Result of FASTA (omim) for
pF1KE0332
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0332, 626 aa
1>>>pF1KE0332 626 - 626 aa - 626 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5344+/-0.000458; mu= 17.8307+/- 0.028
mean_var=68.5888+/-13.610, 0's: 0 Z-trim(109.2): 21 B-trim: 58 in 1/51
Lambda= 0.154863
statistics sampled from 17379 (17399) to 17379 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 10.320
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001055 (OMIM: 606781,617044) transketolase isof ( 623) 2832 642.5 1.3e-183
NP_001128527 (OMIM: 606781,617044) transketolase i ( 623) 2832 642.5 1.3e-183
NP_001244957 (OMIM: 606781,617044) transketolase i ( 631) 2806 636.7 7.4e-182
XP_011532356 (OMIM: 606781,617044) PREDICTED: tran ( 631) 2806 636.7 7.4e-182
NP_001139405 (OMIM: 300044) transketolase-like pro ( 590) 2685 609.6 9.6e-174
NP_001139406 (OMIM: 300044) transketolase-like pro ( 540) 2683 609.2 1.2e-173
NP_036385 (OMIM: 300044) transketolase-like protei ( 596) 2683 609.2 1.3e-173
XP_011532357 (OMIM: 606781,617044) PREDICTED: tran ( 457) 2008 458.3 2.6e-128
NP_001166939 (OMIM: 179060,614111) pyruvate dehydr ( 341) 205 55.4 3.7e-07
NP_001302465 (OMIM: 179060,614111) pyruvate dehydr ( 341) 181 50.1 1.5e-05
NP_000916 (OMIM: 179060,614111) pyruvate dehydroge ( 359) 181 50.1 1.6e-05
>>NP_001055 (OMIM: 606781,617044) transketolase isoform (623 aa)
initn: 1710 init1: 1710 opt: 2832 Z-score: 3417.4 bits: 642.5 E(85289): 1.3e-183
Smith-Waterman score: 2832; 66.7% identity (87.4% similar) in 625 aa overlap (2-626:1-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYK
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NP_001 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVD
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NP_001 SQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFASHYNLDNLV
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NP_001 VATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFASIYKLDNLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQASQVKNKPT
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NP_001 AILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA---KHQPT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKSPVEDSPQI
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NP_001 AIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATPPQEDAPSV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFSEIFRKEHP
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NP_001 DIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSEIFKKEHP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQANINLIGSH
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NP_001 DRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISESNINLCGSH
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 CGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPE
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NP_001 CGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGICFIRTSRPE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 TAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGISVRVIDPFT
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NP_001 NAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKINIRVLDPFT
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 IKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRG
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NP_001 IKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLAVNRVPRSG
540 550 560 570 580 590
610 620
pF1KE0 KTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
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NP_001 KPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
600 610 620
>>NP_001128527 (OMIM: 606781,617044) transketolase isofo (623 aa)
initn: 1710 init1: 1710 opt: 2832 Z-score: 3417.4 bits: 642.5 E(85289): 1.3e-183
Smith-Waterman score: 2832; 66.7% identity (87.4% similar) in 625 aa overlap (2-626:1-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYK
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NP_001 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVD
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NP_001 SQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFASHYNLDNLV
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NP_001 VATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFASIYKLDNLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQASQVKNKPT
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NP_001 AILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA---KHQPT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKSPVEDSPQI
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NP_001 AIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATPPQEDAPSV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFSEIFRKEHP
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NP_001 DIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSEIFKKEHP
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 ERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQANINLIGSH
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NP_001 DRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISESNINLCGSH
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 CGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPE
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NP_001 CGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGICFIRTSRPE
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NP_001 NAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKINIRVLDPFT
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 IKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRG
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NP_001 IKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLAVNRVPRSG
540 550 560 570 580 590
610 620
pF1KE0 KTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
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NP_001 KPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
600 610 620
>>NP_001244957 (OMIM: 606781,617044) transketolase isofo (631 aa)
initn: 2391 init1: 1710 opt: 2806 Z-score: 3385.9 bits: 636.7 E(85289): 7.4e-182
Smith-Waterman score: 2806; 65.9% identity (86.3% similar) in 633 aa overlap (2-626:1-630)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYK
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NP_001 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVD
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NP_001 SQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTD
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130 140 150 160 170
pF1KE0 VATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKAS--------YRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFAS
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NP_001 VATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASLPSSWDYSYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFAS
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pF1KE0 HYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQA
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NP_001 IYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA
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pF1KE0 SQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKS
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NP_001 ---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATP
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 PVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFS
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300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 EIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQA
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NP_001 EIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISES
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 NINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMC
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NP_001 NINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGIC
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pF1KE0 FIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGIS
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NP_001 FIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKIN
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pF1KE0 VRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLA
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NP_001 IRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLA
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE0 VSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
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NP_001 VNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
600 610 620 630
>>XP_011532356 (OMIM: 606781,617044) PREDICTED: transket (631 aa)
initn: 2391 init1: 1710 opt: 2806 Z-score: 3385.9 bits: 636.7 E(85289): 7.4e-182
Smith-Waterman score: 2806; 65.9% identity (86.3% similar) in 633 aa overlap (2-626:1-630)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYK
: . ::: . .:.:.:::::::: ::.:: :.:::. ::::::::...:::::::.::
XP_011 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVD
. ::..: ::::.::.:::::::::.:.:.: ..:..::::::. :::. ::.:. :.:
XP_011 SQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 VATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKAS--------YRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFAS
:::::::::::.::::::::::.:::: :::.::.:::: ::::::::.::::
XP_011 VATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASLPSSWDYSYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFAS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQA
:.::::::..:.:::::: ::::.: ::::. ::::::.. .::::.:: ::.:: ::
XP_011 IYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKS
:..::::.::::::::: ..:: :.:::::.::. :. :.. : ::::......
XP_011 ---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFS
: ::.:...:..:.: : :.:::::::::.:.:: ::::::.:..:.:.:.::: :::::
XP_011 PQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFS
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 EIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQA
:::.::::.::::: ::::::::.:.:::::.::. : ..:::::::::::.::.:::..
XP_011 EIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISES
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMC
:::: ::::::: :::: :::::::::::::.:. :::::::...::.:. :::::::.:
XP_011 NINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGIC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGIS
:::::.::.:.::. .:.:..:::::: .. .:.:::::::::::::: ::. :... :.
XP_011 FIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKIN
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLA
.::.::::::::: :..::.:: ::..:::::: :::::::: .:: :: : : .::
XP_011 IRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLA
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE0 VSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
:. ::. :: .::: ::::. : :: . :
XP_011 VNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
600 610 620 630
>>NP_001139405 (OMIM: 300044) transketolase-like protein (590 aa)
initn: 2877 init1: 2683 opt: 2685 Z-score: 3240.3 bits: 609.6 E(85289): 9.6e-174
Smith-Waterman score: 2894; 70.0% identity (86.6% similar) in 621 aa overlap (5-625:13-589)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVL
.:.:: :.:::.: :.:::::::::::...:: :..:..:::
NP_001 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVLQDMASRLRIHSIRATCSTSSG------SSSEIMSVL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FFHTMKYKQTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHP
::. :.:::.:::.::::::.:..
NP_001 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TPRLPFVDVATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFAS
:: ::::::: ::::::.::::::::::.:.:::::::::.::::::::::::.::::
NP_001 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFAS
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQA
.:.::::::.:::::::.:: : :: .::: :::::::::.:::.:::::::.::::
NP_001 YYSLDNLVAIFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQA
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKS
::::.::::.::::::::: :.:::::.::.::.:.::::::.:::::::::..:: :.
NP_001 SQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQP
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFS
:.::::...:::..::::: :.:::::::.:. :::::::: ::.::.::.::: ::::
NP_001 PIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFS
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 EIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQA
::: ::.:::::::..:::::::::::::.::::::::..::::.:::::..:.:.....
NP_001 EIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAES
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMC
:::.::::::::.:.::.:::::::.::::.::.::.:::.::.:::::. ::::.::::
NP_001 NINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMC
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGIS
::::..::: ::::::: ::::::::.:: :.:::::::::.:..::: :::.::.: :
NP_001 FIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIF
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLA
.:::: :::::::.:::.:::::: ::.::::::: .:::::::::::: .::: ::.::
NP_001 IRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLA
500 510 520 530 540 550
600 610 620
pF1KE0 VSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
:::::: ::. :::::.:::.::::.:: :.
NP_001 VSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
560 570 580 590
>>NP_001139406 (OMIM: 300044) transketolase-like protein (540 aa)
initn: 2854 init1: 2683 opt: 2683 Z-score: 3238.4 bits: 609.2 E(85289): 1.2e-173
Smith-Waterman score: 2749; 71.2% identity (87.2% similar) in 577 aa overlap (49-625:1-539)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 TANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYKQTDPEHPDNDRFILSRGH
.:::::. :.:::.:::.::::::.:..
NP_001 MSVLFFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK--
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 AAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVDVATGSLGQGLGTACGMAY
:: ::::::: ::::::.::::::
NP_001 ------------------------------------RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAY
30 40 50
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 TGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFASHYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEH
::::.:.:::::::::.::::::::::::.::::.:.::::::.:::::::.:: : ::
NP_001 TGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSLDNLVAIFDVNRLGHSGALPAEH
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 GADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQASQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDA
.::: :::::::::.:::.:::::::.::::::::.::::.::::::::: :.::::
NP_001 CINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDA
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 ENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKSPVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDK
:.::.::.:.::::::.:::::::::..:: :. :.::::...:::..::::: :.::::
NP_001 ESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDK
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 IATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFSEIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVAL
:::.:. :::::::: ::.::.::.::: ::::::: ::.:::::::..::::::::::
NP_001 IATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVAL
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 GCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQANINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDL
:::.::::::::..::::.:::::..:.:.....:::.::::::::.:.::.:::::::.
NP_001 GCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDI
300 310 320 330 340 350
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 AMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKV
::::.::.::.:::.::.:::::. ::::.::::::::..::: ::::::: ::::::::
NP_001 AMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKV
360 370 380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 VRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGISVRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGG
.:: :.:::::::::.:..::: :::.::.: : .:::: :::::::.:::.:::::: :
NP_001 LRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEG
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 RVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIA
:.::::::: .:::::::::::: .::: ::.:::::::: ::. :::::.:::.::::.
NP_001 RIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIV
480 490 500 510 520 530
620
pF1KE0 AVTLTLMK
:: :.
NP_001 AVKCMLLN
540
>>NP_036385 (OMIM: 300044) transketolase-like protein 1 (596 aa)
initn: 3040 init1: 2683 opt: 2683 Z-score: 3237.8 bits: 609.2 E(85289): 1.3e-173
Smith-Waterman score: 2935; 70.5% identity (87.3% similar) in 621 aa overlap (5-625:13-595)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVL
.:.:: :.:::.: :.:::::::::::...::. ::: :..:..:::
NP_036 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVLQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FFHTMKYKQTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHP
::. :.:::.:::.::::::.:..
NP_036 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TPRLPFVDVATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFAS
:: ::::::: ::::::.::::::::::.:.:::::::::.::::::::::::.::::
NP_036 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFAS
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQA
.:.::::::.:::::::.:: : :: .::: :::::::::.:::.:::::::.::::
NP_036 YYSLDNLVAIFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKS
::::.::::.::::::::: :.:::::.::.::.:.::::::.:::::::::..:: :.
NP_036 SQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQP
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFS
:.::::...:::..::::: :.:::::::.:. :::::::: ::.::.::.::: ::::
NP_036 PIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 EIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQA
::: ::.:::::::..:::::::::::::.::::::::..::::.:::::..:.:.....
NP_036 EIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAES
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMC
:::.::::::::.:.::.:::::::.::::.::.::.:::.::.:::::. ::::.::::
NP_036 NINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMC
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGIS
::::..::: ::::::: ::::::::.:: :.:::::::::.:..::: :::.::.: :
NP_036 FIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIF
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLA
.:::: :::::::.:::.:::::: ::.::::::: .:::::::::::: .::: ::.::
NP_036 IRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLA
510 520 530 540 550 560
600 610 620
pF1KE0 VSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
:::::: ::. :::::.:::.::::.:: :.
NP_036 VSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
570 580 590
>>XP_011532357 (OMIM: 606781,617044) PREDICTED: transket (457 aa)
initn: 1710 init1: 1710 opt: 2008 Z-score: 2424.5 bits: 458.3 E(85289): 2.6e-128
Smith-Waterman score: 2008; 65.5% identity (86.2% similar) in 458 aa overlap (169-626:2-456)
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 TGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFASHYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEH
:::: :.::::::..:.:::::: ::::.:
XP_011 MAFASIYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQH
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 GADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQASQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDA
::::. ::::::.. .::::.:: ::.:: :: :..::::.::::::::: ..::
XP_011 QMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDK
40 50 60 70 80
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 ENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKSPVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDK
:.:::::.::. :. :.. : ::::...... : ::.:...:..:.: : :.::::::
XP_011 ESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATPPQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGDK
90 100 110 120 130 140
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 IATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFSEIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVAL
:::.:.:: ::::::.:..:.:.:.::: ::::::::.::::.::::: ::::::::.:.
XP_011 IATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSEIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAV
150 160 170 180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 GCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQANINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDL
:::::.::. : ..:::::::::::.::.:::..:::: ::::::: :::: ::::::::
XP_011 GCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDL
210 220 230 240 250 260
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 AMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKV
:::::.:. :::::::...::.:. :::::::.::::::.::.:.::. .:.:..:::::
XP_011 AMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKV
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 VRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGISVRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGG
: .. .:.:::::::::::::: ::. :... :..::.::::::::: :..::.:: :
XP_011 VLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKG
330 340 350 360 370 380
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 RVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIA
:..:::::: :::::::: .:: :: : : .:::. ::. :: .::: ::::. :
XP_011 RILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLAVNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIAQ
390 400 410 420 430 440
620
pF1KE0 AVTLTLMK
:: . :
XP_011 AVRGLITKA
450
>>NP_001166939 (OMIM: 179060,614111) pyruvate dehydrogen (341 aa)
initn: 139 init1: 101 opt: 205 Z-score: 249.4 bits: 55.4 E(85289): 3.7e-07
Smith-Waterman score: 210; 23.7% identity (53.9% similar) in 308 aa overlap (291-584:9-295)
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 WHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKSPVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDKIA
. :... . .. :.: : .: . :
NP_001 MAAVSGLVRRPLREVSGLLKRRFHWTAPAALQVTVRDA
10 20 30
330 340 350 360 370
pF1KE0 TQKTYGLALAKLGRANERVIVLSG-----DTMNSTFSEIFRKEHPERFIECIIAEQNMVS
.. . : . .:.:..:. : .. ...: .:.:. :.:.....
NP_001 INQGMDEELER----DEKVFLLGEEVAQYDGAYKVSRGLWKKYGDKRIIDTPISEMGFAG
40 50 60 70 80 90
380 390 400 410 420
pF1KE0 VALGCATRG-RTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQANINLIG---SHC-----GVSTG
.:.: : : : : .: : .:.::. .: . .. .. :.: : :
NP_001 IAVGAAMAGLRPICEFMTFN-FSMQAIDQVINSAAKTYYMSGVAAQHSQCFAAWYGHCPG
100 110 120 130 140 150
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 EDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPETAVIYT
:: :: ... . .. . .. :. .. :. : . .. .
NP_001 LKVVSPWNSEDA---KGLIKSAIRDNNPVVVLENELMY-----GVPFEFPPEAQSKDFLI
160 170 180 190 200
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 PQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGISVRVIDPFTIKPLDA
: ::.::. :.:.. .::.. . . . :::: ::..:. .::. ::.:.:
NP_001 P-----IGKAKIERQGTH--ITVVSHSRPVGHCLEAAAVLSKEGVECEVINMRTIRPMDM
210 220 230 240 250
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 ATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRGKTSELL
:: .:. :. ...::: . . :.: .:: . . :
NP_001 ETIEASVMKTN-HLVTVEGGWPQFGVGAEICARIMEGPAFNFLDAPAVRVTGADVPMPYA
260 270 280 290 300 310
610 620
pF1KE0 DMFGISTRHIIAAVTLTLMK
NP_001 KILEDNSIPQVKDIIFAIKKTLNI
320 330 340
>>NP_001302465 (OMIM: 179060,614111) pyruvate dehydrogen (341 aa)
initn: 139 init1: 101 opt: 181 Z-score: 220.4 bits: 50.1 E(85289): 1.5e-05
Smith-Waterman score: 208; 27.0% identity (56.9% similar) in 248 aa overlap (354-584:55-295)
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 TYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFSEIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVALGCATR
...: .:.:. :.:......:.: :
NP_001 MDEELERDEKVFLLGEEVAQYDGAYKVSRGLWKKYGDKRIIDTPISEMGFAGIAVGAAMA
30 40 50 60 70 80
390 400 410 420 430
pF1KE0 G-RTIAFAGAFAAFFTRAFDQL--------RM-GAISQANINLIGSHCGVSTGEDGVSQM
: : : .: : .:.::. : :... . : . : . :.:.: ..:
NP_001 GLRPICEFMTFN-FSMQAIDQVINSAAKTYYMSGGLQPVPIVFRGPN-GASAGV--AAQH
90 100 110 120 130 140
440 450 460 470 480
pF1KE0 ALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPETAVIYT-PQE---
. : . :. : : .. ... : : .. . .. .: . : :
NP_001 SQCFAAWYGHCPGLKVVSPWNSEDAKGLIKSAIRDNNPVVVLENELMYGVPFEFPPEAQS
150 160 170 180 190 200
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 -NF--EIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGISVRVIDPFTIKPLDA
.: ::.::. :.:.. .::.. . . . :::: ::..:. .::. ::.:.:
NP_001 KDFLIPIGKAKIERQGTH--ITVVSHSRPVGHCLEAAAVLSKEGVECEVINMRTIRPMDM
210 220 230 240 250
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 ATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRGKTSELL
:: .:. :. ...::: . . :.: .:: . . :
NP_001 ETIEASVMKTN-HLVTVEGGWPQFGVGAEICARIMEGPAFNFLDAPAVRVTGADVPMPYA
260 270 280 290 300 310
610 620
pF1KE0 DMFGISTRHIIAAVTLTLMK
NP_001 KILEDNSIPQVKDIIFAIKKTLNI
320 330 340
626 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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