Result of FASTA (omim) for pF1KB6254
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6254, 683 aa
  1>>>pF1KB6254 683 - 683 aa - 683 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7152+/-0.000384; mu= 0.8648+/- 0.024
 mean_var=286.4672+/-62.145, 0's: 0 Z-trim(122.6): 139  B-trim: 4223 in 2/54
 Lambda= 0.075777
 statistics sampled from 40818 (41017) to 40818 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.785), E-opt: 0.2 (0.481), width:  16
 Scan time: 14.680

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001157685 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat an ( 696) 1040 127.4 1.8e-28
NP_055931 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and c ( 728) 1040 127.4 1.9e-28
NP_001157683 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat an ( 763) 1019 125.1 9.5e-28
XP_016875972 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-ric ( 731) 1008 123.9 2.1e-27
XP_016875973 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-ric ( 477)  413 58.7 5.9e-08
NP_665894 (OMIM: 605247) p53-induced protein with  ( 893)  400 57.5 2.5e-07
XP_011518513 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 893)  400 57.5 2.5e-07
XP_011518512 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 910)  400 57.5 2.5e-07
NP_665893 (OMIM: 605247) p53-induced protein with  ( 910)  400 57.5 2.5e-07
XP_011518511 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 920)  400 57.5 2.6e-07
XP_005253062 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 934)  400 57.5 2.6e-07
XP_005253063 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 934)  400 57.5 2.6e-07
XP_005253064 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 934)  400 57.5 2.6e-07
XP_005253065 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 788)  356 52.7 6.4e-06
XP_011518514 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 788)  356 52.7 6.4e-06
NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 536)  351 52.0 7.1e-06
NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repea ( 582)  351 52.0 7.5e-06
NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582)  351 52.0 7.5e-06
XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  351 52.0 7.5e-06
XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  351 52.0 7.5e-06
NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582)  351 52.0 7.5e-06
XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  351 52.0 7.5e-06
XP_006717379 (OMIM: 610933,614436) PREDICTED: E3 u ( 690)  341 51.0 1.8e-05
XP_011542154 (OMIM: 605352) PREDICTED: malignant f (1003)  336 50.6 3.5e-05
NP_004216 (OMIM: 605352) malignant fibrous histioc (1052)  336 50.6 3.6e-05
NP_001177652 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 696)  326 49.3 5.7e-05
NP_001005373 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 723)  326 49.4 5.8e-05
NP_612370 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-prote ( 723)  326 49.4 5.8e-05
XP_016870772 (OMIM: 610933,614436) PREDICTED: E3 u ( 723)  326 49.4 5.8e-05
NP_001005374 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 723)  326 49.4 5.8e-05
XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 331)  311 47.4  0.0001
XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 465)  311 47.5 0.00013
NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-conta ( 524)  311 47.6 0.00014
XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 524)  311 47.6 0.00014
XP_006714723 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1246)  315 48.4  0.0002
XP_016865126 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1298)  315 48.4 0.00021
NP_001006600 (OMIM: 606944) erbin isoform 7 [Homo  (1302)  315 48.4 0.00021
NP_001240627 (OMIM: 606944) erbin isoform 4 [Homo  (1346)  315 48.4 0.00021
NP_001240630 (OMIM: 606944) erbin isoform 9 [Homo  (1367)  315 48.4 0.00022
NP_061165 (OMIM: 606944) erbin isoform 2 [Homo sap (1371)  315 48.4 0.00022
NP_001240626 (OMIM: 606944) erbin isoform 1 [Homo  (1412)  315 48.4 0.00022
XP_016865125 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1415)  315 48.4 0.00022
NP_001240628 (OMIM: 606944) erbin isoform 8 [Homo  (1419)  315 48.4 0.00022
XP_005248612 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1456)  315 48.4 0.00023
XP_016865124 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460)  315 48.4 0.00023
XP_005248611 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460)  315 48.4 0.00023
NP_036557 (OMIM: 179555) ras suppressor protein 1  ( 277)  290 45.1 0.00044
XP_011539991 (OMIM: 612890) PREDICTED: volume-regu ( 858)  300 46.6 0.00048
XP_016857090 (OMIM: 612890) PREDICTED: volume-regu ( 858)  300 46.6 0.00048
NP_060573 (OMIM: 612890) volume-regulated anion ch ( 858)  300 46.6 0.00048


>>NP_001157685 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and ca  (696 aa)
 initn: 1351 init1: 976 opt: 1040  Z-score: 632.1  bits: 127.4 E(85289): 1.8e-28
Smith-Waterman score: 1409; 43.4% identity (65.4% similar) in 662 aa overlap (7-635:41-675)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
                                     :: .:::  ...     :. .::  :. ::
NP_001 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
               20        30        40        50             60     

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB6 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
       :::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. :::   :..:::: :
NP_001 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
          70        80        90       100       110       120     

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
       .:::::.: .  :. ::  :::::::::::: ::  .: :::.:::.::::::.:: .::
NP_001 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
         130       140       150       160       170       180     

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB6 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
        : .: .:::: ::. .::...  :.:::.:::::: :..::.:: :::::..:::::.:
NP_001 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKV
         190       200       210       220       230       240     

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB6 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSALG-DLAPS
         ::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: :  .: .  :   
NP_001 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
         250       260       270       280       290       300     

         280       290       300       310       320        330    
pF1KB6 RPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELARE
       . : .    .::   :.. :.  :::  : :.:.:: :..: .:: .  :.  .:.. .:
NP_001 ERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
         310            320          330       340       350       

          340       350       360            370       380         
pF1KB6 PRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRERA
        .     :::.    .::. .: .   :     :.. . :  ..:   . . :  ..   
NP_001 EQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDR-ADGLHSEFMN
       360          370       380       390       400        410   

     390       400       410           420       430               
pF1KB6 PSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL---
        ..: :.   ::  : .    :: .      ..:... :     .   : :  : ::   
NP_001 YKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTD
           420         430       440       450       460       470 

         440            450              460       470       480   
pF1KB6 ---RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SPKSSASQAGAAAGQGAPAPAPASQEP
          :.:.     :.: :.  : .  ::      ::   ...  .  ..:.       .: 
NP_001 ITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIREN
             480       490       500       510       520       530 

           490       500       510       520       530       540   
pF1KB6 LPIAGPATAPAPRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDSVLRPRRYPQVPDEKDLMTQ
        : ..:.:  .  :.:   .: : ..:   : .    .:. ..: :.. :. .::.:. :
NP_001 SPAVSPTTN-STAPFG--LKPRSVFLRP--QRNLESIDPQFTIR-RKMEQMREEKELVEQ
             540          550         560       570        580     

           550       560       570       580       590       600   
pF1KB6 LRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVILCQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKN
       ::. .: ::.  : :::. :: .::.::.:.:..:::::  ::::::::::::  : :.:
NP_001 LRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRN
         590       600       610       620       630       640     

           610       620       630       640       650       660   
pF1KB6 VESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWPPSGLGGFV
       ::.:::::::.::::  :: :  .:.   .::                            
NP_001 VENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILE--EKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT       
         650       660       670         680       690             

           670       680   
pF1KB6 VFYVVLMLLLYVTYTRLLGS

>>NP_055931 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and calpo  (728 aa)
 initn: 1441 init1: 976 opt: 1040  Z-score: 631.8  bits: 127.4 E(85289): 1.9e-28
Smith-Waterman score: 1517; 43.1% identity (65.9% similar) in 706 aa overlap (7-677:41-721)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
                                     :: .:::  ...     :. .::  :. ::
NP_055 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
               20        30        40        50             60     

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB6 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
       :::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. :::   :..:::: :
NP_055 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
          70        80        90       100       110       120     

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
       .:::::.: .  :. ::  :::::::::::: ::  .: :::.:::.::::::.:: .::
NP_055 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
         130       140       150       160       170       180     

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB6 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
        : .: .:::: ::. .::...  :.:::.:::::: :..::.:: :::::..:::::.:
NP_055 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKV
         190       200       210       220       230       240     

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB6 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSALG-DLAPS
         ::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: :  .: .  :   
NP_055 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
         250       260       270       280       290       300     

         280       290       300       310       320        330    
pF1KB6 RPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELARE
       . : .    .::   :.. :.  :::  : :.:.:: :..: .:: .  :.  .:.. .:
NP_055 ERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
         310            320          330       340       350       

          340       350       360            370       380         
pF1KB6 PRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRERA
        .     :::.    .::. .: .   :     :.. . :  :...  . . :  ..   
NP_055 EQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGE-ERDQFTDRADGLHSEFMN
       360          370       380       390        400       410   

     390       400       410           420       430               
pF1KB6 PSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL---
        ..: :.   ::  : .    :: .      ..:... :     .   : :  : ::   
NP_055 YKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTD
           420         430       440       450       460       470 

         440            450              460       470       480   
pF1KB6 ---RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SPKSSASQAGAAAGQGAPAPAPASQEP
          :.:.     :.: :.  : .  ::      ::   ...  .  ..:.       .: 
NP_055 ITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIREN
             480       490       500       510       520       530 

           490       500       510       520       530       540   
pF1KB6 LPIAGPATAPAPRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDSVLRPRRYPQVPDEKDLMTQ
        : ..:.:  .  :.:   .: : ..:   : .    .:. ..: :.. :. .::.:. :
NP_055 SPAVSPTTN-STAPFG--LKPRSVFLRP--QRNLESIDPQFTIR-RKMEQMREEKELVEQ
             540          550         560       570        580     

           550       560       570       580       590       600   
pF1KB6 LRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVILCQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKN
       ::. .: ::.  : :::. :: .::.::.:.:..:::::  ::::::::::::  : :.:
NP_055 LRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRN
         590       600       610       620       630       640     

           610       620       630       640       650         660 
pF1KB6 VESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWP--PSGLGG
       ::.:::::::.:::::::::: :.::   : .: .....  .: :: ::        : :
NP_055 VENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIG
         650       660       670       680       690       700     

             670       680    
pF1KB6 FVVFYVVLMLLLYVTYTRLLGS 
       : . ......:.:.::       
NP_055 FCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
         710       720        

>>NP_001157683 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and ca  (763 aa)
 initn: 1441 init1: 976 opt: 1019  Z-score: 619.2  bits: 125.1 E(85289): 9.5e-28
Smith-Waterman score: 1464; 43.0% identity (64.7% similar) in 709 aa overlap (7-652:41-729)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
                                     :: .:::  ...     :. .::  :. ::
NP_001 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
               20        30        40        50             60     

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB6 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
       :::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. :::   :..:::: :
NP_001 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
          70        80        90       100       110       120     

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
       .:::::.: .  :. ::  :::::::::::: ::  .: :::.:::.::::::.:: .::
NP_001 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
         130       140       150       160       170       180     

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB6 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
        : .: .:::: ::. .::...  :.:::.:::::: :..::.:: :::::..:::::.:
NP_001 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKV
         190       200       210       220       230       240     

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB6 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSALG-DLAPS
         ::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: :  .: .  :   
NP_001 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
         250       260       270       280       290       300     

         280       290       300       310       320        330    
pF1KB6 RPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELARE
       . : .    .::   :.. :.  :::  : :.:.:: :..: .:: .  :.  .:.. .:
NP_001 ERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
         310            320          330       340       350       

          340       350       360            370       380         
pF1KB6 PRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRERA
        .     :::.    .::. .: .   :     :.. . :  :...  . . :  ..   
NP_001 EQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGE-ERDQFTDRADGLHSEFMN
       360          370       380       390        400       410   

     390       400       410           420       430               
pF1KB6 PSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL---
        ..: :.   ::  : .    :: .      ..:... :     .   : :  : ::   
NP_001 YKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTD
           420         430       440       450       460       470 

         440            450                        460        470  
pF1KB6 ---RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SP----------KSSASQ-AGAAAGQG
          :.:.     :.: :.  : .  ::      ::          .:..:: .     ..
NP_001 ITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIREN
             480       490       500       510       520       530 

            480        490          500       510       520        
pF1KB6 APAPAPASQEPLPIA-GPATAPA---PRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDSV-LR
       .:: .:...   :..  : . ::   : :..     ..  . ::: :  . .. :.: ::
NP_001 SPAVSPTTNSTAPFGLKPRSDPALILP-PISFNTLTQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLR
             540       550        560       570       580       590

                     530       540       550       560       570   
pF1KB6 P--------------RRYPQVPDEKDLMTQLRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVILCQL
       :              :.. :. .::.:. :::. .: ::.  : :::. :: .::.::.:
NP_001 PQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHL
              600       610       620       630       640       650

           580       590       600       610       620       630   
pF1KB6 ANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKNVESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTAR
       .:..:::::  ::::::::::::  : :.:::.:::::::.:::::::::: :.::   :
NP_001 VNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFR
              660       670       680       690       700       710

           640       650       660       670       680      
pF1KB6 GLRTALEAVKRVGGKALPPLWPPSGLGGFVVFYVVLMLLLYVTYTRLLGS   
        .: .....  .: :: ::                                  
NP_001 HIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
              720       730       740       750       760   

>>XP_016875972 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-rich re  (731 aa)
 initn: 1340 init1: 965 opt: 1008  Z-score: 612.9  bits: 123.9 E(85289): 2.1e-27
Smith-Waterman score: 1380; 42.3% identity (63.7% similar) in 695 aa overlap (7-635:41-710)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
                                     :: .:::  ...     :. .::  :. ::
XP_016 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
               20        30        40        50             60     

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB6 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
       :::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. :::   :..:::: :
XP_016 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
          70        80        90       100       110       120     

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
       .:::::.: .  :. ::  :::::::::::: ::  .: :::.:::.::::::.:: .::
XP_016 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
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        160       170       180       190       200       210      
pF1KB6 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
        : .: .:::: ::. .::...  :.:::.:::::: :..::.:: :: ::..:::::.:
XP_016 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKV
         190       200       210       220       230       240     

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB6 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSALG-DLAPS
         ::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: :  .: .  :   
XP_016 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
         250       260       270       280       290       300     

         280       290       300       310       320        330    
pF1KB6 RPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELARE
       . : .    .::   :.. :.  :::  : :.:.:: :..: .:: .  :.  .:.. .:
XP_016 ERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
         310            320          330       340       350       

          340       350       360            370       380         
pF1KB6 PRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRERA
        .     :::.    .::. .: .   :     :.. . :  ..:   . . :  ..   
XP_016 EQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDR-ADGLHSEFMN
       360          370       380       390       400        410   

     390       400       410           420       430               
pF1KB6 PSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL---
        ..: :.   ::  : .    :: .      ..:... :     .   : :  : ::   
XP_016 YKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTD
           420         430       440       450       460       470 

         440            450                        460        470  
pF1KB6 ---RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SP----------KSSASQ-AGAAAGQG
          :.:.     :.: :.  : .  ::      ::          .:..:: .     ..
XP_016 ITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIREN
             480       490       500       510       520       530 

            480        490           500       510       520       
pF1KB6 APAPAPASQEPLPIA-GPATAPA----PRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDS---
       .:: .:...   :..  : . ::    :  .... . ...    .:.: : ::  ::   
XP_016 SPAVSPTTNSTAPFGLKPRSDPALILPPISFNTLTQAQTW----DSSSYSVPSEGDSDNV
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pF1KB6 VLRP--------------RRYPQVPDEKDLMTQLRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVIL
        :::              :.. :. .::.:. :::. .: ::.  : :::. :: .::.:
XP_016 FLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVL
       590       600       610       620       630       640       

              580       590       600       610       620       630
pF1KB6 CQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKNVESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQG
       :.:.:..:::::  ::::::::::::  : :.:::.:::::::.::::  :: :  .:. 
XP_016 CHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILE-
       650       660       670       680       690       700       

              640       650       660       670       680   
pF1KB6 TARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWPPSGLGGFVVFYVVLMLLLYVTYTRLLGS
         .::                                                
XP_016 -EKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT                           
         710       720       730                            

>>XP_016875973 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-rich re  (477 aa)
 initn: 610 init1: 389 opt: 413  Z-score: 263.8  bits: 58.7 E(85289): 5.9e-08
Smith-Waterman score: 608; 35.1% identity (57.1% similar) in 476 aa overlap (226-635:1-456)

         200       210       220       230       240       250     
pF1KB6 TLPEELGDLPLVRLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIF
                                     ...:::.::..:::::::::.: :::.:::
XP_016                               MKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIF
                                             10        20        30

         260       270        280       290       300       310    
pF1KB6 KYLSTEAGQRGSALG-DLAPSRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSG
       :::: .: :  .: .  :   . : .    .::   :.. :.  :::  : :.:.:: :.
XP_016 KYLSIQACQIKTADSLYLHTMERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSA
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pF1KB6 NESTDEFS-ELSFRISELAREPRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEER
       .: .:: .  :.  .:.. .: .     :::.    .::. .: .   :     :.. . 
XP_016 TEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNS
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pF1KB6 GTVEEQRPPELSPGAGDRERAPSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGA
       :  ..:   . . :  ..    ..: :.   ::  : .    :: .      ..:... :
XP_016 GEERDQFTDR-ADGLHSEFMNYKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIA
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pF1KB6 WGAPRK---DSLLKP-GL------RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SP----
            .   : :  : ::      :.:.     :.: :.  : .  ::      ::    
XP_016 MIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEV
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pF1KB6 ------KSSASQ-AGAAAGQGAPAPAPASQEPLPIA-GPATAPA----PRPLGSIQRPNS
             .:..:: .     ...:: .:...   :..  : . ::    :  .... . ..
XP_016 QSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTNSTAPFGLKPRSDPALILPPISFNTLTQAQT
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        510       520                        530       540         
pF1KB6 FLFRSSSQSGSGPSSPDS---VLRP--------------RRYPQVPDEKDLMTQLRQVLE
       .    .:.: : ::  ::    :::              :.. :. .::.:. :::. .:
XP_016 W----DSSSYSVPSEGDSDNVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIE
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pF1KB6 SRLQRPLPEDLAEALASGVILCQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKNVESFLE
        ::.  : :::. :: .::.::.:.:..:::::  ::::::::::::  : :.:::.:::
XP_016 MRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLE
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pF1KB6 ACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWPPSGLGGFVVFYVVL
       ::::.::::  :: :  .:.   .::                                  
XP_016 ACRKLGVPEEKLCLPHHILE--EKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT             
            440       450         460       470                    

>>NP_665894 (OMIM: 605247) p53-induced protein with a de  (893 aa)
 initn: 524 init1: 211 opt: 400  Z-score: 252.5  bits: 57.5 E(85289): 2.5e-07
Smith-Waterman score: 400; 41.5% identity (66.2% similar) in 195 aa overlap (54-244:114-302)

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pF1KB6 GSPGLPGRRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEV
                                     : ..: : .    :. ... ::: : .  .
NP_665 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLS---GLAHLAHLDLSFNSLETL
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pF1KB6 PEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLP-LRVLI
       :  . :. .: .: : ::::  :  ::: : :::.:....:.:. ::: .  :  :. : 
NP_665 PACVLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLD
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            150       160       170       180       190       200  
pF1KB6 VSNNKLGALPPDIGTLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELG
       .:.: : .:::.:: :::: .:...::.:::::. : :: ::: : .. : :...: .:.
NP_665 LSQNLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLA
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             210       220       230         240       250         
pF1KB6 DLPLV-RLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPL--QSPPAQVCLKGKLHIFKYLS
        :::. :::.  :..  .:    .:     . :..:::   :: :               
NP_665 RLPLLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRL
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     260       270       280       290       300       310         
pF1KB6 TEAGQRGSALGDLAPSRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTD
                                                                   
NP_665 FLTSDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALL
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>>XP_011518513 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced dea  (893 aa)
 initn: 524 init1: 211 opt: 400  Z-score: 252.5  bits: 57.5 E(85289): 2.5e-07
Smith-Waterman score: 400; 41.5% identity (66.2% similar) in 195 aa overlap (54-244:114-302)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KB6 GSPGLPGRRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEV
                                     : ..: : .    :. ... ::: : .  .
XP_011 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLS---GLAHLAHLDLSFNSLETL
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            90       100       110       120       130        140  
pF1KB6 PEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLP-LRVLI
       :  . :. .: .: : ::::  :  ::: : :::.:....:.:. ::: .  :  :. : 
XP_011 PACVLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLD
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            150       160       170       180       190       200  
pF1KB6 VSNNKLGALPPDIGTLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELG
       .:.: : .:::.:: :::: .:...::.:::::. : :: ::: : .. : :...: .:.
XP_011 LSQNLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLA
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pF1KB6 DLPLV-RLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPL--QSPPAQVCLKGKLHIFKYLS
        :::. :::.  :..  .:    .:     . :..:::   :: :               
XP_011 RLPLLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRL
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     260       270       280       290       300       310         
pF1KB6 TEAGQRGSALGDLAPSRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTD
                                                                   
XP_011 FLTSDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALL
       320       330       340       350       360       370       

>>XP_011518512 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced dea  (910 aa)
 initn: 524 init1: 211 opt: 400  Z-score: 252.4  bits: 57.5 E(85289): 2.5e-07
Smith-Waterman score: 400; 41.5% identity (66.2% similar) in 195 aa overlap (54-244:114-302)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KB6 GSPGLPGRRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEV
                                     : ..: : .    :. ... ::: : .  .
XP_011 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLS---GLAHLAHLDLSFNSLETL
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            90       100       110       120       130        140  
pF1KB6 PEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLP-LRVLI
       :  . :. .: .: : ::::  :  ::: : :::.:....:.:. ::: .  :  :. : 
XP_011 PACVLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLD
              150       160       170       180       190       200

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB6 VSNNKLGALPPDIGTLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELG
       .:.: : .:::.:: :::: .:...::.:::::. : :: ::: : .. : :...: .:.
XP_011 LSQNLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLA
              210       220       230       240       250       260

             210       220       230         240       250         
pF1KB6 DLPLV-RLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPL--QSPPAQVCLKGKLHIFKYLS
        :::. :::.  :..  .:    .:     . :..:::   :: :               
XP_011 RLPLLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRL
              270       280          290       300       310       

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB6 TEAGQRGSALGDLAPSRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTD
                                                                   
XP_011 FLTSDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALL
       320       330       340       350       360       370       

>>NP_665893 (OMIM: 605247) p53-induced protein with a de  (910 aa)
 initn: 524 init1: 211 opt: 400  Z-score: 252.4  bits: 57.5 E(85289): 2.5e-07
Smith-Waterman score: 400; 41.5% identity (66.2% similar) in 195 aa overlap (54-244:114-302)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KB6 GSPGLPGRRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEV
                                     : ..: : .    :. ... ::: : .  .
NP_665 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLS---GLAHLAHLDLSFNSLETL
            90       100       110       120          130       140

            90       100       110       120       130        140  
pF1KB6 PEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLP-LRVLI
       :  . :. .: .: : ::::  :  ::: : :::.:....:.:. ::: .  :  :. : 
NP_665 PACVLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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