Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8486
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8486, 855 aa
1>>>pF1KB8486 855 - 855 aa - 855 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3836+/-0.00137; mu= 16.1102+/- 0.082
mean_var=182.5991+/-35.733, 0's: 0 Z-trim(107.4): 266 B-trim: 37 in 1/49
Lambda= 0.094913
statistics sampled from 9222 (9530) to 9222 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 3.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 6038 840.8 0
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 949 143.9 1.1e-33
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 949 143.9 1.1e-33
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 921 140.0 1.4e-32
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 810 125.0 6.9e-28
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 753 117.2 1.5e-25
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 717 111.8 2.9e-24
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 717 111.9 3.1e-24
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 703 110.0 1.2e-23
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 703 110.0 1.2e-23
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 703 110.0 1.2e-23
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 695 108.7 2.1e-23
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 695 108.8 2.2e-23
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 695 108.8 2.3e-23
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 674 105.9 1.6e-22
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 ( 423) 661 104.1 5.5e-22
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 638) 654 103.4 1.4e-21
CCDS33907.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 699) 627 99.7 1.9e-20
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 ( 625) 625 99.4 2.1e-20
CCDS14666.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 461) 623 98.9 2.1e-20
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 423) 605 96.4 1.1e-19
CCDS10481.1 PRSS22 gene_id:64063|Hs108|chr16 ( 317) 603 96.0 1.1e-19
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 602 96.0 1.5e-19
CCDS44881.1 TMPRSS12 gene_id:283471|Hs108|chr12 ( 348) 598 95.4 1.9e-19
CCDS10478.1 PRSS21 gene_id:10942|Hs108|chr16 ( 314) 592 94.5 3.2e-19
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 590 94.4 4.8e-19
CCDS83235.1 PRSS2 gene_id:5645|Hs108|chr7 ( 261) 582 93.0 7.4e-19
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs108|chr8 ( 352) 581 93.0 9.7e-19
CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 418) 581 93.1 1.1e-18
CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 421) 581 93.1 1.1e-18
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 ( 418) 571 91.8 2.8e-18
CCDS9529.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 444) 557 89.9 1.1e-17
CCDS9528.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 466) 557 89.9 1.1e-17
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 ( 416) 556 89.7 1.2e-17
CCDS34302.1 F12 gene_id:2161|Hs108|chr5 ( 615) 555 89.8 1.6e-17
CCDS14101.1 ACR gene_id:49|Hs108|chr22 ( 421) 548 88.6 2.5e-17
CCDS3369.1 HGFAC gene_id:3083|Hs108|chr4 ( 655) 546 88.6 3.9e-17
CCDS75098.1 HGFAC gene_id:3083|Hs108|chr4 ( 662) 546 88.6 3.9e-17
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 541 88.1 7.5e-17
CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1 ( 269) 533 86.3 7.8e-17
CCDS73602.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 382) 528 85.8 1.6e-16
CCDS45388.1 PRSS21 gene_id:10942|Hs108|chr16 ( 300) 523 85.0 2.2e-16
CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11 ( 565) 527 85.9 2.2e-16
CCDS53579.1 HABP2 gene_id:3026|Hs108|chr10 ( 534) 516 84.4 6e-16
CCDS7577.1 HABP2 gene_id:3026|Hs108|chr10 ( 560) 516 84.4 6.1e-16
CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11 (1905) 521 85.8 8e-16
CCDS58452.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 752) 514 84.3 8.9e-16
CCDS58453.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 850) 514 84.4 9.6e-16
CCDS32436.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 855) 514 84.4 9.6e-16
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 ( 268) 506 82.6 1e-15
>>CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 (855 aa)
initn: 6038 init1: 6038 opt: 6038 Z-score: 4484.1 bits: 840.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6038; 100.0% identity (100.0% similar) in 855 aa overlap (1-855:1-855)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGSDRARKGGGGPKDFGAGLKYNSRHEKVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MGSDRARKGGGGPKDFGAGLKYNSRHEKVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VLIGLLLVLLGIGFLVWHLQYRDVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VLIGLLLVLLGIGFLVWHLQYRDVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KDALKLLYSGVPFLGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSIPQHLVEEAERVMAEERVVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KDALKLLYSGVPFLGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSIPQHLVEEAERVMAEERVVM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LPPRARSLKSFVVTSVVAFPTDSKTVQRTQDNSCSFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LPPRARSLKSFVVTSVVAFPTDSKTVQRTQDNSCSFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 HARCQWALRGDADSVLSLTFRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALVQLCGTYPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 HARCQWALRGDADSVLSLTFRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALVQLCGTYPPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 YNLTFHSSQNVLLITLITNTERRHPGFEATFFQLPRMSSCGGRLRKAQGTFNSPYYPGHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YNLTFHSSQNVLLITLITNTERRHPGFEATFFQLPRMSSCGGRLRKAQGTFNSPYYPGHY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PPNIDCTWNIEVPNNQHVKVRFKFFYLLEPGVPAGTCPKDYVEINGEKYCGERSQFVVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PPNIDCTWNIEVPNNQHVKVRFKFFYLLEPGVPAGTCPKDYVEINGEKYCGERSQFVVTS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 NSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSDPCPGQFTCRTGRCIRKELRCDGWADCTDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSDPCPGQFTCRTGRCIRKELRCDGWADCTDH
430 440 450 460 470 480
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pF1KB8 SDELNCSCDAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQTFRCSNGKCLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SDELNCSCDAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQTFRCSNGKCLSK
490 500 510 520 530 540
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pF1KB8 SQQCNGKDDCGDGSDEASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SQQCNGKDDCGDGSDEASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 DCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHICGASLISPNWLVSAAHCYID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 DCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHICGASLISPNWLVSAAHCYID
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 DRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTFDYDIALLELEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 DRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTFDYDIALLELEKP
670 680 690 700 710 720
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pF1KB8 AEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYGGTGALILQKGEIRVINQTTCENLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYGGTGALILQKGEIRVINQTTCENLL
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pF1KB8 PQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYT
790 800 810 820 830 840
850
pF1KB8 RLPLFRDWIKENTGV
:::::::::::::::
CCDS84 RLPLFRDWIKENTGV
850
>>CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 (802 aa)
initn: 1117 init1: 541 opt: 949 Z-score: 718.4 bits: 143.9 E(32554): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 1487; 32.4% identity (59.7% similar) in 833 aa overlap (46-851:35-799)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 FGAGLKYNSRHEKVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAAVLIGLLLVLLGIGFL
: . .: : : : ..: :::: . : :
CCDS74 EAPQVAGGQGDGGDGEEAEPEGMFKACEDSKRKARGYLRLVPLFVLLA--LLVLASAGVL
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pF1KB8 VWH-LQYR-DVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKVKDALKLLYSGVPF
.:. : :. .: :..:..: .:. :..: . .:. : : ..:.. :: : ...
CCDS74 LWYFLGYKAEVMVSQVYSGSLRVLNRHFSQDLTRRESSAFRSETAKAQKMLKELITSTR-
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180
pF1KB8 LGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSIPQH--LVEEAERVMA---EERVVMLPPRA---
:: :.. :.: .:.:: . ..: ..::.: :. : :.: :: . . :
CCDS74 LGTYYNSSSVYSFGEGPLTCFFWFILQIPEHRRLMLSPEVVQALLVEELLSTVNSSAAVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 -RSLKSFVVTSVVAFPTDSKTVQRTQDN-SC-SFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPAHA
:. ..: . .. : . ... .: .. ..: ...:. : :
CCDS74 YRAEYEVDPEGLVILEASVKDIAALNSTLGCYRYSYVGQG-QVLRLKGPDHLASS-----
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RCQWALRGDADSVLSLTFRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALVQL--CGTYPPS
: : :.: : .:.: .. . :: : .: ...:.. .:.: . .... :. :
CCDS74 -CLWHLQGPKDLMLKLRLE-WTLAECRDR----LAMYDVAGPLEKRLITSVYGCSRQEPV
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KB8 YNLTFHSSQNVLLITLITNTERRHPGF----EATFFQLPRMS-SCGGRLRKAQGTFNSPY
.. .: .. .. . . . : . . :: ... . .:: .::....::
CCDS74 VEVL--ASGAIMAVVWKKGLHSYYDPFVLSVQPVVFQACEVNLTLDNRL-DSQGVLSTPY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 YPGHYPPNIDCTWNIEVPN-NQHVKVRFKFFYLLEPGVPAGTCPKDYVEINGEKYCGER-
.:..: :. :.:.. ::. . . . : . : . : . :.... :: :
CCDS74 FPSYYSPQTHCSWHLTVPSLDYGLALWFDAYALRRQKYDL-PCTQGQWTIQNRRLCGLRI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB8 ----SQFVVTSNSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSDPCPGQFTCRTGRCIRKEL
.. . . . ::. : :. : : : ..: :..::::::.: : .
CCDS74 LQPYAERIPVVATAGITINFTSQISLTGPGVRVHYGLYNQSDPCPGEFLCSV--------
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 RCDGWADCTDHSDELNCSCDAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQT
: .: : .::.:.:: .. ::..: : : :
CCDS74 ----------------------------NGLCVP---ACDGVKDCPNGLDERNCVCRA-T
460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 FRCS-NGKCLSKSQQCNGKDDCGDGSDEASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECD
:.:. .. :.: . :.:. :: .:::: .: . : : :..: . :..: ::.::
CCDS74 FQCKEDSTCISLPKVCDGQPDCLNGSDEEQCQE--GVPCGTFTFQCEDRSCVKKPNPQCD
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 GKEDCSDGSDEKDCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHICGASLISP
:. :: :::::. :::::.. . .:.:::. ..:::::::.::.. :. ::::..::.
CCDS74 GRPDCRDGSDEEHCDCGLQGPS--SRIVGGAVSSEGEWPWQASLQVRGR-HICGGALIAD
550 560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 NWLVSAAHCYIDDRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTF
:...::::. .: ... . ::.::: :..: :: ...:.. ::. .. .
CCDS74 RWVITAAHCFQED---SMASTVLWTVFLGKVWQNSR-WPGEVSFKVSRLLLHPYHEEDSH
610 620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 DYDIALLELEKPAEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYGGTGALILQKGEI
:::.:::.:..:. :. :::.::: :: : : :.:::: . :: . ::: ..
CCDS74 DYDVALLQLDHPVVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGGPISNALQKVDV
660 670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KB8 RVINQTTCENLLPQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGD
..: : : .. :.::::.:.:. .: :.::::::::: .:: : ::.::::
CCDS74 QLIPQDLCSEVYRYQVTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGPLVCKALSGRWFLAGLVSWGL
720 730 740 750 760 770
830 840 850
pF1KB8 GCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENTGV
::.. : :::::. .::..
CCDS74 GCGRPNYFGVYTRITGVISWIQQVVT
780 790 800
>>CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 (811 aa)
initn: 1117 init1: 541 opt: 949 Z-score: 718.3 bits: 143.9 E(32554): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 1487; 32.4% identity (59.7% similar) in 833 aa overlap (46-851:44-808)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 FGAGLKYNSRHEKVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAAVLIGLLLVLLGIGFL
: . .: : : : ..: :::: . : :
CCDS13 EAPQVAGGQGDGGDGEEAEPEGMFKACEDSKRKARGYLRLVPLFVLLA--LLVLASAGVL
20 30 40 50 60 70
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pF1KB8 VWH-LQYR-DVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKVKDALKLLYSGVPF
.:. : :. .: :..:..: .:. :..: . .:. : : ..:.. :: : ...
CCDS13 LWYFLGYKAEVMVSQVYSGSLRVLNRHFSQDLTRRESSAFRSETAKAQKMLKELITSTR-
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180
pF1KB8 LGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSIPQH--LVEEAERVMA---EERVVMLPPRA---
:: :.. :.: .:.:: . ..: ..::.: :. : :.: :: . . :
CCDS13 LGTYYNSSSVYSFGEGPLTCFFWFILQIPEHRRLMLSPEVVQALLVEELLSTVNSSAAVP
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 -RSLKSFVVTSVVAFPTDSKTVQRTQDN-SC-SFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPAHA
:. ..: . .. : . ... .: .. ..: ...:. : :
CCDS13 YRAEYEVDPEGLVILEASVKDIAALNSTLGCYRYSYVGQG-QVLRLKGPDHLASS-----
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CCDS33 RADG
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CCDS54 RADG
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CCDS58 FANSFSILRYNSTIQESLHRSECPSQRYISLQCSHCGLRAMT--GRIVGGALASDSKWPW
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CCDS58 QVSLH-FGTTHICGGTLIDAQWVLTAAHCFFVTR---EKVLEGWKVYAGTSNLHQ--LP-
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]