Result of FASTA (ccds) for pF1KE0394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0394, 1120 aa
  1>>>pF1KE0394 1120 - 1120 aa - 1120 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1841+/-0.00106; mu= 18.4808+/- 0.063
 mean_var=86.1665+/-17.197, 0's: 0 Z-trim(105.2): 31  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.138167
 statistics sampled from 8267 (8293) to 8267 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.255), width:  16
 Scan time:  4.680

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS42071.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15         (1120) 7430 1491.8       0
CCDS42070.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15         (1069) 6930 1392.1       0
CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19          ( 858)  440 98.4 7.6e-20
CCDS45707.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17        ( 937)  432 96.8 2.5e-19
CCDS11489.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17        ( 972)  432 96.8 2.6e-19
CCDS3468.1 GUF1 gene_id:60558|Hs108|chr4           ( 669)  381 86.6 2.1e-16
CCDS59295.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17        ( 962)  383 87.0 2.2e-16
CCDS47232.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5          ( 513)  328 75.9 2.6e-13
CCDS4024.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5           ( 732)  328 76.0 3.5e-13
CCDS4023.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5           ( 779)  328 76.0 3.7e-13
CCDS82867.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3          ( 591)  304 71.2   8e-12
CCDS33885.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3          ( 751)  304 71.2 9.8e-12
CCDS77851.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3          ( 770)  304 71.2   1e-11


>>CCDS42071.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15              (1120 aa)
 initn: 7430 init1: 7430 opt: 7430  Z-score: 7998.2  bits: 1491.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7430; 100.0% identity (100.0% similar) in 1120 aa overlap (1-1120:1-1120)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 EDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 EGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 FTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 WGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILEN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 IWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 QKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 DAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 RGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 GFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 LPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 TAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 MKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 SSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 EDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 KFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 LIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE0 MFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEK
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120
pF1KE0 ADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHAEKQRTLSKNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHAEKQRTLSKNK
             1090      1100      1110      1120

>>CCDS42070.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15              (1069 aa)
 initn: 6920 init1: 6920 opt: 6930  Z-score: 7459.9  bits: 1392.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7002; 95.4% identity (95.4% similar) in 1120 aa overlap (1-1120:1-1069)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSR
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
CCDS42 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHG-----------------------------
               10        20        30                              

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 EDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAV
                             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ----------------------NEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAV
                                    40        50        60         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 EGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTL
      70        80        90       100       110       120         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 FTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDG
     130       140       150       160       170       180         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 WGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILEN
     190       200       210       220       230       240         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 IWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVC
     250       260       270       280       290       300         

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 QKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAV
     310       320       330       340       350       360         

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 DAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEP
     370       380       390       400       410       420         

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 RGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPL
     430       440       450       460       470       480         

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 GFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCS
     490       500       510       520       530       540         

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 LPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLV
     550       560       570       580       590       600         

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 TAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQ
     610       620       630       640       650       660         

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 MKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLT
     670       680       690       700       710       720         

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 SSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKS
     730       740       750       760       770       780         

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 EDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLS
     790       800       810       820       830       840         

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 KFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQ
     850       860       870       880       890       900         

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 LIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTD
     910       920       930       940       950       960         

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE0 MFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEK
     970       980       990      1000      1010      1020         

             1090      1100      1110      1120
pF1KE0 ADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHAEKQRTLSKNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHAEKQRTLSKNK
    1030      1040      1050      1060         

>>CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19               (858 aa)
 initn: 1670 init1: 432 opt: 440  Z-score: 469.8  bits: 98.4 E(32554): 7.6e-20
Smith-Waterman score: 1465; 30.5% identity (53.2% similar) in 1130 aa overlap (1-1100:1-844)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSR
       ::  ..:..  .. . :::::. :.:::::::.::.: :. . :::.:  ::. :. :.:
CCDS12 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
               10        20        30        40        50        60

               70        80                    90       100        
pF1KE0 EDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEE------------YLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVR
       .::: : ::.::.:::: :  ....            .:::::::::::::::::..:.:
CCDS12 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130       140       150       160        
pF1KE0 ICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKN
       . :: ..::: : ::: ::..:::::  : :.:::..::.:: ..::.. :.: :. .. 
CCDS12 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
              130       140       150       160       170       180

      170       180       190       200       210       220        
pF1KE0 ILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPE
       :.:..:.. .:               :.. .:   .:. . :                : 
CCDS12 IVENVNVIISTY-------------GEGESGP---MGNIMID----------------PV
              190                       200                        

      230       240       250                  260         270     
pF1KE0 QGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIK-----------KEV--LMKTLWGDYYINM
        :.: : :.. ::.: ...::..:  :.. :           :.:  .:: :::: :.. 
CCDS12 LGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDP
      210       220       230       240       250       260        

         280        290         300       310       320       330  
pF1KE0 KAKKIMKGDQA-KGKK-P-LFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREA
          :. :.  . .::: :  : ::::. :....::...  :..  :.. .: .:. . : 
CCDS12 ANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDS-ED
      270       280       290       300       310       320        

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE0 RHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPET
       . .. :  ..:.  .::: . :.: :.  .::::.     : : :.  :       ::. 
CCDS12 KDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCE-LLYEG-------PPDD
       330       340       350       360       370                 

            400       410       420       430       440       450  
pF1KE0 QALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEK
       .:   .. .:  .  .:.....:::                                   
CCDS12 EA-AMGIKSC--DPKGPLMMYISKMV----------------------------------
     380          390       400                                    

            460       470       480       490       500       510  
pF1KE0 LAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEPRGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVF
                  ::.:        ::.                          : ::.:::
CCDS12 -----------PTSD--------KGR--------------------------FYAFGRVF
                                                         410       

            520       530       540       550       560       570  
pF1KE0 SGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPLGFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELE
       ::..  : :. ..::.:.:            .  . :   :      ..   :.::: .:
CCDS12 SGLVSTGLKVRIMGPNYTP------------GKKEDLYLKP------IQRTILMMGRYVE
       420       430                   440             450         

            580       590       600       610       620       630  
pF1KE0 YLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQ
        .:.:: ::..:. :...:..:..:. ..     .  ..: ..:.:::::: :.:...:.
CCDS12 PIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPK
     460       470       480       490       500       510         

            640       650       660       670       680       690  
pF1KE0 LVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPF
       ::.:.: : ..:: :: .:.:.:::... :::.::. :: ::.:  : : :. :.:.. .
CCDS12 LVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSY
     520       530       540       550       560       570         

            700       710       720       730       740       750  
pF1KE0 RETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQMKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLS
       :::...                                    .:. :    .:::   : 
CCDS12 RETVSE------------------------------------ESNVLCLSKSPNKHNRLY
     580                                           590       600   

            760       770       780       790       800       810  
pF1KE0 VRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLTSSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLT
       ..: :.:.                  :. ....:: .   .:. ...   .  : :  ..
CCDS12 MKARPFPD-----------------GLAEDIDKGEVS--ARQELKQRARYLAEKYEWDVA
           610                        620         630       640    

            820       830       840       850       860       870  
pF1KE0 GRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKSEDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSG
         :      .:: :::   :::::.. ..  :                   .. .:.:.:
CCDS12 EAR------KIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQ----------------YLNEIKDSVVAG
                650       660       670                       680  

            880       890       900       910       920       930  
pF1KE0 FQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQD
       :: ::  : .::: . :: : ..   :        .:  ..:                  
CCDS12 FQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLH-------ADAIHRG------------------
            690       700       710                                

            940       950       960       970         980       990
pF1KE0 GCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQLIATMKEACRYA--LQVKPQRLMAAMYTCDIM
                                .::.: : .. : ::  : ..: :::  .:  .:.
CCDS12 -------------------------GGQIIPTARR-CLYASVLTAQP-RLMEPIYLVEIQ
                                720        730        740       750

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KE0 ATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASP
          .:.: .:.::....:.:..: .  :: ::..:: ::: :::::. ..:. :.: : :
CCDS12 CPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFP
              760       770       780       790       800       810

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KE0 QLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHA
       : ::.::.:.:.:::                :. ..  . .  .::::::          
CCDS12 QCVFDHWQILPGDPF----------------DNSSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNF
              820                       830       840       850    

             1120
pF1KE0 EKQRTLSKNK
                 
CCDS12 LDKL      
                 

>>CCDS45707.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17             (937 aa)
 initn: 1251 init1: 299 opt: 432  Z-score: 460.6  bits: 96.8 E(32554): 2.5e-19
Smith-Waterman score: 1012; 25.9% identity (51.1% similar) in 1102 aa overlap (6-1100:81-908)

                                        10        20        30     
pF1KE0                          MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTL
                                     .: . .:. :.  :::. . .:. :::: .
CCDS45 TQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCF
               60        70        80        90       100       110

          40         50        60        70        80         90   
pF1KE0 ADCLI-SSNGIISSRLAGKLRYMDSREDEQIRGITMKSSAISLHYA-TGNEEYLINLIDS
       .:::: ...  : .:    : : :    :: ::. .::. ...    : .. ::.:..:.
CCDS45 VDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDT
              120       130       140       150       160       170

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE0 PGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIV
       ::::.::.::....:: :: .. .::.:::  .:. ....:  : .  .. ::::::::.
CCDS45 PGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLIL
              180       190       200       210       220       230

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE0 ELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWST
       :::. : .:: .:..:....:.:  .....                              
CCDS45 ELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLI-SMYST------------------------------
              240       250                                        

           220       230       240       250        260       270  
pF1KE0 GLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIG-IKKEVLMKTLWGDYY
             : .: .::  ::: :.:.  .  : .  ::.::.. .: :. . . : :::: :
CCDS45 ------DENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIY
           260       270       280       290       300       310   

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE0 INMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREA
       .: :..:. :   .....  ::..::: ....   :.     .. . .  ::... ..: 
CCDS45 FNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHL-TKEE
           320       330       340       350       360        370  

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE0 RHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPET
        . . .  .  .:....    . . :  :..:::   .  ..:. .  :    ::     
CCDS45 LKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGG---VDS-----
            380       390       400       410       420            

            400       410       420       430       440       450  
pF1KE0 QALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEK
         :  :.  :  .  .:..  ..::...:                               
CCDS45 -DLGEAMSDC--DPDGPLMCHTTKMYSTD-------------------------------
           430         440       450                               

            460       470       480       490       500       510  
pF1KE0 LAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEPRGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVF
                     ::                                   .: ::.::.
CCDS45 --------------DGV----------------------------------QFHAFGRVL
                                                              460  

            520       530       540       550       560       570  
pF1KE0 SGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPLGFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELE
       ::. . :. . ::: .:. ::             :.  :.     :..  :.. ..:   
CCDS45 SGTIHAGQPVKVLGENYT-LE----------DEEDS--QI-----CTVGRLWISVARYHI
            470       480                         490       500    

            580       590       600           610       620        
pF1KE0 YLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPS----CPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPS
        ...:: :: . : :... ..:.::. . :        : ::.:..: ....:::: .::
CCDS45 EVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATI-TEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPS
          510       520       530        540       550       560   

      630       640       650       660       670       680        
pF1KE0 EMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEP
       :.:... :.. .:.. : .   ..:.::::.. .::..:.  . ::.. ...: :.:..:
CCDS45 ELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADP
           570       580       590       600       610       620   

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pF1KE0 IIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQMKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKL
       .. : ::...  ..    :  .:..:...: .  :      .:.  :             
CCDS45 VVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLE------KGLAED-------------
           630       640       650             660                 

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pF1KE0 ATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLTSSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLE
                . .::.::  . . :             ::               :. : .
CCDS45 ---------IENEVVQITWNRKKL-------------GE--------------FFQTKYD
                   670                    680                      

      810       820       830       840       850       860        
pF1KE0 QHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKSEDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNS
         : . :      .::.:::   ::::::.          : :..  .   .  .:   :
CCDS45 WDLLAAR------SIWAFGPDATGPNILVDD---------TLPSEVDKALLGSVKD---S
      690             700       710                720          730

      870       880       890       900       910       920        
pF1KE0 IVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQ
       ::.::: .:  ::.:.: . .:          ::.   :  .:.:  ..     ::    
CCDS45 IVQGFQWGTREGPLCDELIRNV----------KFKILDAV-VAQEPLHR-----GG----
              740       750                 760             770    

      930       940       950       960       970       980        
pF1KE0 ELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQLIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCD
                                     ::.: : ...   :. .   :::  .:  .
CCDS45 ------------------------------GQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVE
                                            780       790       800

      990      1000      1010      1020      1030      1040        
pF1KE0 IMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLA
       ..: .: .. ::.::..:.:.: :.    :. .. ::: .:. .::::  ..: .:.: :
CCDS45 VQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQA
              810       820       830       840       850       860

     1050      1060      1070      1080      1090      1100        
pF1KE0 SPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVE
           :: ::.:.:.::.     .   ..  :   . . ::..:  .:.::::        
CCDS45 FSLSVFHHWQIVPGDPL----DKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISK
              870           880       890       900       910      

     1110      1120         
pF1KE0 HAEKQRTLSKNK         
                            
CCDS45 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
        920       930       

>>CCDS11489.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17             (972 aa)
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Smith-Waterman score: 1012; 25.9% identity (51.1% similar) in 1102 aa overlap (6-1100:116-943)

                                        10        20        30     
pF1KE0                          MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTL
                                     .: . .:. :.  :::. . .:. :::: .
CCDS11 TQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCF
          90       100       110       120       130       140     

          40         50        60        70        80         90   
pF1KE0 ADCLI-SSNGIISSRLAGKLRYMDSREDEQIRGITMKSSAISLHYA-TGNEEYLINLIDS
       .:::: ...  : .:    : : :    :: ::. .::. ...    : .. ::.:..:.
CCDS11 VDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDT
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           100       110       120       130       140       150   
pF1KE0 PGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIV
       ::::.::.::....:: :: .. .::.:::  .:. ....:  : .  .. ::::::::.
CCDS11 PGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLIL
         210       220       230       240       250       260     

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE0 ELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWST
       :::. : .:: .:..:....:.:  .....                              
CCDS11 ELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLI-SMYST------------------------------
         270       280        290                                  

           220       230       240       250        260       270  
pF1KE0 GLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIG-IKKEVLMKTLWGDYY
             : .: .::  ::: :.:.  .  : .  ::.::.. .: :. . . : :::: :
CCDS11 ------DENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIY
                300       310       320       330       340        

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE0 INMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREA
       .: :..:. :   .....  ::..::: ....   :.     .. . .  ::... ..: 
CCDS11 FNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHL-TKEE
      350       360       370       380       390       400        

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE0 RHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPET
        . . .  .  .:....    . . :  :..:::   .  ..:. .  :    ::     
CCDS11 LKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGG---VDS-----
       410       420       430       440       450                 

            400       410       420       430       440       450  
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         :  :.  :  .  .:..  ..::...:                               
CCDS11 -DLGEAMSDC--DPDGPLMCHTTKMYSTD-------------------------------
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pF1KE0 LAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEPRGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVF
                     ::                                   .: ::.::.
CCDS11 --------------DGV----------------------------------QFHAFGRVL
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pF1KE0 SGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPLGFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELE
       ::. . :. . ::: .:. ::             :.  :.     :..  :.. ..:   
CCDS11 SGTIHAGQPVKVLGENYT-LE----------DEEDS--QI-----CTVGRLWISVARYHI
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        ...:: :: . : :... ..:.::. . :        : ::.:..: ....:::: .::
CCDS11 EVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATI-TEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPS
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pF1KE0 EMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEP
       :.:... :.. .:.. : .   ..:.::::.. .::..:.  . ::.. ...: :.:..:
CCDS11 ELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADP
      600       610       620       630       640       650        

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pF1KE0 IIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQMKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKL
       .. : ::...  ..    :  .:..:...: .  :      .:.  :             
CCDS11 VVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLE------KGLAED-------------
      660       670       680       690                            

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pF1KE0 ATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLTSSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLE
                . .::.::  . . :             ::               :. : .
CCDS11 ---------IENEVVQITWNRKKL-------------GE--------------FFQTKYD
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pF1KE0 QHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKSEDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNS
         : . :      .::.:::   ::::::.          : :..  .   .  .:   :
CCDS11 WDLLAAR------SIWAFGPDATGPNILVDD---------TLPSEVDKALLGSVKD---S
           730             740                750       760        

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pF1KE0 IVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQ
       ::.::: .:  ::.:.: . .:          ::.   :  .:.:  ..     ::    
CCDS11 IVQGFQWGTREGPLCDELIRNV----------KFKILDAV-VAQEPLHR-----GG----
         770       780                 790        800              

      930       940       950       960       970       980        
pF1KE0 ELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQLIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCD
                                     ::.: : ...   :. .   :::  .:  .
CCDS11 ------------------------------GQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVE
                                       810       820       830     

      990      1000      1010      1020      1030      1040        
pF1KE0 IMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLA
       ..: .: .. ::.::..:.:.: :.    :. .. ::: .:. .::::  ..: .:.: :
CCDS11 VQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQA
         840       850       860       870       880       890     

     1050      1060      1070      1080      1090      1100        
pF1KE0 SPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVE
           :: ::.:.:.::.     .   ..  :   . . ::..:  .:.::::        
CCDS11 FSLSVFHHWQIVPGDPL----DKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISK
         900       910           920       930       940       950 

     1110      1120         
pF1KE0 HAEKQRTLSKNK         
                            
CCDS11 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
             960       970  

>>CCDS3468.1 GUF1 gene_id:60558|Hs108|chr4                (669 aa)
 initn: 364 init1: 260 opt: 381  Z-score: 407.9  bits: 86.6 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 381; 38.8% identity (65.7% similar) in 201 aa overlap (18-210:67-260)

                            10        20        30        40       
pF1KE0              MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIIS
                                     ::::. ..:::::::.:::: :.  .: :.
CCDS34 GAAPESWATDRLYSSAEFKEKLDMSRFPVENIRNFSIVAHVDHGKSTLADRLLELTGTID
         40        50        60        70        80        90      

        50        60        70        80        90       100       
pF1KE0 SRLAGKLRYMDSREDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAV
       .   .: . .:. . :. ::::.:... :: :   ...::.::::.::::::: ::: ..
CCDS34 KTKNNK-QVLDKLQVERERGITVKAQTASLFYNCEGKQYLLNLIDTPGHVDFSYEVSRSL
        100        110       120       130       140       150     

       110       120       130       140       150        160      
pF1KE0 RICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFT-PQEAYSHL
         :.: ..:::: ::.  :: : .  :.  ..  . ::::::     :: . :... ...
CCDS34 SACQGVLLVVDANEGIQAQTVANFFLAFEAQLSVIPVINKID-----LKNADPERVENQI
         160       170       180       190            200       210

        170              180       190       200       210         
pF1KE0 KNILE-------QINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTD
       .....       .:.:  ::   : ::.   ::    .:. ..     :.:         
CCDS34 EKVFDIPSDECIKISAKLGTNVES-VLQAIIERIPPPKVHRKNPLRALVFDSTFDQYRGV
              220       230        240       250       260         

     220       230       240       250       260       270         
pF1KE0 DSHLYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKK
                                                                   
CCDS34 IANVALFDGVVSKGDKIVSAHTQKTYEVNEVGVLNPNEQPTHKLYAGQVGYLIAGMKDVT
     270       280       290       300       310       320         

>>CCDS59295.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17             (962 aa)
 initn: 1220 init1: 299 opt: 383  Z-score: 407.6  bits: 87.0 E(32554): 2.2e-16
Smith-Waterman score: 963; 25.5% identity (50.4% similar) in 1101 aa overlap (6-1100:116-933)

                                        10        20        30     
pF1KE0                          MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTL
                                     .: . .:. :.  :::. . .:. ::::  
CCDS59 TQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT--
          90       100       110       120       130       140     

          40        50        60        70        80         90    
pF1KE0 ADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSREDEQIRGITMKSSAISLHYA-TGNEEYLINLIDSP
              .  : .:    : : :    :: ::. .::. ...    : .. ::.:..:.:
CCDS59 -------HPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTP
                  150       160       170       180       190      

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE0 GHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVE
       :::.::.::....:: :: .. .::.:::  .:. ....:  : .  .. ::::::::.:
CCDS59 GHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILE
        200       210       220       230       240       250      

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE0 LKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTG
       ::. : .:: .:..:....:.:  .....                               
CCDS59 LKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLI-SMYST-------------------------------
        260       270        280                                   

          220       230       240       250        260       270   
pF1KE0 LEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIG-IKKEVLMKTLWGDYYI
            : .: .::  ::: :.:.  .  : .  ::.::.. .: :. . . : :::: :.
CCDS59 -----DENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYF
               290       300       310       320       330         

           280       290       300       310       320       330   
pF1KE0 NMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREAR
       : :..:. :   .....  ::..::: ....   :.     .. . .  ::... ..:  
CCDS59 NPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHL-TKEEL
     340       350       360       370       380       390         

           340       350       360       370       380       390   
pF1KE0 HSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQ
       . . .  .  .:....    . . :  :..:::   .  ..:. .  :    ::      
CCDS59 KLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGG---VDS------
      400       410       420       430       440                  

           400       410       420       430       440       450   
pF1KE0 ALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKL
        :  :.  :  .  .:..  ..::...:                                
CCDS59 DLGEAMSDC--DPDGPLMCHTTKMYSTD--------------------------------
     450         460       470                                     

           460       470       480       490       500       510   
pF1KE0 AAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEPRGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFS
                    ::                                   .: ::.::.:
CCDS59 -------------DGV----------------------------------QFHAFGRVLS
                                                        480        

           520       530       540       550       560       570   
pF1KE0 GVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPLGFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEY
       :. . :. . ::: .:. ::             :.  :.     :..  :.. ..:    
CCDS59 GTIHAGQPVKVLGENYT-LE----------DEEDS--QI-----CTVGRLWISVARYHIE
      490       500                  510              520       530

           580       590       600           610       620         
pF1KE0 LEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPS----CPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSE
       ...:: :: . : :... ..:.::. . :        : ::.:..: ....:::: .:::
CCDS59 VNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATI-TEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSE
              540       550        560       570       580         

     630       640       650       660       670       680         
pF1KE0 MPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPI
       .:... :.. .:.. : .   ..:.::::.. .::..:.  . ::.. ...: :.:..:.
CCDS59 LPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPV
     590       600       610       620       630       640         

     690       700       710       720       730       740         
pF1KE0 IPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQMKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLA
       . : ::...  ..    :  .:..:...: .  :      .:.  :              
CCDS59 VTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLE------KGLAED--------------
     650       660       670       680                             

     750       760       770       780       790       800         
pF1KE0 TLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLTSSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQ
               . .::.::  . . :             ::               :. : . 
CCDS59 --------IENEVVQITWNRKKL-------------GE--------------FFQTKYDW
             690       700                                  710    

     810       820       830       840       850       860         
pF1KE0 HLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKSEDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSI
        : . :      .::.:::   ::::::.          : :..  .   .  .:   ::
CCDS59 DLLAAR------SIWAFGPDATGPNILVDD---------TLPSEVDKALLGSVKD---SI
          720             730                740       750         

     870       880       890       900       910       920         
pF1KE0 VSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQE
       :.::: .:  ::.:.: . .:          ::.   :  .:.:  ..     ::     
CCDS59 VQGFQWGTREGPLCDELIRNV----------KFKILDAV-VAQEPLHR-----GG-----
        760       770                 780        790               

     930       940       950       960       970       980         
pF1KE0 LQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQLIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDI
                                    ::.: : ...   :. .   :::  .:  ..
CCDS59 -----------------------------GQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEV
                                      800       810       820      

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KE0 MATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLAS
       .: .: .. ::.::..:.:.: :.    :. .. ::: .:. .::::  ..: .:.: : 
CCDS59 QAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAF
        830       840       850       860       870       880      

    1050      1060      1070      1080      1090      1100         
pF1KE0 PQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEH
          :: ::.:.:.::.     .   ..  :   . . ::..:  .:.::::         
CCDS59 SLSVFHHWQIVPGDPL----DKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKF
        890       900           910       920       930       940  

    1110      1120         
pF1KE0 AEKQRTLSKNK         
                           
CCDS59 FDDPMLLELAKQDVVLNYPM
            950       960  

>>CCDS47232.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5               (513 aa)
 initn: 284 init1: 213 opt: 328  Z-score: 352.5  bits: 75.9 E(32554): 2.6e-13
Smith-Waterman score: 328; 29.0% identity (56.2% similar) in 283 aa overlap (17-293:68-342)

                             10        20        30        40      
pF1KE0               MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGII
                                     :.:::: ..::.: :::: .. ..  .:  
CCDS47 HVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHIDAGKTTTTERILYYSGY-
        40        50        60        70        80        90       

         50        60            70        80        90       100  
pF1KE0 SSRLAGKLRYMDSRED----EQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSE
        .:  : .   :.  :    :. ::::..:.:... .    . : .::::.::::::. :
CCDS47 -TRSLGDVDDGDTVTDFMAQERERGITIQSAAVTFDW----KGYRVNLIDTPGHVDFTLE
         100       110       120       130           140       150 

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE0 VSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEA
       :   .:. :: . : ::  ::  :: .: :::  .::  .  .::.:.  . .:.. .  
CCDS47 VERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQADKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESI
             160       170       180       190       200       210 

            170       180       190       200       210       220  
pF1KE0 YSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSH
         .::     ..   :   : : . . . .: .   : ::..:.. .. .  :: .:   
CCDS47 REKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGVVDVVMKE-KLLWNCNSNDGKD-FERKPLLEMNDPEL
             220       230       240        250        260         

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE0 LYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMK
       :  . :  :... .. :      .   . .:... .     ..:      . . :  .. 
CCDS47 LKETTEARNALIEQVADLDDEFADLVLEEFSENFDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTAVPVLC
     270       280       290       300       310       320         

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 GD--QAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQ
       :.  . :: .::.                                               
CCDS47 GSALKNKGIQPLLDAVTMYLPSPEERNYEFLQWYKDDLCALAFKVLHDKQRGPLVFMRIY
     330       340       350       360       370       380         

>>CCDS4024.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5                (732 aa)
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Smith-Waterman score: 328; 29.0% identity (56.2% similar) in 283 aa overlap (17-293:68-342)

                             10        20        30        40      
pF1KE0               MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGII
                                     :.:::: ..::.: :::: .. ..  .:  
CCDS40 HVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHIDAGKTTTTERILYYSGY-
        40        50        60        70        80        90       

         50        60            70        80        90       100  
pF1KE0 SSRLAGKLRYMDSRED----EQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSE
        .:  : .   :.  :    :. ::::..:.:... .    . : .::::.::::::. :
CCDS40 -TRSLGDVDDGDTVTDFMAQERERGITIQSAAVTFDW----KGYRVNLIDTPGHVDFTLE
         100       110       120       130           140       150 

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE0 VSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEA
       :   .:. :: . : ::  ::  :: .: :::  .::  .  .::.:.  . .:.. .  
CCDS40 VERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQADKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESI
             160       170       180       190       200       210 

            170       180       190       200       210       220  
pF1KE0 YSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSH
         .::     ..   :   : : . . . .: .   : ::..:.. .. .  :: .:   
CCDS40 REKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGVVDVVMKE-KLLWNCNSNDGKD-FERKPLLEMNDPEL
             220       230       240        250        260         

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE0 LYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMK
       :  . :  :... .. :      .   . .:... .     ..:      . . :  .. 
CCDS40 LKETTEARNALIEQVADLDDEFADLVLEEFSENFDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTAVPVLC
     270       280       290       300       310       320         

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pF1KE0 GD--QAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQ
       :.  . :: .::.                                               
CCDS40 GSALKNKGIQPLLDAVTMYLPSPEERNYEFLERISRLLLPFADQHVEIPSLTAGNIALTV
     330       340       350       360       370       380         

>>CCDS4023.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5                (779 aa)
 initn: 284 init1: 213 opt: 328  Z-score: 349.7  bits: 76.0 E(32554): 3.7e-13
Smith-Waterman score: 328; 29.0% identity (56.2% similar) in 283 aa overlap (17-293:68-342)

                             10        20        30        40      
pF1KE0               MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGII
                                     :.:::: ..::.: :::: .. ..  .:  
CCDS40 HVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHIDAGKTTTTERILYYSGY-
        40        50        60        70        80        90       

         50        60            70        80        90       100  
pF1KE0 SSRLAGKLRYMDSRED----EQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSE
        .:  : .   :.  :    :. ::::..:.:... .    . : .::::.::::::. :
CCDS40 -TRSLGDVDDGDTVTDFMAQERERGITIQSAAVTFDW----KGYRVNLIDTPGHVDFTLE
         100       110       120       130           140       150 

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE0 VSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEA
       :   .:. :: . : ::  ::  :: .: :::  .::  .  .::.:.  . .:.. .  
CCDS40 VERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQADKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESI
             160       170       180       190       200       210 

            170       180       190       200       210       220  
pF1KE0 YSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSH
         .::     ..   :   : : . . . .: .   : ::..:.. .. .  :: .:   
CCDS40 REKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGVVDVVMKE-KLLWNCNSNDGKD-FERKPLLEMNDPEL
             220       230       240        250        260         

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE0 LYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMK
       :  . :  :... .. :      .   . .:... .     ..:      . . :  .. 
CCDS40 LKETTEARNALIEQVADLDDEFADLVLEEFSENFDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTAVPVLC
     270       280       290       300       310       320         

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 GD--QAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQ
       :.  . :: .::.                                               
CCDS40 GSALKNKGIQPLLDAVTMYLPSPEERNYEFLQWYKDDLCALAFKVLHDKQRGPLVFMRIY
     330       340       350       360       370       380         




1120 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 Total Scan time:  4.680 Total Display time:  0.340

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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