Result of SIM4 for pF1KB5957

seq1 = pF1KB5957.tfa, 1539 bp
seq2 = pF1KB5957/gi568815592r_28804073.tfa (gi568815592r:28804073_29023632), 219560 bp

>pF1KB5957 1539
>gi568815592r:28804073_29023632 (Chr6)

(complement)

1-420  (100001-100420)   100% ->
421-516  (101646-101741)   100% ->
517-747  (103391-103621)   100% ->
748-770  (111915-111937)   100% ->
771-886  (114545-114660)   100% ->
887-919  (114793-114825)   100% ->
920-946  (116371-116397)   100% ->
947-1539  (118968-119560)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCCGGGAGTGTGGCCGAGTGCCTGCAGCAGGAGACCACCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCCGGGAGTGTGGCCGAGTGCCTGCAGCAGGAGACCACCTGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGTGCCTGCAGTACTTCGCAGAGCCCATGATGCTCGACTGCGGCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTGTGCCTGCAGTACTTCGCAGAGCCCATGATGCTCGACTGCGGCCATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATCTGTTGCGCGTGCCTCGCCCGCTGCTGGGGCACGGCAGAGACTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACATCTGTTGCGCGTGCCTCGCCCGCTGCTGGGGCACGGCAGAGACTAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGTCGTGCCCGCAGTGCCGGGAGACCTTCCCGCAGAGGCACATGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGTCGTGCCCGCAGTGCCGGGAGACCTTCCCGCAGAGGCACATGCGGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACCGGCACCTGGCCAACGTGACCCAACTGGTAAAGCAGCTGCGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACCGGCACCTGGCCAACGTGACCCAACTGGTAAAGCAGCTGCGCACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCGGCCGTCGGGGCCCGGCGGCGAGATGGGCGTGTGCGAGAAGCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCGGCCGTCGGGGCCCGGCGGCGAGATGGGCGTGTGCGAGAAGCACCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGCCCCTGAAGCTGTACTGCGAGGAGGACCAGATGCCCATCTGCGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGCCCCTGAAGCTGTACTGCGAGGAGGACCAGATGCCCATCTGCGTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGCGACCGCTCCCGCGAGCACCGCGGCCACAGCGTGCTGCCGCTCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTGCGACCGCTCCCGCGAGCACCGCGGCCACAGCGTGCTGCCGCTCGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGCGGTGGAGGGCTTCAAG         GAGCAAATCCAGAACCAGCTC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100401 AGGCGGTGGAGGGCTTCAAGGTG...CAGGAGCAAATCCAGAACCAGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GACCATTTAAAAAGAGTGAAAGATTTAAAGAAGAGACGTCGGGCCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101667 GACCATTTAAAAAGAGTGAAAGATTTAAAGAAGAGACGTCGGGCCCAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGAACAGGCACGAGCTGAACTCTTG         AGCCTAACCCAGATGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101717 GGAACAGGCACGAGCTGAACTCTTGGTA...TAGAGCCTAACCCAGATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGAGGGAGAAGATTGTTTGGGAGTTTGAGCAGCTGTATCACTCCTTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103407 AGAGGGAGAAGATTGTTTGGGAGTTTGAGCAGCTGTATCACTCCTTAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAGCATGAGTATCGCCTCCTGGCCCGCCTTGAGGAGCTAGACTTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103457 GAGCATGAGTATCGCCTCCTGGCCCGCCTTGAGGAGCTAGACTTGGCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTACAATAGCATCAATGGTGCCATCACCCAGTTCTCTTGCAACATCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103507 CTACAATAGCATCAATGGTGCCATCACCCAGTTCTCTTGCAACATCTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACCTCAGCAGCCTGATCGCTCAGCTAGAAGAGAAGCAGCAGCAGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103557 ACCTCAGCAGCCTGATCGCTCAGCTAGAAGAGAAGCAGCAGCAGCCCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGGGAGCTCCTGCAG         GACATTGGGGACACATTGAGCAG   
        |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>>>
 103607 AGGGAGCTCCTGCAGGTA...CAGGACATTGGGGACACATTGAGCAGGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    771       GGCTGAAAGAATCAGGATTCCTGAACCTTGGATCACACCTCCAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111941 ...TAGGGCTGAAAGAATCAGGATTCCTGAACCTTGGATCACACCTCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATTTGCAAGAGAAAATCCACATTTTTGCCCAAAAATGTCTATTCTTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114589 ATTTGCAAGAGAAAATCCACATTTTTGCCCAAAAATGTCTATTCTTGACG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GAGAGTCTAAAGCAGTTCACAG         AAAAAATGCAGTCAGATAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 114639 GAGAGTCTAAAGCAGTTCACAGGTA...TAGAAAAAATGCAGTCAGATAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGAGAAAATCCAAG         AATTAAGAGAGGCTCAGTTATACTCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 114812 GGAGAAAATCCAAGGTA...CAGAATTAAGAGAGGCTCAGTTATACTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947          TGGACGTGACTCTGGACCCAGACACGGCCTACCCCAGCCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116398 GTA...CAGTGGACGTGACTCTGGACCCAGACACGGCCTACCCCAGCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATCCTCTCTGATAATCTGCGGCAAGTGCGGTACAGTTACCTCCAACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119009 ATCCTCTCTGATAATCTGCGGCAAGTGCGGTACAGTTACCTCCAACAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCTGCCTGACAACCCCGAGAGGTTCAATCTGTTTCCCTGTGTCTTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119059 CCTGCCTGACAACCCCGAGAGGTTCAATCTGTTTCCCTGTGTCTTGGGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTCCATGCTTCATCGCCGGGAGACATTATTGGGAGGTAGAGGTGGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119109 CTCCATGCTTCATCGCCGGGAGACATTATTGGGAGGTAGAGGTGGGAGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AAAGCCAAGTGGACCATAGGTGTCTGTGAAGACTCAGTGTGCAGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119159 AAAGCCAAGTGGACCATAGGTGTCTGTGAAGACTCAGTGTGCAGAAAAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGGAGTAACCTCAGCCCCCCAGAATGGATTCTGGGCAGTGTCTTTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119209 TGGAGTAACCTCAGCCCCCCAGAATGGATTCTGGGCAGTGTCTTTGTGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ATGGGAAAGAATATTGGGCTCTTACCTCCCCAATGACTGCCCTACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119259 ATGGGAAAGAATATTGGGCTCTTACCTCCCCAATGACTGCCCTACCCCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CGGACCCCGCTCCAGCGGGTGGGGATTTTCTTGGACTATGATGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119309 CGGACCCCGCTCCAGCGGGTGGGGATTTTCTTGGACTATGATGCTGGTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGTCTCCTTCTACAACGTGACAGAGAGGTGTCACACCTTCACTTTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119359 GGTCTCCTTCTACAACGTGACAGAGAGGTGTCACACCTTCACTTTCTCTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 ATGCTACCTTTTGTGGGCCTGTCCGGCCCTACTTCAGTCTGAGTTACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119409 ATGCTACCTTTTGTGGGCCTGTCCGGCCCTACTTCAGTCTGAGTTACTCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GGAGGGAAAAGTGCAGCTCCTCTGATCATCTGCCCCATGAGTGGGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119459 GGAGGGAAAAGTGCAGCTCCTCTGATCATCTGCCCCATGAGTGGGATAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TGGGTTTTCTGGCCATGTTGGGAATCATGGTCATTCCATGGAGACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119509 TGGGTTTTCTGGCCATGTTGGGAATCATGGTCATTCCATGGAGACCTCCC

   1600 
   1538 CT
        ||
 119559 CT

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