Result of FASTA (ccds) for pF1KB5616
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5616, 788 aa
  1>>>pF1KB5616 788 - 788 aa - 788 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6023+/-0.00143; mu= 15.6446+/- 0.086
 mean_var=191.9897+/-35.742, 0's: 0 Z-trim(107.1): 130  B-trim: 34 in 1/50
 Lambda= 0.092563
 statistics sampled from 9235 (9365) to 9235 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.288), width:  16
 Scan time:  4.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17         ( 788) 5529 752.2 7.2e-217
CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3           ( 799) 3122 430.8 4.2e-120
CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2           ( 788) 2896 400.6  5e-111
CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2          ( 746) 2794 387.0 6.1e-107
CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2          ( 693) 2621 363.8 5.3e-100
CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10          ( 798) 2408 335.5 2.1e-91
CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12          ( 798) 2065 289.7 1.3e-77
CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2          ( 681) 2020 283.6 7.6e-76
CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21         ( 769) 2018 283.4 9.8e-76
CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17         (1752) 1537 219.6 3.5e-56
CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17         (1805) 1537 219.6 3.6e-56
CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17         (1822) 1537 219.6 3.6e-56
CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7           ( 769) 1385 198.8 2.7e-50
CCDS61362.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13        ( 353)  510 81.6 2.5e-15
CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13        ( 401)  510 81.6 2.7e-15
CCDS73594.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13        ( 445)  510 81.7 2.9e-15
CCDS9499.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13         ( 494)  431 71.2 4.7e-12


>>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17              (788 aa)
 initn: 5529 init1: 5529 opt: 5529  Z-score: 4007.0  bits: 752.2 E(32554): 7.2e-217
Smith-Waterman score: 5529; 100.0% identity (100.0% similar) in 788 aa overlap (1-788:1-788)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 DDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 AFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 VGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 MDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 VSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 FECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 KITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 CSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 CRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDIL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 VVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTF
              730       740       750       760       770       780

               
pF1KB5 TNITYRGT
       ::::::::
CCDS11 TNITYRGT
               

>>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3                (799 aa)
 initn: 3007 init1: 2122 opt: 3122  Z-score: 2269.7  bits: 430.8 E(32554): 4.2e-120
Smith-Waterman score: 3122; 55.7% identity (78.9% similar) in 788 aa overlap (5-781:2-782)

                10        20        30        40        50         
pF1KB5 MRARPR-PRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPL
           :: : ::.: .:.: ::    ..: ::::. ...::..:: . : ::::: :   .
CCDS30    MPRAPAPLYACLLGLCALLPR-LAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKE--DF
                  10        20         30        40        50      

      60             70        80        90       100        110   
pF1KB5 GSPR-----CDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSS-QVTQVSPQR
       ::::     :::. ::.:..:. : :: :.:  .::.. :::.::::... .: :..::.
CCDS30 GSPRSITSRCDLRANLVKNGCGGE-IESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQE
           60        70         80        90       100       110   

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB5 IALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTS
       ::. ::: :. .:..:::::::::::.::::::: :::::: .:..:::::: .::::::
CCDS30 IAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTS
           120       130       140       150       160       170   

           180       190       200         210       220       230 
pF1KB5 NLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPC--YDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNE
       :.:.:::.:::: .::. : . :.   :::  : .  .:.: ::..:.: :::.:  :::
CCDS30 NFRLGFGSFVDKDISPFSY-TAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNE
           180       190        200       210       220       230  

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB5 EVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGI
       ::.:: ::::::::::::::..::.:: ::::::.:: ::::::::   ::::::.:.:.
CCDS30 EVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGL
            240       250       260       270       280       290  

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB5 VQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELI
       :::.:::::..  :.:.::. ::::::.:. :::...:::::::::.:   ::.:.. ::
CCDS30 VQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALI
            300       310       320       330       340       350  

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB5 PGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKS
       ::::: .:. ::.:..:::..::..::::::: : : ::.:.: :.::: ..   :: ..
CCDS30 PGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRK
            360       370       380       390       400       410  

             420       430        440       450       460       470
pF1KB5 CMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEK-EKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPN
       : :::::::.:: .  ..:.::... :. :...::::.::: : ::..: :.:..  :::
CCDS30 CEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPN
            420       430       440       450       460       470  

              480       490       500       510       520       530
pF1KB5 SHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCG
       : ::: :.::. ::.:.:.::.::..:::.. . .   :. :   ::.:.:: ::.: :.
CCDS30 SARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCN
             480       490       500       510       520       530 

              540       550       560       570       580       590
pF1KB5 QCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRT
       :: :  :.:::: : .::::.:::.: :: .:::::.: ::.: : . . :  :::.:  
CCDS30 QCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDI
             540       550       560       570       580       590 

              600       610       620       630       640       650
pF1KB5 DTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGA
       .:: . .: .:: ::.: ::.: : .::..:. :::::::::::. :..::::  .  : 
CCDS30 STCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGK
             600       610       620       630       640       650 

              660        670       680       690       700         
pF1KB5 LHDENTCNRYCRDEIES-VKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVE
         :..::.  ::::. . :  .    ..:: : ::.  :::. : : :  :::: : :..
CCDS30 -PDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLR
              660       670       680       690       700       710

     710       720       730       740       750       760         
pF1KB5 EPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTAN
       :::: . :. ...::.:.:.:::.::: : :::::.:::::.:::::. ::.::... :.
CCDS30 EPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMAS
              720       730       740       750       760       770

     770       780                  
pF1KB5 NPLYKEATSTFTNITYRGT          
       ::::..  :: :                 
CCDS30 NPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD
              780       790         

>>CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2                (788 aa)
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                                     :.  :. .:..:: ..:.::::..: .  :
CCDS22         MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHP
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pF1KB5 LG-SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALR
        : . :::   :::  .:  . :: :::....:...:::   . .::...:..:: . :.
CCDS22 SGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILK
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pF1KB5 LRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRI
       :::  .......:::.::::::.::::::: :: ::: .:..::..:. .: :::::.:.
CCDS22 LRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRL
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pF1KB5 GFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQS
       :::.::.:::::..  .: : . ::: ..   ::: ::.::.: ::... :::: ::.:.
CCDS22 GFGSFVEKPVSPFVKTTP-EEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQK
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pF1KB5 VSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDG
       .: : :.:::::::::::.:: ::::::::. :::::..:: .:...:..::::: ::::
CCDS22 ISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDG
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pF1KB5 QCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVG
        ::. : :.:: ::...::..: . .:: :.:. ::::::.. :.::.::..::::.:::
CCDS22 LCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVG
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pF1KB5 VLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKI
       .:. ::.:.::::..:: ..::.:::::    : :.:::.: : :. ..   :.:  .:.
CCDS22 LLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKV
             360       370       380       390       400       410 

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pF1KB5 GDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNG
       :::.:::. ...  : ... . . :::::. :.: . :. .:.: :: ..: :: .:..:
CCDS22 GDTASFSVTVNIPHC-ERRSRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHG
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pF1KB5 NGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSS
       ::.:.:::: : :: .: .:::.: :.  .  : :.    .: :: ::.: ::::.:: :
CCDS22 NGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLST--DSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS
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pF1KB5 DFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSN
        .:.: : ::.::.:::::.:: .:.:.:.:.::.:.: : ::: :::::: ::.:.: .
CCDS22 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSED
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pF1KB5 GLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTC
       :.:::::: : ::.::: .::. : :::.:::: : :. :. :.::.    :  ..:  :
CCDS22 GVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREE--C
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pF1KB5 NRYCRDEIESVKELKDTGKD-AVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKG
          :.    ...: .: .:: .:.:. ..:..:.. :    :. ::.:.. ..: .::: 
CCDS22 VDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKP
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pF1KB5 PDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEA
       :.: ...:.:  ::::::.. : :::::...::::: :::: ::..:::.:..::::. .
CCDS22 PNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGS
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        780                   
pF1KB5 TSTFTNITYRGT           
       :::: :.::.             
CCDS22 TSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
         770       780        

>>CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2               (746 aa)
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pF1KB5 PNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG-SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSE
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CCDS74                      MITYKNFTHPSGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQ
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pF1KB5 ARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDL
       ...:...:::   . .::...:..:: . :.:::  .......:::.::::::.::::::
CCDS74 VEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDL
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pF1KB5 SYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDM
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CCDS74 SASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVK-TTPEEIANPCSSI
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pF1KB5 KTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRN
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CCDS74 PYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRN
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pF1KB5 DASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLS
       :. :::::..:: .:...:..::::: :::: ::. : :.:: ::...::..: . .:: 
CCDS74 DSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLV
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pF1KB5 QKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVR
       :.:. ::::::.. :.::.::..::::.:::.:. ::.:.::::..:: ..::.::::: 
CCDS74 QNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVL
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pF1KB5 DLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVG
          : :.:::.: : :. ..   :.:  .:.:::.:::. ...  : ... . . :::::
CCDS74 GDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHC-ERRSRHIIIKPVG
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pF1KB5 FKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRP
       . :.: . :. .:.: :: ..: :: .:..:::.:.:::: : :: .: .:::.: :.  
CCDS74 LGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLS
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pF1KB5 SQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHG
       .  : :.    .: :: ::.: ::::.:: : .:.: : ::.::.:::::.:: .:.:.:
CCDS74 T--DSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNG
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pF1KB5 QCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEK
       .:.::.:.: : ::: :::::: ::.:.: .:.:::::: : ::.::: .::. : :::.
CCDS74 DCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCER
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pF1KB5 CPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRYCRDEIESVKELKDTGKD-AVNCTYKN
       :::: : :. :. :.::.    :  ..:  :   :.    ...: .: .:: .:.:. ..
CCDS74 CPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREE--CVDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQG
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pF1KB5 EDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLI
       :..:.. :    :. ::.:.. ..: .::: :.: ...:.:  ::::::.. : :::::.
CCDS74 ENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLV
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pF1KB5 TIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT           
       ..::::: :::: ::..:::.:..::::. .:::: :.::.             
CCDS74 SFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
            700       710       720       730       740      

>>CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2               (693 aa)
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Smith-Waterman score: 2621; 52.6% identity (79.5% similar) in 665 aa overlap (123-786:23-680)

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pF1KB5 RPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKD
                                     .......:::.::::::.::::::: :: :
CCDS74         MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDD
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pF1KB5 DLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLP
       :: .:..::..:. .: :::::.:.:::.::.:::::..  .: : . ::: ..   :::
CCDS74 DLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTP-EEIANPCSSIPYFCLP
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pF1KB5 MFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLL
        ::.::.: ::... :::: ::.:..: : :.:::::::::::.:: ::::::::. :::
CCDS74 TFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLL
             120       130       140       150       160       170 

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pF1KB5 VFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINL
       ::..:: .:...:..::::: :::: ::. : :.:: ::...::..: . .:: :.:. :
CCDS74 VFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLL
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CCDS74 IFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGL
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       .:::.: : :. ..   :.:  .:.:::.:::. ...  : ... . . :::::. :.: 
CCDS74 NLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHC-ERRSRHIIIKPVGLGDALE
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CCDS74 LLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLST--DSC
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pF1KB5 SPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGD
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CCDS74 KEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGE
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CCDS74 CVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGD
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        :. :. :.::.    :  ..:  :   :.    ...: .: .:: .:.:. ..:..:..
CCDS74 PCNSKRSCIECHLSAAGQAREE--CVDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQGENECLI
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CCDS74 TFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRK
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CCDS74 EVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
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CCDS71 GMPT-SARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQ
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CCDS71 ELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRN-VTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGG
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CCDS71 IVLPNDGQCHL-ENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNL
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CCDS71 PESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGEC
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CCDS71 VCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACD
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CCDS71 FNKGEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNN
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CCDS71 EVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKM
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pF1KB5 RAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT
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CCDS71 NAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
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CCDS88 ELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPSCAWCKQLNFTASGEAEARR
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CCDS88 CARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA--TQLAPQRVRVTLRPGEP
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CCDS88 QQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFV
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pF1KB5 DKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSRNRD
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CCDS88 DKTVLPFVS-TVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLD
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       .::::::::.::..:.:.::::: .:.:::::.:   : : ::.:.:: .:.::.::. :
CCDS88 SPEGGFDAILQAALCQEQIGWRN-VSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDS
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pF1KB5 DNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLSMDS
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CCDS88 NGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDS
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CCDS88 SNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREGKAEDRGQCNHVRINQ
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pF1KB5 TVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNG
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CCDS88 TVTFWVSLQATHCLPEPHL-LRLRALGFSEELIVELHTLCDCNC-SDTQPQAPHCSDGQG
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CCDS88 HLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGRCSCS--
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pF1KB5 DFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSN
         :. .:. ::::: :: :..: .:.: :.:.:: : : .. ::  :.:.   :.:.: .
CCDS88 --GQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSGDMDSCISPE
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pF1KB5 GLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTC
       : ::::.:.:.:. : :.. : ::  :..:: :   :  ...:.::  :  : :   ..:
CCDS88 GGLCSGHGRCKCNRCQCLD-GYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGPL--ATNC
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pF1KB5 NRYC--RDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPK
       .  :   .   ..  . : :     :  .. :. .  :   .:. :  .: :  .:.  :
CCDS88 STACAHTNVTLALAPILDDGW----CKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRV--RPQ-EK
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pF1KB5 GPD-ILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYK
       : :   ...:. .:.:. .::. .: ..: . :.::.:...::.:. . .:   .:::::
CCDS88 GADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYK
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          780             
pF1KB5 EATSTFTNITYRGT     
        : .:  :  ..       
CCDS88 SAITTTINPRFQEADSPTL
     780       790        

>>CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2               (681 aa)
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                                     :.  :. .:..:: ..:.::::..: .  :
CCDS63         MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHP
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pF1KB5 LG-SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALR
        : . :::   :::  .:  . :: :::....:...:::   . .::...:..:: . :.
CCDS63 SGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILK
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pF1KB5 LRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRI
       :::  .......:::.::::::.::::::: :: ::: .:..::..:. .: :::::.:.
CCDS63 LRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRL
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pF1KB5 GFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQS
       :::.::.:::::..  .: : . ::: ..   ::: ::.::.: ::... :::: ::.:.
CCDS63 GFGSFVEKPVSPFVKTTP-EEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQK
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pF1KB5 VSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDG
       .: : :.:::::::::::.:: ::::::::. :::::..:: .:...:..::::: ::::
CCDS63 ISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDG
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pF1KB5 QCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVG
        ::. : :.:: ::...::..: . .:: :.:. ::::::.. :.::.::..::::.:::
CCDS63 LCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVG
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pF1KB5 VLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKI
       .:. ::.:.::::..:: ..::.:::::    : :.:::.: : :. ..   :.:  .:.
CCDS63 LLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKV
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pF1KB5 GDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNG
       :::.:::. ...  : ... . . :::::. :.: . :. .:.: :: ..: :: .:..:
CCDS63 GDTASFSVTVNIPHC-ERRSRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHG
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pF1KB5 NGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSS
       ::.:.:::: : :: .: .:::.: :.  .  : :.    .: :: ::.: ::::.:: :
CCDS63 NGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLST--DSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS
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pF1KB5 DFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSN
        .:.: : ::.::.:::::.:                                       
CCDS63 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHK---------------------------------------
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pF1KB5 GLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTC
       ::::                   ::             :.:.                  
CCDS63 GLLC-------------------GD-------------FSKD------------------
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pF1KB5 NRYCRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGP
                           .:.:. ..:..:.. :    :. ::.:.. ..: .::: :
CCDS63 -------------------GSVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPP
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pF1KB5 DILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEAT
       .: ...:.:  ::::::.. : :::::...::::: :::: ::..:::.:..::::. .:
CCDS63 NIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGST
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       780                   
pF1KB5 STFTNITYRGT           
       ::: :.::.             
CCDS63 STFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
     660       670       680 

>>CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21              (769 aa)
 initn: 1251 init1: 374 opt: 2018  Z-score: 1473.2  bits: 283.4 E(32554): 9.8e-76
Smith-Waterman score: 2075; 40.3% identity (68.3% similar) in 791 aa overlap (6-782:5-763)

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pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEAL--P
            :: ::    ::: .: ..:    . ::   ::::..:.  .: :.::.   .  :
CCDS13  MLGLRP-PL----LALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGP
                     10        20        30        40        50    

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pF1KB5 LGSP---RCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIA
        :.:   ::: . .::  .:: ..:  :.: :.. ::.  ..:         :.:::...
CCDS13 -GDPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQK---------QLSPQKVT
            60        70        80        90                100    

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pF1KB5 LRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNL
       : ::: ..  :..  :... ::.:.:::::::::: ::: ....::  :   . ..: . 
CCDS13 LYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESG
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pF1KB5 RIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKK
       :::::.:::: : :..  . :. :.::: . .  : : :...::: ::.. ..:. :: :
CCDS13 RIGFGSFVDKTVLPFVN-THPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGK
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pF1KB5 QSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPN
       : .: : ::::::.::.::...: :.::::: ...::::.::   :.: ::.:..:. ::
CCDS13 QLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRN-VTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPN
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pF1KB5 DGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTT
       ::.::.  :: :. :. .::::.: ...::...::. :::::  .:. :.. .:.:: ..
CCDS13 DGRCHL-EDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA
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pF1KB5 VGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLK--SCM
       :: :: :::::..:: .::.:. :.: :.   ::. :...... : :. .  .    .: 
CCDS13 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD
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pF1KB5 GLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHR
       :..:.  ..:.... .  : ::.  ::.:. .:: : . :::  .:.: :. :..  :  
CCDS13 GVQINVPITFQVKVTATECIQEQ--SFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSL-
             410       420         430       440       450         

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pF1KB5 CNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDE--CSPREGQPVCSQRGECLCGQ
       :. :.: .:::.:::  :..:..:::. .  : ::. :  :   ... .::  :.:.:::
CCDS13 CH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQG-RSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQ
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pF1KB5 CVCHSSDF-GK-ITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQ--CSCGDCLCDSDWTGYYCNCT
       :.::.::  :: : :.::::: ..: ::.:..:.: :.  : :: : :   . :  :.: 
CCDS13 CLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCE
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pF1KB5 TRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFD
         :. :..   . :::::.:.:. : : . :     :..:: ::. :     :.:: ::.
CCDS13 RTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFE
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pF1KB5 RGALHDENTCNRYCRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQY-YEDSSGKSILY
       .: .   ..:.  :     : . .:  :.   .:  .. . : : .    .:.  . ..:
CCDS13 KGPFG--KNCSAACPGLQLSNNPVK--GR---TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIY
         640         650         660          670       680        

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pF1KB5 VVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWD
       : :  ::  ::.: ... .....:.:::.  :.::: :: . : .:. .::.:. ...:.
CCDS13 VDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWN
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        770       780        
pF1KB5 TANNPLYKEATSTFTNITYRGT
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CCDS13 N-DNPLFKSATTTVMNPKFAES
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