Result of FASTA (ccds) for pF1KE0204
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0204, 207 aa
  1>>>pF1KE0204 207 - 207 aa - 207 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1138+/-0.00077; mu= 14.9583+/- 0.046
 mean_var=68.0801+/-13.526, 0's: 0 Z-trim(108.0): 34  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.155440
 statistics sampled from 9916 (9949) to 9916 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.306), width:  16
 Scan time:  2.030

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4378.1 FGF18 gene_id:8817|Hs108|chr5           ( 207) 1400 322.4 1.2e-88
CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 215)  767 180.5 6.8e-46
CCDS6019.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8           ( 216)  740 174.4 4.5e-44
CCDS78310.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8          ( 205)  712 168.1 3.4e-42
CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 244)  689 163.0 1.4e-40
CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 204)  682 161.4 3.6e-40
CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 233)  679 160.8 6.3e-40
CCDS73185.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10          ( 140)  527 126.5 7.7e-30
CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15          ( 194)  257 66.1 1.7e-11


>>CCDS4378.1 FGF18 gene_id:8817|Hs108|chr5                (207 aa)
 initn: 1400 init1: 1400 opt: 1400  Z-score: 1704.8  bits: 322.4 E(32554): 1.2e-88
Smith-Waterman score: 1400; 100.0% identity (100.0% similar) in 207 aa overlap (1-207:1-207)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 TSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGKP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYPK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       
pF1KE0 GQPELQKPFKYTTVTKRSRRIRPTHPA
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GQPELQKPFKYTTVTKRSRRIRPTHPA
              190       200       

>>CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10                (215 aa)
 initn: 735 init1: 579 opt: 767  Z-score: 937.4  bits: 180.5 E(32554): 6.8e-46
Smith-Waterman score: 767; 54.3% identity (80.8% similar) in 208 aa overlap (1-205:1-207)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSR
       : :  :: .:: ::.:.::.:.:: : . . .:  ::..:. . :..::. .: ::::::
CCDS75 MGSPRSALSCLLLHLLVLCLQAQVTV-QSSPNFTQHVREQSLVTDQLSRRLIRTYQLYSR
               10        20         30        40        50         

               70         80        90       100       110         
pF1KE0 TSGKHIQVLG-RRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGK
       :::::.:::. .::.: .:::: .:.:.::::::::.::..: :: .:.:::.::::..:
CCDS75 TSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGLYICMNKKGKLIAK
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 PDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYP
        .: .:.::: : :::::::::..::: :::..::.::::::: :::..:..:::::: :
CCDS75 SNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTRQHQREVHFMKRLP
     120       130       140       150       160       170         

     180         190       200             
pF1KE0 KGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA      
       .:.   ..   :.. .    .: .: ..        
CCDS75 RGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
     180       190       200       210     

>>CCDS6019.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8                (216 aa)
 initn: 730 init1: 654 opt: 740  Z-score: 904.7  bits: 174.4 E(32554): 4.5e-44
Smith-Waterman score: 740; 53.4% identity (80.9% similar) in 204 aa overlap (11-206:12-214)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0  MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYS
                  :::..:.:: :.:    . . .:  .:..:    :..::.:.: :::::
CCDS60 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQGE-NHPSPNFNQYVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYS
               10        20         30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE0 RTSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGK
       ::::::.:: :::::: .:::.:.:.:.::::::::.::::: :.: :.:::..:::.::
CCDS60 RTSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGK
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 PDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYP
       :.: ::.::: : ::::::::...:.. ::...::..::::.. ..:.::...::.::  
CCDS60 PSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLY
     120       130       140       150       160       170         

     180             190         200        
pF1KE0 KGQ-P-----ELQKPFKY--TTVTKRSRRIRPTHPA 
       .:: :     : :: :..  .. :.:..: :  .:  
CCDS60 QGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
     180       190       200       210      

>>CCDS78310.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8               (205 aa)
 initn: 730 init1: 654 opt: 712  Z-score: 871.0  bits: 168.1 E(32554): 3.4e-42
Smith-Waterman score: 723; 52.9% identity (78.9% similar) in 204 aa overlap (11-206:12-203)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0  MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYS
                  :::..:.:: :.:            .:..:    :..::.:.: :::::
CCDS78 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQ------------YVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYS
               10        20                    30        40        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE0 RTSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGK
       ::::::.:: :::::: .:::.:.:.:.::::::::.::::: :.: :.:::..:::.::
CCDS78 RTSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGK
       50        60        70        80        90       100        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 PDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYP
       :.: ::.::: : ::::::::...:.. ::...::..::::.. ..:.::...::.::  
CCDS78 PSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLY
      110       120       130       140       150       160        

     180             190         200        
pF1KE0 KGQ-P-----ELQKPFKY--TTVTKRSRRIRPTHPA 
       .:: :     : :: :..  .. :.:..: :  .:  
CCDS78 QGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
      170       180       190       200     

>>CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10                (244 aa)
 initn: 741 init1: 541 opt: 689  Z-score: 842.1  bits: 163.0 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 702; 47.0% identity (71.6% similar) in 236 aa overlap (1-205:1-236)

               10        20                                    30  
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQV----------------------------LVAEENVD
       : :  :: .:: ::.:.::.:.:                             .... . .
CCDS75 MGSPRSALSCLLLHLLVLCLQAQEGPGRGPALGRELASLFRAGREPQGVSQQVTVQSSPN
               10        20        30        40        50        60

             40        50        60        70         80        90 
pF1KE0 FRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSRTSGKHIQVLG-RRISARGEDGDKYAQLLVETD
       :  ::..:. . :..::. .: :::::::::::.:::. .::.: .:::: .:.:.::::
CCDS75 FTQHVREQSLVTDQLSRRLIRTYQLYSRTSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETD
               70        80        90       100       110       120

             100       110       120       130       140       150 
pF1KE0 TFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGKPDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYV
       ::::.::..: :: .:.:::.::::..: .: .:.::: : :::::::::..::: :::.
CCDS75 TFGSRVRVRGAETGLYICMNKKGKLIAKSNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYM
              130       140       150       160       170       180

             160       170       180         190       200         
pF1KE0 GFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYPKGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA  
       .::.::::::: :::..:..:::::: :.:.   ..   :.. .    .: .: ..    
CCDS75 AFTRKGRPRKGSKTRQHQREVHFMKRLPRGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWA
              190       200       210       220       230       240

CCDS75 PEPR
           

>>CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10                (204 aa)
 initn: 741 init1: 541 opt: 682  Z-score: 834.7  bits: 161.4 E(32554): 3.6e-40
Smith-Waterman score: 731; 52.9% identity (77.9% similar) in 208 aa overlap (1-205:1-196)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSR
       : :  :: .:: ::.:.::.:.:            ::..:. . :..::. .: ::::::
CCDS75 MGSPRSALSCLLLHLLVLCLQAQ------------HVREQSLVTDQLSRRLIRTYQLYSR
               10        20                    30        40        

               70         80        90       100       110         
pF1KE0 TSGKHIQVLG-RRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGK
       :::::.:::. .::.: .:::: .:.:.::::::::.::..: :: .:.:::.::::..:
CCDS75 TSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGLYICMNKKGKLIAK
       50        60        70        80        90       100        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 PDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYP
        .: .:.::: : :::::::::..::: :::..::.::::::: :::..:..:::::: :
CCDS75 SNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTRQHQREVHFMKRLP
      110       120       130       140       150       160        

     180         190       200             
pF1KE0 KGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA      
       .:.   ..   :.. .    .: .: ..        
CCDS75 RGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
      170       180       190       200    

>>CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10                (233 aa)
 initn: 763 init1: 541 opt: 679  Z-score: 830.3  bits: 160.8 E(32554): 6.3e-40
Smith-Waterman score: 720; 50.7% identity (74.2% similar) in 225 aa overlap (1-205:1-225)

               10        20               30                  40   
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQ-------VLVAEENVDFRI----------HVENQTRA
       : :  :: .:: ::.:.::.:.:       .:  :    ::           ::..:. .
CCDS75 MGSPRSALSCLLLHLLVLCLQAQEGPGRGPALGRELASLFRAGREPQGVSQQHVREQSLV
               10        20        30        40        50        60

            50        60        70         80        90       100  
pF1KE0 RDDVSRKQLRLYQLYSRTSGKHIQVLG-RRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGK
        :..::. .: :::::::::::.:::. .::.: .:::: .:.:.::::::::.::..: 
CCDS75 TDQLSRRLIRTYQLYSRTSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGA
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE0 ETEFYLCMNRKGKLVGKPDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKG
       :: .:.:::.::::..: .: .:.::: : :::::::::..::: :::..::.:::::::
CCDS75 ETGLYICMNKKGKLIAKSNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKG
              130       140       150       160       170       180

            170       180         190       200             
pF1KE0 PKTRENQQDVHFMKRYPKGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA      
        :::..:..:::::: :.:.   ..   :.. .    .: .: ..        
CCDS75 SKTRQHQREVHFMKRLPRGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
              190       200       210       220       230   

>>CCDS73185.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10               (140 aa)
 initn: 525 init1: 525 opt: 527  Z-score: 649.2  bits: 126.5 E(32554): 7.7e-30
Smith-Waterman score: 527; 56.2% identity (82.3% similar) in 130 aa overlap (78-205:3-132)

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                                     :::: .:.:.::::::::.::..: :: .:
CCDS73                             MAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGLY
                                           10        20        30  

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pF1KE0 LCMNRKGKLVGKPDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRE
       .:::.::::..: .: .:.::: : :::::::::..::: :::..::.::::::: :::.
CCDS73 ICMNKKGKLIAKSNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTRQ
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pF1KE0 NQQDVHFMKRYPKGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA      
       .:..:::::: :.:.   ..   :.. .    .: .: ..        
CCDS73 HQREVHFMKRLPRGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
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>>CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15               (194 aa)
 initn: 232 init1:  93 opt: 257  Z-score: 319.9  bits: 66.1 E(32554): 1.7e-11
Smith-Waterman score: 257; 31.6% identity (62.6% similar) in 171 aa overlap (10-175:23-189)

                            10        20        30        40       
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                             ::   . : : ..       ::.     : .::. : .
CCDS10 MHKWILTWILPTLLYRSCFHIICLVGTISLACNDMTPEQMATNVNCS-SPERHTRSYDYM
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pF1KE0 SRKQLRLYQLYSRTSGKHIQVLGR-RISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEF
          ..:. .:. ::.  ....  : ....  :  ..:  . ..: . :  : ::: :.::
CCDS10 EGGDIRVRRLFCRTQW-YLRIDKRGKVKGTQEMKNNYNIMEIRTVAVGI-VAIKGVESEF
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pF1KE0 YLCMNRKGKLVGKPDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSG----WYVGFTKKGRPRKG
       :: ::..::: .: .  ...: : : .:::.:..  :::..      .:....:: : .:
CCDS10 YLAMNKEGKLYAKKE-CNEDCNFKELILENHYNTYASAKWTHNGGEMFVALNQKGIPVRG
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pF1KE0 PKTRENQQDVHFMKRYPKGQPELQKPFKYTTVTKRSRRIRPTHPA
        ::...:. .::.                                
CCDS10 KKTKKEQKTAHFLPMAIT                           
        180       190                               




207 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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