Result of SIM4 for pF1KB0461

seq1 = pF1KB0461.tfa, 1329 bp
seq2 = pF1KB0461/gi568815593r_146489950.tfa (gi568815593r:146489950_146978071), 488122 bp

>pF1KB0461 1329
>gi568815593r:146489950_146978071 (Chr5)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-168  (276930-277027)   100% ->
169-334  (279928-280093)   100% ->
335-447  (286832-286944)   100% ->
448-625  (327348-327525)   100% ->
626-790  (339657-339821)   100% ->
791-960  (377612-377781)   100% ->
961-1052  (385010-385101)   100% ->
1053-1329  (387846-388122)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGGACATTGATACCCGCAAAATCAACAACAGTTTCCTGCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGGACATTGATACCCGCAAAATCAACAACAGTTTCCTGCGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACAGCTATGCGACCGAAG         CTGACATTATCTCTACGGTAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CCACAGCTATGCGACCGAAGGTA...CAGCTGACATTATCTCTACGGTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATTCAACCACACGGGAGAATTACTAGCGACAGGGGACAAGGGGGGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276951 AATTCAACCACACGGGAGAATTACTAGCGACAGGGGACAAGGGGGGTCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTGTAATATTTCAACGAGAGCAGGAG         AGTAAAAATCAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 277001 GTTGTAATATTTCAACGAGAGCAGGAGGTA...CAGAGTAAAAATCAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCATCGTAGGGGTGAATACAATGTTTACAGCACATTCCAGAGCCATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279942 TCATCGTAGGGGTGAATACAATGTTTACAGCACATTCCAGAGCCATGAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGAGTTCGATTACCTGAAGAGTTTAGAAATAGAAGAAAAAATCAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279992 CCGAGTTCGATTACCTGAAGAGTTTAGAAATAGAAGAAAAAATCAATAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATAAGATGGCTCCCCCAGCAGAATGCAGCTTACTTTCTTCTGTCTACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280042 ATAAGATGGCTCCCCCAGCAGAATGCAGCTTACTTTCTTCTGTCTACTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TG         ATAAAACTGTGAAGCTGTGGAAAGTCAGCGAGCGTGATA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280092 TGGTA...CAGATAAAACTGTGAAGCTGTGGAAAGTCAGCGAGCGTGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAGGCCAGAAGGCTACAATCTGAAAGATGAGGAGGGCCGGCTCCGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286871 AGAGGCCAGAAGGCTACAATCTGAAAGATGAGGAGGGCCGGCTCCGGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTGCCACCATCACAACCCTGCGG         GTGCCTGTCCTGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 286921 CCTGCCACCATCACAACCCTGCGGGTG...CAGGTGCCTGTCCTGAGACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATGGACCTGATGGTGGAGGCCACCCCACGAAGAGTATTTGCCAACGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327365 CATGGACCTGATGGTGGAGGCCACCCCACGAAGAGTATTTGCCAACGCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACACATATCACATCAACTCCATATCTGTCAACAGCGACTATGAAACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327415 ACACATATCACATCAACTCCATATCTGTCAACAGCGACTATGAAACCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGTCCGCTGATGACCTGAGGATTAACCTATGGAACTTTGAAATAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327465 ATGTCCGCTGATGACCTGAGGATTAACCTATGGAACTTTGAAATAACCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCAAAGTTTTA         ATATTGTGGACATTAAGCCAGCCAACATGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 327515 TCAAAGTTTTAGTA...CAGATATTGTGGACATTAAGCCAGCCAACATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGAGCTCACGGAGGTGATCACAGCAGCCGAGTTCCACCCCCATCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 339687 AGGAGCTCACGGAGGTGATCACAGCAGCCGAGTTCCACCCCCATCATTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AACACCTTCGTGTACAGCAGCAGCAAAGGGACAATCCGGCTGTGTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 339737 AACACCTTCGTGTACAGCAGCAGCAAAGGGACAATCCGGCTGTGTGACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCGGGCATCTGCCCTGTGTGACAGGCACACCAAAT         TTTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 339787 GCGGGCATCTGCCCTGTGTGACAGGCACACCAAATGTG...CAGTTTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAGAGCCGGAAGATCCAAGCAACAGATCATTTTTCTCTGAAATTATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 377618 AAGAGCCGGAAGATCCAAGCAACAGATCATTTTTCTCTGAAATTATCTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCGATTTCGGATGTGAAGTTCAGCCACAGTGGGAGGTATATCATGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 377668 TCGATTTCGGATGTGAAGTTCAGCCACAGTGGGAGGTATATCATGACCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGACTACTTGACCGTCAAAGTCTGGGATCTCAACATGGAAAACCGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 377718 GGACTACTTGACCGTCAAAGTCTGGGATCTCAACATGGAAAACCGCCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCGAGACTTACCAG         GTTCATGACTACCTCCGCAGCAAGCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 377768 TCGAGACTTACCAGGTA...CAGGTTCATGACTACCTCCGCAGCAAGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TGTTCCCTCTATGAAAATGACTGCATTTTTGATAAATTTGAGTGTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 385037 TGTTCCCTCTATGAAAATGACTGCATTTTTGATAAATTTGAGTGTGTGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAATGGGTCAGACAG         TGTCATCATGACAGGCTCCTACAACA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 385087 GAATGGGTCAGACAGGTA...CAGTGTCATCATGACAGGCTCCTACAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACTTCTTCAGGATGTTCGACAGAAACACCAAGCGTGATGTGACCCTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 387872 ACTTCTTCAGGATGTTCGACAGAAACACCAAGCGTGATGTGACCCTTGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCTTCGAGGGAAAACAGCAAGCCCCGGGCTATCCTCAAACCCCGAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 387922 GCTTCGAGGGAAAACAGCAAGCCCCGGGCTATCCTCAAACCCCGAAAAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GTGTGTGGGGGGCAAGCGGAGAAAAGACGAGATCAGTGTCGACAGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 387972 GTGTGTGGGGGGCAAGCGGAGAAAAGACGAGATCAGTGTCGACAGTCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ACTTTAGCAAAAAGATCTTGCATACAGCTTGGCATCCTTCAGAAAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 388022 ACTTTAGCAAAAAGATCTTGCATACAGCTTGGCATCCTTCAGAAAATATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATAGCAGTGGCGGCTACAAATAACCTATATATATTCCAGGACAAGGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 388072 ATAGCAGTGGCGGCTACAAATAACCTATATATATTCCAGGACAAGGTTAA

   1400 
   1329 C
        |
 388122 C

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