Result of SIM4 for pF1KE3336

seq1 = pF1KE3336.tfa, 2922 bp
seq2 = pF1KE3336/gi568815581r_6355341.tfa (gi568815581r:6355341_6638085), 282745 bp

>pF1KE3336 2922
>gi568815581r:6355341_6638085 (Chr17)

(complement)

1-22  (81680-81701)   100% ->
23-118  (100004-100099)   98% ->
119-226  (112623-112730)   100% ->
227-274  (134512-134559)   100% ->
275-351  (153794-153870)   100% ->
352-587  (154334-154569)   100% ->
588-777  (159350-159539)   99% ->
778-900  (159989-160111)   100% ->
901-1085  (160873-161057)   100% ->
1086-1258  (163482-163654)   100% ->
1259-1429  (165259-165429)   100% ->
1430-1624  (166731-166925)   100% ->
1625-1773  (167678-167826)   100% ->
1774-1890  (169745-169861)   100% ->
1891-2007  (173315-173431)   100% ->
2008-2156  (173768-173916)   100% ->
2157-2306  (174205-174354)   100% ->
2307-2490  (176530-176713)   99% ->
2491-2619  (180364-180492)   100% ->
2620-2922  (182443-182745)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAGGCGGGCCGTGCAG         GTGGTCCTCCCCCGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
  81680 ATGGCCAAGGCGGGCCGTGCAGGTG...CAGGTGGTCCTCCCCCGGGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CGGTGCCTCCTGGCACCTTCGAAATGTCCTCAGTGACTCTGTGGAGAGCT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100023 CGGTGCCCCCTGGCACCTTCGAAATGTCCTCAGTGACTCTGTGGAGAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGATGATGAATTCTTTGATGCCAGAG         AGGAGATGGCTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100073 CAGATGATGAATTCTTTGATGCCAGAGGTG...CAGAGGAGATGGCTGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GGGAAGAATGCCATCCTCATTGGGATGAGCCAGTGGAACTCCAATGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112637 GGGAAGAATGCCATCCTCATTGGGATGAGCCAGTGGAACTCCAATGACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGTGGAGCAGATCGAGACCATGGGGAAACTGGACGAGCATCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 112687 CGTGGAGCAGATCGAGACCATGGGGAAACTGGACGAGCATCAAGGTG...

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    227    GAGAAGGGACCGCGCCGTGCACATCCAGCATCCTCCAGGAGAAGCAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134509 CAGGAGAAGGGACCGCGCCGTGCACATCCAGCATCCTCCAGGAGAAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 C         GAGAACTGTACCGGGTTTCCTTGAGAAGACAGAGGTTCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134559 CGTG...CAGGAGAACTGTACCGGGTTTCCTTGAGAAGACAGAGGTTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AGCCCAGGGAAGCATCGAGATCCACGAAGACAGCGAG         GAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 153834 AGCCCAGGGAAGCATCGAGATCCACGAAGACAGCGAGGTA...CAGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 GCTGCCCGCAGCGCTCCTGCAAGACACATGTCCTCCTGCTGGTCCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154338 GCTGCCCGCAGCGCTCCTGCAAGACACATGTCCTCCTGCTGGTCCTGCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GGGGGAAACATCCTGGACACGGGTGCCGGGGACCCGTCCTGCAAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154388 GGGGGAAACATCCTGGACACGGGTGCCGGGGACCCGTCCTGCAAGGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CGACATCCACACCTTCAGCTCCGTGCTGGAGAAGGTCACACGAGCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154438 CGACATCCACACCTTCAGCTCCGTGCTGGAGAAGGTCACACGAGCCCATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCCCTGCTGCCCTGGGCCACATCCTCATCAAGTTCGTCCCCTGTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154488 TCCCTGCTGCCCTGGGCCACATCCTCATCAAGTTCGTCCCCTGTCCTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATCTGCTCTGAGGCTTTCTCGCTTGTCTCTCA         CCTGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 154538 ATCTGCTCTGAGGCTTTCTCGCTTGTCTCTCAGTG...CAGCCTGAACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTACAGCCACGATGAGGGCTGCCTCAGCAGCAGCCAGGACCACGTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159359 CTACAGCCACGATGAGGGCTGCCTCAGCAGCAGCCAGGACCACGTCCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGGCCGCCCTTCCCCTGTTGGCCATCTCCTCCCCGCAGTACCAGGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159409 TGGCCGCCCTTCCCCTGTTGGCCATCTCCTCCCCGCAGTACCAGGATGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTCGCCACTGTCATCGAGCGAGCCAACCAGGTCTACAGAGAGTTCCTGAA
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159459 GTCGCCACCGTCATCGAGCGAGCCAACCAGGTCTACAGAGAGTTCCTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GTCCTCTGATGGGATTGGCTTCAGTGGGCAG         GTGTGTCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 159509 GTCCTCTGATGGGATTGGCTTCAGTGGGCAGGTA...CAGGTGTGTCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCGGGGACTGTGTGGGGGGCCTCCTGGCCTTCGATGCCATCTGCTACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159999 TCGGGGACTGTGTGGGGGGCCTCCTGGCCTTCGATGCCATCTGCTACAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCGGGGCCCTCAGGGGACAGCCCTGCCAGCAGCAGCCGGAAGGGGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160049 GCGGGGCCCTCAGGGGACAGCCCTGCCAGCAGCAGCCGGAAGGGGAGCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAGCAGCACCCAG         GACACCCCAGTCGCGGTGGAGGAAGATT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 160099 CAGCAGCACCCAGGTA...AAGGACACCCCAGTCGCGGTGGAGGAAGATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCAGCCTGGCCAGCAGCAAGCGTCTCAGCAAAAGCAACATTGACATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160901 GCAGCCTGGCCAGCAGCAAGCGTCTCAGCAAAAGCAACATTGACATCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGTGGGTTGGAGGATGAGGAGCCCAAGAGGCCGTTGCCGCGGAAACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160951 AGTGGGTTGGAGGATGAGGAGCCCAAGAGGCCGTTGCCGCGGAAACAGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CGACTCCTCCACCTATGACTGCGAGGCCATCACCCAGCACCATGCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161001 CGACTCCTCCACCTATGACTGCGAGGCCATCACCCAGCACCATGCCTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCTCAAG         CATCCACTCCAGCGTGCTAAAGGATGAGTCTGAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161051 TCTCAAGGTA...CAGCATCCACTCCAGCGTGCTAAAGGATGAGTCTGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ACCCCGGCGGCTGGGGGGCCGCAGCTCCCTGAGGTCAGCCTGGGCCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163516 ACCCCGGCGGCTGGGGGGCCGCAGCTCCCTGAGGTCAGCCTGGGCCGCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGACTTCGATGTGTCCGACTTCTTCCTCTTCGGCTCGCCACTGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163566 TGACTTCGATGTGTCCGACTTCTTCCTCTTCGGCTCGCCACTGGGCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TCCTGGCCATGCGGAGGACGGTGCTGCCTGGGCTGGACG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 163616 TCCTGGCCATGCGGAGGACGGTGCTGCCTGGGCTGGACGGTA...CAGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TTCCAGGTGCGTCCTGCCTGCAGCCAGGTCTACAGCTTCTTCCATTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165261 TTCCAGGTGCGTCCTGCCTGCAGCCAGGTCTACAGCTTCTTCCATTGCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AGACCCCTCTGCCTCACGGCTCGAGCCACTGCTGGAGCCCAAGTTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165311 AGACCCCTCTGCCTCACGGCTCGAGCCACTGCTGGAGCCCAAGTTCCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGGTGCCGCCTGTCAGCGTGCCTCGCTACCAGAGGTTCCCACTGGGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165361 TGGTGCCGCCTGTCAGCGTGCCTCGCTACCAGAGGTTCCCACTGGGCGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GGGCAGTCCCTCCTCCTCG         CTGATGCCCTACACACCCACAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 165411 GGGCAGTCCCTCCTCCTCGGTA...CAGCTGATGCCCTACACACCCACAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CCCCCTCTTCCTGGAGGGCAGCTCCCGGGACAGCCCGCCACTTCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166753 CCCCCTCTTCCTGGAGGGCAGCTCCCGGGACAGCCCGCCACTTCTGGATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCCCTGCCTCGCCCCCTCAGGCCTCGAGGTTCCAGCGCCCAGGACGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166803 CCCCTGCCTCGCCCCCTCAGGCCTCGAGGTTCCAGCGCCCAGGACGGAGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ATGAGCGAGGGGAGCTCCCACAGCGAGAGCTCGGAGTCCTCGGACAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166853 ATGAGCGAGGGGAGCTCCCACAGCGAGAGCTCGGAGTCCTCGGACAGCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GGCACCCGTGGGTGCCTCCCGCA         TCACAGCCAAGTGGTGGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 166903 GGCACCCGTGGGTGCCTCCCGCAGTG...CAGTCACAGCCAAGTGGTGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GAAGCAAGAGGATCGACTATGCCCTGTACTGCCCTGATGTCCTCACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167696 GAAGCAAGAGGATCGACTATGCCCTGTACTGCCCTGATGTCCTCACGGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TTCCCCACCGTGGCCCTGCCCCACCTCTTCCACGCCAGTTACTGGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167746 TTCCCCACCGTGGCCCTGCCCCACCTCTTCCACGCCAGTTACTGGGAGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CACAGACGTGGTGGCCTTCATCCTGAGACAG         GTAATGCGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 167796 CACAGACGTGGTGGCCTTCATCCTGAGACAGGTA...TAGGTAATGCGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ATGAGAGCGTGAACATCAAGGAAAGCGCCCGCCTGGACCCTGCAGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169755 ATGAGAGCGTGAACATCAAGGAAAGCGCCCGCCTGGACCCTGCAGCACTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 AGTCCTGCCAACCCCCGGGAGAAGTGGCTTCGTAAGCGGACTCAGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169805 AGTCCTGCCAACCCCCGGGAGAAGTGGCTTCGTAAGCGGACTCAGGTCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GCTGAGG         AATGTCACGGCTAATCACCGGGCCAATGATGTGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169855 GCTGAGGGTG...CAGAATGTCACGGCTAATCACCGGGCCAATGATGTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TTGCTGCTGAAGATGGCCCCCAGGTCCTGGTGGGGCGGTTCATGTACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173349 TTGCTGCTGAAGATGGCCCCCAGGTCCTGGTGGGGCGGTTCATGTACGGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 CCCCTCGACATGGTGGCTCTGACTGGAGAGAAG         GTGGACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 173399 CCCCTCGACATGGTGGCTCTGACTGGAGAGAAGGTA...CAGGTGGACAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CCTAGTAATGGCAGAGCCATCCTCAGGCCGCTGGGTACACCTGGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173776 CCTAGTAATGGCAGAGCCATCCTCAGGCCGCTGGGTACACCTGGACACAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 AGATCACCAACAGCAGTGGTCGCATCACATACAATGTGCCGCGGCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173826 AGATCACCAACAGCAGTGGTCGCATCACATACAATGTGCCGCGGCCCCGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CGCCTGGGGGTTGGTGTCTATCCTGTGAAGATGGTCGTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 173876 CGCCTGGGGGTTGGTGTCTATCCTGTGAAGATGGTCGTCAGGTA...CAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 GGGCGACCAGACCTGTGCCATGAGCTACCTCACGGTGTTGCCCAGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174205 GGGCGACCAGACCTGTGCCATGAGCTACCTCACGGTGTTGCCCAGGGGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TGGAGTGTGTAGTGTTCAGCATTGATGGGTCCTTCGCGGCCAGCGTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174255 TGGAGTGTGTAGTGTTCAGCATTGATGGGTCCTTCGCGGCCAGCGTGTCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 ATCATGGGAAGCGACCCCAAGGTCCGGCCGGGTGCAGTGGATGTTGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174305 ATCATGGGAAGCGACCCCAAGGTCCGGCCGGGTGCAGTGGATGTTGTCCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307          GCACTGGCAGGACTTGGGCTACATGATCCTTTACATCACGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174355 GTG...CAGGCACTGGCAGGACTTGGGCTACATGATCCTTTACATCACGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 GACGGCCGGACATGCAGAAGCAGCGGGTGGTGTCGTGGCTGTCCCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176571 GACGGCCGGACATGCAGAAGCAGCGGGTGGTGTCGTGGCTGTCCCAGCAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 AACTTCCCACAGGGCATGATCTTCTTCTCCGACGGGCTGGTGCATGACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 176621 AACTTCCCACAGGGCATGATCTTCTTCTCCGATGGGCTGGTGCATGACCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 GCTGCGGCAGAAGGCCATCTTCCTGCGCAACCTCATGCAGGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 176671 GCTGCGGCAGAAGGCCATCTTCCTGCGCAACCTCATGCAGGAGGTG...C

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2491   TGCTTCATCAAAATCAGTGCGGCCTATGGCTCCACGAAGGACATCTCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180362 AGTGCTTCATCAAAATCAGTGCGGCCTATGGCTCCACGAAGGACATCTCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 GTCTACAGCGTGCTGGGCCTGCCTGCCTCCCAGATCTTCATTGTGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180412 GTCTACAGCGTGCTGGGCCTGCCTGCCTCCCAGATCTTCATTGTGGGCCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 GCCCACCAAGAAGTACCAAACCCAGTGCCAG         TTCCTGAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 180462 GCCCACCAAGAAGTACCAAACCCAGTGCCAGGTG...CAGTTCCTGAGCG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 AGGGCTACGCCGCACACCTGGCCGCGCTGGAGGCCAGCCACCGCTCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182453 AGGGCTACGCCGCACACCTGGCCGCGCTGGAGGCCAGCCACCGCTCACGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 CCAAAGAAGAACAACTCGCGCATGATCCTGCGCAAGGGCAGCTTCGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182503 CCAAAGAAGAACAACTCGCGCATGATCCTGCGCAAGGGCAGCTTCGGGCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 GCACGCGCAGCCAGAGTTCCTGCGGAAGCGCAACCACCTGCGCAGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182553 GCACGCGCAGCCAGAGTTCCTGCGGAAGCGCAACCACCTGCGCAGAACCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 TGTCAGTGCAGCAGCCCGACCCGCCCGCCGCCAACCCCAAGCCCGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182603 TGTCAGTGCAGCAGCCCGACCCGCCCGCCGCCAACCCCAAGCCCGAGCGG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 GCCCAGAGCCAGCCCGAGTCGGACAAAGACCACGAGCGGCCGCTGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182653 GCCCAGAGCCAGCCCGAGTCGGACAAAGACCACGAGCGGCCGCTGCCGGC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 GCTCAGCTGGGCGCGTGGGCCCCCCAAGTTCGAGTCGGTGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182703 GCTCAGCTGGGCGCGTGGGCCCCCCAAGTTCGAGTCGGTGCCC

Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com