Result of FASTA (ccds) for pF1KA1460
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1460, 1962 aa
  1>>>pF1KA1460 1962 - 1962 aa - 1962 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4459+/-0.00117; mu= 3.1816+/- 0.071
 mean_var=334.5015+/-67.329, 0's: 0 Z-trim(112.7): 57  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.070125
 statistics sampled from 13364 (13406) to 13364 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.412), width:  16
 Scan time:  5.090

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10624.2 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16       (1962) 13475 1378.9       0
CCDS81959.1 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16       (1913) 8856 911.6       0
CCDS54533.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22       (1833) 2584 277.1 4.7e-73
CCDS45798.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17       (1690) 2525 271.1 2.7e-71
CCDS46713.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22       (1723) 2015 219.5 9.5e-56
CCDS46712.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22       (1029) 1756 193.1   5e-48
CCDS45799.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17       (1726) 1691 186.7   7e-46


>>CCDS10624.2 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16            (1962 aa)
 initn: 13475 init1: 13475 opt: 13475  Z-score: 7379.5  bits: 1378.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 13475; 100.0% identity (100.0% similar) in 1962 aa overlap (1-1962:1-1962)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATEQKIKVPEQIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATEQKIKVPEQIK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PSVSQPQPANSNNGTSTATSTNNNAKRATANNQQPQQQQQQQQPQQQQPQQQPQPQPQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PSVSQPQPANSNNGTSTATSTNNNAKRATANNQQPQQQQQQQQPQQQQPQQQPQPQPQQQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 QPQQQPQALPRYPREVPPRFRHQEHKQLLKRGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QPQQQPQALPRYPREVPPRFRHQEHKQLLKRGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 QQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSGSHYENSQRGPVSSTSDSSTNCKNAVVSDLSEKEAWP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSGSHYENSQRGPVSSTSDSSTNCKNAVVSDLSEKEAWP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 SNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSSNGGLNPST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSSNGGLNPST
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 LNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 GSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELPSSNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELPSSNT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 GAWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWGAYGSNYSGDKCSGPNGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GAWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWGAYGSNYSGDKCSGPNGQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 ANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 SVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 SGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 SGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 DGQKSSQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DGQKSSQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 ATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVN
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 MWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 WGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 WEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 SRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALGSIAGLGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALGSIAGLGM
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 QNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLL
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA1 KYAPNNGGLNPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KYAPNNGGLNPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQ
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA1 DQQGRPLSVQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DQQGRPLSVQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA1 GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSLDQNSSKHGAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSLDQNSSKHGAI
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA1 SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPNGSSSVNWPPEFRPGEPWKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPNGSSSVNWPPEFRPGEPWKG
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KA1 YPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASN
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KA1 YNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQ
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KA1 KPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KA1 CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFF
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 SVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 SGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSV
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pF1KA1 SGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWG
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pF1KA1 DGQKSSQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DGQKSSQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
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pF1KA1 NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPP
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pF1KA1 ATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVN
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pF1KA1 MWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSA
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pF1KA1 WGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTG
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pF1KA1 WEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
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pF1KA1 INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPG
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pF1KA1 SRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALGSIAGLGM
       :::::::::::::::::::                                         
CCDS81 SRPQISKESSMERNPYFDK-----------------------------------------
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             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 QNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLL
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 --------NGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLL
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pF1KA1 KYAPNNGGLNPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KYAPNNGGLNPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQ
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pF1KA1 DQQGRPLSVQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DQQGRPLSVQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK
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pF1KA1 GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSLDQNSSKHGAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSLDQNSSKHGAI
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pF1KA1 SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPNGSSSVNWPPEFRPGEPWKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPNGSSSVNWPPEFRPGEPWKG
            1520      1530      1540      1550      1560      1570 

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pF1KA1 YPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASN
            1580      1590      1600      1610      1620      1630 

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KA1 YNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQ
            1640      1650      1660      1670      1680      1690 

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KA1 KPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL
            1700      1710      1720      1730      1740      1750 

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KA1 CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFF
            1760      1770      1780      1790      1800      1810 

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KA1 AQSQSLTPSPGWQSLGSSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AQSQSLTPSPGWQSLGSSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWG
            1820      1830      1840      1850      1860      1870 

             1930      1940      1950      1960  
pF1KA1 TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
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>>CCDS54533.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22            (1833 aa)
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CCDS54 --------PSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGA
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         .: :   .: . .:.. .  . . .:   :.: ::  :  .::.. .: :     . :
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       . : :. : ::   ..: : .::   : .:::.  ::..      :.: ..:       :
CCDS54 IVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTL---PGSTTSNK-------G
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        ::: .      : . :.  . : :  .  :       ::.. .: .:. :: .. : .:
CCDS54 KGSQCQ------SASSGNECNLGVWKSDPKAK------SVQSSNSTTEN-NNGLGNWRNV
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       :...  . : . :..:  :: .:::.: ..: . :: . . .:. . : ::.::   .:.
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       :   ..:. .: . . :    ::      .:::          :.:. :.:  ::.:.. 
CCDS54 NP--MENKGMPFGMGLGNTSRST------DAPSQ---------STGDRKTGSVGSWGAAR
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         .:....:: ::  .:: :.  :  :   ::..  .. ::.  :.. .:. .:  : : 
CCDS54 PQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQP---TGSDELKIGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQK-
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          :      :.::.:      :.  :....... :. . .:::  .. :...:..  ::
CCDS54 ---G--HPLPENQGNA------QAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRR
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       .      : ...::....:::::::::::.::::: :::.:.:: :  :: : :.:.:::
CCDS54 SYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTE
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       .: :.:::: :::.  :  .:. ..  . ::::. . . .: : :..   :::.: .  .
CCDS54 GWESAATQTKNSGGWGD--APSQSNQMK-SGWGELSASTEWKDPKNT---GGWNDYKNNN
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CCDS54 ----SSNWGGGRPDEKTPSSWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWS-SGKNGWGEEVDQTKNSN
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CCDS54 WE----------SSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGW-EDCKRSPA--WN
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       .  .. .:  :. . .  . :.     : .  ::::   ::  :  .: ...: .:: ::
CCDS54 ETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPA
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         :.:::.:::::::.:: :::.:::::::::::..:::::::.:.::  .: .  . . 
CCDS54 TPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPN-
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CCDS54 ----LPTP---MTSKSASV-------WSKSTPPAP--DNGTSAWGEPNESSPGWGEMDDT
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       ..::. ::.. .. :.:. : . :::::::  .: :. : :  .::::::   :.::...
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       ::   :: :        .: : .:::. .    .::::  ...:.::..:::::...   
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       :::.:        :: ..::.    :  : :.:: ::.:.::: .::.:. ::. ::. .
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CCDS54 ARQGGSHGLF--GNSTAQSRGLHTP-VQPLNSS-PSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPN
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       .:   ::   .: ..:::.:::.:: :. :..   ::  :: :::. :   .::.. .. 
CCDS54 SGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQL--LLQQQQQQQLLQNQRKISQAV
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CCDS54 RQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQ-----------PGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNA
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pF1KA1 T----PELQ-KGPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEP--QSRLRKWTTV-DSISV
            :.:: ::: :     ..  :..:. .... : . ::   .::...::.. ...  
CCDS54 LNVGLPDLQTKGPIP-----GYGSGFSSG-GMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPS
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pF1KA1 NTSLDQNSSKHGAI-SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPN----
        .. . :  :.::: . :     ::.  .:.. ..:  ..  :  ::.:  ::::     
CCDS54 VATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTL-GGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKI
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pF1KA1 GSSSVN--WPPEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDH--LRDRNS
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CCDS54 GSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTT
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CCDS54 KMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPS-SPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGG
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pF1KA1 SGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKS
       : : . ::::.:::::::::::::.:::::::.:::::: .:.::.:::.:.:..::: .
CCDS54 SVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTA
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pF1KA1 LHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP-----GWQSLGSSQSRLGSLDCS
       ::::::::::::::::...:.:::.::.:  ::  .:     ::::: ..:..   .  .
CCDS54 LHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPA
           1710      1720      1730      1740      1750      1760  

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pF1KA1 HS-FSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPIN
        . :.. : :..:.... .:.. .:: :.:::: :.::.:::: :.  ::. ..::.:. 
CCDS54 LNLFGGSTGLGQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPL-
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      1950      1960  
pF1KA1 AFLSVDHLGGGGESM
         :  : ::::..:.
CCDS54 --LPGDLLGGGSDSI
               1830   

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        ::.    .: ..:.:     :: . :.  .  . ::.. ..: ..  ...: .: ::  
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       .:.::.:.: . ::  .: .::::: ..: .  :    . :.:    :.:::  .::  :
CCDS45 ASNSNAGINLN-LNPNANPAAWPVLGHEGTVATG----NPSSICSPVSAIGQNMGNQ--N
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       .. .:  : :.::.:  ::. : ..: .:.::::.::::..:.  ::::: : :.:: ::
CCDS45 GNPTG--TLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTD--GPNNT-NPMNSS-PN
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pF1KA1 S-GSVQNNELPSSNTG-AWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWG-
         ...:.: ::  : : :  ....  :..:.  : ::.:.:..:.: ..  :  ...:: 
CCDS45 PINAMQTNGLP--NWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAE--GISNSVWGL
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pF1KA1 AYGSNYSGDKCSGPNGQANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGA-ANSQ
       . :.  .:.. :: . :.::::::..: .   ::  ..  : . ..::..:.::  :.  
CCDS45 SPGNPATGNSNSGFS-QGNGDTVNSAL-SAKQNGS-SSAVQ-KEGSGGNAWDSGPPAGPG
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pF1KA1 STSWGSGNGANSGGS-RRG-WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNG
         .:: :.: :. :. . : :: :...: .:  . ::.: : :::::.. ::.:.:   :
CCDS45 ILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRST-SNGVNGEWGK-PPNQHSNSDINGKGST---G
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pF1KA1 WKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAK--TGGTVESDGSTESTGRLEE-----KGTGESQSR
       :.:    .:. ...  .:. . :::  ..::. :.::....:  .:     .::::.. :
CCDS45 WESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRR
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pF1KA1 DRRKIDQ-HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEA
       :.  ::: :  :     :.:::::::::.::::::.::::::. : :::.:::.::::::
CCDS45 DKGIIDQGHIQLP----RNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEA
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pF1KA1 WGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPA-----LRWGDS--KGSNCQGGWE
       :: .:::. :::.  : .  :...::::::: .  ::       ::::  :. .  : : 
CCDS45 WGCAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWG
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       :. ..:..     .::.. :.   : .... .:..  : : : :::::.:. .::....:
CCDS45 DSISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGD
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pF1KA1 NWGETSRN-NHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNINPNNSSG--WDE
        :...:   .: :...:..:.  .::.:: ::::.  ....  :::. : . . :  : :
CCDS45 -WADSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGE
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pF1KA1 SSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPPATGKPPGTGWLG
       . :: :.:.:.. :..:.  .:: .                       :. :  ::::.:
CCDS45 TLKPGPQQNWASKPQDNNVSNWGGA-----------------------ASVKQTGTGWIG
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pF1KA1 GPIPAPAKEE-EPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVP----
       ::.:.  :.  : :::::::: :::::::::::::::::::.:: :.::::..: :    
CCDS45 GPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQS
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pF1KA1 ------NGNSRSDQQAQVHQLLTP----ASAISNKEASSG------SGWGE-P-------
             . .. .  .  .:.. ::    :..  :.    :      ::::: :       
CCDS45 STTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPPHQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTE
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pF1KA1 --WGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKS
         :::::.:.: :::::.::::: .:: .::.  :    .   ... :. .:: : . ::
CCDS45 NSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKS
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pF1KA1 MQDGWC--GDDMPLPGNRPTGWEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLN-WPPYTKKMSSKGL
       ::.::   ::.: :  ..   ::.::     .::. .::: .:: . :    ::  .:: 
CCDS45 MQEGWGSGGDEMNLSTSQ---WEDEEG---DVWNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKG-
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pF1KA1 SGKKRRRERGMMKGGNKQEEAWI-NPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGM--LQ
                  :: ..::.:::: . ..::.....: :.  :: ..::.:.:. .:  : 
CCDS45 -----------MKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSALL
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pF1KA1 DKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPGSRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSS
       .:....::..:.. :.:  ..:  : :: ::::::..:  ..:::: ...:     :. :
CCDS45 EKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLPS
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pF1KA1 QSMKLPPSNSALPNQALGSIA-GLGMQNLNSVRQ--NGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPP-
        :.::: :.::::.::::.:: ::::::::: ::  .:: .::: .. ::: : ::::: 
CCDS45 PSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSSRQIPSGNLGMFG-NSGAAQARTMQQPPQ
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         .:::.::::.::::::  .::::: ..::..: .: :::: .     .::...:::::
CCDS45 PPVQPLNSSQPSLRAQVPQ-FLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLTSPINPQHMTMLNQL
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       :::::  ::    .  ::  : :: .:.   :      :.::   .  :: :.:. .:. 
CCDS45 LLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSP-NTFAPYPLA
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       ::: :.::: :::.   :.:.:   :::: .::  .:.    :. . :.:: :::::: .
CCDS45 GLNPNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPG
     1270      1280      1290      1300      1310      1320        

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pF1KA1 GFRLE-------ESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSP-----NGSSSVNWPP
       :. .        .. .  ::....: :::::: ..  .: ::::      :::: .::::
CCDS45 GLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSS-INWPP
     1330      1340      1350      1360      1370      1380        

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pF1KA1 EFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINT-VREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPS
       ::.:: ::::  :::::.:: :::::: .. .::: ...:..   ...:. :....:   
CCDS45 EFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKST---
      1390      1400      1410      1420      1430      1440       

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pF1KA1 TSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITA
          :::                            .: : :..::.::::::   :.: ::
CCDS45 ---WSS----------------------------GPTSHTQASLSHELWKV---PRNSTA
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pF1KA1 PSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLT
       :.:::::::. ::  :::  :::    :: .:   :. ::.:. ..::: ..::::.:::
CCDS45 PTRPPPGLTNPKPS-STWGASPL----GWTSS---YSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLT
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pF1KA1 PQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAE
       ::::::::::::.:::::::::::: .:::.::::::::..:::::::::::::::::::
CCDS45 PQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILAE
           1530      1540      1550      1560      1570      1580  

    1850      1860      1870       1880      1890      1900        
pF1KA1 FASEEEISRFFAQSQSLTPSPGWQSLG-SSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGT
       ::.:::..::.::.:.: :. .::: . ::: ::..   ::..  :.: .:::.  :.: 
CCDS45 FAGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAGSSHGLV-RSDAGHWNAPCLGGK
           1590      1600      1610      1620       1630      1640 

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pF1KA1 NCGDLHGTSLWG-TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
       . ..:    ::: .:.::.:::::::..: : :.::.:....:  : :.:     
CCDS45 GSSEL----LWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL  
                1650      1660      1670      1680      1690  

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pF1KA1 QQQQPQQQPQALPRYPREVPPRFR-HQEHKQLLKRGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESS
               :.:   .::::::::: .:.:: ::::::  :     ::...      . ..
CCDS46 --------PSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGA
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         .: :   .: . .:.. .  . . .:   :.: ::  :  .::.. .: :     . :
CCDS46 NPNNAQV--TGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGSGASSNNGTSPNPIHIWDKV
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pF1KA1 VSDLSEKEAWPSAPGSDPELASE-CMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTG
       . : :. : ::   ..: : .::   : .:::.  ::..      :.: ..:       :
CCDS46 IVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTL---PGSTTSNK-------G
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pF1KA1 LGSQNKFVVGSSSNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTV
        ::: .      : . :.  . : :  .  :       ::.. .: .:. :: .. : .:
CCDS46 KGSQCQ------SASSGNECNLGVWKSDPKAK------SVQSSNSTTEN-NNGLGNWRNV
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pF1KA1 SSSS--NGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQS
       :...  . : . :..:  :: .:::.: ..: . :: . . .:. . : ::.::   .:.
CCDS46 SGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQ
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         ::.                  : .:.. :  ::. :    .  ::.: .:: .. : :
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       :   ..:. .: . . :    ::      .:::          :.:. :.:  ::.:.. 
CCDS46 NP--MENKGMPFGMGLGNTSRST------DAPSQ---------STGDRKTGSVGSWGAAR
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       :  :..  ::.. :: ::. ::    :. ... .: .. :  . ... :. . :: :. :
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         .:....:: ::  .:: :.  :  :   ::..  .. ::.  :.. .:. .:  : : 
CCDS46 PQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQP---TGSDELKIGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQK-
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pF1KA1 FTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRR
          :      :.::.:      :.  :....... :. . .:::  .. :...:..  ::
CCDS46 ---G--HPLPENQGNA------QAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRR
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pF1KA1 KI-----DQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTE
       .      : ...::....:::::::::::.::::: :::.:.:: :  :: : :.:.:::
CCDS46 SYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTE
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pF1KA1 AWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAAT
       .: :.:::: :::.  :  .:. ..  . ::::. . . .: : :..   :::.: .  .
CCDS46 GWESAATQTKNSGGWGD--APSQSNQMK-SGWGELSASTEWKDPKNT---GGWNDYKNNN
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pF1KA1 GMVKSNQWGNCK-EEK--AAWNDSQKNKQGWGDGQKSSQGWSVSASDNWGET---SRNNH
           :..::. . .::  ..::.. .. :::: :.. .:::: :....:::    ..:..
CCDS46 ----SSNWGGGRPDEKTPSSWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWS-SGKNGWGEEVDQTKNSN
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       :           :.... ::::.: :..   ::::. : . .:  :: :. : .:.  :.
CCDS46 WE----------SSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGW-EDCKRSPA--WN
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           930       940         950         960         970       
pF1KA1 DPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNK--QQDIVGSWG--IPPATG--KPPGTGWLGGPIPA
       .  .. .:  :. . .  . :.     : .  ::::   ::  :  .: ...: .:: ::
CCDS46 ETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPA
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pF1KA1 PAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVPNGNSRSDQQA
         :.:::.:::::::.:: :::.:::::::::::..:::::::.:.::  .:        
CCDS46 TPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKNSQGG--------
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pF1KA1 QVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAA
              ::                   ::. :.                      :...
CCDS46 -------PAPR-----------------EPNLPT----------------------PMTS
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      1100      1110      1120      1130      1140      1150       
pF1KA1 ASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTGWEEEEDVEIGMWNSNSS
        :....                :::::::  .: :. : :  .::::::   :.::...:
CCDS46 KSASDS----------------KSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDG--GVWNTTGS
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pF1KA1 QELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAWINPFVKQFSNISFSRDS
       :   :: :        .: : .:::. .    .::::  ...:.::..:::::...   :
CCDS46 QGSASSHN-------SASWGQGGKKQMKCS--LKGGN--NDSWMNPLAKQFSNMGLL--S
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         :.  :.::::: : :.::....::...:.::.:  . :   : ::  ::. .. . .:
CCDS46 QTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGP
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pF1KA1 YFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALGSIAGLGMQNLNSVRQNGNPSMF
       ::.:                                                 .:. ..:
CCDS46 YFEK-------------------------------------------------GGSHGLF
                                                              1090 

        1340      1350      1360      1370      1380               
pF1KA1 GVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNG---GL---
       :  :..:: ::.. : .:::.:: :.::::::: ..:::: .:.::  ::.:   ::   
CCDS46 G--NSTAQSRGLHTP-VQPLNSS-PSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNV
              1100       1110       1120      1130      1140       

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pF1KA1 NPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQ---SQRSVPSGNRPQQDQQ-GR
       .: ..:::.:::.:: :. :..   ::  :: :::. :   .::.. .. : ::.:: .:
CCDS46 GPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQL--LLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLAR
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pF1KA1 PLS-VQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTT----PELQ-
        .: .:::..::.::           :  ...: :  . :  :::..:..     :.:: 
CCDS46 MVSALQQQQQQQQRQ-----------PGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQT
        1210      1220                 1230      1240      1250    

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pF1KA1 KGPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEP--QSRLRKWTTV-DSISVNTSLDQNSSK
       ::: :     ..  :..:. .... : . ::   .::...::.. ...   .. . :  :
CCDS46 KGPIP-----GYGSGFSSG-GMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHK
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pF1KA1 HGAI-SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPN----GSSSVN--WP
       .::: . :     ::.  .:.. ..:  ..  :  ::.:  ::::     ::.: :  ::
CCDS46 NGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTL-GGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWP
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pF1KA1 PEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDH--LRDRNSGSSSSLNTTL
       :::.:: ::::  :::::.:::::::::... . . . ..::  ::: ..::.:::::.:
CCDS46 PEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSL
      1370      1380      1390      1400      1410      1420       

      1670      1680      1690      1700      1710        1720     
pF1KA1 PSTSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTN--TSLAHELWKVPLPPK
       :: .::    ::. .    ....::::.  : : ::::  . .  : :....::  .  .
CCDS46 PSPGAWP-YSASDNSF---TNVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSR
      1430       1440         1450      1460      1470      1480   

        1730      1740      1750      1760      1770      1780     
pF1KA1 NITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVL
       : :   :::::::. ::  : :...  :   :::..:.: . .:.:....: : . ::::
CCDS46 NTTPLPRPPPGLTNPKPS-SPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVL
          1490      1500       1510      1520      1530      1540  

        1790      1800      1810      1820      1830      1840     
pF1KA1 KNLTPQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTT
       .:::::::::::::.:::::::.:::::: .:.::.:::.:.:..::: .::::::::::
CCDS46 HNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTT
           1550      1560      1570      1580      1590      1600  

        1850      1860        1870           1880      1890        
pF1KA1 ILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP-----GWQSLGSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDL
       ::::::...:.:::.::.:  ::  .:     ::::: ..:..   .  . . :.. : :
CCDS46 ILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGL
           1610      1620      1630      1640      1650      1660  

      1900      1910      1920      1930      1940      1950       
pF1KA1 NHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGG
       ..:.... .:.. .:: :.:::: :.::.:::: :.  ::. ..::.:.   :  : :::
CCDS46 GQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPL---LPGDLLGG
            1670      1680      1690      1700      1710           

      1960  
pF1KA1 GGESM
       :..:.
CCDS46 GSDSI
     1720   

>>CCDS46712.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22            (1029 aa)
 initn: 1422 init1: 568 opt: 1756  Z-score: 975.7  bits: 193.1 E(32554): 5e-48
Smith-Waterman score: 2154; 41.7% identity (66.5% similar) in 960 aa overlap (1045-1962:170-1029)

         1020      1030      1040       1050      1060      1070   
pF1KA1 NYKNVNMWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASA-ISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATT
                                     : .: ...   .: :: .  :.. . ::  
CCDS46 LLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPVWSKSTPPAP-
     140       150       160       170       180       190         

          1080      1090      1100      1110       1120      1130  
pF1KA1 VDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVG-PQALSKSGPKSMQDGWCGDDMP
        ::::::::.: .:.:.:::   ...::. ::.. .. :.:. : . :::::::  .: :
CCDS46 -DNGTSAWGEPNESSPGWGEMDDTGASTTGWGNTPANAPNAM-KPNSKSMQDGWGESDGP
       200       210       220       230        240       250      

           1140      1150      1160      1170      1180      1190  
pF1KA1 LPGNRPTGWEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKG
       . : :  .::::::   :.::...::   :: :        .: : .:::. .    .::
CCDS46 VTGARHPSWEEEED--GGVWNTTGSQGSASSHN-------SASWGQGGKKQMKCS--LKG
        260       270         280              290       300       

           1200      1210      1220      1230      1240      1250  
pF1KA1 GNKQEEAWINPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYN
       ::  ...:.::..:::::...   :  :.  :.::::: : :.::....::...:.::.:
CCDS46 GN--NDSWMNPLAKQFSNMGLL--SQTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFN
           310       320         330       340       350       360 

            1260       1270      1280      1290      1300      1310
pF1KA1 RTVGKG-PGSRPQISKE-SSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQ
         . :   : ::  ::. .. . .:::.:                               
CCDS46 DIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEK-------------------------------
             370       380       390                               

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KA1 ALGSIAGLGMQNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPL
                         .:. ..:  ::..:: ::.. : .:::.:: :.::::::: .
CCDS46 ------------------GGSHGLF--GNSTAQSRGLHTP-VQPLNSS-PSLRAQVPPQF
                                  400       410         420        

             1380            1390      1400      1410      1420    
pF1KA1 LSPQVPVSLLKYAPNNG---GL---NPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQ
       .:::: .:.::  ::.:   ::   .: ..:::.:::.:: :. :..   ::  :: :::
CCDS46 ISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQL--LLQQQQ
      430       440       450       460       470       480        

            1430      1440        1450      1460      1470         
pF1KA1 RAQ---SQRSVPSGNRPQQDQQ-GRPLS-VQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLH
       . :   .::.. .. : ::.:: .: .: .:::..::.::           :  ...: :
CCDS46 QQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQ-----------PGMKHSPSH
        490       500       510       520                  530     

    1480      1490           1500      1510      1520      1530    
pF1KA1 QPAMKSFLDNVMPHTT----PELQ-KGPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEP--Q
         . :  :::..:..     :.:: ::: :     ..  :..:. .... : . ::   .
CCDS46 PVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIP-----GYGSGFSSG-GMDYGMVGGKEAGTE
         540       550       560            570        580         

           1540       1550      1560       1570      1580      1590
pF1KA1 SRLRKWTTV-DSISVNTSLDQNSSKHGAI-SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSI
       ::...::.. ...   .. . :  :.::: . :     ::.  .:.. ..:  ..  :  
CCDS46 SRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTL-GGHTGPA
     590       600       610       620       630       640         

             1600            1610      1620      1630      1640    
pF1KA1 GDGWPRAKSPN----GSSSVN--WPPEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSIN
       ::.:  ::::     ::.: :  :::::.:: ::::  :::::.:::::::::... . .
CCDS46 GDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATS
      650       660       670       680       690       700        

         1650        1660      1670      1680      1690      1700  
pF1KA1 TVREVDH--LRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLT
        . ..::  ::: ..::.:::::.::: .::    ::. .    ....::::.  : : :
CCDS46 PIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWP-YSASDNSF---TNVHSTSAKFPDYKST
      710       720       730       740           750       760    

           1710        1720      1730      1740      1750      1760
pF1KA1 WSPGSVTN--TSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGN
       :::  . .  : :....::  .  .: :   :::::::. ::  : :...  :   :::.
CCDS46 WSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPS-SPWSSTAPRSVRGWGT
          770       780       790       800        810       820   

             1770      1780      1790      1800      1810      1820
pF1KA1 SDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNAL
       .:.: . .:.:....: : . ::::.:::::::::::::.:::::::.:::::: .:.::
CCDS46 QDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTAL
           830       840       850       860       870       880   

             1830      1840      1850      1860        1870        
pF1KA1 VRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP-----GWQ
       .:::.:.:..::: .::::::::::::::::...:.:::.::.:  ::  .:     :::
CCDS46 IRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQ
           890       900       910       920       930       940   

          1880      1890       1900      1910      1920      1930  
pF1KA1 SLGSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPP
       :: ..:..   .  . . :.. : :..:.... .:.. .:: :.:::: :.::.:::: :
CCDS46 SLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVP
           950       960       970        980       990      1000  

           1940      1950      1960  
pF1KA1 SSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
       .  ::. ..::.:.   :  : ::::..:.
CCDS46 TVEDPHRMGSPAPL---LPGDLLGGGSDSI
           1010         1020         

>>CCDS45799.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17            (1726 aa)
 initn: 2088 init1: 631 opt: 1691  Z-score: 937.2  bits: 186.7 E(32554): 7e-46
Smith-Waterman score: 4341; 44.7% identity (68.5% similar) in 1823 aa overlap (271-1957:1-1723)

              250       260       270       280        290         
pF1KA1 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDG-LRNSTGLGSQNKFVVGS
                                     ::.:.. :.  :  ....: .. :  .: :
CCDS45                               MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQS
                                             10        20        30

     300           310           320       330         340         
pF1KA1 SSNN----VGHGSSTGP----WGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSES--SNNR-MNAWGTV
        ::.    .: ..:.:     :: . :.  .  . ::.. ..: ..  ...: .: ::  
CCDS45 PSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSSGLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWG--
               40        50        60        70        80          

      350       360       370       380       390       400        
pF1KA1 SSSSNGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSIN
       .:.::.:.: . ::  .: .::::: ..: .  :    . :.:    :.:::  .::  :
CCDS45 ASNSNAGINLN-LNPNANPAAWPVLGHEGTVATG----NPSSICSPVSAIGQNMGNQ--N
       90        100       110       120           130       140   

      410       420         430       440       450       460      
pF1KA1 SKVSGGSTHGTWGSL--QETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPN
       .. .:  : :.::.:  ::. : ..: .:.::::.::::..:.  ::::: : :.:: ::
CCDS45 GNPTG--TLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTD--GPNNT-NPMNSS-PN
               150       160       170       180          190      

         470       480        490       500       510       520    
pF1KA1 S-GSVQNNELPSSNTG-AWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWG-
         ...:.: ::  : : :  ....  :..:.  : ::.:.:..:.: ..  :  ...:: 
CCDS45 PINAMQTNGLP--NWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAE--GISNSVWGL
         200         210       220       230       240         250 

           530       540       550       560       570        580  
pF1KA1 AYGSNYSGDKCSGPNGQANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGA-ANSQ
       . :.  .:.. :: . :.::::::..: .   ::  ..  : . ..::..:.::  :.  
CCDS45 SPGNPATGNSNSGFS-QGNGDTVNSAL-SAKQNGS-SSAVQ-KEGSGGNAWDSGPPAGPG
             260        270        280         290       300       

            590        600        610       620       630       640
pF1KA1 STSWGSGNGANSGGS-RRG-WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNG
         .:: :.: :. :. . : :: :...: .:  . ::.: : :::::.. ::.:.:   :
CCDS45 ILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRST-SNGVNGEWGK-PPNQHSNSDINGKGST---G
       310       320       330        340        350       360     

              650       660         670       680            690   
pF1KA1 WKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAK--TGGTVESDGSTESTGRLEE-----KGTGESQSR
       :.:    .:. ...  .:. . :::  ..::. :.::....:  .:     .::::.. :
CCDS45 WESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRR
            370       380       390       400       410       420  

           700        710       720       730       740       750  
pF1KA1 DRRKIDQ-HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEA
       :.  ::: :  :     :.:::::::::.::::::.::::::. : :::.:::.::::::
CCDS45 DKGIIDQGHIQLP----RNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEA
            430           440       450       460       470        

            760       770       780            790         800     
pF1KA1 WGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPA-----LRWGDS--KGSNCQGGWE
       :: .:::. :::.  : .  :...::::::: .  ::       ::::  :. .  : : 
CCDS45 WGCAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWG
      480       490       500       510       520       530        

         810             820          830        840       850     
pF1KA1 DDSAATGM-----VKSNQ-WG---NCKEEKAAWNDSQKNK-QGWGDGQKSSQGWSVSASD
       :. ..:..     .::.. :.   : .... .:..  : : : :::::.:. .::....:
CCDS45 DSISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGD
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pF1KA1 NWGETSRN-NHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNINPNNSSG--WDE
        :...:   .: :...:..:.  .::.:: ::::.  ....  :::. : . . :  : :
CCDS45 -WADSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGE
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pF1KA1 SSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPPATGKPPGTGWLG
       . :: :.:.:.. :..:.  .:: .                       :. :  ::::.:
CCDS45 TLKPGPQQNWASKPQDNNVSNWGGA-----------------------ASVKQTGTGWIG
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pF1KA1 GPIPAPAKEE-EPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVP----
       ::.:.  :.  : :::::::: :::::::::::::::::::.:: :.::::..: :    
CCDS45 GPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQS
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pF1KA1 ------NGNSRSDQQAQVHQLLTP----ASAISNKEASSG---SGWGE-P---------W
             . .. .  .  .:.. ::    :..  :.    :   ::::: :         :
CCDS45 STTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPPHQAGTQLNRSPLLGPVSSGWGEMPNVHSKTENSW
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pF1KA1 GEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQD
       ::::.:.: :::::.::::: .:: .::.  :    .   ... :. .:: : . ::::.
CCDS45 GEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQE
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pF1KA1 GWC--GDDMPLPGNRPTGWEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLN-WPPYTKKMSSKGLSGK
       ::   ::.: :  ..   ::.::     .::. .::: .:: . :    ::  .::    
CCDS45 GWGSGGDEMNLSTSQ---WEDEEG---DVWNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKG----
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               :: ..::.:::: . ..::.....: :.  :: ..::.:.:. .:  : .:.
CCDS45 --------MKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSALLEKK
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pF1KA1 MEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPGSRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSM
       ...::..:.. :.:  ..:  : :: ::::::..:  ..:::: ...:     :. : :.
CCDS45 VDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLPSPSL
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pF1KA1 KLPPSNSALPNQALGSIA-GLGMQNLNSVRQ--NGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPP---A
       ::: :.::::.::::.:: ::::::::: ::  .:: .::: .. ::: : :::::   .
CCDS45 KLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSSRQIPSGNLGMFG-NSGAAQARTMQQPPQPPV
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       :::.::::.::::::  .::::: ..::..: .: :::: .     .::...::::: ::
CCDS45 QPLNSSQPSLRAQVPQ-FLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLTSPINPQHMTMLNQLYQL
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pF1KA1 NQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQDQQGRPLS-VQQQMMQQSRQLDPNLLV
        ::.     :::  :::  :.::.: .. : :..: .: .. .:::..:..:::   :::
CCDS45 -QLA----YQRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLV
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pF1KA1 KQQTPPSQ--QQPLHQPAMKSFLDNVMPHTT----PELQ---KGPSPINAFSNFPI-GLN
       ::  ::    .  ::  : :: .:.   :      :.::   .  :: :.:. .:. :::
CCDS45 KQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSP-NTFAPYPLAGLN
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pF1KA1 SNLNVN-MDMN---SIKEP---QSRLRKWTTVDSI----SVNTSLDQNSSKHGAISSGFR
        :.::: :::.   :.:.:   :::: .::  .:.    :. . :.:: :::::: .:. 
CCDS45 PNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPGGLS
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pF1KA1 LE-------ESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSP-----NGSSSVNWPPEFR
       .        .. .  ::....: :::::: ..  .: ::::      :::: .::::::.
CCDS45 IGPPGKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSS-INWPPEFH
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pF1KA1 PGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINT-VREVDHLRDRNSGSS--SSLNTTLPST
       :: ::::  :::::.:: :::::: .. .::: ...:..   ...:::  :: :.::::.
CCDS45 PGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGSSPPSSQNATLPSS
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pF1KA1 SAWSSIRASNYNVPLSS--TAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNT--SLAHELWKVPLPPKN
       :::  . ::.:.  .::  .: :.... :: : ::: : ...:  ::.:::::::   .:
CCDS45 SAWP-LSASGYSSSFSSIASAPSVAGKLSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHELWKVP---RN
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        :::.:::::::. ::  :::  :::    :: .:   :. ::.:. ..::: ..::::.
CCDS45 STAPTRPPPGLTNPKPS-STWGASPL----GWTSS---YSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLR
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pF1KA1 NLTPQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTI
       :::::::::::::::.:::::::::::: .:::.::::::::..::::::::::::::::
CCDS45 NLTPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTI
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CCDS45 LAEFAGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAGSSHGLV-RSDAGHWNAPCL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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