Result of SIM4 for pF1KB6231

seq1 = pF1KB6231.tfa, 2229 bp
seq2 = pF1KB6231/gi568815586r_114571844.tfa (gi568815586r:114571844_114783200), 211357 bp

>pF1KB6231 2229
>gi568815586r:114571844_114783200 (Chr12)

(complement)

1-389  (100001-100389)   100% ->
390-657  (102055-102322)   100% ->
658-717  (103229-103288)   100% ->
718-864  (103550-103696)   100% ->
865-941  (105545-105621)   100% ->
942-1099  (106731-106888)   100% ->
1100-1770  (108366-109036)   100% ->
1771-2229  (110899-111357)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCTCTCCATGAGAGATCCGGTCATTCCTGGGACAAGCATGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCTCTCCATGAGAGATCCGGTCATTCCTGGGACAAGCATGGCCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCATCCGTTCCTACCTCACCGGGCGCCGGACTTCGCCATGAGCGCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCATCCGTTCCTACCTCACCGGGCGCCGGACTTCGCCATGAGCGCGGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGGTCACCAGCCGCCGTTCTTCCCCGCGCTGACGCTGCCTCCCAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGGTCACCAGCCGCCGTTCTTCCCCGCGCTGACGCTGCCTCCCAACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGGCGGCGCTCTCGCTGCCGGGCGCCCTGGCCAAGCCGATCATGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGGCGGCGCTCTCGCTGCCGGGCGCCCTGGCCAAGCCGATCATGGATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTGGTGGGGGCGGCCGAGACCGGCATCCCGTTCTCCTCCCTGGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTGGTGGGGGCGGCCGAGACCGGCATCCCGTTCTCCTCCCTGGGGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGCGCATCTGAGGCCTTTGAAGACCATGGAGCCCGAAGAAGAGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGCGCATCTGAGGCCTTTGAAGACCATGGAGCCCGAAGAAGAGGTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACGACCCCAAGGTGCACCTGGAGGCTAAAGAACTTTGGGATCAGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACGACCCCAAGGTGCACCTGGAGGCTAAAGAACTTTGGGATCAGTTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAGCGGGGCACCGAGATGGTCATTACCAAGTCGGGAAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100351 CAAGCGGGGCACCGAGATGGTCATTACCAAGTCGGGAAGGTA...TAGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GAATGTTTCCTCCATTTAAAGTGAGATGTTCTGGGCTGGATAAAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102057 GAATGTTTCCTCCATTTAAAGTGAGATGTTCTGGGCTGGATAAAAAAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAATACATTTTATTGATGGACATTATAGCTGCTGATGACTGTCGTTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102107 AAATACATTTTATTGATGGACATTATAGCTGCTGATGACTGTCGTTATAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ATTTCACAATTCTCGGTGGATGGTGGCTGGTAAGGCCGACCCCGAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102157 ATTTCACAATTCTCGGTGGATGGTGGCTGGTAAGGCCGACCCCGAAATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAAAGAGGATGTACATTCACCCGGACAGCCCCGCTACTGGGGAACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102207 CAAAGAGGATGTACATTCACCCGGACAGCCCCGCTACTGGGGAACAGTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATGTCCAAAGTCGTCACTTTCCACAAACTGAAACTCACCAACAACATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102257 ATGTCCAAAGTCGTCACTTTCCACAAACTGAAACTCACCAACAACATTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGACAAACATGGATTT         ACTTTGGCCTTCCCAAGTGATCACG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102307 AGACAAACATGGATTTGTA...AAGACTTTGGCCTTCCCAAGTGATCACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTACGTGGCAGGGGAATTATAGTTTTGGTACTCAG         ACTATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103254 CTACGTGGCAGGGGAATTATAGTTTTGGTACTCAGGTA...CAGACTATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTGAACTCCATGCACAAATACCAGCCCCGGTTCCACATTGTAAGAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103556 TTGAACTCCATGCACAAATACCAGCCCCGGTTCCACATTGTAAGAGCCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGACATCTTGAAACTCCCTTATAGTACATTTCGGACATACTTGTTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103606 TGACATCTTGAAACTCCCTTATAGTACATTTCGGACATACTTGTTCCCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AAACTGAATTCATCGCTGTGACTGCATACCAGAATGATAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 103656 AAACTGAATTCATCGCTGTGACTGCATACCAGAATGATAAGGTA...TAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATAACCCAGTTAAAAATAGACAACAACCCTTTTGCAAAAGGTTTCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105545 ATAACCCAGTTAAAAATAGACAACAACCCTTTTGCAAAAGGTTTCCGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CACTGGAAATGGCCGAAGAGAAAAAAG         AAAACAGCTCACCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105595 CACTGGAAATGGCCGAAGAGAAAAAAGGTG...CAGAAAACAGCTCACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGCAGTCCATGAGGGTGTTTGATGAAAGACACAAAAAGGAGAATGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106745 TGCAGTCCATGAGGGTGTTTGATGAAAGACACAAAAAGGAGAATGGGACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TCTGATGAGTCCTCCAGTGAACAAGCAGCTTTCAACTGCTTCGCCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106795 TCTGATGAGTCCTCCAGTGAACAAGCAGCTTTCAACTGCTTCGCCCAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TTCTTCTCCAGCCGCCTCCACTGTAGGGACATCGAACCTCAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106845 TTCTTCTCCAGCCGCCTCCACTGTAGGGACATCGAACCTCAAAGGTA...

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1100    ATTTATGTCCCAGCGAGGGTGAGAGCGACGCCGAGGCCGAGAGCAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108363 TAGATTTATGTCCCAGCGAGGGTGAGAGCGACGCCGAGGCCGAGAGCAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAGGAGCATGGCCCCGAGGCCTGCGACGCGGCCAAGATCTCCACCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108413 GAGGAGCATGGCCCCGAGGCCTGCGACGCGGCCAAGATCTCCACCACCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GTCGGAGGAGCCCTGCCGTGACAAGGGCAGCCCCGCGGTCAAGGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108463 GTCGGAGGAGCCCTGCCGTGACAAGGGCAGCCCCGCGGTCAAGGCTCACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TTTTCGCTGCTGAGCGGCCCCGGGACAGCGGGCGGCTGGACAAAGCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108513 TTTTCGCTGCTGAGCGGCCCCGGGACAGCGGGCGGCTGGACAAAGCGTCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CCCGACTCACGCCATAGCCCCGCCACCATCTCGTCCAGCACTCGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108563 CCCGACTCACGCCATAGCCCCGCCACCATCTCGTCCAGCACTCGCGGCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GGGCGCGGAGGAGCGCAGGAGCCCGGTTCGCGAGGGCACAGCGCCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108613 GGGCGCGGAGGAGCGCAGGAGCCCGGTTCGCGAGGGCACAGCGCCGGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 AGGTGGAAGAGGCGCGCGCGCTCCCGGGCAAGGAGGCCTTCGCGCCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108663 AGGTGGAAGAGGCGCGCGCGCTCCCGGGCAAGGAGGCCTTCGCGCCGCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 ACGGTGCAGACGGACGCGGCCGCCGCGCACCTGGCCCAGGGCCCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108713 ACGGTGCAGACGGACGCGGCCGCCGCGCACCTGGCCCAGGGCCCCCTGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 TGGCCTCGGCTTCGCCCCGGGCCTGGCGGGCCAACAGTTCTTCAACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108763 TGGCCTCGGCTTCGCCCCGGGCCTGGCGGGCCAACAGTTCTTCAACGGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 ACCCGCTCTTCCTGCACCCCAGCCAGTTTGCCATGGGGGGCGCCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108813 ACCCGCTCTTCCTGCACCCCAGCCAGTTTGCCATGGGGGGCGCCTTCTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 AGCATGGCGGCCGCTGGCATGGGTCCCCTCCTGGCCACGGTTTCTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108863 AGCATGGCGGCCGCTGGCATGGGTCCCCTCCTGGCCACGGTTTCTGGGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CTCCACCGGTGTCTCGGGCCTGGATTCCACGGCCATGGCCTCTGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108913 CTCCACCGGTGTCTCGGGCCTGGATTCCACGGCCATGGCCTCTGCCGCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 CGGCGCAGGGACTGTCCGGGGCGTCCGCGGCCACCCTGCCCTTCCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108963 CGGCGCAGGGACTGTCCGGGGCGTCCGCGGCCACCCTGCCCTTCCACCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 CAGCAGCACGTCCTGGCCTCTCAG         GGCCTGGCCATGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 109013 CAGCAGCACGTCCTGGCCTCTCAGGTA...CAGGGCCTGGCCATGTCCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TTTCGGAAGCCTGTTCCCTTACCCCTACACGTACATGGCCGCAGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110916 TTTCGGAAGCCTGTTCCCTTACCCCTACACGTACATGGCCGCAGCGGCGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 CCGCCTCCTCTGCGGCAGCCTCCAGCTCGGTGCACCGCCACCCCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110966 CCGCCTCCTCTGCGGCAGCCTCCAGCTCGGTGCACCGCCACCCCTTCCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AATCTGAACACCATGCGCCCGCGGCTGCGCTACAGCCCCTACTCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111016 AATCTGAACACCATGCGCCCGCGGCTGCGCTACAGCCCCTACTCCATCCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 GGTGCCGGTCCCGGACGGCAGCAGTCTGCTCACCACCGCCCTGCCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111066 GGTGCCGGTCCCGGACGGCAGCAGTCTGCTCACCACCGCCCTGCCCTCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 TGGCGGCGGCCGCGGGGCCCCTGGACGGCAAAGTCGCCGCCCTGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111116 TGGCGGCGGCCGCGGGGCCCCTGGACGGCAAAGTCGCCGCCCTGGCCGCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 AGCCCGGCCTCGGTGGCAGTGGACTCGGGCTCTGAACTCAACAGCCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111166 AGCCCGGCCTCGGTGGCAGTGGACTCGGGCTCTGAACTCAACAGCCGCTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2088 CTCCACGCTCTCCTCCAGCTCCATGTCCTTGTCGCCCAAACTCTGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111216 CTCCACGCTCTCCTCCAGCTCCATGTCCTTGTCGCCCAAACTCTGCGCGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 AGAAAGAGGCGGCCACCAGCGAACTGCAGAGCATCCAGCGGTTGGTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111266 AGAAAGAGGCGGCCACCAGCGAACTGCAGAGCATCCAGCGGTTGGTTAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 GGCTTGGAAGCCAAGCCGGACAGGTCCCGCAGCGCGTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111316 GGCTTGGAAGCCAAGCCGGACAGGTCCCGCAGCGCGTCCCCG

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