seq1 = pF1KE3911.tfa, 2130 bp
seq2 = pF1KE3911/gi568815596r_232779492.tfa (gi568815596r:232779492_233074890), 295399 bp

>pF1KE3911 2130
>gi568815596r:232779492_233074890 (Chr2)

(complement)

1-268  (100001-100268)   100% ->
269-383  (104563-104677)   99% ->
384-526  (147705-147847)   100% ->
527-828  (154306-154607)   99% ->
829-989  (179975-180135)   100% ->
990-1142  (181841-181993)   98% ->
1143-1272  (183404-183533)   100% ->
1273-1347  (186784-186858)   100% ->
1348-1437  (189522-189611)   100% ->
1438-1601  (190747-190910)   100% ->
1602-1757  (191425-191580)   100% ->
1758-1837  (192626-192705)   100% ->
1838-1942  (193641-193745)   100% ->
1943-2130  (195212-195399)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACCAGGGAATCTGAAGATTTGGAAAAGACCCGGAGGAAATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACCAGGGAATCTGAAGATTTGGAAAAGACCCGGAGGAAATCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGTGATCAATGGAACACTGATAATGAACCAGCCAAGGTGAAACCTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGTGATCAATGGAACACTGATAATGAACCAGCCAAGGTGAAACCTGAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TACTCCCAGAAAAAGAGGAGACTTCTCAAGCTGACCAGGATATCCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TACTCCCAGAAAAAGAGGAGACTTCTCAAGCTGACCAGGATATCCAAGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAGAGCCTCATTGCCACATCCCAATTAAGAGAAATTCCATCTTCAATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAAGAGCCTCATTGCCACATCCCAATTAAGAGAAATTCCATCTTCAATCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCATAAGACGCAAAAGCAAAGCCAAGGCCAGAGACAACCCCGAACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCATAAGACGCAAAAGCAAAGCCAAGGCCAGAGACAACCCCGAACGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACGCCAGCTGCCTGGCAG         ATTCACAGGACAATGGAAAATCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100251 ACGCCAGCTGCCTGGCAGGTC...CAGATTCACAGGACAATGGAAAATCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTAAATGAGCCCCTGACCTTGAATATCCCCTGGAGCAGAACGCCTCCTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 104586 GTAAATGAGCCCCTGACCTTGAATATCCCCTGGAGCAGAATGCCTCCTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGAACAGCAATGCAGACAGACCCAGGAGCCCAGGAAATGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104636 CAGAACAGCAATGCAGACAGACCCAGGAGCCCAGGAAATGAGGTA...CA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    384  TGAGTCGTCCTCCACCCCGGGAAATGGGGCCACGCCCGAGGAGTGGCCG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147704 GTGAGTCGTCCTCCACCCCGGGAAATGGGGCCACGCCCGAGGAGTGGCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCCTGGCCGACAGCCCCACCACGCTCACCGAGGCCCTGCGGATGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147754 GCCCTGGCCGACAGCCCCACCACGCTCACCGAGGCCCTGCGGATGATCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCCCATTCCCGCCGACTCCTGGAGAAACCTCATTGAACAAATAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 147804 CCCCATTCCCGCCGACTCCTGGAGAAACCTCATTGAACAAATAGGTG...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    527    GGCTCCTGTATCAGGAATACCGAGATAAATCGACTCTCCAAGAAATC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154303 CAGGGCTCCTGTATCAGGAATACCGAGATAAATCGACTCTCCAAGAAATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAACCAGGAGGCAACAGGATGCAGAAATAGAAGACAATACCAATGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154353 GAAACCAGGAGGCAACAGGATGCAGAAATAGAAGACAATACCAATGGGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCCGGCCAGTGAGGACACCCCGGAGGAGGAAGAAGAAGAGGAGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154403 CCCGGCCAGTGAGGACACCCCGGAGGAGGAAGAAGAAGAGGAGGAGGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGGAGCCGGCCAGCCCACCAGAGAGGAAGACTCTGCCCCAGATCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154453 AGGAGCCGGCCAGCCCACCAGAGAGGAAGACTCTGCCCCAGATCTGCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTCAGTAACCCCCACTCAAGGTTCAACCTCTGGCAGGATCTTCCCGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154503 CTCAGTAACCCCCACTCAAGGTTCAACCTCTGGCAGGATCTTCCCGAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCGGAGCAGCGGGGTGCTTGAGATCCTACAGCCTGAGGAGATTAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 154553 CCGGAGCAGCGGGGTGCTTGAGATCCTACAGCCCGAGGAGATTAAGCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGGAG         GCCATGTTCGAGCTGGTCACTTCCGAGGCGTCCTAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154603 AGGAGGTA...CAGGCCATGTTCGAGCTGGTCACTTCCGAGGCGTCCTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TACAAGAGTCTGAACCTGCTCGTGTCCCACTTCATGGAGAACGAGCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180011 TACAAGAGTCTGAACCTGCTCGTGTCCCACTTCATGGAGAACGAGCGGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AAGGAAGATCCTGCACCCGTCCGAGGCGCACATCCTCTTCTCCAACGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180061 AAGGAAGATCCTGCACCCGTCCGAGGCGCACATCCTCTTCTCCAACGTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGGACGTGCTGGCTGTCAGTGAGCG         GTTCCTCCTGGAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 180111 TGGACGTGCTGGCTGTCAGTGAGCGGTG...TAGGTTCCTCCTGGAGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAGCACCGGATGGAGGAGAACATCGTCATCTCTGACGTGTGTGACATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 181857 GAGCACCGGATGGAGGAGAACATCGTCATCTCTGACGTGTGTGACATTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GTACCGTTATGCGGCTGACCACTTCTCTGTCTACATCACCTACGTCAGCA
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181907 GTACCGTTATGCGGCCGACCACTTCTCTGTCTACATCACCTACGTCAGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ATCAGACCTACCAGGAGCGGACCTATAAGCAGCTGCT         CCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 181957 ATCAGACCTACCAGGAGCGGACCTATAAGCAGCTGCTGTG...CAGCCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAGAAGGCAGCTTTCCGGGAGCTGATCGCGCAGCTAGAGCTCGACCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183408 GAGAAGGCAGCTTTCCGGGAGCTGATCGCGCAGCTAGAGCTCGACCCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GTGCAGGGGGCTGCCCTTCTCCTCCTTCCTCATCCTGCCTTTCCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183458 GTGCAGGGGGCTGCCCTTCTCCTCCTTCCTCATCCTGCCTTTCCAGAGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TCACACGCCTCAAGCTGTTGGTCCAG         AACATCCTGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 183508 TCACACGCCTCAAGCTGTTGGTCCAGGTA...TAGAACATCCTGAAGAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GTAGAAGAGAGGTCTGAGCGGGAGTGCACTGCTTTGGATGCTCACAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186799 GTAGAAGAGAGGTCTGAGCGGGAGTGCACTGCTTTGGATGCTCACAAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GCTGGAAATG         GTGGTGAAGGCATGCAACGAGGGCGTCAGGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 186849 GCTGGAAATGGTG...CAGGTGGTGAAGGCATGCAACGAGGGCGTCAGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AAATGAGCCGCACGGAACAGATGATCAGCATTCAGAAGAAGATGGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189553 AAATGAGCCGCACGGAACAGATGATCAGCATTCAGAAGAAGATGGAGTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AAGATCAAG         TCGGTGCCCATCATCTCCCACTCCCGCTGGCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 189603 AAGATCAAGGTG...CAGTCGGTGCCCATCATCTCCCACTCCCGCTGGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GCTGAAGCAGGGTGAGCTGCAGCAGATGTCAGGCCCCAAGACCTCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190779 GCTGAAGCAGGGTGAGCTGCAGCAGATGTCAGGCCCCAAGACCTCCCGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCCTGAGGACCAAGAAGCTCTTCCACGAAATTTACCTCTTCCTGTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190829 CCCTGAGGACCAAGAAGCTCTTCCACGAAATTTACCTCTTCCTGTTCAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GACCTGCTGGTGATCTGCCGGCAGATTCCAGG         AGACAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 190879 GACCTGCTGGTGATCTGCCGGCAGATTCCAGGGTG...CAGAGACAAGTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CCAGGTATTTGACTCAGCTCCGCGGGGACTGCTGCGTGTGGAGGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191434 CCAGGTATTTGACTCAGCTCCGCGGGGACTGCTGCGTGTGGAGGAGCTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AGGACCAGGGCCAGACGCTGGCCAACGTGTTCATCCTGCGGCTGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191484 AGGACCAGGGCCAGACGCTGGCCAACGTGTTCATCCTGCGGCTGCTGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 AACGCAGATGACCGGGAGGCCACCTACATGCTAAAGGCGTCCTCTCA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 191534 AACGCAGATGACCGGGAGGCCACCTACATGCTAAAGGCGTCCTCTCAGTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1758       GAGTGAGATGAAGCGTTGGATGACCTCACTGGCCCCCAACAGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191584 ...CAGGAGTGAGATGAAGCGTTGGATGACCTCACTGGCCCCCAACAGGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 GGACCAAGTTTGTTTCGTTCACATCCCGGCTGCTGG         ACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 192670 GGACCAAGTTTGTTTCGTTCACATCCCGGCTGCTGGGTA...CAGACTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CCCCAGGTCCAGTGCGTGCACCCATACGTGGCTCAGCAGCCAGACGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193646 CCCCAGGTCCAGTGCGTGCACCCATACGTGGCTCAGCAGCCAGACGAGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GACGCTGGAGCTCGCCGACATCCTCAACATCCTGGACAAGACTGACGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193696 GACGCTGGAGCTCGCCGACATCCTCAACATCCTGGACAAGACTGACGACG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943          GGTGGATCTTTGGCGAGCGTCTGCACGACCAGGAGAGAGGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193746 GTG...CAGGGTGGATCTTTGGCGAGCGTCTGCACGACCAGGAGAGAGGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 TGGTTCCCCAGCTCCATGACTGAGGAGATCTTGAATCCCAAGATCCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195253 TGGTTCCCCAGCTCCATGACTGAGGAGATCTTGAATCCCAAGATCCGGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CCAGAACCTCAAGGAATGTTTCCGTGTCCACAAGATGGATGACCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195303 CCAGAACCTCAAGGAATGTTTCCGTGTCCACAAGATGGATGACCCTCAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2084 GCAGCCAGAACAAGGACCGCAGGAAGCTGGGCAGCCGGAATCGGCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195353 GCAGCCAGAACAAGGACCGCAGGAAGCTGGGCAGCCGGAATCGGCAA