Result of FASTA (ccds) for pF1KE1434
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1434, 784 aa
  1>>>pF1KE1434     784 - 784 aa - 784 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7763+/-0.00125; mu= 18.1354+/- 0.074
 mean_var=109.6179+/-22.727, 0's: 0 Z-trim(101.8): 183  B-trim: 254 in 1/52
 Lambda= 0.122499
 statistics sampled from 6535 (6752) to 6535 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.202), width:  16
 Scan time:  1.760

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs109|chr4            ( 784) 5157 923.8       0
CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs109|chr4          ( 811) 1205 225.3 3.1e-58
CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs109|chr4           ( 786) 1182 221.3 5.1e-57
CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs109|chr4           ( 796) 1174 219.8 1.4e-56
CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX          (1041)  529 106.0 3.4e-22
CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX          (1059)  529 106.0 3.5e-22
CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs109|chrX          (1049)  525 105.3 5.6e-22
CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs109|chr9            ( 839)  512 102.9 2.4e-21
CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs109|chr4            ( 904)  404 83.8 1.4e-15
CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs109|chr1           ( 858)  358 75.7 3.7e-13


>>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs109|chr4                 (784 aa)
 initn: 5157 init1: 5157 opt: 5157  Z-score: 4933.9  bits: 923.8 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 5157; 100.0% identity (100.0% similar) in 784 aa overlap (1-784:1-784)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 IDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECLELRDTDLDTFHFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECLELRDTDLDTFHFS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 DRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLSQHLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLSQHLK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 SLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLTLKNLTNIDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLTLKNLTNIDI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 SKNSFHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRIHSVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SKNSFHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRIHSVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQLK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 ELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 FLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 FLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 QELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 QELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 HFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 HFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRA
              730       740       750       760       770       780

           
pF1KE1 AIKS
       ::::
CCDS37 AIKS
           

>>CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs109|chr4               (811 aa)
 initn: 812 init1: 515 opt: 1205  Z-score: 1159.1  bits: 225.3 E(33420): 3.1e-58
Smith-Waterman score: 1234; 30.9% identity (62.7% similar) in 789 aa overlap (13-782:9-775)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
                   .. :.     ..   :  .:. . . :. :: ..:. :: :. .::::
CCDS34     MRLIRNIYIFCSIVMTAEGDAPELPEERELMTNCSNMSLRKVPADLTPATTTLDLS
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
        : .  ...::..   .:..:.:  : :. ..  .:     :..:::: : :.  : .:.
CCDS34 YNLLFQLQSSDFHSVSKLRVLILCHNRIQQLDLKTFEFNKELRYLDLSNNRLK--SVTWY
         60        70        80        90       100         110    

              130       140       150       160       170          
pF1KE1 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLE--E
         :..: .:.:  : . :.      .....:.:: ...    .:::..::  .. :.   
CCDS34 L-LAGLRYLDLSFNDFDTMPICEEAGNMSHLEILGLSG----AKIQKSDFQKIAHLHLNT
           120       130       140       150           160         

      180       190       200        210       220       230       
pF1KE1 LEIDASDLQSYEPKSLKSIQNVS-HLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECLELRDTDLDTF
       . .    :  ::  ::  ..... :..: :  .. .:  . :  .. . ::. . :  . 
CCDS34 VFLGFRTLPHYEEGSLPILNTTKLHIVLPMDTNFWVL--LRDGIKTSKILEMTNIDGKSQ
     170       180       190       200         210       220       

       240          250       260       270       280       290    
pF1KE1 HFS-ELSTGET--NSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGVGN
         : :.. . .  :.  . . . .: .  ..:: ..... . : . .... . :..:   
CCDS34 FVSYEMQRNLSLENAKTSVLLLNKVDLLWDDLFLILQFVWHTS-VEHFQIRNVTFGG---
       230       240       250       260       270        280      

          300       310       320        330         340       350 
pF1KE1 FRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFY-DLSTLYSLTER--VKRITVENSKVFLV
        .:  .   .: ...   ::.  :. .: .:: . . .: :  .  .. .:. :...   
CCDS34 -KAYLDHNSFDYSNTVMRTIKLEHV-HFRVFYIQQDKIYLLLTKMDIENLTISNAQM---
            290       300        310       320       330           

             360        370       380       390       400       410
pF1KE1 PCLLSQHLKS-LEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLL
       : .:  .  . ..::....:....: .: .      : :.::::  :.: .:  ..  . 
CCDS34 PHMLFPNYPTKFQYLNFANNILTDELFKRTI---QLPHLKTLILNGNKLETLSLVS-CFA
      340       350       360          370       380       390     

              420        430       440        450       460        
pF1KE1 TLKNLTNIDISKNSF-HSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRIH-SVTGCIPKTLEILDVSNNN
       .   : ..:.:.: . :.  :.:.::: .  .::: ...  ::  :.::...:::..::.
CCDS34 NNTPLEHLDLSQNLLQHKNDENCSWPETVVNMNLSYNKLSDSVFRCLPKSIQILDLNNNQ
          400       410       420       430       440       450    

      470          480       490       500       510       520     
pF1KE1 LNLF---SLNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTL
       ..     ...:  :.:: :. : :  ::  : .  : ::.:  : : . : . ..: . .
CCDS34 IQTVPKETIHLMALRELNIAFNFLTDLPGCSHFSRLSVLNIEMNFILSPSLDFVQSCQEV
          460       470       480       490       500       510    

         530       540       550       560       570       580     
pF1KE1 KTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSEC
       :::.:: : : :.::. .: : .     ... :  .: :. : ..:: ...::.:    :
CCDS34 KTLNAGRNPFRCTCELKNFIQLETYSEVMMVGWSDSYTCEYPLNLRGTRLKDVHLHELSC
          520       530       540       550       560       570    

         590       600       610       620           630       640 
pF1KE1 HRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMM----WAWLQAKRKPRKAPSRNICY
       . . :.  .   ...: : ..  : .:   ::..:.     .: ....  ..  .::. .
CCDS34 NTALLIVTIVVIMLVLGLAVAFCCLHFDLPWYLRMLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRF
          580       590       600       610       620       630    

             650       660       670       680       690       700 
pF1KE1 DAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVF
        ::.::::.:. ::.: .. .::. .  . .::..  : ::: : .::.. ::::.:..:
CCDS34 HAFISYSEHDSLWVKNELIPNLEKEDGSILICLYESYFDPGKSISENIVSFIEKSYKSIF
          640       650       660       670       680       690    

             710       720       730       740       750       760 
pF1KE1 VLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTY
       ::: :::..:::.::. :.:  :: ::.:  ::::::::    :: :. ::. ... :.:
CCDS34 VLSPNFVQNEWCHYEFYFAHHNLFHENSDHIILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALLEKKAY
          700       710       720       730       740       750    

             770       780                                      
pF1KE1 LEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS                                  
       :::: :. .   ::.::::::                                    
CCDS34 LEWPKDRRKCGLFWANLRAAINVNVLATREMYELQTFTELNEESRGSTISLMRTDCL
          760       770       780       790       800       810 

>>CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs109|chr4                (786 aa)
 initn: 975 init1: 467 opt: 1182  Z-score: 1137.3  bits: 221.3 E(33420): 5.1e-57
Smith-Waterman score: 1248; 30.3% identity (65.2% similar) in 775 aa overlap (28-782:21-776)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
                                  :: . . .   :...:  .:. :.. .  :..:
CCDS33        MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
       .: :. . .::.    .:. :... : :. .. . :.    ::.::::.: : ..:    
CCDS33 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISC---
            60        70        80        90       100       110   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
       .:  .:  :.:  : . .:   . :.....:..: ...   . : .   .: :.. . : 
CCDS33 HPTVNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTH-LEKSSVLPIAHLNISKVLL
              120       130       140       150        160         

               190       200         210       220            230  
pF1KE1 IDASDL-QSYEPKSLKSIQNVS-HLILHM-KQHILLLEIFVDVT-----SSVECLELRDT
       . .    .. .:..:..... : :...   :.  ..:.. : ..     :...:. :.:.
CCDS33 VLGETYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCV-LEDN
     170       180       190       200       210       220         

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE1 DLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGV
         . : .: :.  .::  ....:. :.. : .:......:. . . .  . ...  :.: 
CCDS33 KCSYF-LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTT-VWYFSISNVKLQGQ
      230        240       250       260       270        280      

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE1 GNFRASD-NDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLV
        .::  : .   .   ... ..   . .:. :..  .:..      .: .:: ...  .:
CCDS33 LDFRDFDYSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNM-----NIKNFTVSGTR--MV
        290       300       310       320            330           

             360       370       380       390       400       410 
pF1KE1 PCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLT
         :  .... . .::.:.::...  ..:  :      :.::::..:.:  : : .:    
CCDS33 HMLCPSKISPFLHLDFSNNLLTDTVFEN--C-GHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQ
     340       350       360          370       380       390      

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pF1KE1 LKNLTNIDISKNS--FHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRI-HSVTGCIPKTLEILDVSNNN
       .:.: ..:::.::  .      :.: ...  ::.::. .  ..  :.:  ...::. .:.
CCDS33 MKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNK
        400       410       420       430       440       450      

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pF1KE1 LNLFS---LNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTL
       .. .    ..:  :.:: .. :.:  ::  . .  : :: :..:...  : . ..: . .
CCDS33 IKSIPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKM
        460       470       480       490       500       510      

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pF1KE1 KTLEAGGNNFICSCEFLSFTQE-QQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSE
       ....:: : : :.::.  :... .:. ..::  :: .: :: :   ::  ..: ..:   
CCDS33 RSIKAGDNPFQCTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELS
        520       530       540       550       560       570      

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pF1KE1 CHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAP----SRNIC
       :. : :.  .  ....: . .  ::  .   ::..:.  : :..:. :. :    .::. 
CCDS33 CNITLLIVTIVATMLVLAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQ
        580       590       600       610       620       630      

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pF1KE1 YDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTV
       . ::.::: .:..::.: .. .::  .  ...:::.:.:.::: :..:::  ::::.:..
CCDS33 FHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLE--KEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSI
        640       650       660         670       680       690    

              710       720       730       740       750       760
pF1KE1 FVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKT
       :::: :::.::::.::: :.:  :: :.... :::::::: . .::. . ::...:  .:
CCDS33 FVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRT
          700       710       720       730       740       750    

              770       780            
pF1KE1 YLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS        
       ::::: ....:  ::.::::::          
CCDS33 YLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK
          760       770       780      

>>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs109|chr4                (796 aa)
 initn: 1016 init1: 462 opt: 1174  Z-score: 1129.6  bits: 219.8 E(33420): 1.4e-56
Smith-Waterman score: 1265; 31.5% identity (64.8% similar) in 793 aa overlap (11-781:17-780)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE1       MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAV
                       : .::  .. . :.   .. :.      :. .:  .:. :   .
CCDS34 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDK------SKRGLIHVPKDLPLKT
               10        20        30              40        50    

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pF1KE1 KSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSN
       : ::.:.: :. .. ::..   .: .: :. : :. .. . :.   .::.::::.: :..
CCDS34 KVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQK
           60        70        80        90       100       110    

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pF1KE1 LSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLT
       .:    .:. :.  :.:  : .:.:   . :..:..:..: .. :    :.:. :.  ..
CCDS34 ISC---HPIVSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAM----KLQKLDLLPIA
             120       130       140       150           160       

          180       190         200       210        220        230
pF1KE1 FLEELEIDASDLQSYEPKS--LKSIQNVSHLILHMKQHIL-LLEIFVDVT-SSVECLELR
        :. :     ::..:  :    .:.: ..   ::.  :   :. : :... ... ::.: 
CCDS34 HLH-LSYILLDLRNYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLT
       170        180       190       200       210       220      

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pF1KE1 DTDLD-----TF--HFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELE
       .  :.     .:   .:::. : :   . .::. ... : . : .:...:   . .  :.
CCDS34 NIKLNDDNCQVFIKFLSELTRGST---LLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFL-WPKPVEYLN
        230       240       250          260       270        280  

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE1 FDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITV
       . . :.  . ..:  ..: . .   ...:::.  ::    .... ..::..  ... . .
CCDS34 IYNLTI--IESIR--EEDFTYSKTTLKALTIE--HITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMML
              290         300       310         320       330      

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE1 ENSKVFLVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLE
         : . ..  :  .  .....:....:....  ...  : ..  .:.::::..: : .: 
CCDS34 TISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNFTQNVFTDSIFEK--C-STLVKLETLILQKNGLKDLF
        340       350       360       370          380       390   

           410       420         430       440        450       460
pF1KE1 KTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHS--MPETCQWPEKMKYLNLSSTRI-HSVTGCIPKTLE
       :.:     . .:  .:.: ::..:    :.: : :..  :::::. .  ::  :.:  ..
CCDS34 KVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIK
           400       410       420       430       440       450   

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pF1KE1 ILDVSNNNLNLFS---LNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKE
       .::. .:...      ..:  :.:: .. :.:  ::  . .  : :: :..:...  : .
CCDS34 VLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSAD
           460       470       480       490       500       510   

       520       530       540        550       560       570      
pF1KE1 QLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQE-QQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQ
        ..: . .....:: : : :.::.  :... .:. ..::  :: .: :: :   ::. ..
CCDS34 FFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLK
           520       530       540       550       560       570   

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pF1KE1 DVRLSVSECHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAP-
       : ..:   :. : :.  .  ....: . .  ::  .   ::..:.  : :..:. :. : 
CCDS34 DFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPL
           580       590       600       610       620       630   

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pF1KE1 ---SRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDS
          .::. . ::.::::.:. ::.. .:  ::. .  ...:::.:.:.::: :..:::. 
CCDS34 EELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSELVPYLEKED--IQICLHERNFVPGKSIVENIINC
           640       650       660         670       680       690 

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pF1KE1 IEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKL
       ::::.:..:::: :::.::::.::: :.:  :: :...  :::::::: ...::... ::
CCDS34 IEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKL
             700       710       720       730       740       750 

            760       770       780                 
pF1KE1 RKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS             
       . .:. .:::.:: ....:  ::.:.:::                
CCDS34 KALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS
             760       770       780       790      

>>CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX               (1041 aa)
 initn: 464 init1: 212 opt: 529  Z-score: 512.1  bits: 106.0 E(33420): 3.4e-22
Smith-Waterman score: 666; 26.5% identity (57.0% similar) in 825 aa overlap (42-782:212-1022)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KE1 GVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLSNNRITYISNSD
                                     ::. .:  :  ....: :::..: :::. :
CCDS14 YFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQIKYISEED
             190       200       210       220       230       240 

              80                       90         100       110    
pF1KE1 LQRCVNLQALVLTSN---------------GINTIEED--SFSSLGSLEHLDLSYNYLSN
       ..  .::  : :..:               :  .:. :  .:..: .:..:.:: . : .
CCDS14 FKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRK
             250       260       270       280       290       300 

          120       130       140          150             160     
pF1KE1 LSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETS---LFSHLTKLQILRV------GNMDTFTKI
       ....::: .  :  :.:  : :  .:: .   ... : .:.:: .      :..    .:
CCDS14 INAAWFKNMPHLKVLDLEFN-Y-LVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYPQHINI
             310       320         330       340       350         

         170       180          190       200                 210  
pF1KE1 QRKDFAGLTFLEELEIDA---SDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMK----------QHIL
       .: .:. :  :. :.. .   ..:.  . . : .. :.: . : ..          :.. 
CCDS14 SR-NFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQIDFKLFQNFS
     360        370       380       390       400       410        

            220         230       240               250       260  
pF1KE1 LLEIFVDVTSSVECL--ELRDTDLDTFHFSEL-----STG---ETNSLIKKFTFRNVKIT
        :::.    . .  :  . :..  ..  :..      ::    . .: . .::   .:  
CCDS14 NLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSSSFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPLIKPQ
      420       430       440       450       460       470        

            270        280       290       300       310        320
pF1KE1 DESLFQVMKL-LNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLT-IRRLHIP
         .  ... : ::.:  .   .:..    .  :. :..: .:..  .  ..  .. : . 
CCDS14 CAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLT
      480       490       500       510       520       530        

               330       340       350            360       370    
pF1KE1 RFYLFYD-LSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLS-----QHLKSLEYLDLSENLMVE
          : .:  :.:  :..        ::. : .  .       :.. .:. :.::.: .  
CCDS14 NNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNI--
      540       550       560       570       580       590        

          380       390       400            410       420         
pF1KE1 EYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGET-----LLTLKNLTNIDISKNSFHSMP
        :  ..  .    ::  :..  :.:  : .  ..     .  ::::: .:.: : .. .:
CCDS14 -YTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIP
         600       610       620       630       640       650     

     430         440           450       460       470             
pF1KE1 ETC--QWPEKMKYLNLSSTRIH----SVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQ----L
       .    . : ..  :..... ..    ..   .:. ::.::. .:.: ... .: .    :
CCDS14 NEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPR-LELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSL
         660       670       680        690       700       710    

     480       490         500       510       520         530     
pF1KE1 KELYISRNKLMTLPDASL--LPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKT--LEAGGNNF
       . : .:.:..  ::.. :  .  :  : .: : . :..:  :..  : :   ::  :: :
CCDS14 RTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPF
          720       730       740       750       760       770    

         540       550       560       570       580       590     
pF1KE1 ICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMC
        :.:.. .: . ..   .: :   .. .: ::.  ::... ...:..     ::..  . 
CCDS14 ECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLVDVICASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVIL-FF
          780       790       800       810       820       830    

         600         610       620       630        640       650  
pF1KE1 CALFL--LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKP-RKAPSRNICYDAFVSYSERDA
        ..:.  ...:...  : :.  : . ...    :: :  :.  . .  :::..::. .::
CCDS14 FTFFITTMVMLAALAHHLFY--WDVWFIYNVCLAKVKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDA
           840       850         860       870       880       890 

               660        670       680       690       700        
pF1KE1 Y---WVENLMVQELE-NFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFV
           :: : .  .:: . .    :::..::. ::  ::::...::..:.::::::.....
CCDS14 SVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYA
             900       910       920       930       940       950 

      710       720       730       740       750       760        
pF1KE1 KSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDE
       ::   :  . ..  ::.::: :. :.:::::. ...   .. .::. .  .. :.:: :.
CCDS14 KSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHS---QYLRLRQRICKSSILQWP-DN
             960       970       980          990      1000        

      770        780                     
pF1KE1 AQREG-FWVNLRAAIKS                 
        . :: :: .:: ..                   
CCDS14 PKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY
      1010      1020      1030      1040 

>>CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX               (1059 aa)
 initn: 464 init1: 212 opt: 529  Z-score: 512.0  bits: 106.0 E(33420): 3.5e-22
Smith-Waterman score: 666; 26.5% identity (57.0% similar) in 825 aa overlap (42-782:230-1040)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KE1 GVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLSNNRITYISNSD
                                     ::. .:  :  ....: :::..: :::. :
CCDS14 YFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQIKYISEED
     200       210       220       230       240       250         

              80                       90         100       110    
pF1KE1 LQRCVNLQALVLTSN---------------GINTIEED--SFSSLGSLEHLDLSYNYLSN
       ..  .::  : :..:               :  .:. :  .:..: .:..:.:: . : .
CCDS14 FKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRK
     260       270       280       290       300       310         

          120       130       140          150             160     
pF1KE1 LSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETS---LFSHLTKLQILRV------GNMDTFTKI
       ....::: .  :  :.:  : :  .:: .   ... : .:.:: .      :..    .:
CCDS14 INAAWFKNMPHLKVLDLEFN-Y-LVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYPQHINI
     320       330        340        350       360       370       

         170       180          190       200                 210  
pF1KE1 QRKDFAGLTFLEELEIDA---SDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMK----------QHIL
       .: .:. :  :. :.. .   ..:.  . . : .. :.: . : ..          :.. 
CCDS14 SR-NFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQIDFKLFQNFS
        380       390       400       410       420       430      

            220         230       240               250       260  
pF1KE1 LLEIFVDVTSSVECL--ELRDTDLDTFHFSEL-----STG---ETNSLIKKFTFRNVKIT
        :::.    . .  :  . :..  ..  :..      ::    . .: . .::   .:  
CCDS14 NLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSSSFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPLIKPQ
        440       450       460       470       480       490      

            270        280       290       300       310        320
pF1KE1 DESLFQVMKL-LNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLT-IRRLHIP
         .  ... : ::.:  .   .:..    .  :. :..: .:..  .  ..  .. : . 
CCDS14 CAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLT
        500       510       520       530       540       550      

               330       340       350            360       370    
pF1KE1 RFYLFYD-LSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLS-----QHLKSLEYLDLSENLMVE
          : .:  :.:  :..        ::. : .  .       :.. .:. :.::.: .  
CCDS14 NNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNI--
        560       570       580       590       600       610      

          380       390       400            410       420         
pF1KE1 EYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGET-----LLTLKNLTNIDISKNSFHSMP
        :  ..  .    ::  :..  :.:  : .  ..     .  ::::: .:.: : .. .:
CCDS14 -YTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIP
           620       630       640       650       660       670   

     430         440           450       460       470             
pF1KE1 ETC--QWPEKMKYLNLSSTRIH----SVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQ----L
       .    . : ..  :..... ..    ..   .:. ::.::. .:.: ... .: .    :
CCDS14 NEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPR-LELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSL
           680       690       700        710       720       730  

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pF1KE1 KELYISRNKLMTLPDASL--LPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKT--LEAGGNNF
       . : .:.:..  ::.. :  .  :  : .: : . :..:  :..  : :   ::  :: :
CCDS14 RTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPF
            740       750       760       770       780       790  

         540       550       560       570       580       590     
pF1KE1 ICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMC
        :.:.. .: . ..   .: :   .. .: ::.  ::... ...:..     ::..  . 
CCDS14 ECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLVDVICASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVIL-FF
            800       810       820       830       840        850 

         600         610       620       630        640       650  
pF1KE1 CALFL--LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKP-RKAPSRNICYDAFVSYSERDA
        ..:.  ...:...  : :.  : . ...    :: :  :.  . .  :::..::. .::
CCDS14 FTFFITTMVMLAALAHHLFY--WDVWFIYNVCLAKVKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDA
             860       870         880       890       900         

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pF1KE1 Y---WVENLMVQELE-NFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFV
           :: : .  .:: . .    :::..::. ::  ::::...::..:.::::::.....
CCDS14 SVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYA
     910       920       930       940       950       960         

      710       720       730       740       750       760        
pF1KE1 KSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDE
       ::   :  . ..  ::.::: :. :.:::::. ...   .. .::. .  .. :.:: :.
CCDS14 KSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHS---QYLRLRQRICKSSILQWP-DN
     970       980       990      1000         1010      1020      

      770        780                     
pF1KE1 AQREG-FWVNLRAAIKS                 
        . :: :: .:: ..                   
CCDS14 PKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY
        1030      1040      1050         

>>CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs109|chrX               (1049 aa)
 initn: 325 init1: 213 opt: 525  Z-score: 508.2  bits: 105.3 E(33420): 5.6e-22
Smith-Waterman score: 700; 28.7% identity (58.2% similar) in 794 aa overlap (36-784:273-1035)

          10        20        30        40           50        60  
pF1KE1 WMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSG---SLNSIPSGLTEAVKSLDLSNN
                                     ::..:     .:.. ..::: .: : : .:
CCDS14 DDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAF-DALTE-LKVLRLHSN
            250       260       270       280        290        300

             70        80         90        100       110          
pF1KE1 RITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGI-NTIEEDSFSS-LGSLEHLDLSYN-----YLSNL
        . ..    ..   .:: : :..: . . : . .:   : :: .::::.:     : ...
CCDS14 SLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASM
              310       320       330       340       350       360

          120       130       140       150       160         170  
pF1KE1 S-SSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDT-FTKIQRKD-FAG
       . :. :. :.:: .: . :  .: :   .: : : .:: :.: .. : : ::   . :  
CCDS14 NLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNL-SPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQ
              370       380       390        400       410         

            180        190       200       210        220          
pF1KE1 LTFLEELEIDASDLQ-SYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHIL-LLEIFVDVTSSVEC-LEL
       .  :. ...... .. : . . .   .:.   .  .. ..:  :. :     .  : .. 
CCDS14 FKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKN
     420       430       440       450       460       470         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE1 RDTDLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTL
       ..... . . :  . :.: .: :.  :  :: .: . .. .: :: .:: :  .    ::
CCDS14 KEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFF-VKSSDFQHLSFLKCLN-LSGNLISQ----TL
     480       490       500        510       520        530       

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE1 NGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVF
       :: ..:.   . : .: .. . : .  ::   :  .. : .: ...   . .  :.   .
CCDS14 NG-SEFQPLAELRYLDFSN-NRLDL--LHSTAFEELHKLEVL-DISSNSHYFQSEGITHM
            540       550          560       570        580        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE1 LVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGET-
       :    ....:: :. : ...: .     ..   :    ::.:: .: :::  : . :.. 
CCDS14 LN---FTKNLKVLQKLMMNDNDISSSTSRTMESE----SLRTLEFRGNHLDVLWREGDNR
      590          600       610           620       630       640 

       410          420       430         440       450            
pF1KE1 -LLTLKNLTNI---DISKNSFHSMPETC--QWPEKMKYLNLSSTRIHSVT----GCIPKT
        :  .::: ..   ::::::.  .:       : ..: :.:... ..: .     :. :.
CCDS14 YLQLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCL-KN
             650       660       670       680       690        700

      460       470           480       490         500       510  
pF1KE1 LEILDVSNNNLNLFSLNLPQ----LKELYISRNKLMTLPDASLLP--MLLVLKISRNAIT
       :: ::.:.:.:.     : .    ::.: .. :.. .:    :    .:  : .: : : 
CCDS14 LETLDLSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQ
              710       720       730       740       750       760

              520       530       540       550       560          
pF1KE1 TFSKEQL--DSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPA-NYLCDSPSH
        ..: ..  . ...:: :    : :.:.:. . :.      ..: : . : .  : .:. 
CCDS14 MIQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVW-WVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGA
              770       780       790        800       810         

     570       580       590          600       610       620      
pF1KE1 VRGQQVQDVRLSVSECHRTALVS---GMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQ
        .::.: .. : . :   : :.    ..  .:::....:.   . :  .::.   . . .
CCDS14 HKGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLY-FWDVWYI---YHFCK
     820       830       840       850       860        870        

        630        640       650          660        670       680 
pF1KE1 AKRKP-RKAPSRNICYDAFVSYSERD---AYWVENLMVQELEN-FNPPFKLCLHKRDFIP
       :: :  ..  : . :::::. :. .:   . ::   .: .::.  .  :.:::..::..:
CCDS14 AKIKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLP
         880       890       900       910       920       930     

             690       700       710       720       730        740
pF1KE1 GKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLE-PI
       :. ...:. .::. :.:::::......:.:  :  . .:: ::.::. :. :::.:: :.
CCDS14 GQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPF
         940       950       960       970       980       990     

              750       760       770       780                  
pF1KE1 EKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS              
       .:.    .: .::: .  .. :::: .   .  ::  :. :. .              
CCDS14 QKS----KFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
            1000      1010      1020      1030      1040         

>>CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs109|chr9                 (839 aa)
 initn: 580 init1: 239 opt: 512  Z-score: 497.0  bits: 102.9 E(33420): 2.4e-21
Smith-Waterman score: 690; 27.3% identity (55.7% similar) in 795 aa overlap (79-782:57-815)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE1 GLTEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLS
                                     . : :. : .  .   :: :.  :. ::::
CCDS68 EPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLDLSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLS
         30        40        50        60        70        80      

      110       120       130       140       150       160        
pF1KE1 YNYLSNLSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK
          .... .. .. :: :. : : ::: ..:.  . :: :..:: : :.   ......  
CCDS68 RCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLA-LGAFSGLSSLQKL-VAVETNLASLENF
         90       100       110        120       130        140    

      170       180       190        200       210       220       
pF1KE1 DFAGLTFLEELEIDASDLQSYE-PKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECL
        .. :  :.::..  . .::.. :. .... :. :: :  ..            .:. : 
CCDS68 PIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSSNK-----------IQSIYCT
          150       160       170       180                  190   

       230        240        250       260          270        280 
pF1KE1 ELRDT-DLDTFHFS-ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESL---FQVMKLLNQ-ISGLLE
       .::   ..  ...: .:: .  : .:.  .:.....   .:   :. .....  :.::  
CCDS68 DLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMN-FIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSLNVMKTCIQGLAG
           200       210        220       230       240       250  

             290       300       310          320        330       
pF1KE1 LEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVE---TLTIRRLHIPRF-YLFYDLSTLYSLTER
       ::    .:   :.::   : . .: . .:   .:::.....  . : . :.  :..    
CCDS68 LEVHRLVL---GEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDIIDLFNCLTN
            260          270       280       290       300         

       340                      350           360       370        
pF1KE1 VKR-----ITVENSKVF----------LVPCLLSQ----HLKSLEYLDLSENLMVEEYLK
       :.      .:.:  : :          :: : ..:    .::::. : .. :        
CCDS68 VSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTSN-----KGG
     310       320       330       340       350       360         

      380       390       400                              410     
pF1KE1 NSACEDAWPSLQTLILRQNHLA-----SLEKTGET------------------LLTLKNL
       :.  :   :::. : : .: :.     :    : :                  .: :..:
CCDS68 NAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLGLEQL
          370       380       390       400       410       420    

         420       430         440       450          460          
pF1KE1 TNIDISKNSFHSMPETCQWP--EKMKYLNLSSTRIHSVTGCIPK---TLEILDVSNNNL-
        ..:........: :   .   ... ::..: :. . . . : .   .::.: ...:.. 
CCDS68 EHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAGNSFQ
          430       440       450       460       470       480    

                 470                       480       490           
pF1KE1 ------------NLFSLNLPQ----------------LKELYISRNKLMTLPD--ASLLP
                   ::  :.: :                :. : .:.:....:     . : 
CCDS68 ENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPYKCLN
          490       500       510       520       530       540    

     500       510       520        530       540       550        
pF1KE1 MLLVLKISRNAITTFSKEQLDSF-HTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDW
        : ::  : : : : .:..:. :  .:  :.   :.: :.::  :: :  .   ..:.. 
CCDS68 SLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLVEV
          550       560       570       580       590       600    

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE1 PANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYM
          . : .::  .:. :  . :... :. .  . :.     :.. ...:: ..:.  ...
CCDS68 E-RMECATPSDKQGMPV--LSLNIT-CQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFY--FHL
           610       620          630       640       650          

      620       630       640       650       660       670        
pF1KE1 KMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRD
        .. . ..  :      ..:: ::::: :: .:  ::.: .:..::.  :::.:::: ::
CCDS68 MLLAGCIKYGR------GENI-YDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRD
      660             670        680       690       700       710 

      680       690        700       710       720       730       
pF1KE1 FIPGKWIIDNII-DSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILL
       ::::  :  ::: ....::.:.. :.:..:..:.:: .: ....   :  .  . :.:.:
CCDS68 FIPGVAIAANIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVL
             720       730       740       750       760       770 

       740       750       760       770       780                 
pF1KE1 EPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS             
       . .::  . :.  .: .... .:::::  .   :. ::  :: :.               
CCDS68 QKVEKTLLRQQV-ELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTG
             780        790       800       810       820       830

CCDS68 CNWQEATSI
                

>>CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs109|chr4                 (904 aa)
 initn: 346 init1: 137 opt: 404  Z-score: 393.5  bits: 83.8 E(33420): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 553; 24.1% identity (57.5% similar) in 804 aa overlap (21-784:145-899)

                         10        20        30        40        50
pF1KE1           MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGL
                                     ...:  .:. ..::. . . :.  ..    
CCDS38 SDKTFAFCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKLGTQVQL----
          120       130       140       150       160       170    

               60        70          80        90       100        
pF1KE1 TEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQRCVN--LQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLS
        : .. : ::::.:  ... .:.  .:  :. : :.:: :. .    : ..: :  : :.
CCDS38 -ENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFANSSLKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRLFGLFLN
               180       190       200       210       220         

      110        120       130        140         150       160    
pF1KE1 YNYLS-NLSSSWFKPLSSLTFLNL-LGNPYKTLGETSLFSHL--TKLQILRVGNMDTFTK
          :. .:. .    :.. .. :: :.:   .   .. :  :  :.: .: . ...... 
CCDS38 NVQLGPSLTEKLCLELANTSIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGLKWTNLTMLDL-SYNNLNV
     230       240       250       260       270       280         

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE1 IQRKDFAGLTFLEELEIDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSV
       .   .:: :  :: . .. ...:    .::... :: .  :..:.       :.  . :.
CCDS38 VGNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRY--LNLKRS------FTKQSISL
      290       300       310       320         330             340

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE1 ECLELRDTDLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEF
         :      .: : :. :.  :           .... :...  . .  :...::..:..
CCDS38 ASLP----KIDDFSFQWLKCLE-----------HLNMEDNDIPGIKS--NMFTGLINLKY
                  350                  360       370         380   

          290       300           310       320       330       340
pF1KE1 DDCTLNGVGNFRASDNDRVID----PGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKR
        . . :.  ..:.  :.  ..    : .. .::  ..   .   :  :. :  :   ...
CCDS38 LSLS-NSFTSLRTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNE
            390       400       410       420       430       440  

              350       360       370       380        390         
pF1KE1 ITVENSKVFLVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAW-PSLQTLILRQNHL
       :  :         : .:. ..:: . .   :  ..::. .    :  :::: :.::.  :
CCDS38 IGQE---------LTGQEWRGLENI-FEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLMLRRVAL
                     450        460       470       480       490  

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pF1KE1 ASLEKTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHSM-PETCQWPEKMKYLNLSSTRI-----HSVTG
        .....   .  :.::: .:.:.:.. ..  .  .  ::.. :.:. . .     :.  :
CCDS38 KNVDSSPSPFQPLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLEKLEILDLQHNNLARLWKHANPG
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pF1KE1 CIP-------KTLEILDVSNNNLNLFSL----NLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLL
         :       . :.::.. .:... . .    .: .:: . .. :.: ::: ::..   .
CCDS38 G-PIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLP-ASVFNNQV
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pF1KE1 VLK---ISRNAITTFSKEQLD-SFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLS-FTQEQQALAKVLID
        ::   ...: ::.  :. .  .:..:  :.   : : :.:: .. :..  .     . .
CCDS38 SLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTNIPE
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pF1KE1 WPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTA--LVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGL
         ..:::..: : .:  :.   ...: :. .:   .  :  . .:::..  ::  .:.: 
CCDS38 LSSHYLCNTPPHYHGFPVR--LFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEG-
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pF1KE1 WYMKMMWAWLQAKR----KPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFK
       : ....:  ....:    :     .... : :.. .. .:  :: .   . .:. .  .:
CCDS38 WRISFYWN-VSVHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDKDWVWE-HFSSMEKEDQSLK
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pF1KE1 LCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCK-YELDFSHFRLFDENND
       .::..:::  : . .. :..::..:.: .::......:.  :: ...  .  . ...: :
CCDS38 FCLEERDFEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLD
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pF1KE1 AAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS     
       . ::..:: :    . . .:  : .....  :.::... .  .:  .:..:. :     
CCDS38 SIILVFLEEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH
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CCDS31 RFCNLTQVPQVLNTTERLLLSFNYIRTVTASSFP--FLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAF
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CCDS31 RNLPNLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLD
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pF1KE1 LLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK--DFAGLTFLEELEIDASDLQS
       :  :  ..:     :..:..:. .  .. . :   ...   . : : :  . . :..: :
CCDS31 LSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPLQGKT-LSFFSLAANSLYS
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CCDS31 RVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFG
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pF1KE1 ----RDTDLDTF---------HFSELSTGETNSLIKKF--TFRNVKITDESLFQVMKLLN
           .: : .::         :. .:: : . :: ..   :....:. . .  .. :. .
CCDS31 FHNIKDPDQNTFAGLARSSVRHL-DLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIAD
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pF1KE1 Q-ISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYS
       . . :: .:.  . . : .:.. .:.        ::  . ... ::    .. : .  ..
CCDS31 EAFYGLDNLQVLNLSYNLLGELYSSN---FYGLPKVAYIDLQKNHIA---IIQDQT--FK
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pF1KE1 LTERVKRITVEN---SKVFLVPCL----LS-QHLKSLEYLDLSENL--MVEEYLKNSACE
       . :... . ...   . . ..: .    :: ..: .:  ..:. ::  . :. :.:    
CCDS31 FLEKLQTLDLRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLPKINLTANLIHLSENRLENLDIL
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pF1KE1 MKYLNLSSTRIHSVTGCIPKTLEILDVSNNNLN-----LFSLNLPQLKELYISRNKLMTL
         . .::    :         :..: ...: ::     .:: .:  :. : .. :.: .:
CCDS31 -VFEGLS----H---------LQVLYLNHNYLNSLPPGVFS-HLTALRGLSLNSNRLTVL
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          .:   : .: :::: . . .    : : .:..:.   :.::: ::. .: .  .   
CCDS31 SHNDLPANLEILDISRNQLLAPNP---DVFVSLSVLDITHNKFICECELSTFINWLNHTN
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        ..   ::.  :  :.   :  :.   ::.  : .  .....  .::.       :.:.:
CCDS31 VTIAGPPADIYCVYPDSFSG--VSLFSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMT
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pF1KE1 GVLCHRFHGLWYMKMMWAW-LQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELE
        .   .:.:. .. .  :  :  : .:. .      :::.. .: .:  ::.: ....:.
CCDS31 ILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLD
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CCDS31 TQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQ
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pF1KE1 FRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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