Result of FASTA (ccds) for pF1KE0831
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0831, 252 aa
  1>>>pF1KE0831 252 - 252 aa - 252 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8803+/-0.00122; mu= 17.2758+/- 0.073
 mean_var=107.7302+/-28.520, 0's: 0 Z-trim(103.0): 351  B-trim: 860 in 2/48
 Lambda= 0.123568
 statistics sampled from 6826 (7222) to 6826 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.222), width:  16
 Scan time:  2.150

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11        ( 311) 1244 233.0 1.9e-61
CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11        ( 322) 1009 191.1 7.9e-49
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11       ( 326)  835 160.1 1.7e-39
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11      ( 316)  821 157.6 9.6e-39
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11        ( 315)  810 155.6 3.7e-38
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11       ( 308)  808 155.2 4.7e-38
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14      ( 362)  794 152.8 2.9e-37
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11       ( 340)  793 152.6 3.2e-37
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11       ( 327)  787 151.5 6.6e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6          ( 321)  784 151.0 9.4e-37
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11       ( 316)  783 150.8 1.1e-36
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11       ( 359)  783 150.9 1.1e-36
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11      ( 309)  782 150.6 1.2e-36
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11       ( 313)  775 149.4 2.8e-36
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11       ( 310)  773 149.0 3.6e-36
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11        ( 313)  771 148.6 4.6e-36
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11       ( 314)  769 148.3 5.9e-36
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11      ( 314)  769 148.3 5.9e-36
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11       ( 309)  767 147.9 7.5e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11         ( 314)  765 147.6 9.7e-36
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11      ( 309)  762 147.0 1.4e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11       ( 324)  761 146.9 1.6e-35
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11       ( 312)  753 145.4 4.3e-35
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11      ( 324)  752 145.3 4.9e-35
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11        ( 311)  751 145.1 5.4e-35
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1       ( 322)  750 144.9 6.3e-35
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11       ( 346)  750 145.0 6.6e-35
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3         ( 314)  745 144.0 1.1e-34
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9        ( 311)  743 143.6 1.5e-34
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9         ( 313)  743 143.6 1.5e-34
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11       ( 312)  740 143.1 2.1e-34
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11       ( 314)  737 142.6 3.1e-34
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11       ( 309)  736 142.4 3.5e-34
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11       ( 311)  734 142.0 4.4e-34
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11       ( 311)  733 141.9   5e-34
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11       ( 314)  733 141.9 5.1e-34
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3         ( 313)  732 141.7 5.7e-34
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3       ( 310)  731 141.5 6.4e-34
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11       ( 310)  731 141.5 6.4e-34
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11         ( 311)  731 141.5 6.4e-34
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3         ( 308)  730 141.3 7.3e-34
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1       ( 313)  730 141.3 7.3e-34
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11       ( 314)  730 141.3 7.3e-34
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3        ( 316)  730 141.3 7.4e-34
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11       ( 307)  729 141.1 8.2e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9        ( 311)  728 141.0 9.3e-34
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11       ( 326)  728 141.0 9.6e-34
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12       ( 335)  727 140.8 1.1e-33
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11       ( 315)  725 140.4 1.4e-33
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3         ( 325)  724 140.3 1.6e-33


>>CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11             (311 aa)
 initn: 1236 init1: 1236 opt: 1244  Z-score: 1216.6  bits: 233.0 E(32554): 1.9e-61
Smith-Waterman score: 1244; 73.1% identity (90.9% similar) in 253 aa overlap (1-252:59-311)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     ::.:: :::::::: .. :::.:::.:::.
CCDS77 LVFLGIYVVTLMGNISIIVLIRRSHHLHTPMYIFLCHLAFVDIGYSSSVTPVMLMSFLRK
       30        40        50        60        70        80        

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
        :.:::..: ::::::: :::.::::::.:::::::::::::. :: .:: .::.:::. 
CCDS77 ETSLPVAGCVAQLCSVVTFGTAECFLLAAMAYDRYVAICSPLLYSTCMSPGVCIILVGMS
       90       100       110       120       130       140        

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       :::::::: :: .::: :::::::...:::::.::::::.::.    ::::.::::::::
CCDS77 YLGGCVNAWTFIGCLLRLSFCGPNKVNHFFCDYSPLLKLACSHDFTFEIIPAISSGSIIV
      150       160       170       180       190       200        

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
       .:: .:::::::::::::::.:..:::::::::::::.::::.:::::::::::::::::
CCDS77 ATVCVIAISYIYILITILKMHSTKGRHKAFSTCTSHLTAVTLFYGTITFIYVMPKSSYST
      210       220       230       240       250       260        

              220       230       240        250  
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEAL-RKATVRIYS
       .::...:. ::::::.:::.::::::...: :: :.  ..:.:
CCDS77 DQNKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKGALKRELRIKIFS
      270       280       290       300       310 

>>CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11             (322 aa)
 initn: 1009 init1: 1009 opt: 1009  Z-score: 990.1  bits: 191.1 E(32554): 7.9e-49
Smith-Waterman score: 1009; 60.6% identity (85.1% similar) in 249 aa overlap (1-249:55-303)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     ::.:::::::.:.. .. ::: ::..:: .
CCDS77 ILRVILFMIILSGNLSIIILIRISSQLHHPMYFFLSHLAFADMAYSSSVTPNMLVNFLVE
           30        40        50        60        70        80    

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
        ...   .:  :: :...:.: :: :::.:::::.:::::::. ::..:  . . :. : 
CCDS77 RNTVSYLGCAIQLGSAAFFATVECVLLAAMAYDRFVAICSPLLYSTKMSTQVSVQLLLVV
           90       100       110       120       130       140    

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       :..: . : ..:. .  : ::::::..::::::.:::.::::.::.  .. :.:::::::
CCDS77 YIAGFLIAVSYTTSFYFLLFCGPNQVNHFFCDFAPLLELSCSDISVSTVVLSFSSGSIIV
          150       160       170       180       190       200    

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
       ::: .::. :::::::::::::.::.:::::::::::..:::.:::::::::::. ::::
CCDS77 VTVCVIAVCYIYILITILKMRSTEGHHKAFSTCTSHLTVVTLFYGTITFIYVMPNFSYST
          210       220       230       240       250       260    

              220       230       240       250                  
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS                
       .::...:. ::::::.:::.::::::...: ::..  ::                   
CCDS77 DQNKVVSVLYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKGALKRELVRKILSHDACYFSRTSNNDIT
          270       280       290       300       310       320  

>>CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11            (326 aa)
 initn: 835 init1: 835 opt: 835  Z-score: 822.4  bits: 160.1 E(32554): 1.7e-39
Smith-Waterman score: 835; 49.4% identity (78.7% similar) in 249 aa overlap (1-249:71-319)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     :: ::. :.:.:.  .::::: ::..:: .
CCDS31 LLFLAIYLFTLIGNLGLVVPIIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAK
               50        60        70        80        90       100

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
       . ..   .: .:.  .  :::.::::::.::::::::: .::. :. .:: . . :. . 
CCDS31 NKSISFLGCATQMFLACTFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITAS
              110       120       130       140       150       160

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       :... ..:.  :   .:::::: :.: : ::.. ::: .:::.  . ...     ::: .
CCDS31 YVASILHATIHTVATFSLSFCGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEI
              170       180       190       200       210       220

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
       ::.. . ::: .::..::::.:::::.:.:::: .::..::.:.::: :.:: :.:::..
CCDS31 VTILIVLISYGFILLAILKMQSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTS
              230       240       250       260       270       280

              220       230       240       250      
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS    
       ... ..:. ::.:::.:::.::::::.:::::...  ::       
CCDS31 DNDMIVSIFYTIVIPMLNPIIYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
              290       300       310       320      

>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11           (316 aa)
 initn: 860 init1: 821 opt: 821  Z-score: 809.0  bits: 157.6 E(32554): 9.6e-39
Smith-Waterman score: 821; 50.6% identity (76.3% similar) in 245 aa overlap (1-245:65-309)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     ::.::: :.::: . .. ::: ::.... .
CCDS31 ALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLCLHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAE
           40        50        60        70        80        90    

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
       . :.   .: ::.     :  .:::::: ::::::.:: .::.  . .:  ::.::... 
CCDS31 NKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFLLAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATS
          100       110       120       130       140       150    

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       .:.:: ::.  :.  . ::::: :.:.::.::  ::::::::.  .  :.    :. :..
CCDS31 FLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRINHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVI
          160       170       180       190       200       210    

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
         :. . :::. :.:..::: : ::::::::::.:.: :::...::: :.:. : :::: 
CCDS31 SCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGRHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSM
          220       230       240       250       260       270    

              220       230       240       250  
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
        :....:. :::.::.:::.::::.:.:::.::.:       
CCDS31 EQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKNKDVKKALKKILWKHIL
          280       290       300       310      

>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11             (315 aa)
 initn: 849 init1: 810 opt: 810  Z-score: 798.4  bits: 155.6 E(32554): 3.7e-38
Smith-Waterman score: 810; 47.8% identity (80.0% similar) in 245 aa overlap (1-245:59-303)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     ::.:: :::....: .::..: :::.:: .
CCDS31 LVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMYFFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVK
       30        40        50        60        70        80        

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
         .     : .:: . ..: .:: ..::.::::::::::.::.  . .:  .:.:::.. 
CCDS31 KKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAYDRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLT
       90       100       110       120       130       140        

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       :: :  .: . . :..:.:.:. : :.::.::..::: ::::.  ::: :  ::... .:
CCDS31 YLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCDIAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLV
      150       160       170       180       190       200        

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
        ..... .::. :...::..:: :::.::::::.::. :::..:::. :.:..:....: 
CCDS31 FSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFSTCASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSL
      210       220       230       240       250       260        

              220       230       240       250       
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS     
       . ... :. ::.:::.:::.:::::: ::. ::.:            
CCDS31 DTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVALKKFMENPCYSFKSM
      270       280       290       300       310     

>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11            (308 aa)
 initn: 831 init1: 808 opt: 808  Z-score: 796.6  bits: 155.2 E(32554): 4.7e-38
Smith-Waterman score: 808; 50.0% identity (77.8% similar) in 248 aa overlap (1-248:59-306)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     :: ::: :.:::.  ..:.:: ::..:: .
CCDS31 LLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMYYFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGK
       30        40        50        60        70        80        

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
        ...  . : .::   :.: ..: .::..:::::::::::::. .. .:  .: ::: . 
CCDS31 KNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAA
       90       100       110       120       130       140        

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       .. : ..: : :: ...::::  . :.:.:::  :::.:::::  . :..  : .:   .
CCDS31 FFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTL
      150       160       170       180       190       200        

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
       : ..:.:.:: .:: .::..::.::: :::.::.::: ::....:.:::.:  : :: : 
CCDS31 VPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSL
      210       220       230       240       250       260        

              220       230       240       250  
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
       .:... :. ::.:::.:::.::::::.:::.::::. :    
CCDS31 DQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKALRKVLVGK  
      270       280       290       300          

>>CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14           (362 aa)
 initn: 816 init1: 794 opt: 794  Z-score: 782.4  bits: 152.8 E(32554): 2.9e-37
Smith-Waterman score: 794; 48.6% identity (76.3% similar) in 245 aa overlap (1-245:110-354)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     :: .:. :.:.:.  ...:.:  :..:: .
CCDS32 VVFLGMYTATLLGNLVMFLLIHVSATLHTPMYSLLKSLSFLDFCYSSTVVPQTLVNFLAK
      80        90       100       110       120       130         

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
         ..   .: .:.   . :.::::.:.:.::::::.:::.::. :: .:: .:  :.   
CCDS32 RKVISYFGCMTQMFFYAGFATSECYLIAAMAYDRYAAICNPLLYSTIMSPEVCASLIVGS
     140       150       160       170       180       190         

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       : .: .:.   :.:..::.::: . . :::::  :.:.::: . :. ::.  : .:  ..
CCDS32 YSAGFLNSLIHTGCIFSLKFCGAHVVTHFFCDGPPILSLSCVDTSLCEILLFIFAGFNLL
     200       210       220       230       240       250         

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
         ...: :::. :: ::::: ::.:: ::::::.:::.:. :..::  :.:. :.:::: 
CCDS32 SCTLTILISYFLILNTILKMSSAQGRFKAFSTCASHLTAICLFFGTTLFMYLRPRSSYSL
     260       270       280       290       300       310         

              220       230       240       250   
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS 
       .:.: ... ::::::.:::..:::::.:::.:: :        
CCDS32 TQDRTVAVIYTVVIPVLNPLMYSLRNKDVKKALIKVWGRKTME
     320       330       340       350       360  

>>CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11            (340 aa)
 initn: 836 init1: 789 opt: 793  Z-score: 781.7  bits: 152.6 E(32554): 3.2e-37
Smith-Waterman score: 793; 48.2% identity (75.3% similar) in 251 aa overlap (1-251:89-339)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     :: ::: :.:.:   .::::: ::..:: .
CCDS31 LLFFAIYLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAK
       60        70        80        90       100       110        

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
       . ..   .: .:.   : :::.::::::.::::.:::: .::. :. .:: . . :. . 
CCDS31 NKSISFIGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITAS
      120       130       140       150       160       170        

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       :..: ..:.      .:::::: :.: : :::. ::: .:::.    ...     ::: .
CCDS31 YVAGILHATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEI
      180       190       200       210       220       230        

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
       ::.. . ::  .::..::::.::.::.:::::: :::..::.:.:::   :. :.:::..
CCDS31 VTILIVLISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYAS
      240       250       260       270       280       290        

              220       230       240       250  
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
       ... ..:. ::.::: :::.::::::..::.:..:    .: 
CCDS31 DHDIIVSIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
      300       310       320       330       340

>>CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11            (327 aa)
 initn: 809 init1: 787 opt: 787  Z-score: 776.1  bits: 151.5 E(32554): 6.6e-37
Smith-Waterman score: 787; 46.4% identity (74.0% similar) in 250 aa overlap (1-250:74-323)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     ::.:...:.:.:.  ..: :: .: . . .
CCDS31 GVFLMLYLITLSGNMTLVILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSE
            50        60        70        80        90       100   

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
          . ...: :::    . . .::.:::.:::::..:::.::. :  .:  .:  ::.  
CCDS31 DKRISLAGCGAQLFFSCVVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGS
           110       120       130       140       150       160   

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       :.:: .:: . :.  . : ::: : :::::::  ::.:.::.:  . : .     :  ..
CCDS31 YIGGFLNAIAHTANTFRLHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTNTRVYEKVLLGVVGFTVL
           170       180       190       200       210       220   

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
        ...:: :::. ::..::...:: :::::::::.::: .: :.::.. :.:  :.:.:: 
CCDS31 SSILAILISYVNILLAILRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSL
           230       240       250       260       270       280   

              220       230       240       250    
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS  
        .... .: :::. :.:::.::::::.:.:::.::::  :    
CCDS31 ERDKVAALFYTVINPLLNPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
           290       300       310       320       

>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6               (321 aa)
 initn: 770 init1: 770 opt: 784  Z-score: 773.3  bits: 151.0 E(32554): 9.4e-37
Smith-Waterman score: 784; 49.4% identity (75.9% similar) in 245 aa overlap (1-244:59-302)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
                                     :: ::..:::.::  .:  .: :.. .: .
CCDS46 TIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSK
       30        40        50        60        70        80        

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
         ..  ..: .:: . :.:  :::.:::.::::::.:::.::  :. :: ..:  :.. :
CCDS46 KKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASC
       90       100       110       120       130       140        

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
       . .: .:. . :   . : ::: :::..::::. ::: :::.: :. :.   .:.: .: 
CCDS46 WAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNELA-LLSTGVFIG
      150       160       170       180       190        200       

               160       170       180       190       200         
pF1KE0 VTVF-AIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYS
        : :  :..::: :. :::...:.:::.::::::.:::: : :.::.  : :: : :.::
CCDS46 WTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYS
       210       220       230       240       250       260       

     210       220       230       240       250             
pF1KE0 TSQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS           
        ...::.:. :.:: :.:::.::.:::.:.:::..                   
CCDS46 LKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKEAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
       270       280       290       300       310       320 




252 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 03:24:42 2016 done: Sat Nov  5 03:24:42 2016
 Total Scan time:  2.150 Total Display time:  0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com