Result of FASTA (ccds) for pF1KA0994
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0994, 665 aa
  1>>>pF1KA0994 665 - 665 aa - 665 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6940+/-0.000964; mu= 16.6743+/- 0.058
 mean_var=62.4989+/-12.357, 0's: 0 Z-trim(103.7): 17  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.162233
 statistics sampled from 7537 (7546) to 7537 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.232), width:  16
 Scan time:  3.400

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS177.1 PADI2 gene_id:11240|Hs108|chr1           ( 665) 4520 1067.0       0
CCDS179.1 PADI3 gene_id:51702|Hs108|chr1           ( 664) 2371 564.1 2.3e-160
CCDS178.1 PADI1 gene_id:29943|Hs108|chr1           ( 663) 2301 547.7 1.9e-155
CCDS180.1 PADI4 gene_id:23569|Hs108|chr1           ( 663) 2267 539.7 4.8e-153
CCDS72715.1 PADI6 gene_id:353238|Hs108|chr1        ( 694) 1347 324.4 3.3e-88


>>CCDS177.1 PADI2 gene_id:11240|Hs108|chr1                (665 aa)
 initn: 4520 init1: 4520 opt: 4520  Z-score: 5710.9  bits: 1067.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4520; 100.0% identity (100.0% similar) in 665 aa overlap (1-665:1-665)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 DVDADRDGVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 DVDADRDGVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLKD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRRKLYHVVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRRKLYHVVK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 YTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWIMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 YTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWIMT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 PNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYIEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYIEA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 PHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVTVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVTVN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 GKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 IPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESLVQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 IPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESLVQE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 NLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKDLGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 NLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKDLGI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 PKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKW
              610       620       630       640       650       660

            
pF1KA0 WHMVP
       :::::
CCDS17 WHMVP
            

>>CCDS179.1 PADI3 gene_id:51702|Hs108|chr1                (664 aa)
 initn: 1976 init1: 1976 opt: 2371  Z-score: 2992.6  bits: 564.1 E(32554): 2.3e-160
Smith-Waterman score: 2371; 51.9% identity (77.1% similar) in 668 aa overlap (1-665:1-664)

               10        20        30        40        50          
pF1KA0 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGE-AE
       :  .: ::..    . :: : :.   .:.:...: :.. : .  .  : . .  . : ..
CCDS17 MSLQRIVRVSLEHPTSAVCVAGVETLVDIYGSVPEGTEMFEVYGTPGVDIYISPNMERGR
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA0 EVATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEIS
       : : .  .:: .. .  . :.:.. :.. ....: ..:.. .  .:.  : :.:: ..::
CCDS17 ERADT--RRWRFDATLEIIVVMNSPSNDLNDSHVQISYHSSHEPLPLAYAVLYLTCVDIS
                 70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA0 LDVDADRDGVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLK
       :: : . .:  ..:   : .:.::: : :.::::::::. :    .:  :..:.  .::.
CCDS17 LDCDLNCEGRQDRNFVDKRQWVWGPSGYGGILLVNCDRDDPSCDVQDNCDQHVHCLQDLE
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200       210       220        230        
pF1KA0 DMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPF-FGQRYIHILGRRKLYHV
       ::: :.:::.::  :   ...::. :  :. .. ::.. .:    . : :.::. :. . 
CCDS17 DMSVMVLRTQGPAALFDDHKLVLHTSSYDAKRAQVFHICGPEDVCEAYRHVLGQDKVSYE
      180       190       200       210       220       230        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 VKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWI
       :    :. :  :::::: ::: ::.::.:.::.::.   .:.  .:::::::.::.::::
CCDS17 VPRLHGDEER-FFVEGLSFPDAGFTGLISFHVTLLDDSNEDFSASPIFTDTVVFRVAPWI
      240        250       260       270       280       290       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA0 MTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYI
       :::. :::. :.:: ...:  :.  : .:..:..:.: .: :  ::.:::::::.:.::.
CCDS17 MTPSTLPPLEVYVCRVRNNTCFVDAVAELARKAGCKLTICPQAENRNDRWIQDEMELGYV
       300       310       320       330       340       350       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA0 EAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVT
       .:::: .:::.::::.:.:.::: :..::::::::::::  .::..:::::::::::::.
CCDS17 QAPHKTLPVVFDSPRNGELQDFPYKRILGPDFGYVTREPRDRSVSGLDSFGNLEVSPPVV
       360       370       380       390       400       410       

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA0 VNGKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSF
       .::: :::::::::...: :.:::.:.::::::.::.:: ::::. :::.:::::::.::
CCDS17 ANGKEYPLGRILIGGNLPGSSGRRVTQVVRDFLHAQKVQPPVELFVDWLAVGHVDEFLSF
       420       430       440       450       460       470       

      480       490       500       510        520       530       
pF1KA0 VPIPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGL-GGMSSKRITINKILSNESL
       :: :  : : .:.:: .::.:::.:::: :::.:..:.:.    . : :.::..:::..:
CCDS17 VPAPDGKGFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGHGRALLFQGVVDDEQVKTISINQVLSNKDL
       480       490       500       510       520       530       

       540       550       560       570       580       590       
pF1KA0 VQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKD
       .. : . : :.::::..::.::::.: ::::.: :::  : ..: ::::..:::.:: : 
CCDS17 INYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIIDIPQLFKT-ERKKATAFFPDLVNMLVLGKH
       540       550       560       570        580       590      

       600       610       620       630       640       650       
pF1KA0 LGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFT
       ::::::::: ..  :::: .::.:::::::.::::::.. :: . ::::::::: ::::.
CCDS17 LGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLHCTFIDDFTPYHMLHGEVHCGTNVCRKPFS
        600       610       620       630       640       650      

       660     
pF1KA0 FKWWHMVP
       ::::.:::
CCDS17 FKWWNMVP
        660    

>>CCDS178.1 PADI1 gene_id:29943|Hs108|chr1                (663 aa)
 initn: 2055 init1: 963 opt: 2301  Z-score: 2904.1  bits: 547.7 E(32554): 1.9e-155
Smith-Waterman score: 2301; 52.3% identity (76.2% similar) in 669 aa overlap (1-665:1-663)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEE
       :  .:.:.:.    ..:: :.:.   .:..: .: ::..: .. :  : : .: . ... 
CCDS17 MAPKRVVQLSLKMPTHAVCVVGVEAHVDIHSDVPKGANSFRVSGSSGVEVFMVYN-RTRV
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISL
           :: :: :. .. . :... :: : .. :: :.:. :. .  . .. :.::...:::
CCDS17 KEPIGKARWPLDTDADMVVSVGTASKELKDFKVRVSYFGEQEDQALGRSVLYLTGVDISL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 DVDADRDGVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLKD
       .::. : : :....  : .: ::::: ::::::::::..    . :     ..:  ::.:
CCDS17 EVDTGRTGKVKRSQGDKKTWRWGPEGYGAILLVNCDRDNHRSAEPDLTHSWLMSLADLQD
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRRKLYHVVK
       :: :.:  .:::.:  ....:: . .::: .: :: ...    . : ..:: . : . :.
CCDS17 MSPMLLSCNGPDKLFDSHKLVLNVPFSDSKRVRVFCARGGNSLSDYKQVLGPQCLSYEVE
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 YTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWIMT
          :  :. :.:::: :::  : ::::. :::..     .: . .::::: ::.::::::
CCDS17 RQPGEQEIKFYVEGLTFPDADFLGLVSLSVSLVD--PGTLPEVTLFTDTVGFRMAPWIMT
     240       250       260       270         280       290       

              310           320       330       340       350      
pF1KA0 PNILPPVSVFVCCMKD----NYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFG
       ::  ::  ..:: . :    :  ::.... :. :.::.: .: :  ::.:::::::.:::
CCDS17 PNTQPPEELYVCRVMDTHGSNEKFLEDMSYLTLKANCKLTICPQVENRNDRWIQDEMEFG
       300       310       320       330       340       350       

        360       370       380       390       400       410      
pF1KA0 YIEAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPP
       :::::::.::::.::::. .::::: :..:::::::::::  . . .::::::::.::::
CCDS17 YIEAPHKSFPVVFDSPRNRGLKDFPYKRILGPDFGYVTREIPLPGPSSLDSFGNLDVSPP
       360       370       380       390       400       410       

        420       430       440       450       460       470      
pF1KA0 VTVNGKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFM
       :::.:  ::::::::::::: ::::.:...::.::::::::::::::::::.:::::::.
CCDS17 VTVGGTEYPLGRILIGSSFPKSGGRQMARAVRNFLKAQQVQAPVELYSDWLSVGHVDEFL
       420       430       440       450       460       470       

        480       490       500       510       520       530      
pF1KA0 SFVPIPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNES
       .:::    : : ::.:: ::: :::.::...:.::: .: ::   ..:: .::..:... 
CCDS17 TFVPTSDQKGFRLLLASPSACLKLFQEKKEEGYGEAAQFDGLK-HQAKR-SINEMLADRH
       480       490       500       510       520         530     

        540       550       560       570       580       590      
pF1KA0 LVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDK
       : ..::. :.:.::::..::.::::.:.::.:.: :: . ..  :.::::.::::.:: :
CCDS17 LQRDNLHAQKCIDWNRNVLKRELGLAESDIVDIPQLFFL-KNFYAEAFFPDMVNMVVLGK
         540       550       560       570        580       590    

        600       610       620       630       640       650      
pF1KA0 DLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPF
        ::::::.:: .. .:::: .:..:::::::.: ::::  .::.. ::.:::::::::::
CCDS17 YLGIPKPYGPIINGRCCLEEKVQSLLEPLGLHCIFIDDYLSYHELQGEIHCGTNVRRKPF
          600       610       620       630       640       650    

        660     
pF1KA0 TFKWWHMVP
        ::::.:::
CCDS17 PFKWWNMVP
          660   

>>CCDS180.1 PADI4 gene_id:23569|Hs108|chr1                (663 aa)
 initn: 2199 init1: 1057 opt: 2267  Z-score: 2861.1  bits: 539.7 E(32554): 4.8e-153
Smith-Waterman score: 2267; 50.4% identity (76.0% similar) in 668 aa overlap (1-665:1-663)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEE
       : .   .:.   . ..:: ::::    :. :.::    .::.. :  : :....   :..
CCDS18 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDIAHGPPAKK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISL
        .: :.. : :.:.. . .::. ::  ....:: ..::  . . :. .: :.::..::::
CCDS18 KST-GSSTWPLDPGVEVTLTMKVASGSTGDQKVQISYYGPK-TPPV-KALLYLTGVEISL
                70        80        90       100         110       

              130         140       150       160       170        
pF1KA0 DVDADRDGVVEKNNPKKA--SWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDL
        .:  : : :. .   :   .::::: ::::::::::::..      ::.:..: ..:::
CCDS18 CADITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDEVLDSEDL
       120       130       140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA0 KDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRRKLYHV
       .::: : : :: :  . ... .::... :. ::: :: .    ....   .:: .   : 
CCDS18 QDMSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLGPKWPSHY
       180       190       200       210       220       230       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 VKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWI
       .   ::. .. :.::.: :::  : ::... .:::.    ..: . .: :.:.::.::::
CCDS18 LMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTISLLDTSNLELPEAVVFQDSVVFRVAPWI
       240       250       260       270       280       290       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA0 MTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYI
       ::::  ::  :..: . .:  ::: : .:. :..:.: .: .  :  :.:.:::.:.:::
CCDS18 MTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQDEMEIGYI
       300       310       320       330       340       350       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA0 EAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVT
       .:::: .:::.::::. .::.::.:...::::::::: :   ....::::::::::::::
CCDS18 QAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGNLEVSPPVT
       360       370       380       390       400       410       

      420       430        440       450       460       470       
pF1KA0 VNGKTYPLGRILIGSS-FPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMS
       : :: :::::::.:.: .: . .:.: ....:::.::::::::.::::::.:::::::.:
CCDS18 VRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSVGHVDEFLS
       420       430       440       450       460       470       

       480       490       500       510       520       530       
pF1KA0 FVPIPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESL
       ::: :  : : ::.::  .:::::.:.:..:::::..:.:.   ..:.  :..::::..:
CCDS18 FVPAPDRKGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGI--KKKKQQKIKNILSNKTL
       480       490       500       510         520       530     

       540       550       560       570       580       590       
pF1KA0 VQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKD
        ..: . .::.::::..::.::::.:.::::.: :::. :  .:.:::::::::.:: : 
CCDS18 REHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSKAEAFFPNMVNMLVLGKH
         540       550       560       570       580       590     

       600       610       620       630       640       650       
pF1KA0 LGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFT
       ::::::::: .. .:::: .: .:::::::.::::.:. .::   ::::::::::::::.
CCDS18 LGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQCTFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFS
         600       610       620       630       640       650     

       660     
pF1KA0 FKWWHMVP
       ::::.:::
CCDS18 FKWWNMVP
         660   

>>CCDS72715.1 PADI6 gene_id:353238|Hs108|chr1             (694 aa)
 initn: 1601 init1: 697 opt: 1347  Z-score: 1697.0  bits: 324.4 E(32554): 3.3e-88
Smith-Waterman score: 1851; 44.1% identity (68.8% similar) in 690 aa overlap (1-665:9-694)

                       10        20        30        40        50  
pF1KA0         MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEV
               :  .  ..:.  : :.:: :::: .  :. . ::   : :... : .: ..:
CCDS72 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KA0 VRDGEAEEVATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLF
       .    .:.   ..   : ::  :   : :.. :  ...:::.:.::  . . :.  : :.
CCDS72 ANTVISEK--EDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLY
                 70        80        90       100       110        

            120       130         140       150       160       170
pF1KA0 LTAIEISLDVDADRDGVVEKNNPKKAS--WTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDE
       ::.::.::.::  :.: :: .. :.:.  : ::: : ::::::::.        :: . .
CCDS72 LTGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTK
      120       130       140       150       160       170        

              180       190       200       210       220       230
pF1KA0 KVYSKEDLKDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHIL
       ::  .:.. ..::: : ..::. .   :..::. :  .: :. :.. ..   .. .  .:
CCDS72 KVIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVL
      180       190       200       210       220        230       

              240       250       260       270         280        
pF1KA0 GRRKLYHVVKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQD--IPLTPIFTD
       :  .  ...   :.  .  :.::.. ::.  ::::.:  :::.:  .::  :: : .. :
CCDS72 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEE-SQDPSIPETVLYKD
       240       250       260       270       280        290      

      290       300       310       320       330       340        
pF1KA0 TVIFRIAPWIMTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRW
       ::.::.:: .. :    :. :..:   .   :.  : .: ::.: ..   ..  ::  ::
CCDS72 TVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRW
        300       310       320       330       340       350      

      350       360       370       380       390       400        
pF1KA0 IQDEIEFGYIEAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSF
       .:::. : : .::::   ..::.:. ..: .::.:  :.: .::. ..   ..:.:.::.
CCDS72 LQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSI
        360       370       380       390       400       410      

      410       420       430        440       450       460       
pF1KA0 GNLEVSPPVTVNGKTYPLGRILIGSSF-PLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWL
       ::: ::::: :.:: :::::.:::::: : . :: :.:..:::: :::::::::::::::
CCDS72 GNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWL
        420       430       440       450       460       470      

       470       480           490       500       510       520   
pF1KA0 TVGHVDEFMSFVPIP----GTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGG---
        .::::::: :.:      : : ::::.:: ::::::::::::.:.:.:..:  : .   
CCDS72 MTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQL
        480       490       500       510       520       530      

                530       540       550       560       570        
pF1KA0 MSSKR--ITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDE-
       .:. :   ::...:..::: ..: : ..:.  :::::: ::::.:::::..: :: ... 
CCDS72 LSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKL
        540       550       560       570       580       590      

            580            590       600       610       620       
pF1KA0 -----DHR-----ARAFFPNMVNMIVLDKDLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGL
            :..     :: .::... :::. :.::::::::::..  :::: ..  ::::::.
CCDS72 TNIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGF
        600       610       620       630       640       650      

       630       640       650       660     
pF1KA0 ECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP
       .::::.:.. :   .:..   .:.:: ::.::::.:::
CCDS72 KCTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
        660       670       680       690    




665 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 22:06:42 2016 done: Sat Nov  5 22:06:42 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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