Result of FASTA (ccds) for pF1KE0614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0614, 364 aa
  1>>>pF1KE0614 364 - 364 aa - 364 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5709+/-0.00118; mu= 15.3546+/- 0.069
 mean_var=190.7390+/-75.175, 0's: 0 Z-trim(103.6): 202  B-trim: 988 in 2/44
 Lambda= 0.092866
 statistics sampled from 7141 (7480) to 7141 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.23), width:  16
 Scan time:  2.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9           ( 364) 2415 337.1 1.5e-92
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1           ( 353) 1242 179.9 2.9e-45
CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19         ( 351) 1225 177.6 1.4e-44
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1            ( 382)  828 124.5 1.5e-28
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9           ( 378)  762 115.6   7e-26
CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19        ( 398)  668 103.1 4.4e-22
CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19         ( 384)  566 89.4 5.7e-18
CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19         ( 353)  546 86.6 3.5e-17
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1             ( 330)  442 72.7 5.2e-13
CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13          ( 334)  431 71.2 1.5e-12


>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9                (364 aa)
 initn: 2415 init1: 2415 opt: 2415  Z-score: 1775.2  bits: 337.1 E(32554): 1.5e-92
Smith-Waterman score: 2415; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 IFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVST
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 WLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 WLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 IPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCDVLAYEKFFLLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCDVLAYEKFFLLLA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 EFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 EFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSND
              310       320       330       340       350       360

           
pF1KE0 HSVV
       ::::
CCDS67 HSVV
           

>>CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1                (353 aa)
 initn: 984 init1: 984 opt: 1242  Z-score: 926.0  bits: 179.9 E(32554): 2.9e-45
Smith-Waterman score: 1242; 51.9% identity (80.8% similar) in 339 aa overlap (19-354:1-329)

               10        20        30        40        50          
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGL--GIT
                         :::  : :.. . ::::::.   . .: : .:::. :  :  
CCDS70                   MNE--CHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDW-TGTKLVIVLCVGTF
                                   10        20         30         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE0 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
        :.::...: ::..:.  ::.::::.:::.:::::::::::.:: .::::::: .. :::
CCDS70 FCLFIFFSNSLVIAAVIKNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTV
      40        50        60        70        80        90         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE0 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
       . :.:::::.:.:::::..:::.::.:::....::..:. ....::...:...:..:: :
CCDS70 NRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFM
     100       110       120       130       140       150         

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE0 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMR
       ::.:..::::.:.:  ::..::.:: ::::::.. ::..:..:::.: .:. ::...:  
CCDS70 GAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNV
     160       170       180       190       200       210         

      240       250       260       270       280        290       
pF1KE0 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
       .: :.::    : : :.:.:::. :::::..:::::::.:::: . : :: :   ...::
CCDS70 LSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFL
     220       230       240       250       260       270         

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE0 LLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVH
       ::: .::..:::::::.:..: .:.....::  .:::       .:  : .  :.:.   
CCDS70 LLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENP-------ERRPSRIPSTVLSRSD
     280       290       300       310              320       330  

       360                  
pF1KE0 SNDHSVV              
                            
CCDS70 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
            340       350   

>>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19              (351 aa)
 initn: 1043 init1: 1043 opt: 1225  Z-score: 913.7  bits: 177.6 E(32554): 1.4e-44
Smith-Waterman score: 1225; 57.3% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (23-328:6-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVC
                             ::.:::.:.:::: :::.:...:   . .:..::.:: 
CCDS12                  MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVS
                                10        20        30        40   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 IFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVST
       ....:.::::..::  ::::: :::::..::::::.:::.::..:::.::: : ::..  
CCDS12 VLVLLTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEG
            50        60        70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 WLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGA
       :.:::::.:::::::::.:::::.::: .:. .:::.:.   :::..:: .:. :. .: 
CCDS12 WFLRQGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGL
           110       120       130       140       150       160   

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 IPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMS
       .:. .:.:.: .. :: :::: : :::. ::. .:..:..::..:..:: :::.:..::.
CCDS12 LPAHSWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMA
           170       180       190       200       210       220   

              250       260       270       280        290         
pF1KE0 RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFLLL
       .: :   : :.: .::.:::::.::::..::::: :.:::: . : .:.::: ::.::::
CCDS12 EHVSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLL
           230       240       250       260       270       280   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE0 AEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSN
       :: :: .:  .:: :: ::  :::..:::                               
CCDS12 AEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENG
           290       300       310       320       330       340   

>>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1                 (382 aa)
 initn: 790 init1: 538 opt: 828  Z-score: 625.9  bits: 124.5 E(32554): 1.5e-28
Smith-Waterman score: 828; 38.2% identity (72.6% similar) in 343 aa overlap (6-340:4-338)

               10        20        30          40        50        
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAF-FYNRSGK-HLATEWNTVSKLVMGLGIT
            ::.:...  . .. .    . : .:    :: .:: ..... ..  ::.  . : 
CCDS77   MGPTSVPLVKAHRSSVSD----YVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFIL
                 10            20        30        40        50    

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE0 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
       .: ::.: :..:...:. ...:: :.::...::: .:..::.::   .. .: .: .:: 
CCDS77 ICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTP
           60        70        80        90       100       110    

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE0 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
       . :.::.: . ..:.::: .::::::::.::...:.::.  .: :. ..: . :......
CCDS77 AQWFLREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLIL
          120       130       140       150       160       170    

      180       190       200        210       220       230       
pF1KE0 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVF-WAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTM
       :..: .:::::  . .::.. :::   :..:  ..:.:. .. .:.:: .:.. :: :. 
CCDS77 GGLPIMGWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLL-LLSIVILYCRIYSLVRTRSR
          180       190       200       210        220       230   

       240         250       260       270       280         290   
pF1KE0 RMS--RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCP--QCDVLAYE
       :..  .. :   :. .  ..:::::.:::..:: ::.: ..:::::: :    ::.:   
CCDS77 RLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRA
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320        330       340       350  
pF1KE0 KFFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQIL-CCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTI
       ..::.:: .::. :::::.  .:::  .: .:. ::.    :.: . :            
CCDS77 EYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCK---CPSGDSAGKFKRPIIAGMEF
           300       310       320       330          340       350

            360                        
pF1KE0 LAGVHSNDHSVV                    
                                       
CCDS77 SRSKSDNSSHPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
              360       370       380  

>>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9                (378 aa)
 initn: 706 init1: 501 opt: 762  Z-score: 578.2  bits: 115.6 E(32554): 7e-26
Smith-Waterman score: 762; 38.4% identity (70.9% similar) in 333 aa overlap (27-347:15-340)

               10        20        30        40           50       
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLA---TEWNTVSKLVMGLGI
                                 ::..   :.  :: ::    : .  : :.  : .
CCDS66             MATALPPRLQPVRGNETLREHYQYVGK-LAGRLKEASEGSTLTTVLFL
                           10        20         30        40       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE0 TVCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLT
       ..: ::.: ::.:..::. : .::  .:....:::  :..::.::   .. .: .:  :.
CCDS66 VICSFIVLENLMVLIAIWKNNKFHNRMYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLS
        50        60        70        80        90       100       

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE0 VSTWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIV
        ..:.::.: . ..: ::. .:::::::::.:...:. .   . .:: ..: . : .:..
CCDS66 PTVWFLREGSMFVALGASTCSLLAIAIERHLTMIKMRPYDANKRHRVFLLIGMCWLIAFT
       110       120       130       140       150       160       

       180       190       200        210       220       230      
pF1KE0 MGAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVF-WAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRT
       .::.: .::::. .. .::.. :::: .:..:  .::. . .:..:.:::.:.  :.. .
CCDS66 LGALPILGWNCLHNLPDCSTILPLYSKKYIAFCISIFTAI-LVTIVILYARIYFLVKSSS
       170       180       190       200        210       220      

        240       250       260       270       280         290    
pF1KE0 MRMSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCC--PQCDVLAYEK
        ... :... :      :.::.:::::...:: ::.: ..:.:.:: :    : .:   .
CCDS66 RKVANHNNSERS-----MALLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLIDVACRVQACPILFKAQ
        230            240       250       260       270       280 

          300       310       320         330           340        
pF1KE0 FFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILC-CQ-RSE----NPTGPTEGSDRSASSL
       .:..:: .::::::.::.  .:::  .: ...: :  :..    .:  :.   .:: :: 
CCDS66 WFIVLAVLNSAMNPVIYTLASKEMRRAFFRLVCNCLVRGRGARASPIQPALDPSRSKSSS
             290       300       310       320       330       340 

      350       360                         
pF1KE0 NHTILAGVHSNDHSVV                     
                                            
CCDS66 SNNSSHSPKVKEDLPHTAPSSCIMDKNAALQNGIFCN
             350       360       370        

>>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19             (398 aa)
 initn: 670 init1: 415 opt: 668  Z-score: 509.9  bits: 103.1 E(32554): 4.4e-22
Smith-Waterman score: 668; 34.1% identity (66.2% similar) in 331 aa overlap (27-347:12-341)

               10        20        30        40        50          
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMG--LGIT
                                 .: :.. :: .::  .....  . :     . ..
CCDS12                MESGLLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVCLA
                              10        20        30        40     

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE0 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
       :: ::.: :: :....  . ::: :.. :...:. .:..:: ::   .. .:: : .:. 
CCDS12 VCAFIVLENLAVLLVLGRHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSP
          50        60        70        80        90       100     

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE0 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
       . :. :.: . ..::::: .:::::.:: .:. :       :  :.... .. : .....
CCDS12 ALWFAREGGVFVALTASVLSLLAIALERSLTMARRGPAPVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLL
         110       120       130       140       150       160     

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE0 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMR
       : .:..::::.  .. ::.. :::. .:..: ..  .  .... .:::.:.  ::  . :
CCDS12 GLLPALGWNCLGRLDACSTVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARR
         170       180       190       200       210       220     

           240        250       260       270       280         290
pF1KE0 M-----SRHSSGPR-RNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQ--CDVL
       .     .  ... : : .   ..::.:. .:: ::. :: : ..:::::: ::   : ::
CCDS12 LPARPGTAGTTSTRARRKPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLDVACPARTCPVL
         230       240       250       260       270       280     

              300       310       320       330       340       350
pF1KE0 AYEKFFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNH
            :: ::  :: .:::::.  ....  .. ...:: :      :. ::..:::.   
CCDS12 LQADPFLGLAMANSLLNPIIYTLTNRDLRHALLRLVCCGRHSCGRDPS-GSQQSASAAEA
         290       300       310       320       330        340    

              360                                            
pF1KE0 TILAGVHSNDHSVV                                        
                                                             
CCDS12 SGGLRRCLPPGLDGSFSGSERSSPQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD
          350       360       370       380       390        

>>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19              (384 aa)
 initn: 578 init1: 210 opt: 566  Z-score: 436.2  bits: 89.4 E(32554): 5.7e-18
Smith-Waterman score: 566; 35.0% identity (63.5% similar) in 337 aa overlap (1-328:1-324)

               10        20        30        40            50      
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLA----TEWNTVSKLVMGLG
       : : .: .   :  :..: .     ... :.. ::.::. ::     : . .. :  ::.
CCDS12 MNATGTPVAPESCQQLAAGG-----HSRLIVLHYNHSGR-LAGRGGPEDGGLGAL-RGLS
               10        20             30         40         50   

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE0 ITVCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRL
       ...  ...: ::::..::  . : .  .:: ..:.. .:...: ::.  .. .:  : ::
CCDS12 VAASCLVVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRL
            60        70        80        90       100       110   

        120       130       140       150       160        170     
pF1KE0 TVSTWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNR-RVVVVIVVIWTMA
       . . :.::.::. :.:.::. .::  : ::  :. :   ..  ..  ::   : . : .:
CCDS12 APAQWFLREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLA
           120       130       140       150       160       170   

         180       190       200        210       220       230    
pF1KE0 IVMGAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVF-WAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQ
        ..: .: .::::.: .. ::.. ::::  :..:  .::  :  ..:  ::. ::  :. 
CCDS12 ALLGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMG-LYGAIFRLVQA
           180       190       200       210       220        230  

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE0 RTMRMSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCDVLAYEK
         ..  :  .. :. :     :::::...: ::..:: : . ::: ::   .  .  : .
CCDS12 SGQKAPR-PAARRKAR----RLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLR
             240           250       260       270       280       

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE0 ---FFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHT
          ..: :: .:::.::::::.:..:.  .  ..:::                       
CCDS12 GMDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSG
       290       300       310       320       330       340       

             360                            
pF1KE0 ILAGVHSNDHSVV                        
                                            
CCDS12 ASTTDSSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
       350       360       370       380    

>>CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19              (353 aa)
 initn: 615 init1: 425 opt: 546  Z-score: 422.0  bits: 86.6 E(32554): 3.5e-17
Smith-Waterman score: 687; 34.5% identity (67.7% similar) in 322 aa overlap (34-352:18-326)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KE0 ISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVCIFI
                                     :: . . : :. .:  ... .. . .:  :
CCDS12              MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAI
                            10        20        30        40       

            70        80        90       100       110       120   
pF1KE0 MLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVSTWLL
       .. ::::..:.  : .::  .: ...::::.:..::.:.    . .:  : :::   :. 
CCDS12 VVENLLVLIAVARNSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFA
        50        60        70        80        90       100       

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE0 RQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGAIPS
       :.:    .:.::: .:::::::::... ...:.   .. :....: . : ...:.:..: 
CCDS12 REGSAFITLSASVFSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPI
       110       120       130       140       150       160       

           190       200        210       220       230       240  
pF1KE0 VGWNCICDIENCSNMAPLYSDSY-LVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMSRH
       .::::.  .: ::.. :::.  : :   .::... ....:.::..:.  ::.    :.  
CCDS12 LGWNCLGHLEACSTVLPLYAKHYVLCVVTIFSII-LLAIVALYVRIYCVVRSSHADMA--
       170       180       190       200        210       220      

            250       260       270       280         290       300
pF1KE0 SSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCP--QCDVLAYEKFFLLLA
         .:.      ..:::::.::::.::.:: :.. .::::  ::  .: .:   ..:. ..
CCDS12 --APQ-----TLALLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLDYACPVHSCPILYKAHYFFAVS
                 230       240       250       260       270       

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 EFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSND
        .:: .::.::..:....     . : : :   :   ..:  :...  .: .        
CCDS12 TLNSLLNPVIYTWRSRDLRREVLRPLQCWR---PGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSL
       280       290       300          310       320       330    

                          
pF1KE0 HSVV               
                          
CCDS12 ERGMHMPTSPTFLEGNTVV
          340       350   

>>CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1                  (330 aa)
 initn: 301 init1: 143 opt: 442  Z-score: 347.0  bits: 72.7 E(32554): 5.2e-13
Smith-Waterman score: 442; 29.6% identity (61.3% similar) in 297 aa overlap (57-342:45-329)

         30        40        50        60           70        80   
pF1KE0 NESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVCI---FIMLANLLVMVAIYVNRRFHFP
                                     ...::   ..   : ::.. :  .  :. :
CCDS30 GSGNVNVSSVGPAEGPTGPAAPLPSPKAWDVVLCISGTLVSCENALVVAIIVGTPAFRAP
           20        30        40        50        60        70    

            90       100          110       120       130       140
pF1KE0 IYYLMANLAAADFFAGLA---YFYLMFNTGPNTRRLTVSTWLLRQGLIDTSLTASVANLL
       .. :...::.::..:::.   .:  .:  :     :..       :..  ..:::...::
CCDS30 MFLLVGSLAVADLLAGLGLVLHFAAVFCIGSAEMSLVLV------GVLAMAFTASIGSLL
           80        90       100       110             120        

              150        160       170       180       190         
pF1KE0 AIAIERHITVFR-MQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGAIPSVGWNCICDIENCSNMA
       ::...:.....  .  ... .  :. :.....:  :. .: .: ..:::.  . .:. . 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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