Result of FASTA (omim) for pF1KE0564
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0564, 448 aa
  1>>>pF1KE0564 448 - 448 aa - 448 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1161+/-0.000479; mu= 0.0158+/- 0.029
 mean_var=273.8983+/-54.827, 0's: 0 Z-trim(117.8): 150  B-trim: 502 in 2/53
 Lambda= 0.077496
 statistics sampled from 29909 (30073) to 29909 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.353), width:  16
 Scan time:  8.600

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 3005 349.7 9.2e-96
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1899 226.0 1.6e-58
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1899 226.0 1.6e-58
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1885 224.5 4.7e-58
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1819 217.1 7.2e-56
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1754 209.8 1.1e-53
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1752 209.6 1.3e-53
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1731 207.2 6.8e-53
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1718 205.8 1.8e-52
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 1588 191.3 4.4e-48
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 1588 191.3 4.8e-48
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 1564 188.6 3.1e-47
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 1552 187.3 7.5e-47
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 1513 182.9 1.5e-45
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1227 150.9 6.6e-36
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1220 150.1 1.1e-35
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1208 148.7 2.6e-35
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1201 148.0 4.7e-35
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1190 146.8 1.2e-34
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1188 146.5 1.3e-34
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1188 146.6 1.3e-34
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1176 145.2 3.4e-34
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1165 144.0 7.4e-34
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1115 138.5 4.5e-32
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1115 138.5 4.7e-32
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1087 135.3 3.5e-31
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1027 128.5 3.3e-29
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459)  996 125.1 3.9e-28
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464)  984 123.8 9.9e-28
XP_011523088 (OMIM: 602761) PREDICTED: keratin, ty ( 245)  974 122.4 1.4e-27
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494)  980 123.3 1.4e-27
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448)  979 123.2 1.4e-27
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450)  979 123.2 1.4e-27
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525)  980 123.4 1.5e-27
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430)  961 121.2 5.6e-27
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430)  961 121.2 5.6e-27
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623)  909 115.5 4.1e-25
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468)  904 114.8 4.9e-25
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422)  892 113.4 1.2e-24
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422)  889 113.1 1.5e-24
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427)  857 109.5 1.7e-23
XP_011522641 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 289)  779 100.6 5.6e-21
NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285)  701 91.9 2.3e-18
XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285)  701 91.9 2.3e-18
XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285)  701 91.9 2.3e-18
NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431)  608 81.7 4.2e-15
NP_002046 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillary a ( 432)  608 81.7 4.2e-15
NP_001229305 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 438)  608 81.7 4.3e-15
XP_016879940 (OMIM: 137780,203450) PREDICTED: glia ( 472)  608 81.7 4.5e-15
NP_005373 (OMIM: 162250) neurofilament medium poly ( 916)  595 80.6   2e-14


>>NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular Ha2  (448 aa)
 initn: 3005 init1: 3005 opt: 3005  Z-score: 1840.2  bits: 349.7 E(85289): 9.2e-96
Smith-Waterman score: 3005; 100.0% identity (100.0% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-448)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLPSVCLPTTFRPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLPSVCLPTTFRPAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 CLSKTYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CLSKTYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 NAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAKLAADD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAKLAADD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 FRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVGS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 LRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELNQQVAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELNQQVAT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 SSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 VEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTPSCTTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTPSCTTC
              370       380       390       400       410       420

              430       440        
pF1KE0 VPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
       ::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
              430       440        

>>XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, type I  (455 aa)
 initn: 1943 init1: 1798 opt: 1899  Z-score: 1171.8  bits: 226.0 E(85289): 1.6e-58
Smith-Waterman score: 1915; 67.0% identity (82.3% similar) in 464 aa overlap (1-448:1-455)

               10        20        30          40        50        
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNC--RPELCLGYVCQPMACLPSVCLP----T
       :.:.:  ..  ..:::: :  ::  :. :.       :     .:.:   :.:      .
XP_011 MASKCLKAGFSSGSLKS-PGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRS
               10         20        30        40        50         

           60        70        80         90       100       110   
pF1KE0 TFRPASCLSKTYLSSSCQAASGISGSM-GPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTR
       ..: .:::        :  :.:.. :. : :.:..:: ..:::::::: ::::::.:: .
XP_011 SYRATSCLPAL-----CLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEK
      60        70             80        90       100       110    

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE0 VRQLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDN
       ::::::::: :::::.:  ..::  : :::::.::::::::.: ::.::::::.::.:::
XP_011 VRQLEQENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDN
          120       130       140       150       160       170    

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE0 AKLAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKN
       :::::::::.:::.:...:::::.::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::
XP_011 AKLAADDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKN
          180       190       200       210       220       230    

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE0 HEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEE
       :::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::..:: ::::.:.:.. : ::
XP_011 HEEEVNSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEE
          240       250       260       270       280       290    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE0 LNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQ
       :::::..::::::. :..::.::::::.::::::::::.::.::.::.:.::::::::::
XP_011 LNQQVVSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQ
          300       310       320       330       340       350    

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE0 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.:: :::::::.
XP_011 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCA
          360       370       380       390       400       410    

                420           430       440        
pF1KE0 ---TPS--CTTCVPSP-CVP---RTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
          .::  :  :.:.  : :   :: : :: .   : ::: ::.
XP_011 PDYSPSKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPI---CVPCPGGRF
          420       430       440          450     

>>NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular Ha5  (455 aa)
 initn: 1943 init1: 1798 opt: 1899  Z-score: 1171.8  bits: 226.0 E(85289): 1.6e-58
Smith-Waterman score: 1915; 67.0% identity (82.3% similar) in 464 aa overlap (1-448:1-455)

               10        20        30          40        50        
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNC--RPELCLGYVCQPMACLPSVCLP----T
       :.:.:  ..  ..:::: :  ::  :. :.       :     .:.:   :.:      .
NP_002 MASKCLKAGFSSGSLKS-PGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRS
               10         20        30        40        50         

           60        70        80         90       100       110   
pF1KE0 TFRPASCLSKTYLSSSCQAASGISGSM-GPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTR
       ..: .:::        :  :.:.. :. : :.:..:: ..:::::::: ::::::.:: .
NP_002 SYRATSCLPAL-----CLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEK
      60        70             80        90       100       110    

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE0 VRQLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDN
       ::::::::: :::::.:  ..::  : :::::.::::::::.: ::.::::::.::.:::
NP_002 VRQLEQENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDN
          120       130       140       150       160       170    

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE0 AKLAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKN
       :::::::::.:::.:...:::::.::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::
NP_002 AKLAADDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKN
          180       190       200       210       220       230    

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE0 HEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEE
       :::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::..:: ::::.:.:.. : ::
NP_002 HEEEVNSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEE
          240       250       260       270       280       290    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE0 LNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQ
       :::::..::::::. :..::.::::::.::::::::::.::.::.::.:.::::::::::
NP_002 LNQQVVSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQ
          300       310       320       330       340       350    

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE0 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.:: :::::::.
NP_002 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCA
          360       370       380       390       400       410    

                420           430       440        
pF1KE0 ---TPS--CTTCVPSP-CVP---RTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
          .::  :  :.:.  : :   :: : :: .   : ::: ::.
NP_002 PDYSPSKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPI---CVPCPGGRF
          420       430       440          450     

>>NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular Ha6  (467 aa)
 initn: 1930 init1: 1765 opt: 1885  Z-score: 1163.2  bits: 224.5 E(85289): 4.7e-58
Smith-Waterman score: 1896; 66.4% identity (82.9% similar) in 455 aa overlap (1-445:1-438)

               10               20        30           40        50
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKS-C------PRPASVCSSGVNCR-PELC--LGYVCQPMACLPSV
       :... :. .   .:.:. :       : .:. : : .:: : :    ::. .  . : ..
NP_003 MATQTCTPTFSTGSIKGLCGTAGGISRVSSIRSVG-SCRVPSLAGAAGYISSARSGLSGL
               10        20        30         40        50         

               60        70        80        90       100       110
pF1KE0 CLPTTFRPASCLSKTYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASY
               .:::  .:::: :..    :: .: :.:. ::.:::.:::::::::::::.:
NP_003 --------GSCLPGSYLSSECHT----SGFVGSGGWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLANY
              60        70            80        90       100       

              120       130       140       150       160       170
pF1KE0 LTRVRQLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVN
       : .:::::.:::::::::::  . :.  . :::::.:.:::..::::: ::.::::.:..
NP_003 LEKVRQLERENAELESRIQEWYEFQIPYICPDYQSYFKTIEDFQQKILLTKSENARLVLQ
       110       120       130       140       150       160       

              180       190       200       210       220       230
pF1KE0 IDNAKLAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCL
       ::::::::::::.:::.::..::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
NP_003 IDNAKLAADDFRTKYETELSLRQLVEADINGLRRILDELTLCKADLEAQVESLKEELMCL
       170       180       190       200       210       220       

              240       250       260       270       280       290
pF1KE0 KKNHEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQ
       ::::::::. ::::::::::.::::::::::...::.:::::::.:: :::::: ::: :
NP_003 KKNHEEEVSVLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNKILEDMRCQYEALVENNRRDVEAWFNTQ
       230       240       250       260       270       280       

              300       310       320       330       340       350
pF1KE0 MEELNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQ
        :::::::..::::::  :..::.::::::.::::::::::.:.:::.::.:.:::::::
NP_003 TEELNQQVVSSSEQLQCCQTEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRNSLESTLAETEARYSSQ
       290       300       310       320       330       340       

              360       370       380       390       400       410
pF1KE0 LAQMQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCN
       ::::::.:.::::::.::: :::::::::::::::.::::::: ::: :::.:::::: .
NP_003 LAQMQCLISNVEAQLSEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEIATYRHLLEGEDCKLPPQ
       350       360       370       380       390       400       

              420       430       440                              
pF1KE0 PCSTPSCTTCVPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY                      
       ::.: .:   .  : :: . :::   ..::.: ::                         
NP_003 PCAT-ACKPVIRVPSVPPVPCVP---SVPCTPAPQVGTQIRTITEEIRDGKVISSREHVQ
       410        420          430       440       450       460   

NP_003 SRPL
           

>>NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular Ha1  (416 aa)
 initn: 1889 init1: 1763 opt: 1819  Z-score: 1124.0  bits: 217.1 E(85289): 7.2e-56
Smith-Waterman score: 1819; 69.1% identity (87.4% similar) in 405 aa overlap (46-447:6-407)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KE0 KSCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLPSVCLPTTFRPASCLSKTYLSSSCQAAS
                                     ::::.   :.     :.  .  : .  .: 
NP_002                          MPYNFCLPSLSCRTSCSSRPCVPPSCHSCTLPGAC
                                        10        20        30     

          80        90       100       110       120       130     
pF1KE0 GISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQENAELESRIQEASHSQ
       .: ....  .:. ::.:::.:::::::::::::::: .:::::..:::::. :.: :..:
NP_002 NIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELENLIRERSQQQ
          40        50        60        70        80        90     

         140       150       160       170       180       190     
pF1KE0 VLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAKLAADDFRAKYEAELAMRQLV
          . :.:::.:.:::::::::::::.::::.::.::::::::::::.::..::..::::
NP_002 EPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCTKSENARLVVQIDNAKLAADDFRTKYQTELSLRQLV
         100       110       120       130       140       150     

         200       210       220       230       240       250     
pF1KE0 EADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDA
       :.::::::::::.:::::.:::::::::::::.:::.:::.::..::::::::::.::::
NP_002 ESDINGLRRILDELTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKSNHEQEVNTLRCQLGDRLNVEVDA
         160       170       180       190       200       210     

         260       270       280       290       300       310     
pF1KE0 APPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELNQQVATSSEQLQNYQSDIIDL
       :: :::.:::.: : ::::.::.:::.::.::. : ::::.::..::::::.::..::.:
NP_002 APTVDLNRVLNETRSQYEALVETNRREVEQWFTTQTEELNKQVVSSSEQLQSYQAEIIEL
         220       230       240       250       260       270     

         320       330       340       350       360       370     
pF1KE0 RRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITNVEAQLAEIRADLERQ
       :::::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.: .:::::.::::::.:::::
NP_002 RRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEARYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRSDLERQ
         280       290       300       310       320       330     

         380       390       400       410       420         430   
pF1KE0 NQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTPSCTTCVPSPCV--PRTVCVP
       ::::::::::::::: ::::::::::.:::.:: :::.: .  .   .::.  : : :::
NP_002 NQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCNLPSNPCATTNACSKPIGPCLSNPCTSCVP
         340       350       360       370       380       390     

           440                 
pF1KE0 RTVGMPCSPC-PQGRY        
        .   ::.:: :. :         
NP_002 PA---PCTPCAPRPRCGPCNSFVR
            400       410      

>>NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular Ha3  (404 aa)
 initn: 1770 init1: 1727 opt: 1754  Z-score: 1084.9  bits: 209.8 E(85289): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1754; 68.1% identity (86.1% similar) in 404 aa overlap (37-433:1-398)

         10        20        30        40          50        60    
pF1KE0 VTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQ-P-MACLPSVCLPTTFRPASCLSK
                                     ..: :  : ..:  : :      : :: . 
NP_004                               MSYSCGLPSLSCRTS-CSSRPCVPPSCHGC
                                             10         20         

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE0 TYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQENAEL
       : : ..:.  ...:.     .:. ::.:::.:::::::::::::::: .:::::..::::
NP_004 T-LPGACNIPANVSNC----NWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAEL
      30         40            50        60        70        80    

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE0 ESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAKLAADDFRAK
       :. :.: :..:   .  .:::.:.:::::::::::.:.::::.::.:::::::.::::.:
NP_004 ENLIRERSQQQEPLVCASYQSYFKTIEELQQKILCSKSENARLVVQIDNAKLASDDFRTK
           90       100       110       120       130       140    

          190       200       210       220       230       240    
pF1KE0 YEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVGSLRCQ
       ::.::..:::::.::::::::::.::::..:::::::::::::.:::.:::.::..::::
NP_004 YETELSLRQLVESDINGLRRILDELTLCRSDLEAQVESLKEELLCLKQNHEQEVNTLRCQ
          150       160       170       180       190       200    

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE0 LGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELNQQVATSSEQ
       ::::::.:::::: :::..::.: : ::::.::.:::.::.::  : ::::.::..::::
NP_004 LGDRLNVEVDAAPTVDLNQVLNETRSQYEALVETNRREVEQWFATQTEELNKQVVSSSEQ
          210       220       230       240       250       260    

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE0 LQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITNVEAQ
       ::.::..::.::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.: .:::::.:
NP_004 LQSYQAEIIELRRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEARYSSQLSQVQRLITNVESQ
          270       280       290       300       310       320    

          370       380       390       400       410              
pF1KE0 LAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTPS-CTT----
       :::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::: :::.: . :      
NP_004 LAEIRSDLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCKLPSNPCATTNACDKSTGP
          330       340       350       360       370       380    

     420       430       440        
pF1KE0 CVPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
       :. .::  :. : :               
NP_004 CISNPCGLRARCGPCNTFGY         
          390       400             

>>NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular Ha3  (404 aa)
 initn: 1755 init1: 1697 opt: 1752  Z-score: 1083.7  bits: 209.6 E(85289): 1.3e-53
Smith-Waterman score: 1752; 68.1% identity (87.2% similar) in 398 aa overlap (47-433:1-398)

         20        30        40         50        60        70     
pF1KE0 SCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLP-SVCLPTTFRPASCLSKTYLSSSCQA--
                                     .: . :::.    .:: :.  .  ::..  
NP_002                               MPYNFCLPSLSCRTSCSSRPCVPPSCHGYT
                                             10        20        30

               80        90       100       110       120       130
pF1KE0 ---ASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQENAELESRIQE
          : .: ....  .:. ::.:::.:::::::::::::::: .:::::..:::::. :.:
NP_002 LPGACNIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELENLIRE
               40        50        60        70        80        90

              140       150       160       170       180       190
pF1KE0 ASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAKLAADDFRAKYEAELA
        :..:   . :.:::.:.:::::::::::.:.::::.::.::::::::::::.::..: .
NP_002 RSQQQEPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCSKSENARLVVQIDNAKLAADDFRTKYQTEQS
              100       110       120       130       140       150

              200       210       220       230       240       250
pF1KE0 MRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVGSLRCQLGDRLN
       .:::::.:::.::::::.::::..:::::.:::::::. ::.:::.::..::::::::::
NP_002 LRQLVESDINSLRRILDELTLCRSDLEAQMESLKEELLSLKQNHEQEVNTLRCQLGDRLN
              160       170       180       190       200       210

              260       270       280       290       300       310
pF1KE0 IEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELNQQVATSSEQLQNYQS
       .:::::: :::..::.: : ::::.::.:::.::.::  : ::::.::..::::::.::.
NP_002 VEVDAAPAVDLNQVLNETRNQYEALVETNRREVEQWFATQTEELNKQVVSSSEQLQSYQA
              220       230       240       250       260       270

              320       330       340       350       360       370
pF1KE0 DIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITNVEAQLAEIRA
       .::.::::::.:::::::::.:: :::::::::::::::::.:.: .:::::.::::::.
NP_002 EIIELRRTVNALEIELQAQHNLRYSLENTLTESEARYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRS
              280       290       300       310       320       330

              380       390       400       410            420     
pF1KE0 DLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTPS-CT----TCVPSPC
       :::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::: :::.: . :     .:: .::
NP_002 DLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCKLPSNPCATTNACEKPIGSCVTNPC
              340       350       360       370       380       390

         430       440        
pF1KE0 VPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
        ::. : :               
NP_002 GPRSRCGPCNTFGY         
              400             

>>NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular Ha4  (436 aa)
 initn: 1710 init1: 1710 opt: 1731  Z-score: 1070.6  bits: 207.2 E(85289): 6.8e-53
Smith-Waterman score: 1731; 65.7% identity (83.8% similar) in 414 aa overlap (20-425:23-427)

                  10        20        30           40        50    
pF1KE0    MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNCRPELC---LGYVCQPMACLPSV----
                             .:: .  . ..:    :   ..: :    ::::.    
NP_066 MLYAKPPPTINGIKGLQRKERLKPAHIHLQQLTCFSITCSSTMSYSC----CLPSLGCRT
               10        20        30        40            50      

                60        70        80        90       100         
pF1KE0 -CLPTTFRPASCLSKTYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLAS
        :      : :: . : : ..:.  ...:.     .:. ::.:::.::::::::::::::
NP_066 SCSSRPCVPPSCHGYT-LPGACNIPANVSNC----NWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLAS
         60        70         80            90       100       110 

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE0 YLTRVRQLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVV
       :: .:::::..:::::. ::: :..:   . :.:::.:.:::::::::::.::::::.::
NP_066 YLEKVRQLERDNAELEKLIQERSQQQEPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCAKAENARLVV
             120       130       140       150       160       170 

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE0 NIDNAKLAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMC
       ::::::::.::::.::..: ..: :::.:::..:::::.:::::.:::.:::::.:::.:
NP_066 NIDNAKLASDDFRSKYQTEQSLRLLVESDINSIRRILDELTLCKSDLESQVESLREELIC
             180       190       200       210       220       230 

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE0 LKKNHEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNM
       :::::::::..:: :::::::.:::.:: :::..::.: : ::::.:: :::.::.::  
NP_066 LKKNHEEEVNTLRSQLGDRLNVEVDTAPTVDLNQVLNETRSQYEALVEINRREVEQWFAT
             240       250       260       270       280       290 

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE0 QMEELNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSS
       : ::::.::..::::::. :..::.::::::.:::::::::.::::::::::::::.:::
NP_066 QTEELNKQVVSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEAHYSS
             300       310       320       330       340       350 

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE0 QLAQMQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPC
       ::.:.: .:::::.:::::: :::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::
NP_066 QLSQVQSLITNVESQLAEIRCDLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCKLPC
             360       370       380       390       400       410 

     410       420       430       440        
pF1KE0 NPCSTPSCTTCVPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
       :::.: . .    .::                       
NP_066 NPCATTNASGNSCGPCGTSQKGCCN              
             420       430                    

>>XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, type I  (412 aa)
 initn: 1710 init1: 1710 opt: 1718  Z-score: 1063.0  bits: 205.8 E(85289): 1.8e-52
Smith-Waterman score: 1718; 69.4% identity (87.7% similar) in 382 aa overlap (49-425:22-403)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE0 PRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLPSVCLPTTFRPASCLSKTYLSSSCQA-----
                                     : :::.    .:: :.  .  ::..     
XP_011          MDTKIPLSTLAPIFVSCTMSYSCCLPSLGCRTSCSSRPCVPPSCHGYTLPG
                        10        20        30        40        50 

            80        90       100       110       120       130   
pF1KE0 ASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQENAELESRIQEASH
       : .: ....  .:. ::.:::.:::::::::::::::: .:::::..:::::. ::: :.
XP_011 ACNIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELEKLIQERSQ
              60        70        80        90       100       110 

           140       150       160       170       180       190   
pF1KE0 SQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAKLAADDFRAKYEAELAMRQ
       .:   . :.:::.:.:::::::::::.::::::.::::::::::.::::.::..: ..: 
XP_011 QQEPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCAKAENARLVVNIDNAKLASDDFRSKYQTEQSLRL
             120       130       140       150       160       170 

           200       210       220       230       240       250   
pF1KE0 LVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVGSLRCQLGDRLNIEV
       :::.:::..:::::.:::::.:::.:::::.:::.::::::::::..:: :::::::.::
XP_011 LVESDINSIRRILDELTLCKSDLESQVESLREELICLKKNHEEEVNTLRSQLGDRLNVEV
             180       190       200       210       220       230 

           260       270       280       290       300       310   
pF1KE0 DAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELNQQVATSSEQLQNYQSDII
       :.:: :::..::.: : ::::.:: :::.::.::  : ::::.::..::::::. :..::
XP_011 DTAPTVDLNQVLNETRSQYEALVEINRREVEQWFATQTEELNKQVVSSSEQLQSCQAEII
             240       250       260       270       280       290 

           320       330       340       350       360       370   
pF1KE0 DLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITNVEAQLAEIRADLE
       .::::::.:::::::::.::::::::::::::.:::::.:.: .:::::.:::::: :::
XP_011 ELRRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEAHYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRCDLE
             300       310       320       330       340       350 

           380       390       400       410       420       430   
pF1KE0 RQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTPSCTTCVPSPCVPRTVCVP
       ::::::::::::::::: ::::::::::.::::::::::.: . .    .::        
XP_011 RQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCKLPCNPCATTNASGNSCGPCGTSQKGCC
             360       370       380       390       400       410 

           440        
pF1KE0 RTVGMPCSPCPQGRY
                      
XP_011 N              
                      

>>NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskeletal   (431 aa)
 initn: 1632 init1: 1468 opt: 1588  Z-score: 984.2  bits: 191.3 E(85289): 4.4e-48
Smith-Waterman score: 1588; 57.9% identity (79.3% similar) in 439 aa overlap (1-431:1-424)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLPSVCLPTTFRPAS
       :::.:  :.    : .::   :: :. . .:  :     .: : .:  : :   .:   :
NP_872 MTSDCSSTH---CSPESCGT-ASGCAPASSCSVET----ACLPGTCATSRCQTPSFLSRS
                  10         20        30            40        50  

                    70        80        90       100       110     
pF1KE0 -----CLSKTYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVR
            ::   :...::..   .    :  .:  .:.:..::::::::::::::::: .::
NP_872 RGLTGCLLPCYFTGSCNSPCLV----GNCAWCEDGVFTSNEKETMQFLNDRLASYLEKVR
             60        70            80        90       100        

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE0 QLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAK
       .::. ::::::::::  ....  . :::: .: :::.::::::::::::.:..:..:: :
NP_872 SLEETNAELESRIQEQCEQDIPMVCPDYQRYFNTIEDLQQKILCTKAENSRLAVQLDNCK
      110       120       130       140       150       160        

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE0 LAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHE
       ::.:::..:::.::..:::.::::..:. ::..:::::.::::.::::::.:.:::::::
NP_872 LATDDFKSKYESELSLRQLLEADISSLHGILEELTLCKSDLEAHVESLKEDLLCLKKNHE
      170       180       190       200       210       220        

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE0 EEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELN
       :::. :: ::::::..:.:.:: .::.:::.::::: :...  :::..:::. .: ::::
NP_872 EEVNLLREQLGDRLSVELDTAPTLDLNRVLDEMRCQCETVLANNRREAEEWLAVQTEELN
      230       240       250       260       270       280        

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE0 QQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQ
       ::  .:.::::. : .:..:.::...::::::::.:: .::: :..:.::.:::::::.:
NP_872 QQQLSSAEQLQGCQMEILELKRTASALEIELQAQQSLTESLECTVAETEAQYSSQLAQIQ
      290       300       310       320       330       340        

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE0 CMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTP
       :.: :.: :::::: :::::::::::::::.:::::::::: .::..:: .: :.:::: 
NP_872 CLIDNLENQLAEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEINTYWGLLDSEDSRLSCSPCST-
      350       360       370       380       390       400        

            420       430       440        
pF1KE0 SCT---TCVPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
       .::   ::   ::   ..:                 
NP_872 TCTSSNTC--EPCSAYVICTVENCCL          
       410         420       430           




448 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 23:11:21 2016 done: Wed Nov  2 23:11:22 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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