Result of FASTA (ccds) for pF1KE0067
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0067, 1447 aa
  1>>>pF1KE0067 1447 - 1447 aa - 1447 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1566+/-0.00144; mu= -3.1872+/- 0.086
 mean_var=403.2515+/-82.518, 0's: 0 Z-trim(109.5): 178  B-trim: 5 in 1/52
 Lambda= 0.063868
 statistics sampled from 10789 (10956) to 10789 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.337), width:  16
 Scan time:  5.820

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18           (1447) 9662 906.5       0
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1461) 4874 465.3 5.8e-130
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1408) 4470 428.1  9e-119
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1450) 4279 410.5 1.8e-113
CCDS34590.1 SDK1 gene_id:221935|Hs108|chr7         (2213)  965 105.3 2.1e-21
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1912)  791 89.2 1.3e-16
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7          (1192)  763 86.4 5.4e-16
CCDS75652.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7          (1211)  763 86.4 5.4e-16
CCDS47686.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7          (1304)  763 86.5 5.7e-16
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1948)  732 83.8 5.5e-15
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX          (1248)  721 82.6 8.1e-15
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX          (1253)  721 82.6 8.1e-15
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX          (1257)  721 82.6 8.1e-15
CCDS10206.1 IGDCC4 gene_id:57722|Hs108|chr15       (1250)  691 79.8 5.5e-14
CCDS77788.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3           (1115)  686 79.3   7e-14
CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3          (1171)  671 78.0 1.9e-13
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7           (1183)  671 78.0 1.9e-13
CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3          (1208)  671 78.0 1.9e-13
CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3           (1224)  671 78.0 1.9e-13
CCDS2971.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3            (1114)  665 77.4 2.7e-13
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1496)  666 77.6 3.1e-13
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1502)  658 76.9 5.2e-13
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3          (1378)  648 75.9 9.2e-13
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3          (1394)  648 75.9 9.3e-13
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9           (1505)  648 75.9 9.8e-13
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1506)  648 75.9 9.8e-13
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11        (1386)  614 72.8 8.1e-12
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1898)  612 72.7 1.2e-11
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1         (1240)  595 71.0 2.5e-11
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11        (1026)  588 70.3 3.4e-11
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1651)  593 70.9 3.5e-11
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11        (1100)  588 70.3 3.6e-11
CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15        (1150)  586 70.1 4.2e-11
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1907)  588 70.5 5.3e-11
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1910)  587 70.4 5.7e-11
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1505)  584 70.0 5.8e-11


>>CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18                (1447 aa)
 initn: 9662 init1: 9662 opt: 9662  Z-score: 4831.1  bits: 906.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9662; 100.0% identity (100.0% similar) in 1447 aa overlap (1-1447:1-1447)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MENSLRCVWVPKLAFVLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNVLLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MENSLRCVWVPKLAFVLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNVLLD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 CSAESDRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQCEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CSAESDRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQCEAS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQQDL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 TPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLHRQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLHRQL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 YFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRSKKYSLLGGSNLLISNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRSKKYSLLGGSNLLISNV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 TDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 TVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLIVPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLIVPKP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 AIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTFTVFFSREGDNRERALNTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTFTVFFSREGDNRERALNTT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 QPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 PTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYSLRFLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYSLRFLA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 YNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 RHRKTTRRGEMETLEPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTAETPENDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RHRKTTRRGEMETLEPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTAETPENDL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 DESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYIIGYGVGSPYAETVRVDSKQRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYIIGYGVGSPYAETVRVDSKQRY
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 YSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSVPDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSVPDL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 STPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTSEVRLYTVRWRTSFSASAKYKSEDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 STPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTSEVRLYTVRWRTSFSASAKYKSEDT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 TSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTVITREGKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTVITREGKP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 RAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLNLDTMYYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLNLDTMYYF
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE0 RIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRSTLNEPPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRSTLNEPPI
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE0 GQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLVVVIVAVICTRRSSAQQRKKRATHSAGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLVVVIVAVICTRRSSAQQRKKRATHSAGK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE0 RKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPSGTDPAGRDSPIQSCQDLTPVSHSQSETQLGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPSGTDPAGRDSPIQSCQDLTPVSHSQSETQLGS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE0 KSTSHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARRAPRAKLMIPMDAQSNNPAVVSAIPVPTLESAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KSTSHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARRAPRAKLMIPMDAQSNNPAVVSAIPVPTLESAQ
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE0 YPGILPSPTCGYPHPQFTLRPVPFPTLSVDRGFGAGRSQSVSEGPTTQQPPMLPPSQPEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YPGILPSPTCGYPHPQFTLRPVPFPTLSVDRGFGAGRSQSVSEGPTTQQPPMLPPSQPEH
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE0 SSSEEAPSRTIPTACVRPTHPLRSFANPLLPPPMSAIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSSEEAPSRTIPTACVRPTHPLRSFANPLLPPPMSAIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVK
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE0 TASLGLAGKARSPLLPVSVPTAPEVSEESHKPTEDSANVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TASLGLAGKARSPLLPVSVPTAPEVSEESHKPTEDSANVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLN
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

              
pF1KE0 AITGSAF
       :::::::
CCDS11 AITGSAF
              

>>CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15               (1461 aa)
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pF1KE0    MENSLRCVWVPKLAFVLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNV
                                     :  : .:..:: . :: :: :....::..:
CCDS10 LSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPVDTLSVRGSSV
               20        30        40        50        60        70

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pF1KE0 LLDCSAESDRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQC
       .:.::: :. . : :.:::::  : :  :.:.: : .:::.:.:..::.:.::::: :::
CCDS10 ILNCSAYSEPS-PKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLPDGSLFISNVVHSKHNKPDEGYYQC
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pF1KE0 EASLGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQ
        :.. . :.:::::::. :::  :: :: :  ... :....:.::: .. .: ..:..:.
CCDS10 VATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLVPFVRWEQNR
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pF1KE0 QDLTPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLH
       :   :.  :.::. :::: : ::    :: :.::: ... .  . ..:.:...: :: . 
CCDS10 Q---PLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVLPDPEVI
     190          200       210       220       230       240      

       240       250       260       270       280        290      
pF1KE0 RQLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRS-KKYSLLGGSNLL
        .: ::..:: .: . :.:.:: : .:: : :.. :...::... .: ..  ::.:..: 
CCDS10 SDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLLAGGSLE
        250       260       270       280       290       300      

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pF1KE0 ISNVTDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSG
       ::.::.::.: : :..   ::.: :.::::: . : ::..:.:.::.::::: ::: :.:
CCDS10 ISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVFECEVTG
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pF1KE0 KPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLI
       ::.:::.:.::::.:::::::.::   ::..::.::::::::::.:::..::::..::::
CCDS10 KPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQAGAQLI
        370       380       390       400       410       420      

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pF1KE0 VPKPAIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPA-EAKGNIQTFTVFFSREGDNRER
       . . :  ... :::::::::  :::.::..:.:: :: . .:.  :..::...::  :::
CCDS10 ILEHAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARER
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pF1KE0 ALNTTQPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQ
       . ::..:: .:.:. :: : ..: :::.: :. : :::: :..: ::::.:.:::. ::.
CCDS10 VENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLR
        490       500       510       520       530       540      

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pF1KE0 AVSTSPTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYS
       : ..::::: .::: :. .:: .:.:.:.  : .: :::...:.. :: ..::::.::::
CCDS10 AYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKGTDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYS
        550       560       570       580       590       600      

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pF1KE0 LRFLAYNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFI
       .: .:::..:::::: :..: :::::::: :::.:::: ::.:: . : ::  .:::: :
CCDS10 FRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNLSLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQI
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pF1KE0 TGYKIRHRKTTRRGEM-ETL-EPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTA
       ::::::.::..:.... :::   ..:  :. ::..:..:.:.:.:.:.::::: ..: .:
CCDS10 TGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLDRGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSA
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pF1KE0 ETPENDLDESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYIIGYGVGSPYAETVR
       :: :.::::..::. :::::::: .. :..::::: : ::::::: ::::.:::.:.:..
CCDS10 ETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTPPENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIK
        730       740       750       760       770       780      

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pF1KE0 VDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDF
       :: :::::.:: :. ::::::.::::::.:::.::::::.::  :: :. :: . ...  
CCDS10 VDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPLYESAVTRPHTD-TSEVDLF-VINAP
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pF1KE0 PTSVPDLSTPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTSEVRLYTVRWRTSFSASA
        : :::  :::.:::::::  :.::..:..:::::.::.:: .. : :::::.:.. :..
CCDS10 YTPVPD-PTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLPKHQKITDSRYYTVRWKTNIPANT
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pF1KE0 KYKSEDTTSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTV
       :::. ..:.::: .:::::::.:::::::::.:::::::::::.::.: .::: :::.::
CCDS10 KYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSSTWSMTAHGTTFELVPTSPPKDVTV
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pF1KE0 ITREGKPRAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLN
       ...::::...::.:::: :::::::.::..:. : :  : ::..: . :.::::::..:.
CCDS10 VSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNAEIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELT
           970       980       990      1000      1010      1020   

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pF1KE0 LDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRS
       ::: :::.::::::::.::.:. . ::: :..  ::: :::.  :.::     . : : .
CCDS10 LDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKADSSDKMPNDQAS-GSGGK---GSRLPDLG
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pF1KE0 TLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLVVVIVAVICTRRSSAQQRKKR
       .  .::..  . :::: :   .::.:..:.:.:::::..::::.::.::::....:.:::
CCDS10 SDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVFCTRRTTSHQKKKR
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

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pF1KE0 AT----HSAGKRKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPSGTDPAGRDSPI-QSCQDLTP
       :.    ... : ::..::..:::::::::..:.: :.:    .:   :.:: .. ::.::
CCDS10 AACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPDPNPIMTDTPIPRNSQDITP
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pF1KE0 VSHSQSETQLGSKSTSHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARRAPRAKLMIPMDAQSNNPAVV
       :..:. .... .. .:. :...:.   :::::    :.::. : :.:.:.:.:  .: :.
CCDS10 VDNSM-DSNIHQRRNSYRGHESED---SMSTL----AGRRGMRPKMMMPFDSQPPQP-VI
    1200       1210      1220             1230      1240       1250

     1250      1260         1270       1280        1290      1300  
pF1KE0 SAIPVPTLESAQY---PGILPSPTCGY-PHPQFTLRPVPFPT-LSV-DRGFGAGRSQSVS
       :: :. .:.. ..    . : ::. ..  ::     : :. : .:. ::   :. ..:: 
CCDS10 SAHPIHSLDNPHHHFHSSSLASPARSHLYHPG---SPWPIGTSMSLSDR---ANSTESVR
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pF1KE0 EGPTT---------------QQPPMLPPSQPEHSSSEEAPSRTIPTACVRPTHPLRSFAN
       . :.:               :.:     :.   ::.::  ....::: :::.:::.::: 
CCDS10 NTPSTDTMPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLKSFAV
         1310      1320      1330      1340      1350      1360    

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pF1KE0 PLLPPPMS-AIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVKTASLGLAGKARSPLLPVSVPTAPEVS
       : .:::   . .: .: :::::: . .     :::::.:  :..: :. :: ::.:::: 
CCDS10 PAIPPPGPPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPM-PVVVPSAPEV-
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       1410      1420      1430      1440       
pF1KE0 EESHKPTEDSANVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLNAITGSAF
       .:. .  ::: . :: :.:...:: ::::::.:::::    
CCDS10 QETTRMLEDSESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA  
           1430      1440      1450      1460   

>>CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15               (1408 aa)
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pF1KE0    MENSLRCVWVPKLAFVLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNV
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CCDS53 LSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPVDTLSVRGSSV
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pF1KE0 LLDCSAESDRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQC
       .:.::: :. . : :.:::::  : :  :.:.: : .:::.:.:..::.:.::::: :::
CCDS53 ILNCSAYSEPS-PKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLPDGSLFISNVVHSKHNKPDEGYYQC
               80         90       100       110       120         

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pF1KE0 EASLGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQ
        :.. . :.:::::::. :::  :: :: :  ... :....:.::: .. .: ..:..:.
CCDS53 VATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLVPFVRWEQNR
     130       140       150       160       170       180         

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pF1KE0 QDLTPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLH
       :   :.  :.::. :::: : ::    :: :.::: ... .  . ..:.:...: :: . 
CCDS53 Q---PLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVLPDPEVI
     190          200       210       220       230       240      

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pF1KE0 RQLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRS-KKYSLLGGSNLL
        .: ::..:: .: . :.:.:: : .:: : :.. :...::... .: ..  ::.:..: 
CCDS53 SDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLLAGGSLE
        250       260       270       280       290       300      

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pF1KE0 ISNVTDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSG
       ::.::.::.: : :..   ::.: :.::::: . : ::..:.:.::.::::: ::: :.:
CCDS53 ISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVFECEVTG
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pF1KE0 KPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLI
       ::.:::.:.::::.:::::::.::   ::..::.::::::::::.:::..::::..::::
CCDS53 KPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQAGAQLI
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pF1KE0 VPKPAIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPA-EAKGNIQTFTVFFSREGDNRER
       . . :  ... :::::::::  :::.::..:.:: :: . .:.  :..::...::  :::
CCDS53 ILEHAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARER
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pF1KE0 ALNTTQPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQ
       . ::..:: .:.:. :: : ..: :::.: :. : :::: :..: ::::.:.:::. ::.
CCDS53 VENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLR
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pF1KE0 AVSTSPTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYS
       : ..::::: .::: :. .:: .:.:.:.  : .: :::...:.. :: ..::::.::::
CCDS53 AYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKGTDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYS
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pF1KE0 LRFLAYNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFI
       .: .:::..:::::: :..: :::::::: :::.:::: ::.:: . : ::  .:::: :
CCDS53 FRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNLSLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQI
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pF1KE0 TGYKIRHRKTTRRGEM-ETL-EPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTA
       ::::::.::..:.... :::   ..:  :. ::..:..:.:.:.:.:.::::: ..: .:
CCDS53 TGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLDRGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSA
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pF1KE0 ETPENDLDESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYIIGYGVGSPYAETVR
       :: :.::::..::. :::::::: .. :..::::: : ::::::: ::::.:::.:.:..
CCDS53 ETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTPPENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIK
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pF1KE0 VDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDF
       :: :::::.:: :. ::::::.::::::.:::.::::::.::  :: :. :: . ...  
CCDS53 VDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPLYESAVTRPHTD-TSEVDLF-VINAP
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CCDS53 YTPVPD-PTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLPKHQKITDSRYYTVRWKTNIPANT
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       :::. ..:.::: .:::::::.:::::::::.:::::::::::.::.: .::: :::.::
CCDS53 KYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSSTWSMTAHGTTFELVPTSPPKDVTV
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pF1KE0 ITREGKPRAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLN
       ...::::...::.:::: :::::::.::..:. : :  : ::..: . :.::::::..:.
CCDS53 VSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNAEIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELT
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CCDS53 SDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVFCTRRTTSHQKKKR
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       :.    ... : ::..::..:::::::::..:.: :.:    .:   :.:: .. ::.::
CCDS53 AACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPDPNPIMTDTPIPRNSQDITP
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       :..:. .... .. .:. :...:.   :::::    :.::. : :.:.:.:.:       
CCDS53 VDNSM-DSNIHQRRNSYRGHESED---SMSTL----AGRRGMRPKMMMPFDSQ-------
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pF1KE0 SAIPVPTLESAQYPGILPSPTCGYPHPQFTLRPVPFPTLSVDRGFGAGRSQSVSEGPTTQ
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CCDS53 -----------------P--------PQQSVRNTP----STDT-MPASSSQTCCTDH--Q
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       .:     :.   ::.::  ....::: :::.:::.::: : .:::   . .: .: ::::
CCDS53 DPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLKSFAVPAIPPPGPPTYDPALPSTPLL
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       :: . .     :::::.:  :..: :. :: ::.:::: .:. .  ::: . :: :.:..
CCDS53 SQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPM-PVVVPSAPEV-QETTRMLEDSESSYEPDELTK
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       .:: ::::::.:::::    
CCDS53 EMAHLEGLMKDLNAITTA  
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>>CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15               (1450 aa)
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CCDS58 LSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPVDTLSVRGSSV
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pF1KE0 EASLGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQ
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CCDS58 VATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLVPFVRWEQNR
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CCDS58 Q---PLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVLPDPEVI
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pF1KE0 RQLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRS-KKYSLLGGSNLL
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CCDS58 SDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLLAGGSLE
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CCDS58 ISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVFECEVTG
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CCDS58 KPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQAGAQLI
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CCDS58 ILEHAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARER
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CCDS58 VENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLR
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CCDS58 ETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTPPENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIK
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pF1KE0 VDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDF
       :: :::::.:: :. ::::::.::::::.:::.::::::.::  :: :. :: . ...  
CCDS58 VDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPLYESAVTRPHTD-TSEVDLF-VINAP
        790       800       810       820       830         840    

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pF1KE0 PTSVPDLSTPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTSEVRLYTVRWRTSFSASA
        : :::  :::.:::::::  :.::..:..:::::.::.:: .. : :::::.:.. :..
CCDS58 YTPVPD-PTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLPKHQKITDSRYYTVRWKTNIPANT
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pF1KE0 KYKSEDTTSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTV
       :::. ..:.::: .:::::::.:::::::::.:::::::::::.::.: .::: :::.::
CCDS58 KYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSSTWSMTAHGTTFELVPTSPPKDVTV
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pF1KE0 ITREGKPRAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLN
       ...::::...::.:::: :::::::.::..:. : :  : ::..: . :.::::::..:.
CCDS58 VSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNAEIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELT
           970       980       990      1000      1010      1020   

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pF1KE0 LDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRS
       ::: :::.::::::::.::.:. . ::: :.         .:  : :.  :      : .
CCDS58 LDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKA---------SGSGGKGSRLP------DLG
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pF1KE0 TLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLVVVIVAVICTRRSSAQQRKKR
       .  .::..  . :::: :   .::.:..:.:.:::::..::::.::.::::....:.:::
CCDS58 SDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVFCTRRTTSHQKKKR
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pF1KE0 AT----HSAGKRKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPSGTDPAGRDSPI-QSCQDLTP
       :.    ... : ::..::..:::::::::..:.: :.:    .:   :.:: .. ::.::
CCDS58 AACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPDPNPIMTDTPIPRNSQDITP
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pF1KE0 VSHSQSETQLGSKSTSHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARRAPRAKLMIPMDAQSNNPAVV
       :..:. .... .. .:. :...:.   :::::    :.::. : :.:.:.:.:  .: :.
CCDS58 VDNSM-DSNIHQRRNSYRGHESED---SMSTL----AGRRGMRPKMMMPFDSQPPQP-VI
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pF1KE0 SAIPVPTLESAQY---PGILPSPTCGY-PHPQFTLRPVPFPT-LSV-DRGFGAGRSQSVS
       :: :. .:.. ..    . : ::. ..  ::     : :. : .:. ::   :. ..:: 
CCDS58 SAHPIHSLDNPHHHFHSSSLASPARSHLYHPG---SPWPIGTSMSLSDR---ANSTESVR
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pF1KE0 EGPTT---------------QQPPMLPPSQPEHSSSEEAPSRTIPTACVRPTHPLRSFAN
       . :.:               :.:     :.   ::.::  ....::: :::.:::.::: 
CCDS58 NTPSTDTMPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLKSFAV
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pF1KE0 PLLPPPMS-AIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVKTASLGLAGKARSPLLPVSVPTAPEVS
       : .:::   . .: .: :::::: . .     :::::.:  :..: :. :: ::.:::: 
CCDS58 PAIPPPGPPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPM-PVVVPSAPEV-
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pF1KE0 EESHKPTEDSANVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLNAITGSAF
       .:. .  ::: . :: :.:...:: ::::::.:::::    
CCDS58 QETTRMLEDSESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA  
            1420      1430      1440      1450  

>>CCDS34590.1 SDK1 gene_id:221935|Hs108|chr7              (2213 aa)
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          20        30        40        50         60        70    
pF1KE0 VLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGN-VLLDCSAESDRGVP--VI
                                     :..  .. :.. . :.: : : : :    .
CCDS34 GENKTSPFIHLSIARDVGTPETMAPTIVVPPGNRSVVAGSSETTLECIA-SARPVEDLSV
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pF1KE0 KWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQCEASLGDSGSIISR-T
        ::..:.... :.    ..:.     :.:   .     : : : :::.:  :.   .: :
CCDS34 TWKRNGVRITSGLHSFGRRLT-----ISNPTSA-----DTGPYVCEAALPGSAFEPARAT
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pF1KE0 AKVAVAGPLRFLSQTES-VTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQQDLTPIPGDSRVV
       : . .  :  : .. :: ..: . .:: . :...: :.::..: :.  ... .  . :  
CCDS34 AFLFIIEPPYFTAEPESRISAEVEETVDIGCQAMGVPLPTLQWYKDAISISRLQ-NPRYK
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pF1KE0 VLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLHRQLYFLQRPSNVV
       :: ::.:.:..:.: : ::..: : :      :.: ...   :   .    : ::: ...
CCDS34 VLASGGLRIQKLRPEDSGIFQCFASNE-----GGEIQTHTYLDV-TNIAPVFTQRPVDTT
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pF1KE0 AIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVI---QLRSKKYSLLGGSNLLISNVTDDDSGM
       . .:  :.:.: ::: : :..:: : ....   ..:  .. :: ...: :. :  .:.: 
CCDS34 VTDGMTAILRCEVSGAPKPAITWKRENHILASGSVRIPRFMLLESGGLQIAPVFIQDAGN
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pF1KE0 YTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVPTVN--WM
       ::: ..  . ...::: :::     ... : .  . ..    ..: ..  :  ..   : 
CCDS34 YTCYAANTEGSLNASATLTVWNRTSIVHPPEDHVVIKGTTATLHCGATHDPRVSLRYVWK
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pF1KE0 KNGDVVIPSDYFQIV---GGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLIVPKPAI
       :.. .. ::.  .::    :: : :  . ..: : :.:   .:.:: .  :.: : .   
CCDS34 KDNVALTPSSTSRIVVEKDGS-LLISQTWSGDIGDYSCEIVSEGGNDSRMARLEVIE---
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pF1KE0 PSSSVLPSAPRD--VVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTFTVFFSREGDNRERALNTT
            :: .:..  : :    :. : :::  : .... :  . : .:....  .  :...
CCDS34 -----LPHSPQNLLVSPNSSHSHAVVLSWVRPFDGNSPILYYIVELSENNSPWKVHLSNV
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pF1KE0 QPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTS
        :    .::..: :   : ::: : :: : :. :   .    ::    .: .:. : . .
CCDS34 GPEMTGVTVSGLTPARTYQFRVCAVNEVGRGQYSAETSRLMLPEEPPSAPPKNIVASGRT
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pF1KE0 PTSILITWEPPAYA--NGPVQGYRL-FCTEVSTGKEQ--NIEVDGLSYKL-EGLKKFTEY
         ::.. :.::  .  :: ..:: : .      :. :  ::    ..: :   :  .:.:
CCDS34 NQSIMVQWQPPPETEHNGVLRGYILRYRLAGLPGEYQQRNITSPEVNYCLVTDLIIWTQY
             790       800       810       820       830       840 

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pF1KE0 SLRFLAYNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGF
        ..  :::  : :: .  .:  ::. ::.::::::. :.::: .:.  : :::.   ::.
CCDS34 EIQVAAYNGAGLGVFSRAVTEYTLQGVPTAPPQNVQTEAVNSTTIQFLWNPPPQQFINGI
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pF1KE0 ITGYKIRH--RKTTRRGEMETLEPN--NLWY-LFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSN
         :::.      . .   . :. :.  .. .  .:.:.: . :  .:  .:. : ::::.
CCDS34 NQGYKLLAWPADAPEAVTVVTIAPDFHGVHHGHITNLKKFTAYFTSVLCFTTPGDGPPST
             910       920       930       940       950       960 

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pF1KE0 ----WYTAETPE--NDLDESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYIIGYG
           :   . :   . :. ... :  .::.:         ::  ::. : .. :: :.. 
CCDS34 PQLVWTQEDKPGAVGHLSFTEILD--TSLKV---------SWQEPLEKNGIITGYQISWE
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pF1KE0 V-GSPYAE-TVRVDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPT
       : :   .. :  ..:  . :.:. : : . :.:.. : . .: :.     .:. .:.. .
CCDS34 VYGRNDSRLTHTLNSTTHEYKIQGLSSLTTYTIDVAAVTAVGTGL-----VTSSTISSGV
             1020      1030      1040      1050           1060     

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pF1KE0 DPVDYYPLLDDFPTSVPDLSTPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTSEVRLY
        :        :.: .  .:    . :   ....:     : .. :...  ..   : .. 
CCDS34 PP--------DLPGAPSNLVISNISP---RSATLQF---RPGY-DGKTSISRWIVEGQVG
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pF1KE0 TVRWRTSFSASAKYKSEDTTSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHAT-TY
       ..  .  . .  . ..:  ...     .: : : :.: .  ..    : .: ....  : 
CCDS34 AIGDEEEWVTLYEEENEPDAQM-LEIPNLTPYTHYRFRMKQVNIVGPSPYSPSSRVIQTL
             1120      1130       1140      1150      1160         

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pF1KE0 EAAPTSAPKDLTVITREGKPRAVIVSWQP-P-LEANGK---ITAYILFYTLDKNIPIDDW
       .: :  :: ..::  : ..  .. . : : :  . ::.   .   : ..  :    ... 
CCDS34 QAPPDVAPTSVTV--RTASETSLRLRWVPLPDSQYNGNPESVGYRIKYWRSD----LQSS
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pF1KE0 IMETISGDRLTHQ--IMDLNLDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMAND
        .  . .::: ..  : .:.    : ...:: :. :.:: :. .  ::            
CCDS34 AVAQVVSDRLEREFTIEELEEWMEYELQMQAFNAVGAGPWSEVVRGRTRESVPSAAPENV
          1230      1240      1250      1260      1270      1280   

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pF1KE0 QGRHGDGGYWPVDTNLIDRSTLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLV
                                                                   
CCDS34 SAEAVSSTQILLTWTSVPEQDQNGLILGYKILFRAKDLDPEPRSHIVRGNHTQSALLAGL
          1290      1300      1310      1320      1330      1340   

>>CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9               (1912 aa)
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Smith-Waterman score: 1032; 27.4% identity (51.9% similar) in 1055 aa overlap (36-1046:20-1018)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KE0 RCVWVPKLAFVLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNVLLDCSAES
                                     : :  ::   : : . . :: . . :.: .
CCDS43            MVHVARLLLLLLTFFLRTDAETPPRFTRTPVDQTGVSGGVASFICQATG
                          10        20        30        40         

          70        80        90         100       110       120   
pF1KE0 DRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQ--QLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQCEASLGD
       :   : : :.: : ...   ..: .  ....::  .  :   :  . ::..:.: :: ..
CCDS43 D-PRPKIVWNKKGKKVS---NQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPR-DEAIYECVAS-NN
      50         60           70        80        90        100    

                  130       140       150       160       170      
pF1KE0 SGSI-------ISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKN
        : :       . :  ..  . :   ..   .:.     ...: : . :.: : : : :.
CCDS43 VGEISVSTRLTVLREDQIPRGFPTIDMGPQLKVVERTRTATML-CAASGNPDPEITWFKD
           110       120       130       140        150       160  

        180       190                200       210       220       
pF1KE0 QQDLTPIPGDSRVVVLPS---------GALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAE
          .    ...:.  : :         ::::: . . .: : :.: : : :..: .  :.
CCDS43 FLPVDTSNNNGRIKQLRSESIGGTPIRGALQIEQSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPAN
            170       180       190       200       210       220  

       230        240       250       260       270       280      
pF1KE0 VRILSDPGLHR-QLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRSKK
       . .     ..:    :   :.:   . : .. . : . : : :   :. : :  .:  . 
CCDS43 LYVRELREVRRVPPRFSIPPTNHEIMPGGSVNITCVAVGSPMPYVKWMLGAE--DLTPED
            230       240       250       260       270         280

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE0 YSLLGGSNLLISNVTDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESM
          .: . : ...: .  :. ::::.      : : :..:: . :   . :..  . :: 
CCDS43 DMPIGRNVLELNDVRQ--SANYTCVAMSTLGVIEAIAQITVKALP---KPPGTPVVTEST
              290         300       310       320          330     

        350        360       370       380          390       400  
pF1KE0 DIEFECTV-SGKPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGG---SNLRILGVVKSDEGFYQCVA
          .  :  ::.: :.  .. .       . .. . :   .   . :.   ..  .. ::
CCDS43 ATSITLTWDSGNPEPVSYYIIQHKPKNSEELYKEIDGVATTRYSVAGLSPYSDYEFRVVA
         340       350       360       370       380       390     

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pF1KE0 ENEAGNAQTSAQLIVPKPAIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTF
        :. : .  :  ...      : ..  ::::::   ..::  . ..:. : : .:.:: .
CCDS43 VNNIGRGPPSEPVLTQT----SEQAPSSAPRDVQARMLSSTTILVQWKEPEEPNGQIQGY
         400       410           420       430       440       450 

            470       480        490       500       510       520 
pF1KE0 TVFFSREGDNRERALNTTQPGSLQLT-VGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVAT
        :... .  ..       . .. :.: .::: :.  :. .:.:..  : :  :. :.: :
CCDS43 RVYYTMDPTQHVNNWMKHNVADSQITTIGNLVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVIT
             460       470       480       490       500       510 

             530       540       550       560       570        580
pF1KE0 QPELQVPGPVENLQAVSTSPTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVD-G
       :    :::   :..:   : ::::..: ::   .  . .:.:   .   :.:: : .. :
CCDS43 Q--TGVPGQPLNFKAEPESETSILLSWTPP--RSDTIANYELVYKDGEHGEEQRITIEPG
               520       530         540       550       560       

              590       600       610       620       630       640
pF1KE0 LSYKLEGLKKFTEYSLRFLAYNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIK
        ::.:.:::  . : .:. : .  : :.:: .:.. :... ::::::..:    .: :: 
CCDS43 TSYRLQGLKPNSLYYFRLAARSPQGLGASTAEISARTMQSKPSAPPQDISCTSPSSTSIL
       570       580       590       600       610       620       

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pF1KE0 VSWLPPPSGTQNGFITGYKIRHR----KTTRRGEMETLEPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQV
       ::: :::   :::.:: :.:..     .  .  :.  .  ..  ::.  ::: ..: . :
CCDS43 VSWQPPPVEKQNGIITEYSIKYTAVDGEDDKPHEILGIPSDTTKYLLEQLEKWTEYRITV
       630       640       650       660       670       680       

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pF1KE0 SAMTVNGTGPPSNWYTAETPENDLDESQVPD-QPSSLHVRP-QTNCIIMSWTPPLNPNIV
       .: :  : :: :     .: :.      ::.  : ...:.  ... . .::  :. ::  
CCDS43 TAHTDVGPGPESLSVLIRTNED------VPSGPPRKVEVEAVNSTSVKVSWRSPV-PNKQ
       690       700             710       720       730        740

             760          770       780       790       800        
pF1KE0 ---VRGYIIGY---GVGSPYAETVRVDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPL
          .::: . :     : : .. .  :      . :  ... : .:           .  
CCDS43 HGQIRGYQVHYVRMENGEPKGQPMLKDVMLADAQWEFDDTTEHDMI-----------ISG
              750       760       770       780                    

      810       820       830       840       850          860     
pF1KE0 YESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSVPDLSTPMLPPVGVQAVALTH---DAVRVSWA
        .  :. :.:     :  :    :   : : : .      :   ....:   ... ..: 
CCDS43 LQPETSYSLT-----VTAYTTKGDGARSKPKLVSTTGAVPGKPRLVINHTQMNTALIQWH
     790            800       810       820       830       840    

         870       880        890       900       910       920    
pF1KE0 DNSVPKNQKTSEVRLYTVRW-RTSFSASAKYKSEDTTSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTK
           :  .  . .. : ... : ..   .  .  .  .  .::: .. .. : :  . ..
CCDS43 ----PPVDTFGPLQGYRLKFGRKDMEPLTTLEFSEKED-HFTATDIHKGASYVFR-LSAR
              850       860       870        880       890         

          930       940       950       960        970         980 
pF1KE0 NRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTVITREGKPR-AVIVSWQPPL--EANGKITAYI
       :. .    :. . .  : .::. :..:     ::    .: .:::::.  : :: :: : 
CCDS43 NKVGFGEEMVKEISIPEEVPTGFPQNL---HSEGTTSTSVQLSWQPPVLAERNGIITKYT
      900       910       920          930       940       950     

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pF1KE0 LFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLNLDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPILFRT
       :.:  : :::.    .  . .:  :  .  :. :: :  ...:..::: :: :  . :::
CCDS43 LLYR-DINIPLLPMEQLIVPADT-TMTLTGLKPDTTYDVKVRAHTSKGPGPYSPSVQFRT
          960       970        980       990      1000      1010   

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pF1KE0 LKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRSTLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSNLLVI
       : :..                                                       
CCDS43 LPVDQVFAKNFHVKAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEEVDGRATQKLIV
          1020      1030      1040      1050      1060      1070   

>>CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7               (1192 aa)
 initn: 415 init1: 120 opt: 763  Z-score: 400.7  bits: 86.4 E(32554): 5.4e-16
Smith-Waterman score: 849; 27.6% identity (54.5% similar) in 802 aa overlap (47-814:259-1027)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KE0 LFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNVLLDCSAESDRGVPVIKW-K
                                     :.   .::. . :.: ::.   .:.: : :
CCDS55 QQKQPISVKVISAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEG-LPTPIIYWAK
      230       240       250       260       270        280       

          80        90       100       110       120       130     
pF1KE0 KDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQCEASLGDSGSIISRTAKVA
       .::.     . . .   .:    .: :.:    . : : ::: :.  .. . : .: .: 
CCDS55 EDGM-----LPKNRTVYKNFEKTLQ-IIHVS--EADSGNYQCIAK--NALGAIHHTISVR
       290            300        310         320         330       

         140       150       160       170       180        190    
pF1KE0 VAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQQDLTPIPGD-SRVVVLPS
       : .   ...  ....   :.   : :.. :.: : : :  :   .   : : :: .   .
CCDS55 VKAAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKI--DG
       340       350       360       370       380       390       

          200       210       220       230       240       250    
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        .. .: .:  . ..:.:.: :  .   .: : : .:..:   : :     :.:..  .:
CCDS55 DTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLAN-AFVNVLAEPP--RIL----TPANTLYQVI
         400       410       420        430             440        

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pF1KE0 EGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRSKKYSLLGGSNLLISNVTDDDSGMYTCVV
        .. :.:.:   : : :.. :..: .   :.   : :  ...: :  .  :..: ::::.
CCDS55 ANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVA
      450       460       470       480       490       500        

            320       330       340       350       360         370
pF1KE0 TYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVP--TVNWMKNGDV
         :    .  ..: .  : :....:    . ..  . ::: :.   .   :: :.:. . 
CCDS55 RNKLGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKD-NR
      510       520       530       540       550       560        

              380       390       400       410         420        
pF1KE0 VIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQL--IVPKPAIPSSSVL
        .:::    :  ..: .  :  .: : : :::..   ....:: :  ..: :.      .
CCDS55 ELPSDERFTVDKDHLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVAPTPTPAPVYDV
       570       580       590       600       610       620       

      430       440       450       460       470       480        
pF1KE0 PSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTFTVFFSREGDNRERALNTTQPGSLQLT
       :. : :.  .   .. :.::: :  . .. :  : . .     .     . :. .. : :
CCDS55 PNPPFDLELTDQLDKSVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTT
       630       640       650       660       670       680       

      490        500          510        520       530       540   
pF1KE0 VG-NLKPEAMYTFRVVAYNEWG---PGESS-QPIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTSPTS
       .  .:.: . :.:::.: :  :   :.:.: : .  :..:. . :  ::.:   .. : .
CCDS55 AQLKLSPYVNYSFRVMAVNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPD-KNPTAVEGL---GSEPDN
       690       700       710       720        730          740   

           550         560       570        580        590         
pF1KE0 ILITWEPPA--YANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQ-NIEVDGLS-YKLEGLKKFTEYSLRFL
       ..:::.:     .:::   :..   . .   :  .. : ..: : . :   :. : ..  
CCDS55 LVITWKPLNGFESNGPGLQYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQ
           750       760       770       780       790       800   

     600       610         620       630       640       650       
pF1KE0 AYNRYGPGVSTDDITVVTLS--DVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFITG
       : : .:   . .  .:.  :  :.: . : :: ..::::   .: : : :  .  : . :
CCDS55 ALNDMG--FAPEPAVVMGHSGEDLPMVAPGNVRVNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQG
             810       820       830       840       850       860 

       660                670       680       690       700        
pF1KE0 YKIRHRKT---TRRG------EMETLEPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPS
       :.: . ::   ..:.      .. :.. ..   .. :::  :.:...: ... .: :: :
CCDS55 YRIYYWKTQSSSKRNRRHIEKKILTFQGSKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPAS
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pF1KE0 NWYTAETPENDLDESQVPDQPSSLH-VRPQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYIIGYG-VGS
          . .:::.      ::. ::::. : :  . . . : :: .:: ..  : . :  ..:
CCDS55 PDRVFNTPEG------VPSAPSSLKIVNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINS
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pF1KE0 PYAETVRVDSK----QRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTD
        .     :: :    .  .... :. :..: . . : ..:: :  . : :.:        
CCDS55 THELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTTVDEAGIL
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CCDS55 PPDVGAGKAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAH
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        .. :.:.:   : : :.. :..: .   :.   : :  ...: :  .  :..: ::::.
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         :    .  ..: .  : :....:    . ..  . ::: :.   .   :: :.:. . 
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        .:::    :  ..: .  :  .: : : :::..   ....:: :  ..: :.      .
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       :. : :.  .   .. :.::: :  . .. :  : . .     .     . :. .. : :
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       .  .:.: . :.:::.: :  :   :.:.: : .  :..:. . :  ::.:   .. : .
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       ..:::.:     .:::   :..   . .   :  .. : ..: : . :   :. : ..  
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       :.: . ::   ..:.      .. :.. ..   .. :::  :.:...: ... .: :: :
CCDS75 YRIYYWKTQSSSKRNRRHIEKKILTFQGSKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPAS
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CCDS75 PDRVFNTPEG------VPSAPSSLKIVNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINS
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CCDS75 THELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTTVDEAGIL
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CCDS75 PPDVGAGKAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAH
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CCDS47 IAANLSDTEFYGAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEG-LPTPIIYWAK
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CCDS47 EDGM-----LPKNRTVYKNFEKTLQ-IIHV--SEADSGNYQCIAK--NALGAIHHTISVR
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         140       150       160       170       180        190    
pF1KE0 VAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQQDLTPIPGD-SRVVVLPS
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CCDS47 VKAAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKI--DG
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pF1KE0 GALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLHRQLYFLQRPSNVV--AI
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CCDS47 DTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLAN-AFVNVLAEPP--RIL----TPANTLYQVI
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pF1KE0 EGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRSKKYSLLGGSNLLISNVTDDDSGMYTCVV
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CCDS47 ANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVA
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pF1KE0 TYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVP--TVNWMKNGDV
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CCDS47 RNKLGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKD-NR
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pF1KE0 VIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQL--IVPKPAIPSSSVL
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CCDS47 ELPSDERFTVDKDHLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVAPTPTPAPVYDV
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       :. : :.  .   .. :.::: :  . .. :  : . .     .     . :. .. : :
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pF1KE0 VG-NLKPEAMYTFRVVAYNEWG---PGESS-QPIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTSPTS
       .  .:.: . :.:::.: :  :   :.:.: : .  :..:. . :  ::.:   .. : .
CCDS47 AQLKLSPYVNYSFRVMAVNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPD-KNPTAVEGL---GSEPDN
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CCDS47 LVITWKPLNGFESNGPGLQYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQ
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       :.: . ::   ..:.      .. :.. ..   .. :::  :.:...: ... .: :: :
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          . .:::.      ::. ::::. : :  . . . : :: .:: ..  : . :  ..:
CCDS47 PDRVFNTPEG------VPSAPSSLKIVNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINS
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pF1KE0 -----PYAETVRVDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPT
            : .. ... ...  .... :. :..: . . : ..:: :  . : :.:       
CCDS47 THELGPLVD-LKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTT------
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         ::   .:   :   ::...  .  :. .   ::  :.. ..:. :  . .   .: .:
CCDS47 --VDEAGIL---P---PDVGAGKVQAVNPRISNLTAAAAE-TYANISW-EYEGPEHVNFY
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        :.. .. :     :   . : :. .  :: :.: :.  : .. .      ....   ..
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       :..:. : ... . :.                                            
CCDS47 ETGPAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPE
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CCDS45 RYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAED
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       .   . . ..  : :.:  ..::  ::. ::::.  .   : : :..::   :   . :.
CCDS45 L---TPEDDMPVGRNVL--ELTDVKDSANYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLP---KAPG
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CCDS45 EPNGLIRGYRVYYTMEP---EHPVGNWQKHNVDDSLLTTVGSLLEDETYTVRVLAFTSVG
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        .: :   .  .::: . :    :.   : :  . : .        :. .  . :  :. 
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CCDS45 ETAYSITVAAYTMKGDGA--------RS--KPKVVVTKGAVLGR-----PTLSVQQTPEG
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CCDS45 SLLA----------RWEPPAGTAEDQVLGYRLQFGREDSTPLATLEFPPSED----RYTA
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       .:.. .. : :  .....: .     .   .  : .: . :.   ..   :.  :  :..
CCDS45 SGVHKGATYVFR-LAARSRGGLGEEAAEVLSIPEDTPRGHPQ---ILEAAGNASAGTVLL
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CCDS45 RWLPPVPAERNGAIVKYTVAVREAGALGPARETELPAAAEPGAENALTLQGLKPDTAYDL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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