Result of FASTA (ccds) for pF1KE0823
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0823, 233 aa
  1>>>pF1KE0823 233 - 233 aa - 233 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0416+/-0.00107; mu= 15.7813+/- 0.063
 mean_var=114.9699+/-34.729, 0's: 0 Z-trim(104.0): 357  B-trim: 845 in 2/47
 Lambda= 0.119614
 statistics sampled from 7268 (7705) to 7268 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.237), width:  16
 Scan time:  1.690

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11       ( 314) 1072 196.3 1.9e-50
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11       ( 314)  763 143.0 2.1e-34
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11       ( 310)  714 134.6 7.4e-32
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11       ( 313)  712 134.2 9.4e-32
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11       ( 309)  703 132.7 2.7e-31
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11      ( 309)  701 132.3 3.5e-31
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11        ( 311)  696 131.4 6.4e-31
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11        ( 313)  691 130.6 1.2e-30
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11      ( 316)  690 130.4 1.3e-30
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11       ( 314)  684 129.4 2.7e-30
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11      ( 314)  674 127.7 8.9e-30
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11       ( 310)  671 127.1 1.3e-29
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11        ( 311)  668 126.6 1.8e-29
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11         ( 311)  665 126.1 2.6e-29
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11         ( 314)  664 125.9 2.9e-29
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11       ( 309)  662 125.6 3.7e-29
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11       ( 326)  662 125.6 3.8e-29
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11       ( 312)  657 124.7 6.8e-29
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11      ( 324)  652 123.9 1.3e-28
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11       ( 307)  642 122.1   4e-28
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11      ( 310)  641 122.0 4.6e-28
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11       ( 346)  640 121.8 5.5e-28
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11       ( 315)  637 121.3 7.4e-28
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11       ( 340)  635 121.0 9.9e-28
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11       ( 310)  630 120.1 1.7e-27
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11       ( 327)  628 119.7 2.2e-27
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11       ( 359)  627 119.6 2.7e-27
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9        ( 320)  626 119.4 2.8e-27
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11       ( 314)  625 119.2 3.1e-27
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6          ( 357)  625 119.3 3.4e-27
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11       ( 324)  624 119.0 3.6e-27
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11       ( 311)  622 118.7 4.4e-27
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11      ( 313)  622 118.7 4.5e-27
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11       ( 308)  621 118.5   5e-27
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3         ( 308)  621 118.5   5e-27
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11       ( 309)  620 118.3 5.6e-27
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11      ( 305)  619 118.1 6.3e-27
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11       ( 312)  618 118.0 7.2e-27
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14      ( 362)  617 117.9 8.9e-27
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11       ( 310)  615 117.5   1e-26
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11       ( 314)  614 117.3 1.2e-26
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6          ( 321)  611 116.8 1.7e-26
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11       ( 326)  611 116.8 1.7e-26
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11       ( 319)  610 116.6 1.9e-26
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3        ( 321)  609 116.5 2.1e-26
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6        ( 311)  607 116.1 2.7e-26
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6         ( 312)  607 116.1 2.7e-26
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3        ( 316)  606 115.9   3e-26
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11      ( 314)  603 115.4 4.3e-26
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3        ( 321)  603 115.4 4.4e-26


>>CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11            (314 aa)
 initn: 1072 init1: 1072 opt: 1072  Z-score: 1019.3  bits: 196.3 E(32554): 1.9e-50
Smith-Waterman score: 1072; 70.0% identity (89.3% similar) in 233 aa overlap (1-233:1-233)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
       ::: ::. ::::::. : :::.: .:::::::::::::.::: :::.:::::..:.::.:
CCDS31 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISYGCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMAY
       ::::::..:::: .::::::::::::: :::::::  :.:: .:::::::::.::.::::
CCDS31 FFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFCD
       ::..:: :::  ...:.:  :  ....:..::::::::.:::::::::: ::::::::::
CCDS31 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230          
pF1KE0 LPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG       
       ::::::::::. .. ::::.. .. ..:::. :::: :.:::..::.:::.::       
CCDS31 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
              190       200       210       220       230       240

CCDS31 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11            (314 aa)
 initn: 763 init1: 763 opt: 763  Z-score: 731.1  bits: 143.0 E(32554): 2.1e-34
Smith-Waterman score: 763; 50.6% identity (79.8% similar) in 233 aa overlap (1-233:1-233)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
       ::.:: ..::::.:..::.: .  :::::.::::::.:.::: :::.::. : .::::.:
CCDS31 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRRLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISYGCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMAY
       ::::::...: : .:.: ::.::.:    :.:: .  :.:: .::. :. .::::..:::
CCDS31 FFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFCD
       ::..:. .::     .:  .   ....:.. :  .:...:. .:::::: .:.:::.:::
CCDS31 DRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230          
pF1KE0 LPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG       
       :::::::.:..    :.::.. :  .. : ..:::. :..:: :::...::::       
CCDS31 LPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFST
              190       200       210       220       230       240

CCDS31 CASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKEA
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11            (310 aa)
 initn: 747 init1: 714 opt: 714  Z-score: 685.4  bits: 134.6 E(32554): 7.4e-32
Smith-Waterman score: 714; 47.4% identity (78.5% similar) in 228 aa overlap (1-228:1-228)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
       ::. ::. ::::.:..::..:: :.::::.:: .::.: :::  ::::: .: :::.:.:
CCDS31 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISYGCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMAY
       :.::::::.:.: .:. .::.::.:    ...::   :.:: .::. .. .::::..:::
CCDS31 FLLSHLAFMDVCYSSITVPQMLAVLLEHGAALSYTRCAAQFFLFTFFGSIDCYLLALMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFCD
       ::..:. .::     .:  .   ..:.:.. :. .:...:. .::::::  ..:.:.:::
CCDS31 DRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230          
pF1KE0 LPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG       
       :::::::.:.     :..:.. :  .. :...:::. :..:: ::. .            
CCDS31 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGIPAGSQAKTFSTC
              190       200       210       220       230       240

CCDS31 TSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKEAL
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11            (313 aa)
 initn: 741 init1: 700 opt: 712  Z-score: 683.5  bits: 134.2 E(32554): 9.4e-32
Smith-Waterman score: 712; 45.7% identity (76.1% similar) in 234 aa overlap (1-233:1-233)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
       :  :: : ::::::. .:::::.  :::..::  :.::..:: :.:::. ....::::.:
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFQQPLFFLFLVVYIVTMVGNLGLIILFGLNSHLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90        100       110         
pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISY-GCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMA
       .:: .:.:.: : .::.::..: .... :..::: ::  .:. :: . . .:::.:. ::
CCDS31 YFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISYVGC-MTQLFFFLFFVISECYMLTSMA
               70        80        90        100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 YDRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFC
       :::.::: :::  ..::.  .: ..  .:.: :..::  :: : . :.::  : :: ..:
CCDS31 YDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLC
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 DLPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG      
       :. :::.:.:.:   .:.:.:. .   ...   .::: :..:. .::..::. :      
CCDS31 DILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGINIMVPSCTILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFS
     180       190       200       210       220       230         

CCDS31 TCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSSGSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11            (309 aa)
 initn: 730 init1: 703 opt: 703  Z-score: 675.2  bits: 132.7 E(32554): 2.7e-31
Smith-Waterman score: 703; 47.2% identity (74.7% similar) in 233 aa overlap (1-233:1-233)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
       ::. : . .:::::: .::: :: .:::..:::.:: : .:: :.:.::..:..:.::.:
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISYGCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMAY
       ::::.:::.: : .:::::..:...   ..:::.   :.:.. :     .:  ::. :::
CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFCD
       ::.::: :::   ..:::: :  ..:  .  .   :..::  :: ::.: .: .: :.::
CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230          
pF1KE0 LPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG       
         :::.:.::.    .. :. ::  ::......... ::.:: ::::..:: :       
CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
              190       200       210       220       230       240

CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11           (309 aa)
 initn: 637 init1: 637 opt: 701  Z-score: 673.3  bits: 132.3 E(32554): 3.5e-31
Smith-Waterman score: 701; 47.0% identity (77.8% similar) in 230 aa overlap (5-233:3-230)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
           : . ::::::. .:: :.: .::.:.:: .::.:.::::::...:. :..::::.:
CCDS31   MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90        100       110         
pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISY-GCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMA
       ::::.:...:   .:...:. .:.: .   .::: :: :.:: ::.  : .:::::. ::
CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGC-AAQFFFFVGFATVECYLLASMA
       60        70        80        90        100       110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 YDRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFC
       ::: .:.  ::: . ::: :.: .. ..... :  .: .:.. :: :::: .:.:: :::
CCDS31 YDRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFC
       120       130       140       150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 DLPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG      
       :.:::: :.::.   ...:... .  .:.. ..:::: :..:  .: :..:: :      
CCDS31 DIPPLLALSCSDTRISKLVVFVAGFNVFFT-LLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFS
       180       190       200        210       220       230      

CCDS31 TCASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKS
        240       250       260       270       280       290      

>>CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11             (311 aa)
 initn: 682 init1: 682 opt: 696  Z-score: 668.6  bits: 131.4 E(32554): 6.4e-31
Smith-Waterman score: 696; 49.8% identity (76.0% similar) in 233 aa overlap (1-231:1-231)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
       :.:.: .::.::::. ..: ::: : :::.:: .: ::.:.: ::  ::::...::::::
CCDS31 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTPVY
               10        20        30        40        50        60

               70        80         90       100       110         
pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATL-ATDKTVISYGCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMA
       ::::::.:.: : .:.:.:..::..   ::..   ::  ::: .:  :. :: .::.:::
CCDS31 FFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGC-MVQFYLFCTCGVTEVFLLAVMA
               70        80        90        100       110         

     120       130       140        150       160       170        
pF1KE0 YDRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASA-FICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFF
       ::::::: :::   .::.    :: :.:  ..::.  ...:.. .. . :  .: :: ::
CCDS31 YDRFVAICNPLLYMVTMSQKL-RVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFF
     120       130       140        150       160       170        

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE0 CDLPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG     
       :::::::.::::..: .: ...: :     ...:.::  :.::. .::...::       
CCDS31 CDLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAF
      180       190       200       210       220       230        

CCDS31 STCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVN
      240       250       260       270       280       290        

>>CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11             (313 aa)
 initn: 700 init1: 675 opt: 691  Z-score: 663.9  bits: 130.6 E(32554): 1.2e-30
Smith-Waterman score: 691; 44.9% identity (74.8% similar) in 234 aa overlap (1-233:1-233)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
       :  :: : ::::::. .:::::.  :::..:: .:.::..:: :.: :. ....::::.:
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFRQPLFFLFLVIYIVTMVGNLGLITLFGLNSHLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90        100       110         
pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVIS-YGCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMA
       .:: .:.:.: : .::.::..: .... :..::  :: .  : :: . . .:::.:. ::
CCDS31 YFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISNVGCMTRLF-FFLFFVISECYMLTSMA
               70        80        90       100        110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 YDRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFC
       :::.::: :::  ..::.  .: ..  .:.: :..::  :: : . :.::  : :: ..:
CCDS31 YDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLC
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 DLPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG      
       :. :::.:.:.:   .:.:.:. .   . .   .::: :..:. .::..::. :      
CCDS31 DILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGTNITVPSCTILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFS
     180       190       200       210       220       230         

CCDS31 TCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSSGSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11           (316 aa)
 initn: 706 init1: 681 opt: 690  Z-score: 663.0  bits: 130.4 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 690; 45.9% identity (75.3% similar) in 231 aa overlap (4-233:10-239)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE0       MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQ
                :: . ::::.:. ..:.:.:   :: .:: .:.....:: :::.::..:  
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90        100       110   
pF1KE0 LHTPVYFFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISY-GCRAVQFSFFTICAGTECY
       ::::.::::: :.:.::  .: .::..:..: ... .::. :: :.:: ::    ::::.
CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGC-AAQFYFFGSFLGTECF
               70        80        90       100        110         

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE0 LLSVMAYDRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQ
       ::..:::::..:: :::   . ..   : ...:..:. : ..: .::  :: :::: .:.
CCDS31 LLAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNR
     120       130       140       150       160       170         

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE0 INFFFCDLPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG
       :: :.:: ::::::.::.   . :::.  .. . .. ::..:: :. :. :.:.. :  :
CCDS31 INHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEG
     180       190       200       210       220       230         

CCDS31 RHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLK
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11            (314 aa)
 initn: 712 init1: 666 opt: 684  Z-score: 657.4  bits: 129.4 E(32554): 2.7e-30
Smith-Waterman score: 684; 44.0% identity (73.9% similar) in 234 aa overlap (1-233:1-233)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
       :. .: ::::::.:  .:.. :: .::: .::..: :: .:: .:: .:... :::::.:
CCDS31 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80         90       100       110         
pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILAT-LATDKTVISYGCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMA
       .::: :.::: : .:::::..:.  :  :...   ::  .:. :: .:. .:::.:..::
CCDS31 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGC-MIQLFFFCVCVISECYMLAAMA
               70        80        90        100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 YDRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFC
        ::.::: .::   . :.: .: ...:..:  : . :..:  : . :::: .: :. .::
CCDS31 CDRYVAICSPLLYRVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFC
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 DLPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG      
       :. ::.::.:::    :..:.. .   ..:. ..:.: : .:. .:::..:  :      
CCDS31 DIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFS
     180       190       200       210       220       230         

CCDS31 TCSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVILMLNPLIYSLRNNEVRN
     240       250       260       270       280       290         




233 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 03:22:22 2016 done: Sat Nov  5 03:22:22 2016
 Total Scan time:  1.690 Total Display time: -0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com