Result of FASTA (ccds) for pF1KB8522
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8522, 879 aa
  1>>>pF1KB8522     879 - 879 aa - 879 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3003+/-0.00129; mu= 21.0898+/- 0.077
 mean_var=72.8889+/-14.443, 0's: 0 Z-trim(101.0): 51  B-trim: 102 in 2/47
 Lambda= 0.150225
 statistics sampled from 6380 (6424) to 6380 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.192), width:  16
 Scan time:  1.730

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs109|chr7            ( 879) 5921 1293.7       0
CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs109|chr3            ( 872) 4116 902.5       0
CCDS87515.1 GRM3 gene_id:2913|Hs109|chr7           ( 537) 2897 638.1 1.3e-182
CCDS5794.1 GRM8 gene_id:2918|Hs109|chr7            ( 908) 2550 563.1 8.3e-160
CCDS47696.1 GRM8 gene_id:2918|Hs109|chr7           ( 908) 2550 563.1 8.3e-160
CCDS4787.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6            ( 912) 2499 552.0 1.8e-156
CCDS43042.1 GRM7 gene_id:2917|Hs109|chr3           ( 915) 2494 550.9 3.8e-156
CCDS8283.1 GRM5 gene_id:2915|Hs109|chr11           (1180) 2352 520.2 8.5e-147
CCDS44694.1 GRM5 gene_id:2915|Hs109|chr11          (1212) 2352 520.3 8.7e-147
CCDS47497.1 GRM1 gene_id:2911|Hs109|chr6           ( 906) 2277 503.9 5.4e-142
CCDS64548.1 GRM1 gene_id:2911|Hs109|chr6           ( 908) 2277 503.9 5.4e-142
CCDS5209.1 GRM1 gene_id:2911|Hs109|chr6            (1194) 2277 504.0 6.7e-142
CCDS4442.1 GRM6 gene_id:2916|Hs109|chr5            ( 877) 2174 481.6 2.8e-135
CCDS59011.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6           ( 743) 2031 450.5 5.2e-126
CCDS59010.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6           ( 779) 2031 450.6 5.4e-126
CCDS59012.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6           ( 796) 1371 307.5 6.3e-83
CCDS75432.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6           ( 865) 1371 307.5 6.7e-83
CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs109|chr1        ( 852)  839 192.2 3.4e-48
CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs109|chr1          ( 839)  801 184.0   1e-45
CCDS3010.1 CASR gene_id:846|Hs109|chr3             (1078)  724 167.4 1.3e-40
CCDS54632.1 CASR gene_id:846|Hs109|chr3            (1088)  695 161.1   1e-38
CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs109|chr1           ( 841)  606 141.7 5.3e-33
CCDS5112.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs109|chr6        ( 926)  558 131.4 7.8e-30
CCDS69184.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs109|chr6       ( 855)  540 127.4 1.1e-28
CCDS69185.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs109|chr6       ( 751)  453 108.5 4.7e-23


>>CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs109|chr7                 (879 aa)
 initn: 5921 init1: 5921 opt: 5921  Z-score: 6931.4  bits: 1293.7 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 5921; 100.0% identity (100.0% similar) in 879 aa overlap (1-879:1-879)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 NEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 KSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNIC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 IATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANASFTWVAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANASFTWVAS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 DGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKFQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 CSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLCD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 AMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNVGGKYSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNVGGKYSY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 LKVGHWAETLSLDVNSIHWSRNSVPTSQCSDPCAPNEMKNMQPGDVCCWICIPCEPYEYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LKVGHWAETLSLDVNSIHWSRNSVPTSQCSDPCAPNEMKNMQPGDVCCWICIPCEPYEYL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 ADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWEDAWAIGPVTIACLGFMCTCMVVTVFIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWEDAWAIGPVTIACLGFMCTCMVVTVFIK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 HNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPVICALRRLGLGSSFAICYSALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPVICALRRLGLGSSFAICYSALL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 TKTNCIARIFDGVKNGAQRPKFISPSSQVFICLGLILVQIVMVSVWLILEAPGTRRYTLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TKTNCIARIFDGVKNGAQRPKFISPSSQVFICLGLILVQIVMVSVWLILEAPGTRRYTLA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 EKRETVILKCNVKDSSMLISLTYDVILVILCTVYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTMYTTCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EKRETVILKCNVKDSSMLISLTYDVILVILCTVYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTMYTTCI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 IWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCISVSLSGFVVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVVTHRLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCISVSLSGFVVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVVTHRLH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870         
pF1KB8 LNRFSVSGTGTTYSQSSASTYVPTVCNGREVLDSTTSSL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LNRFSVSGTGTTYSQSSASTYVPTVCNGREVLDSTTSSL
              850       860       870         

>>CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs109|chr3                 (872 aa)
 initn: 3844 init1: 1795 opt: 4116  Z-score: 4817.2  bits: 902.5 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 4116; 68.7% identity (87.9% similar) in 857 aa overlap (30-879:23-872)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRI
                                    .. . .:::::::::::...::  .:.:: .
CCDS28        MGSLLALLALLLLWGAVAEGPAKKVLTLEGDLVLGGLFPVHQKGGPAEDCGPV
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110          
pF1KB8 NEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTK-
       :: ::::::::::::.:.::.: .:::::.::.::::.::.::.::::.:.::::::.. 
CCDS28 NEHRGIQRLEAMLFALDRINRDPHLLPGVRLGAHILDSCSKDTHALEQALDFVRASLSRG
            60        70        80        90       100       110   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 VDEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLS
       .: ....::::::: . . :  :.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ADGSRHICPDGSYATHGDAPTAITGVIGGSYSDVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLS
           120       130       140       150       160       170   

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB8 DKSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNI
       ::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::
CCDS28 DKSRYDYFARTVPPDFFQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFELEARARNI
           180       190       200       210       220       230   

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB8 CIATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANASFTWVA
       :.::.:::::.  : ....:.: :::::.:::.::: ::.:.:::.::..: ::::::::
CCDS28 CVATSEKVGRAMSRAAFEGVVRALLQKPSARVAVLFTRSEDARELLAASQRLNASFTWVA
           240       250       260       270       280       290   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB8 SDGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKF
       :::::: ::.. ::: .: ::::.:::: :. .:  :::::.:.:: ::::::.::::.:
CCDS28 SDGWGALESVVAGSEGAAEGAITIELASYPISDFASYFQSLDPWNNSRNPWFREFWEQRF
           300       310       320       330       340       350   

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB8 QCSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLC
       .::..     .: :  : .. .  .:::::::::::::::::::::.:.:.::::::.::
CCDS28 RCSFR-----QRDCAAH-SLRAVPFEQESKIMFVVNAVYAMAHALHNMHRALCPNTTRLC
                360        370       380       390       400       

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB8 DAMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNVG-GKY
       :::. ..:..::::..:...: ::: :  :. . :.:: ::::.::::.:..  .: :.:
CCDS28 DAMRPVNGRRLYKDFVLNVKFDAPFRPA-DTHNEVRFDRFGDGIGRYNIFTYLRAGSGRY
       410       420       430        440       450       460      

      480       490       500          510       520       530     
pF1KB8 SYLKVGHWAETLSLDVNSIHWSRNS---VPTSQCSDPCAPNEMKNMQPGDVCCWICIPCE
        : :::.::: :.::.. : :.  :   .:.:.::.::  ::.:..:::.::::.::::.
CCDS28 RYQKVGYWAEGLTLDTSLIPWASPSAGPLPASRCSEPCLQNEVKSVQPGEVCCWLCIPCQ
        470       480       490       500       510       520      

         540       550       560       570       580       590     
pF1KB8 PYEYLADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWEDAWAIGPVTIACLGFMCTCMVV
       ::::  ::::: ::: : ::.:.::::..::..:::: ::::.::::::::: . : .:.
CCDS28 PYEYRLDEFTCADCGLGYWPNASLTGCFELPQEYIRWGDAWAVGPVTIACLGALATLFVL
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pF1KB8 TVFIKHNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPVICALRRLGLGSSFAIC
        ::..:: ::.::::::::::::: :: : :::::.:::::: ..:.:::::::..:..:
CCDS28 GVFVRHNATPVVKASGRELCYILLGGVFLCYCMTFIFIAKPSTAVCTLRRLGLGTAFSVC
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pF1KB8 YSALLTKTNCIARIFDGVKNGAQRPKFISPSSQVFICLGLILVQIVMVSVWLILEAPGTR
       ::::::::: ::::: :...:::::.::::.::: :::.::  :...: .::..::::: 
CCDS28 YSALLTKTNRIARIFGGAREGAQRPRFISPASQVAICLALISGQLLIVVAWLVVEAPGTG
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pF1KB8 RYTLAEKRETVILKCNVKDSSMLISLTYDVILVILCTVYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTM
       . :  :.::.: :.:: .:.::: ::.:.:.:. :::.::::::::::::::::::::::
CCDS28 KETAPERREVVTLRCNHRDASMLGSLAYNVLLIALCTLYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTM
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       :::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::::::::::.::::::::::::
CCDS28 YTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCVSVSLSGSVVLGCLFAPKLHIILFQPQKNVV
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pF1KB8 THRLHLNRFSVSGT--GTTYSQSSASTYVPTVCNGREVLDSTTSSL
       .::   .::. ...  ... .:.:.: .::::::::::.:::::::
CCDS28 SHRAPTSRFGSAAARASSSLGQGSGSQFVPTVCNGREVVDSTTSSL
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>>CCDS87515.1 GRM3 gene_id:2913|Hs109|chr7                (537 aa)
 initn: 2897 init1: 2897 opt: 2897  Z-score: 3392.4  bits: 638.1 E(33420): 1.3e-182
Smith-Waterman score: 2897; 100.0% identity (100.0% similar) in 441 aa overlap (1-441:1-441)

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 KSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNIC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 IATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANASFTWVAS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKFQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 CSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLCD
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pF1KB8 AMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNVGGKYSY
       :::::::::::::::::::::                                       
CCDS87 AMKILDGKKLYKDYLLKINFTGADDNHVHLCQPEWLCGLGLFVCTQGSHHPVSTPEECCH
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>>CCDS5794.1 GRM8 gene_id:2918|Hs109|chr7                 (908 aa)
 initn: 1535 init1: 681 opt: 2550  Z-score: 2982.7  bits: 563.1 E(33420): 8.3e-160
Smith-Waterman score: 2550; 47.6% identity (75.0% similar) in 821 aa overlap (33-834:40-849)

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pF1KB8 MLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRINE
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CCDS57 SCPCFFLLTAKFYWILTMMQRTHSQEYAHSIRVDGDIILGGLFPVHAKGERGVPCGELKK
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pF1KB8 DRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKVDE
       ..::.::::::.:::.::::  :: .. :::.:::::::::::::::: ::.: . : : 
CCDS57 EKGIHRLEAMLYAIDQINKDPDLLSNITLGVRILDTCSRDTYALEQSLTFVQALIEK-DA
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       ..  : .:.  :  . :  :.::::.. :::::.:::.::::.:::::::::. .:::..
CCDS57 SDVKCANGDPPIFTK-PDKISGVIGAAASSVSIMVANILRLFKIPQISYASTAPELSDNT
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pF1KB8 RYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEAR-LRNICI
       :::.:.:.:::: :::.::..:.  ..:.::::.::::.:::.:.::: : .: . ..::
CCDS57 RYDFFSRVVPPDSYQAQAMVDIVTALGWNYVSTLASEGNYGESGVEAFTQISREIGGVCI
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pF1KB8 ATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANAS--FTWVA
       : ..:. :      ....:..::. ::::.:..:   :: :... ::.. : :  : :..
CCDS57 AQSQKIPREPRPGEFEKIIKRLLETPNARAVIMFANEDDIRRILEAAKKLNQSGHFLWIG
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pF1KB8 SDGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKF
       ::.::.. . .  .:..: ::.:.      .  :::::.: .  ::.:: :: .:::..:
CCDS57 SDSWGSKIAPVYQQEEIAEGAVTILPKRASIDGFDRYFRSRTLANNRRNVWFAEFWEENF
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pF1KB8 QCSL--QNKRN-HRRVCD--KHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPN
        :.:  ..::: : . :   ...: ::: ::::.:..::..:::.::.:::.:.. :::.
CCDS57 GCKLGSHGKRNSHIKKCTGLERIARDSS-YEQEGKVQFVIDAVYSMAYALHNMHKDLCPG
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pF1KB8 TTKLCDAMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNV
          ::  :. .:::.:   :.  .::      : .: . : :.  ::. :::..:..: .
CCDS57 YIGLCPRMSTIDGKELL-GYIRAVNF------NGSAGTPVTFNENGDAPGRYDIFQYQIT
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pF1KB8 GGKYSYLKVGHWAETLSLDVNSIHWSR--NSVPTSQCSDPCAPNEMKNMQPGDVCCWICI
       . .  :  .:::.. : : :....:..  .. :.: :: :: :.: :.   :  ::: : 
CCDS57 NKSTEYKVIGHWTNQLHLKVEDMQWAHREHTHPASVCSLPCKPGERKKTVKGVPCCWHCE
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pF1KB8 PCEPYEYLADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWEDAWAIGPVTIACLGFMCTC
        :: :.: .::..:  :   : :. . :::  .:   ..:.. ::. :: .: ::.. : 
CCDS57 RCEGYNYQVDELSCELCPLDQRPNMNRTGCQLIPIIKLEWHSPWAVVPVFVAILGIIATT
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pF1KB8 MVVTVFIKHNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPVICALRRLGLGSSF
       .:...:...:.::.:.:::::: :.:: :. : : .::..:: :. .::..::. :: ..
CCDS57 FVIVTFVRYNDTPIVRASGRELSYVLLTGIFLCYSITFLMIAAPDTIICSFRRVFLGLGM
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pF1KB8 AICYSALLTKTNCIARIFDGVKNGAQRPKFISPSSQVFICLGLILVQIVMVSVWLILEAP
        . :.::::::: : :::.  :...  ::::::.::. : ..:: ::.. : ::.... :
CCDS57 CFSYAALLTKTNRIHRIFEQGKKSVTAPKFISPASQLVITFSLISVQLLGVFVWFVVDPP
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pF1KB8 ------GTRRYTLAEKRETVILKCNVKDSSMLISLTYDVILVILCTVYAFKTRKCPENFN
             : .: ::  ..   .:::...: :.. :: :...:.. :::::.:::  ::.::
CCDS57 HIIIDYGEQR-TLDPEKARGVLKCDISDLSLICSLGYSILLMVTCTVYAIKTRGVPETFN
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pF1KB8 EAKFIGFTMYTTCIIWLAFLPIFYVTSSD---YRVQTTTMCISVSLSGFVVLGCLFAPKV
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CCDS57 EAKPIGFTMYTTCIIWLAFIPIFFGTAQSAEKMYIQTTTLTVSMSLSASVSLGMLYMPKV
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pF1KB8 HIILFQPQKNVVTHRLHLNRFSVSGTGTTYSQSSASTYVPTVCNGREVLDSTTSSL    
       .::.:.:..::                                                 
CCDS57 YIIIFHPEQNVQKRKRSFKAVVTAATMQSKLIQKGNDRPNGEVKSELCESLETNTSSTKT
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>>CCDS47696.1 GRM8 gene_id:2918|Hs109|chr7                (908 aa)
 initn: 1535 init1: 681 opt: 2550  Z-score: 2982.7  bits: 563.1 E(33420): 8.3e-160
Smith-Waterman score: 2550; 47.6% identity (75.0% similar) in 821 aa overlap (33-834:40-849)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB8 MLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRINE
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CCDS47 SCPCFFLLTAKFYWILTMMQRTHSQEYAHSIRVDGDIILGGLFPVHAKGERGVPCGELKK
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pF1KB8 DRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKVDE
       ..::.::::::.:::.::::  :: .. :::.:::::::::::::::: ::.: . : : 
CCDS47 EKGIHRLEAMLYAIDQINKDPDLLSNITLGVRILDTCSRDTYALEQSLTFVQALIEK-DA
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pF1KB8 AEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSDKS
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CCDS47 RNIWFAEFWEDNFHCKLSRHALKKGSHVKKCTNRERIGQDSAYEQEGKVQFVIDAVYAMG
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CCDS47 HALHAMHRDLCPGRVGLCPRMDPVDGTQLLK-YIRNVNFSGI------AGNPVTFNENGD
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pF1KB8 GMGRYNVFNFQNVGGKYSYLKVGHWAETLSLDVNSIHW--SRNSVPTSQCSDPCAPNEMK
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CCDS47 APGRYDIYQYQLRNDSAEYKVIGSWTDHLHLRIERMHWPGSGQQLPRSICSLPCQPGERK
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pF1KB8 PVTIACLGFMCTCMVVTVFIKHNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPV
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CCDS47 PLFLAVVGIAATLFVVITFVRYNDTPIVKASGRELSYVLLAGIFLCYATTFLMIAEPDLG
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CCDS47 TCSLRRIFLGLGMSISYAALLTKTNRIYRIFEQGKRSVSAPRFISPASQLAITFSLISLQ
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CCDS47 LLGICVWFVVDPSHSVVDFQDQRTLDPRFARGVLKCDISDLSLICLLGYSMLLMVTCTVY
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pF1KB8 FVVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVVTHRLHLNRFSVSGTGTTYSQSSASTYVPTVCNGREV
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CCDS47 SVSLGMLYMPKVYIILFHPEQNVPKRKRSLKAVVTAATMSNKFTQKGNFRPNGEAKSELC
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pF1KB8 LDSTTSSL              
                             
CCDS47 ENLEAPALATKQTYVTYTNHAI
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>>CCDS43042.1 GRM7 gene_id:2917|Hs109|chr3                (915 aa)
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Smith-Waterman score: 2494; 45.7% identity (74.3% similar) in 849 aa overlap (7-834:21-856)

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pF1KB8 INEKGTGTEECGRINEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYAL
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CCDS43 VHAKGPSGVPCGDIKRENGIHRLEAMLYALDQINSDPNLLPNVTLGARILDTCSRDTYAL
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pF1KB8 EQSLEFVRASLTKVDEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQI
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CCDS43 EQSLTFVQALIQK-DTSDVRCTNGEPPVFVK-PEKVVGVIGASGSSVSIMVANILRLFQI
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       .:.: : ..  . .::: . ..   :..   ..: .:..::. ::.:.::.:  ..: ..
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CCDS43 VYAMAHALHHMNKDLCADYRGVCPEMEQAGGKKLLK-YIRNVNF------NGSAGTPVMF
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       .:: ::.. : .:. .. :.      .. :.  ..   .:::.. : ... :: :...:.
CCDS43 SLISVQLLGVFIWFGVDPPNIIIDYDEHKTMNPEQARGVLKCDITDLQIICSLGYSILLM
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CCDS43 VTCTVYAIKTRGVPENFNEAKPIGFTMYTTCIVWLAFIPIFFGTAQSAEKLYIQTTTLTI
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CCDS43 SMNLSASVALGMLYMPKVYIIIFHPELNVQKRKRSFKAVVTAATMSSRLSHKPSDRPNGE
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CCDS82 SLISSEEEEGLVRCVDGSSSSFRSKKP--IVGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFNIPQIAYS
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CCDS82 ATSMDLSDKTLFKYFMRVVPSDAQQARAMVDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESGMEAFKD
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CCDS82 MSAKEGICIAHSYKIYSNAGEQSFDKLLKKLTSHLPKARVVACFCEGMTVRGLLMAMRRL
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CCDS82 GLAGEFLLLGSDGWADRYDVTDGYQREAVGGITIKLQSPDVKWFDDYYLKLRPETNHRNP
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CCDS82 WFQEFWQHRFQCRLEGFPQENSKYNKTCNSSLTL-KTHHVQDSKMGFVINAIYSMAYGLH
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pF1KB8 KMQRTLCPNTTKLCDAMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGR
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CCDS82 NMQMSLCPGYAGLCDAMKPIDGRKLLES-LMKTNFTGV-----SGDTIL-FDENGDSPGR
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pF1KB8 YNVFNFQNVGGKY-SYLKVGHWAE-TLSLDVNSIHWSRNS-VPTSQCSDPCAPNEMKNMQ
       :...::...:  : .:..:: : .  :..: . . ::..: .  : ::.::  ...: ..
CCDS82 YEIMNFKEMGKDYFDYINVGSWDNGELKMDDDEV-WSKKSNIIRSVCSEPCEKGQIKVIR
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CCDS82 KGEVSCCWTCTPCKENEYVFDEYTCKACQLGSWPTDDLTGCDLIPVQYLRWGDPEPIAAV
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pF1KB8 TIACLGFMCTCMVVTVFIKHNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPVIC
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CCDS82 VFACLGLLATLFVTVVFIIYRDTPVVKSSSRELCYIILAGICLGYLCTFCLIAKPKQIYC
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CCDS82 YLQRIGIGLSPAMSYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTKKPRFMSACAQLVIAFILICIQ
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CCDS82 LGIIVALFIMEPPDIM-HDYPSIRE-VYLICNTTNLGVVTPLGYNGLLILSCTFYAFKTR
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pF1KB8 KCPENFNEAKFIGFTMYTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCISVSLSGFVVLGCLF
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CCDS82 NVPANFNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYF--GSNYKI--ITMCFSVSLSATVALGCMF
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pF1KB8 APKVHIILFQPQKNVVTHRLH--LNRFSVSGTGTTYSQSSASTYVPTVCNGREVLDSTTS
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CCDS82 VPKVYIILAKPERNVRSAFTTSTVVRMHV-GDGKSSSAASRSSSLVNLWKRRGSSGETLS
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pF1KB8 SL                                                          
                                                                   
CCDS82 SNGKSVTWAQNEKSSRGQHLWQRLSIHINKKENPNQTAVIKPFPKSTESRGLGAGAGAGG
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>>CCDS44694.1 GRM5 gene_id:2915|Hs109|chr11               (1212 aa)
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pF1KB8 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREI-KIEGDLVLGGLFPINEKGT----GTE
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CCDS44      MVLLLILSVLLLKEDVRGSAQSSERRVVAHMPGDIIIGALFSVHHQPTVDKVHER
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CCDS44 KCGAVREQYGIQRVEAMLHTLERINSDPTLLPNITLGCEIRDSCWHSAVALEQSIEFIRD
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pF1KB8 SLTKVDEAEYM--CPDGSYA-IQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYA
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CCDS44 SLISSEEEEGLVRCVDGSSSSFRSKKP--IVGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFNIPQIAYS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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