Result of FASTA (omim) for pF1KB5888
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5888, 521 aa
  1>>>pF1KB5888 521 - 521 aa - 521 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2508+/-0.000387; mu= 19.2418+/- 0.024
 mean_var=84.5946+/-17.651, 0's: 0 Z-trim(113.3): 162  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.139445
 statistics sampled from 22357 (22527) to 22357 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.264), width:  16
 Scan time: 10.240

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002258 (OMIM: 601892) importin subunit alpha-4  ( 521) 3415 697.3 2.8e-200
XP_016876050 (OMIM: 601892) PREDICTED: importin su ( 497) 3258 665.7 8.6e-191
NP_002259 (OMIM: 602970) importin subunit alpha-3  ( 521) 3004 614.7 2.2e-175
NP_002257 (OMIM: 600685) importin subunit alpha-1  ( 529) 1685 349.3 1.7e-95
NP_001307540 (OMIM: 600685) importin subunit alpha ( 529) 1685 349.3 1.7e-95
NP_036448 (OMIM: 610563) importin subunit alpha-7  ( 536) 1556 323.4 1.1e-87
XP_005270768 (OMIM: 610563) PREDICTED: importin su ( 566) 1556 323.4 1.1e-87
NP_001139187 (OMIM: 614107) importin subunit alpha ( 516) 1448 301.6 3.7e-81
XP_011514517 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 543) 1448 301.6 3.8e-81
XP_016866329 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 536) 1446 301.2   5e-81
NP_002260 (OMIM: 604545) importin subunit alpha-6  ( 539) 1446 301.2   5e-81
XP_016866328 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 539) 1446 301.2   5e-81
XP_016866327 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 559) 1446 301.3 5.1e-81
XP_011534107 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 559) 1446 301.3 5.1e-81
XP_016867700 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 522) 1437 299.4 1.7e-80
XP_016867702 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 521) 1432 298.4 3.4e-80
XP_016867701 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 521) 1432 298.4 3.4e-80
XP_016867703 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 521) 1432 298.4 3.4e-80
XP_016867699 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 537) 1432 298.4 3.5e-80
XP_016867697 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 548) 1432 298.4 3.6e-80
NP_002255 (OMIM: 600686) importin subunit alpha-5  ( 538) 1407 293.4 1.1e-78
XP_005247494 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 538) 1407 293.4 1.1e-78
XP_016867698 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 544) 1395 291.0 6.1e-78
XP_011511097 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 477) 1387 289.3 1.7e-77
XP_016867705 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 425) 1231 257.9 4.4e-68
XP_016867704 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 487) 1171 245.9 2.1e-64
XP_016861853 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1004 212.1 2.1e-54
XP_016861854 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1004 212.1 2.1e-54
XP_011511099 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1004 212.1 2.1e-54
XP_005247496 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1004 212.1 2.1e-54
XP_016861852 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1004 212.1 2.1e-54
XP_016866330 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 332)  958 202.9 1.2e-51
XP_016866331 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 327)  953 201.9 2.5e-51
XP_016866332 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 327)  953 201.9 2.5e-51
XP_016858908 (OMIM: 609803) PREDICTED: ankyrin and ( 898)  209 52.6 5.9e-06
XP_005252703 (OMIM: 605730) PREDICTED: sperm-assoc ( 451)  184 47.3 0.00012
NP_758442 (OMIM: 605730) sperm-associated antigen  ( 458)  184 47.3 0.00012
NP_001240784 (OMIM: 605730) sperm-associated antig ( 484)  184 47.3 0.00012
XP_005252702 (OMIM: 605730) PREDICTED: sperm-assoc ( 506)  184 47.3 0.00013
NP_036575 (OMIM: 605730) sperm-associated antigen  ( 509)  184 47.3 0.00013
NP_001240783 (OMIM: 605730) sperm-associated antig ( 484)  176 45.7 0.00038


>>NP_002258 (OMIM: 601892) importin subunit alpha-4 [Hom  (521 aa)
 initn: 3415 init1: 3415 opt: 3415  Z-score: 3716.7  bits: 697.3 E(85289): 2.8e-200
Smith-Waterman score: 3415; 100.0% identity (100.0% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNVPQEESLEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNVPQEESLEDS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCEQAVWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCEQAVWA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVIVNLCRNKDPPPPMETV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVIVNLCRNKDPPPPMETV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 QEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVPLLSHQEVKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVPLLSHQEVKV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 QTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 VQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQNVIPPFCNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQNVIPPFCNLL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 SVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAGDEASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHENEDIYKLAFEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAGDEASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHENEDIYKLAFEI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520 
pF1KB5 IDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
              490       500       510       520 

>>XP_016876050 (OMIM: 601892) PREDICTED: importin subuni  (497 aa)
 initn: 3258 init1: 3258 opt: 3258  Z-score: 3546.3  bits: 665.7 E(85289): 8.6e-191
Smith-Waterman score: 3258; 100.0% identity (100.0% similar) in 497 aa overlap (25-521:1-497)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNVPQEESLEDS
                               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                         MRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNVPQEESLEDS
                                       10        20        30      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
         40        50        60        70        80        90      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCEQAVWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCEQAVWA
        100       110       120       130       140       150      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVIVNLCRNKDPPPPMETV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVIVNLCRNKDPPPPMETV
        160       170       180       190       200       210      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 QEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVPLLSHQEVKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVPLLSHQEVKV
        220       230       240       250       260       270      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 QTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQ
        280       290       300       310       320       330      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 VQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQNVIPPFCNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQNVIPPFCNLL
        340       350       360       370       380       390      

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 SVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAGDEASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHENEDIYKLAFEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAGDEASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHENEDIYKLAFEI
        400       410       420       430       440       450      

              490       500       510       520 
pF1KB5 IDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
        460       470       480       490       

>>NP_002259 (OMIM: 602970) importin subunit alpha-3 [Hom  (521 aa)
 initn: 3370 init1: 3004 opt: 3004  Z-score: 3269.8  bits: 614.7 E(85289): 2.2e-175
Smith-Waterman score: 3004; 85.8% identity (96.2% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNVPQEESLEDS
       ::.: .:.:.:.:.:::::::.:::::.::::.::::::::::::::.::::.:.  :::
NP_002 MADNEKLDNQRLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNVPHEDICEDS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
       :.:.:...::..::::.:::.:::  .:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DIDGDYRVQNTSLEAIVQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCEQAVWA
       .:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_002 HCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLLHSPHQNVCEQAVWA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVIVNLCRNKDPPPPMETV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::.
NP_002 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVMVNLCRHKDPPPPMETI
              190       200       210       220       230       240

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       :::::::::::.:::.:::::::::::::::.::::::::::::.:: ::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::.::::: ::.::::::::::::::::::::::::
NP_002 QTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQ
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       :::::::.:.::::: : :::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::::::
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       .:::.::::::::::.::: :: ::: ::...::::::::::: ::.::::::::::.::
NP_002 TVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAEDEAETIGNLIEECGGLEKIEQLQNHENEDIYKLAYEI
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       :::.::.::::::: :.::: ::::..:. .::. :. :.:
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        : .. . . :   : ... :... .:.:   ::.:.:::::::: ...::::..:..:.
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pF1KB5 DPPPPMETVQEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVP
       .: ::...:..:::.:  :..: : ..:.:: ::.:::::: ::.: ::. .:::: :: 
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pF1KB5 LLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLS
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pF1KB5 NITAGNQQQVQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQN
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pF1KB5 VIPPFCNLLSVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAGD--EASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHE
       .: :. :::..::.... :.::...::.  :    :.  .. .:::::::.:::.::.::
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pF1KB5 NEDIYKLAFEIIDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
       ::..:: .. .:..::: .. .::  ..::.:. : :.:. . .     :::
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>>NP_001307540 (OMIM: 600685) importin subunit alpha-1 [  (529 aa)
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pF1KB5 DSDVDADFKAQ---NVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGI
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NP_001 TSPLQENRNNQGTVNWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGL
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pF1KB5 LPILVKCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCE
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NP_001 IPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHISE
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pF1KB5 QAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFIS-P---SIPITFLRNVTWVIVNLCRNK
       ::::::::: :::   :: ::. :.: :::.... :   :.   .:::.::.. ::::::
NP_001 QAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNK
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pF1KB5 DPPPPMETVQEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVP
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pF1KB5 LLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLS
       ::. .:. . : ::::.::::::::::::::..  .:. ::.::..:: .:.:::.: .:
NP_001 LLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMS
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pF1KB5 NITAGNQQQVQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQN
       ::::: :.:.: :.. ::.:...  :.:.:: :::::.::..: : .:  .:. :::. .
NP_001 NITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVHCG
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pF1KB5 VIPPFCNLLSVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAGD--EASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHE
       .: :. :::..::.... :.::...::.  :    :.  .. .:::::::.:::.::.::
NP_001 IIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQNHE
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pF1KB5 NEDIYKLAFEIIDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
       ::..:: .. .:..::: .. .::  ..::.:. : :.:. . .     :::
NP_001 NESVYKASLSLIEKYFSVEE-EEDQNVVPETTSEG-YTFQ-VQDGAPGTFNF
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>>NP_036448 (OMIM: 610563) importin subunit alpha-7 [Hom  (536 aa)
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pF1KB5   MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNVP--QEES
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NP_036 METMASPGKDNYRMKSYKNNALNPEEMRRRREEEGIQLRKQKREQQLFKRRNVELINEEA
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pF1KB5 ------LEDSDVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDL
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NP_036 AMFDSLLMDSYVSST-TGESVITREMVEMLFSDDSDLQLATTQKFRKLLSKEPSPPIDEV
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pF1KB5 IKSG-ILPILVKCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSP
       :..  ..  .:. :.:..: .::::::::::::::::: ::. :....:::.:..:: : 
NP_036 INTPRVVDRFVEFLKRNENCTLQFEAAWALTNIASGTSQQTKIVIEAGAVPIFIELLNSD
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pF1KB5 HQNVCEQAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVIVNLCR
        ..: :::::::::: ::.  :::::.. ....:::.... :  .:. ::..:.. ::::
NP_036 FEDVQEQAVWALGNIAGDSSVCRDYVLNCSILNPLLTLLTKSTRLTMTRNAVWALSNLCR
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pF1KB5 NKDPPPPMETVQEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFL
       .:.::: .  :.  ::.:  :.. .: ..:.:. ::::::.:: ::.:: ::::::   :
NP_036 GKNPPPEFAKVSPCLPVLSRLLFSSDSDLLADACWALSYLSDGPNEKIQAVIDSGVCRRL
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pF1KB5 VPLLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWF
       : :: :.. :: . ::::::::::: : ::::.:::..:  . .::: :::.: ::: : 
NP_036 VELLMHNDYKVASPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEACWT
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pF1KB5 LSNITAGNQQQVQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQ
       .:::::::. :.::::::...:..:. : :..: :.:::::::.: : .:  .:..:::.
NP_036 ISNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYLVS
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pF1KB5 QNVIPPFCNLLSVKDSQVVQVVLDGLKNILIM-------AGDEASTIAEIIEECGGLEKI
        . : :.:.::.: ::..:::.:.::.::: .       .:. ..    .:::  ::.::
NP_036 LGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEGKRSGSGVNPYCGLIEEAYGLDKI
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pF1KB5 EVLQQHENEDIYKLAFEIIDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
       : ::.:::..::. ::..:..::. .  :.:  : :.. .                   
NP_036 EFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVE--DDDSSLAPQVDETQQQFIFQQPEAPMEGFQL
     480       490       500         510       520       530      

>>XP_005270768 (OMIM: 610563) PREDICTED: importin subuni  (566 aa)
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                                          10        20        30   
pF1KB5                            MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVT
                                     .:. .:.:.::.::.. . : :::.:.:  
XP_005 ASLSAVLEGEASVQDSPGSVMKSYVSETMASPGKDNYRMKSYKNNALNPEEMRRRREEEG
          10        20        30        40        50        60     

            40        50                60        70        80     
pF1KB5 VELRKNKRDEHLLKKRNVP--QEES------LEDSDVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNP
       ..:::.::...:.:.:::   .::.      : :: :..   ...:  . ...   ::. 
XP_005 IQLRKQKREQQLFKRRNVELINEEAAMFDSLLMDSYVSST-TGESVITREMVEMLFSDDS
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pF1KB5 VVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSG-ILPILVKCLERDDNPSLQFEAAWALTNIAS
        .::...:  :::::.. .::::..:..  ..  .:. :.:..: .::::::::::::::
XP_005 DLQLATTQKFRKLLSKEPSPPIDEVINTPRVVDRFVEFLKRNENCTLQFEAAWALTNIAS
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pF1KB5 GTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCEQAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPL
       ::: ::. :....:::.:..:: :  ..: :::::::::: ::.  :::::.. ....::
XP_005 GTSQQTKIVIEAGAVPIFIELLNSDFEDVQEQAVWALGNIAGDSSVCRDYVLNCSILNPL
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pF1KB5 LSFISPSIPITFLRNVTWVIVNLCRNKDPPPPMETVQEILPALCVLIYHTDINILVDTVW
       :.... :  .:. ::..:.. ::::.:.::: .  :.  ::.:  :.. .: ..:.:. :
XP_005 LTLLTKSTRLTMTRNAVWALSNLCRGKNPPPEFAKVSPCLPVLSRLLFSSDSDLLADACW
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pF1KB5 ALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVPLLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLN
       :::::.:: ::.:: ::::::   :: :: :.. :: . ::::::::::: : ::::.::
XP_005 ALSYLSDGPNEKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVASPALRAVGNIVTGDDIQTQVILN
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pF1KB5 CDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQVQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGT
       :..:  . .::: :::.: ::: : .:::::::. :.::::::...:..:. : :..: :
XP_005 CSALPCLLHLLSSPKESIRKEACWTISNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRT
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pF1KB5 QKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQNVIPPFCNLLSVKDSQVVQVVLDGLKNILIM---
       .:::::::.: : .:  .:..:::. . : :.:.::.: ::..:::.:.::.::: .   
XP_005 RKEAAWAITNATSGGTPEQIRYLVSLGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQ
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pF1KB5 ----AGDEASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHENEDIYKLAFEIIDQYFSGDDIDEDPCLI
           .:. ..    .:::  ::.::: ::.:::..::. ::..:..::. .  :.:  : 
XP_005 EGKRSGSGVNPYCGLIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVE--DDDSSLA
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       500       510       520 
pF1KB5 PEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
       :.. .                   
XP_005 PQVDETQQQFIFQQPEAPMEGFQL
            550       560      

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                 10        20        30        40        50        
pF1KB5 MAENPSLE--NHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNVPQEESLE
           :.:.  ..: ..:: .:.::   :..:  :..:::: :.::. ::.::. .     
NP_001    MPTLDAPEERRRKFKYRGKDVSLRRQQRMAVSLELRKAKKDEQTLKRRNITSFCPDT
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pF1KB5 DSDVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPI
        :.  :   : ..::  :.....:..::. ..:.:.:::.::...:::.  .:..:..: 
NP_001 PSEKTAKGVAVSLTLGEIIKGVNSSDPVLCFQATQTARKMLSQEKNPPLKLVIEAGLIPR
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pF1KB5 LVKCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCEQAV
       .:. :. .  : ::::::::::::::::: ::.:::...:.  ...:: : .  ::::::
NP_001 MVEFLKSSLYPCLQFEAAWALTNIASGTSEQTRAVVEGGAIQPLIELLSSSNVAVCEQAV
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pF1KB5 WALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVIVNLCRNKDPPPPME
       :::::: ::::. :: ::. ...  ::..:::..:::::::.::.. ::::::.: :   
NP_001 WALGNIAGDGPEFRDNVITSNAIPHLLALISPTLPITFLRNITWTLSNLCRNKNPYPCDT
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pF1KB5 TVQEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVPLLSHQEV
       .:..:::::  :. : : ..: :. :::::::::.:..: .:...::.: :: :.. .:.
NP_001 AVKQILPALLHLLQHQDSEVLSDACWALSYLTDGSNKRIGQVVNTGVLPRLVVLMTSSEL
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pF1KB5 KVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQ
       .: : .::.:::::::::::::....  .:. .:.::.: : .:.:::.: :::..::  
NP_001 NVLTPSLRTVGNIVTGTDEQTQMAIDAGMLNVLPQLLQHNKPSIQKEAAWALSNVAAGPC
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KB5 QQVQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQNVIPPFCN
       ...: ..   ..: ..  : .:.: .::::.: ..:.. ..  ::.  ::...:. :. :
NP_001 HHIQQLLAYDVLPPLVALLKNGEFKVQKEAVWMVANFATGATMDQLIQLVHSGVLEPLVN
       360       370       380       390       400       410       

      420       430       440         450       460       470      
pF1KB5 LLSVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAG--DEASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHENEDIYKL
       ::.. : ..: ..:: .. ::  :   .:  ..  .::: ::...::.:: :::..: . 
NP_001 LLTAPDVKIVLIILDVISCILQAAEKRSEKENLCLLIEELGGIDRIEALQLHENRQIGQS
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        480       490       500       510       520 
pF1KB5 AFEIIDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
       :..::...: :.. ::.  :. .                      
NP_001 ALNIIEKHF-GEEEDESQTLLSQVIDQDYEFIDYECLAKK     
       480        490       500       510           

>>XP_011514517 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin subuni  (543 aa)
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                                         10        20        30    
pF1KB5                         MAENPSLE--NHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTV
                                   :.:.  ..: ..:: .:.::   :..:  :..
XP_011 MKRSQVCRDPGQSSYFKGPSNLLLPVNMPTLDAPEERRRKFKYRGKDVSLRRQQRMAVSL
               10        20        30        40        50        60

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB5 ELRKNKRDEHLLKKRNVPQEESLEDSDVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQA
       :::: :.::. ::.::. .      :.  :   : ..::  :.....:..::. ..:.:.
XP_011 ELRKAKKDEQTLKRRNITSFCPDTPSEKTAKGVAVSLTLGEIIKGVNSSDPVLCFQATQT
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          100       110       120       130       140       150    
pF1KB5 ARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILVKCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVV
       :::.::...:::.  .:..:..: .:. :. .  : ::::::::::::::::: ::.:::
XP_011 ARKMLSQEKNPPLKLVIEAGLIPRMVEFLKSSLYPCLQFEAAWALTNIASGTSEQTRAVV
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pF1KB5 QSNAVPLFLRLLRSPHQNVCEQAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPI
       ...:.  ...:: : .  :::::::::::: ::::. :: ::. ...  ::..:::..::
XP_011 EGGAIQPLIELLSSSNVAVCEQAVWALGNIAGDGPEFRDNVITSNAIPHLLALISPTLPI
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          220       230       240       250       260       270    
pF1KB5 TFLRNVTWVIVNLCRNKDPPPPMETVQEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGN
       :::::.::.. ::::::.: :   .:..:::::  :. : : ..: :. :::::::::.:
XP_011 TFLRNITWTLSNLCRNKNPYPCDTAVKQILPALLHLLQHQDSEVLSDACWALSYLTDGSN
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          280       290       300       310       320       330    
pF1KB5 EQIQMVIDSGVVPFLVPLLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNL
       ..: .:...::.: :: :.. .:..: : .::.:::::::::::::....  .:. .:.:
XP_011 KRIGQVVNTGVLPRLVVLMTSSELNVLTPSLRTVGNIVTGTDEQTQMAIDAGMLNVLPQL
              310       320       330       340       350       360

          340       350       360       370       380       390    
pF1KB5 LSHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQVQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISN
       :.: : .:.:::.: :::..::  ...: ..   ..: ..  : .:.: .::::.: ..:
XP_011 LQHNKPSIQKEAAWALSNVAAGPCHHIQQLLAYDVLPPLVALLKNGEFKVQKEAVWMVAN
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          400       410       420       430       440         450  
pF1KB5 LTISGRKDQVEYLVQQNVIPPFCNLLSVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAG--DEASTIAEI
       .. ..  ::.  ::...:. :. :::.. : ..: ..:: .. ::  :   .:  ..  .
XP_011 FATGATMDQLIQLVHSGVLEPLVNLLTAPDVKIVLIILDVISCILQAAEKRSEKENLCLL
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pF1KB5 IEECGGLEKIEVLQQHENEDIYKLAFEIIDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTA
       ::: ::...::.:: :::..: . :..::...: :.. ::.  :. .             
XP_011 IEELGGIDRIEALQLHENRQIGQSALNIIEKHF-GEEEDESQTLLSQVIDQDYEFIDYEC
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            520 
pF1KB5 NLQTKEFNF
                
XP_011 LAKK     
     540        

>>XP_016866329 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin subuni  (536 aa)
 initn: 1541 init1: 1178 opt: 1446  Z-score: 1575.7  bits: 301.2 E(85289): 5e-81
Smith-Waterman score: 1581; 48.9% identity (77.0% similar) in 517 aa overlap (4-502:3-517)

               10        20        30        40        50          
pF1KB5 MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNV--PQ-EESL
          .:. .:.:.::.:::. . . :::.:.:  ..:::.::.:.:.:.:::  :. .::.
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