Result of FASTA (ccds) for pF1KB9906
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9906, 589 aa
  1>>>pF1KB9906 589 - 589 aa - 589 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8453+/-0.000959; mu= 4.1527+/- 0.058
 mean_var=192.2929+/-38.515, 0's: 0 Z-trim(112.4): 25  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.092490
 statistics sampled from 13133 (13148) to 13133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.404), width:  16
 Scan time:  3.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6663.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9         ( 589) 3824 522.7  5e-148
CCDS6664.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9         ( 561) 2718 375.1 1.3e-103
CCDS14374.1 UBQLN2 gene_id:29978|Hs108|chrX        ( 624) 2617 361.7 1.6e-99
CCDS1127.1 UBQLN4 gene_id:56893|Hs108|chr1         ( 601) 2029 283.2 6.4e-76
CCDS7758.1 UBQLN3 gene_id:50613|Hs108|chr11        ( 655) 1150 165.9 1.4e-40
CCDS31385.1 UBQLNL gene_id:143630|Hs108|chr11      ( 475)  641 97.9   3e-20


>>CCDS6663.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9              (589 aa)
 initn: 3824 init1: 3824 opt: 3824  Z-score: 2771.0  bits: 522.7 E(32554): 5e-148
Smith-Waterman score: 3824; 100.0% identity (100.0% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 NPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 IPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580         
pF1KB9 QNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
              550       560       570       580         

>>CCDS6664.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9              (561 aa)
 initn: 2710 init1: 2710 opt: 2718  Z-score: 1973.8  bits: 375.1 E(32554): 1.3e-103
Smith-Waterman score: 3565; 95.2% identity (95.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-561)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS66 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQM---
              370       380       390       400       410          

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 NPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 -------------------------QNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
                                420       430       440       450  

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 IPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQL
            460       470       480       490       500       510  

              550       560       570       580         
pF1KB9 QNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
            520       530       540       550       560 

>>CCDS14374.1 UBQLN2 gene_id:29978|Hs108|chrX             (624 aa)
 initn: 3022 init1: 1826 opt: 2617  Z-score: 1900.2  bits: 361.7 E(32554): 1.6e-99
Smith-Waterman score: 2931; 74.5% identity (87.1% similar) in 628 aa overlap (1-582:1-617)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
       :::.:::.:::  . . :.:.:.    ::: :::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAENGESSGPPRPSRGPAAAQGS----AAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
               10        20            30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
       ::: :::::::.::::::::::::::::::: :::::::::::::::.::::: .:.: .
CCDS14 FKEAISKRFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIHDGLTVHLVIKSQNRPQGQSTQPS
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
       :.::.:.:..::: ::::  :..:::::::.::::::::::::..:::::::::::.::.
CCDS14 NAAGTNTTSASTPRSNSTPISTNSNPFGLGSLGGLAGLSSLGLSSTNFSELQSQMQQQLM
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
       ..::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS14 ASPEMMIQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHLLNNPDIMRQTLE
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
       .::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::. 
CCDS14 IARNPAMMQEMMRNQDLALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLNAAQEQFGGNPFASVG
        240       250       260       270       280       290      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
       :..:::::.:::::::::::::::::  . .:::...:....:. .:...:...:....:
CCDS14 SSSSSGEGTQPSRTENRDPLPNPWAPPPATQSSATTSTTTSTGSGSGNSSSNATGNTVAA
        300       310       320       330       340       350      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
        : :    ::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ANYV----ASIFSTPGMQSLLQQITENPQLIQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
        360           370       380       390       400       410  

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 NPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
       .:::..::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS14 SPLFTANPQLQEQMRPQLPAFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALMQIQQGLQTLATEAPGL
            420       430       440       450       460       470  

              490                                             500  
pF1KB9 IPGFTPGLGA---------------------------------LGSTG-----GSSGTNG
       ::.::::.:.                                 .: ::     ::.:..:
CCDS14 IPSFTPGVGVGVLGTAIGPVGPVTPIGPIGPIVPFTPIGPIGPIGPTGPAAPPGSTGSGG
            480       490       500       510       520       530  

                  510       520        530        540       550    
pF1KB9 ------SNATPSENTSPTAGTTEPG-HQQFIQQMLQALAGVN-PQLQNPEVRFQQQLEQL
             :.:.:::.::::   .: : .:::::::.:::::.: ::: :::::::::::::
CCDS14 PTGPTVSSAAPSETTSPT---SESGPNQQFIQQMVQALAGANAPQLPNPEVRFQQQLEQL
            540       550          560       570       580         

          560       570       580         
pF1KB9 SAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
       .:::::::::::::::::::::::::::       
CCDS14 NAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
     590       600       610       620    

>>CCDS1127.1 UBQLN4 gene_id:56893|Hs108|chr1              (601 aa)
 initn: 1876 init1: 908 opt: 2029  Z-score: 1476.4  bits: 283.2 E(32554): 6.4e-76
Smith-Waterman score: 2337; 62.8% identity (83.2% similar) in 608 aa overlap (26-589:4-601)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
                                :..: .  :  ..:::::::.:::... . .::..
CCDS11                       MAEPSGAETRPP--IRVTVKTPKDKEEIVICDRASVKE
                                     10          20        30      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
       ::::::.:::.. :::::::::::::: :::.::::.::::::::::: .. :: .:  .
CCDS11 FKEEISRRFKAQQDQLVLIFAGKILKDGDTLNQHGIKDGLTVHLVIKTPQKAQDPAAATA
         40        50        60        70        80        90      

                      130        140                               
pF1KB9 NT--------AGSNVTTS-STPNSNSTSGSATSN---------------------PFG--
       ..        : :.. .: .:: . ::::::.:.                     : .  
CCDS11 SSPSTPDPASAPSTTPASPATPAQPSTSGSASSDAGSGSRRSSGGGPSPGAGEGSPSATA
        100       110       120       130       140       150      

        150       160       170       180       190       200      
pF1KB9 --LGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLLSNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMR
         :.:.::. ::.::::...:: :::.::::::.:::::. ::::::.::.:.:::::::
CCDS11 SILSGFGGILGLGSLGLGSANFMELQQQMQRQLMSNPEMLSQIMENPLVQDMMSNPDLMR
        160       170       180       190       200       210      

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB9 QLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIP
       ..::::::::::..::::::::::::..::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HMIMANPQMQQLMERNPEISHMLNNPELMRQTMELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIP
        220       230       240       250       260       270      

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB9 GGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLVSNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAP
       :::::::::::::::::.:::.::::.:::.::..:..:. .::: :::::.::::::.:
CCDS11 GGYNALRRMYTDIQEPMFSAAREQFGNNPFSSLAGNSDSS-SSQPLRTENREPLPNPWSP
        280       290       300       310        320       330     

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB9 QTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTAPNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITE
       .   :.. .::  .: ::. :..    . ..  . : . ..:..:::.: ::.:::::.:
CCDS11 SPPTSQAPGSGGEGT-GGS-GTSQVHPTVSNPFGIN-AASLGSGMFNSPEMQALLQQISE
         340       350         360        370       380       390  

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB9 NPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQ
       :::::::..::::::::::.:.::::.:::::.: ::::::::::::.: :::.::::::
CCDS11 NPQLMQNVISAPYMRSMMQTLAQNPDFAAQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQ
            400       410       420       430       440       450  

        450       460       470       480              490         
pF1KB9 NPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGF-------TPGLGALGSTGGSS-
       ::..:: ..:::::::::::::::::: ::::::.:..       ::. .: ::..::. 
CCDS11 NPESLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPSLGSFGISRTPAPSA-GSNAGSTP
            460       470       480       490       500        510 

       500       510       520       530        540       550      
pF1KB9 -GTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGV-NPQLQNPEVRFQQQLEQLSA
        . ..: :::. ..:::....  ..::..:::.: :::  : :.:.::::::::::::..
CCDS11 EAPTSSPATPA-TSSPTGASS--AQQQLMQQMIQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNS
             520        530         540       550       560        

        560       570       580         
pF1KB9 MGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
       :::.::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS11 MGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQLS
      570       580       590       600 

>>CCDS7758.1 UBQLN3 gene_id:50613|Hs108|chr11             (655 aa)
 initn: 1256 init1: 762 opt: 1150  Z-score: 842.0  bits: 165.9 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1222; 41.4% identity (63.5% similar) in 567 aa overlap (17-496:2-557)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
                       : :.:.    . :   .:...::::::::.::.:.: .. ..::
CCDS77                MAKGGEALPQGSPAPVQDPHLIKVTVKTPKDKEDFSVTDTCTIQQ
                              10        20        30        40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
       .:::::.:::.: :::::::::::::: :.:.: :..:::::::::: :.: . .    .
CCDS77 LKEEISQRFKAHPDQLVLIFAGKILKDPDSLAQCGVRDGLTVHLVIKRQHRAMGNECPAA
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
       ..  .. . .: :. .:   .     :.::    :.::: :::   .: .  :...:: .
CCDS77 SVPTQGPSPGSLPQPSSIYPADGPPAFSLGL---LTGLSRLGLAYRGFPDQPSSLMRQHV
         110       120       130          140       150       160  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
       : ::...:....::. ..:::  :.:::.. ::.::::::.::::.:.::::.:::::::
CCDS77 SVPEFVTQLIDDPFIPGLLSNTGLVRQLVLDNPHMQQLIQHNPEIGHILNNPEIMRQTLE
            170       180       190       200       210       220  

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
       . :::::::::.:.:::.::::::::::::.:  :::::..:::.:.::::::::::. .
CCDS77 FLRNPAMMQEMIRSQDRVLSNLESIPGGYNVLCTMYTDIMDPMLNAVQEQFGGNPFATAT
            230       240       250       260       270       280  

              310       320       330                              
pF1KB9 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSG-----------------------
       .....   ::::: :: :::::::. .:  .:.. .:                       
CCDS77 TDNATTTTSQPSRMENCDPLPNPWT-STHGGSGSRQGRQDGDQDAPDIRNRFPNFLGIIR
            290       300        310       320       330       340 

                 340       350       360                   370     
pF1KB9 ----------TASTVGGTTGSTASGTSGQSTTAPNLV------------PGVGASM----
                 . ...:    .:::. : ::   :  :            :: :  .    
CCDS77 LYDYLQQLHENPQSLGTYLQGTASALS-QSQEPPPSVNRVPPSSPSSQEPGSGQPLPEES
             350       360        370       380       390       400

                380                             390           400  
pF1KB9 FNTPGMQS---LLQQITEN----------------------PQLMQNMLSA----PYMRS
           : .:   .:.  :::                      :.:.... ..    :.   
CCDS77 VAIKGRSSCPAFLRYPTENSTGQGGDQDGAGKSSTGHSTNLPDLVSGLGDSANRVPFAPL
              410       420       430       440       450       460

            410       420                430       440       450   
pF1KB9 MMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGN---------PQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSA
        ..  .  : .     : .: .  .         ::::.... ::: .:...:     .:
CCDS77 SFSPTAAIPGIPEPPWLPSPAYPRSLRPDGMNPAPQLQDEIQPQLP-LLMHLQ-----AA
              470       480       490       500        510         

           460       470       480       490       500       510   
pF1KB9 MSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSP
       :.::::.::: ::.::::.:::::: :.  : : :.. ::..:                 
CCDS77 MANPRALQALRQIEQGLQVLATEAPRLLLWFMPCLAGTGSVAGGIESREDPLMSEDPLPN
          520       530       540       550       560       570    

           520       530       540       550       560       570   
pF1KB9 TAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQLQNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATG
                                                                   
CCDS77 PPPEVFPALDSAELGFLSPPFLHMLQDLVSTNPQQLQPEAHFQVQLEQLRSMGFLNREAN
          580       590       600       610       620       630    

>>CCDS31385.1 UBQLNL gene_id:143630|Hs108|chr11           (475 aa)
 initn: 646 init1: 239 opt: 641  Z-score: 477.0  bits: 97.9 E(32554): 3e-20
Smith-Waterman score: 762; 36.0% identity (62.5% similar) in 480 aa overlap (23-453:14-475)

               10        20           30        40        50       
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPA---AAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSS
                             .: :.   :  .   .  .: :::  ....: : .. :
CCDS31          MWHAISRTSRMSQSGCPSGLLADKNISSSATRVIVKTAGNQKDFMVADDIS
                        10        20        30        40        50 

        60        70        80        90       100         110     
pF1KB9 VQQFKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQ--NRPQDH
       :.:::: .  .:. . :::::.: : .:::.:::::.:: :: :..::::..  .:   :
CCDS31 VRQFKEMLLAHFQCQMDQLVLVFMGCLLKDHDTLSQRGIMDGHTIYLVIKSKQGSRSLAH
              60        70        80        90       100       110 

         120       130       140       150           160       170 
pF1KB9 SAQQTNTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGG----LGGLAGLSSLGLNTTNFSEL
       : ..  :   :       :....: : . .: :..     :. ..: ..  ..: :.   
CCDS31 SFRDLPT---NDPCHRDRNTKGNS-SRVHQPTGMNQAPVELAHFVGSDAPKVHTQNLE--
                120       130        140       150       160       

             180       190       200       210       220        230
pF1KB9 QSQMQRQLLSNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHML-N
               .:.::  .:..::: .: .::: ..: :.:  . . :::.:.:::.:..: .
CCDS31 --------VSHPECKAQMLENPSIQRLLSNMEFMWQFISEHLDTQQLMQQNPEVSRLLLD
                 170       180       190       200       210       

              240       250       260                  270         
pF1KB9 NPDIMRQTLELARNPAMMQEMMRNQDRALS-----------NLESIPGGYNALRRMYTDI
       : .:. :::::::: ::.::.:. :. . .           .::..::: ::: . :.::
CCDS31 NSEILLQTLELARNLAMIQEIMQIQQPSQNLEYPLNPQPYLGLETMPGGNNALGQNYADI
       220       230       240       250       260       270       

     280       290       300            310       320       330    
pF1KB9 QEPMLSAAQEQFGGNPFASLVSN-----TSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSA
       .. ::.. :. ::::::..:...     ..:.    :   :..: : .  : ..  .::.
CCDS31 NDQMLNSMQDPFGGNPFTALLAGQVLEQVQSSPPPPPPSQEQQDQLTQHPATRVIYNSSG
       280       290       300       310       320       330       

            340            350             360       370           
pF1KB9 --SSGTAST-----VGGTTGSTAS--GTSGQS----TTAPNLVPGVGASMFN--------
         ::.:...     :. :. ....  .:.:::    :  :  .:.. .  ..        
CCDS31 GFSSNTSANDTLNKVNHTSKANTAMISTKGQSHICATRQPAWIPALPSIELTQQLQEEYK
       340       350       360       370       380       390       

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB9 --TPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGNPQLQ
         : ...:  : .  . :: ... :.    .::: : .:: ::::.::    :.. :::.
CCDS31 DATVSLSSSRQTLKGDLQLSDEQSSSQITGGMMQLLMNNPYLAAQIML----FTSMPQLS
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