seq1 = pF1KE0079.tfa, 1848 bp
seq2 = pF1KE0079/gi568815580f_62248166.tfa (gi568815580f:62248166_62485031), 236866 bp

>pF1KE0079 1848
>gi568815580f:62248166_62485031 (Chr18)

1-75  (77188-77262)   100% ->
76-157  (100003-100084)   100% ->
158-283  (101647-101772)   100% ->
284-427  (106226-106369)   100% ->
428-521  (110083-110176)   100% ->
522-616  (111790-111884)   100% ->
617-730  (113515-113628)   100% ->
731-783  (118543-118595)   100% ->
784-1567  (120536-121319)   100% ->
1568-1848  (136586-136866)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCCGCGCGCCCGGCGGCGCCGCCCGCTGTTCGCGCTGCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  77188 ATGGCCCCGCGCGCCCGGCGGCGCCGCCCGCTGTTCGCGCTGCTGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCGCGCTGCTCGCCCGGCTGCAG         GTGGCTTTGCAGATCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  77238 CTGCGCGCTGCTCGCCCGGCTGCAGGTA...CAGGTGGCTTTGCAGATCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCCTCCATGTACCAGTGAGAAGCATTATGAGCATCTGGGACGGTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 CTCCTCCATGTACCAGTGAGAAGCATTATGAGCATCTGGGACGGTGCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACAAATGTGAACCAG         GAAAGTACATGTCTTCTAAATGCAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100069 AACAAATGTGAACCAGGTA...AAGGAAAGTACATGTCTTCTAAATGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TACTACCTCTGACAGTGTATGTCTGCCCTGTGGCCCGGATGAATACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101672 TACTACCTCTGACAGTGTATGTCTGCCCTGTGGCCCGGATGAATACTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATAGCTGGAATGAAGAAGATAAATGCTTGCTGCATAAAGTTTGTGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101722 ATAGCTGGAATGAAGAAGATAAATGCTTGCTGCATAAAGTTTGTGATACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 G         GCAAGGCCCTGGTGGCCGTGGTCGCCGGCAACAGCACGAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101772 GGTG...CAGGCAAGGCCCTGGTGGCCGTGGTCGCCGGCAACAGCACGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCCCGGCGCTGCGCGTGCACGGCTGGGTACCACTGGAGCCAGGACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106266 CCCCCGGCGCTGCGCGTGCACGGCTGGGTACCACTGGAGCCAGGACTGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGTGCTGCCGCCGCAACACCGAGTGCGCGCCGGGCCTGGGCGCCCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106316 AGTGCTGCCGCCGCAACACCGAGTGCGCGCCGGGCCTGGGCGCCCAGCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCGT         TGCAGCTCAACAAGGACACAGTGTGCAAACCTTGCCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106366 CCGTGTA...CAGTGCAGCTCAACAAGGACACAGTGTGCAAACCTTGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGCAGGCTACTTCTCTGATGCCTTTTCCTCCACGGACAAATGCAGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110120 TGCAGGCTACTTCTCTGATGCCTTTTCCTCCACGGACAAATGCAGACCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGACCAA         CTGTACCTTCCTTGGAAAGAGAGTAGAACATCAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110170 GGACCAAGTA...CAGCTGTACCTTCCTTGGAAAGAGAGTAGAACATCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGGACAGAGAAATCCGATGCGGTTTGCAGTTCTTCTCTGCCAGCTAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111824 GGGACAGAGAAATCCGATGCGGTTTGCAGTTCTTCTCTGCCAGCTAGAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACCACCAAATG         AACCCCATGTTTACTTGCCCGGTTTAATAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 111874 ACCACCAAATGGTA...CAGAACCCCATGTTTACTTGCCCGGTTTAATAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTCTGCTTCTCTTCGCGTCTGTGGCCCTGGTGGCTGCCATCATCTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113545 TTCTGCTTCTCTTCGCGTCTGTGGCCCTGGTGGCTGCCATCATCTTTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTTTGCTATAGGAAAAAAGGGAAAGCACTCACAG         CTAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 113595 GTTTGCTATAGGAAAAAAGGGAAAGCACTCACAGGTA...TAGCTAATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GTGGCACTGGATCAATGAGGCTTGTGGCCGCCTAAGTGGAGATAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 118550 GTGGCACTGGATCAATGAGGCTTGTGGCCGCCTAAGTGGAGATAAGGTA.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    784      GAGTCCTCAGGTGACAGTTGTGTCAGTACACACACGGCAAACTTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118600 ..CAGGAGTCCTCAGGTGACAGTTGTGTCAGTACACACACGGCAAACTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GGTCAGCAGGGAGCATGTGAAGGTGTCTTACTGCTGACTCTGGAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120581 GGTCAGCAGGGAGCATGTGAAGGTGTCTTACTGCTGACTCTGGAGGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GACATTTCCAGAAGATATGTGCTACCCAGATCAAGGTGGTGTCTGTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120631 GACATTTCCAGAAGATATGTGCTACCCAGATCAAGGTGGTGTCTGTCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCACATGTGTAGGAGGTGGTCCCTACGCACAAGGCGAAGATGCCAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120681 GCACATGTGTAGGAGGTGGTCCCTACGCACAAGGCGAAGATGCCAGGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTCTCATTGGTCAGCAAGACCGAGATAGAGGAAGACAGCTTCAGACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120731 CTCTCATTGGTCAGCAAGACCGAGATAGAGGAAGACAGCTTCAGACAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCCCACAGAAGATGAATACATGGACAGGCCCTCCCAGCCCACAGACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120781 GCCCACAGAAGATGAATACATGGACAGGCCCTCCCAGCCCACAGACCAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TACTGTTCCTCACTGAGCCTGGAAGCAAATCCACACCTCCTTTCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120831 TACTGTTCCTCACTGAGCCTGGAAGCAAATCCACACCTCCTTTCTCTGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CCCCTGGAGGTGGGGGAGAATGACAGTTTAAGCCAGTGCTTCACGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120881 CCCCTGGAGGTGGGGGAGAATGACAGTTTAAGCCAGTGCTTCACGGGGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ACAGAGCACAGTGGGTTCAGAAAGCTGCAACTGCACTGAGCCCCTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120931 ACAGAGCACAGTGGGTTCAGAAAGCTGCAACTGCACTGAGCCCCTGTGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GGACTGATTGGACTCCCATGTCCTCTGAAAACTACTTGCAAAAAGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120981 GGACTGATTGGACTCCCATGTCCTCTGAAAACTACTTGCAAAAAGAGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GACAGTGGCCATTGCCCGCACTGGGCAGCCAGCCCCAGCCCCAACTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121031 GACAGTGGCCATTGCCCGCACTGGGCAGCCAGCCCCAGCCCCAACTGGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AGATGTCTGCACAGGCTGCCGGAACCCTCCTGGGGAGGACTGTGAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121081 AGATGTCTGCACAGGCTGCCGGAACCCTCCTGGGGAGGACTGTGAACCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TCGTGGGTTCCCCAAAACGTGGACCCTTGCCCCAGTGCGCCTATGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121131 TCGTGGGTTCCCCAAAACGTGGACCCTTGCCCCAGTGCGCCTATGGCATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GGCCTTCCCCCTGAAGAAGAAGCCAGCAGGACGGAGGCCAGAGACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121181 GGCCTTCCCCCTGAAGAAGAAGCCAGCAGGACGGAGGCCAGAGACCAGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CGAGGATGGGGCTGATGGGAGGCTCCCAAGCTCAGCGAGGGCAGGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121231 CGAGGATGGGGCTGATGGGAGGCTCCCAAGCTCAGCGAGGGCAGGTGCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GGTCTGGAAGCTCCCCTGGTGGCCAGTCCCCTGCATCTG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 121281 GGTCTGGAAGCTCCCCTGGTGGCCAGTCCCCTGCATCTGGTA...CAGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 AATGTGACTGGAAACAGTAACTCCACGTTCATCTCCAGCGGGCAGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136588 AATGTGACTGGAAACAGTAACTCCACGTTCATCTCCAGCGGGCAGGTGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GAACTTCAAGGGCGACATCATCGTGGTCTACGTCAGCCAGACCTCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136638 GAACTTCAAGGGCGACATCATCGTGGTCTACGTCAGCCAGACCTCGCAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 AGGGCGCGGCGGCGGCTGCGGAGCCCATGGGCCGCCCGGTGCAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136688 AGGGCGCGGCGGCGGCTGCGGAGCCCATGGGCCGCCCGGTGCAGGAGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 ACCCTGGCGCGCCGAGACTCCTTCGCGGGGAACGGCCCGCGCTTCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136738 ACCCTGGCGCGCCGAGACTCCTTCGCGGGGAACGGCCCGCGCTTCCCGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 CCCGTGCGGCGGCCCCGAGGGGCTGCGGGAGCCGGAGAAGGCCTCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136788 CCCGTGCGGCGGCCCCGAGGGGCTGCGGGAGCCGGAGAAGGCCTCGAGGC

   1900     .    :    .    :    .
   1820 CGGTGCAGGAGCAAGGCGGGGCCAAGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 136838 CGGTGCAGGAGCAAGGCGGGGCCAAGGCT