seq1 = pF1KE4407.tfa, 1263 bp seq2 = pF1KE4407/gi568815581f_41868067.tfa (gi568815581f:41868067_42073921), 205855 bp >pF1KE4407 1263 >gi568815581f:41868067_42073921 (Chr17) 1-676 (100000-100674) 99% -> 677-816 (103826-103965) 100% -> 817-1263 (105409-105855) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAACAGAGGCTTCTCCCGAAAAAGCCACACATTCCTGCCCAAGATCTT |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100000 A GAACAGAGGCTTCTCCCGAAAAAGCCACACATTCCTGCCCAAGATCTT 50 . : . : . : . : . : 51 CTTCCGCAAGATGTCATCCTCAGGGGCCAAGGACAAGCCTGAGCTGCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100049 CTTCCGCAAGATGTCATCCTCAGGGGCCAAGGACAAGCCTGAGCTGCAGT 100 . : . : . : . : . : 101 TTCCCTTCCTTCAGGATGAGGACACAGTGGCCACGCTGCTAGAGTGCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100099 TTCCCTTCCTTCAGGATGAGGACACAGTGGCCACGCTGCTAGAGTGCAAG 150 . : . : . : . : . : 151 ACGCTCTTCATCTTGCGCGGCCTGCCAGGAAGCGGCAAGTCCACGCTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100149 ACGCTCTTCATCTTGCGCGGCCTGCCAGGAAGCGGCAAGTCCACGCTGGC 200 . : . : . : . : . : 201 ACGGGTCATCGTGGACAAGTACCGTGATGGCACCAAGATGGTGTCGGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100199 ACGGGTCATCGTGGACAAGTACCGTGATGGCACCAAGATGGTGTCGGCTG 250 . : . : . : . : . : 251 ACGCTTACAAGATCACCCCCGGCGCTCGAGGAGCCTTCTCCGAGGAGTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100249 ACGCTTACAAGATCACCCCCGGCGCTCGAGGAGCCTTCTCCGAGGAGTAC 300 . : . : . : . : . : 301 AAGCGGCTCGATGAGGACCTGGCTGCCTACTGCCGCCGCCGGGACATCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100299 AAGCGGCTCGATGAGGACCTGGCTGCCTACTGCCGCCGCCGGGACATCAG 350 . : . : . : . : . : 351 AATTCTTGTGCTTGATGACACCAACCACGAACGGGAACGGCTGGAGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100349 AATTCTTGTGCTTGATGACACCAACCACGAACGGGAACGGCTGGAGCAGC 400 . : . : . : . : . : 401 TCTTTGAAATGGCCGACCAGTACCAGTACCAGGTGGTGCTGGTGGAGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100399 TCTTTGAAATGGCCGACCAGTACCAGTACCAGGTGGTGCTGGTGGAGCCC 450 . : . : . : . : . : 451 AAGACGGCGTGGCGGCTGGACTGTGCCCAGCTCAAGGAGAAGAACCAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100449 AAGACGGCGTGGCGGCTGGACTGTGCCCAGCTCAAGGAGAAGAACCAGTG 500 . : . : . : . : . : 501 GCAGCTGTCGGCTGATGACCTGAAGAAGCTGAAGCCTGGGCTGGAGAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100499 GCAGCTGTCGGCTGATGACCTGAAGAAGCTGAAGCCTGGGCTGGAGAAGG 550 . : . : . : . : . : 551 ACTTCCTGCCGCTCTACTTCGGCTGGTTCCTGACCAAGAAGAGCTCTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100549 ACTTCCTGCCGCTCTACTTCGGCTGGTTCCTGACCAAGAAGAGCTCTGAG 600 . : . : . : . : . : 601 ACCCTCCGCAAAGCCGGCCAGGTCTTCCTGGAAGAGCTGGGGAACCACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100599 ACCCTCCGCAAAGCCGGCCAGGTCTTCCTGGAAGAGCTGGGGAACCACAA 650 . : . : . : . : . : 651 GGCCTTCAAGAAGGAGCTGCGACAAT TCGTCCCTGGGGATG ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 100649 GGCCTTCAAGAAGGAGCTGCGACAATGTA...CAGTCGTCCCTGGGGATG 700 . : . : . : . : . : 692 AGCCCAGGGAGAAGATGGACTTGGTCACCTACTTTGGAAAGAGACCCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103841 AGCCCAGGGAGAAGATGGACTTGGTCACCTACTTTGGAAAGAGACCCCCA 750 . : . : . : . : . : 742 GGCGTGCTGCATTGCACAACCAAGTTTTGTGACTACGGGAAGGCTCCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103891 GGCGTGCTGCATTGCACAACCAAGTTTTGTGACTACGGGAAGGCTCCCGG 800 . : . : . : . : . : 792 GGCAGAGGAGTACGCTCAACAAGAT GTGTTAAAGAAATCTT |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 103941 GGCAGAGGAGTACGCTCAACAAGATGTG...CAGGTGTTAAAGAAATCTT 850 . : . : . : . : . : 833 ACTCCAAGGCCTTCACGCTGACCATCTCTGCCCTCTTTGTGACACCCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105425 ACTCCAAGGCCTTCACGCTGACCATCTCTGCCCTCTTTGTGACACCCAAG 900 . : . : . : . : . : 883 ACGACTGGGGCCCGGGTGGAGTTAAGCGAGCAGCAACTGCAGTTGTGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105475 ACGACTGGGGCCCGGGTGGAGTTAAGCGAGCAGCAACTGCAGTTGTGGCC 950 . : . : . : . : . : 933 GAGTGATGTGGACAAGCTGTCACCCACTGACAACCTGCCGCGGGGGAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105525 GAGTGATGTGGACAAGCTGTCACCCACTGACAACCTGCCGCGGGGGAGCC 1000 . : . : . : . : . : 983 GCGCCCACATCACCCTCGGCTGTGCAGCTGACGTAGAGGCCGTGCAGACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105575 GCGCCCACATCACCCTCGGCTGTGCAGCTGACGTAGAGGCCGTGCAGACG 1050 . : . : . : . : . : 1033 GGCCTTGACCTCTTAGAGATTCTGCGGCAGGAGAAGGGGGGCAGCCGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105625 GGCCTTGACCTCTTAGAGATTCTGCGGCAGGAGAAGGGGGGCAGCCGAGG 1100 . : . : . : . : . : 1083 CGAGGAGGTGGGCGAGCTAAGCCGGGGCAAGCTCTATTCCTTGGGCAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105675 CGAGGAGGTGGGCGAGCTAAGCCGGGGCAAGCTCTATTCCTTGGGCAATG 1150 . : . : . : . : . : 1133 GGCGCTGGATGCTGACCCTGGCCAAGAACATGGAGGTCAGGGCCATCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105725 GGCGCTGGATGCTGACCCTGGCCAAGAACATGGAGGTCAGGGCCATCTTC 1200 . : . : . : . : . : 1183 ACGGGGTACTACGGGAAAGGCAAACCTGTGCCCACGCAAGGTAGCCGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105775 ACGGGGTACTACGGGAAAGGCAAACCTGTGCCCACGCAAGGTAGCCGGAA 1250 . : . : . : 1233 GGGGGGCGCCTTGCAGTCCTGCACCATCATA ||||||||||||||||||||||||||||||| 105825 GGGGGGCGCCTTGCAGTCCTGCACCATCATA