seq1 = pF1KE2103.tfa, 2766 bp seq2 = pF1KE2103/gi568815595f_6761389.tfa (gi568815595f:6761389_7786424), 1025036 bp >pF1KE2103 2766 >gi568815595f:6761389_7786424 (Chr3) 1-519 (100001-100519) 100% -> 520-736 (385064-385280) 100% -> 737-878 (537296-537437) 100% -> 879-1033 (545110-545264) 100% -> 1034-1174 (653635-653775) 100% -> 1175-1375 (691219-691419) 100% -> 1376-1515 (700195-700334) 100% -> 1516-2451 (817034-817969) 99% -> 2452-2698 (918661-918907) 100% -> 2699-2766 (924969-925036) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGTCCAGCTGAGGAAGCTGCTCCGCGTCCTGACTTTGATGAAGTTCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGTCCAGCTGAGGAAGCTGCTCCGCGTCCTGACTTTGATGAAGTTCCC 50 . : . : . : . : . : 51 CTGCTGCGTGCTGGAGGTGCTCCTGTGCGCGCTGGCGGCGGCGGCGCGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CTGCTGCGTGCTGGAGGTGCTCCTGTGCGCGCTGGCGGCGGCGGCGCGCG 100 . : . : . : . : . : 101 GCCAGGAGATGTACGCCCCGCACTCAATCCGGATCGAGGGGGACGTCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 GCCAGGAGATGTACGCCCCGCACTCAATCCGGATCGAGGGGGACGTCACC 150 . : . : . : . : . : 151 CTCGGGGGGCTGTTCCCCGTGCACGCCAAGGGTCCCAGCGGAGTGCCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 CTCGGGGGGCTGTTCCCCGTGCACGCCAAGGGTCCCAGCGGAGTGCCCTG 200 . : . : . : . : . : 201 CGGCGACATCAAGAGGGAAAACGGGATCCACAGGCTGGAAGCGATGCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 CGGCGACATCAAGAGGGAAAACGGGATCCACAGGCTGGAAGCGATGCTCT 250 . : . : . : . : . : 251 ACGCCCTGGACCAGATCAACAGTGATCCCAACCTACTGCCCAACGTGACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 ACGCCCTGGACCAGATCAACAGTGATCCCAACCTACTGCCCAACGTGACG 300 . : . : . : . : . : 301 CTGGGCGCGCGGATCCTGGACACTTGTTCCAGGGACACTTACGCGCTCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 CTGGGCGCGCGGATCCTGGACACTTGTTCCAGGGACACTTACGCGCTCGA 350 . : . : . : . : . : 351 ACAGTCGCTTACTTTCGTCCAGGCGCTCATCCAGAAGGACACCTCCGACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100351 ACAGTCGCTTACTTTCGTCCAGGCGCTCATCCAGAAGGACACCTCCGACG 400 . : . : . : . : . : 401 TGCGCTGCACCAACGGCGAACCGCCGGTTTTCGTCAAGCCGGAGAAAGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100401 TGCGCTGCACCAACGGCGAACCGCCGGTTTTCGTCAAGCCGGAGAAAGTA 450 . : . : . : . : . : 451 GTTGGAGTGATTGGGGCTTCGGGGAGTTCGGTCTCCATCATGGTAGCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100451 GTTGGAGTGATTGGGGCTTCGGGGAGTTCGGTCTCCATCATGGTAGCCAA 500 . : . : . : . : . : 501 CATCCTGAGGCTCTTCCAG ATCCCCCAGATTAGTTATGCAT |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 100501 CATCCTGAGGCTCTTCCAGGTA...CAGATCCCCCAGATTAGTTATGCAT 550 . : . : . : . : . : 542 CAACGGCACCCGAGCTAAGTGATGACCGGCGCTATGACTTCTTCTCTCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 385086 CAACGGCACCCGAGCTAAGTGATGACCGGCGCTATGACTTCTTCTCTCGC 600 . : . : . : . : . : 592 GTGGTGCCACCCGATTCCTTCCAAGCCCAGGCCATGGTAGACATTGTAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 385136 GTGGTGCCACCCGATTCCTTCCAAGCCCAGGCCATGGTAGACATTGTAAA 650 . : . : . : . : . : 642 GGCCCTAGGCTGGAATTATGTGTCTACCCTCGCATCGGAAGGAAGTTATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 385186 GGCCCTAGGCTGGAATTATGTGTCTACCCTCGCATCGGAAGGAAGTTATG 700 . : . : . : . : . : 692 GAGAGAAAGGTGTGGAGTCCTTCACGCAGATTTCCAAAGAGGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 385236 GAGAGAAAGGTGTGGAGTCCTTCACGCAGATTTCCAAAGAGGCAGGTA.. 750 . : . : . : . : . : 737 GTGGACTCTGCATTGCCCAGTCCGTGAGAATCCCCCAGGAACGCAA .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 385286 .CAGGTGGACTCTGCATTGCCCAGTCCGTGAGAATCCCCCAGGAACGCAA 800 . : . : . : . : . : 783 AGACAGGACCATTGACTTTGATAGAATTATCAAACAGCTCCTGGACACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 537342 AGACAGGACCATTGACTTTGATAGAATTATCAAACAGCTCCTGGACACCC 850 . : . : . : . : . : 833 CCAACTCCAGGGCCGTCGTGATTTTTGCCAACGATGAGGATATAAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 537392 CCAACTCCAGGGCCGTCGTGATTTTTGCCAACGATGAGGATATAAAGTA. 900 . : . : . : . : . : 879 GCAGATCCTTGCAGCAGCCAAAAGAGCTGACCAAGTTGGCCATTT ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 537442 ..CAGGCAGATCCTTGCAGCAGCCAAAAGAGCTGACCAAGTTGGCCATTT 950 . : . : . : . : . : 924 TCTTTGGGTGGGATCAGACAGCTGGGGATCCAAAATAAACCCACTGCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 545155 TCTTTGGGTGGGATCAGACAGCTGGGGATCCAAAATAAACCCACTGCACC 1000 . : . : . : . : . : 974 AGCATGAAGATATCGCAGAAGGGGCCATCACCATTCAGCCCAAGCGAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 545205 AGCATGAAGATATCGCAGAAGGGGCCATCACCATTCAGCCCAAGCGAGCC 1050 . : . : . : . : . : 1024 ACGGTGGAAG GGTTTGATGCCTACTTTACGTCCCGTACACT ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 545255 ACGGTGGAAGGTA...TAGGGTTTGATGCCTACTTTACGTCCCGTACACT 1100 . : . : . : . : . : 1065 TGAAAACAACAGAAGAAATGTATGGTTTGCCGAATACTGGGAGGAAAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 653666 TGAAAACAACAGAAGAAATGTATGGTTTGCCGAATACTGGGAGGAAAACT 1150 . : . : . : . : . : 1115 TCAACTGCAAGTTGACGATTAGTGGGTCAAAAAAAGAAGACACAGATCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 653716 TCAACTGCAAGTTGACGATTAGTGGGTCAAAAAAAGAAGACACAGATCGC 1200 . : . : . : . : . : 1165 AAATGCACAG GACAGGAGAGAATTGGAAAAGATTCCAACTA ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 653766 AAATGCACAGGTA...CAGGACAGGAGAGAATTGGAAAAGATTCCAACTA 1250 . : . : . : . : . : 1206 TGAGCAGGAGGGTAAAGTCCAGTTCGTGATTGACGCAGTCTATGCTATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 691250 TGAGCAGGAGGGTAAAGTCCAGTTCGTGATTGACGCAGTCTATGCTATGG 1300 . : . : . : . : . : 1256 CTCACGCCCTTCACCACATGAACAAGGATCTCTGTGCTGACTACCGGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 691300 CTCACGCCCTTCACCACATGAACAAGGATCTCTGTGCTGACTACCGGGGT 1350 . : . : . : . : . : 1306 GTCTGCCCAGAGATGGAGCAAGCTGGAGGCAAGAAGTTGCTGAAGTATAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 691350 GTCTGCCCAGAGATGGAGCAAGCTGGAGGCAAGAAGTTGCTGAAGTATAT 1400 . : . : . : . : . : 1356 ACGCAATGTTAATTTCAATG GTAGTGCTGGCACTCCAGTGA ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 691400 ACGCAATGTTAATTTCAATGGTG...TAGGTAGTGCTGGCACTCCAGTGA 1450 . : . : . : . : . : 1397 TGTTTAACAAGAACGGGGATGCACCTGGGCGTTATGACATCTTTCAGTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 700216 TGTTTAACAAGAACGGGGATGCACCTGGGCGTTATGACATCTTTCAGTAC 1500 . : . : . : . : . : 1447 CAGACCACAAACACCAGCAACCCGGGTTACCGTCTGATCGGGCAGTGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 700266 CAGACCACAAACACCAGCAACCCGGGTTACCGTCTGATCGGGCAGTGGAC 1550 . : . : . : . : . : 1497 AGACGAACTTCAGCTCAAT ATAGAAGACATGCAGTGGGGTA |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 700316 AGACGAACTTCAGCTCAATGTG...CAGATAGAAGACATGCAGTGGGGTA 1600 . : . : . : . : . : 1538 AAGGAGTCCGAGAGATACCCGCCTCAGTGTGCACACTACCATGTAAGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817056 AAGGAGTCCGAGAGATACCCGCCTCAGTGTGCACACTACCATGTAAGCCA 1650 . : . : . : . : . : 1588 GGACAGAGAAAGAAGACACAGAAAGGAACTCCTTGCTGTTGGACCTGTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817106 GGACAGAGAAAGAAGACACAGAAAGGAACTCCTTGCTGTTGGACCTGTGA 1700 . : . : . : . : . : 1638 GCCTTGCGATGGTTACCAGTACCAGTTTGATGAGATGACATGCCAGCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817156 GCCTTGCGATGGTTACCAGTACCAGTTTGATGAGATGACATGCCAGCATT 1750 . : . : . : . : . : 1688 GCCCCTATGACCAGAGGCCCAATGAAAATCGAACCGGATGCCAGGATATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817206 GCCCCTATGACCAGAGGCCCAATGAAAATCGAACCGGATGCCAGGATATT 1800 . : . : . : . : . : 1738 CCCATCATCAAACTGGAGTGGCACTCCCCCTGGGCTGTGATTCCTGTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817256 CCCATCATCAAACTGGAGTGGCACTCCCCCTGGGCTGTGATTCCTGTCTT 1850 . : . : . : . : . : 1788 CCTGGCAATGTTGGGGATCATTGCCACCATCTTTGTCATGGCCACTTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817306 CCTGGCAATGTTGGGGATCATTGCCACCATCTTTGTCATGGCCACTTTCA 1900 . : . : . : . : . : 1838 TCCGCTACAATGACACGCCCATTGTCCGGGCATCTGGGCGGGAACTCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817356 TCCGCTACAATGACACGCCCATTGTCCGGGCATCTGGGCGGGAACTCAGC 1950 . : . : . : . : . : 1888 TATGTTCTTTTGACGGGCATCTTTCTTTGCTACATCATCACTTTCCTGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817406 TATGTTCTTTTGACGGGCATCTTTCTTTGCTACATCATCACTTTCCTGAT 2000 . : . : . : . : . : 1938 GATTGCCAAACCAGATGTGGCAGTGTGTTCTTTCCGGCGAGTTTTCTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817456 GATTGCCAAACCAGATGTGGCAGTGTGTTCTTTCCGGCGAGTTTTCTTGG 2050 . : . : . : . : . : 1988 GCTTGGGTATGTGCATCAGTTATGCAGCCCTCTTGACGAAAACAAATCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817506 GCTTGGGTATGTGCATCAGTTATGCAGCCCTCTTGACGAAAACAAATCGG 2100 . : . : . : . : . : 2038 ATTTATCGCATATTTGAGCAGGGCAAGAAATCAGTAACAGCTCCCAGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817556 ATTTATCGCATATTTGAGCAGGGCAAGAAATCAGTAACAGCTCCCAGACT 2150 . : . : . : . : . : 2088 CATAAGCCCAACATCACAACTGGCAATCACTTCCAGTTTAATATCAGTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817606 CATAAGCCCAACATCACAACTGGCAATCACTTCCAGTTTAATATCAGTTC 2200 . : . : . : . : . : 2138 AGCTTCTAGGGGTGTTCATTTGGTTTGGTGTTGATCCACCCAACATCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817656 AGCTTCTAGGGGTGTTCATTTGGTTTGGTGTTGATCCACCCAACATCATC 2250 . : . : . : . : . : 2188 ATAGACTACGATGAACACAAGACAATGAACCCTGAGCAAGCCAGAGGGGT |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817706 ATAGACTATGATGAACACAAGACAATGAACCCTGAGCAAGCCAGAGGGGT 2300 . : . : . : . : . : 2238 TCTCAAGTGTGACATTACAGATCTCCAAATCATTTGCTCCTTGGGATATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817756 TCTCAAGTGTGACATTACAGATCTCCAAATCATTTGCTCCTTGGGATATA 2350 . : . : . : . : . : 2288 GCATTCTTCTCATGGTCACATGTACTGTGTATGCCATCAAGACTCGGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817806 GCATTCTTCTCATGGTCACATGTACTGTGTATGCCATCAAGACTCGGGGT 2400 . : . : . : . : . : 2338 GTACCCGAGAATTTTAACGAAGCCAAGCCCATTGGATTCACTATGTACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817856 GTACCCGAGAATTTTAACGAAGCCAAGCCCATTGGATTCACTATGTACAC 2450 . : . : . : . : . : 2388 GACATGTATAGTATGGCTTGCCTTCATTCCAATTTTTTTTGGCACCGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 817906 GACATGTATAGTATGGCTTGCCTTCATTCCAATTTTTTTTGGCACCGCTC 2500 . : . : . : . : . : 2438 AATCAGCGGAAAAG CTCTACATACAAACTACCACGCTTACA ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 817956 AATCAGCGGAAAAGGTA...TAGCTCTACATACAAACTACCACGCTTACA 2550 . : . : . : . : . : 2479 ATCTCCATGAACCTAAGTGCATCAGTGGCGCTGGGGATGCTATACATGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 918688 ATCTCCATGAACCTAAGTGCATCAGTGGCGCTGGGGATGCTATACATGCC 2600 . : . : . : . : . : 2529 GAAAGTGTACATCATCATTTTCCACCCTGAACTCAATGTCCAGAAACGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 918738 GAAAGTGTACATCATCATTTTCCACCCTGAACTCAATGTCCAGAAACGGA 2650 . : . : . : . : . : 2579 AGCGAAGCTTCAAGGCGGTAGTCACAGCAGCCACCATGTCATCGAGGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 918788 AGCGAAGCTTCAAGGCGGTAGTCACAGCAGCCACCATGTCATCGAGGCTG 2700 . : . : . : . : . : 2629 TCACACAAACCCAGTGACAGACCCAACGGTGAGGCAAAGACCGAGCTCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 918838 TCACACAAACCCAGTGACAGACCCAACGGTGAGGCAAAGACCGAGCTCTG 2750 . : . : . : . : . : 2679 TGAAAACGTAGACCCAAACA ACTGTATACCACCAGTAAGAA ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 918888 TGAAAACGTAGACCCAAACAGTA...TAGACTGTATACCACCAGTAAGAA 2800 . : . : . : . : . 2720 AGAGTGTACAAAAGTCTGTTACTTGGTACACTATCCCACCAACAGTA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 924990 AGAGTGTACAAAAGTCTGTTACTTGGTACACTATCCCACCAACAGTA