Result of FASTA (omim) for pF1KE0577
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0577, 309 aa
  1>>>pF1KE0577 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1782+/-0.000549; mu= 22.3312+/- 0.034
 mean_var=104.9801+/-31.583, 0's: 0 Z-trim(106.7): 260  B-trim: 1001 in 1/49
 Lambda= 0.125176
 statistics sampled from 14434 (14832) to 14434 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.508), E-opt: 0.2 (0.174), width:  16
 Scan time:  4.430

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1022 196.1 7.6e-50
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  964 185.6 1.1e-46
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  890 172.3 1.1e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  851 165.2 1.5e-40
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  847 164.5 2.5e-40
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312)  845 164.1 3.2e-40
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312)  845 164.1 3.2e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322)  845 164.2 3.2e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  837 162.7 8.6e-40
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312)  828 161.1 2.7e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  823 160.2 4.9e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312)  816 158.9 1.2e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  807 157.3 3.6e-38
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  792 154.6 2.4e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  784 153.1 6.6e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  768 150.3 4.9e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  768 150.3 4.9e-36
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  768 150.3 4.9e-36
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  756 148.1 2.2e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  715 140.7 3.7e-33
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  487 99.5 9.3e-21
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  463 95.2 1.9e-19
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor  ( 428)  213 50.2 8.5e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382)  199 47.6 4.6e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382)  199 47.6 4.6e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345)  189 45.7 0.00015
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380)  186 45.3 0.00024
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409)  186 45.3 0.00024
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350)  178 43.8 0.00061
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306)  177 43.5 0.00065
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444)  178 43.9  0.0007
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351)  177 43.6  0.0007
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461)  178 44.0 0.00071
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389)  172 42.8  0.0014
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425)  172 42.8  0.0014
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425)  172 42.8  0.0014
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425)  172 42.8  0.0014
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339)  168 41.9  0.0021
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339)  168 41.9  0.0021
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367)  168 42.0  0.0022
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367)  168 42.0  0.0022
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367)  168 42.0  0.0022
NP_110387 (OMIM: 605146) sphingosine 1-phosphate r ( 398)  163 41.2  0.0043
NP_001159687 (OMIM: 605146) sphingosine 1-phosphat ( 398)  163 41.2  0.0043
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398)  163 41.2  0.0043
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398)  163 41.2  0.0043
NP_848566 (OMIM: 300513) glucose-dependent insulin ( 335)  161 40.7   0.005
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348)  160 40.5  0.0058
XP_016864712 (OMIM: 600933) PREDICTED: proteinase- ( 383)  160 40.6  0.0061
NP_005233 (OMIM: 600933) proteinase-activated rece ( 397)  160 40.6  0.0062


>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo   (314 aa)
 initn: 1039 init1: 1007 opt: 1022  Z-score: 1015.9  bits: 196.1 E(85289): 7.6e-50
Smith-Waterman score: 1022; 48.4% identity (76.9% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
       :..  :.:.::.  .::  ..  .:. ..:  .. :::::  .:...:: .: .::.:.:
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
       :::..:: ::..: :::.:.: ::.   . . ::. :.::::.::.:::.::::::: : 
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
              250       260       270       280       290       300

                     
pF1KE0 HALRRVIRK     
        : ..:.:      
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
              310    

>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 1012 init1: 954 opt: 964  Z-score: 959.3  bits: 185.6 E(85289): 1.1e-46
Smith-Waterman score: 964; 46.6% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (3-309:1-307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
         ... : : .::::: ::.:   :....:. :::.: .:..::::.:.::  : .:: :
NP_003   MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTP
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
       ::.::..:.: :.:.::.:::.::...:..   ::.: :. :.::: : :::::.:. .:
NP_003 MYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLM
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
       :::::.::: :::: ..::  .  .. . ... :.:. .:..: .  :.::  :.::.:.
NP_003 AYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFF
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
       :.   :::.::.   ..  .  :...   . ::..:. ::. :::.:.. .: .:: .::
NP_003 CDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAF
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
       :::..:: .. :.:.: :. :.::.:. . .:::: :.:::..::.:::.:::::.:.: 
NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
      240       250       260       270       280       290        

                       
pF1KE0 HALRRVIRK       
       .::  :: .       
NP_003 KALANVISRKRTSSFL
      300       310    

>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H  (311 aa)
 initn: 911 init1: 890 opt: 890  Z-score: 887.1  bits: 172.3 E(85289): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 890; 43.1% identity (74.0% similar) in 304 aa overlap (6-309:5-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
            :: : .: :.: :..: : .  ..:..:::.:. ... ::.:::::  : ::: :
NP_001  MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTP
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
       ::.::..:.: :.:  .: .:.:: :.:..   :... :: :...:.. . .:  :.. :
NP_001 MYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAM
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
       :::::.::::::::  .::  : . ..  .:. :.   : ... ::.: ::  :.:..:.
NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFF
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
       :.. ::. .::.   .  .:  :.  :. : . ..:.:::  . ..:.:  : :::::::
NP_001 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
       .::..:: .:::.: . ::.:.  .:: . . :.  :.:::..::.:::.:::::::.. 
NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
     240       250       260       270       280       290         

                   
pF1KE0 HALRRVIRK   
        ::.:. ..   
NP_001 DALKRLQKRKCC
     300       310 

>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor   (311 aa)
 initn: 830 init1: 800 opt: 851  Z-score: 849.0  bits: 165.2 E(85289): 1.5e-40
Smith-Waterman score: 851; 43.1% identity (70.5% similar) in 295 aa overlap (14-307:15-308)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0  MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHM
                     :.:.:... : :.:..::: :. ::.:..::: .:.: . : ::: 
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE0 PMYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVM
       :::.::..:.: : : .::  :..:::.      :: : :. :.::  . .:::: :::.
NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 MAYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYF
       :.::::.:.: :: : :.:  ..   :   :.: :: .  .: :. . . .:    . .:
NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200        210       220       230        
pF1KE0 YCEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGA-FIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSK
       .::.  :...::    .: : ..: .. :. :: :. :. ::  ..  ::. .:  : .:
NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIP-LILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
              190       200       210        220       230         

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 AFSTCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKK
       .:.::::::..:::..   . ::..: :: ..:: :  .::::.. : :::.::.:::: 
NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
     240       250       260       270       280       290         

      300          
pF1KE0 VMHALRRVIRK 
       :  :..:..   
NP_001 VRGAVKRLMGWE
     300       310 

>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo   (308 aa)
 initn: 817 init1: 702 opt: 847  Z-score: 845.1  bits: 164.5 E(85289): 2.5e-40
Smith-Waterman score: 847; 43.9% identity (72.6% similar) in 303 aa overlap (7-309:5-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
             :.: ::::.: ::.: :  . :.:.:.: :::.:..::: :: :.  : .:: :
NP_003   MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTP
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
       ::.:: .:...: : ::.:.:. ::..:..  .:... : ... ::   . :.: ::..:
NP_003 MYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVM
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
       .::::::::::: :: .:. :. .:: . :.. :.:  .: ....::: .   : : .:.
NP_003 SYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFF
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
       ::   :. .. .    . . ::..:. : .  .. :..:: :..  ..: ::  :  :::
NP_003 CEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAF
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
       ::::.::. : :.::. :. :. : :  ...:.:  :.::.:. :.:::.::::::: : 
NP_003 STCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVK
      240       250       260         270       280       290      

                   
pF1KE0 HALRRVIRK   
        :::.:  .   
NP_003 AALRKVATRNFP
        300        

>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (312 aa)
 initn: 847 init1: 828 opt: 845  Z-score: 843.1  bits: 164.1 E(85289): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 845; 41.6% identity (71.5% similar) in 305 aa overlap (3-307:1-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
         .:  :.. :.::.: ::. .:  . :.:: :: .:: :..::: .:. .  :  :: :
XP_011   MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTP
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
       ::.::..:.: : : : . .:.::.: . .:  ::.  :.::.::    .  . :::..:
XP_011 MYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVM
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
       :::..::.:.:: : . :...: : :..  .:.. :. :.:. :.  :.::  : : .:.
XP_011 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFF
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
       :..  :.:.::.   .: ..:.  ::...:  .. :. :: ..   .::  : ::: :::
XP_011 CDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
       ::::.::  : :.:.:.: .:  : :. . ..: . ...::.. :.::::::::::. . 
XP_011 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
      240       250       260       270       280       290        

                     
pF1KE0 HALRRVIRK     
        ::..:.       
XP_011 GALKKVVGRVVFSV
      300       310  

>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo   (312 aa)
 initn: 847 init1: 828 opt: 845  Z-score: 843.1  bits: 164.1 E(85289): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 845; 41.6% identity (71.5% similar) in 305 aa overlap (3-307:1-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
         .:  :.. :.::.: ::. .:  . :.:: :: .:: :..::: .:. .  :  :: :
NP_036   MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTP
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
       ::.::..:.: : : : . .:.::.: . .:  ::.  :.::.::    .  . :::..:
NP_036 MYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVM
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
       :::..::.:.:: : . :...: : :..  .:.. :. :.:. :.  :.::  : : .:.
NP_036 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFF
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
       :..  :.:.::.   .: ..:.  ::...:  .. :. :: ..   .::  : ::: :::
NP_036 CDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
       ::::.::  : :.:.:.: .:  : :. . ..: . ...::.. :.::::::::::. . 
NP_036 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
      240       250       260       270       280       290        

                     
pF1KE0 HALRRVIRK     
        ::..:.       
NP_036 GALKKVVGRVVFSV
      300       310  

>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (322 aa)
 initn: 847 init1: 828 opt: 845  Z-score: 843.0  bits: 164.2 E(85289): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 845; 41.6% identity (71.5% similar) in 305 aa overlap (3-307:11-315)

                       10        20        30        40        50  
pF1KE0         MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIW
                 .:  :.. :.::.: ::. .:  . :.:: :: .:: :..::: .:. . 
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE0 NDPHLHMPMYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATT
        :  :: :::.::..:.: : : : . .:.::.: . .:  ::.  :.::.::    .  
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE0 ECFLLVMMAYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCR
       . :::..::::..::.:.:: : . :...: : :..  .:.. :. :.:. :.  :.:: 
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE0 FNIIHYFYCEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKS
        : : .:.:..  :.:.::.   .: ..:.  ::...:  .. :. :: ..   .::  :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
              190       200       210       220       230       240

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE0 EKGRSKAFSTCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIY
        ::: :::::::.::  : :.:.:.: .:  : :. . ..: . ...::.. :.::::::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
              250       260       270       280       290       300

            300              
pF1KE0 SLRNKKVMHALRRVIRK     
       ::::. .  ::..:.       
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
              310       320  

>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo   (312 aa)
 initn: 798 init1: 798 opt: 837  Z-score: 835.3  bits: 162.7 E(85289): 8.6e-40
Smith-Waterman score: 837; 41.3% identity (73.3% similar) in 303 aa overlap (7-309:3-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
             :.. .  :.: :....: :.  .::: :. ::.:.:::  .:.:   ::.:: :
NP_009     MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSP
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
       ::.::..:.: : : .:: .:.::::.      ::. .: .:...: : .::::.::..:
NP_009 MYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
       :.:::::.:.:: : ...  .:  :: :...:::... .:..   :.: ::    .  : 
NP_009 AFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFV
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
       ::.  :...::.  : : ... . ..:: .  :  :..::  . . .:. .: ::: :::
NP_009 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAF
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pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
       .::..::  :.:.:...: .:..: .  :... : ..:::..  : :::.::.::::.: 
NP_009 GTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVT
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pF1KE0 HALRRVIRK       
       .:.::.. :       
NP_009 RAFRRLLGKEMGLTQS
        300       310  

>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo   (312 aa)
 initn: 787 init1: 715 opt: 828  Z-score: 826.5  bits: 161.1 E(85289): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 828; 41.8% identity (73.4% similar) in 304 aa overlap (6-309:4-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
            ::..  .::.: :... :  . ..: .:: .::.:.:::. .:. : .: .:: :
NP_002   MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTP
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pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
       .:.::..:.:.:    :.  :.::::. ...  :: : :.::.::..: .. . ..:..:
NP_002 VYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVM
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pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
       ::::::::: :: : . :: ::   :::. .:.. :. :.:. :. :.:::    :::..
NP_002 AYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIF
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pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
       ::.  :....:.. .::  ...  : :: .  .  .::::. ..  ::.  : . . :::
NP_002 CEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAF
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pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
       :::..:: .:::.:::: ..:..:    .  .:.: ...:... :..:::::::::: . 
NP_002 STCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSV-KDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMH
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pF1KE0 HALRRVIRK      
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NP_002 GALGRLLDKHFKRLT
       300       310  




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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