Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0235
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0235, 313 aa
1>>>pF1KE0235 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6080+/-0.00131; mu= 13.9585+/- 0.077
mean_var=155.5348+/-51.812, 0's: 0 Z-trim(101.8): 381 B-trim: 783 in 2/46
Lambda= 0.102840
statistics sampled from 6185 (6674) to 6185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.546), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 1.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 2044 316.1 2.2e-86
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 1955 302.9 2.1e-82
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 1786 277.8 7.4e-75
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 1675 261.4 6.9e-70
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1666 260.0 1.7e-69
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1270 201.3 8.2e-52
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1110 177.5 1.1e-44
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 1080 173.1 2.6e-43
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1077 172.6 3.4e-43
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 1059 170.0 2.2e-42
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1036 166.6 2.3e-41
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1008 162.4 4.1e-40
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1008 162.4 4.1e-40
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1004 161.9 6.5e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 997 160.8 1.3e-39
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 992 160.1 2.2e-39
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 988 159.4 3.2e-39
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 987 159.4 3.9e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 979 158.1 8.1e-39
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 974 157.4 1.4e-38
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 973 157.2 1.5e-38
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 963 155.7 4.2e-38
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 959 155.2 6.5e-38
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 957 154.9 8.3e-38
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 955 154.5 9.6e-38
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 952 154.1 1.3e-37
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 946 153.2 2.4e-37
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 938 152.0 5.5e-37
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 935 151.6 7.5e-37
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 930 150.8 1.2e-36
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 928 150.5 1.6e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 927 150.4 1.7e-36
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 927 150.4 1.7e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 926 150.2 1.9e-36
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 923 149.8 2.6e-36
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 921 149.5 3.2e-36
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 920 149.3 3.5e-36
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 914 148.5 6.5e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 913 148.3 7.4e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 907 147.4 1.3e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 904 147.0 1.8e-35
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 902 146.7 2.2e-35
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 899 146.2 3.1e-35
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 896 145.8 4.3e-35
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 895 145.6 4.6e-35
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 894 145.5 5.1e-35
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 893 145.4 5.9e-35
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 891 145.1 7e-35
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 883 143.9 1.7e-34
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 882 143.7 1.8e-34
>>CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 2044 init1: 2044 opt: 2044 Z-score: 1664.3 bits: 316.1 E(32554): 2.2e-86
Smith-Waterman score: 2044; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSFAISVTTECFLLATMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSFAISVTTECFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFAILKKKSDKGVRKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFAILKKKSDKGVRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVTVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVTVS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 FTKMLKKHVKVSY
:::::::::::::
CCDS33 FTKMLKKHVKVSY
310
>>CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 1955 init1: 1955 opt: 1955 Z-score: 1592.9 bits: 302.9 E(32554): 2.1e-82
Smith-Waterman score: 1955; 94.6% identity (98.7% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSFAISVTTECFLLATMAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::
CCDS33 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSIAIGVTTECFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFAILKKKSDKGVRKAFST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::..:.:::::::::::::
CCDS33 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFTVLEKKSDKGVRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVTVS
:::::::: :::::::..:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS33 CGAHLFSVCLYYGPLLLMYVGPASPQADGQNMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVIVS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 FTKMLKKHVKVSY
: ::::..:::::
CCDS33 FIKMLKRNVKVSY
310
>>CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 (310 aa)
initn: 1835 init1: 1786 opt: 1786 Z-score: 1457.4 bits: 277.8 E(32554): 7.4e-75
Smith-Waterman score: 1786; 88.0% identity (95.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSFAISVTTECFLLATMAY
::::::::::: .::.:: ::: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS33 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::..:.:::
CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFAILKKKSDKGVRKAFST
::: ::: :::::::::::::.::::::.: :.:.:: :::..:::::: ::.::::::
CCDS33 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVTVS
:::::.::::::::: :.:.: ::::::::::.: ::::::.:::::.::::::::: .:
CCDS33 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 FTKMLKKHVKVSY
::::.:..
CCDS33 FTKMFKRNDV
310
>>CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 (325 aa)
initn: 1722 init1: 1675 opt: 1675 Z-score: 1368.2 bits: 261.4 E(32554): 6.9e-70
Smith-Waterman score: 1675; 81.6% identity (94.2% similar) in 309 aa overlap (1-309:17-325)
10 20 30 40
pF1KE0 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
::::::::::::::::::.::. :::::::::::::::::::::
CCDS33 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 LIAVIWKDPHLHIPMYLLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSF
::..:::::::::::::.::.:::::: .::::::::: :::::::::::::: .::::.
CCDS33 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDASLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 AISVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLF
. .::::::::::::::::::::: ::::.:::: :::.::.::..::.:::::::.: :
CCDS33 VTTVTTECFLLATMAYDRYVAICKALLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 RLTFCNSNIVHHIYCDTIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFA
:::::::::..:.::: ::: :::::::::::::::::.::.:::.: :::.:::..::.
CCDS33 RLTFCNSNIIQHFYCDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ILKKKSDKGVRKAFSTCGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPL
::.::: ::.::: :::::::.::::::::: : :.: ::::::::::.: ::::::.::
CCDS33 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLTFKYLGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPL
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE0 LNPIIYSLRNKQVTVSFTKMLKKHVKVSY
:::.::::::::: .:::::.:..:
CCDS33 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
310 320
>>CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 (314 aa)
initn: 1713 init1: 1666 opt: 1666 Z-score: 1361.2 bits: 260.0 E(32554): 1.7e-69
Smith-Waterman score: 1666; 79.6% identity (94.5% similar) in 309 aa overlap (1-309:6-314)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHL
::..:.::::::::::. :::.::.::::.:::::::::. ::::::.::.::.:
CCDS33 MSNEDMEQDNTTLLTEFVLTGLTYQPEWKMPLFLVFLVIYLITIVWNLGLIALIWNDPQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 HIPMYLLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSFAISVTTECFLL
:::::..::.::::::::::::::::: :::::..::::::: :::::::.. :::::::
CCDS33 HIPMYFFLGSLAFVDAWISSTVTPKMLVNFLAKNRMISLSECMIQFFSFAFGGTTECFLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVH
::::::::::::::::::.::.:.:::::: .:..::.::::::: ..::::::::::.:
CCDS33 ATMAYDRYVAICKPLLYPVIMNNSLCIRLLAFSFLGGFLHALIHEVLIFRLTFCNSNIIH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HIYCDTIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFAILKKKSDKGVR
:.::: ::: ::::: :::::::::.:::::::.:::.: ::::.::.:::::: .:::
CCDS33 HFYCDIIPLFMISCTDPSINFLMVFILSGSIQVFTIVTVLNSYTFALFTILKKKSVRGVR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KAFSTCGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNK
::::::::::.:::::::::.:.:. :::::::::::.. .:::.:::::::::::::::
CCDS33 KAFSTCGAHLLSVSLYYGPLIFMYLRPASPQADDQDMIDSVFYTIIIPLLNPIIYSLRNK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 QVTVSFTKMLKKHVKVSY
:: :::::.:..:
CCDS33 QVIDSFTKMVKRNV
310
>>CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 (309 aa)
initn: 1249 init1: 1249 opt: 1270 Z-score: 1043.7 bits: 201.3 E(32554): 8.2e-52
Smith-Waterman score: 1270; 61.9% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:3-309)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIP
. : : ::.:::::::. .: .. .:..:::.::::..::::::..::.:::::.:
CCDS33 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MYLLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSFAISVTTECFLLATM
:::.::.::: :: :...::.:: ::: :. ::::.:: ::. :: :.:::::::. :
CCDS33 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
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CCDS33 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
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CCDS33 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
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CCDS33 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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300 310
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CCDS33 HALRRVIRK
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CCDS33 CASHFLSVSIFYICLL-MYIGPS--EEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINV
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CCDS33 LKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
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CCDS33 TLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAFST
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]