seq1 = pF1KE2233.tfa, 1986 bp seq2 = pF1KE2233/gi568815581r_19809181.tfa (gi568815581r:19809181_20068463), 259283 bp >pF1KE2233 1986 >gi568815581r:19809181_20068463 (Chr17) (complement) 1-88 (90785-90872) 100% -> 89-136 (100003-100050) 100% -> 137-319 (105442-105624) 100% -> 320-877 (109893-110450) 100% -> 878-976 (120959-121057) 100% -> 977-1061 (126554-126638) 100% -> 1062-1185 (127454-127577) 100% -> 1186-1322 (128615-128751) 100% -> 1323-1467 (132034-132178) 100% -> 1468-1641 (136486-136659) 100% -> 1642-1751 (143947-144056) 100% -> 1752-1834 (148346-148428) 100% -> 1835-1887 (158486-158538) 100% -> 1888-1986 (159188-159286) 98% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAGGGGAGCCGGGCCCTCCCCGCGCCAGTCCCCCCGCACCCTCCGTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 90785 ATGAGGGGAGCCGGGCCCTCCCCGCGCCAGTCCCCCCGCACCCTCCGTCC 50 . : . : . : . : . : 51 CGACCCGGGCCCCGCCATGTCCTTCTTCCGGCGGAAAG TGA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 90835 CGACCCGGGCCCCGCCATGTCCTTCTTCCGGCGGAAAGGTA...TAGTGA 100 . : . : . : . : . : 92 AAGGCAAAGAACAAGAGAAGACCTCAGATGTGAAGTCCATTAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 100006 AAGGCAAAGAACAAGAGAAGACCTCAGATGTGAAGTCCATTAAAGGTA.. 150 . : . : . : . : . : 137 CTTCAATATCCGTACATTCCCCACAAAAAAGCACTAAAAATCATGC .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100056 .TAGCTTCAATATCCGTACATTCCCCACAAAAAAGCACTAAAAATCATGC 200 . : . : . : . : . : 183 CTTGCTGGAGGCTGCAGGACCAAGTCATGTTGCAATCAATGCCATTTCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105488 CTTGCTGGAGGCTGCAGGACCAAGTCATGTTGCAATCAATGCCATTTCTG 250 . : . : . : . : . : 233 CCAACATGGACTCCTTTTCAAGTAGCAGGACAGCCACACTTAAGAAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105538 CCAACATGGACTCCTTTTCAAGTAGCAGGACAGCCACACTTAAGAAGCAG 300 . : . : . : . : . : 283 CCAAGCCACATGGAGGCCGCTCATTTTGGTGACCTGG GCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 105588 CCAAGCCACATGGAGGCCGCTCATTTTGGTGACCTGGGTA...TAGGCAG 350 . : . : . : . : . : 324 ATCTTGTCTGGACTACCAGACTCAAGAGACCAAATCAAGCCTTTCTAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109897 ATCTTGTCTGGACTACCAGACTCAAGAGACCAAATCAAGCCTTTCTAAGA 400 . : . : . : . : . : 374 CCCTTGAACAAGTCTTGCACGACACTATTGTCCTCCCTTACTTCATTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109947 CCCTTGAACAAGTCTTGCACGACACTATTGTCCTCCCTTACTTCATTCAA 450 . : . : . : . : . : 424 TTCATGGAACTTCGGCGAATGGAGCATTTGGTGAAATTTTGGTTAGAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109997 TTCATGGAACTTCGGCGAATGGAGCATTTGGTGAAATTTTGGTTAGAGGC 500 . : . : . : . : . : 474 TGAAAGTTTTCATTCAACAACTTGGTCGCGAATAAGAGCACACAGTCTAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110047 TGAAAGTTTTCATTCAACAACTTGGTCGCGAATAAGAGCACACAGTCTAA 550 . : . : . : . : . : 524 ACACAGTGAAGCAGAGCTCACTGGCTGAGCCTGTCTCTCCATCTAAAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110097 ACACAGTGAAGCAGAGCTCACTGGCTGAGCCTGTCTCTCCATCTAAAAAG 600 . : . : . : . : . : 574 CATGAAACTACAGCGTCTTTTTTAACTGATTCTCTTGATAAGAGATTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110147 CATGAAACTACAGCGTCTTTTTTAACTGATTCTCTTGATAAGAGATTGGA 650 . : . : . : . : . : 624 GGATTCTGGCTCAGCACAGTTGTTTATGACTCATTCAGAAGGAATTGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110197 GGATTCTGGCTCAGCACAGTTGTTTATGACTCATTCAGAAGGAATTGACC 700 . : . : . : . : . : 674 TGAATAATAGAACTAACAGCACTCAGAATCACTTGCTGCTTTCCCAGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110247 TGAATAATAGAACTAACAGCACTCAGAATCACTTGCTGCTTTCCCAGGAA 750 . : . : . : . : . : 724 TGTGACAGTGCCCATTCTCTCCGTCTTGAAATGGCCAGAGCAGGAACTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110297 TGTGACAGTGCCCATTCTCTCCGTCTTGAAATGGCCAGAGCAGGAACTCA 800 . : . : . : . : . : 774 CCAAGTTTCCATGGAAACCCAAGAATCTTCCTCTACACTTACAGTAGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110347 CCAAGTTTCCATGGAAACCCAAGAATCTTCCTCTACACTTACAGTAGCCA 850 . : . : . : . : . : 824 GTAGAAATAGTCCCGCTTCTCCACTAAAAGAATTGTCAGGAAAACTAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110397 GTAGAAATAGTCCCGCTTCTCCACTAAAAGAATTGTCAGGAAAACTAATG 900 . : . : . : . : . : 874 AAAA GTATAGAACAAGATGCAGTGAATACTTTTACCAAATA ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110447 AAAAGTG...CAGGTATAGAACAAGATGCAGTGAATACTTTTACCAAATA 950 . : . : . : . : . : 915 TATATCTCCAGATGCTGCTAAACCAATACCAATTACAGAAGCAATGAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120996 TATATCTCCAGATGCTGCTAAACCAATACCAATTACAGAAGCAATGAGAA 1000 . : . : . : . : . : 965 ATGACATCATAG CAAGGATTTGTGGAGAAGATGGACAGGTG ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 121046 ATGACATCATAGGTA...CAGCAAGGATTTGTGGAGAAGATGGACAGGTG 1050 . : . : . : . : . : 1006 GATCCCAACTGTTTCGTTTTGGCACAGTCCATAGTCTTTAGTGCAATGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126583 GATCCCAACTGTTTCGTTTTGGCACAGTCCATAGTCTTTAGTGCAATGGA 1100 . : . : . : . : . : 1056 GCAAGA GCACTTTAGTGAGTTTCTGCGAAGTCACCATTTCT ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126633 GCAAGAGTA...CAGGCACTTTAGTGAGTTTCTGCGAAGTCACCATTTCT 1150 . : . : . : . : . : 1097 GTAAATACCAGATTGAAGTGCTGACCAGTGGAACTGTTTACCTGGCTGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127489 GTAAATACCAGATTGAAGTGCTGACCAGTGGAACTGTTTACCTGGCTGAC 1200 . : . : . : . : . : 1147 ATTCTCTTCTGTGAGTCAGCCCTCTTTTATTTCTCTGAG TA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 127539 ATTCTCTTCTGTGAGTCAGCCCTCTTTTATTTCTCTGAGGTA...TAGTA 1250 . : . : . : . : . : 1188 CATGGAAAAAGAGGATGCAGTGAATATCTTACAATTCTGGTTGGCAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128617 CATGGAAAAAGAGGATGCAGTGAATATCTTACAATTCTGGTTGGCAGCAG 1300 . : . : . : . : . : 1238 ATAACTTCCAGTCTCAGCTTGCTGCCAAAAAGGGCCAATATGATGGACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128667 ATAACTTCCAGTCTCAGCTTGCTGCCAAAAAGGGCCAATATGATGGACAG 1350 . : . : . : . : . : 1288 GAGGCACAGAATGATGCCATGATTTTATATGACAA GTACTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 128717 GAGGCACAGAATGATGCCATGATTTTATATGACAAGTG...TAGGTACTT 1400 . : . : . : . : . : 1329 CTCCCTCCAAGCCACACATCCTCTTGGATTTGATGATGTTGTACGATTAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132040 CTCCCTCCAAGCCACACATCCTCTTGGATTTGATGATGTTGTACGATTAG 1450 . : . : . : . : . : 1379 AAATTGAATCCAATATCTGCAGGGAAGGTGGGCCACTCCCCAACTGTTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132090 AAATTGAATCCAATATCTGCAGGGAAGGTGGGCCACTCCCCAACTGTTTC 1500 . : . : . : . : . : 1429 ACAACTCCATTACGTCAGGCCTGGACAACCATGGAGAAG GT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 132140 ACAACTCCATTACGTCAGGCCTGGACAACCATGGAGAAGGTA...CAGGT 1550 . : . : . : . : . : 1470 CTTTTTGCCTGGCTTTTTGTCCAGCAATCTTTATTATAAATATTTGAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 136488 CTTTTTGCCTGGCTTTTTGTCCAGCAATCTTTATTATAAATATTTGAATG 1600 . : . : . : . : . : 1520 ATCTCATCCATTCGGTTCGAGGAGATGAATTTCTGGGCGGGAACGTGTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 136538 ATCTCATCCATTCGGTTCGAGGAGATGAATTTCTGGGCGGGAACGTGTCG 1650 . : . : . : . : . : 1570 CTGACTGCTCCTGGCTCTGTTGGCCCTCCTGATGAGTCTCACCCAGGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 136588 CTGACTGCTCCTGGCTCTGTTGGCCCTCCTGATGAGTCTCACCCAGGGAG 1700 . : . : . : . : . : 1620 TTCTGACAGCTCTGCGTCTCAG TCCAGTGTGAAAAAAGCCA ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 136638 TTCTGACAGCTCTGCGTCTCAGGTA...TAGTCCAGTGTGAAAAAAGCCA 1750 . : . : . : . : . : 1661 GTATTAAAATACTGAAAAATTTTGATGAAGCGATAATTGTGGATGCGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 143966 GTATTAAAATACTGAAAAATTTTGATGAAGCGATAATTGTGGATGCGGCA 1800 . : . : . : . : . : 1711 AGTCTGGATCCAGAATCTTTATATCAACGGACATATGCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 144016 AGTCTGGATCCAGAATCTTTATATCAACGGACATATGCCGGGTA...TAG 1850 . : . : . : . : . : 1752 GAAGATGACATTTGGAAGAGTCAGTGACTTGGGGCAATTCATCCGAGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 148346 GAAGATGACATTTGGAAGAGTCAGTGACTTGGGGCAATTCATCCGAGAAT 1900 . : . : . : . : . : 1802 CTGAGCCTGAACCTGATGTAAGGAAATCAAAAG GATCCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 148396 CTGAGCCTGAACCTGATGTAAGGAAATCAAAAGGTT...TAGGATCCATG 1950 . : . : . : . : . : 1843 TTCTCACAAGCTATGAAGAAATGGGTGCAAGGAAATACTGATGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 158494 TTCTCACAAGCTATGAAGAAATGGGTGCAAGGAAATACTGATGAGGTA.. 2000 . : . : . : . : . : 1888 GCCCAGGAAGAGCTAGCTTGGAAGATTGCTAAAATGATAGTCAGTG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 158544 .TAGGCCCAGGAAGAGCTAGCTTGGAAGATTGCTAAAATGATAGTCAGTG 2050 . : . : . : . : . : 1934 ACATTATGCAGCAGGCTCAGTATGATCAACCGTTAGAGAAATCTACAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 159234 ACATTATGCAGCAGGCTCAGTATGATCAACCGTTAGAGAAATCTACAAAG 2100 1984 TTA || 159284 GTA