Result of FASTA (omim) for pF1KE2390
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2390, 501 aa
  1>>>pF1KE2390 501 - 501 aa - 501 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0686+/-0.000311; mu= 20.2463+/- 0.019
 mean_var=77.7371+/-15.497, 0's: 0 Z-trim(117.6): 169  B-trim: 119 in 1/53
 Lambda= 0.145466
 statistics sampled from 29615 (29793) to 29615 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.349), width:  16
 Scan time: 10.350

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000738 (OMIM: 100710,616313,616314) acetylcholi ( 501) 3400 723.0  5e-208
NP_005190 (OMIM: 100730,253290,265000) acetylcholi ( 517) 1290 280.2   1e-74
NP_000742 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61632 ( 517) 1268 275.5 2.5e-73
NP_001243586 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 502) 1148 250.3 9.3e-66
NP_000071 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) acet ( 493) 1103 240.9 6.4e-63
XP_016879604 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) P ( 481) 1079 235.9 2.1e-61
NP_001298125 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 416) 1010 221.3 4.2e-57
XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424)  777 172.4 2.3e-42
XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424)  777 172.4 2.3e-42
XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468)  777 172.5 2.4e-42
XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468)  777 172.5 2.4e-42
XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495)  777 172.5 2.5e-42
XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495)  777 172.5 2.5e-42
NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498)  777 172.5 2.5e-42
XP_011519494 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 316)  771 171.1 4.3e-42
XP_011508826 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 390)  763 169.5 1.6e-41
XP_016855669 (OMIM: 118507,605375) PREDICTED: neur ( 332)  732 162.9 1.3e-39
NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502)  732 163.0 1.8e-39
NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505)  676 151.3 6.2e-36
NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479)  663 148.5 3.9e-35
XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529)  649 145.6 3.2e-34
NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529)  649 145.6 3.2e-34
XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529)  649 145.6 3.2e-34
XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449)  639 143.5 1.2e-33
XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462)  636 142.9 1.9e-33
XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463)  635 142.7 2.2e-33
NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627)  580 131.2 8.4e-30
NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458)  565 128.0 5.9e-29
NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489)  547 124.2 8.5e-28
XP_016868492 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370)  534 121.4 4.6e-27
XP_005273454 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370)  534 121.4 4.6e-27
NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514)  534 121.5 5.8e-27
NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482)  532 121.1 7.4e-27
XP_016858745 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 489)  532 121.1 7.5e-27
XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546)  530 120.7 1.1e-26
XP_011526826 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 556)  530 120.7 1.1e-26
NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494)  526 119.8 1.8e-26
XP_016868493 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331)  523 119.0 2.1e-26
XP_011542691 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331)  523 119.0 2.1e-26
XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 243)  521 118.5 2.2e-26
XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 245)  521 118.5 2.2e-26
NP_001243502 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ( 451)  518 118.1 5.4e-26
XP_016883114 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 451)  518 118.1 5.4e-26
XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438)  517 117.9 6.1e-26
NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457)  513 117.1 1.1e-25
XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464)  494 113.1 1.8e-24
NP_001298124 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 323)  485 111.0 5.2e-24
XP_011542692 (OMIM: 118508) PREDICTED: neuronal ac ( 329)  482 110.4 8.1e-24
XP_011519479 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 401)  469 107.8 6.2e-23
XP_011520455 (OMIM: 609756) PREDICTED: CHRNA7-FAM7 ( 412)  469 107.8 6.3e-23


>>NP_000738 (OMIM: 100710,616313,616314) acetylcholine r  (501 aa)
 initn: 3400 init1: 3400 opt: 3400  Z-score: 3855.7  bits: 723.0 E(85289): 5e-208
Smith-Waterman score: 3400; 100.0% identity (100.0% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGLIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGLIL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 AQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNND
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 GNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 LQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFYLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFYLI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 IRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVPE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 TSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLYLRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLYLRL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 KRPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KRPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRFI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 DGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTS
              430       440       450       460       470       480

              490       500 
pF1KE2 VGTLVIFLDATYHLPPPDPFP
       :::::::::::::::::::::
NP_000 VGTLVIFLDATYHLPPPDPFP
              490       500 

>>NP_005190 (OMIM: 100730,253290,265000) acetylcholine r  (517 aa)
 initn: 1046 init1: 607 opt: 1290  Z-score: 1462.4  bits: 280.2 E(85289): 1e-74
Smith-Waterman score: 1290; 42.0% identity (69.7% similar) in 509 aa overlap (4-501:6-506)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE2   MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGL
            : ::.::  :.. :  :..: . : ::   :...:: ..:::.. .: : ::. :
NP_005 MHGGQGPLLLLL-LLAVCL--GAQGRNQEERLLADLMQNYDPNLRPAERDSDVVNVSLKL
               10           20        30        40        50       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE2 ILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNN
        :..::::::..: ..:.:.....: :::: ::: ...:.  ::. .  :: ::.:: ::
NP_005 TLTNLISLNEREEALTTNVWIEMQWCDYRLRWDPRDYEGLWVLRVPSTMVWRPDIVLENN
        60        70        80        90       100       110       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE2 NDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSE
        :: :.:::  .:.:: :: . : ::.:.::.:::.:::::::::::...:.: .:...:
NP_005 VDGVFEVALYCNVLVSPDGCIYWLPPAIFRSACSISVTYFPFDWQNCSLIFQSQTYSTNE
       120       130       140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE2 VSLQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFY
       ..:: .   :::  . : :   .: :::.: : :.:....  :. :  ..:. .:.:.::
NP_005 IDLQLSQ-EDGQTIEWIFIDPEAFTENGEWAIQHRPAKMLLDPAAP--AQEAGHQKVVFY
       180        190       200       210       220         230    

      240       250       260       270        280       290       
pF1KE2 LIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAG-EKMGLSIFALLTLTVFLLLLADK
       :.:.::::::..:.::::.::. .::.. .::  :: .:  ..: .::. ::::.:.: :
NP_005 LLIQRKPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHFLPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFLVAKK
          240       250       260       270       280       290    

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 VPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLY
       ::::: .::.: ::: : .:.. . :. .:::::.  ::::::.:   ::..:.. ::  
NP_005 VPETSQAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAVVVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRLLPQL
          300       310       320       330       340       350    

       360        370       380        390       400       410     
pF1KE2 LRLK-RPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGT-DEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPD
       ::.. ::     ..    . .. .:::.  : .:  .  : :..:: . .:    : :  
NP_005 LRMHVRPLAPAAVQDTQSRLQNGSSGWSITTGEEVALCLPRSELLFQQWQR--QGLVAAA
          360       370       380       390       400         410  

         420       430               440       450       460       
pF1KE2 LRRFIDGPNRAVALL--------PELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVV
       :...  ::. ... .        : ..  : . . ::   ..:   :  .:.: .:. :.
NP_005 LEKLEKGPELGLSQFCGSLKQAAPAIQACVEACNLIACARHQQSHFDNGNEEWFLVGRVL
            420       430       440       450       460       470  

       470       480       490       500            
pF1KE2 DRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP           
       ::. . ... .   ::  ::: : :.  :  :::           
NP_005 DRVCFLAMLSLFICGTAGIFLMAHYNRVPALPFPGDPRPYLPSPD
            480       490       500       510       

>>NP_000742 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,616323) a  (517 aa)
 initn: 1214 init1: 491 opt: 1268  Z-score: 1437.5  bits: 275.5 E(85289): 2.5e-73
Smith-Waterman score: 1268; 40.6% identity (70.5% similar) in 508 aa overlap (7-501:5-503)

               10        20        30          40        50        
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFS--GYDSSVRPAREVGDRVRVSVGL
             .. :: :.:  . :  : . : :: ..::.  ::.. .::. .  . : :...:
NP_000   MEGPVLTLGLLAALAVCGSWGLNEEERLIRHLFQEKGYNKELRPVAHKEESVDVALAL
                 10        20        30        40        50        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE2 ILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNN
        :..::::.: .: ..:.:...  ::: ::.:.  :  .:. ::.  . ::::..:: ::
NP_000 TLSNLISLKEVEETLTTNVWIEHGWTDNRLKWNAEEFGNISVLRLPPDMVWLPEIVLENN
       60        70        80        90       100       110        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE2 NDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSE
       :::.:... . .:.:   : : : ::.:.:::: :.:::::::::::.. ::: .: ..:
NP_000 NDGSFQISYSCNVLVYHYGFVYWLPPAIFRSSCPISVTYFPFDWQNCSLKFSSLKYTAKE
      120       130       140       150       160       170        

      180       190             200       210       220       230  
pF1KE2 VSLQTGLGPDGQGHQEIHIH------EGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREG-Q
       ..:  .:  :.. ..   ..      :: : :::.:::.:.:.:.     :::.  .. .
NP_000 ITL--SLKQDAKENRTYPVEWIIIDPEG-FTENGEWEIVHRPARVNV---DPRAPLDSPS
      180         190       200        210       220          230  

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE2 RQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFL
       ::.. ::::::::::::..:...::.::.... .::::: :.::: ...: .::. .:::
NP_000 RQDITFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISFMVNLVFYLPADSGEKTSVAISVLLAQSVFL
            240       250       260       270       280       290  

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE2 LLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFI
       ::.. ..: ::...:.: :.:.: :::::. :.. :.:::.: :.: :: .   :...:.
NP_000 LLISKRLPATSMAIPLIGKFLLFGMVLVTMVVVICVIVLNIHFRTPSTHVLSEGVKKLFL
            300       310       320       330       340       350  

             360       370         380       390       400         
pF1KE2 HKLPLYLRLKRPKPERDLMPEPPHC--SSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPN-RFQ
       . ::  :...::  .    : :      : . :.   ..:::. :  ::..: : . :  
NP_000 ETLPELLHMSRPAED---GPSPGALVRRSSSLGYISKAEEYFLLKSRSDLMFEKQSERHG
            360          370       380       390       400         

      410       420        430       440       450       460       
pF1KE2 PELSAPDLRRFIDGPNRAVA-LLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVV
               ::   . ..:   :. ::. .:.. ..:. ....:....  :..:. :: .:
NP_000 LARRLTTARRPPASSEQAQQELFNELKPAVDGANFIVNHMRDQNNYNEEKDSWNRVARTV
     410       420       430       440       450       460         

       470       480       490       500               
pF1KE2 DRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP              
       ::: :..      :::  :::...:. :::.:::              
NP_000 DRLCLFVVTPVMVVGTAWIFLQGVYNQPPPQPFPGDPYSYNVQDKRFI
     470       480       490       500       510       

>>NP_001243586 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,616323  (502 aa)
 initn: 1125 init1: 491 opt: 1148  Z-score: 1301.5  bits: 250.3 E(85289): 9.3e-66
Smith-Waterman score: 1203; 39.8% identity (68.3% similar) in 508 aa overlap (7-501:5-488)

               10        20        30          40        50        
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFS--GYDSSVRPAREVGDRVRVSVGL
             .. :: :.:  . :  : . : :: ..::.  ::.. .::. .  . : :...:
NP_001   MEGPVLTLGLLAALAVCGSWGLNEEERLIRHLFQEKGYNKELRPVAHKEESVDVALAL
                 10        20        30        40        50        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE2 ILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNN
        :..::::.               ::: ::.:.  :  .:. ::.  . ::::..:: ::
NP_001 TLSNLISLG---------------WTDNRLKWNAEEFGNISVLRLPPDMVWLPEIVLENN
       60                       70        80        90       100   

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE2 NDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSE
       :::.:... . .:.:   : : : ::.:.:::: :.:::::::::::.. ::: .: ..:
NP_001 NDGSFQISYSCNVLVYHYGFVYWLPPAIFRSSCPISVTYFPFDWQNCSLKFSSLKYTAKE
           110       120       130       140       150       160   

      180       190             200       210       220       230  
pF1KE2 VSLQTGLGPDGQGHQEIHIH------EGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREG-Q
       ..:  .:  :.. ..   ..      :: : :::.:::.:.:.:.     :::.  .. .
NP_001 ITL--SLKQDAKENRTYPVEWIIIDPEG-FTENGEWEIVHRPARVNV---DPRAPLDSPS
             170       180        190       200          210       

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE2 RQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFL
       ::.. ::::::::::::..:...::.::.... .::::: :.::: ...: .::. .:::
NP_001 RQDITFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISFMVNLVFYLPADSGEKTSVAISVLLAQSVFL
       220       230       240       250       260       270       

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE2 LLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFI
       ::.. ..: ::...:.: :.:.: :::::. :.. :.:::.: :.: :: .   :...:.
NP_001 LLISKRLPATSMAIPLIGKFLLFGMVLVTMVVVICVIVLNIHFRTPSTHVLSEGVKKLFL
       280       290       300       310       320       330       

             360       370         380       390       400         
pF1KE2 HKLPLYLRLKRPKPERDLMPEPPHC--SSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPN-RFQ
       . ::  :...::  .    : :      : . :.   ..:::. :  ::..: : . :  
NP_001 ETLPELLHMSRPAED---GPSPGALVRRSSSLGYISKAEEYFLLKSRSDLMFEKQSERHG
       340       350          360       370       380       390    

      410       420        430       440       450       460       
pF1KE2 PELSAPDLRRFIDGPNRAVA-LLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVV
               ::   . ..:   :. ::. .:.. ..:. ....:....  :..:. :: .:
NP_001 LARRLTTARRPPASSEQAQQELFNELKPAVDGANFIVNHMRDQNNYNEEKDSWNRVARTV
          400       410       420       430       440       450    

       470       480       490       500               
pF1KE2 DRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP              
       ::: :..      :::  :::...:. :::.:::              
NP_001 DRLCLFVVTPVMVVGTAWIFLQGVYNQPPPQPFPGDPYSYNVQDKRFI
          460       470       480       490       500  

>>NP_000071 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) acetylch  (493 aa)
 initn: 986 init1: 625 opt: 1103  Z-score: 1250.6  bits: 240.9 E(85289): 6.4e-63
Smith-Waterman score: 1217; 39.9% identity (69.3% similar) in 499 aa overlap (3-500:5-487)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE2   MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGL
           : ..:.::: ::     :: :.. : :: ..::..:: . ::.::  : : .:. .
NP_000 MARAPLGVLLLLGLLGR----GV-GKNEELRLYHHLFNNYDPGSRPVREPEDTVTISLKV
               10             20        30        40        50     

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE2 ILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNN
        :..:::::::.: ..:.:.. ..: ::::...  .  ::..::. .: ::::..:: ::
NP_000 TLTNLISLNEKEETLTTSVWIGIDWQDYRLNYSKDDFGGIETLRVPSELVWLPEIVLENN
          60        70        80        90       100       110     

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE2 NDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSE
        ::.: :: : .:.:   ::: : ::.:::: :...:::::::::::...: : .:.. :
NP_000 IDGQFGVAYDANVLVYEGGSVTWLPPAIYRSVCAVEVTYFPFDWQNCSLIFRSQTYNAEE
         120       130       140       150       160       170     

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE2 VSLQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFY
       : .  ..  ::.  ..: :   .. :::.: :   :. . .  :    :  :.  .::. 
NP_000 VEFTFAVDNDGKTINKIDIDTEAYTENGEWAIDFCPGVIRRHHGGATDG-PGET-DVIYS
         180       190       200       210       220         230   

      240       250       260       270        280       290       
pF1KE2 LIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAG-EKMGLSIFALLTLTVFLLLLADK
       ::::::::::..:.:.::.::. :......:: .:: .:  .:: .::. ::::.:.:.:
NP_000 LIIRRKPLFYVINIIVPCVLISGLVLLAYFLPAQAGGQKCTVSINVLLAQTVFLFLIAQK
           240       250       260       270       280       290   

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 VPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLY
       .::::::::.. ..:.:.::..:. :.  :.:::. .:.: :: :   .:..... ::  
NP_000 IPETSLSVPLLGRFLIFVMVVATLIVMNCVIVLNVSQRTPTTHAMSPRLRHVLLELLPRL
           300       310       320       330       340       350   

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 LRLKRPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLR
       :  . : ::      ::. .: . :    ..: ...:: :...:    . :   .:    
NP_000 LG-SPPPPEAPRAASPPRRAS-SVGLLLRAEELILKKPRSELVFEGQRHRQGTWTAA---
            360       370        380       390       400           

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE2 RFIDGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFII
        : .. . :.   ::.:  :......:.. ..::       ::  .. ..: . .:. ..
NP_000 -FCQSLGAAA---PEVRCCVDAVNFVAESTRDQEATGEEVSDWVRMGNALDNICFWAALV
       410          420       430       440       450       460    

       480       490       500      
pF1KE2 FTSVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP     
       . :::. .::: : ..  :  :.      
NP_000 LFSVGSSLIFLGAYFNRVPDLPYAPCIQP
          470       480       490   

>>XP_016879604 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) PREDI  (481 aa)
 initn: 986 init1: 625 opt: 1079  Z-score: 1223.5  bits: 235.9 E(85289): 2.1e-61
Smith-Waterman score: 1193; 39.8% identity (69.7% similar) in 482 aa overlap (20-500:6-475)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGLIL
                          :: :.. : :: ..::..:: . ::.::  : : .:. . :
XP_016               MQRGRGV-GKNEELRLYHHLFNNYDPGSRPVREPEDTVTISLKVTL
                              10        20        30        40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 AQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNND
       ..:::::::.: ..:.:.. ..: ::::...  .  ::..::. .: ::::..:: :: :
XP_016 TNLISLNEKEETLTTSVWIGIDWQDYRLNYSKDDFGGIETLRVPSELVWLPEIVLENNID
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 GNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVS
       :.: :: : .:.:   ::: : ::.:::: :...:::::::::::...: : .:.. :: 
XP_016 GQFGVAYDANVLVYEGGSVTWLPPAIYRSVCAVEVTYFPFDWQNCSLIFRSQTYNAEEVE
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 LQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFYLI
       .  ..  ::.  ..: :   .. :::.: :   :. . .  :    :  :.  .::. ::
XP_016 FTFAVDNDGKTINKIDIDTEAYTENGEWAIDFCPGVIRRHHGGATDG-PGET-DVIYSLI
         170       180       190       200       210         220   

              250       260       270        280       290         
pF1KE2 IRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAG-EKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVP
       ::::::::..:.:.::.::. :......:: .:: .:  .:: .::. ::::.:.:.:.:
XP_016 IRRKPLFYVINIIVPCVLISGLVLLAYFLPAQAGGQKCTVSINVLLAQTVFLFLIAQKIP
           230       240       250       260       270       280   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE2 ETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLYLR
       :::::::.. ..:.:.::..:. :.  :.:::. .:.: :: :   .:..... ::  : 
XP_016 ETSLSVPLLGRFLIFVMVVATLIVMNCVIVLNVSQRTPTTHAMSPRLRHVLLELLPRLLG
           290       300       310       320       330       340   

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE2 LKRPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRF
        . : ::      ::. .: . :    ..: ...:: :...:    . :   .:     :
XP_016 -SPPPPEAPRAASPPRRAS-SVGLLLRAEELILKKPRSELVFEGQRHRQGTWTAA----F
            350       360        370       380       390           

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE2 IDGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFT
        .. . :.   ::.:  :......:.. ..::       ::  .. ..: . .:. ... 
XP_016 CQSLGAAA---PEVRCCVDAVNFVAESTRDQEATGEEVSDWVRMGNALDNICFWAALVLF
       400          410       420       430       440       450    

     480       490       500      
pF1KE2 SVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP     
       :::. .::: : ..  :  :.      
XP_016 SVGSSLIFLGAYFNRVPDLPYAPCIQP
          460       470       480 

>>NP_001298125 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,616323  (416 aa)
 initn: 987 init1: 491 opt: 1010  Z-score: 1146.1  bits: 221.3 E(85289): 4.2e-57
Smith-Waterman score: 1010; 40.9% identity (70.6% similar) in 394 aa overlap (119-501:18-402)

       90       100       110       120       130       140        
pF1KE2 SWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNNDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYR
                                     :::.:... . .:.:   : : : ::.:.:
NP_001              MLKNLETSVSCASPRTCNDGSFQISYSCNVLVYHYGFVYWLPPAIFR
                            10        20        30        40       

      150       160       170       180       190             200  
pF1KE2 SSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVSLQTGLGPDGQGHQEIHIH------EGTF
       ::: :.:::::::::::.. ::: .: ..:..:  .:  :.. ..   ..      :: :
NP_001 SSCPISVTYFPFDWQNCSLKFSSLKYTAKEITL--SLKQDAKENRTYPVEWIIIDPEG-F
        50        60        70        80          90       100     

            210       220       230        240       250       260 
pF1KE2 IENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREG-QRQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITL
        :::.:::.:.:.:.     :::.  .. .::.. ::::::::::::..:...::.::..
NP_001 TENGEWEIVHRPARVNV---DPRAPLDSPSRQDITFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISF
          110       120          130       140       150       160 

             270       280       290       300       310       320 
pF1KE2 LAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTF
       .. .::::: :.::: ...: .::. .:::::.. ..: ::...:.: :.:.: :::::.
NP_001 MVNLVFYLPADSGEKTSVAISVLLAQSVFLLLISKRLPATSMAIPLIGKFLLFGMVLVTM
             170       180       190       200       210       220 

             330       340       350       360       370           
pF1KE2 SVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLYLRLKRPKPERDLMPEPPHC--SSP
        :.. :.:::.: :.: :: .   :...:.. ::  :...::  .    : :      : 
NP_001 VVVICVIVLNIHFRTPSTHVLSEGVKKLFLETLPELLHMSRPAED---GPSPGALVRRSS
             230       240       250       260          270        

     380       390       400        410       420        430       
pF1KE2 GSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPN-RFQPELSAPDLRRFIDGPNRAVA-LLPELREVV
       . :.   ..:::. :  ::..: : . :          ::   . ..:   :. ::. .:
NP_001 SLGYISKAEEYFLLKSRSDLMFEKQSERHGLARRLTTARRPPASSEQAQQELFNELKPAV
      280       290       300       310       320       330        

       440       450       460       470       480       490       
pF1KE2 SSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHLPPP
       .. ..:. ....:....  :..:. :: .:::: :..      :::  :::...:. :::
NP_001 DGANFIVNHMRDQNNYNEEKDSWNRVARTVDRLCLFVVTPVMVVGTAWIFLQGVYNQPPP
      340       350       360       370       380       390        

       500               
pF1KE2 DPFP              
       .:::              
NP_001 QPFPGDPYSYNVQDKRFI
      400       410      

>>XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal acetyl  (424 aa)
 initn: 1131 init1: 564 opt: 777  Z-score: 881.7  bits: 172.4 E(85289): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 1196; 42.8% identity (68.9% similar) in 444 aa overlap (73-500:1-419)

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE2 RPAREVGDRVRVSVGLILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLR
                                     :.:.:.:  :::::::.:. ....:.. ::
XP_011                               MTTNVWLKQEWTDYRLTWNSSRYEGVNILR
                                             10        20        30

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE2 ITAESVWLPDVVLLNNNDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDW
       : :. .::::.:: :: ::...:..  ...: :.::: : ::.::.:.:.:.: ::::: 
XP_011 IPAKRIWLPDIVLYNNADGTYEVSVYTNLIVRSNGSVLWLPPAIYKSACKIEVKYFPFDQ
               40        50        60        70        80        90

            170       180       190       200       210       220  
pF1KE2 QNCTMVFSSYSYDSSEVSLQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPG
       ::::. : :..:: .:... . . : ..  .        :  .:.:.:.  :.:    : 
XP_011 QNCTLKFRSWTYDHTEIDM-VLMTPTASMDD--------FTPSGEWDIVALPGRRTVNPQ
              100        110       120               130       140 

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE2 DPRGGREGQRQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIF
       ::      .  .: . .::.:::::: .:.: ::.: :::::.::::: : :::: : : 
XP_011 DP------SYVDVTYDFIIKRKPLFYTINLIIPCVLTTLLAILVFYLPSDCGEKMTLCIS
                   150       160       170       180       190     

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE2 ALLTLTVFLLLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQM
       .::.:: ::::..  :: :::.::.: :::::::::::::.. :: :::.::::: :: :
XP_011 VLLALTFFLLLISKIVPPTSLDVPLIGKYLMFTMVLVTFSIVTSVCVLNVHHRSPSTHTM
         200       210       220       230       240       250     

            350       360          370                 380         
pF1KE2 PLWVRQIFIHKLPLYLRLKRPKPERD---LMPEPPHC----------SSPGSGWGRGTDE
         ::.. :.:::: .: .::: :. .    .:    :          .::.. .:  .. 
XP_011 APWVKRCFLHKLPTFLFMKRPGPDSSPARAFPPSKSCVTKPEATATSTSPSNFYG--NSM
         260       270       280       290       300       310     

     390       400       410        420       430       440        
pF1KE2 YFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRF-IDGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQ
       ::.   :..    .:    : .. :  : : . . .:   .  ...:.. ..:.::....
XP_011 YFVN--PASAASKSPAGSTP-VAIP--RDFWLRSSGR---FRQDVQEALEGVSFIAQHMK
             320       330          340          350       360     

      450       460       470       480       490         500     
pF1KE2 EQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATY--HLPPPDPFP    
       .... ... :::..:::::::::::.:..   .::. .::   .  :     :.     
XP_011 NDDEDQSVVEDWKYVAMVVDRLFLWVFMFVCVLGTVGLFLPPLFQTHAASEGPYAAQRD
         370       380       390       400       410       420    

>>XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal acetyl  (424 aa)
 initn: 1131 init1: 564 opt: 777  Z-score: 881.7  bits: 172.4 E(85289): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 1196; 42.8% identity (68.9% similar) in 444 aa overlap (73-500:1-419)

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE2 RPAREVGDRVRVSVGLILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLR
                                     :.:.:.:  :::::::.:. ....:.. ::
XP_011                               MTTNVWLKQEWTDYRLTWNSSRYEGVNILR
                                             10        20        30

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE2 ITAESVWLPDVVLLNNNDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDW
       : :. .::::.:: :: ::...:..  ...: :.::: : ::.::.:.:.:.: ::::: 
XP_011 IPAKRIWLPDIVLYNNADGTYEVSVYTNLIVRSNGSVLWLPPAIYKSACKIEVKYFPFDQ
               40        50        60        70        80        90

            170       180       190       200       210       220  
pF1KE2 QNCTMVFSSYSYDSSEVSLQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPG
       ::::. : :..:: .:... . . : ..  .        :  .:.:.:.  :.:    : 
XP_011 QNCTLKFRSWTYDHTEIDM-VLMTPTASMDD--------FTPSGEWDIVALPGRRTVNPQ
              100        110       120               130       140 

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE2 DPRGGREGQRQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIF
       ::      .  .: . .::.:::::: .:.: ::.: :::::.::::: : :::: : : 
XP_011 DP------SYVDVTYDFIIKRKPLFYTINLIIPCVLTTLLAILVFYLPSDCGEKMTLCIS
                   150       160       170       180       190     

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE2 ALLTLTVFLLLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQM
       .::.:: ::::..  :: :::.::.: :::::::::::::.. :: :::.::::: :: :
XP_011 VLLALTFFLLLISKIVPPTSLDVPLIGKYLMFTMVLVTFSIVTSVCVLNVHHRSPSTHTM
         200       210       220       230       240       250     

            350       360          370                 380         
pF1KE2 PLWVRQIFIHKLPLYLRLKRPKPERD---LMPEPPHC----------SSPGSGWGRGTDE
         ::.. :.:::: .: .::: :. .    .:    :          .::.. .:  .. 
XP_011 APWVKRCFLHKLPTFLFMKRPGPDSSPARAFPPSKSCVTKPEATATSTSPSNFYG--NSM
         260       270       280       290       300       310     

     390       400       410        420       430       440        
pF1KE2 YFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRF-IDGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQ
       ::.   :..    .:    : .. :  : : . . .:   .  ...:.. ..:.::....
XP_011 YFVN--PASAASKSPAGSTP-VAIP--RDFWLRSSGR---FRQDVQEALEGVSFIAQHMK
             320       330          340          350       360     

      450       460       470       480       490         500     
pF1KE2 EQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATY--HLPPPDPFP    
       .... ... :::..:::::::::::.:..   .::. .::   .  :     :.     
XP_011 NDDEDQSVVEDWKYVAMVVDRLFLWVFMFVCVLGTVGLFLPPLFQTHAASEGPYAAQRD
         370       380       390       400       410       420    

>>XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal acetyl  (468 aa)
 initn: 1226 init1: 564 opt: 777  Z-score: 881.2  bits: 172.5 E(85289): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 1280; 42.4% identity (69.1% similar) in 479 aa overlap (38-500:10-463)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KE2 MLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGLILAQLISLN
                                     :.. .:::   .. . ... : ::::::.:
XP_016                      MDDLLNKTRYNNLIRPATSSSQLISIKLQLSLAQLISVN
                                    10        20        30         

        70        80        90       100       110       120       
pF1KE2 EKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNNDGNFDVAL
       :... :.:.:.:  :::::::.:. ....:.. ::: :. .::::.:: :: ::...:..
XP_016 EREQIMTTNVWLKQEWTDYRLTWNSSRYEGVNILRIPAKRIWLPDIVLYNNADGTYEVSV
      40        50        60        70        80        90         

       130       140       150       160       170       180       
pF1KE2 DISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVSLQTGLGP
         ...: :.::: : ::.::.:.:.:.: ::::: ::::. : :..:: .:... . . :
XP_016 YTNLIVRSNGSVLWLPPAIYKSACKIEVKYFPFDQQNCTLKFRSWTYDHTEIDM-VLMTP
     100       110       120       130       140       150         

       190       200       210       220       230       240       
pF1KE2 DGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFYLIIRRKPLF
        ..  .        :  .:.:.:.  :.:    : ::      .  .: . .::.:::::
XP_016 TASMDD--------FTPSGEWDIVALPGRRTVNPQDP------SYVDVTYDFIIKRKPLF
      160               170       180             190       200    

       250       260       270       280       290       300       
pF1KE2 YLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVPETSLSVPI
       : .:.: ::.: :::::.::::: : :::: : : .::.:: ::::..  :: :::.::.
XP_016 YTINLIIPCVLTTLLAILVFYLPSDCGEKMTLCISVLLALTFFLLLISKIVPPTSLDVPL
          210       220       230       240       250       260    

       310       320       330       340       350       360       
pF1KE2 IIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLYLRLKRPKPER
       : :::::::::::::.. :: :::.::::: :: :  ::.. :.:::: .: .::: :. 
XP_016 IGKYLMFTMVLVTFSIVTSVCVLNVHHRSPSTHTMAPWVKRCFLHKLPTFLFMKRPGPDS
          270       280       290       300       310       320    

          370                 380       390       400       410    
pF1KE2 D---LMPEPPHC----------SSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAP
       .    .:    :          .::.. .: .   ::.   :..    .:    : .. :
XP_016 SPARAFPPSKSCVTKPEATATSTSPSNFYGNSM--YFVN--PASAASKSPAGSTP-VAIP
          330       340       350         360         370          

           420       430       440       450       460       470   
pF1KE2 DLRRF-IDGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLW
         : : . . .:   .  ...:.. ..:.::........ ... :::..:::::::::::
XP_016 --RDFWLRSSGR---FRQDVQEALEGVSFIAQHMKNDDEDQSVVEDWKYVAMVVDRLFLW
       380          390       400       410       420       430    

           480       490         500     
pF1KE2 TFIIFTSVGTLVIFLDATY--HLPPPDPFP    
       .:..   .::. .::   .  :     :.     
XP_016 VFMFVCVLGTVGLFLPPLFQTHAASEGPYAAQRD
          440       450       460        




501 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Mon Nov  7 01:51:12 2016 done: Mon Nov  7 01:51:14 2016
 Total Scan time: 10.350 Total Display time:  0.090

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com