Result of FASTA (ccds) for pF1KE0575
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0575, 352 aa
  1>>>pF1KE0575 352 - 352 aa - 352 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5672+/-0.000821; mu= 15.2105+/- 0.049
 mean_var=82.0985+/-16.472, 0's: 0 Z-trim(108.7): 83  B-trim: 2 in 1/52
 Lambda= 0.141549
 statistics sampled from 10304 (10390) to 10304 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.319), width:  16
 Scan time:  2.380

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19       ( 444)  890 191.4 1.2e-48
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19       ( 466)  679 148.4 1.2e-35
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19       ( 483)  679 148.4 1.2e-35
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19       ( 510)  673 147.2 2.9e-35
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19       ( 597)  673 147.2 3.3e-35
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19       ( 598)  673 147.2 3.3e-35
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19       ( 489)  644 141.2 1.7e-33
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 634)  641 140.7 3.2e-33
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 650)  641 140.7 3.3e-33
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 651)  641 140.7 3.3e-33
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 651)  641 140.7 3.3e-33
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 652)  641 140.7 3.3e-33
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19       ( 481)  637 139.8 4.5e-33
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19       ( 631)  638 140.1 4.9e-33
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19       ( 632)  638 140.1 4.9e-33
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19       ( 454)  628 137.9 1.5e-32
CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19       ( 341)  583 128.7 7.2e-30
CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19       ( 348)  565 125.0 9.4e-29
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19       ( 499)  565 125.1 1.2e-28
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19       ( 590)  535 119.0 9.9e-27
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19       ( 591)  535 119.0 9.9e-27
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19       ( 273)  519 115.5 5.2e-26
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19       ( 342)  519 115.6 6.2e-26
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19       ( 438)  517 115.3   1e-25
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19       ( 455)  517 115.3   1e-25
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19       ( 482)  517 115.3 1.1e-25
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19     ( 410)  495 110.8 2.1e-24
CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19          ( 339)  470 105.6 6.3e-23
CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19          ( 620)  470 105.8   1e-22
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19      ( 299)  464 104.3 1.3e-22
CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19          ( 321)  449 101.3 1.2e-21
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19       ( 289)  432 97.8 1.2e-20
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19      ( 287)  408 92.9 3.6e-19
CCDS12907.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19          ( 287)  384 88.0 1.1e-17
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19       ( 491)  367 84.7 1.8e-16
CCDS42618.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19       ( 447)  345 80.2 3.8e-15
CCDS12902.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19       ( 448)  345 80.2 3.8e-15
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19          ( 287)  341 79.2 4.7e-15
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19          ( 303)  341 79.2 4.9e-15
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19          ( 304)  341 79.2   5e-15
CCDS14629.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX          (1336)  325 76.4 1.5e-13
CCDS55491.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX          (1341)  325 76.4 1.5e-13
CCDS42622.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19          ( 265)  314 73.7   2e-13
CCDS55490.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX          (1327)  320 75.4 3.1e-13
CCDS46173.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19       ( 271)  311 73.1 3.2e-13
CCDS12909.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19          ( 275)  311 73.1 3.2e-13


>>CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19            (444 aa)
 initn: 519 init1: 437 opt: 890  Z-score: 986.9  bits: 191.4 E(32554): 1.2e-48
Smith-Waterman score: 890; 46.3% identity (70.7% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-303)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAPKLITVLCLGFCLNQKICPHAGAQDKFSLSAWPSPVVPLGGRVTLSCHSHLRFVIWTI
       :.  .... :.:. : :.  :: :.:::  :::::: ::: ::.::: :: . ::  . .
CCDS42 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML
               10        20        30        40        50        60

               70         80        90       100        110        
pF1KE0 FQTTGTRSHELHTGL-SNNITISPVTPEHAGTYRCVGIYKHA-SKWSAESNSLKIIVTGL
       ..    .   .:  . ......::::  :::.: : : . :. . ::: :: . :.::: 
CCDS42 YKEDRIHIPIFHGRIFQESFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGN
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE0 FTKPSISAHPSSLVHAGARVSLRCHSELAFDEFILYKEGHIQHSQQLDQGMEAGIHYVEA
         :::. :::. ::..: :: :.: :.. :..:.:.:::  .  ..:   .. :.   .:
CCDS42 HRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVS--KA
              130       140       150       160       170          

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE0 VFSMGPVTPAHAGAYRCCGCFSHSRYEWSAPSDPLDIVITGKYKKPSLSTQVDPMMRLGE
        ::.::.  : ::.::: :  .:. :. ::::::::::.:: :.:::::.:  : .. ::
CCDS42 NFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGE
      180       190       200       210       220       230        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 KLTLFCSSEISFDQYHLFRHGVAHGQWLSGGQRHREAFQANFSVGRATPVPGGTYRCYGS
       ..:: :::. :.:.::: :.: :: . : . ..  ..:::.: .: ::   ::::::.::
CCDS42 SVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATH--GGTYRCFGS
      240       250       260       270       280         290      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE0 FNDSPYKPPVTRCNFTPQETLRVLLCHSQNPPLNLTHLALKDSPATCICSLDSQ      
       :  :::.                                                     
CCDS42 FRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLL
        300       310       320       330       340       350      

>>CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19            (466 aa)
 initn: 611 init1: 346 opt: 679  Z-score: 753.7  bits: 148.4 E(32554): 1.2e-35
Smith-Waterman score: 679; 38.3% identity (66.2% similar) in 311 aa overlap (1-307:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAPKLITVLCLGFCLNQKICPHAGAQDKFSLSAWPSPVVPLGGRVTLSCHSHLRFVIWTI
       :.: : ...:::. :. .   .::   : .: : :. :.  :. ::: :.. :.   . .
CCDS12 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVIIQGSPVTLRCQGSLQAEEYHL
               10        20        30        40        50        60

                  70        80        90       100       110       
pF1KE0 FQTTGTRS---HELHTGLSNNITISPVTPEHAGTYRCVGIYKHASKWSAESNSLKIIVTG
       .. . . :   .  . : .... :  .: :::: :.:   :.:  . :  :. :...:::
CCDS12 YRENKSASWVRRIQEPGKNGQFPIPSITWEHAGRYHC-QYYSHNHS-SEYSDPLELVVTG
               70        80        90        100        110        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE0 LFTKPSISAHPSSLVHAGARVSLRCHSELAFDEFILYKEGHIQHSQQLDQGMEAGIHYVE
        ..::..:: :: .: .:. :.:.: :..::: ::: :::. .: :.:..  .:   .  
CCDS12 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTLQCVSQVAFDGFILCKEGEDEHPQRLNSHSHAR-GWSW
      120       130       140       150       160       170        

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE0 AVFSMGPVTPAHAGAYRCCGCFSHSRYEWSAPSDPLDIVITGKYKKPSLSTQVDPMMRLG
       :.::.:::.:..  .::: .  :.: : :: ::: :.... :  ::::::.:  ::.  :
CCDS12 AIFSVGPVSPSRRWSYRCYAYDSNSPYVWSLPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPMVAPG
       180       190       200       210       220       230       

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE0 EKLTLFCSSEISFDQYHLFRHGVAHGQWLSGGQRHREAFQANFSVGRATPVPGGTYRCYG
       :.::: : :....:.. :...:        : : .    ::::..: ..:  :: ::::.
CCDS12 ESLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGWQPQAGLSQANFTLGPVSPSHGGQYRCYS
       240       250       260       270       280       290       

       300        310       320       330       340       350      
pF1KE0 SFN-DSPYKPPVTRCNFTPQETLRVLLCHSQNPPLNLTHLALKDSPATCICSLDSQ    
       . : .: .. :                                                 
CCDS12 AHNLSSEWSAPSDPLDILITGQFYDRPSLSVQPVPTVAPGKNVTLLCQSRGQFHTFLLTK
       300       310       320       330       340       350       

>>CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19            (483 aa)
 initn: 611 init1: 346 opt: 679  Z-score: 753.5  bits: 148.4 E(32554): 1.2e-35
Smith-Waterman score: 679; 38.3% identity (66.2% similar) in 311 aa overlap (1-307:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAPKLITVLCLGFCLNQKICPHAGAQDKFSLSAWPSPVVPLGGRVTLSCHSHLRFVIWTI
       :.: : ...:::. :. .   .::   : .: : :. :.  :. ::: :.. :.   . .
CCDS46 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVIIQGSPVTLRCQGSLQAEEYHL
               10        20        30        40        50        60

                  70        80        90       100       110       
pF1KE0 FQTTGTRS---HELHTGLSNNITISPVTPEHAGTYRCVGIYKHASKWSAESNSLKIIVTG
       .. . . :   .  . : .... :  .: :::: :.:   :.:  . :  :. :...:::
CCDS46 YRENKSASWVRRIQEPGKNGQFPIPSITWEHAGRYHC-QYYSHNHS-SEYSDPLELVVTG
               70        80        90        100        110        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE0 LFTKPSISAHPSSLVHAGARVSLRCHSELAFDEFILYKEGHIQHSQQLDQGMEAGIHYVE
        ..::..:: :: .: .:. :.:.: :..::: ::: :::. .: :.:..  .:   .  
CCDS46 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTLQCVSQVAFDGFILCKEGEDEHPQRLNSHSHAR-GWSW
      120       130       140       150       160       170        

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE0 AVFSMGPVTPAHAGAYRCCGCFSHSRYEWSAPSDPLDIVITGKYKKPSLSTQVDPMMRLG
       :.::.:::.:..  .::: .  :.: : :: ::: :.... :  ::::::.:  ::.  :
CCDS46 AIFSVGPVSPSRRWSYRCYAYDSNSPYVWSLPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPMVAPG
       180       190       200       210       220       230       

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE0 EKLTLFCSSEISFDQYHLFRHGVAHGQWLSGGQRHREAFQANFSVGRATPVPGGTYRCYG
       :.::: : :....:.. :...:        : : .    ::::..: ..:  :: ::::.
CCDS46 ESLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGWQPQAGLSQANFTLGPVSPSHGGQYRCYS
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KE0 SFN-DSPYKPPVTRCNFTPQETLRVLLCHSQNPPLNLTHLALKDSPATCICSLDSQ    
       . : .: .. :                                                 
CCDS46 AHNLSSEWSAPSDPLDILITGQFYDRPSLSVQPVPTVAPGKNVTLLCQSRGQFHTFLLTK
       300       310       320       330       340       350       

>>CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19            (510 aa)
 initn: 808 init1: 346 opt: 673  Z-score: 746.6  bits: 147.2 E(32554): 2.9e-35
Smith-Waterman score: 673; 36.7% identity (65.1% similar) in 327 aa overlap (1-323:1-317)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAPKLITVLCLGFCLNQKICPHAGAQDKFSLSAWPSPVVPLGGRVTLSCHSHLRFVIWTI
       :.: . ...:::. :. .   ..:.  : .: : :. :.  :. :::::.. :.   . .
CCDS62 MTPIVTVLICLGLSLGPRTRVQTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRL
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       ..   . :   ...  : .:  . :  .: ::.: : :   :   ..::  :. : ...:
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       : . ::..::.:: .: .:.::.:.:.:..::  ::: :::. .: : :..  .:     
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       .:.::.:::.: .  ..:: :   .: : ::.::: :.... :  ::::::.:  :.:  
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       ::.::: : :....:.. :...:    . : : : .    ::::..: ..   :: ::::
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pF1KE0 GSFNDSPYKPPVTRCNFTPQETLRVLLCHSQNPPLNLTHLALKDSPATCICSLDSQ    
       :. : :      ..:. .:.. : .:.                                 
CCDS62 GAHNLS------SECS-APSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQ
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>>CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19            (597 aa)
 initn: 808 init1: 346 opt: 673  Z-score: 745.6  bits: 147.2 E(32554): 3.3e-35
Smith-Waterman score: 673; 36.7% identity (65.1% similar) in 327 aa overlap (1-323:1-317)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAPKLITVLCLGFCLNQKICPHAGAQDKFSLSAWPSPVVPLGGRVTLSCHSHLRFVIWTI
       :.: . ...:::. :. .   ..:.  : .: : :. :.  :. :::::.. :.   . .
CCDS42 MTPIVTVLICLGLSLGPRTRVQTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRL
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       ..   . :   ...  : .:  . :  .: ::.: : :   :   ..::  :. : ...:
CCDS42 YREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQ--YYSRARWSELSDPLVLVMT
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       : . ::..::.:: .: .:.::.:.:.:..::  ::: :::. .: : :..  .:     
CCDS42 GAYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHAR-GSS
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       .:.::.:::.: .  ..:: :   .: : ::.::: :.... :  ::::::.:  :.:  
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       ::.::: : :....:.. :...:    . : : : .    ::::..: ..   :: ::::
CCDS42 GESLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCY
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pF1KE0 GSFNDSPYKPPVTRCNFTPQETLRVLLCHSQNPPLNLTHLALKDSPATCICSLDSQ    
       :. : :      ..:. .:.. : .:.                                 
CCDS42 GAHNLS------SECS-APSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQ
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>>CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19            (598 aa)
 initn: 808 init1: 346 opt: 673  Z-score: 745.6  bits: 147.2 E(32554): 3.3e-35
Smith-Waterman score: 673; 36.7% identity (65.1% similar) in 327 aa overlap (1-323:1-317)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAPKLITVLCLGFCLNQKICPHAGAQDKFSLSAWPSPVVPLGGRVTLSCHSHLRFVIWTI
       :.: . ...:::. :. .   ..:.  : .: : :. :.  :. :::::.. :.   . .
CCDS12 MTPIVTVLICLGLSLGPRTRVQTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRL
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pF1KE0 FQTTGTRS--HELHTGLSNN--ITISPVTPEHAGTYRCVGIYKHASKWSAESNSLKIIVT
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CCDS12 YREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQ--YYSRARWSELSDPLVLVMT
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pF1KE0 GLFTKPSISAHPSSLVHAGARVSLRCHSELAFDEFILYKEGHIQHSQQLDQGMEAGIHYV
       : . ::..::.:: .: .:.::.:.:.:..::  ::: :::. .: : :..  .:     
CCDS12 GAYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHAR-GSS
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pF1KE0 EAVFSMGPVTPAHAGAYRCCGCFSHSRYEWSAPSDPLDIVITGKYKKPSLSTQVDPMMRL
       .:.::.:::.: .  ..:: :   .: : ::.::: :.... :  ::::::.:  :.:  
CCDS12 RAIFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVMAP
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pF1KE0 GEKLTLFCSSEISFDQYHLFRHGVAHGQWLSGGQRHREAFQANFSVGRATPVPGGTYRCY
       ::.::: : :....:.. :...:    . : : : .    ::::..: ..   :: ::::
CCDS12 GESLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCY
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pF1KE0 GSFNDSPYKPPVTRCNFTPQETLRVLLCHSQNPPLNLTHLALKDSPATCICSLDSQ    
       :. : :      ..:. .:.. : .:.                                 
CCDS12 GAHNLS------SECS-APSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQ
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>>CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19            (489 aa)
 initn: 618 init1: 338 opt: 644  Z-score: 714.8  bits: 141.2 E(32554): 1.7e-33
Smith-Waterman score: 644; 36.8% identity (64.1% similar) in 315 aa overlap (1-307:1-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAPKLITVLCLGFCLNQKICPHAGAQDKFSLSAWPSPVVPLGGRVTLSCHSHLRFVIWTI
       :.: . ...:: . :. .   .::.  : .: : :. :.  :. ::: :.. :.   . .
CCDS12 MTPIVTVLICLRLSLGPRTHVQAGTLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLWCQGILETQEYRL
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pF1KE0 FQTTGTRSHELHTGLSNNIT------ISPVTPEHAGTYRCVGIYKHASKWSAESNSLKII
       ..    ..    : . ..:.      :  .: ::.: :::    .:.. ::  :. :...
CCDS12 YREK--KTAPWITRIPQEIVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCF-YGSHTAGWSEPSDPLELV
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pF1KE0 VTGLFTKPSISAHPSSLVHAGARVSLRCHSELAFDEFILYKEGHIQHSQQLD-QGMEAGI
       ::: . ::..:: :: .: .:. :.:.: :..::  ::: :::. .: : :. :    : 
CCDS12 VTGAYIKPTLSALPSPVVTSGGNVTLHCVSQVAFGSFILCKEGEDEHPQCLNSQPRTHG-
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pF1KE0 HYVEAVFSMGPVTPAHAGAYRCCGCFSHSRYEWSAPSDPLDIVITGKYKKPSLSTQVDPM
        . .:.::.:::.:..  .::: .  :.: . :: ::: :.... :  ::::::.:  :.
CCDS12 -WSRAIFSVGPVSPSRRWSYRCYAYDSNSPHVWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPI
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pF1KE0 MRLGEKLTLFCSSEISFDQYHLFRHGVAHGQWLSGGQRHREAFQANFSVGRATPVPGGTY
       .  ::.::: : :..:.:.. :...:      : : : .    ::::..: ..   :: :
CCDS12 VAPGESLTLQCVSDVSYDRFVLYKEGERDFLQLPGPQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQY
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pF1KE0 RCYGSFN-DSPYKPPVTRCNFTPQETLRVLLCHSQNPPLNLTHLALKDSPATCICSLDSQ
       :: :..: .: .. :                                             
CCDS12 RCSGAYNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFRGRPFISVHPGPTVASGENVTLLCQSWGPFHTF
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>>CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19            (634 aa)
 initn: 597 init1: 331 opt: 641  Z-score: 709.9  bits: 140.7 E(32554): 3.2e-33
Smith-Waterman score: 641; 37.4% identity (63.9% similar) in 313 aa overlap (1-307:1-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAPKLITVLCLGFCLNQKICPHAGAQDKFSLSAWPSPVVPLGGRVTLSCHSHLRFVIWTI
       :.: : ...:::. :. .   .::   : .: : :. :.  :. ::: :..  .   . .
CCDS62 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL
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pF1KE0 FQTTGTRS--HELHTGL--SNNITISPVTPEHAGTYRCVGIYKHASKWSAESNSLKIIVT
       ..   :     ..   :  .... :  .: ::.: :::      :.. :  :. :...::
CCDS62 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGR-SESSDPLELVVT
               70        80        90       100        110         

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pF1KE0 GLFTKPSISAHPSSLVHAGARVSLRCHSELAFDEFILYKEGHIQHSQQLD-QGMEAGIHY
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CCDS62 GAYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSS-
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pF1KE0 VEAVFSMGPVTPAHAGAYRCCGCFSHSRYEWSAPSDPLDIVITGKYKKPSLSTQVDPMMR
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CCDS42 PEETLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRC
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       300       310       320       330       340       350       




352 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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