Result of FASTA (ccds) for pF1KE0094
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0094, 535 aa
  1>>>pF1KE0094 535 - 535 aa - 535 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4915+/-0.00109; mu= 18.5669+/- 0.066
 mean_var=85.0376+/-16.751, 0's: 0 Z-trim(104.8): 33  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.139081
 statistics sampled from 8060 (8092) to 8060 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.249), width:  16
 Scan time:  3.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1774.1 EHD3 gene_id:30845|Hs108|chr2           ( 535) 3558 724.2 8.9e-209
CCDS8084.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11          ( 534) 3188 650.0  2e-186
CCDS73315.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11         ( 548) 3188 650.0  2e-186
CCDS10081.1 EHD4 gene_id:30844|Hs108|chr15         ( 541) 2748 561.7 7.6e-160
CCDS12704.1 EHD2 gene_id:30846|Hs108|chr19         ( 543) 2608 533.6 2.2e-151
CCDS81943.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16           ( 431)  755 161.7 1.5e-39
CCDS42113.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16           ( 473)  755 161.8 1.7e-39
CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1            ( 896)  332 77.1 9.6e-14
CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 601)  327 76.0 1.4e-13
CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 754)  327 76.1 1.7e-13
CCDS32944.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 864)  327 76.1 1.9e-13
CCDS58654.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 910)  327 76.1 1.9e-13


>>CCDS1774.1 EHD3 gene_id:30845|Hs108|chr2                (535 aa)
 initn: 3558 init1: 3558 opt: 3558  Z-score: 3861.6  bits: 724.2 E(32554): 8.9e-209
Smith-Waterman score: 3558; 100.0% identity (100.0% similar) in 535 aa overlap (1-535:1-535)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 PFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLPNSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLPNSV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530     
pF1KE0 LGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
              490       500       510       520       530     

>>CCDS8084.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11               (534 aa)
 initn: 3220 init1: 3188 opt: 3188  Z-score: 3460.4  bits: 650.0 E(32554): 2e-186
Smith-Waterman score: 3188; 87.0% identity (97.2% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
       ::::.. : ::.:.::.::::.:::..:: .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
       ::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:  ::..:::::::::..
CCDS80 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
       ::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
       :::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS80 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
       :::::::::::::::::::.::::..:::::::::.::: .:::::::::::::.:..::
CCDS80 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
       . ::.::::::: :: :::..::::::.:::.:::.::::::  : :.::::::.::..:
CCDS80 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQVVKGGAFDGTMNG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 PFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLPNSV
       ::::::::::::::::.::::..::: :::::::::::.:::::::::::::.:::::.:
CCDS80 PFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLPNTV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530     
pF1KE0 LGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
       :::::::::.::::.:::.::::::::::::::::::: .:: ::.:::::.   
CCDS80 LGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE 
              490       500       510       520       530     

>>CCDS73315.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11              (548 aa)
 initn: 3220 init1: 3188 opt: 3188  Z-score: 3460.3  bits: 650.0 E(32554): 2e-186
Smith-Waterman score: 3188; 87.0% identity (97.2% similar) in 532 aa overlap (1-532:15-546)

                             10        20        30        40      
pF1KE0               MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFH
                     ::::.. : ::.:.::.::::.:::..:: .:::::::::::::::
CCDS73 MEQPGTAASPVSGSMFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFH
               10        20        30        40        50        60

         50        60        70        80        90       100      
pF1KE0 SPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDME
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:  :
CCDS73 SPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTE
               70        80        90       100       110       120

        110       120       130       140       150       160      
pF1KE0 GIIPGNALVVDPKKPFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRIS
       :..:::::::::..::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::::::::::::
CCDS73 GVVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRIS
              130       140       150       160       170       180

        170       180       190       200       210       220      
pF1KE0 RGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIET
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS73 RGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIET
              190       200       210       220       230       240

        230       240       250       260       270       280      
pF1KE0 QQLMRVYGALMWSLGKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLP
       :::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS73 QQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLP
              250       260       270       280       290       300

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE0 RNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..:::::::::.::: .:::::
CCDS73 RNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREH
              310       320       330       340       350       360

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE0 QISPGDFPNLKRMQDQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPI
       ::::::::.:..::. ::.::::::: :: :::..::::::.:::.:::.::::::  : 
CCDS73 QISPGDFPSLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPS
              370       380       390       400       410       420

        410       420       430       440       450       460      
pF1KE0 QMVKGGAFEGTLHGPFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGAN
       :.::::::.::..:::::::::::::::::.::::..::: :::::::::::.:::::::
CCDS73 QVVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGAN
              430       440       450       460       470       480

        470       480       490       500       510       520      
pF1KE0 AKKEMVRSKLPNSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLL
       ::::::.:::::.::::::::::.::::.:::.::::::::::::::::::: .:: ::.
CCDS73 AKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLV
              490       500       510       520       530       540

        530     
pF1KE0 PPSKRKVAE
       :::::.   
CCDS73 PPSKRRHE 
                

>>CCDS10081.1 EHD4 gene_id:30844|Hs108|chr15              (541 aa)
 initn: 2751 init1: 2719 opt: 2748  Z-score: 2983.2  bits: 561.7 E(32554): 7.6e-160
Smith-Waterman score: 2748; 75.3% identity (90.7% similar) in 535 aa overlap (1-532:1-535)

                 10         20        30        40        50       
pF1KE0 MFSWLGTD--DRRRKD-PEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDN
       ::::.: .   :.:    .. :::. ::..::  :.::::: ::::::::::::::::.:
CCDS10 MFSWMGRQAGGRERAGGADAVQTVTGGLRSLYLRKVLPLEEAYRFHEFHSPALEDADFEN
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE0 KPMVLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVD
       :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. ::  ::::::::
CCDS10 KPMILLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMYGETEGSTPGNALVVD
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE0 PKKPFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEW
       ::::::::. :::::::::.:.:::: ::.::::::.:::::::::::::::::  ::.:
CCDS10 PKKPFRKLSRFGNAFLNRFMCSQLPNQVLKSISVIDSPGILSGEKQRISRGYDFCQVLQW
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE0 FAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALM
       :::::::::::::::::::::::::.:::.....::.:::::::::..::::::::::::
CCDS10 FAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEAIKAFRGQDDKIRVVLNKADQVDTQQLMRVYGALM
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE0 WSLGKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDL
       :::::..:::::.::::::::..::   :::.::::: :::::::::::..::.::::::
CCDS10 WSLGKVINTPEVLRVYIGSFWAQPLQNTDNRRLFEAEAQDLFRDIQSLPQKAAVRKLNDL
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE0 IKRARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLK
       ::::::::::::::: :::::::::::.:::.::.. : ::: ...::.::: ::::..:
CCDS10 IKRARLAKVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKRELISRLPEIYIQLQREYQISAGDFPEVK
              310       320       330       340       350       360

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE0 RMQDQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGT
        ::.::.  ::.::. :: ::.:.::.::.. :. :: :. :::.. : :.:.::::.::
CCDS10 AMQEQLENYDFTKFHSLKPKLIEAVDNMLSNKISPLMNLISQEETSTPTQLVQGGAFDGT
              370       380       390       400       410       420

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE0 LHGPFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLP
        .:::..:::::: :: :. :::::.:::.:::.::::::..:::.:.::::::: ::::
CCDS10 TEGPFNQGYGEGAKEGADEEEWVVAKDKPVYDELFYTLSPINGKISGVNAKKEMVTSKLP
              430       440       450       460       470       480

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE0 NSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE  
       :::::::::::: : :::::..:::::.::::.::.:.:::. :: ::.:::.::     
CCDS10 NSVLGKIWKLADCDCDGMLDEEEFALAKHLIKIKLDGYELPSSLPPHLVPPSHRKSLPKA
              490       500       510       520       530       540

CCDS10 D
        

>>CCDS12704.1 EHD2 gene_id:30846|Hs108|chr19              (543 aa)
 initn: 2602 init1: 2142 opt: 2608  Z-score: 2831.4  bits: 533.6 E(32554): 2.2e-151
Smith-Waterman score: 2608; 71.7% identity (89.0% similar) in 537 aa overlap (1-532:1-537)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
       :::::     : ..::...::. .::.::..:::::::::::  ::::::::::::.:::
CCDS12 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
       ::..::::::::.::.:::::. :: :.::::::: :.:::.:: :: .::::::::: :
CCDS12 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
       :::::: :::.:::::.:::::: ::::::.::::::::: :::.:::::: :::.::::
CCDS12 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
       ::: ::::::::::.:::::::.: ::..::::.::::::::..::::::::::::::.:
CCDS12 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
       ::.:.::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::::::.:::.:::::::::.::
CCDS12 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
       :::..::::::: :::::::::::.::::.:. .:  :...:. ::.:::::::. ..::
CCDS12 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
       . :.:.::.::. :: ::::..:.::.::::.:: :.:::: .     :.:::::::  :
CCDS12 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGTHMG
              370       380       390       400       410       420

                  430        440       450       460       470     
pF1KE0 PF---GHGYG-EGAGEGIDD-AEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSK
       ::   :   . : . :: :: :::::..::  ::::::.:.:.:::..:..::  :: .:
CCDS12 PFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGTK
              430       440       450       460       470       480

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE0 LPNSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
       :::::::.::::.:.:.::::::.:::::.:::..::::: :: .:: .:.:::::.   
CCDS12 LPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHKG
              490       500       510       520       530       540

CCDS12 SAE
          

>>CCDS81943.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16                (431 aa)
 initn: 551 init1: 385 opt: 755  Z-score: 823.3  bits: 161.7 E(32554): 1.5e-39
Smith-Waterman score: 755; 33.9% identity (69.6% similar) in 375 aa overlap (13-377:6-377)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
                   :  . ...: . :.:.:.:.. :::. :...:...  . :... .:::
CCDS81        MLNEDKPSDDYSAVLQRLRKIYHSSIKPLEQSYKYNELRQHEITDGEITSKPM
                      10        20        30        40        50   

               70          80        90       100       110        
pF1KE0 VLLVGQYSTGKTTFIRYLL--EQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDP
       ::..: .:.::.:.: :::  :.    .  : ::::. : ..:.:     : : ....: 
CCDS81 VLFLGPWSVGKSTMINYLLGLENTRYQLYTGAEPTTSEFTVLMHGPKLKTIEGIVMAADS
            60        70        80        90       100       110   

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE0 KKPFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWF
        . :  :. ::. ::....  ..:. .:: .. .:::::. ..::.  ::: :  : .::
CCDS81 ARSFSPLEKFGQNFLEKLIGIEVPHKLLERVTFVDTPGIIENRKQQ-ERGYPFNDVCQWF
           120       130       140       150        160       170  

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE0 AERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMW
        .:.: :...::  :::.. :.  ... ::..:...:..:::::.. ::.::::::::.:
CCDS81 IDRADLIFVVFDPTKLDVGLELEMLFRQLKGRESQIRIILNKADNLATQMLMRVYGALFW
            180       190       200       210       220       230  

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 SLGKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLI
       ::. ..:. :  :::..::: .      ...::  :: .:..:.... .:    :.  . 
CCDS81 SLAPLINVTEPPRVYVSSFWPQEYKPDTHQELFLQEEISLLEDLNQVIENRLENKIAFIR
            240       250       260       270       280       290  

      300       310           320         330         340       350
pF1KE0 KRARLAKVHAYIIS----SLKKEMPSVFGKDNKK--KELVNNLAE--IYGRIEREHQISP
       ..:  ...:: ...    . : .:  .: .:..   :..:..  .  :.  :  . ..: 
CCDS81 QHAIRVRIHALLVDRYLQTYKDKM--TFFSDGELVFKDIVEDPDKFYIFKTILAKTNVSK
            300       310         320       330       340       350

              360       370       380       390       400       410
pF1KE0 GDFPNLKRMQDQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVK
        :.:: . ..: .  . .:.:. :...                                 
CCDS81 FDLPNREAYKDFFGINPISSFKLLSQQCSYMGGCFLEKIERAITQELPGLLGSLGLGKNP
              360       370       380       390       400       410

>>CCDS42113.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16                (473 aa)
 initn: 551 init1: 385 opt: 755  Z-score: 822.8  bits: 161.8 E(32554): 1.7e-39
Smith-Waterman score: 755; 33.9% identity (69.6% similar) in 375 aa overlap (13-377:48-419)

                                 10        20        30        40  
pF1KE0                   MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRF
                                     :  . ...: . :.:.:.:.. :::. :..
CCDS42 GQAEETEDANEEAPLRDRSHIEKTLMLNEDKPSDDYSAVLQRLRKIYHSSIKPLEQSYKY
        20        30        40        50        60        70       

             50        60        70          80        90       100
pF1KE0 HEFHSPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRYLL--EQDFPGMRIGPEPTTDSFIAV
       .:...  . :... .:::::..: .:.::.:.: :::  :.    .  : ::::. : ..
CCDS42 NELRQHEITDGEITSKPMVLFLGPWSVGKSTMINYLLGLENTRYQLYTGAEPTTSEFTVL
        80        90       100       110       120       130       

              110       120       130       140       150       160
pF1KE0 MQGDMEGIIPGNALVVDPKKPFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSG
       :.:     : : ....:  . :  :. ::. ::....  ..:. .:: .. .:::::. .
CCDS42 MHGPKLKTIEGIVMAADSARSFSPLEKFGQNFLEKLIGIEVPHKLLERVTFVDTPGIIEN
       140       150       160       170       180       190       

              170       180       190       200       210       220
pF1KE0 EKQRISRGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNK
       .::.  ::: :  : .:: .:.: :...::  :::.. :.  ... ::..:...:..:::
CCDS42 RKQQ-ERGYPFNDVCQWFIDRADLIFVVFDPTKLDVGLELEMLFRQLKGRESQIRIILNK
       200        210       220       230       240       250      

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 ADQIETQQLMRVYGALMWSLGKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFR
       ::.. ::.::::::::.:::. ..:. :  :::..::: .      ...::  :: .:..
CCDS42 ADNLATQMLMRVYGALFWSLAPLINVTEPPRVYVSSFWPQEYKPDTHQELFLQEEISLLE
        260       270       280       290       300       310      

              290       300       310           320         330    
pF1KE0 DIQSLPRNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIIS----SLKKEMPSVFGKDNKK--KELVNN
       :.... .:    :.  . ..:  ...:: ...    . : .:  .: .:..   :..:..
CCDS42 DLNQVIENRLENKIAFIRQHAIRVRIHALLVDRYLQTYKDKM--TFFSDGELVFKDIVED
        320       330       340       350         360       370    

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE0 LAE--IYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQDQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQ
         .  :.  :  . ..:  :.:: . ..: .  . .:.:. :...               
CCDS42 PDKFYIFKTILAKTNVSKFDLPNREAYKDFFGINPISSFKLLSQQCSYMGGCFLEKIERA
          380       390       400       410       420       430    

            400       410       420       430       440       450  
pF1KE0 LMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHGPFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIF
                                                                   
CCDS42 ITQELPGLLGSLGLGKNPGALNCDKTGCSETPKNRYRKH                     
          440       450       460       470                        

>>CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1                 (896 aa)
 initn: 350 init1: 322 opt: 332  Z-score: 360.3  bits: 77.1 E(32554): 9.6e-14
Smith-Waterman score: 332; 48.1% identity (72.1% similar) in 104 aa overlap (430-532:113-216)

     400       410       420       430       440        450        
pF1KE0 EESQRPIQMVKGGAFEGTLHGPFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVA-RDKPMYDEIFYTLSPV
                                     .: .  .  :.:  .::  :: :: .::::
CCDS55 AQNGLEVSLSSLNLAVPPPRFHDTSSPLLISGTSAAELPWAVKPEDKAKYDAIFDSLSPV
             90       100       110       120       130       140  

      460       470       480       490       500       510        
pF1KE0 DGKITGANAKKEMVRSKLPNSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELP
       .: ..: ..:  .. :::: ..::..:.:.:::.::::: ::::.:  :.   :: . .:
CCDS55 NGFLSGDKVKPVLLNSKLPVDILGRVWELSDIDHDGMLDRDEFAVAMFLVYCALEKEPVP
            150       160       170       180       190       200  

      520       530                                                
pF1KE0 NELPAHLLPPSKRKVAE                                           
         ::  :.::::::                                              
CCDS55 MSLPPALVPPSKRKTWVVSPAEKAKYDEIFLKTDKDMDGFVSGLEVREIFLKTGLPSTLL
            210       220       230       240       250       260  

>>CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19           (601 aa)
 initn: 314 init1: 314 opt: 327  Z-score: 357.2  bits: 76.0 E(32554): 1.4e-13
Smith-Waterman score: 327; 49.0% identity (75.5% similar) in 98 aa overlap (436-532:118-215)

         410       420       430       440        450       460    
pF1KE0 IQMVKGGAFEGTLHGPFGHGYGEGAGEGIDDAEWVV-ARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITG
                                     .:.:.: ...:  .: :: .: :..: ..:
CCDS59 EVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSG
        90       100       110       120       130       140       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KE0 ANAKKEMVRSKLPNSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAH
        ..:  .. :::: .:::..: :.:::::: :: ::::.: ::.   :: . .:. ::  
CCDS59 DKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPS
       150       160       170       180       190       200       

          530                                                      
pF1KE0 LLPPSKRKVAE                                                 
       :.::::::                                                    
CCDS59 LIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTV
       210       220       230       240       250       260       

>>CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19           (754 aa)
 initn: 314 init1: 314 opt: 327  Z-score: 355.9  bits: 76.1 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 327; 49.0% identity (75.5% similar) in 98 aa overlap (436-532:118-215)

         410       420       430       440        450       460    
pF1KE0 IQMVKGGAFEGTLHGPFGHGYGEGAGEGIDDAEWVV-ARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITG
                                     .:.:.: ...:  .: :: .: :..: ..:
CCDS58 EVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSG
        90       100       110       120       130       140       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KE0 ANAKKEMVRSKLPNSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAH
        ..:  .. :::: .:::..: :.:::::: :: ::::.: ::.   :: . .:. ::  
CCDS58 DKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPS
       150       160       170       180       190       200       

          530                                                      
pF1KE0 LLPPSKRKVAE                                                 
       :.::::::                                                    
CCDS58 LIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTV
       210       220       230       240       250       260       




535 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Fri Nov  4 03:30:16 2016 done: Fri Nov  4 03:30:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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