Result of FASTA (ccds) for pF1KE0323
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0323, 844 aa
  1>>>pF1KE0323 844 - 844 aa - 844 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6095+/-0.000969; mu= 10.3872+/- 0.058
 mean_var=143.9215+/-29.944, 0's: 0 Z-trim(109.3): 114  B-trim: 106 in 1/51
 Lambda= 0.106908
 statistics sampled from 10652 (10768) to 10652 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.331), width:  16
 Scan time:  4.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2902.1 PRICKLE2 gene_id:166336|Hs108|chr3      ( 844) 5886 920.2       0
CCDS8742.1 PRICKLE1 gene_id:144165|Hs108|chr12     ( 831) 2477 394.4 4.3e-109
CCDS14320.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX       ( 615) 1874 301.3 3.3e-81
CCDS78481.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX       ( 547) 1846 297.0 6.1e-80
CCDS34449.1 PRICKLE4 gene_id:29964|Hs108|chr6      ( 384)  746 127.2 5.4e-29
CCDS5764.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7            ( 412)  710 121.7 2.7e-27
CCDS5763.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7            ( 421)  710 121.7 2.7e-27
CCDS63533.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3         ( 253)  445 80.7 3.6e-15
CCDS63534.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3         ( 292)  445 80.7 4.1e-15
CCDS33688.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3         ( 365)  445 80.8 4.9e-15
CCDS30678.1 FHL3 gene_id:2275|Hs108|chr1           ( 280)  398 73.4   6e-13
CCDS14655.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX           ( 280)  355 66.8 5.9e-11
CCDS55506.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX           ( 296)  355 66.8 6.2e-11
CCDS55505.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX           ( 309)  355 66.8 6.4e-11


>>CCDS2902.1 PRICKLE2 gene_id:166336|Hs108|chr3           (844 aa)
 initn: 5886 init1: 5886 opt: 5886  Z-score: 4913.6  bits: 920.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5886; 99.9% identity (99.9% similar) in 844 aa overlap (1-844:1-844)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 FPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS29 FPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVCTVCNELLVDLIYFYQDGK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 IYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 IYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 PYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 QGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 SSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPLQLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPLQLLS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 QCNIRTSYSPGGQGAGAQPEMWGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECREDYYPGRLRSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QCNIRTSYSPGGQGAGAQPEMWGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECREDYYPGRLRSQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 ESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKYEEEEEEEGGLSTQQCRTRHPISSLKYTEDMTPTEQTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKYEEEEEEEGGLSTQQCRTRHPISSLKYTEDMTPTEQTP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 RGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNVSEKLSNMGTLNSSMQFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNVSEKLSNMGTLNSSMQFR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 SAESVRSLLSAQQYQEMEGNLHQLSNPIGYRDLQSHGRMHQSFDFDGGMAGSKLPGQEGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SAESVRSLLSAQQYQEMEGNLHQLSNPIGYRDLQSHGRMHQSFDFDGGMAGSKLPGQEGV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 RIQPMSERTRRRATSRDDNRRFRPHRSRRSRRSRSDNALHLASEREAISRLKDRPPLRAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RIQPMSERTRRRATSRDDNRRFRPHRSRRSRRSRSDNALHLASEREAISRLKDRPPLRAR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 EDYDQFMRQRSFQESMGHGSRRDLYGQCPRTVSDLALQNAFGDRWGPYFAEYDWCSTCSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 EDYDQFMRQRSFQESMGHGSRRDLYGQCPRTVSDLALQNAFGDRWGPYFAEYDWCSTCSS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 SSESDNEGYFLGEPIPQPARLRYVTSDELLHKYSSYGLPKSSTLGGRGQLHSRKRQKSKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SSESDNEGYFLGEPIPQPARLRYVTSDELLHKYSSYGLPKSSTLGGRGQLHSRKRQKSKN
              790       800       810       820       830       840

           
pF1KE0 CIIS
       ::::
CCDS29 CIIS
           

>>CCDS8742.1 PRICKLE1 gene_id:144165|Hs108|chr12          (831 aa)
 initn: 2419 init1: 1990 opt: 2477  Z-score: 2072.1  bits: 394.4 E(32554): 4.3e-109
Smith-Waterman score: 2684; 50.8% identity (73.7% similar) in 851 aa overlap (5-844:1-831)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEK
           ::::::  .::: :  ::.:::::::::::::::::::::.:::.. :..::::::
CCDS87     MPLEMEPKMSKLAFGCQRSSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLRPEQIQLYFACLPEEK
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRP
       :::::::::: ::::::.::::::::::::.::.::::.::..::.:::.: ::::... 
CCDS87 VPYVNSPGEKHRIKQLLYQLPPHDNEVRYCQSLSEEEKKELQVFSAQRKKEALGRGTIKL
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 FPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGK
       .  ..  :.::::: .::::..:::::::: :::::: :::  .::::::::::::::::
CCDS87 LSRAVMHAVCEQCGLKINGGEVAVFASRAGPGVCWHPSCFVCFTCNELLVDLIYFYQDGK
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 IYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGR
       :.::::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::
CCDS87 IHCGRHHAELLKPRCSACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCLECETVLGGQRYIMKDGR
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 PYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPK
       :.:: ::::::::::.::..:::.:..:::::::::::::.:: ::.:: :::: :::::
CCDS87 PFCCGCFESLYAEYCETCGEHIGVDHAQMTYDGQHWHATEACFSCAQCKASLLGCPFLPK
        240       250       260       270       280       290      

              310       320       330       340         350        
pF1KE0 QGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEE--PMLNQHSQL
       ::::.::..:: ::: ..:::::::::.::...::::...::.. ....    :     :
CCDS87 QGQIYCSKTCSLGEDVHASDSSDSAFQSARSRDSRRSVRMGKSSRSADQCRQSLLLSPAL
        300       310       320       330       340       350      

      360       370        380       390       400       410       
pF1KE0 QVSSNRLSADVDP-LSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPL-
       . .   ::...:  :: ..: :::: :  :.  . .:..: :     .  :  . .. . 
CCDS87 NYKFPGLSGNADDTLSRKLDDLSLSRQGTSFASEEFWKGRVEQETPEDPEEWADHEDYMT
        360       370       380       390       400       410      

        420       430        440       450       460        470    
pF1KE0 QLLSQCNIRTSYSPGGQGAGAQP-EMWGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFI-KECREDYYP
       ::: . . .. ..:  .    .  : :   .:.   .:.  .  .  :.  :. . :.: 
CCDS87 QLLLKFGDKSLFQPQPNEMDIRASEHW---ISDNMVKSKTELKQNNQSLASKKYQSDMYW
        420       430       440          450       460       470   

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE0 GRLRSQESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKYEEEEEEEGGLSTQQCRTRHPISSLKYTEDMT
       ..  ::.. .:   ....   :  .  . .: : ..:. . .. .:.   .::.   :. 
CCDS87 AQ--SQDGLGD---SAYGSHPGPASSRRLQELELDHGASGYNHDETQWYEDSLECLSDLK
             480          490       500       510       520        

          540       550       560       570       580       590    
pF1KE0 PTEQTPRGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNVSEKLSNMGTLN
       : ::. : ::.:::::: :: :.::  : .  :  .:. .. ..   .  ::.:::::::
CCDS87 P-EQSVRDSMDSLALSNITGASVDGENKPRPSL--YSLQNF-EEMETEDCEKMSNMGTLN
       530       540       550       560          570       580    

          600       610       620       630       640       650    
pF1KE0 SSMQFRSAESVRSLLSAQQYQEMEGNLHQLSNPIGYRDLQSHGRMHQSFDFDGGMAGSKL
       :::  :::::..:: :    ...  . . .  :.  :. .:..:  :.  :.  .  .  
CCDS87 SSMLHRSAESLKSLSSELCPEKILPEEKPVHLPVLRRS-KSQSR-PQQVKFSDDVIDNGN
          590       600       610       620         630       640  

          660       670        680       690       700       710   
pF1KE0 PGQEGVRIQPMSERTRRRATSRDD-NRRFRPHRSRRSRRSRSDNALHLASEREAISRLKD
          : .:  :::::::::. . .. . : . :: ::::.:::::::.:..::.     ::
CCDS87 YDIE-IRQPPMSERTRRRVYNFEERGSRSHHHRRRRSRKSRSDNALNLVTERKYSP--KD
             650       660       670       680       690           

           720       730       740       750       760       770   
pF1KE0 RPPLRAREDYDQFMRQRSFQESMGHGSRRDLYGQCPRTVSDLALQNAFGDRWGPYFAEYD
       :  : . ..:..:....: .: ... .  :::::  ...:: .:::   .:.   ..: :
CCDS87 RLRLYTPDNYEKFIQNKSAREIQAYIQNADLYGQYAHATSDYGLQNPGMNRFLGLYGEDD
     700       710       720       730       740       750         

             780       790       800        810       820       830
pF1KE0 --WCSTCSSSSESDNEGYFLGEPIPQPARLRYVT-SDELLHKYSSYGLPKSSTLGGRGQL
         :::. ::::.:..::::::.:::::   :..  .:.:    :.   :.   .: :   
CCDS87 DSWCSSSSSSSDSEEEGYFLGQPIPQPRPQRFAYYTDDLSSPPSALPTPQ---FGQRTTK
     760       770       780       790       800          810      

               840    
pF1KE0 HSRKR-QKSKNCIIS
        ..:. .:.::::::
CCDS87 SKKKKGHKGKNCIIS
        820       830 

>>CCDS14320.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX            (615 aa)
 initn: 1914 init1: 1841 opt: 1874  Z-score: 1571.3  bits: 301.3 E(32554): 3.3e-81
Smith-Waterman score: 1874; 50.6% identity (71.2% similar) in 559 aa overlap (2-543:58-599)

                                            10        20        30 
pF1KE0                              MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSG
                                     : ..:...:. . .:. ::::.: ::::::
CCDS14 NSCREQCPGFLLHGWRKICQHCKCPREEHAVHAVPVDLERIMCRLISDFQRHSISDDDSG
        30        40        50        60        70        80       

              40        50        60        70        80        90 
pF1KE0 CALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCN
       :: :::::::::::::::.:..:::::.::::::::::: :::::::::::::.:..::.
CCDS14 CASEEYAWVPPGLKPEQVYQFFSCLPEDKVPYVNSPGEKYRIKQLLHQLPPHDSEAQYCT
        90       100       110       120       130       140       

             100       110       120       130       140       150 
pF1KE0 SLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGH
       .:.::::.::. ::.:::::::::: :: ::::.::::::.:: ::.:::::::::::: 
CCDS14 ALEEEEKKELRAFSQQRKRENLGRGIVRIFPVTITGAICEECGKQIGGGDIAVFASRAGL
       150       160       170       180       190       200       

             160       170       180       190       200       210 
pF1KE0 GVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAE
       :.:::: ::: :.:.::::::::::. ::.::::::::::.::: :::::::. ::::::
CCDS14 GACWHPQCFVCTTCQELLVDLIYFYHVGKVYCGRHHAECLRPRCQACDEIIFSPECTEAE
       210       220       230       240       250       260       

             220       230       240       250       260       270 
pF1KE0 GRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTY
       :::::: ::::::::. ::::::.:...::.:: :.:. .::::: :..:::.:::::.:
CCDS14 GRHWHMDHFCCFECEASLGGQRYVMRQSRPHCCACYEARHAEYCDGCGEHIGLDQGQMAY
       270       280       290       300       310       320       

             280       290       300       310       320           
pF1KE0 DGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNA--
       .::::::.. ::::..: ..::::::::..: :::::::: : .:..   :  ... .  
CCDS14 EGQHWHASDRCFCCSRCGRALLGRPFLPRRGLIFCSRACSLGSEPTAPGPSRRSWSAGPV
       330       340       350       360       370       380       

     330       340       350       360            370       380    
pF1KE0 RAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSS-----NRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQ
        :  .  .:...  :: .:    .  ..:  ..     .:.   . :   .:  :.: : 
CCDS14 TAPLAASTASFSAVKGASETTTKGTSTELAPATGPEEPSRFLRGA-PHRHSMPELGLRS-
       390       400       410       420       430        440      

          390       400       410       420        430         440 
pF1KE0 TPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPLQLLSQCNIRTSY-SPGG--QGAGAQPEM
       .:    .:  .:  .:     ... ...    :   . ..:    : ::  .  .: : .
CCDS14 VP----EPPPESPGQP-----NLRPDDSAFGRQSTPRVSFRDPLVSEGGPRRTLSAPPAQ
             450            460       470       480       490      

             450       460       470       480       490       500 
pF1KE0 WGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECREDYYPGRLRSQESYSDMSSQSFSETRGSIQVP
         .  : : :. :     : .   .. :   .:.: :  .   : .: : ::. .:    
CCDS14 RRRPRSPPPRAPSRRRHHHHNHHHHHNR---HPSRRRHYQ--CDAGSGSDSESCSSSPSS
        500       510       520          530         540       550 

             510              520       530       540       550    
pF1KE0 KYEEEEEEEG---G----LSTQQCRTRHPISSLKYTEDMTPTEQTPRGSMESLALSNATG
       .  :  :..:   :    :  . ::   : ..  .    .:. . :: :           
CCDS14 SSSESSEDDGFFLGERIPLPPHLCRP-MPAQDTAMETFNSPSLSLPRDSRAGMPRQARDK
             560       570        580       590       600       610

          560       570       580       590       600       610    
pF1KE0 LSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNVSEKLSNMGTLNSSMQFRSAESVRSLLSAQQY
                                                                   
CCDS14 NCIVA                                                       
                                                                   

>>CCDS78481.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX            (547 aa)
 initn: 1886 init1: 1813 opt: 1846  Z-score: 1548.7  bits: 297.0 E(32554): 6.1e-80
Smith-Waterman score: 1846; 51.1% identity (71.0% similar) in 548 aa overlap (13-543:1-531)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEK
                   . .:. ::::.: :::::::: :::::::::::::::.:..:::::.:
CCDS78             MCRLISDFQRHSISDDDSGCASEEYAWVPPGLKPEQVYQFFSCLPEDK
                           10        20        30        40        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRP
       :::::::::: :::::::::::::.:..::..:.::::.::. ::.:::::::::: :: 
CCDS78 VPYVNSPGEKYRIKQLLHQLPPHDSEAQYCTALEEEEKKELRAFSQQRKRENLGRGIVRI
       50        60        70        80        90       100        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 FPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGK
       ::::.::::::.:: ::.:::::::::::: :.:::: ::: :.:.::::::::::. ::
CCDS78 FPVTITGAICEECGKQIGGGDIAVFASRAGLGACWHPQCFVCTTCQELLVDLIYFYHVGK
      110       120       130       140       150       160        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 IYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGR
       .::::::::::.::: :::::::. :::::::::::: ::::::::. ::::::.:...:
CCDS78 VYCGRHHAECLRPRCQACDEIIFSPECTEAEGRHWHMDHFCCFECEASLGGQRYVMRQSR
      170       180       190       200       210       220        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 PYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPK
       :.:: :.:. .::::: :..:::.:::::.:.::::::.. ::::..: ..::::::::.
CCDS78 PHCCACYEARHAEYCDGCGEHIGLDQGQMAYEGQHWHASDRCFCCSRCGRALLGRPFLPR
      230       240       250       260       270       280        

              310       320         330       340       350        
pF1KE0 QGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNA--RAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQL
       .: :::::::: : .:..   :  ... .   :  .  .:...  :: .:    .  ..:
CCDS78 RGLIFCSRACSLGSEPTAPGPSRRSWSAGPVTAPLAASTASFSAVKGASETTTKGTSTEL
      290       300       310       320       330       340        

      360            370       380       390       400       410   
pF1KE0 QVSS-----NRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQ
         ..     .:.   . :   .:  :.: : .:    .:  .:  .:     ... ... 
CCDS78 APATGPEEPSRFLRGA-PHRHSMPELGLRS-VP----EPPPESPGQP-----NLRPDDSA
      350       360        370            380            390       

           420        430         440       450       460       470
pF1KE0 SPLQLLSQCNIRTSY-SPGG--QGAGAQPEMWGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECRE
          :   . ..:    : ::  .  .: : .  .  : : :. :     : .   .. : 
CCDS78 FGRQSTPRVSFRDPLVSEGGPRRTLSAPPAQRRRPRSPPPRAPSRRRHHHHNHHHHHNR-
       400       410       420       430       440       450       

              480       490       500       510              520   
pF1KE0 DYYPGRLRSQESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKYEEEEEEEG---G----LSTQQCRTRHP
         .:.: :  .   : .: : ::. .:    .  :  :..:   :    :  . ::   :
CCDS78 --HPSRRRHYQC--DAGSGSDSESCSSSPSSSSSESSEDDGFFLGERIPLPPHLCRP-MP
          460         470       480       490       500        510 

           530       540       550       560       570       580   
pF1KE0 ISSLKYTEDMTPTEQTPRGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNV
        ..  .    .:. . :: :                                        
CCDS78 AQDTAMETFNSPSLSLPRDSRAGMPRQARDKNCIVA                        
             520       530       540                               

>>CCDS34449.1 PRICKLE4 gene_id:29964|Hs108|chr6           (384 aa)
 initn: 820 init1: 723 opt: 746  Z-score: 634.1  bits: 127.2 E(32554): 5.4e-29
Smith-Waterman score: 746; 44.3% identity (65.6% similar) in 253 aa overlap (24-268:24-259)

               10        20        30        40        50          
pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYS------
                              ..::.:::          ::  ::..:          
CCDS34 MSVQNSGWPHQEDSPKPQDPGPPANSDSDSGHL--------PGEDPEDTHAQGPAVLSLG
               10        20        30                40        50  

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE0 --CLPEEKVPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKREN
         ::  ...:  :  :    .. ::.::::.: . ::: .: :::. ::.:: ..::.: 
CCDS34 SLCLDTNQAP--NWTG----LQTLLQQLPPQDIDERYCLALGEEERAELQLFCARRKQEA
             60              70        80        90       100      

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE0 LGRGNVRPFPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDL
       ::.: .:     . :  ::.:   .. :. .:::.:::.  ::: :::.  .:.. :..:
CCDS34 LGQGVARLVLPKLEGHTCEKCRELLKPGEYGVFAARAGEQRCWHQPCFACQACGQALINL
        110       120       130       140       150       160      

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE0 IYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQ
       ::::.::..:::::::: :.::: :::..::. .::::::..:: .:::: .:   ::: 
CCDS34 IYFYHDGQLYCGRHHAELLRPRCPACDQLIFSWRCTEAEGQRWHENHFCCQDCAGPLGGG
        170       180       190       200       210       220      

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE0 RYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSL
       :: .  : : :  :::.   .: :. ..  :  .::                        
CCDS34 RYALPGGSPCCPSCFEN---RYSDAGSSWAGALEGQAFLGETGLDRTEGRDQTSVNSATL
        230       240          250       260       270       280   

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE0 LGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEEPML
                                                                   
CCDS34 SRTLLAAAGGSSLQTQRGLPGSSPQQENRPGDKAEAPKGQEQCRLETIRDPKDTPFSTCS
           290       300       310       320       330       340   

>>CCDS5764.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7                 (412 aa)
 initn: 950 init1: 694 opt: 710  Z-score: 603.6  bits: 121.7 E(32554): 2.7e-27
Smith-Waterman score: 863; 39.1% identity (64.8% similar) in 307 aa overlap (37-310:102-407)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS
                                     : :.::  .   ..::.. ::.:: : ..:
CCDS57 SDGIPMYKRNVMILTNPVAAKKNVSINTVTYEWAPPVQNQALARQYMQMLPKEKQPVAGS
              80        90       100       110       120       130 

         70        80        90       100       110       120      
pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTM-
        : . : ::: .::: ::..   :. :. .: .:.. : .. : : :: :.:. .:  : 
CCDS57 EGAQYRKKQLAKQLPAHDQDPSKCHELSPREVKEMEQFVKKYKSEALGVGDVK-LPCEMD
             140       150       160       170       180        190

                                         130       140       150   
pF1KE0 -------------------TGAI-------------CEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGV
                          .::.             :  :  ... :: :..: :::.  
CCDS57 AQGPKQMNIPGGDRSTPAAVGAMEDKSAEHKRTQYSCYCCKLSMKEGDPAIYAERAGYDK
              200       210       220       230       240       250

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE0 CWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGR
        ::: ::: ..:.:::::.:::... :.:::::. .  :::::.:::.::..: :.::..
CCDS57 LWHPACFVCSTCHELLVDMIYFWKNEKLYCGRHYCDSEKPRCAGCDELIFSNEYTQAENQ
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pF1KE0 HWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDG
       .::.::::::.:...:.:. :.: . .: :  :. . .:  :. : . :  .  ..::..
CCDS57 NWHLKHFCCFDCDSILAGEIYVMVNDKPVCKPCYVKNHAVVCQGCHNAIDPEVQRVTYNN
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pF1KE0 QHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKE
         :::.  :: :. :.: :.:. :.: .:..:::  :                       
CCDS57 FSWHASTECFLCSCCSKCLIGQKFMPVEGMVFCSVECKKRMS                  
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pF1KE0 SRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPI

>>CCDS5763.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7                 (421 aa)
 initn: 950 init1: 694 opt: 710  Z-score: 603.5  bits: 121.7 E(32554): 2.7e-27
Smith-Waterman score: 863; 39.1% identity (64.8% similar) in 307 aa overlap (37-310:111-416)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS
                                     : :.::  .   ..::.. ::.:: : ..:
CCDS57 SDGIPMYKRNVMILTNPVAAKKNVSINTVTYEWAPPVQNQALARQYMQMLPKEKQPVAGS
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pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTM-
        : . : ::: .::: ::..   :. :. .: .:.. : .. : : :: :.:. .:  : 
CCDS57 EGAQYRKKQLAKQLPAHDQDPSKCHELSPREVKEMEQFVKKYKSEALGVGDVK-LPCEMD
              150       160       170       180       190          

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pF1KE0 -------------------TGAI-------------CEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGV
                          .::.             :  :  ... :: :..: :::.  
CCDS57 AQGPKQMNIPGGDRSTPAAVGAMEDKSAEHKRTQYSCYCCKLSMKEGDPAIYAERAGYDK
     200       210       220       230       240       250         

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pF1KE0 CWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGR
        ::: ::: ..:.:::::.:::... :.:::::. .  :::::.:::.::..: :.::..
CCDS57 LWHPACFVCSTCHELLVDMIYFWKNEKLYCGRHYCDSEKPRCAGCDELIFSNEYTQAENQ
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pF1KE0 HWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDG
       .::.::::::.:...:.:. :.: . .: :  :. . .:  :. : . :  .  ..::..
CCDS57 NWHLKHFCCFDCDSILAGEIYVMVNDKPVCKPCYVKNHAVVCQGCHNAIDPEVQRVTYNN
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pF1KE0 QHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKE
         :::.  :: :. :.: :.:. :.: .:..:::  :                       
CCDS57 FSWHASTECFLCSCCSKCLIGQKFMPVEGMVFCSVECKKRMS                  
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pF1KE0 SRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPI

>>CCDS63533.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3              (253 aa)
 initn: 613 init1: 423 opt: 445  Z-score: 385.8  bits: 80.7 E(32554): 3.6e-15
Smith-Waterman score: 548; 38.1% identity (59.3% similar) in 231 aa overlap (51-249:20-250)

               30        40        50        60        70        80
pF1KE0 QRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNSPGEKLRIKQLLHQL
                                     ::.  .:.:: : ... :   : .::.:::
CCDS63            MFGMQGDVFGLRATFMEGLQYMELIPKEKQPVTGTEGAFYRRRQLMHQL
                          10        20        30        40         

               90       100       110                        120   
pF1KE0 PPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNV-----------------RPFPV
       : .:..   : .: :.: . .. : .: : : :: :.:                 .:  .
CCDS63 PIYDQDPSRCRGLLENELKLMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGLPKEEGKQQEKPEGA
      50        60        70        80        90       100         

                          130       140       150       160        
pF1KE0 TMTGA---------------ICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNEL
         :.:               .:: : :     . .:...:::..  ::: ::: . :.: 
CCDS63 ETTAATTNGSLSDPSKEVEYVCELCKGAAPPDSPVVYSDRAGYNKQWHPTCFVCAKCSEP
     110       120       130       140       150       160         

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pF1KE0 LVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETV
       :::::::..::  .::::. : :.:::..:::::::..  ..:   :: ::: :  :: .
CCDS63 LVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFAEDYQRVEDLAWHRKHFVCEGCEQL
     170       180       190       200       210       220         

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pF1KE0 LGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHC
       :.:. ::. .:.  :  : .:                                       
CCDS63 LSGRAYIVTKGQLLCPTCSKSKRS                                    
     230       240       250                                       

>>CCDS63534.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3              (292 aa)
 initn: 632 init1: 423 opt: 445  Z-score: 384.9  bits: 80.7 E(32554): 4.1e-15
Smith-Waterman score: 589; 38.0% identity (59.2% similar) in 245 aa overlap (37-249:45-289)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS
                                     : :.:::.  .   ::.  .:.:: : ...
CCDS63 GDGIRIYKRNRMIMTNPIATGKDPTFDTITYEWAPPGVTQKLGLQYMELIPKEKQPVTGT
           20        30        40        50        60        70    

         70        80        90       100       110                
pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNV--------
        :   : .::.:::: .:..   : .: :.: . .. : .: : : :: :.:        
CCDS63 EGAFYRRRQLMHQLPIYDQDPSRCRGLLENELKLMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGL
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               120                      130       140       150    
pF1KE0 ---------RPFPVTMTGA---------------ICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVC
                .:  .  :.:               .:: : :     . .:...:::..  
CCDS63 PKEEGKQQEKPEGAETTAATTNGSLSDPSKEVEYVCELCKGAAPPDSPVVYSDRAGYNKQ
          140       150       160       170       180       190    

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE0 WHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRH
       ::: ::: . :.: :::::::..::  .::::. : :.:::..:::::::..  ..:   
CCDS63 WHPTCFVCAKCSEPLVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFAEDYQRVEDLA
          200       210       220       230       240       250    

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE0 WHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQ
       :: ::: :  :: .:.:. ::. .:.  :  : .:                         
CCDS63 WHRKHFVCEGCEQLLSGRAYIVTKGQLLCPTCSKSKRS                      
          260       270       280       290                        

          280       290       300       310       320       330    
pF1KE0 HWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKES

>>CCDS33688.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3              (365 aa)
 initn: 632 init1: 423 opt: 445  Z-score: 383.5  bits: 80.8 E(32554): 4.9e-15
Smith-Waterman score: 589; 38.0% identity (59.2% similar) in 245 aa overlap (37-249:118-362)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS
                                     : :.:::.  .   ::.  .:.:: : ...
CCDS33 GDGIRIYKRNRMIMTNPIATGKDPTFDTITYEWAPPGVTQKLGLQYMELIPKEKQPVTGT
        90       100       110       120       130       140       

         70        80        90       100       110                
pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNV--------
        :   : .::.:::: .:..   : .: :.: . .. : .: : : :: :.:        
CCDS33 EGAFYRRRQLMHQLPIYDQDPSRCRGLLENELKLMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGL
       150       160       170       180       190       200       

               120                      130       140       150    
pF1KE0 ---------RPFPVTMTGA---------------ICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVC
                .:  .  :.:               .:: : :     . .:...:::..  
CCDS33 PKEEGKQQEKPEGAETTAATTNGSLSDPSKEVEYVCELCKGAAPPDSPVVYSDRAGYNKQ
       210       220       230       240       250       260       

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE0 WHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRH
       ::: ::: . :.: :::::::..::  .::::. : :.:::..:::::::..  ..:   
CCDS33 WHPTCFVCAKCSEPLVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFAEDYQRVEDLA
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pF1KE0 WHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQ
       :: ::: :  :: .:.:. ::. .:.  :  : .:                         
CCDS33 WHRKHFVCEGCEQLLSGRAYIVTKGQLLCPTCSKSKRS                      
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pF1KE0 HWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKES




844 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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