Result of FASTA (omim) for pF1KB4033
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4033, 1262 aa
  1>>>pF1KB4033 1262 - 1262 aa - 1262 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1339+/-0.000521; mu= 23.8931+/- 0.032
 mean_var=68.1644+/-14.438, 0's: 0 Z-trim(106.0): 60  B-trim: 85 in 1/51
 Lambda= 0.155344
 statistics sampled from 14141 (14180) to 14141 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.166), width:  16
 Scan time: 13.340

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002152 (OMIM: 600709,617093) isoleucine--tRNA l (1262) 8407 1894.6       0
NP_038203 (OMIM: 600709,617093) isoleucine--tRNA l (1262) 8407 1894.6       0
NP_060530 (OMIM: 612801,616007) isoleucine--tRNA l (1012) 1050 245.7 1.2e-63
XP_016866735 (OMIM: 192150) PREDICTED: valine--tRN ( 682)  362 91.4 2.2e-17
XP_016866736 (OMIM: 192150) PREDICTED: valine--tRN ( 682)  362 91.4 2.2e-17
NP_001304894 (OMIM: 151350,615438) leucine--tRNA l (1122)  173 49.2 0.00019
XP_011535958 (OMIM: 151350,615438) PREDICTED: leuc (1122)  173 49.2 0.00019
NP_001304893 (OMIM: 151350,615438) leucine--tRNA l (1130)  173 49.2 0.00019
NP_057544 (OMIM: 151350,615438) leucine--tRNA liga (1149)  173 49.2 0.00019
NP_064502 (OMIM: 151350,615438) leucine--tRNA liga (1176)  173 49.2  0.0002
NP_006286 (OMIM: 192150) valine--tRNA ligase [Homo (1264)  173 49.2 0.00021
XP_005249419 (OMIM: 192150) PREDICTED: valine--tRN (1265)  173 49.2 0.00021
XP_016861531 (OMIM: 604544,615300,617021) PREDICTE ( 804)  164 47.1 0.00058
XP_011531856 (OMIM: 604544,615300,617021) PREDICTE ( 830)  164 47.1  0.0006
XP_005265063 (OMIM: 604544,615300,617021) PREDICTE ( 903)  164 47.1 0.00064
NP_056155 (OMIM: 604544,615300,617021) probable le ( 903)  164 47.1 0.00064


>>NP_002152 (OMIM: 600709,617093) isoleucine--tRNA ligas  (1262 aa)
 initn: 8407 init1: 8407 opt: 8407  Z-score: 10173.3  bits: 1894.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8407; 100.0% identity (100.0% similar) in 1262 aa overlap (1-1262:1-1262)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MLQQVPENINFPAEEEKILEFWTEFNCFQECLKQSKHKPKFTFYDGPPFATGLPHYGHIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MLQQVPENINFPAEEEKILEFWTEFNCFQECLKQSKHKPKFTFYDGPPFATGLPHYGHIL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 AGTIKDIVTRYAHQSGFHVDRRFGWDCHGLPVEYEIDKTLGIRGPEDVAKMGITEYNNQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AGTIKDIVTRYAHQSGFHVDRRFGWDCHGLPVEYEIDKTLGIRGPEDVAKMGITEYNNQC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 RAIVMRYSAEWKSTVSRLGRWIDFDNDYKTLYPQFMESVWWVFKQLYDKGLVYRGVKVMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RAIVMRYSAEWKSTVSRLGRWIDFDNDYKTLYPQFMESVWWVFKQLYDKGLVYRGVKVMP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 FSTACNTPLSNFESHQNYKDVQDPSVFVTFPLEEDETVSLVAWTTTPWTLPSNLAVCVNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FSTACNTPLSNFESHQNYKDVQDPSVFVTFPLEEDETVSLVAWTTTPWTLPSNLAVCVNP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 EMQYVKIKDVARGRLLILMEARLSALYKLESDYEILERFPGAYLKGKKYRPLFDYFLKCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EMQYVKIKDVARGRLLILMEARLSALYKLESDYEILERFPGAYLKGKKYRPLFDYFLKCK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 ENGAFTVLVDNYVKEEEGTGVVHQAPYFGAEDYRVCMDFNIIRKDSLPVCPVDASGCFTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ENGAFTVLVDNYVKEEEGTGVVHQAPYFGAEDYRVCMDFNIIRKDSLPVCPVDASGCFTT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 EVTDFAGQYVKDADKSIIRTLKEQGRLLVATTFTHSYPFCWRSDTPLIYKAVPSWFVRVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EVTDFAGQYVKDADKSIIRTLKEQGRLLVATTFTHSYPFCWRSDTPLIYKAVPSWFVRVE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 NMVDQLLRNNDLCYWVPELVREKRFGNWLKDARDWTISRNRYWGTPIPLWVSDDFEEVVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NMVDQLLRNNDLCYWVPELVREKRFGNWLKDARDWTISRNRYWGTPIPLWVSDDFEEVVC
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 IGSVAELEELSGAKISDLHRESVDHLTIPSRCGKGSLHRISEVFDCWFESGSMPYAQVHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IGSVAELEELSGAKISDLHRESVDHLTIPSRCGKGSLHRISEVFDCWFESGSMPYAQVHY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 PFENKREFEDAFPADFIAEGIDQTRGWFYTLLVLATALFGQPPFKNVIVNGLVLASDGQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PFENKREFEDAFPADFIAEGIDQTRGWFYTLLVLATALFGQPPFKNVIVNGLVLASDGQK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 MSKRKKNYPDPVSIIQKYGADALRLYLINSPVVRAENLRFKEEGVRDVLKDVLLPWYNAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MSKRKKNYPDPVSIIQKYGADALRLYLINSPVVRAENLRFKEEGVRDVLKDVLLPWYNAY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 RFLIQNVLRLQKEEEIEFLYNENTVRESPNITDRWILSFMQSLIGFFETEMAAYRLYTVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RFLIQNVLRLQKEEEIEFLYNENTVRESPNITDRWILSFMQSLIGFFETEMAAYRLYTVV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 PRLVKFVDILTNWYVRMNRRRLKGENGMEDCVMALETLFSVLLSLCRLMAPYTPFLTELM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PRLVKFVDILTNWYVRMNRRRLKGENGMEDCVMALETLFSVLLSLCRLMAPYTPFLTELM
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 YQNLKVLIDPVSVQDKDTLSIHYLMLPRVREELIDKKTESAVSQMQSVIELGRVIRDRKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YQNLKVLIDPVSVQDKDTLSIHYLMLPRVREELIDKKTESAVSQMQSVIELGRVIRDRKT
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 IPIKYPLKEIVVIHQDPEALKDIKSLEKYIIEELNVRKVTLSTDKNKYGIRLRAEPDHMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IPIKYPLKEIVVIHQDPEALKDIKSLEKYIIEELNVRKVTLSTDKNKYGIRLRAEPDHMV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 LGKRLKGAFKAVMTSIKQLSSEELEQFQKTGTIVVEGHELHDEDIRLMYTFDQATGGTAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LGKRLKGAFKAVMTSIKQLSSEELEQFQKTGTIVVEGHELHDEDIRLMYTFDQATGGTAQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 FEAHSDAQALVLLDVTPDQSMVDEGMAREVINRIQKLRKKCNLVPTDEITVYYKAKSEGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FEAHSDAQALVLLDVTPDQSMVDEGMAREVINRIQKLRKKCNLVPTDEITVYYKAKSEGT
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 YLNSVIESHTEFIFTTIKAPLKPYPVSPSDKVLIQEKTQLKGSELEITLTRGSSLPGPAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YLNSVIESHTEFIFTTIKAPLKPYPVSPSDKVLIQEKTQLKGSELEITLTRGSSLPGPAC
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB4 AYVNLNICANGSEQGGVLLLENPKGDNRLDLLKLKSVVTSIFGVKNTELAVFHDETEIQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AYVNLNICANGSEQGGVLLLENPKGDNRLDLLKLKSVVTSIFGVKNTELAVFHDETEIQN
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB4 QTDLLSLSGKTLCVTAGSAPSLINSSSTLLCQYINLQLLNAKPQECLMGTVGTLLLENPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QTDLLSLSGKTLCVTAGSAPSLINSSSTLLCQYINLQLLNAKPQECLMGTVGTLLLENPL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB4 GQNGLTHQGLLYEAAKVFGLRSRKLKLFLNETQTQEITEDIPVKTLNMKTVYVSVLPTTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GQNGLTHQGLLYEAAKVFGLRSRKLKLFLNETQTQEITEDIPVKTLNMKTVYVSVLPTTA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

         
pF1KB4 DF
       ::
NP_002 DF
         

>>NP_038203 (OMIM: 600709,617093) isoleucine--tRNA ligas  (1262 aa)
 initn: 8407 init1: 8407 opt: 8407  Z-score: 10173.3  bits: 1894.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8407; 100.0% identity (100.0% similar) in 1262 aa overlap (1-1262:1-1262)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MLQQVPENINFPAEEEKILEFWTEFNCFQECLKQSKHKPKFTFYDGPPFATGLPHYGHIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 MLQQVPENINFPAEEEKILEFWTEFNCFQECLKQSKHKPKFTFYDGPPFATGLPHYGHIL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 AGTIKDIVTRYAHQSGFHVDRRFGWDCHGLPVEYEIDKTLGIRGPEDVAKMGITEYNNQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 AGTIKDIVTRYAHQSGFHVDRRFGWDCHGLPVEYEIDKTLGIRGPEDVAKMGITEYNNQC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 RAIVMRYSAEWKSTVSRLGRWIDFDNDYKTLYPQFMESVWWVFKQLYDKGLVYRGVKVMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 RAIVMRYSAEWKSTVSRLGRWIDFDNDYKTLYPQFMESVWWVFKQLYDKGLVYRGVKVMP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 FSTACNTPLSNFESHQNYKDVQDPSVFVTFPLEEDETVSLVAWTTTPWTLPSNLAVCVNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 FSTACNTPLSNFESHQNYKDVQDPSVFVTFPLEEDETVSLVAWTTTPWTLPSNLAVCVNP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 EMQYVKIKDVARGRLLILMEARLSALYKLESDYEILERFPGAYLKGKKYRPLFDYFLKCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 EMQYVKIKDVARGRLLILMEARLSALYKLESDYEILERFPGAYLKGKKYRPLFDYFLKCK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 ENGAFTVLVDNYVKEEEGTGVVHQAPYFGAEDYRVCMDFNIIRKDSLPVCPVDASGCFTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 ENGAFTVLVDNYVKEEEGTGVVHQAPYFGAEDYRVCMDFNIIRKDSLPVCPVDASGCFTT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 EVTDFAGQYVKDADKSIIRTLKEQGRLLVATTFTHSYPFCWRSDTPLIYKAVPSWFVRVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 EVTDFAGQYVKDADKSIIRTLKEQGRLLVATTFTHSYPFCWRSDTPLIYKAVPSWFVRVE
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB4 DF
       ::
NP_038 DF
         

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pF1KB4 CHGLPVEYEIDKTLGIRGPEDVAKMGITEYNNQCRAIVMRYSAEWKSTVSRLGRWIDFDN
       :::::.: .. . :: :  .... :   :  .. :...     . ::.  : :   :..:
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pF1KB4 LILMEARLSALYK-LESDYEILERFPGAYLK-GKKYRPLFDYFLKCKENGAFTVLVDNYV
        .:   ..... . ::. .: .  . :. :. :   .::.        . :  .:  :.:
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pF1KB4 KEEEGTGVVHQAPYFGAEDYRVCMDFNIIRKDSLPV-CPVDASGCFTTEVTDFAGQYVKD
          .:::.:: ::  : ::: :  . :      ::. : :: .: ::    : ::  ...
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pF1KB4 LRNNDLCYWVPELVREKRF--GNWLK------DARD-WTISRNRYWGTPIPLWVSDDFEE
          .:.   . ::... .:  :. :.      : :  : :::.: ::.:::..     .:
NP_060 ---TDIKTAAKELLKKVKFIPGSALNGMVEMMDRRPYWCISRQRVWGVPIPVFHHKTKDE
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pF1KB4 VVCIGS-----VAELEELSGAKIS-DLHRESVDHLTIPSRCG-KGSLHRI--SEVFDCWF
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NP_060 YL-INSQTTEHIVKLVEQHGSDIWWTLPPEQLLPKEVLSEVGGPDALEYVPGQDILDIWF
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pF1KB4 ESGSMPYAQVHYPFENKREFEDAFPADFIAEGIDQTRGWFYTLLVLATALFGQPPFKNVI
       .::.  .. :  :  ..:       ::.  :: ::  ::: . :. ..:   . :.:.::
NP_060 DSGT-SWSYV-LPGPDQR-------ADLYLEGKDQLGGWFQSSLLTSVAARKRAPYKTVI
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pF1KB4 VNGLVLASDGQKMSKRKKN--YPDPV-------SIIQKYGADALRLYLINSPVVRAENLR
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NP_060 VHGFTLGEKGEKMSKSLGNVIHPDVVVNGGQDQSKEPPYGADVLRWWVADSNVFTEVAIG
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pF1KB4 FKEEGVRDVLKDVLLPWYNAYRFLIQNVLRLQKEEEIEFLYNENTVRESPNITDRWILSF
           .: .. .: .    :. :::. ::  .. :       ...   ..  . :...: .
NP_060 ---PSVLNAARDDISKLRNTLRFLLGNVADFNPE-------TDSIPVNDMYVIDQYMLHL
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pF1KB4 MQSLIGFFETEMAAYRLYTVVPRLVK--FVDILTNWYVRMNRRRL--KGENGME--DCVM
       .:.: . . ::.     .  : ::..  ..  :.:.:  . . ::  . ::  .  .:  
NP_060 LQDLANKI-TELYKQYDFGKVVRLLRTFYTRELSNFYFSIIKDRLYCEKENDPKRRSCQT
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pF1KB4 ALETLFSVLLSLCRLMAPYTPFLTELMYQNLKVLIDPVSVQDKDTLSIHYLMLPRVREEL
       ::  ...:..   : .::  : :.: ..:..  . .: ::     .:   .     ..  
NP_060 ALVEILDVIV---RSFAPILPHLAEEVFQHIPYIKEPKSVFRTGWISTSSIW----KKPG
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pF1KB4 IDKKTESAVSQMQSVIEL--GRVIRDRKTIPIKYP--LKEIVVIHQDPEALKDIKSLEKY
       ... .::: .. .: .    :.   . :.: .  :  : ::. . :. :           
NP_060 LEEAVESACAMRDSFLGSIPGKNAAEYKVITVIEPGLLFEIIEMLQSEETSSTSQLNELM
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pF1KB4 IIEELNVRKVTLSTDKNKYGIRLRAEPDHMVLGKRLKGAFKAVMTSIKQLSSEELEQFQK
                                                                   
NP_060 MASESTLLAQEPREMTADVIELKGKFLINLEGGDIREESSYKVIVMPTTKEKCPRCWKYT
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pF1KB4 EGIDQTRGWFYTLLVLATALFGQPPFK---NVIVNGLVLASDGQKMSKRKKNYPDPVSII
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NP_001 SGKDLVPNHLSYYLYNHVAMWPEQSDKWPTAVRANGHLLL-NSEKMSKSTGNFLTLTQAI
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         .  :..          :: :  ::  ::   .  :         :   .. .      
NP_001 IAALRDLKKKQALRAKYGIRDDMVLPFEPVPVIEIPGFGNLSAVTICDELKIQSQNDREK
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                                370       380       390       400  
pF1KB4 ----------------------FAGQYVKDADKSIIRTLKEQGRLLVATTFTHSYPFCWR
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NP_001 LAEAKEKIYLKGFYEGIMLVDGFKGQKVQDVKKTIQKKMIDAGDALIY--MEPEKQVMSR
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pF1KB4 SDTPLIYKAVPSWFVRV--EN---MVDQLLRNNDLCYWVPELVR--EKRFGNWLKDARDW
       :.   .     .:..    ::   ...: :.:  :  .  :  :  :  .: ::..    
NP_001 SSDECVVALCDQWYLDYGEENWKKQTSQCLKN--LETFCEETRRNFEATLG-WLQEH---
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pF1KB4 TISRNRYWGTPIPL---WVSDDFEE---VVCIGSVAELEELSGAKISDLHRESVDHLTI-
       . ::.   :: .:    :. ... .    . . .::.:  :.:.   .:: .. . : : 
NP_001 ACSRTYGLGTHLPWDEQWLIESLSDSTIYMAFYTVAHL--LQGG---NLHGQAESPLGIR
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pF1KB4 PSRCGKGSLHRISEVFD-CWFESGSMPYAQVHYPFEN--KREFEDAFPADFIAEGIDQTR
       :..  :       ::.:  .:. . .: .:.     .  :.:::  .:.:. . : : . 
NP_001 PQQMTK-------EVWDYVFFKEAPFPKTQIAKEKLDQLKQEFEFWYPVDLRVSGKDLVP
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pF1KB4 GWFYTLLVLATALFGQPPFK---NVIVNGLVLASDGQKMSKRKKNYPDPVSIIQKYGADA
       . .   :   .:.. .   :    : .:: .:  ...::::   :.   .. :.:..::.
NP_001 NHLSYYLYNHVAMWPEQSDKWPTAVRANGHLLL-NSEKMSKSTGNFLTLTQAIDKFSADG
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pF1KB4 LRLYLINSPVVRAENLRFKEEGVRDVLKDVLLPWYNAYRFLIQNVLRLQKEEEIEFLYNE
       .:: : ..  . .:.  : : .. :.    :  : .  .               :.. : 
NP_001 MRLALADAGDT-VEDANFVE-AMADAGILRLYTWVEWVK---------------EMVANW
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pF1KB4 NTVRESPNIT--DRWILSFMQSLIGFFETEMAAYRLYTVVPRLVKFVDILTNWYVRMNRR
       ...: .:  :  :: . : ...  :...:..   ...        : . : . . ...  
NP_001 DSLRSGPASTFNDRVFASELNA--GIIKTDQNYEKMM--------FKEALKTGFFEFQAA
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pF1KB4 RLKG-ENGMEDCVMALETLFSVLLSLCRLMAPYTPFLTELMYQNLKVLIDPVSVQDKDTL
       . :  : ..:   :  : .:  .     :.::. : : : ..    .:  : :.     .
NP_001 KDKYRELAVEG--MHRELVFRFIEVQTLLLAPFCPHLCEHIWT---LLGKPDSI-----M
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pF1KB4 SIHYLMLPRVREELIDKKTESAVSQMQSVIELGRVIRDRKTIPIKYPLKEIVVIHQDPEA
       .  . .   : : :: ..        : ..:. . .: :    .:  .      . : . 
NP_001 NASWPVAGPVNEVLIHSS--------QYLMEVTHDLRLR----LKNYMMPAKGKKTDKQP
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pF1KB4 LKDIKSLEKYIIEELNV-RKVTLSTDKNKYGIRLRAEPDHMVLGKRLKGA--FKAVMTSI
       :.  .    :. ..    ...:::. ....       ::. :....: .   .:  : ..
NP_001 LQKPSHCTIYVAKNYPPWQHTTLSVLRKHFEANNGKLPDNKVIASELGSMPELKKYMKKV
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pF1KB4 KQLSSEELEQFQKTGTIVVEGHELHDEDIRLMYTFDQATGGTA--QFEAH--SDAQALVL
         . .   :...: :  ... .   ::   :: ..   :..    ..:..  :.:.  . 
NP_001 MPFVAMIKENLEKMGPRILDLQLEFDEKAVLMENIVYLTNSLELEHIEVKFASEAEDKIR
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pF1KB4 LDVTPDQSM----VDEGMAREVINRIQKLRKKCNLVPTDEITVYYKAKSEGTYLNSVIES
        :  : . .    .. :..  ..:                                    
NP_001 EDCCPGKPLNVFRIEPGVSVSLVNPQPSNGHFSTKIEIRQGDNCDSIIRRLMKMNRGIKD
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>>NP_057544 (OMIM: 151350,615438) leucine--tRNA ligase,   (1149 aa)
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NP_057 KSLGLSDEEIVKFSEAEHWLDYFPPLAIQDLKRMGLKVDWRRSFITTDVNPYYDSFVRWQ
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pF1KB4 FKQLYDKGLVYRGVKVMPFSTACNTPLSNFESH-------QNYKDVQDPSVFVTFPLE--
       :  : ... .  : .   .:   . :  . . .       :.:  ..  .:.  .: .  
NP_057 FLTLRERNKIKFGKRYTIYSPKDGQPCMDHDRQTGEGVGPQEYTLLKL-KVLEPYPSKLS
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pF1KB4 --EDETVSLVAWTTTPWTLPSNLAVCVNPEMQYVKIKDVARGRLLILME--ARLSALYKL
         . ... ::: :  : :. ..    : :.:.:. .. :  : ..:  .  ::  .   .
NP_057 GLKGKNIFLVAATLRPETMFGQTNCWVRPDMKYIGFETVN-GDIFICTQKAARNMSYQGF
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pF1KB4 ESD---YEILERFPGAYLKGKKYR-PLFDYFLKCKENGAFTVLVDNYVKEEEGTGVVHQA
        .:     ..... :  . : .   :: .:        .. ::    .::..::::: ..
NP_057 TKDNGVVPVVKELMGEEILGASLSAPLTSY-------KVIYVLPMLTIKEDKGTGVVTSV
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pF1KB4 PYFGAEDYRVCMDFNI---------IRKDS-LPVCPV---DASG---------CFTTEVT
       :  . .:  .  :..          :: :  ::  ::   .  :         :   .. 
NP_057 PSDSPDDIAALRDLKKKQALRAKYGIRDDMVLPFEPVPVIEIPGFGNLSAVTICDELKIQ
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pF1KB4 D----------------------------FAGQYVKDADKSIIRTLKEQGRLLVATTFTH
       .                            : :: :.:. :.: . . . :  :.   .  
NP_057 SQNDREKLAEAKEKIYLKGFYEGIMLVDGFKGQKVQDVKKTIQKKMIDAGDALIY--MEP
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pF1KB4 SYPFCWRSDTPLIYKAVPSWFVRV--EN---MVDQLLRNNDLCYWVPELVR--EKRFGNW
             ::.   .     .:..    ::   ...: :.:  :  .  :  :  :  .: :
NP_057 EKQVMSRSSDECVVALCDQWYLDYGEENWKKQTSQCLKN--LETFCEETRRNFEATLG-W
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pF1KB4 LKDARDWTISRNRYWGTPIPL---WVSDDFEE---VVCIGSVAELEELSGAKISDLHRES
       :..    . ::.   :: .:    :. ... .    . . .::.:  :.:   ..:: ..
NP_057 LQEH---ACSRTYGLGTHLPWDEQWLIESLSDSTIYMAFYTVAHL--LQG---GNLHGQA
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pF1KB4 VDHLTI-PSRCGKGSLHRISEVFD-CWFESGSMPYAQVHYPFEN--KREFEDAFPADFIA
        . : : :..  :       ::.:  .:. . .: .:.     .  :.:::  .:.:. .
NP_057 ESPLGIRPQQMTK-------EVWDYVFFKEAPFPKTQIAKEKLDQLKQEFEFWYPVDLRV
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pF1KB4 EGIDQTRGWFYTLLVLATALFGQPPFK---NVIVNGLVLASDGQKMSKRKKNYPDPVSII
        : : . . .   :   .:.. .   :    : .:: .:  ...::::   :.   .. :
NP_057 SGKDLVPNHLSYYLYNHVAMWPEQSDKWPTAVRANGHLLL-NSEKMSKSTGNFLTLTQAI
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pF1KB4 QKYGADALRLYLINSPVVRAENLRFKEEGVRDVLKDVLLPWYNAYRFLIQNVLRLQKEEE
       .:..::..:: : ..  . .:.  : : .. :.    :  : .  .              
NP_057 DKFSADGMRLALADAGDT-VEDANFVE-AMADAGILRLYTWVEWVK--------------
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pF1KB4 IEFLYNENTVRESPNIT--DRWILSFMQSLIGFFETEMAAYRLYTVVPRLVKFVDILTNW
        :.. : ...: .:  :  :: . : ...  :...:..   ...      . : .. .  
NP_057 -EMVANWDSLRSGPASTFNDRVFASELNA--GIIKTDQNYEKMMFKEALKTGFFEFQA--
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pF1KB4 YVRMNRRRLKGENGMEDCVMALETLFSVLLSLCRLMAPYTPFLTELMYQNLKVLIDPVSV
        .. . :.:  : ::.      : .:  .     :.::. : : : ..    .:  : :.
NP_057 -AKDKYRELAVE-GMHR-----ELVFRFIEVQTLLLAPFCPHLCEHIWT---LLGKPDSI
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pF1KB4 QDKDTLSIHYLMLPRVREELIDKKTESAVSQMQSVIELGRVIRDRKTIPIKYPLKEIVVI
            ..  . .   : : :: ..        : ..:. . .: :    .:  .      
NP_057 -----MNASWPVAGPVNEVLIHSS--------QYLMEVTHDLRLR----LKNYMMPAKGK
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pF1KB4 HQDPEALKDIKSLEKYIIEELNV-RKVTLSTDKNKYGIRLRAEPDHMVLGKRLKGA--FK
       . : . :.  .    :. ..    ...:::. ....       ::. :....: .   .:
NP_057 KTDKQPLQKPSHCTIYVAKNYPPWQHTTLSVLRKHFEANNGKLPDNKVIASELGSMPELK
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pF1KB4 AVMTSIKQLSSEELEQFQKTGTIVVEGHELHDEDIRLMYTFDQATGGTA--QFEAH--SD
         : ..  . .   :...: :  ... .   ::   :: ..   :..    ..:..  :.
NP_057 KYMKKVMPFVAMIKENLEKMGPRILDLQLEFDEKAVLMENIVYLTNSLELEHIEVKFASE
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pF1KB4 AQALVLLDVTPDQSM----VDEGMAREVINRIQKLRKKCNLVPTDEITVYYKAKSEGTYL
       :.  .  :  : . .    .. :..  ..:                              
NP_057 AEDKIREDCCPGKPLNVFRIEPGVSVSLVNPQPSNGHFSTKIEIRQGDNCDSIIRRLMKM
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>>NP_064502 (OMIM: 151350,615438) leucine--tRNA ligase,   (1176 aa)
 initn: 117 init1:  73 opt: 173  Z-score: 200.6  bits: 49.2 E(85289): 0.0002
Smith-Waterman score: 204; 20.9% identity (47.2% similar) in 960 aa overlap (135-992:192-1073)

          110       120       130       140       150         160  
pF1KB4 PEDVAKMGITEYNNQCRAIVMRYSAEWKSTVSRLGRWIDFDNDYKT--LYPQFMESVWWV
                                     ..:.:  .:.  .. :  . : .   : : 
NP_064 KSLGLSDEEIVKFSEAEHWLDYFPPLAIQDLKRMGLKVDWRRSFITTDVNPYYDSFVRWQ
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