2.4e-05
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370)  199 48.4 2.6e-05
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 370)  199 48.4 2.6e-05
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370)  199 48.4 2.6e-05
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370)  199 48.4 2.6e-05
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 388)  199 48.5 2.7e-05
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 388)  199 48.5 2.7e-05
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 388)  199 48.5 2.7e-05
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399)  199 48.5 2.8e-05
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365)  197 48.1 3.4e-05
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 365)  197 48.1 3.4e-05


>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo  (317 aa)
 initn: 877 init1: 568 opt: 884  Z-score: 909.8  bits: 176.5 E(85289): 6.1e-44
Smith-Waterman score: 884; 45.5% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
           :.. :::::: .::..: ..  .::: .: ..: :: :: ::. ..  .  ::.::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
       ::.::.:: :::: ..:. :  :.:.: .:  :  .. . :  .: . :::.: ..::.:
NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCL-LILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
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              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
       ::: ::: :: . :  .:: :. ::. .:  :  :.. .::: ::.:.:::.::::.:.:
NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK
     240       250       260       270       280       290         

              310        
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS  
       ::....:           
NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP
     300       310       

>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (312 aa)
 initn: 843 init1: 524 opt: 855  Z-score: 880.6  bits: 171.1 E(85289): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 855; 44.3% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-303)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQ-HLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
               10        20         30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
       :.::  ::. .: :. . .:.:::. ..  ..:.: .:  ::.: :::    .::: ::.
XP_011 YFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
       :::.:..::::::.  :. . :: :::  :. ...  .. :...  :.::..:.: ::.:
XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210         220       230        
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCL-FLIIL-SFVFIMAAILRIPSAEGRHK
        :  ::::.:   ... .  :...   ::.    :: :: :.. :  ..:..::..:: :
XP_011 DVTPLLKLSC---SDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWK
     180          190       200       210       220       230      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 TFSTCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKE
       .:::: :::.::.. ::    .:..: . ::  .:.. .. ::: ::.:.:.:.::::. 
XP_011 AFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRY
        240       250       260       270       280       290      

      300       310      
pF1KE0 LKNAINKNFCRRFCPLSS
       ::.:..:           
XP_011 LKGALKKVVGRVVFSV  
        300       310    

>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo   (312 aa)
 initn: 843 init1: 524 opt: 855  Z-score: 880.6  bits: 171.1 E(85289): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 855; 44.3% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-303)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
       : : : :..:::.: :.:  :::   .::...: :.: :.::::::. .: :.  :::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQ-HLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
               10        20         30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
       :.::  ::. .: :. . .:.:::. ..  ..:.: .:  ::.: :::    .::: ::.
NP_036 YFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
       :::.:..::::::.  :. . :: :::  :. ...  .. :...  :.::..:.: ::.:
NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210         220       230        
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCL-FLIIL-SFVFIMAAILRIPSAEGRHK
        :  ::::.:   ... .  :...   ::.    :: :: :.. :  ..:..::..:: :
NP_036 DVTPLLKLSC---SDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWK
     180          190       200       210       220       230      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 TFSTCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKE
       .:::: :::.::.. ::    .:..: . ::  .:.. .. ::: ::.:.:.:.::::. 
NP_036 AFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRY
        240       250       260       270       280       290      

      300       310      
pF1KE0 LKNAINKNFCRRFCPLSS
       ::.:..:           
NP_036 LKGALKKVVGRVVFSV  
        300       310    

>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (322 aa)
 initn: 843 init1: 524 opt: 855  Z-score: 880.4  bits: 171.1 E(85289): 2.7e-42
Smith-Waterman score: 855; 44.3% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-305:11-313)

                         10        20        30        40        50
pF1KE0           MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATV
                 : : : :..:::.: :.:  :::   .::...: :.: :.::::::. .:
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQ-HLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSV
               10        20        30         40        50         

               60        70        80        90       100       110
pF1KE0 WIERRLHTPMYLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGF
        :.  ::::::.::  ::. .: :. . .:.:::. ..  ..:.: .:  ::.: :::  
XP_011 SIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVD
      60        70        80        90       100       110         

              120       130       140       150       160       170
pF1KE0 THSFLLMVMGYDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFC
         .::: ::.:::.:..::::::.  :. . :: :::  :. ...  .. :...  :.::
XP_011 MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFC
     120       130       140       150       160       170         

              180       190       200       210         220        
pF1KE0 GSNVIHHFLCHVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCL-FLIIL-SFVFIMAAIL
       ..:.: ::.: :  ::::.:   ... .  :...   ::.    :: :: :.. :  ..:
XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSC---SDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVL
     180       190          200       210       220       230      

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE0 RIPSAEGRHKTFSTCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLS
       ..::..:: :.:::: :::.::.. ::    .:..: . ::  .:.. .. ::: ::.:.
XP_011 KVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLN
        240       250       260       270       280       290      

      290       300       310      
pF1KE0 PIIFSLRNKELKNAINKNFCRRFCPLSS
       :.:.::::. ::.:..:           
XP_011 PFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV  
        300       310       320    

>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo   (314 aa)
 initn: 731 init1: 463 opt: 794  Z-score: 818.8  bits: 159.7 E(85289): 7.2e-39
Smith-Waterman score: 794; 41.0% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (4-305:6-305)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE0   MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHT
            .::. ..:::: :: . :. :  ::::..: .. . :.::. .:  . :. .:.:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPE-LQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQT
               10        20         30        40        50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE0 PMYLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMV
       :::.::  ::. .. .   :.:.::...:  ..::.. .::.:..:   :. :.::.: .
NP_006 PMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAA
      60        70        80        90       100       110         

      120       130       140        150       160       170       
pF1KE0 MGYDHYVTICHPLHYNMLMSPRG-CAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHH
       :.::.::.::.:: :...:: :: : .:.. .. ::.. ... : ..: : .: .:::.:
NP_006 MAYDRYVAICNPLLYTVVMS-RGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINH
     120       130        140       150       160       170        

       180       190       200         210       220       230     
pF1KE0 FLCHVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCV--TALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEG
       :.: .  ::::.:   :...:   .:     .. : :...::.:. ::. ..:.: :  :
NP_006 FFCDLPPLLKLSC---TDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSG
      180       190          200       210       220       230     

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE0 RHKTFSTCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLR
       :.::::::.:::: :... .   .:: .:. :.:  .: .... ::.: : :.:.:.:::
NP_006 RKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLR
         240       250       260       270       280       290     

         300       310      
pF1KE0 NKELKNAINKNFCRRFCPLSS
       ::..:.: .:           
NP_006 NKDVKDAAEKVLRSKVDSS  
         300       310      

>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 760 init1: 459 opt: 783  Z-score: 807.7  bits: 157.6 E(85289): 3e-38
Smith-Waterman score: 783; 38.4% identity (74.8% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
       :  .::....::.: :. :   .:  .:::..:... .:.:::: ..  . :. .:::::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGL-ADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
               10         20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
       :.::  ::. ..  ...:::.::::::  ...:.:..: .::.: . .. :. .:. .:.
NP_003 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
       ::.:..::.:: :...::     ...: ..:.: .  :. :  :  :.:: :::::::.:
NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
           :.::.:..   .  .. .:. :. ..: :..:. :. ... .:. . :.::::..:
NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVN-IVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAF
     180       190       200        210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
       :::.::::.... :.     ::.:.. .:. .: . .. :::  :.:.:.:.:::.::.:
NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
      240       250       260       270       280       290        

              310      
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
       .:. . . :.      
NP_003 KALANVISRKRTSSFL
      300       310    

>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo   (327 aa)
 initn: 651 init1: 279 opt: 783  Z-score: 807.5  bits: 157.7 E(85289): 3.1e-38
Smith-Waterman score: 783; 39.6% identity (72.7% similar) in 308 aa overlap (1-303:1-306)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0 MPGQNYS-TISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTP
       :  .:.:  .:::.: :: : :  :  .:: : :: ....:  : ::. ..  .  :: :
NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPA-PAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKP
               10        20         30        40        50         

      60        70        80        90           100       110     
pF1KE0 MYLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRS----ITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFL
       ::.::  .:. :: ....  :.::: .. ....    :.: .:  :..: . .: :.  :
NP_003 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
      60        70        80        90       100       110         

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE0 LMVMGYDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVI
       : ::.::.:..::.:::: ...: : :....: .::::  ..:. ....  :..:: :.:
NP_003 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE0 HHFLCHVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEG
       .::.: :  ::.:.: . ... .   .:. .  :.: : .   :.: : .:...:::: :
NP_003 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILA-IFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAG
     180       190       200        210       220       230        

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE0 RHKTFSTCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLR
       :.:.::::.::::::.. :. . .:: .::.: .. .. :... :.:..:.:.:::. ::
NP_003 RYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLR
      240       250       260       270       280       290        

         300       310              
pF1KE0 NKELKNAINKNFCRRFCPLSS        
       :.:.: :.                     
NP_003 NQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
      300       310       320       

>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep  (317 aa)
 initn: 775 init1: 462 opt: 781  Z-score: 805.7  bits: 157.3 E(85289): 3.9e-38
Smith-Waterman score: 781; 38.9% identity (73.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-313)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
       :  .: . .::::: :.:.   .    ::.:.:.:.. :.::: ::.  . .. ::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
               10         20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
       :.::  ::. .. ......:..:: .:  :..: : .:: :.:::. .:  .  :: ::.
XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
       ::.::..:  :.:. .:    ::.:.  .:..: . . . : ..:.: .: .. : :. :
XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
       ..:....:::   :::  . .:.  .. :.  . :..::.. :...::.: : :::.:.:
XP_011 ELLAVVRLAC-VDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF
     180        190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
        ::.::::::.. :. : . :..:..  :. .. :... :...::.:.:.:.::::::.:
XP_011 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
      240       250       260       270       280       290        

              310          
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS    
       .: .: .  .:  :.:    
XP_011 GAWQK-LLWKFSGLTSKLAT
      300        310       

>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo   (317 aa)
 initn: 775 init1: 462 opt: 781  Z-score: 805.7  bits: 157.3 E(85289): 3.9e-38
Smith-Waterman score: 781; 38.9% identity (73.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-313)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
       :  .: . .::::: :.:.   .    ::.:.:.:.. :.::: ::.  . .. ::::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
               10         20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
       :.::  ::. .. ......:..:: .:  :..: : .:: :.:::. .:  .  :: ::.
NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
       ::.::..:  :.:. .:    ::.:.  .:..: . . . : ..:.: .: .. : :. :
NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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       ..:....:::   :::  . .:.  .. :.  . :..::.. :...::.: : :::.:.:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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