seq1 = pF1KE1470.tfa, 543 bp seq2 = pF1KE1470/gi568815595r_192044012.tfa (gi568815595r:192044012_192460540), 416529 bp >pF1KE1470 543 >gi568815595r:192044012_192460540 (Chr3) (complement) 8-124 (99999-100113) 97% == 219-427 (289879-290083) 98% -> 428-543 (316414-316529) 99% 0 . : . : . : . : . : 8 GCAAAGAACCCCAGCTAAAAGGGATTGTGACAAGGTTATTCAGCCAGCAG ||--|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 99999 GC AGAACCCCAGCTCAAAGGGATTGTGACAAGGTTATTCAGCCAGCAG 50 . : . : . : . : . : 58 GGATACTTCCTGCAGATGCACCCAGATGGTACCATTGATGGGACCAAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100047 GGATACTTCCTGCAGATGCACCCAGATGGTACCATTGATGGGACCAAGGA 100 . : . 108 CGAAAACAGCGACTACA ||||||||||||||||| 100097 CGAAAACAGCGACTACA 0 . : . : . : . : . : 219 CTACAGTTCAGATGTTTTCACTCCAGAATGCAAATTCAAGGAATCTGTGT ||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 289879 CTACAG GATGTTTTCACTCCAGAATGCAAATTCAAGGAATCTGTGT 50 . : . : . : . : . : 269 TTGAAAACTACTATGTGATCTATTCTTCCACACTGTACCGCCAGCAAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 289925 TTGAAAACTACTATGTGATCTATTCTTCCACACTGTACCGCCAGCAAGAA 100 . : . : . : . : . : 319 TCAGGCCGAGCTTGGTTTCTGGGACTCAATAAAGAAGGTCAAATTATGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 289975 TCAGGCCGAGCTTGGTTTCTGGGACTCAATAAAGAAGGTCAAATTATGAA 150 . : . : . : . : . : 369 GGGGAACAGAGTGAAGAAAACCAAGCCCTCATCACATTTTGTACCGAAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 290025 GGGGAACAGAGTGAAGAAAACCAAGCCCTCATCACATTTTGTACCGAAAC 200 . : . : . : . : . : 419 CTATTGAAG TGTGTATGTACAGAGAACAATCGCTACATGAA |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| ||||||||||||| 290075 CTATTGAAGGTA...CAGTGTGTATGTACAGAGAACCATCGCTACATGAA 250 . : . : . : . : . : 460 ATTGGAGAAAAACAAGGGCGTTCAAGGAAAAGTTCTGGAACACCAACCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 316446 ATTGGAGAAAAACAAGGGCGTTCAAGGAAAAGTTCTGGAACACCAACCAT 300 . : . : . : 510 GAATGGAGGCAAAGTTGTGAATCAAGATTCAACA |||||||||||||||||||||||||||||||||| 316496 GAATGGAGGCAAAGTTGTGAATCAAGATTCAACA