Result of FASTA (ccds) for pF1KB4124
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4124, 993 aa
  1>>>pF1KB4124 993 - 993 aa - 993 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0582+/-0.0014; mu= -7.9557+/- 0.082
 mean_var=347.0512+/-74.403, 0's: 0 Z-trim(106.7): 672  B-trim: 103 in 1/52
 Lambda= 0.068846
 statistics sampled from 8382 (9162) to 8382 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.281), width:  16
 Scan time:  4.570

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6           ( 998) 6712 682.4 1.2e-195
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1016) 4454 458.2 3.9e-128
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1015) 4453 458.1 4.2e-128
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2           ( 986) 4392 452.0 2.7e-126
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3           ( 983) 4315 444.4 5.4e-124
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 987) 3966 409.7 1.5e-113
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 986) 3958 408.9 2.6e-113
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1          (1055) 3957 408.8 2.9e-113
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3          ( 984) 3861 399.3  2e-110
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3           ( 998) 3655 378.8  3e-104
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7           ( 987) 3217 335.3 3.7e-91
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1            (1005) 2690 283.0 2.1e-75
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7           ( 976) 2599 273.9 1.1e-72
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3          ( 539) 2250 239.1 1.9e-62
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1037) 2127 227.1 1.5e-58
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1038) 2127 227.1 1.5e-58
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1004) 2004 214.8 6.9e-55
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1       (1008) 1987 213.1 2.2e-54
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6          ( 279) 1895 203.6 4.7e-52
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1            ( 976) 1888 203.3   2e-51
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1          ( 495) 1761 190.5 7.4e-48
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3        (1130) 1476 162.4 4.6e-39
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7           (1022) 1269 141.8 6.6e-33
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1         ( 295) 1215 136.0 1.1e-31
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7          ( 729)  964 111.4 6.8e-24
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 504)  761 91.1   6e-18
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 505)  761 91.1   6e-18
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 525)  761 91.1 6.2e-18
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 526)  761 91.2 6.2e-18
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 537)  742 89.3 2.3e-17
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18          ( 543)  742 89.3 2.3e-17
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8            (1052)  748 90.1 2.6e-17
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8           (1065)  748 90.1 2.6e-17
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20           ( 536)  738 88.9 3.1e-17
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6             ( 505)  735 88.6 3.6e-17
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 534)  733 88.4 4.3e-17
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1370)  742 89.6 4.7e-17
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1382)  742 89.6 4.8e-17
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5            ( 453)  727 87.7 5.7e-17
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8            ( 491)  723 87.4   8e-17
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8             ( 512)  723 87.4 8.3e-17
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1              ( 509)  722 87.3 8.8e-17
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5             ( 822)  727 87.9   9e-17
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 694)  719 87.1 1.4e-16
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 752)  719 87.1 1.5e-16
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 764)  719 87.1 1.5e-16
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 822)  719 87.1 1.6e-16
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 482)  713 86.4 1.6e-16
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4             ( 631)  710 86.1 2.4e-16
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4             ( 527)  704 85.5 3.1e-16


>>CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6                (998 aa)
 initn: 3688 init1: 3688 opt: 6712  Z-score: 3626.1  bits: 682.4 E(32554): 1.2e-195
Smith-Waterman score: 6712; 99.5% identity (99.5% similar) in 998 aa overlap (1-993:1-998)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLLLDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLLLDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 LDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 ETFNLYYYETDYDTGRNIRENLYVKIDTIAADESFTQGDLGERKMKLNTEVREIGPLSKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 ETFNLYYYETDYDTGRNIRENLYVKIDTIAADESFTQGDLGERKMKLNTEVREIGPLSKK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 GFYLAFQDVGACIALVSVKVYYKKCWSIIENLAIFPDTVTGSEFSSLVEVRGTCVSSAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 GFYLAFQDVGACIALVSVKVYYKKCWSIIENLAIFPDTVTGSEFSSLVEVRGTCVSSAEE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 EAENAPRMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDTCEPCGRGFYKSSSQDLQCSRCPTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EAENAPRMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDTCEPCGRGFYKSSSQDLQCSRCPTHS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 FSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAPQNLIFNINQTTVSLEWSPPADNGGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 FSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAPQNLIFNINQTTVSLEWSPPADNGGR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 NDVTYRILCKRCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGLEDNYVTVMDLLAHANYTFEVEAVNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 NDVTYRILCKRCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGLEDNYVTVMDLLAHANYTFEVEAVNG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 VSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVITEYEIKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 VSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVITEYEIKY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530          
pF1KB4 YEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVATLEEAT-
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS50 YEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVATLEEATG
              490       500       510       520       530       540

         540       550       560       570       580       590     
pF1KB4 ----ATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYFHF
           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KMFEATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYFHF
              550       560       570       580       590       600

         600       610       620       630       640       650     
pF1KB4 KFPGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KFPGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRDV
              610       620       630       640       650       660

         660       670       680       690       700       710     
pF1KB4 AVAIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENGALD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AVAIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENGALD
              670       680       690       700       710       720

         720       730       740       750       760       770     
pF1KB4 AFLRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AFLRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS
              730       740       750       760       770       780

         780       790       800       810       820       830     
pF1KB4 RVIEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 RVIEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDM
              790       800       810       820       830       840

         840       850       860       870       880       890     
pF1KB4 SNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIRNPNSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIRNPNSL
              850       860       870       880       890       900

         900       910       920       930       940       950     
pF1KB4 KTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTI
              910       920       930       940       950       960

         960       970       980       990   
pF1KB4 EDVMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EDVMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV
              970       980       990        

>>CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4               (1016 aa)
 initn: 4295 init1: 3045 opt: 4454  Z-score: 2413.9  bits: 458.2 E(32554): 3.9e-128
Smith-Waterman score: 4454; 65.2% identity (86.5% similar) in 985 aa overlap (6-985:37-1011)

                                        10        20        30     
pF1KB4                          MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLL
                                     : : :  :     ::   :  :. ..:: :
CCDS75 RGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALR---TLLASPSNEVNL
         10        20        30        40        50           60   

          40        50        60        70        80        90     
pF1KB4 LDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISGLDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNA
       :::.. . .: ::. : ::::::. .::::.::.:::::.::: :::::: :.:::. .:
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CCDS24   MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVS
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CCDS24 IMDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTC
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       ::::::::::.: :  : :::: .:::::::::::::: :.:.: ::::::.:..:::::
CCDS24 KETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSK
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       :::::::::::::::::::.:.::::   ..::: ::::.::.. ::::::::.::...:
CCDS24 KGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNSE
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       :  ...:.:.:.:.::::::::.:.:.::.....  :. :  :.::. : :  :..:: :
CCDS24 E--KDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPH
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       :.:  ::.. : :. :..:: .:   . :::::::: ::: :.:.:.:.:::: : ..::
CCDS24 SYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGG
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       :.:..: ..::.: . . ..: ::::.. : :::.::. . :.. :::::.:::::. ::
CCDS24 RQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAV
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       ::::  . .    ..:..::.:::::... :. ..: . :: :.: ::..::::: :::.
CCDS24 NGVSKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYEV
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       ::::::: ::.:  :.: . ...:..:.: : :::..:: ::::::..:  :.:.: . .
CCDS24 KYYEKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTT-NTV
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        .  ...  : ....  :.:.:...:: ... .:.:.::.  :::: ::.::: ...   
CCDS24 PSRIIGDGANSTVLL--VSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEKHLN---
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        :..::.:: ::::::.::..::::.::::::::.:::.::::::::::::.::::.. :
CCDS24 QGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPGKREICV
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       ::::::.:::.::::::: ::::::::::::..:::::::. :::::. :.::::.::::
CCDS24 AIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAF
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       :::.::.:::::::::::::..::.::.::.:::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS24 LRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRV
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       .::::::.::: :::::.:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSN
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pF1KB4 QDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIRNPNSLKT
       :::::::::::::: ::::: .:::::::::::::..:::: :::..:::.:::::::: 
CCDS24 QDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKR
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pF1KB4 PLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTIED
            ::: . ::: ..:.:..  :::.:::::::.:::::::::::..::.:.... ::
CCDS24 TGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQED
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pF1KB4 VMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV
       .  .::: . ::.::.::.:.::.:: ..::  . :
CCDS24 LARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
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CCDS29 VDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCK
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       :::::::.:.: : : ..::. ..::::::::::::: :::.: .:::::.::.::..::
CCDS29 ETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKK
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       ::::::::::::.:::::.::.:::   ..:::.:::::   . .:::::::.::....:
CCDS29 GFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-MDSQSLVEVRGSCVNNSKE
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pF1KB4 EAENAPRMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDTCEPCGRGFYKSSSQDLQCSRCPTHS
         :. :::.::.::::::::::: :.:::...:  :. :  ::::. . ...:..:: ::
CCDS29 --EDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHS
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        ....::  :.::..:.:: .::: .:::::::.:.:.: :::.:.: :.:: : :.:::
CCDS29 STQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGR
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       .:::. :.::.:.:.  .: ::. :. ..:.: :: .. ::: :::::.:::::..::::
CCDS29 KDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNG
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pF1KB4 VSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVITEYEIKY
       ::.::   : ::::::::.::::: :  . :.:. . :. :::::::::::.: .::.::
CCDS29 VSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKY
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pF1KB4 YEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVATLEEATA
       :::...: .:. .....:...:..::: :.::::::: ::::::. : ...  :  .. .
CCDS29 YEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFS
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pF1KB4 TAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYF---HFKF
         .:.:.. :..::. :... :.:. ...  .:::  :::..     ...:.:   :.:.
CCDS29 --ISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIY-VLIGR-FCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKL
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pF1KB4 PGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRDVAV
       :: .::.::.:::::..:::.:::::::. :.:..:.::::::::::::::::.:....:
CCDS29 PGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISV
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pF1KB4 AIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENGALDAF
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CCDS29 AIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSF
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pF1KB4 LRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRV
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CCDS29 LRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRV
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pF1KB4 IEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSN
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CCDS29 LEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSN
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       . ..:.:.:: ::::.:::.....:           
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CCDS23 FDVVSQMMMEDILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV  
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CCDS22 NAEEV--DVPIKLYCNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEAC
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pF1KB4 SRCPTHSFSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAPQNLIFNINQTTVSLEWSP
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CCDS22 THCPINSRTTSEGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTP
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CCDS22 EIQAVNGVTDQSPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVI
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pF1KB4 TEYEIKYYEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVA
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CCDS22 LDYELQYYEKELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQ
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pF1KB4 TLEEATATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYF
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CCDS22 TMTEAEYQTSIQEKLPLIIGS--SAAGLVFLIAVVVIAIVCNRR-GFERADSEYTDKLQ-
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CCDS22 HYTSGHMTPGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKL
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pF1KB4 PGKRDVAVAIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFM
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CCDS22 PGKREIFVAIKTLKSGYTEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFM
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CCDS22 ENGSLDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKV
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       ::::::: .:::  . .::.. :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SDFGLSRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSY
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CCDS22 GERPYWDMTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDK
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CCDS22 MIRNPNSLKA-MAPLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTS
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       .. :..: .::.. .:.::.::::::..:::.::::: ..... .  
CCDS22 FDVVSQMMMEDILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV  
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CCDS81 VSRSGFYLAFQDYGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIA
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pF1KB4 SAEEEAENAP-RMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQ--QKGDTCEPCGRGFYKSSSQDLQC
       .:::   ..: ...:...::::::::.:.::::..  ..: .:. :  : .:... :  :
CCDS81 NAEEV--DVPIKLYCNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEAC
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CCDS81 THCPINSRTTSEGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTP
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pF1KB4 EVEAVNGVSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVI
       :..:::::.: :  .  ::.:.:::.::::: :: . .      :. :::..:..:::::
CCDS81 EIQAVNGVTDQSPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVI
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pF1KB4 TEYEIKYYEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVA
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CCDS81 LDYELQYYEKELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQ
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pF1KB4 TLEEATATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYF
       :. ::   .  .:. :.:: .  ..:: ..:. .:   :.  :. :. .::.:  ..:  
CCDS81 TMTEAEYQTSIQEKLPLIIGS--SAAGLVFLIAVVVIAIVCNRR-GFERADSEYTDKLQ-
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pF1KB4 HFK----FPGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKL
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CCDS81 HYTSGHMTPGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKL
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       ::::.. ::::::: ::::::::::: :::::::::::::.:::::::.. ::::. :::
CCDS81 PGKREIFVAIKTLKSGYTEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFM
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       ::::::: .:::  . .::.. :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SDFGLSRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSY
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pF1KB4 MIRNPNSLKTPLGTCSRPIS-PLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNS
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CCDS46 YDENLNTIRTYQVCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCK
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CCDS46 ETFNLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGP
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CCDS46 LTRNGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIP
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pF1KB4 SAEEEAENAP-RMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDT-CEPCGRGFYKSSSQDLQCS
       .:::   ..: ...:...:::.::::.: :: ::. .... :. :  : .:.:..   ::
CCDS46 NAEEV--DVPIKLYCNGDGEWMVPIGRCTCKPGYEPENSVACKACPAGTFKASQEAEGCS
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pF1KB4 RCPTHSFSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAPQNLIFNINQTTVSLEWSPP
       .::..: :  :.:  : :. :::::  ::: ::::  ::.:.:.:  .:.:.. ::: ::
CCDS46 HCPSNSRSPAEASPICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPP
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pF1KB4 ADNGGRNDVTYRILCKRCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGLEDNYVTVMDLLAHANYTFE
        ..:::.:::: :.::.:  ..  :  : .:. ..:.: :: .  :.. .: ::. :::.
CCDS46 RETGGRDDVTYNIICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFD
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pF1KB4 VEAVNGVSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVIT
       ..:.::::. :      ..:.:::.::::: :  . .  . .::. ::: .::.:::.: 
CCDS46 IQAINGVSSKSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIIL
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pF1KB4 EYEIKYYEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVAT
       .:::.::::.. : . : .......: :..:.:: ::: :.:: :.::::..: ..   :
CCDS46 DYEIRYYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQT
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pF1KB4 LEEATATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYFH
       : .    .   :: :  .::  :.::....: .:   :.  :. .:::    .:.  .. 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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