Result of FASTA (ccds) for pF1KE0390
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0390, 488 aa
  1>>>pF1KE0390 488 - 488 aa - 488 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8800+/-0.00115; mu= 6.5740+/- 0.067
 mean_var=313.6859+/-72.684, 0's: 0 Z-trim(111.4): 625  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.072415
 statistics sampled from 11561 (12338) to 11561 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.379), width:  16
 Scan time:  3.490

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20          ( 488) 3374 366.8  3e-101
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1              ( 509) 1264 146.4 6.9e-35
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 505) 1258 145.8 1.1e-34
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 526) 1258 145.8 1.1e-34
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 504) 1255 145.4 1.3e-34
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 525) 1255 145.5 1.4e-34
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20          ( 451) 1230 142.8 7.6e-34
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1              ( 529) 1224 142.2 1.3e-33
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20           ( 536) 1218 141.6   2e-33
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8              ( 505) 1211 140.8 3.2e-33
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6             ( 505) 1192 138.9 1.3e-32
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18          ( 543) 1190 138.7 1.5e-32
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 534) 1187 138.4 1.9e-32
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8            ( 491) 1174 137.0 4.6e-32
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8             ( 512) 1174 137.0 4.7e-32
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8             ( 434) 1169 136.4 6.1e-32
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1130) 1050 124.5 5.9e-28
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1149) 1050 124.5 5.9e-28
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             ( 542) 1038 122.8 9.2e-28
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1043) 1038 123.2 1.3e-27
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1058) 1038 123.2 1.3e-27
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1064) 1038 123.2 1.3e-27
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1079) 1038 123.2 1.4e-27
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1161) 1038 123.3 1.4e-27
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1167) 1038 123.3 1.4e-27
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1182) 1038 123.3 1.4e-27
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 537) 1003 119.2 1.2e-26
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19          ( 466)  893 107.6 3.1e-23
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19          ( 507)  893 107.6 3.2e-23
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19          ( 508)  893 107.6 3.2e-23
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5             ( 822)  893 107.9 4.2e-23
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5            ( 453)  887 106.9 4.6e-23
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 482)  846 102.7 9.4e-22
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 764)  823 100.6 6.5e-21
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 822)  823 100.6 6.7e-21
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15           ( 450)  814 99.3 9.2e-21
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4             ( 631)  814 99.5 1.1e-20
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX             ( 659)  807 98.8 1.9e-20
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX             ( 693)  807 98.8 1.9e-20
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs108|chrX             ( 675)  789 96.9 7.1e-20
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4             ( 527)  781 96.0 1.1e-19
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs108|chr5             ( 620)  771 95.0 2.5e-19
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 694)  748 92.7 1.4e-18
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 752)  748 92.7 1.5e-18
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1            ( 976)  712 89.1 2.3e-17
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6           ( 998)  695 87.4   8e-17
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1            (1005)  688 86.6 1.3e-16
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1004)  687 86.5 1.4e-16
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1015)  687 86.5 1.4e-16
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1016)  687 86.5 1.4e-16


>>CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20               (488 aa)
 initn: 3374 init1: 3374 opt: 3374  Z-score: 1931.3  bits: 366.8 E(32554): 3e-101
Smith-Waterman score: 3374; 100.0% identity (100.0% similar) in 488 aa overlap (1-488:1-488)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQLFLALY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQLFLALY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 DFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAKVCHYRVSMAADGSLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAKVCHYRVSMAADGSLY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 LQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCMPQKAPRQDVWERPHSEFALGRKLGEGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCMPQKAPRQDVWERPHSEFALGRKLGEGY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 FGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 VTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 GLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 TYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATLREKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATLREKL
              430       440       450       460       470       480

               
pF1KE0 HAIHRCHP
       ::::::::
CCDS13 HAIHRCHP
               

>>CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1                   (509 aa)
 initn: 1095 init1: 730 opt: 1264  Z-score: 739.8  bits: 146.4 E(32554): 6.9e-35
Smith-Waterman score: 1264; 44.5% identity (69.6% similar) in 454 aa overlap (39-480:46-494)

       10        20        30        40          50         60     
pF1KE0 LAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAE--PCSPFPQ-LFLALYDFTAR
                                     ::. :  .   : ::. . : .::...   
CCDS35 NIDVCENCHYPIVPLDGKGTLLIRNGSEVRDPLVTYEGSNPPASPLQDNLVIALHSYEPS
          20        30        40        50        60        70     

          70        80        90        100       110       120    
pF1KE0 CGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLS-GQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPWYFSG
         :.:. ..:..:  ::..: .  :. :. ::   :..:.. ::::.  .:  .::.:..
CCDS35 HDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQE--GFIPFNFVAKAN--SLEPEPWFFKN
          80        90       100         110       120         130 

          130       140       150       160            170         
pF1KE0 VSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVR----AQAKVC-HYRVSMAADGSL
       .:: .:.. ::.: :  :.:::: :::. :..:::::     :..:  ::..    .:..
CCDS35 LSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGF
             140       150       160       170       180       190 

     180       190       200       210          220       230      
pF1KE0 YLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPHSEFALGRKL
       :..    ::::.::. .:      . . : .::.   :::   .: :: :.  . : ..:
CCDS35 YISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERL
             200       210       220       230       240       250 

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE0 GEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGE
       : : ::::: : . :   ::.: .:...:.   .  : . .: :.:.::.::.:: .  :
CCDS35 GAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQ-E
             260       270       280       290       300        310

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE0 PVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNV
       :.::.:: :..:.:  :: :: :  : .  :: .: :.::::...::.  .:::: : :.
CCDS35 PIYIITEYMENGSLVDFLKTPSGIKLTINKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANI
              320       330       340       350       360       370

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE0 LVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLL
       ::.: :.::.::::::::..:. :.   ..:.:.::::::: :: .:. ::::::::.::
CCDS35 LVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILL
              380       390       400       410       420       430

        420       430       440       450       460       470      
pF1KE0 HEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATL
        :. :.:. :: :::: :..:.. ::::. ::  :: :.: ::  ::.  ::.::.:  :
CCDS35 TEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLCWKERPEDRPTFDYL
              440       450       460       470       480       490

        480               
pF1KE0 REKLHAIHRCHP       
       :  :               
CCDS35 RSVLEDFFTATEGQYQPQP
              500         

>>CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20                (505 aa)
 initn: 1176 init1: 732 opt: 1258  Z-score: 736.4  bits: 145.8 E(32554): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 1258; 41.3% identity (68.3% similar) in 463 aa overlap (26-480:32-490)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE0      MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQL
                                     ::  .  .  ::.    :   .  .    .
CCDS54 GCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPNSHNSNTPGIREAGSEDII
              10        20        30        40        50        60 

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE0 FLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETL
        .::::. :    .:: ..::.. .:::.: .  :: :. . . : .: ..::..  ..:
CCDS54 VVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATR-KEGYIPSNYVARV--DSL
              70        80        90       100        110          

         120       130       140       150       160            170
pF1KE0 SDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAK-----VCHYR
         . :.:.:.:: .:.. ::.: :  :.:.:: ::.. :.::::::         : ::.
CCDS54 ETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYK
      120       130       140       150       160       170        

              180       190       200       210          220       
pF1KE0 VSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPH
       .    .:..:..    :  :.::. .:: .   . . :  :::   :::  ..:.:: :.
CCDS54 IRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPR
      180       190       200       210       220       230        

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE0 SEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIR
         . : .::: : ::::: . .     ::.:..: ..:..  .  : ...: :.:..:..
CCDS54 ESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVK
      240       250       260       270       280       290        

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE0 LHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVV
       :::: .  ::.::.::.: ::.:  :: . ::    :: :. :. :.::::...:..  .
CCDS54 LHAVVTK-EPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYI
      300        310       320       330       340       350       

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE0 HRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKS
       :::: : :.::. .:.::.:::::::...:. :.   ..:.:.::::::: :.  :. ::
CCDS54 HRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKS
       360       370       380       390       400       410       

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE0 DVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSP
       ::::::.:: :. :::. :: ::.: :... . ::::.:::  :: :.: .:..::.. :
CCDS54 DVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELYNIMMRCWKNRP
       420       430       440       450       460       470       

       470       480               
pF1KE0 EERPSFATLREKLHAIHRCHP       
       ::::.:  ..  :               
CCDS54 EERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP
       480       490       500     

>>CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20                (526 aa)
 initn: 1176 init1: 732 opt: 1258  Z-score: 736.3  bits: 145.8 E(32554): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 1258; 41.3% identity (68.3% similar) in 463 aa overlap (26-480:53-511)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE0      MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQL
                                     ::  .  .  ::.    :   .  .    .
CCDS33 GCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPNSHNSNTPGIREAGSEDII
             30        40        50        60        70        80  

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE0 FLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETL
        .::::. :    .:: ..::.. .:::.: .  :: :. . . : .: ..::..  ..:
CCDS33 VVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATR-KEGYIPSNYVARV--DSL
             90       100       110       120        130           

         120       130       140       150       160            170
pF1KE0 SDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAK-----VCHYR
         . :.:.:.:: .:.. ::.: :  :.:.:: ::.. :.::::::         : ::.
CCDS33 ETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYK
     140       150       160       170       180       190         

              180       190       200       210          220       
pF1KE0 VSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPH
       .    .:..:..    :  :.::. .:: .   . . :  :::   :::  ..:.:: :.
CCDS33 IRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPR
     200       210       220       230       240       250         

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE0 SEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIR
         . : .::: : ::::: . .     ::.:..: ..:..  .  : ...: :.:..:..
CCDS33 ESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVK
     260       270       280       290       300       310         

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE0 LHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVV
       :::: .  ::.::.::.: ::.:  :: . ::    :: :. :. :.::::...:..  .
CCDS33 LHAVVTK-EPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYI
     320        330       340       350       360       370        

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE0 HRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKS
       :::: : :.::. .:.::.:::::::...:. :.   ..:.:.::::::: :.  :. ::
CCDS33 HRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKS
      380       390       400       410       420       430        

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE0 DVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSP
       ::::::.:: :. :::. :: ::.: :... . ::::.:::  :: :.: .:..::.. :
CCDS33 DVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELYNIMMRCWKNRP
      440       450       460       470       480       490        

       470       480               
pF1KE0 EERPSFATLREKLHAIHRCHP       
       ::::.:  ..  :               
CCDS33 EERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP
      500       510       520      

>>CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20                (504 aa)
 initn: 1170 init1: 732 opt: 1255  Z-score: 734.8  bits: 145.4 E(32554): 1.3e-34
Smith-Waterman score: 1255; 41.5% identity (68.5% similar) in 463 aa overlap (26-480:32-489)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE0      MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQL
                                     ::  .  .  ::.    : :.   .    .
CCDS54 GCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPNSHNSNT-PGIREGSEDII
              10        20        30        40         50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE0 FLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETL
        .::::. :    .:: ..::.. .:::.: .  :: :. . . : .: ..::..  ..:
CCDS54 VVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATR-KEGYIPSNYVARV--DSL
               70        80        90       100        110         

         120       130       140       150       160            170
pF1KE0 SDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAK-----VCHYR
         . :.:.:.:: .:.. ::.: :  :.:.:: ::.. :.::::::         : ::.
CCDS54 ETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYK
       120       130       140       150       160       170       

              180       190       200       210          220       
pF1KE0 VSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPH
       .    .:..:..    :  :.::. .:: .   . . :  :::   :::  ..:.:: :.
CCDS54 IRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPR
       180       190       200       210       220       230       

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE0 SEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIR
         . : .::: : ::::: . .     ::.:..: ..:..  .  : ...: :.:..:..
CCDS54 ESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVK
       240       250       260       270       280       290       

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE0 LHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVV
       :::: .  ::.::.::.: ::.:  :: . ::    :: :. :. :.::::...:..  .
CCDS54 LHAVVTK-EPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYI
       300        310       320       330       340       350      

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE0 HRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKS
       :::: : :.::. .:.::.:::::::...:. :.   ..:.:.::::::: :.  :. ::
CCDS54 HRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKS
        360       370       380       390       400       410      

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE0 DVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSP
       ::::::.:: :. :::. :: ::.: :... . ::::.:::  :: :.: .:..::.. :
CCDS54 DVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELYNIMMRCWKNRP
        420       430       440       450       460       470      

       470       480               
pF1KE0 EERPSFATLREKLHAIHRCHP       
       ::::.:  ..  :               
CCDS54 EERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP
        480       490       500    

>>CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20                (525 aa)
 initn: 1170 init1: 732 opt: 1255  Z-score: 734.6  bits: 145.5 E(32554): 1.4e-34
Smith-Waterman score: 1255; 41.5% identity (68.5% similar) in 463 aa overlap (26-480:53-510)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE0      MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQL
                                     ::  .  .  ::.    : :.   .    .
CCDS54 GCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPNSHNSNT-PGIREGSEDII
             30        40        50        60        70         80 

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE0 FLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETL
        .::::. :    .:: ..::.. .:::.: .  :: :. . . : .: ..::..  ..:
CCDS54 VVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATR-KEGYIPSNYVARV--DSL
              90       100       110       120        130          

         120       130       140       150       160            170
pF1KE0 SDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAK-----VCHYR
         . :.:.:.:: .:.. ::.: :  :.:.:: ::.. :.::::::         : ::.
CCDS54 ETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYK
      140       150       160       170       180       190        

              180       190       200       210          220       
pF1KE0 VSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPH
       .    .:..:..    :  :.::. .:: .   . . :  :::   :::  ..:.:: :.
CCDS54 IRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPR
      200       210       220       230       240       250        

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE0 SEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIR
         . : .::: : ::::: . .     ::.:..: ..:..  .  : ...: :.:..:..
CCDS54 ESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVK
      260       270       280       290       300       310        

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE0 LHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVV
       :::: .  ::.::.::.: ::.:  :: . ::    :: :. :. :.::::...:..  .
CCDS54 LHAVVTK-EPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYI
      320        330       340       350       360       370       

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE0 HRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKS
       :::: : :.::. .:.::.:::::::...:. :.   ..:.:.::::::: :.  :. ::
CCDS54 HRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKS
       380       390       400       410       420       430       

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE0 DVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSP
       ::::::.:: :. :::. :: ::.: :... . ::::.:::  :: :.: .:..::.. :
CCDS54 DVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELYNIMMRCWKNRP
       440       450       460       470       480       490       

       470       480               
pF1KE0 EERPSFATLREKLHAIHRCHP       
       ::::.:  ..  :               
CCDS54 EERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP
       500       510       520     

>>CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20               (451 aa)
 initn: 1070 init1: 438 opt: 1230  Z-score: 721.1  bits: 142.8 E(32554): 7.6e-34
Smith-Waterman score: 1230; 47.5% identity (68.1% similar) in 432 aa overlap (56-480:13-441)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KE0 PDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQLFLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGG
                                     ...:.:: .:   ::: : :: . . ..  
CCDS13                   MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEE
                                 10        20        30        40  

          90          100       110       120       130       140  
pF1KE0 GYIFARRLS---GQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPG
        . .:  :.   :  . : ::  :   :  ::. ..::.:. .::..: . : .  :  :
CCDS13 QWWWATLLDEAGGAVAQGYVP--HNYLAERETVESEPWFFGCISRSEAVRRLQAEGNATG
             50        60          70        80        90       100

            150       160       170       180       190       200  
pF1KE0 AFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAKVCHYRVSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWK
       ::::: ::.  . : ::::    : ::..   : : :.:...  : .: ::..:..:.  
CCDS13 AFLIRVSEKPSADYVLSVRDTQAVRHYKIWRRAGGRLHLNEAVSFLSLPELVNYHRAQSL
              110       120       130       140       150       160

            210          220       230       240       250         
pF1KE0 LIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPHSEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKV
            :  ::    :.  :. : ::::. ::.: :::: ::::::.::::   . :::::
CCDS13 SHGLRLAAPCRKHEPEPLPHWDDWERPREEFTLCRKLGSGYFGEVFEGLWKDRVQVAIKV
              170       180       190       200       210       220

     260        270       280       290       300       310        
pF1KE0 IKSANMKLTD-LAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPE
       :.  :.   . : .:::..: :::.... :.:: : :.::::.:::: ::.:  .:   .
CCDS13 ISRDNLLHQQMLQSEIQAMKKLRHKHILALYAVVSVGDPVYIITELMAKGSLLELLRDSD
              230       240       250       260       270       280

      320       330       340       350       360       370        
pF1KE0 GRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDD
        ..: .  :: .: :::::: ::: :  .::::::::.:: ..  :::.:::::::.:.:
CCDS13 EKVLPVSELLDIAWQVAEGMCYLESQNYIHRDLAARNILVGENTLCKVGDFGLARLIKED
              290       300       310       320       330       340

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE0 IYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQ
       .:  : . .:: ::::::: .   .: ::::::::.::::.:. :: :: ::.:::.. .
CCDS13 VYL-SHDHNIPYKWTAPEALSRGHYSTKSDVWSFGILLHEMFSRGQVPYPGMSNHEAFLR
               350       360       370       380       390         

      440       450       460       470       480          
pF1KE0 IMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATLREKLHAIHRCHP  
       .  :::.: :  ::  :. ::: ::  .::.:: : .:::.:          
CCDS13 VDAGYRMPCPLECPPSVHKLMLTCWCRDPEQRPCFKALRERLSSFTSYENPT
     400       410       420       430       440       450 

>>CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1                   (529 aa)
 initn: 1233 init1: 730 opt: 1224  Z-score: 717.0  bits: 142.2 E(32554): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 1224; 45.4% identity (71.2% similar) in 434 aa overlap (55-477:81-509)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KE0 EPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQLFLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEG
                                     ::.::::. ::   .:.  .:...  :.. 
CCDS30 PNYSNFSSQAINPGFLDSGTIRGVSGIGVTLFIALYDYEARTEDDLTFTKGEKFHILNNT
               60        70        80        90       100       110

            90       100       110       120       130       140   
pF1KE0 -GGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGA
        : .  :: ::.  . : .: ..:: .  .... . :::. ..: .:.. :::: :  ::
CCDS30 EGDWWEARSLSSGKT-GCIPSNYVAPV--DSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGA
              120        130         140       150       160       

           150       160            170       180       190        
pF1KE0 FLIRPSESSLGGYSLSVRA--QAK---VCHYRVSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYK
       :::: ::.. :.::::.:   :..   : ::..     :. :.     : ...::. .: 
CCDS30 FLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTRGDHVKHYKIRKLDMGGYYITTRVQFNSVQELVQHYM
       170       180       190       200       210       220       

      200       210            220       230       240       250   
pF1KE0 ANWKLIQNPLLQPCMPQKAPR-----QDVWERPHSEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSL
            . : :. ::  .: :.     .:.::  .: ..: :.:: : ::.:: : : :: 
CCDS30 EVNDGLCNLLIAPCTIMK-PQTLGLAKDAWEISRSSITLERRLGTGCFGDVWLGTWNGST
       230       240        250       260       270       280      

           260       270       280       290       300       310   
pF1KE0 PVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAF
        ::.:..: ..:.   . .: :..: :::..:..:.:: :  ::.:::::.: .:.:  :
CCDS30 KVAVKTLKPGTMSPKAFLEEAQVMKLLRHDKLVQLYAVVSE-EPIYIVTEFMCHGSLLDF
        290       300       310       320        330       340     

           320       330       340       350       360       370   
pF1KE0 LGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLAR
       : .:::. :::: :. .: ::::::.:.:..  .:::: : :.:: . ::::.:::::::
CCDS30 LKNPEGQDLRLPQLVDMAAQVAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLACKIADFGLAR
         350       360       370       380       390       400     

           380       390       400       410       420       430   
pF1KE0 LLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNH
       :.::: :.: ..::.:.:::::::: .  :. ::::::::.:: :..: :. :: ::...
CCDS30 LIKDDEYNPCQGSKFPIKWTAPEAALFGRFTIKSDVWSFGILLTELITKGRIPYPGMNKR
         410       420       430       440       450       460     

           440       450       460       470       480             
pF1KE0 ETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATLREKLHAIHRCHP     
       :.:.:. .::..: : .::: .:  : . :: .:::::.:  :.                
CCDS30 EVLEQVEQGYHMPCPPGCPASLYEAMEQTWRLDPEERPTFEYLQSFLEDYFTSAEPQYQP
         470       480       490       500       510       520     

CCDS30 GDQT
           

>>CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20                (536 aa)
 initn: 1065 init1: 715 opt: 1218  Z-score: 713.6  bits: 141.6 E(32554): 2e-33
Smith-Waterman score: 1218; 43.4% identity (68.5% similar) in 470 aa overlap (21-477:56-516)

                         10        20         30        40         
pF1KE0           MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPD-HGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPC
                                     ::..::   :  .: :  :.:     : : 
CCDS13 GAGGGAFPASQTPSKPASADGHRGPSAAFAPAAAEPKLFGGFNSSDTVTSP---QRAGPL
          30        40        50        60        70           80  

      50        60        70        80         90        100       
pF1KE0 SPFPQLFLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEG-GGYIFARRLS-GQPSAGLVPITHV
       .     :.::::. .:   .:: ..:.::  ...  : . .:. :: ::  .: .: ..:
CCDS13 AGGVTTFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLSTGQ--TGYIPSNYV
             90       100       110       120       130         140

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE0 AKASPETLSDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRA--QAK
       : .  .... . :::. ..: ....:::.  :  :.::.: ::.. :.: :::    .::
CCDS13 APS--DSIQAEEWYFGKITRRESERLLLNAENPRGTFLVRESETTKGAYCLSVSDFDNAK
                150       160       170       180       190        

            170       180       190       200       210            
pF1KE0 ---VCHYRVSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCMPQKAPR---
          : ::..    .:..:. .   : .:..:..::. .   . . :   : : . :.   
CCDS13 GLNVKHYKIRKLDSGGFYITSRTQFNSLQQLVAYYSKHADGLCHRLTTVC-PTSKPQTQG
      200       210       220       230       240        250       

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE0 --QDVWERPHSEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTL
         .:.:: :.  . :  :::.: ::::: : : :.  ::::..: ..:.   . .: :..
CCDS13 LAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVM
       260       270       280       290       300       310       

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE0 KGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEG
       : ::::.:..:.:: :  ::.::::: : ::.:  ::    :. :::: :. .: :.: :
CCDS13 KKLRHEKLVQLYAVVSE-EPIYIVTEYMSKGSLLDFLKGETGKYLRLPQLVDMAAQIASG
       320       330        340       350       360       370      

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE0 MSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEA
       :.:.:..  ::::: : :.:: ..:.:::::::::::..:. :.  ...:.:.:::::::
CCDS13 MAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEA
        380       390       400       410       420       430      

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE0 ANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYV
       : :  :. ::::::::.:: :. : :. :: ::.:.:.:.:. ::::.: :  ::  .. 
CCDS13 ALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHD
        440       450       460       470       480       490      

       460       470       480                 
pF1KE0 LMLECWRSSPEERPSFATLREKLHAIHRCHP         
       :: .:::. :::::.:  :.                    
CCDS13 LMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
        500       510       520       530      

>>CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8                   (505 aa)
 initn: 1032 init1: 309 opt: 1211  Z-score: 709.9  bits: 140.8 E(32554): 3.2e-33
Smith-Waterman score: 1213; 42.2% identity (68.2% similar) in 488 aa overlap (17-480:10-490)

               10        20          30           40               
pF1KE0 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHG--TP---GSLDPNTDPVPTL----------P
                       ::  :   : :.:  .:   .. : .. :.: :          :
CCDS59        MGLVSSKKPDKEKPIK-EKDKGQWSPLKVSAQDKDAPPLPPLVVFNHLTPPPP
                      10         20        30        40        50  

          50        60        70        80        90        100    
pF1KE0 AEPCSPFPQLFLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRL-SGQPSAGLVPI
        :  .   .. .::::.::    .:.. .:..: .:.  : . .:: : .:.   : :: 
CCDS59 DEHLDEDKHFVVALYDYTAMNDRDLQMLKGEKLQVLKGTGDWWLARSLVTGRE--GYVPS
             60        70        80        90       100         110

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE0 THVAKASPETLSDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVR---
       . ::..  :.:  . :.: . .: .:.. ::.: :. :.:::: ::.. :..::::.   
CCDS59 NFVARV--ESLEMERWFFRSQGRKEAERQLLAPINKAGSFLIRESETNKGAFSLSVKDVT
                120       130       140       150       160        

              170       180       190       200       210          
pF1KE0 AQAK-VCHYRVSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKA
       .:.. . ::..    .:. :..    ::.:. :. .:. .   . . :  ::.   ::. 
CCDS59 TQGELIKHYKIRCLDEGGYYISPRITFPSLQALVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVRPAPQNP
      170       180       190       200       210       220        

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE0 PRQDVWERPHSEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTL
         :: :: :.. . : :::: : ::::: : . ... ::::..: ..:.   .  : ...
CCDS59 WAQDEWEIPRQSLRLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNMKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANVM
      230       240       250       260       270       280        

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE0 KGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEG
       :.:.::::.::.:: .  ::.::::: : .: :  :: : ::  : :: :. .. :.:::
CCDS59 KALQHERLVRLYAVVTK-EPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEG
      290       300        310       320       330       340       

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE0 MSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEA
       :.:.:..  .:::: : :.::...: ::.:::::::.. :. :. . ..:.:.:::::::
CCDS59 MAYIERMNSIHRDLRAANILVSEALCCKIADFGLARII-DSEYTAQEGAKFPIKWTAPEA
       350       360       370       380        390       400      

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE0 ANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYV
        .. ::. :.::::::::: :: :::. :: ::.: :..... ::::.::: .:: :.: 
CCDS59 IHFGVFTIKADVWSFGVLLMEVVTYGRVPYPGMSNPEVIRNLERGYRMPRPDTCPPELYR
        410       420       430       440       450       460      

        460       470       480               
pF1KE0 -LMLECWRSSPEERPSFATLREKLHAIHRCHP       
        .. ::::: :::::.:  :.  :               
CCDS59 GVIAECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP
        470       480       490       500     




488 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 12:47:01 2016 done: Thu Nov  3 12:47:02 2016
 Total Scan time:  3.490 Total Display time:  0.090

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com