Result of FASTA (omim) for pF1KE1978
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1978, 555 aa
  1>>>pF1KE1978     555 - 555 aa - 555 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  65951994 residues in 93482 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6623+/-0.000324; mu= 17.4223+/- 0.020
 mean_var=93.0206+/-18.203, 0's: 0 Z-trim(117.6): 90  B-trim: 90 in 1/57
 Lambda= 0.132979
 statistics sampled from 30982 (31087) to 30982 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.333), width:  16
 Scan time:  4.910

The best scores are:                                      opt bits E(93482)
NP_005032 (OMIM: 170280,603553,605027,609135) perf ( 555) 3879 754.6  2e-217
NP_001076585 (OMIM: 170280,603553,605027,609135) p ( 555) 3879 754.6  2e-217
NP_001108603 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 934)  356 78.9 8.4e-14
NP_000056 (OMIM: 217050,612446) complement compone ( 934)  356 78.9 8.4e-14
XP_005248414 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 943)  356 78.9 8.5e-14
XP_011512421 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 952)  356 78.9 8.5e-14
XP_011512420 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 962)  323 72.6 6.9e-12
XP_011512419 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 962)  323 72.6 6.9e-12
XP_011512417 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 962)  323 72.6 6.9e-12
XP_016865307 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 962)  323 72.6 6.9e-12
XP_006714559 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 962)  323 72.6 6.9e-12
XP_011512418 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 962)  323 72.6 6.9e-12
XP_011512416 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 971)  323 72.6   7e-12
XP_016865308 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 814)  317 71.4 1.4e-11
XP_011512423 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 643)  297 67.5 1.6e-10
NP_000553 (OMIM: 120950,613790) complement compone ( 584)  274 63.0 3.2e-09
NP_000578 (OMIM: 217070,610102) complement compone ( 843)  247 58.0 1.5e-07
XP_011541952 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 660)  190 47.0 0.00025
XP_016865348 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 700)  190 47.0 0.00026
XP_016865344 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 727)  190 47.0 0.00027
XP_011541951 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 740)  190 47.0 0.00027
XP_016865345 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 777)  190 47.0 0.00028
NP_001002796 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 778)  190 47.0 0.00028
XP_005272139 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 793)  190 47.0 0.00029
NP_078993 (OMIM: 616296) multiple C2 and transmemb ( 999)  190 47.1 0.00034
NP_001265473 (OMIM: 120960,613789) complement comp ( 529)  163 41.7  0.0077
XP_016865354 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 537)  163 41.7  0.0078
NP_001265472 (OMIM: 120960,613789) complement comp ( 539)  163 41.7  0.0078
XP_016857724 (OMIM: 120960,613789) complement comp ( 591)  163 41.7  0.0083
NP_000057 (OMIM: 120960,613789) complement compone ( 591)  163 41.7  0.0083
XP_016865351 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 681)  163 41.8  0.0093
NP_001284706 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 692)  163 41.8  0.0094
XP_016865353 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 694)  163 41.8  0.0094
XP_016865350 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 694)  163 41.8  0.0094
XP_016865347 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 701)  163 41.8  0.0095
XP_016865346 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 714)  163 41.8  0.0096
XP_016865352 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 719)  163 41.8  0.0097
XP_005272147 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 732)  163 41.8  0.0098
XP_006714755 (OMIM: 616296) multiple C2 and transm ( 734)  163 41.8  0.0098


>>NP_005032 (OMIM: 170280,603553,605027,609135) perforin  (555 aa)
 initn: 3879 init1: 3879 opt: 3879  Z-score: 4025.3  bits: 754.6 E(93482): 2e-217
Smith-Waterman score: 3879; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:1-555)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSGSFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSGSFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTNWRAQGSGCQRHVTRAKVSSTEAVARD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTNWRAQGSGCQRHVTRAKVSSTEAVARD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 AARSIRNDWKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVECRFYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AARSIRNDWKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVECRFYS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 FHVVHTPPLHPDFKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRISALTALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FHVVHTPPLHPDFKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRISALTALR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 TCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFHQTYRERH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFHQTYRERH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SEVVGGHHTSINDLLFGIQAGPEQYSAWVNSLPGSPGLVDYTLEPLHVLLDSQDPRREAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SEVVGGHHTSINDLLFGIQAGPEQYSAWVNSLPGSPGLVDYTLEPLHVLLDSQDPRREAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 RRALSQYLTDRARWRDCSRPCPPGRQKSPRDPCQCVCHGSAVTTQDCCPRQRGLAQLEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RRALSQYLTDRARWRDCSRPCPPGRQKSPRDPCQCVCHGSAVTTQDCCPRQRGLAQLEVT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 FIQAWGLWGDWFTATDAYVKLFFGGQELRTSTVWDNNNPIWSVRLDFGDVLLATGGPLRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FIQAWGLWGDWFTATDAYVKLFFGGQELRTSTVWDNNNPIWSVRLDFGDVLLATGGPLRL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 QVWDQDSGRDDDLLGTCDQAPKSGSHEVRCNLNHGHLKFRYHARCLPHLGGGTCLDYVPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QVWDQDSGRDDDLLGTCDQAPKSGSHEVRCNLNHGHLKFRYHARCLPHLGGGTCLDYVPQ
              490       500       510       520       530       540

              550     
pF1KE1 MLLGEPPGNRSGAVW
       :::::::::::::::
NP_005 MLLGEPPGNRSGAVW
              550     

>>NP_001076585 (OMIM: 170280,603553,605027,609135) perfo  (555 aa)
 initn: 3879 init1: 3879 opt: 3879  Z-score: 4025.3  bits: 754.6 E(93482): 2e-217
Smith-Waterman score: 3879; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:1-555)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSGSFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSGSFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTNWRAQGSGCQRHVTRAKVSSTEAVARD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTNWRAQGSGCQRHVTRAKVSSTEAVARD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 AARSIRNDWKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVECRFYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARSIRNDWKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVECRFYS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 FHVVHTPPLHPDFKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRISALTALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FHVVHTPPLHPDFKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRISALTALR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 TCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFHQTYRERH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFHQTYRERH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SEVVGGHHTSINDLLFGIQAGPEQYSAWVNSLPGSPGLVDYTLEPLHVLLDSQDPRREAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEVVGGHHTSINDLLFGIQAGPEQYSAWVNSLPGSPGLVDYTLEPLHVLLDSQDPRREAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 RRALSQYLTDRARWRDCSRPCPPGRQKSPRDPCQCVCHGSAVTTQDCCPRQRGLAQLEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRALSQYLTDRARWRDCSRPCPPGRQKSPRDPCQCVCHGSAVTTQDCCPRQRGLAQLEVT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 FIQAWGLWGDWFTATDAYVKLFFGGQELRTSTVWDNNNPIWSVRLDFGDVLLATGGPLRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIQAWGLWGDWFTATDAYVKLFFGGQELRTSTVWDNNNPIWSVRLDFGDVLLATGGPLRL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 QVWDQDSGRDDDLLGTCDQAPKSGSHEVRCNLNHGHLKFRYHARCLPHLGGGTCLDYVPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVWDQDSGRDDDLLGTCDQAPKSGSHEVRCNLNHGHLKFRYHARCLPHLGGGTCLDYVPQ
              490       500       510       520       530       540

              550     
pF1KE1 MLLGEPPGNRSGAVW
       :::::::::::::::
NP_001 MLLGEPPGNRSGAVW
              550     

>>NP_001108603 (OMIM: 217050,612446) complement componen  (934 aa)
 initn: 164 init1:  94 opt: 356  Z-score: 369.5  bits: 78.9 E(93482): 8.4e-14
Smith-Waterman score: 356; 24.5% identity (54.7% similar) in 424 aa overlap (28-438:177-581)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE1    MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSG
                                     .. : :... .:.. : :.:    . .  :
NP_001 DSGRCIARKLECNGENDCGDNSDERDCGRTKAVCTRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRG
        150       160       170       180       190       200      

        60        70        80        90         100       110     
pF1KE1 SFPVDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTN--WRAQGSGCQRHVTRAKVSSTE
          :  . :    : :   ... . ..  :.:  : :  ...: .  . ..   :  .. 
NP_001 E--VLDNSF--TGGICKTVKSS-RTSNPYRVPANLENVGFEVQTAEDDLKTDFYKDLTSL
          210         220        230       240       250       260 

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE1 AVARDAARSIRNDWKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVE
       .  ..   :. ..   ...:    .:.   ..  .:..: . : : .:. . ::      
NP_001 GHNENQQGSFSSQGGSSFSVPIFYSSKRSENI--NHNSAFKQAIQASHKKDSSFIRIHKV
             270       280       290         300       310         

         180       190         200       210       220       230   
pF1KE1 CRFYSFHVVHTPPLH-PD-FKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRI
        .  .: ....  ::  : : .::. :: ..:..    : :.....:::.. .  :::  
NP_001 MKVLNF-TTKAKDLHLSDVFLKALNHLPLEYNSAL---YSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVY
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pF1KE1 SALTALRTCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFH
       . :  . . ::   :::..:.. :. .:..  . .  . ..: . :  .: ..:  .:: 
NP_001 DLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRIETKKRVLFAKKTKVEHR-CTTNKLSEKHEGSFI
         380       390       400       410        420       430    

           300       310         320        330       340       350
pF1KE1 QTYRERHSEVVGGHHTSINDLLF--GIQAGPEQ-YSAWVNSLPGSPGLVDYTLEPLHVLL
       :  ..  : . ::.      : .  : ..  :. .: :..:.  .:...:. : :. : :
NP_001 QGAEKSISLIRGGRSEYGAALAWEKGSSGLEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPI-VDL
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pF1KE1 DSQDP----RREALRRALSQYLTDRARWRDCS-RPCPP-GRQKSPRDPCQCVCHGSAVTT
         . :    .:. ::.::..:    :..  :.  :::  ::       : :::...  : 
NP_001 VRNIPCAVTKRNNLRKALQEYA---AKFDPCQCAPCPNNGRPTLSGTECLCVCQSG--TY
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pF1KE1 QDCCPRQRGLAQLEVTFIQAWGLWGDWFTATDAYVKLFFGGQELRTSTVWDNNNPIWSVR
        . : .:    . ...  : :: :..: :   .:                          
NP_001 GENCEKQSPDYKSNAVDGQ-WGCWSSWSTCDATYKRSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQ
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pF1KE1 LDFGDVLLATGGPLRLQVWDQDSGRDDDLLGTCDQAPKSGSHEVRCNLNHGHLKFRYHAR
                                                                   
NP_001 EEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEVDLPEIEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQLYLVGED
       610       620       630       640       650       660       

>>NP_000056 (OMIM: 217050,612446) complement component C  (934 aa)
 initn: 164 init1:  94 opt: 356  Z-score: 369.5  bits: 78.9 E(93482): 8.4e-14
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                  10        20        30        40        50       
pF1KE1    MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSG
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NP_000 DSGRCIARKLECNGENDCGDNSDERDCGRTKAVCTRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRG
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pF1KE1 SFPVDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTN--WRAQGSGCQRHVTRAKVSSTE
          :  . :    : :   ... . ..  :.:  : :  ...: .  . ..   :  .. 
NP_000 E--VLDNSF--TGGICKTVKSS-RTSNPYRVPANLENVGFEVQTAEDDLKTDFYKDLTSL
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pF1KE1 AVARDAARSIRNDWKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVE
       .  ..   :. ..   ...:    .:.   ..  .:..: . : : .:. . ::      
NP_000 GHNENQQGSFSSQGGSSFSVPIFYSSKRSENI--NHNSAFKQAIQASHKKDSSFIRIHKV
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pF1KE1 CRFYSFHVVHTPPLH-PD-FKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRI
        .  .: ....  ::  : : .::. :: ..:..    : :.....:::.. .  :::  
NP_000 MKVLNF-TTKAKDLHLSDVFLKALNHLPLEYNSAL---YSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVY
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pF1KE1 SALTALRTCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFH
       . :  . . ::   :::..:.. :. .:..  . .  . ..: . :  .: ..:  .:: 
NP_000 DLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRIETKKRVLFAKKTKVEHR-CTTNKLSEKHEGSFI
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pF1KE1 QTYRERHSEVVGGHHTSINDLLF--GIQAGPEQ-YSAWVNSLPGSPGLVDYTLEPLHVLL
       :  ..  : . ::.      : .  : ..  :. .: :..:.  .:...:. : :. : :
NP_000 QGAEKSISLIRGGRSEYGAALAWEKGSSGLEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPI-VDL
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pF1KE1 DSQDP----RREALRRALSQYLTDRARWRDCS-RPCPP-GRQKSPRDPCQCVCHGSAVTT
         . :    .:. ::.::..:    :..  :.  :::  ::       : :::...  : 
NP_000 VRNIPCAVTKRNNLRKALQEYA---AKFDPCQCAPCPNNGRPTLSGTECLCVCQSG--TY
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pF1KE1 QDCCPRQRGLAQLEVTFIQAWGLWGDWFTATDAYVKLFFGGQELRTSTVWDNNNPIWSVR
        . : .:    . ...  : :: :..: :   .:                          
NP_000 GENCEKQSPDYKSNAVDGQ-WGCWSSWSTCDATYKRSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQ
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pF1KE1 LDFGDVLLATGGPLRLQVWDQDSGRDDDLLGTCDQAPKSGSHEVRCNLNHGHLKFRYHAR
                                                                   
NP_000 EEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEVDLPEIEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQLYLVGED
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>>XP_005248414 (OMIM: 217050,612446) complement componen  (943 aa)
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                  10        20        30        40        50       
pF1KE1    MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSG
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pF1KE1 SFPVDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTN--WRAQGSGCQRHVTRAKVSSTE
          :  . :    : :   ... . ..  :.:  : :  ...: .  . ..   :  .. 
XP_005 E--VLDNSF--TGGICKTVKSS-RTSNPYRVPANLENVGFEVQTAEDDLKTDFYKDLTSL
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pF1KE1 AVARDAARSIRNDWKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVE
       .  ..   :. ..   ...:    .:.   ..  .:..: . : : .:. . ::      
XP_005 GHNENQQGSFSSQGGSSFSVPIFYSSKRSENI--NHNSAFKQAIQASHKKDSSFIRIHKV
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pF1KE1 CRFYSFHVVHTPPLH-PD-FKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRI
        .  .: ....  ::  : : .::. :: ..:..    : :.....:::.. .  :::  
XP_005 MKVLNF-TTKAKDLHLSDVFLKALNHLPLEYNSAL---YSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVY
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pF1KE1 SALTALRTCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFH
       . :  . . ::   :::..:.. :. .:..  . .  . ..: . :  .: ..:  .:: 
XP_005 DLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRIETKKRVLFAKKTKVEHR-CTTNKLSEKHEGSFI
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pF1KE1 QTYRERHSEVVGGHHTSINDLLF--GIQAGPEQ-YSAWVNSLPGSPGLVDYTLEPLHVLL
       :  ..  : . ::.      : .  : ..  :. .: :..:.  .:...:. : :. : :
XP_005 QGAEKSISLIRGGRSEYGAALAWEKGSSGLEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPI-VDL
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pF1KE1 DSQDP----RREALRRALSQYLTDRARWRDCS-RPCPP-GRQKSPRDPCQCVCHGSAVTT
         . :    .:. ::.::..:    :..  :.  :::  ::       : :::...  : 
XP_005 VRNIPCAVTKRNNLRKALQEYA---AKFDPCQCAPCPNNGRPTLSGTECLCVCQSG--TY
            510       520          530       540       550         

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pF1KE1 QDCCPRQRGLAQLEVTFIQAWGLWGDWFTATDAYVKLFFGGQELRTSTVWDNNNPIWSVR
        . : .:    . ...  : :: :..: :   .:                          
XP_005 GENCEKQSPDYKSNAVDGQ-WGCWSSWSTCDATYKRSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQ
       560       570        580       590       600       610      

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pF1KE1 LDFGDVLLATGGPLRLQVWDQDSGRDDDLLGTCDQAPKSGSHEVRCNLNHGHLKFRYHAR
                                                                   
XP_005 EEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEVDLPEIEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQLYLVGED
        620       630       640       650       660       670      

>>XP_011512421 (OMIM: 217050,612446) complement componen  (952 aa)
 initn: 164 init1:  94 opt: 356  Z-score: 369.4  bits: 78.9 E(93482): 8.5e-14
Smith-Waterman score: 356; 24.5% identity (54.7% similar) in 424 aa overlap (28-438:186-590)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE1    MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSG
                                     .. : :... .:.. : :.:    . .  :
XP_011 DSGRCIARKLECNGENDCGDNSDERDCGRTKAVCTRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRG
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        60        70        80        90         100       110     
pF1KE1 SFPVDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTN--WRAQGSGCQRHVTRAKVSSTE
          :  . :    : :   ... . ..  :.:  : :  ...: .  . ..   :  .. 
XP_011 E--VLDNSF--TGGICKTVKSS-RTSNPYRVPANLENVGFEVQTAEDDLKTDFYKDLTSL
           220         230        240       250       260       270

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE1 AVARDAARSIRNDWKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVE
       .  ..   :. ..   ...:    .:.   ..  .:..: . : : .:. . ::      
XP_011 GHNENQQGSFSSQGGSSFSVPIFYSSKRSENI--NHNSAFKQAIQASHKKDSSFIRIHKV
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pF1KE1 CRFYSFHVVHTPPLH-PD-FKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRI
        .  .: ....  ::  : : .::. :: ..:..    : :.....:::.. .  :::  
XP_011 MKVLNF-TTKAKDLHLSDVFLKALNHLPLEYNSAL---YSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVY
      330        340       350       360          370       380    

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pF1KE1 SALTALRTCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFH
       . :  . . ::   :::..:.. :. .:..  . .  . ..: . :  .: ..:  .:: 
XP_011 DLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRIETKKRVLFAKKTKVEHR-CTTNKLSEKHEGSFI
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       :  ..  : . ::.      : .  : ..  :. .: :..:.  .:...:. : :. : :
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