seq1 = pF1KE5408.tfa, 1008 bp seq2 = pF1KE5408/gi568815597f_233514172.tfa (gi568815597f:233514172_233771527), 257356 bp >pF1KE5408 1008 >gi568815597f:233514172_233771527 (Chr1) 1-355 (100001-100355) 100% -> 356-751 (152424-152819) 100% -> 752-1008 (157100-157356) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCTGCAGTCCCTGGCCGGCAGCTCGTGCGTGCGCCTGGTGGAGCGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGCTGCAGTCCCTGGCCGGCAGCTCGTGCGTGCGCCTGGTGGAGCGGCA 50 . : . : . : . : . : 51 CCGCTCGGCCTGGTGCTTCGGCTTCCTGGTGCTGGGCTACTTGCTCTACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CCGCTCGGCCTGGTGCTTCGGCTTCCTGGTGCTGGGCTACTTGCTCTACC 100 . : . : . : . : . : 101 TGGTCTTCGGCGCAGTGGTCTTCTCCTCGGTGGAGCTGCCCTATGAGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TGGTCTTCGGCGCAGTGGTCTTCTCCTCGGTGGAGCTGCCCTATGAGGAC 150 . : . : . : . : . : 151 CTGCTGCGCCAGGAGCTGCGCAAGCTGAAGCGACGCTTCTTGGAGGAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 CTGCTGCGCCAGGAGCTGCGCAAGCTGAAGCGACGCTTCTTGGAGGAGCA 200 . : . : . : . : . : 201 CGAGTGCCTGTCTGAGCAGCAGCTGGAGCAGTTCCTGGGCCGGGTGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 CGAGTGCCTGTCTGAGCAGCAGCTGGAGCAGTTCCTGGGCCGGGTGCTGG 250 . : . : . : . : . : 251 AGGCCAGCAACTACGGCGTGTCGGTGCTCAGCAACGCCTCGGGCAACTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 AGGCCAGCAACTACGGCGTGTCGGTGCTCAGCAACGCCTCGGGCAACTGG 300 . : . : . : . : . : 301 AACTGGGACTTCACCTCCGCGCTCTTCTTCGCCAGCACCGTGCTCTCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 AACTGGGACTTCACCTCCGCGCTCTTCTTCGCCAGCACCGTGCTCTCCAC 350 . : . : . : . : . : 351 CACAG GTTATGGCCACACCGTGCCCTTGTCAGATGGAGGTA |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100351 CACAGGTA...CAGGTTATGGCCACACCGTGCCCTTGTCAGATGGAGGTA 400 . : . : . : . : . : 392 AGGCCTTCTGCATCATCTACTCCGTCATTGGCATTCCCTTCACCCTCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152460 AGGCCTTCTGCATCATCTACTCCGTCATTGGCATTCCCTTCACCCTCCTG 450 . : . : . : . : . : 442 TTCCTGACGGCTGTGGTCCAGCGCATCACCGTGCACGTCACCCGCAGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152510 TTCCTGACGGCTGTGGTCCAGCGCATCACCGTGCACGTCACCCGCAGGCC 500 . : . : . : . : . : 492 GGTCCTCTACTTCCACATCCGCTGGGGCTTCTCCAAGCAGGTGGTGGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152560 GGTCCTCTACTTCCACATCCGCTGGGGCTTCTCCAAGCAGGTGGTGGCCA 550 . : . : . : . : . : 542 TCGTCCATGCCGTGCTCCTTGGGTTTGTCACTGTGTCCTGCTTCTTCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152610 TCGTCCATGCCGTGCTCCTTGGGTTTGTCACTGTGTCCTGCTTCTTCTTC 600 . : . : . : . : . : 592 ATCCCGGCCGCTGTCTTCTCAGTCCTGGAGGATGACTGGAACTTCCTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152660 ATCCCGGCCGCTGTCTTCTCAGTCCTGGAGGATGACTGGAACTTCCTGGA 650 . : . : . : . : . : 642 ATCCTTTTATTTTTGTTTTATTTCCCTGAGCACCATTGGCCTGGGGGATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152710 ATCCTTTTATTTTTGTTTTATTTCCCTGAGCACCATTGGCCTGGGGGATT 700 . : . : . : . : . : 692 ATGTGCCTGGGGAAGGCTACAATCAAAAATTCAGAGAGCTCTATAAGATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152760 ATGTGCCTGGGGAAGGCTACAATCAAAAATTCAGAGAGCTCTATAAGATT 750 . : . : . : . : . : 742 GGGATCACGT GTTACCTGCTACTTGGCCTTATTGCCATGTT ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 152810 GGGATCACGTGTG...CAGGTTACCTGCTACTTGGCCTTATTGCCATGTT 800 . : . : . : . : . : 783 GGTAGTTCTGGAAACCTTCTGTGAACTCCATGAGCTGAAAAAATTCAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 157131 GGTAGTTCTGGAAACCTTCTGTGAACTCCATGAGCTGAAAAAATTCAGAA 850 . : . : . : . : . : 833 AAATGTTCTATGTGAAGAAGGACAAGGACGAGGATCAGGTGCACATCATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 157181 AAATGTTCTATGTGAAGAAGGACAAGGACGAGGATCAGGTGCACATCATA 900 . : . : . : . : . : 883 GAGCATGACCAACTGTCATTCTCCTCGATCACAGACCAGGCAGCTGGCAT ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 157231 GAGCATGACCAACTGTCCTTCTCCTCGATCACAGACCAGGCAGCTGGCAT 950 . : . : . : . : . : 933 GAAAGAGGACCAGAAGCAAAATGAGCCTTTTGTGGCCACCCAGTCATCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 157281 GAAAGAGGACCAGAAGCAAAATGAGCCTTTTGTGGCCACCCAGTCATCTG 1000 . : . : . 983 CCTGCGTGGATGGCCCTGCAAACCAT |||||||||||||||||||||||||| 157331 CCTGCGTGGATGGCCCTGCAAACCAT