Result of FASTA (ccds) for pF1KE0461
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0461, 215 aa
  1>>>pF1KE0461 215 - 215 aa - 215 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2861+/-0.00091; mu= 14.2776+/- 0.055
 mean_var=82.1571+/-16.193, 0's: 0 Z-trim(107.8): 206  B-trim: 379 in 1/51
 Lambda= 0.141498
 statistics sampled from 9559 (9793) to 9559 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.301), width:  16
 Scan time:  2.110

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9          ( 215) 1422 299.6 9.5e-82
CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1          ( 218)  835 179.8 1.1e-45
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8           ( 212)  825 177.8 4.6e-45
CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19        ( 213)  821 176.9 8.1e-45
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14         ( 216)  803 173.3   1e-43
CCDS56537.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8          ( 188)  665 145.1 2.8e-35
CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 216)  601 132.0 2.7e-31
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19        ( 218)  590 129.8 1.3e-30
CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11        ( 217)  581 128.0 4.6e-30
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2          ( 205)  575 126.7   1e-29
CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1         ( 213)  562 124.1 6.7e-29
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15        ( 207)  555 122.6 1.8e-28
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11        ( 201)  553 122.2 2.3e-28
CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX       ( 213)  550 121.6 3.6e-28
CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7        ( 217)  548 121.2 4.9e-28
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19         ( 207)  539 119.4 1.7e-27
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1           ( 203)  527 116.9 9.1e-27
CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3        ( 212)  527 116.9 9.4e-27
CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 155)  522 115.8 1.5e-26
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 216)  522 115.9 1.9e-26
CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 223)  521 115.7 2.3e-26
CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11         ( 203)  520 115.5 2.4e-26
CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 196)  518 115.1 3.2e-26
CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 228)  518 115.1 3.5e-26
CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2          ( 200)  517 114.9 3.7e-26
CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14       ( 212)  515 114.5 5.1e-26
CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 256)  513 114.1 7.8e-26
CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19         ( 220)  512 113.9 8.1e-26
CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10         ( 206)  509 113.2 1.2e-25
CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18       ( 244)  507 112.9 1.8e-25
CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5         ( 227)  498 111.0   6e-25
CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 190)  494 110.2 9.2e-25
CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1            ( 219)  494 110.2   1e-24
CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19         ( 219)  489 109.2 2.1e-24
CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 216)  479 107.1 8.5e-24
CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 249)  479 107.2 9.4e-24
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12        ( 201)  471 105.5 2.5e-23
CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12          ( 215)  471 105.5 2.6e-23
CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3           ( 215)  468 104.9   4e-23
CCDS9003.1 RAB21 gene_id:23011|Hs108|chr12         ( 225)  462 103.7 9.7e-23
CCDS2520.1 RAB17 gene_id:64284|Hs108|chr2          ( 212)  458 102.8 1.6e-22
CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3          ( 208)  453 101.8 3.3e-22
CCDS33497.1 RAB22A gene_id:57403|Hs108|chr20       ( 194)  448 100.8 6.3e-22
CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  431 97.3 7.3e-21
CCDS3747.1 RAB33B gene_id:83452|Hs108|chr4         ( 229)  429 97.0   1e-20
CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  421 95.3   3e-20
CCDS14621.1 RAB33A gene_id:9363|Hs108|chrX         ( 237)  421 95.3 3.3e-20
CCDS14156.1 RAB9A gene_id:9367|Hs108|chrX          ( 201)  420 95.1 3.4e-20
CCDS54162.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 186)  418 94.6 4.2e-20
CCDS14515.1 RAB9B gene_id:51209|Hs108|chrX         ( 201)  418 94.7 4.5e-20


>>CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9               (215 aa)
 initn: 1422 init1: 1422 opt: 1422  Z-score: 1581.1  bits: 299.6 E(32554): 9.5e-82
Smith-Waterman score: 1422; 100.0% identity (100.0% similar) in 215 aa overlap (1-215:1-215)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210     
pF1KE0 LDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC
              190       200       210     

>>CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1               (218 aa)
 initn: 840 init1: 793 opt: 835  Z-score: 933.4  bits: 179.8 E(32554): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 835; 60.8% identity (82.3% similar) in 209 aa overlap (8-215:10-218)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE0   MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQ
                :...::...::. :.::::::::: ::::  :  ::::::::..::.:.:.
CCDS31 MSQTAMSETYDFLFKFLVIGNAGTGKSCLLHQFIEKKFKDDSNHTIGVEFGSKIINVGGK
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE0 KIKLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTV
        .::::::::::::::.:::::::::::::.::::: : ::: :..:::::: :.. : :
CCDS31 YVKLQIWDTAGQERFRSVTRSYYRGAAGALLVYDITSRETYNALTNWLTDARMLASQNIV
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE0 IILIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQD
       ::: ::: ::.:.:.::. ::..::.:: :.:::.:: ::::::.::.. :.:: ..:..
CCDS31 IILCGNKKDLDADREVTFLEASRFAQENELMFLETSALTGENVEEAFVQCARKILNKIES
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200        210     
pF1KE0 GSLDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQ-PQREGCGC
       : :: .   ::.:.  .: .  :   . : :. . :::
CCDS31 GELDPERMGSGIQYGDAALRQLRSPRRAQAPNAQECGC
              190       200       210        

>>CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8                (212 aa)
 initn: 806 init1: 787 opt: 825  Z-score: 922.6  bits: 177.8 E(32554): 4.6e-45
Smith-Waterman score: 825; 58.9% identity (84.2% similar) in 209 aa overlap (8-215:3-211)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
              :.:.:::::::: :::::::: :::.:.:.     :::::::.:.: ..:..:
CCDS61      MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQI
                    10        20        30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
       ::::::::::: ::..::::::::::::.:::::::.:.:::..:: :::. .: : ::.
CCDS61 KLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIM
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
       :::::.:::..:.:  ::.. ::.:.::.:.:.::::. :::.::...::.::..::.: 
CCDS61 LIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGV
         120       130       140       150       160       170     

              190        200       210      
pF1KE0 LDLNAAESGVQHKPS-APQGGRLTSEPQPQREGCGC 
       .:.:   .:..  :. :  ..  ...   :. : :: 
CCDS61 FDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
         180       190       200       210  

>>CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19             (213 aa)
 initn: 834 init1: 788 opt: 821  Z-score: 918.1  bits: 176.9 E(32554): 8.1e-45
Smith-Waterman score: 821; 57.9% identity (81.8% similar) in 214 aa overlap (8-215:5-213)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
              :...::...::. :.::::::::: :.::  :  ::::::::.:...:.:. .
CCDS33    MAETYDFLFKFLVIGSAGTGKSCLLHQFIENKFKQDSNHTIGVEFGSRVVNVGGKTV
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
       ::::::::::::::.:::::::::::::.::::: : ::: :..::::::.:..:: :.:
CCDS33 KLQIWDTAGQERFRSVTRSYYRGAAGALLVYDITSRETYNSLAAWLTDARTLASPNIVVI
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
       : ::: ::. .:.::. ::..::.:: :.:::.:: ::::::.:::. :. : ..:..: 
CCDS33 LCGNKKDLDPEREVTFLEASRFAQENELMFLETSALTGENVEEAFLKCARTILNKIDSGE
       120       130       140       150       160       170       

              190             200       210     
pF1KE0 LDLNAAESGVQHKPSA------PQGGRLTSEPQPQREGCGC
       :: .   ::.:.  ..      :.... .. :::    :::
CCDS33 LDPERMGSGIQYGDASLRQLRQPRSAQAVA-PQP----CGC
       180       190       200        210       

>>CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14              (216 aa)
 initn: 777 init1: 777 opt: 803  Z-score: 898.2  bits: 173.3 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 803; 56.7% identity (82.8% similar) in 215 aa overlap (8-215:3-216)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
              :.:.:::::::: :::::::: :::.:.:.     :::::::.:.....:..:
CCDS95      MTYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMVNIDGKQI
                    10        20        30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
       ::::::::::: ::..::::::::::::.::::::: :.:::.::: :::. .. : ::.
CCDS95 KLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHLTSWLEDARQHSSSNMVIM
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
       :::::.:::..:::  ::.. ::.:.::.:.:.::::. :::.::...::.::..::.: 
CCDS95 LIGNKSDLESRRDVKREEGEAFAREHGLIFMETSAKTACNVEEAFINTAKEIYRKIQQGL
         120       130       140       150       160       170     

              190              200       210     
pF1KE0 LDLNAAESGVQHKPS-------APQGGRLTSEPQPQREGCGC
       .:..   .:..  :.       .:.... .:.   .  :: :
CCDS95 FDVHNEANGIKIGPQQSISTSVGPSASQRNSRDIGSNSGC-C
         180       190       200       210       

>>CCDS56537.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8               (188 aa)
 initn: 735 init1: 646 opt: 665  Z-score: 746.7  bits: 145.1 E(32554): 2.8e-35
Smith-Waterman score: 678; 51.7% identity (75.6% similar) in 209 aa overlap (8-215:3-187)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
              :.:.:::::::: ::                        :::.:.: ..:..:
CCDS56      MAYAYLFKYIIIGDTGV------------------------EFGARMITIDGKQI
                    10                                20        30 

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
       ::::::::::: ::..::::::::::::.:::::::.:.:::..:: :::. .: : ::.
CCDS56 KLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIM
              40        50        60        70        80        90 

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
       :::::.:::..:.:  ::.. ::.:.::.:.:.::::. :::.::...::.::..::.: 
CCDS56 LIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGV
             100       110       120       130       140       150 

              190        200       210      
pF1KE0 LDLNAAESGVQHKPS-APQGGRLTSEPQPQREGCGC 
       .:.:   .:..  :. :  ..  ...   :. : :: 
CCDS56 FDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
             160       170       180        

>>CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15             (216 aa)
 initn: 603 init1: 568 opt: 601  Z-score: 675.3  bits: 132.0 E(32554): 2.7e-31
Smith-Waterman score: 601; 45.5% identity (71.8% similar) in 213 aa overlap (1-213:1-213)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
       :.:   .:.:.:: ..::: ::::: :: .::...:  .   ::::::.:: :.:.:. :
CCDS10 MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
       : ::::::::::.::.: .:::::.:::.::::... ::...  :: . :. .. : ::.
CCDS10 KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
       :.:::.::.  : :  .::. :::.::: :.:.::  . ::: ::     .::. ... .
CCDS10 LVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210      
pF1KE0 LDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC 
       ..    ..    .  .:     :.: .:. . :   
CCDS10 MSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI
              190       200       210      

>>CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19             (218 aa)
 initn: 584 init1: 584 opt: 590  Z-score: 663.1  bits: 129.8 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 590; 50.0% identity (76.9% similar) in 186 aa overlap (1-186:1-186)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
       :.:   .:.:.:: ..::: ::::: :: .::...:  .   ::::::.:: :.:.:. :
CCDS12 MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
       : ::::::::::.::.: .:::::.:::.::::... ::...  :: . :. .. : ::.
CCDS12 KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
       :.:::.::.  : :  .::. :::.:.: :.:.::  . :::.:: .   .::. ... .
CCDS12 LVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNNLSFIETSALDSTNVEEAFKNILTEIYRIVSQKQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210        
pF1KE0 LDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC   
       .   ::                                
CCDS12 IADRAAHDESPGNNVVDISVPPTTDGQKPNKLQCCQNL
              190       200       210        

>>CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11             (217 aa)
 initn: 535 init1: 244 opt: 581  Z-score: 653.2  bits: 128.0 E(32554): 4.6e-30
Smith-Waterman score: 581; 41.5% identity (73.6% similar) in 212 aa overlap (10-215:7-217)

               10        20        30            40        50      
pF1KE0 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMA----DCPHTIGVEFGTRIIEVS
                : :. :.:::  ::::::::.::. .: .     :  :.::.: .:..:. 
CCDS83    METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIE
                  10        20        30        40        50       

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE0 -GQKIKLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNP
        :..::::.::::::::::..::::::...:...:.::: : ...:...:: .:.  ..:
CCDS83 PGKRIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQP
        60        70        80        90       100       110       

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE0 NTVI-ILIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQ
         .. .:.:.: :: .::.:: :::.... . :. ..:.::: . :::..:   .. ::.
CCDS83 FRIVFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYE
       120       130       140       150       160       170       

          180       190       200       210     
pF1KE0 NIQDGSLDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC
        :. : . .. .  ::. .  .:.  . . :    :. : :
CCDS83 LIKKGEICIQDGWEGVK-SGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC
       180       190        200       210       

>>CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2               (205 aa)
 initn: 532 init1: 532 opt: 575  Z-score: 646.9  bits: 126.7 E(32554): 1e-29
Smith-Waterman score: 575; 44.6% identity (71.3% similar) in 202 aa overlap (1-200:1-202)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
       :..   .:.:.:: ..::: :::::::: .:..  .  .   ::::.:  : ::..:. :
CCDS46 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
       ::::::::::::::..: :::::: : ..:::.: . ..:....:: .    .. :.  .
CCDS46 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
       :.::: :: ... : :  ::.::.  :. :::.:::.. :::..:.  : .: . .  :.
CCDS46 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGA
              130       140       150       160       170       180

              190         200       210     
pF1KE0 LDLNAAESGV--QHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC
          .: .:.:  :  :   .::               
CCDS46 TAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC            
              190       200                 




215 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Thu Nov  3 07:08:00 2016 done: Thu Nov  3 07:08:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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