Result of FASTA (ccds) for pF1KE2076
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2076, 745 aa
  1>>>pF1KE2076     745 - 745 aa - 745 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8706+/-0.00131; mu= -8.9339+/- 0.075
 mean_var=362.2135+/-82.154, 0's: 0 Z-trim(106.6): 600  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.067389
 statistics sampled from 8445 (9180) to 8445 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.275), width:  16
 Scan time:  1.820

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS7488.1 CHUK gene_id:1147|Hs109|chr10           ( 745) 5011 502.8 7.9e-142
CCDS6128.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8           ( 756) 2489 257.7 5.2e-68
CCDS55228.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8          ( 754) 2367 245.8 1.9e-64
CCDS56535.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8          ( 697) 2221 231.6 3.4e-60


>>CCDS7488.1 CHUK gene_id:1147|Hs109|chr10                (745 aa)
 initn: 5011 init1: 5011 opt: 5011  Z-score: 2659.9  bits: 502.8 E(33420): 7.9e-142
Smith-Waterman score: 5011; 99.9% identity (100.0% similar) in 745 aa overlap (1-745:1-745)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MERPPGLRPGAGGPWEMRERLGTGGFGNVCLYQHRELDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MERPPGLRPGAGGPWEMRERLGTGGFGNVCLYQHRELDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 EIQIMKKLNHANVVKACDVPEELNILIHDVPLLAMEYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKESQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EIQIMKKLNHANVVKACDVPEELNILIHDVPLLAMEYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKESQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 ILSLLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDVGGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ILSLLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDVGGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 FVGTLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECIAGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVGTLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECIAGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDPK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 CIFACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLIVEPMENWLQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPRC
       :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CIFACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLVVEPMENWLQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPRC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 FVLMDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLHSLQSRIERETGINTGSQELLSETGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVLMDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLHSLQSRIERETGINTGSQELLSETGI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 SLDPRKPASQCVLDGVRGCDSYMVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLDPRKPASQCVLDGVRGCDSYMVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLPI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 IQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAKL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 EFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAWKEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIMSLHAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAWKEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIMSLHAE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 IMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQLKHRPSDHSYSDSTEMVKIIVHTVQSQDRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQLKHRPSDHSYSDSTEMVKIIVHTVQSQDRV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALSNIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLLKIACTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALSNIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLLKIACTQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 SSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEHDHSLSCVVTPQDGETSAQMIEENLNCLGHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEHDHSLSCVVTPQDGETSAQMIEENLNCLGHL
              670       680       690       700       710       720

              730       740     
pF1KE2 STIIHEANEEQGNSMMNLDWSWLTE
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STIIHEANEEQGNSMMNLDWSWLTE
              730       740     

>>CCDS6128.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8                (756 aa)
 initn: 2151 init1: 972 opt: 2489  Z-score: 1334.7  bits: 257.7 E(33420): 5.2e-68
Smith-Waterman score: 2489; 51.3% identity (77.6% similar) in 749 aa overlap (1-743:1-742)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MERPPGLRPGAGGPWEMRERLGTGGFGNVCLYQHRELDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCH
       :   :.:   . : :::.:::::::::::  ....:   .::::.:: ::: .:::::: 
CCDS61 MSWSPSLTTQTCGAWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCL
               10        20        30        40        50        60

               70        80         90       100       110         
pF1KE2 EIQIMKKLNHANVVKACDVPEEL-NILIHDVPLLAMEYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKES
       :::::..:.: ::: : :::: . :.  .:.::::::::.:::::: ::. ::::::.:.
CCDS61 EIQIMRRLTHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREG
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE2 QILSLLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDVGGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCT
        ::.:::::.:..::::::.::::::::::::::.   ..:::::::::::..:::::::
CCDS61 AILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCT
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE2 SFVGTLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECIAGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDP
       :::::::::::::.:.. ::.:::::::::..::::.:.:::: . ::  :: :...:. 
CCDS61 SFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSE
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE2 KCIFACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLIVEPMENWLQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPR
         : . :...: :.::: :: ::.: :...: .:.:::::: : :.:::  .: :     
CCDS61 VDIVVSEDLNGTVKFSSSLPYPNNLNSVLAERLEKWLQLMLMWHPRQRG--TDPTYGPNG
              250       260       270       280         290        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE2 CFVLMDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLHSLQSRIERETGINTGSQELLSETG
       ::  .: :::::.::::::... : .. .  ::::.::..::...:::   .::::.:.:
CCDS61 CFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAG
      300       310       320       330       340       350        

     360       370           380       390       400       410     
pF1KE2 ISLDPRKPASQCVLDGV--RG--CDSYMVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSK
       ..: : :::.::. ::   .:   :  .:.:::.:: .::  .. :   . :. :.:. :
CCDS61 LALIPDKPATQCISDGKLNEGHTLDMDLVFLFDNSKITYETQISPRPQPESVSCILQEPK
      360       370       380       390       400       410        

         420       430       440       450       460       470     
pF1KE2 IQLPIIQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQ
        .: ..::::::... : .. :::: .:: :::::::..::: :. :.::::.. : :::
CCDS61 RNLAFFQLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQ
      420       430       440       450       460       470        

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE2 LKAKLEFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAWKEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIM
       :::::.::. :::.:::.::::  .::.:.:.: ::.:::. .   .. . .  : ...:
CCDS61 LKAKLDFFKTSIQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKLLVERMM
      480       490       500       510       520       530        

         540       550       560       570        580       590    
pF1KE2 SLHAEIMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQLKHRPSDH-SYSDSTEMVKIIVHTV
       .:...:..::.::.::.::  ...::..: .::..:...: :. . .:: :::.......
CCDS61 ALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTEGDSQEMVRLLLQAI
      540       550       560       570       580       590        

          600       610       620       630       640       650    
pF1KE2 QSQDRVLKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALSNIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLL
       :: .. .. .. .::: . :::: ..:::::: ..: ..: ..::. .: :::::.:.::
CCDS61 QSFEKKVRVIYTQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLL
      600       610       620       630       640       650        

          660       670       680       690       700       710    
pF1KE2 KIACTQSSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEHDHSLSCVVTPQDGETSAQMIEENL
       ::::  :..:. :..: ..  . . :    : .   . : .    :. .. : ... :  
CCDS61 KIAC--SKVRGPVSGSPDSMNASRLSQ---PGQLMSQPSTASNSLPEPAKKSEELVAEAH
      660         670       680          690       700       710   

          720       730       740                 
pF1KE2 NCLGHLSTIIHEANEEQGNSMMNLDWSWLTE            
       :    : . :... .:: .:.  ::::::              
CCDS61 NLCTLLENAIQDTVREQDQSFTALDWSWLQTEEEEHSCLEQAS
           720       730       740       750      

>>CCDS55228.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8               (754 aa)
 initn: 2042 init1: 972 opt: 2367  Z-score: 1270.6  bits: 245.8 E(33420): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 2367; 51.2% identity (77.9% similar) in 715 aa overlap (35-743:33-740)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE2 PGLRPGAGGPWEMRERLGTGGFGNVCLYQHRELDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCHEIQI
                                     .:   .::::.:: ::: .:::::: ::::
CCDS55 SGGCHSPGFGRPSPAFPAPGSPPPAPRPCRQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQI
             10        20        30        40        50        60  

           70        80         90       100       110       120   
pF1KE2 MKKLNHANVVKACDVPEEL-NILIHDVPLLAMEYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKESQILS
       :..:.: ::: : :::: . :.  .:.::::::::.:::::: ::. ::::::.:. ::.
CCDS55 MRRLTHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILT
             70        80        90       100       110       120  

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE2 LLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDVGGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCTSFVG
       :::::.:..::::::.::::::::::::::.   ..:::::::::::..:::::::::::
CCDS55 LLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVG
            130       140       150       160       170       180  

           190       200       210       220       230       240   
pF1KE2 TLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECIAGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDPKCIF
       :::::::::.:.. ::.:::::::::..::::.:.:::: . ::  :: :...:.   : 
CCDS55 TLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEVDIV
            190       200       210       220       230       240  

           250       260       270       280       290       300   
pF1KE2 ACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLIVEPMENWLQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPRCFVL
       . :...: :.::: :: ::.: :...: .:.:::::: : :.:::  .: :     ::  
CCDS55 VSEDLNGTVKFSSSLPYPNNLNSVLAERLEKWLQLMLMWHPRQRG--TDPTYGPNGCFKA
            250       260       270       280         290       300

           310       320       330       340       350       360   
pF1KE2 MDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLHSLQSRIERETGINTGSQELLSETGISLD
       .: :::::.::::::... : .. .  ::::.::..::...:::   .::::.:.:..: 
CCDS55 LDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALI
              310       320       330       340       350       360

           370           380       390       400       410         
pF1KE2 PRKPASQCVLDGV--RG--CDSYMVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLP
       : :::.::. ::   .:   :  .:.:::.:: .::  .. :   . :. :.:. : .: 
CCDS55 PDKPATQCISDGKLNEGHTLDMDLVFLFDNSKITYETQISPRPQPESVSCILQEPKRNLA
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE2 IIQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAK
       ..::::::... : .. :::: .:: :::::::..::: :. :.::::.. : :::::::
CCDS55 FFQLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAK
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE2 LEFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAWKEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIMSLHA
       :.::. :::.:::.::::  .::.:.:.: ::.:::. .   .. . .  : ...:.:..
CCDS55 LDFFKTSIQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKLLVERMMALQT
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570        580       590        
pF1KE2 EIMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQLKHRPSDH-SYSDSTEMVKIIVHTVQSQD
       .:..::.::.::.::  ...::..: .::..:...: :. . .:: :::.......:: .
CCDS55 DIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTEGDSQEMVRLLLQAIQSFE
              550       560       570       580       590       600

      600       610       620       630       640       650        
pF1KE2 RVLKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALSNIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLLKIAC
       . .. .. .::: . :::: ..:::::: ..: ..: ..::. .: :::::.:.::::::
CCDS55 KKVRVIYTQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIAC
              610       620       630       640       650       660

      660       670       680       690       700       710        
pF1KE2 TQSSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEHDHSLSCVVTPQDGETSAQMIEENLNCLG
         :..:. :..: ..  . . :    : .   . : .    :. .. : ... :  :   
CCDS55 --SKVRGPVSGSPDSMNASRLSQ---PGQLMSQPSTASNSLPEPAKKSEELVAEAHNLCT
                670       680          690       700       710     

      720       730       740                 
pF1KE2 HLSTIIHEANEEQGNSMMNLDWSWLTE            
        : . :... .:: .:.  ::::::              
CCDS55 LLENAIQDTVREQDQSFTALDWSWLQTEEEEHSCLEQAS
         720       730       740       750    

>>CCDS56535.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8               (697 aa)
 initn: 1883 init1: 972 opt: 2221  Z-score: 1194.4  bits: 231.6 E(33420): 3.4e-60
Smith-Waterman score: 2221; 50.5% identity (77.7% similar) in 683 aa overlap (67-743:8-683)

         40        50        60        70        80         90     
pF1KE2 LDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCHEIQIMKKLNHANVVKACDVPEEL-NILIHDVPLLAM
                                     .:.: ::: : :::: . :.  .:.:::::
CCDS56                        MSSDGTIRLTHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAM
                                      10        20        30       

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE2 EYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKESQILSLLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDV
       :::.:::::: ::. ::::::.:. ::.:::::.:..::::::.::::::::::::::. 
CCDS56 EYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQG
        40        50        60        70        80        90       

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE2 GGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCTSFVGTLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECI
         ..:::::::::::..::::::::::::::::::::.:.. ::.:::::::::..::::
CCDS56 EQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECI
       100       110       120       130       140       150       

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE2 AGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDPKCIFACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLIVEPMENW
       .:.:::: . ::  :: :...:.   : . :...: :.::: :: ::.: :...: .:.:
CCDS56 TGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEVDIVVSEDLNGTVKFSSSLPYPNNLNSVLAERLEKW
       160       170       180       190       200       210       

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE2 LQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPRCFVLMDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLH
       ::::: : :.:::  .: :     ::  .: :::::.::::::... : .. .  ::::.
CCDS56 LQLMLMWHPRQRG--TDPTYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQ
       220       230         240       250       260       270     

         340       350       360       370           380       390 
pF1KE2 SLQSRIERETGINTGSQELLSETGISLDPRKPASQCVLDGV--RG--CDSYMVYLFDKSK
       ::..::...:::   .::::.:.:..: : :::.::. ::   .:   :  .:.:::.::
CCDS56 SLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCISDGKLNEGHTLDMDLVFLFDNSK
         280       290       300       310       320       330     

             400       410       420       430       440       450 
pF1KE2 TVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLPIIQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAA
        .::  .. :   . :. :.:. : .: ..::::::... : .. :::: .:: ::::::
CCDS56 ITYETQISPRPQPESVSCILQEPKRNLAFFQLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAA
         340       350       360       370       380       390     

             460       470       480       490       500       510 
pF1KE2 MLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAKLEFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAW
       :..::: :. :.::::.. : ::::::::.::. :::.:::.::::  .::.:.:.: ::
CCDS56 MMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSIQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAW
         400       410       420       430       440       450     

             520       530       540       550       560       570 
pF1KE2 KEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIMSLHAEIMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQL
       .:::. .   .. . .  : ...:.:...:..::.::.::.::  ...::..: .::..:
CCDS56 REMEQAVELCGRENEVKLLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRL
         460       470       480       490       500       510     

              580       590       600       610       620       630
pF1KE2 KHRPSDH-SYSDSTEMVKIIVHTVQSQDRVLKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALS
       ...: :. . .:: :::.......:: .. .. .. .::: . :::: ..:::::: ..:
CCDS56 REKPRDQRTEGDSQEMVRLLLQAIQSFEKKVRVIYTQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVS
         520       530       540       550       560       570     

              640       650       660       670       680       690
pF1KE2 NIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLLKIACTQSSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEH
        ..: ..::. .: :::::.:.::::::  :..:. :..: ..  . . :    : .   
CCDS56 LMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIAC--SKVRGPVSGSPDSMNASRLSQ---PGQLMS
         580       590       600         610       620          630

              700       710       720       730       740          
pF1KE2 DHSLSCVVTPQDGETSAQMIEENLNCLGHLSTIIHEANEEQGNSMMNLDWSWLTE     
       . : .    :. .. : ... :  :    : . :... .:: .:.  ::::::       
CCDS56 QPSTASNSLPEPAKKSEELVAEAHNLCTLLENAIQDTVREQDQSFTALDWSWLQTEEEEH
              640       650       660       670       680       690

CCDS56 SCLEQAS
              




745 residues in 1 query   sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Jul 16 15:43:18 2019 done: Tue Jul 16 15:43:18 2019
 Total Scan time:  1.820 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com