seq1 = pF1KE1387.tfa, 2946 bp seq2 = pF1KE1387/gi568815595r_105558973.tfa (gi568815595r:105558973_105967577), 408605 bp >pF1KE1387 2946 >gi568815595r:105558973_105967577 (Chr3) (complement) 1-168 (100001-100168) 100% -> 169-419 (113914-114164) 100% -> 420-566 (191036-191182) 100% -> 567-723 (215960-216116) 100% -> 724-845 (221540-221661) 100% -> 846-983 (226947-227084) 100% -> 984-1071 (230320-230407) 100% -> 1072-1203 (233438-233569) 100% -> 1204-1407 (247328-247531) 99% -> 1408-1593 (263405-263590) 100% -> 1594-1959 (265119-265484) 99% -> 1960-2054 (273990-274084) 100% -> 2055-2201 (282112-282258) 100% -> 2202-2296 (285760-285854) 100% -> 2297-2428 (285968-286099) 100% -> 2429-2569 (289007-289147) 100% -> 2570-2689 (297226-297345) 99% -> 2690-2946 (308349-308605) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCAAACTCAATGAATGGCAGAAACCCTGGTGGTCGAGGAGGAAATCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCAAACTCAATGAATGGCAGAAACCCTGGTGGTCGAGGAGGAAATCC 50 . : . : . : . : . : 51 CCGAAAAGGTCGAATTTTGGGTATTATTGATGCTATTCAGGATGCAGTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CCGAAAAGGTCGAATTTTGGGTATTATTGATGCTATTCAGGATGCAGTTG 100 . : . : . : . : . : 101 GACCCCCTAAGCAAGCTGCCGCAGATCGCAGGACCGTGGAGAAGACTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 GACCCCCTAAGCAAGCTGCCGCAGATCGCAGGACCGTGGAGAAGACTTGG 150 . : . : . : . : . : 151 AAGCTCATGGACAAAGTG GTAAGACTGTGCCAAAATCCCAA ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 100151 AAGCTCATGGACAAAGTGGTA...TAGGTAAGACTGTGCCAAAATCCCAA 200 . : . : . : . : . : 192 ACTTCAGTTGAAAAATAGCCCACCATATATACTTGATATTTTGCCTGATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113937 ACTTCAGTTGAAAAATAGCCCACCATATATACTTGATATTTTGCCTGATA 250 . : . : . : . : . : 242 CATATCAGCATTTACGACTTATATTGAGTAAATATGATGACAACCAGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113987 CATATCAGCATTTACGACTTATATTGAGTAAATATGATGACAACCAGAAA 300 . : . : . : . : . : 292 CTTGCCCAACTCAGTGAGAATGAGTACTTTAAAATCTACATTGATAGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114037 CTTGCCCAACTCAGTGAGAATGAGTACTTTAAAATCTACATTGATAGCCT 350 . : . : . : . : . : 342 TATGAAAAAGTCAAAACGGGCAATAAGACTCTTTAAAGAAGGCAAGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114087 TATGAAAAAGTCAAAACGGGCAATAAGACTCTTTAAAGAAGGCAAGGAGA 400 . : . : . : . : . : 392 GAATGTATGAAGAACAGTCACAGGACAG ACGAAATCTCACA ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 114137 GAATGTATGAAGAACAGTCACAGGACAGGTA...CAGACGAAATCTCACA 450 . : . : . : . : . : 433 AAACTGTCCCTTATCTTCAGTCACATGCTGGCAGAAATCAAAGCAATCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 191049 AAACTGTCCCTTATCTTCAGTCACATGCTGGCAGAAATCAAAGCAATCTT 500 . : . : . : . : . : 483 TCCCAATGGTCAATTCCAGGGAGATAACTTTCGTATCACAAAAGCAGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 191099 TCCCAATGGTCAATTCCAGGGAGATAACTTTCGTATCACAAAAGCAGATG 550 . : . : . : . : . : 533 CTGCTGAATTCTGGAGAAAGTTTTTTGGAGACAA AACTATC ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 191149 CTGCTGAATTCTGGAGAAAGTTTTTTGGAGACAAGTA...CAGAACTATC 600 . : . : . : . : . : 574 GTACCATGGAAAGTATTCAGACAGTGCCTTCATGAGGTCCACCAGATTAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 215967 GTACCATGGAAAGTATTCAGACAGTGCCTTCATGAGGTCCACCAGATTAG 650 . : . : . : . : . : 624 CTCTGGCCTGGAAGCAATGGCTCTAAAATCAACAATTGATTTAACTTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 216017 CTCTGGCCTGGAAGCAATGGCTCTAAAATCAACAATTGATTTAACTTGCA 700 . : . : . : . : . : 674 ATGATTACATTTCAGTTTTTGAATTTGATATTTTTACCAGGCTGTTTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 216067 ATGATTACATTTCAGTTTTTGAATTTGATATTTTTACCAGGCTGTTTCAG 750 . : . : . : . : . : 724 CCTTGGGGCTCTATTTTGCGGAATTGGAATTTCTTAGCTGT >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 216117 GTA...TAGCCTTGGGGCTCTATTTTGCGGAATTGGAATTTCTTAGCTGT 800 . : . : . : . : . : 765 GACACATCCAGGTTACATGGCATTTCTCACATATGATGAAGTTAAAGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 221581 GACACATCCAGGTTACATGGCATTTCTCACATATGATGAAGTTAAAGCAC 850 . : . : . : . : . : 815 GACTACAGAAATATAGCACCAAACCCGGAAG CTATATTTTC |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 221631 GACTACAGAAATATAGCACCAAACCCGGAAGGTA...CAGCTATATTTTC 900 . : . : . : . : . : 856 CGGTTAAGTTGCACTCGATTGGGACAGTGGGCCATTGGCTATGTGACTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 226957 CGGTTAAGTTGCACTCGATTGGGACAGTGGGCCATTGGCTATGTGACTGG 950 . : . : . : . : . : 906 GGATGGGAATATCTTACAGACCATACCTCATAACAAGCCCTTATTTCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 227007 GGATGGGAATATCTTACAGACCATACCTCATAACAAGCCCTTATTTCAAG 1000 . : . : . : . : . : 956 CCCTGATTGATGGCAGCAGGGAAGGATT TTATCTTTATCCT ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 227057 CCCTGATTGATGGCAGCAGGGAAGGATTGTA...CAGTTATCTTTATCCT 1050 . : . : . : . : . : 997 GATGGGAGGAGTTATAATCCTGATTTAACTGGATTATGTGAACCTACACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 230333 GATGGGAGGAGTTATAATCCTGATTTAACTGGATTATGTGAACCTACACC 1100 . : . : . : . : . : 1047 TCATGACCATATAAAAGTTACACAG GAACAATATGAATTAT |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 230383 TCATGACCATATAAAAGTTACACAGGTA...CAGGAACAATATGAATTAT 1150 . : . : . : . : . : 1088 ATTGTGAAATGGGCTCCACTTTTCAGCTCTGTAAGATTTGTGCAGAGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233454 ATTGTGAAATGGGCTCCACTTTTCAGCTCTGTAAGATTTGTGCAGAGAAT 1200 . : . : . : . : . : 1138 GACAAAGATGTCAAGATTGAGCCTTGTGGGCATTTGATGTGCACCTCTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233504 GACAAAGATGTCAAGATTGAGCCTTGTGGGCATTTGATGTGCACCTCTTG 1250 . : . : . : . : . : 1188 CCTTACGGCATGGCAG GAGTCGGATGGTCAGGGCTGCCCTT ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 233554 CCTTACGGCATGGCAGGTA...TAGGAGTCGGATGGTCAGGGCTGCCCTT 1300 . : . : . : . : . : 1229 TCTGTCGTTGTGAAATAAAAGGAACTGAGCCCATAATCGTGGATCCCTTT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 247353 TCTGTCGTTGTGAAATAAAAGGAACTGAGCCCATAATCGTGGACCCCTTT 1350 . : . : . : . : . : 1279 GATCCAAGAGATGAAGGCTCCAGGTGTTGCAGCATCATTGACCCCTTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 247403 GATCCAAGAGATGAAGGCTCCAGGTGTTGCAGCATCATTGACCCCTTTGG 1400 . : . : . : . : . : 1329 CATGCCGATGCTCGACTTGGACGACGATGATGATCGTGAGGAGTCCTTGA |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 247453 CATGCCGATGCTAGACTTGGACGACGATGATGATCGTGAGGAGTCCTTGA 1450 . : . : . : . : . : 1379 TGATGAATCGGTTGGCAAACGTCCGAAAG TGCACTGACAGG |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 247503 TGATGAATCGGTTGGCAAACGTCCGAAAGGTA...TAGTGCACTGACAGG 1500 . : . : . : . : . : 1420 CAGAACTCACCAGTCACATCACCAGGATCCTCTCCCCTTGCCCAGAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 263417 CAGAACTCACCAGTCACATCACCAGGATCCTCTCCCCTTGCCCAGAGAAG 1550 . : . : . : . : . : 1470 AAAGCCACAGCCTGACCCACTCCAGATCCCACATCTAAGCCTGCCACCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 263467 AAAGCCACAGCCTGACCCACTCCAGATCCCACATCTAAGCCTGCCACCCG 1600 . : . : . : . : . : 1520 TGCCTCCTCGCCTGGATCTAATTCAGAAAGGCATAGTTAGATCTCCCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 263517 TGCCTCCTCGCCTGGATCTAATTCAGAAAGGCATAGTTAGATCTCCCTGT 1650 . : . : . : . : . : 1570 GGCAGCCCAACGGGTTCACCAAAG TCTTCTCCTTGCATGGT ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 263567 GGCAGCCCAACGGGTTCACCAAAGGTA...TAGTCTTCTCCTTGCATGGT 1700 . : . : . : . : . : 1611 GAGAAAACAAGATAAACCACTCCCAGCACCACCTCCTCCCTTAAGAGATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265136 GAGAAAACAAGATAAACCACTCCCAGCACCACCTCCTCCCTTAAGAGATC 1750 . : . : . : . : . : 1661 CTCCTCCACCGCCACCTGAAAGACCTCCACCAATCCCACCAGACAATAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265186 CTCCTCCACCGCCACCTGAAAGACCTCCACCAATCCCACCAGACAATAGA 1800 . : . : . : . : . : 1711 CTGAGTAGACACATCCATCATGTGGAAAGCGTGCCTTCCAAAGACCCGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| 265236 CTGAGTAGACACATCCATCATGTGGAAAGCGTGCCTTCCAGAGACCCGCC 1850 . : . : . : . : . : 1761 AATGCCTCTTGAAGCATGGTGCCCTCGGGATGTGTTTGGGACTAATCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265286 AATGCCTCTTGAAGCATGGTGCCCTCGGGATGTGTTTGGGACTAATCAGC 1900 . : . : . : . : . : 1811 TTGTGGGATGTCGACTCCTAGGGGAGGGCTCTCCAAAACCTGGAATCACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265336 TTGTGGGATGTCGACTCCTAGGGGAGGGCTCTCCAAAACCTGGAATCACA 1950 . : . : . : . : . : 1861 GCGAGTTCAAATGTCAATGGAAGGCACAGTAGAGTGGGCTCTGACCCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265386 GCGAGTTCAAATGTCAATGGAAGGCACAGTAGAGTGGGCTCTGACCCAGT 2000 . : . : . : . : . : 1911 GCTTATGCGGAAACACAGACGCCATGATTTGCCTTTAGAAGGAGCTAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 265436 GCTTATGCGGAAACACAGACGCCATGATTTGCCTTTAGAAGGAGCTAAGG 2050 . : . : . : . : . : 1960 GTCTTTTCCAATGGTCACCTTGGAAGTGAAGAATATGATGTT >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265486 TA...CAGGTCTTTTCCAATGGTCACCTTGGAAGTGAAGAATATGATGTT 2100 . : . : . : . : . : 2002 CCTCCCCGGCTTTCTCCTCCTCCTCCAGTTACCACCCTCCTCCCTAGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 274032 CCTCCCCGGCTTTCTCCTCCTCCTCCAGTTACCACCCTCCTCCCTAGCAT 2150 . : . : . : . : . : 2052 AAA GTGTACTGGTCCGTTAGCAAATTCTCTTTCAGAGAAAA |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 274082 AAAGTG...TAGGTGTACTGGTCCGTTAGCAAATTCTCTTTCAGAGAAAA 2200 . : . : . : . : . : 2093 CAAGAGACCCAGTAGAGGAAGATGATGATGAATACAAGATTCCTTCATCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 282150 CAAGAGACCCAGTAGAGGAAGATGATGATGAATACAAGATTCCTTCATCC 2250 . : . : . : . : . : 2143 CACCCTGTTTCCCTGAATTCACAACCATCTCATTGTCATAATGTAAAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 282200 CACCCTGTTTCCCTGAATTCACAACCATCTCATTGTCATAATGTAAAACC 2300 . : . : . : . : . : 2193 TCCTGTTCG GTCTTGTGATAATGGTCACTGTATGCTGAATG |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 282250 TCCTGTTCGGTA...TAGGTCTTGTGATAATGGTCACTGTATGCTGAATG 2350 . : . : . : . : . : 2234 GAACACATGGTCCATCTTCAGAGAAGAAATCAAACATCCCTGACTTAAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 285792 GAACACATGGTCCATCTTCAGAGAAGAAATCAAACATCCCTGACTTAAGC 2400 . : . : . : . : . : 2284 ATATATTTAAAGG GAGATGTTTTTGATTCAGCCTCTGATCC |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 285842 ATATATTTAAAGGGTA...TAGGAGATGTTTTTGATTCAGCCTCTGATCC 2450 . : . : . : . : . : 2325 CGTGCCATTACCACCTGCCAGGCCTCCAACTCGGGACAATCCAAAGCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 285996 CGTGCCATTACCACCTGCCAGGCCTCCAACTCGGGACAATCCAAAGCATG 2500 . : . : . : . : . : 2375 GTTCTTCACTCAACAGGACGCCCTCTGATTATGATCTTCTCATCCCTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 286046 GTTCTTCACTCAACAGGACGCCCTCTGATTATGATCTTCTCATCCCTCCA 2550 . : . : . : . : . : 2425 TTAG GTGAAGATGCTTTTGATGCCCTCCCTCCATCTCTCCC ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 286096 TTAGGTT...CAGGTGAAGATGCTTTTGATGCCCTCCCTCCATCTCTCCC 2600 . : . : . : . : . : 2466 ACCTCCCCCACCTCCTGCAAGGCATAGTCTCATTGAACATTCAAAACCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 289044 ACCTCCCCCACCTCCTGCAAGGCATAGTCTCATTGAACATTCAAAACCTC 2650 . : . : . : . : . : 2516 CTGGCTCCAGTAGCCGGCCATCCTCAGGACAGGATCTTTTTCTTCTTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 289094 CTGGCTCCAGTAGCCGGCCATCCTCAGGACAGGATCTTTTTCTTCTTCCT 2700 . : . : . : . : . : 2566 TCAG ATCCCTTTGTTGATCTAGCAAGTGGCCAAGTTCCTTT ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 289144 TCAGGTA...AAGATCCCTTTGTTGATCTAGCAAGTGGCCAAGTTCCTTT 2750 . : . : . : . : . : 2607 GCCTCCCGCTAGAAGGTTACCAGGTGAAAATGTCAAAACTAACAGAACAT |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 297263 GCCTCCTGCTAGAAGGTTACCAGGTGAAAATGTCAAAACTAACAGAACAT 2800 . : . : . : . : . : 2657 CACAGGACTATGATCAGCTTCCTTCATGTTCAG ATGGTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 297313 CACAGGACTATGATCAGCTTCCTTCATGTTCAGGTG...CAGATGGTTCA 2850 . : . : . : . : . : 2698 CAGGCACCAGCCAGACCCCCTAAACCACGACCGCGCAGGACTGCACCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 308357 CAGGCACCAGCCAGACCCCCTAAACCACGACCGCGCAGGACTGCACCAGA 2900 . : . : . : . : . : 2748 AATTCACCACAGAAAACCCCATGGGCCTGAGGCGGCATTGGAAAATGTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 308407 AATTCACCACAGAAAACCCCATGGGCCTGAGGCGGCATTGGAAAATGTCG 2950 . : . : . : . : . : 2798 ATGCAAAAATTGCAAAACTCATGGGAGAGGGTTATGCCTTTGAAGAGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 308457 ATGCAAAAATTGCAAAACTCATGGGAGAGGGTTATGCCTTTGAAGAGGTG 3000 . : . : . : . : . : 2848 AAGAGAGCCTTAGAGATAGCCCAGAATAATGTCGAAGTTGCCCGGAGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 308507 AAGAGAGCCTTAGAGATAGCCCAGAATAATGTCGAAGTTGCCCGGAGCAT 3050 . : . : . : . : . 2898 CCTCCGAGAATTTGCCTTCCCTCCTCCAGTATCCCCACGTCTAAATCTA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 308557 CCTCCGAGAATTTGCCTTCCCTCCTCCAGTATCCCCACGTCTAAATCTA