Result of FASTA (ccds) for pF1KE0786
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0786, 457 aa
  1>>>pF1KE0786 457 - 457 aa - 457 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5657+/-0.000975; mu= -10.0196+/- 0.059
 mean_var=318.8447+/-65.068, 0's: 0 Z-trim(116.0): 121  B-trim: 6 in 1/50
 Lambda= 0.071826
 statistics sampled from 16456 (16577) to 16456 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.8), E-opt: 0.2 (0.509), width:  16
 Scan time:  3.790

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4422.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5          ( 457) 3252 350.2 2.7e-96
CCDS4423.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5          ( 423) 2366 258.3 1.1e-68
CCDS4424.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5          ( 222) 1305 148.2 7.9e-36
CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10          ( 727) 1030 120.0   8e-27
CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10         ( 617) 1028 119.8 8.1e-27
CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10         ( 732) 1028 119.8 9.3e-27
CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 271)  889 105.2 8.8e-23
CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 487)  889 105.3 1.4e-22
CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4         ( 596)  889 105.4 1.7e-22
CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 625)  889 105.4 1.8e-22
CCDS58917.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 483)  861 102.4 1.1e-21
CCDS47104.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 214)  580 73.1 3.2e-13
CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16       ( 444)  574 72.6 8.9e-13
CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16       ( 461)  574 72.7 9.2e-13


>>CCDS4422.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5               (457 aa)
 initn: 3252 init1: 3252 opt: 3252  Z-score: 1842.4  bits: 350.2 E(32554): 2.7e-96
Smith-Waterman score: 3252; 100.0% identity (100.0% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-457)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 TVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 YHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 HVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       
pF1KE0 WHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
              430       440       450       

>>CCDS4423.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5               (423 aa)
 initn: 2348 init1: 2348 opt: 2366  Z-score: 1346.7  bits: 258.3 E(32554): 1.1e-68
Smith-Waterman score: 2905; 91.5% identity (92.3% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-423)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::...:                       
CCDS44 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKVQTP-----------------------
               70        80        90                              

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
                  . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -----------DKQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
                  100       110       120       130       140      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
        150       160       170       180       190       200      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 TVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHA
        210       220       230       240       250       260      

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 YHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTW
        270       280       290       300       310       320      

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 HVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFS
        330       340       350       360       370       380      

              430       440       450       
pF1KE0 WHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
        390       400       410       420   

>>CCDS4424.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5               (222 aa)
 initn: 1301 init1: 1301 opt: 1305  Z-score: 756.7  bits: 148.2 E(32554): 7.9e-36
Smith-Waterman score: 1305; 95.5% identity (96.5% similar) in 201 aa overlap (1-201:1-201)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
       :::::::::: .    :  .:                                       
CCDS44 DPDEEHLKKSREKYVLELQSPRYTRLRDWHHQRSAHVLNVQS                  
              190       200       210       220                    

>>CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10               (727 aa)
 initn: 1662 init1: 882 opt: 1030  Z-score: 595.0  bits: 120.0 E(32554): 8e-27
Smith-Waterman score: 1067; 39.3% identity (64.8% similar) in 412 aa overlap (86-455:318-724)

          60        70        80        90        100       110    
pF1KE0 ENAGSLTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAP-AADPPRYTFAPSVSLNK
                                     :....:  :..: ::.::  : :  ... .
CCDS73 QDPDEEALRRSSTPIEHAPVCTSQATTPLLPASAQPPAAASPSAASPPLATAAAHTAIAS
       290       300       310       320       330       340       

          120       130       140           150       160          
pF1KE0 TARPFGAPPPADSAPQQNGQPLRPLVP----DASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFR--
       ..    :  :::: :. ...   : :      :..    :.     :.: .  . :.:  
CCDS73 ASTTAPASSPADS-PRPQASSYSPAVAASSAPATHTSYSEGPAAPAPKPRVVTTASIRPS
       350       360        370       380       390       400      

      170       180       190       200                   210      
pF1KE0 ILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASS-------TPQE-----PWPGPT--
       .   . .. .  .:  ..    : .: : .:::: .       ::.      : :.:.  
CCDS73 VYQPVPASTYSPSPGANY----SPTPYTPSPAPAYTPSPAPAYTPSPVPTYTPSPAPAYT
        410       420           430       440       450       460  

                            220       230       240        250     
pF1KE0 ---------APS---------PTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTSTVLTRHSQP-ATPTPL
                :::         :.:::::..: .:....:: :..: ..... : . :.  
CCDS73 PSPAPNYNPAPSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQKFAPGKSTTSISKQTLPRGGPAYT
            470       480       490       500       510       520  

         260       270         280       290       300       310   
pF1KE0 QSRTSIVQAAAGGVPGGGS--NNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGK
        .  ..   : : :  .     ...::.: .:..:::: .:::.:...:::::.:. :  
CCDS73 PAGPQVPPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKT
            530       540       550       560       570       580  

           320       330       340       350       360       370   
pF1KE0 VLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTWHVHCFTCAACKTP
        : .  : ::.. ..:  ::.  .:: ::::. :: ::.::::..:::. ::.::::: :
CCDS73 SLADVCFVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVMHALRQTWHTTCFVCAACKKP
            590       600       610       620       630       640  

           380       390       400       410       420       430   
pF1KE0 IRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFSWHDTCFVCAICQI
       . :  :.::.: ::::.:: ..:.:::::::: ..:::.:.:::: .::::::.::.:..
CCDS73 FGNSLFHMEDGEPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKFIEALGHTWHDTCFICAVCHV
            650       660       670       680       690       700  

           440       450        
pF1KE0 NLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV 
       ::::. :::::::::::.:: .   
CCDS73 NLEGQPFYSKKDRPLCKKHAHTINL
            710       720       

>>CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10              (617 aa)
 initn: 1792 init1: 882 opt: 1028  Z-score: 595.0  bits: 119.8 E(32554): 8.1e-27
Smith-Waterman score: 1040; 38.2% identity (64.6% similar) in 432 aa overlap (51-455:190-614)

               30        40        50        60        70        80
pF1KE0 GKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGSLTHIEAQNKIRACGERLSLG
                                     :..:. .    . :..::: .  ... .  
CCDS41 MYSQDAIMDAIAGQAQAQGSDFSGSLPIKDLAVDSASPVYQAVIKSQNKPEDEADEWA--
     160       170       180       190       200       210         

               90       100       110           120       130      
pF1KE0 LSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARP----FGAPPPADSAPQ-QNGQP
         :.. .::.  .  :  .   ..   :.    . .::    ..    :.:::  ...  
CCDS41 -RRSSNLQSRSFRILAQMTGT-EFMQDPDEEALRRSRPQASSYSPAVAASSAPATHTSYS
        220       230        240       250       260       270     

         140       150          160       170       180       190  
pF1KE0 LRPLVPDASKQRLMENTEDWRP---RPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKS--
         : .: : : :.. .: . ::   .:  ... :    :. . : .  .:   .  .   
CCDS41 EGPAAP-APKPRVV-TTASIRPSVYQPVPASTYSPSPGANYSPTPYTPSPAPAYTPSPAP
         280         290       300       310       320       330   

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pF1KE0 ----SQVPR-TEAPAPASSTPQEPWPGPTAPS---------PTSRPPWAVDPAFAERYAP
           : ::  : .:::: .    :  .: :::         :.:::::..: .:....::
CCDS41 AYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNP-APSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQKFAP
           340       350       360        370       380       390  

        240        250       260       270         280       290   
pF1KE0 DKTSTVLTRHSQP-ATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGS--NNGKTPVCHQCHKVIRGRY
        :..: ..... : . :.   .  ..   : : :  .     ...::.: .:..:::: .
CCDS41 GKSTTSISKQTLPRGGPAYTPAGPQVPPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPF
            400       410       420       430       440       450  

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE0 LVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIM
       :::.:...:::::.:. :   : .  : ::.. ..:  ::.  .:: ::::. :: ::.:
CCDS41 LVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVM
            460       470       480       490       500       510  

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pF1KE0 HALKMTWHVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRF
       :::..:::. ::.::::: :. :  :.::.: ::::.:: ..:.:::::::: ..:::.:
CCDS41 HALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLFHMEDGEPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKF
            520       530       540       550       560       570  

           420       430       440       450        
pF1KE0 LEALGFSWHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV 
       .:::: .::::::.::.:..::::. :::::::::::.:: .   
CCDS41 IEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKKDRPLCKKHAHTINL
            580       590       600       610       

>>CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10              (732 aa)
 initn: 1764 init1: 882 opt: 1028  Z-score: 593.9  bits: 119.8 E(32554): 9.3e-27
Smith-Waterman score: 1040; 38.2% identity (64.6% similar) in 432 aa overlap (51-455:305-729)

               30        40        50        60        70        80
pF1KE0 GKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGSLTHIEAQNKIRACGERLSLG
                                     :..:. .    . :..::: .  ... .  
CCDS53 MYSQDAIMDAIAGQAQAQGSDFSGSLPIKDLAVDSASPVYQAVIKSQNKPEDEADEWA--
          280       290       300       310       320       330    

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pF1KE0 LSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARP----FGAPPPADSAPQ-QNGQP
         :.. .::.  .  :  .   ..   :.    . .::    ..    :.:::  ...  
CCDS53 -RRSSNLQSRSFRILAQMTGT-EFMQDPDEEALRRSRPQASSYSPAVAASSAPATHTSYS
             340       350        360       370       380       390

         140       150          160       170       180       190  
pF1KE0 LRPLVPDASKQRLMENTEDWRP---RPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKS--
         : .: : : :.. .: . ::   .:  ... :    :. . : .  .:   .  .   
CCDS53 EGPAAP-APKPRVV-TTASIRPSVYQPVPASTYSPSPGANYSPTPYTPSPAPAYTPSPAP
               400        410       420       430       440        

                   200       210                220       230      
pF1KE0 ----SQVPR-TEAPAPASSTPQEPWPGPTAPS---------PTSRPPWAVDPAFAERYAP
           : ::  : .:::: .    :  .: :::         :.:::::..: .:....::
CCDS53 AYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNP-APSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQKFAP
      450       460       470        480       490       500       

        240        250       260       270         280       290   
pF1KE0 DKTSTVLTRHSQP-ATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGS--NNGKTPVCHQCHKVIRGRY
        :..: ..... : . :.   .  ..   : : :  .     ...::.: .:..:::: .
CCDS53 GKSTTSISKQTLPRGGPAYTPAGPQVPPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPF
       510       520       530       540       550       560       

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE0 LVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIM
       :::.:...:::::.:. :   : .  : ::.. ..:  ::.  .:: ::::. :: ::.:
CCDS53 LVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVM
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pF1KE0 HALKMTWHVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRF
       :::..:::. ::.::::: :. :  :.::.: ::::.:: ..:.:::::::: ..:::.:
CCDS53 HALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLFHMEDGEPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKF
       630       640       650       660       670       680       

           420       430       440       450        
pF1KE0 LEALGFSWHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV 
       .:::: .::::::.::.:..::::. :::::::::::.:: .   
CCDS53 IEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKKDRPLCKKHAHTINL
       690       700       710       720       730  

>>CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4             (271 aa)
 initn: 1129 init1: 871 opt: 889  Z-score: 522.5  bits: 105.2 E(32554): 8.8e-23
Smith-Waterman score: 889; 46.5% identity (73.3% similar) in 258 aa overlap (199-455:26-268)

      170       180       190       200        210       220       
pF1KE0 ILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEP-WPGPTAPSPTSRPPWAVD
                                     :. .... . : :  :.   :..    . .
CCDS75      MPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPST-GRISNS
                    10        20        30        40         50    

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE0 PAFAERYAPDKTSTVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHK
        ...   :: ...     ..::.      .. ..:: :   .:.:     .::.: .:..
CCDS75 ATYSGSVAPANSAL---GQTQPS------DQDTLVQRAEH-IPAGK----RTPMCAHCNQ
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       290       300       310       320       330       340       
pF1KE0 VIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKK
       :::: .:::::...::::: :..: ...   :: :::::..:  ::.  .:: :..:..:
CCDS75 VIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRK
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pF1KE0 ITGEIMHALKMTWHVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKI
       : ::.. :::.:::: ::.:.::  :::: .:..:.: :::: ::  .::: ::::.: :
CCDS75 ILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPI
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       410       420       430       440       450        
pF1KE0 DAGDRFLEALGFSWHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV 
       .::: ::::::..::::::::..:  .:::.::.::::.::::.:: :   
CCDS75 EAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
              230       240       250       260       270 

>>CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4             (487 aa)
 initn: 1704 init1: 871 opt: 889  Z-score: 518.7  bits: 105.3 E(32554): 1.4e-22
Smith-Waterman score: 1466; 46.7% identity (68.5% similar) in 492 aa overlap (1-455:1-484)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
       :....: : ::::::::::::::::.::.:: :  :::::::.: .:: :::::: :: .
CCDS47 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
       .::.::::::..:   :.. :.::   .. :.   .:. . :  : . : . .. :.   
CCDS47 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRA---SAAPKPEPVPV-QKPTVTSVCSETSQELAEGQR
               70        80           90        100       110      

              130       140                   150       160        
pF1KE0 APPPADSAPQQNGQPLRPLV---------P---DASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFR
           .::  :::: : . .:         :   ::::.::.:.::::::: :: ::::::
CCDS47 RGSQGDSK-QQNGPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFR
        120        130       140       150       160       170     

      170       180       190         200       210       220      
pF1KE0 ILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKS--SQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAV
       :::..:::: ... . .. ::.  :: :  .  . ..:: . :    .  ::::  : ..
CCDS47 ILAQITGTEHLKESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMP---ESLDSPTSGRPGVT
         180       190       200       210          220       230  

        230       240         250       260       270              
pF1KE0 DPAFAERYAPDKTSTVLTRHS--QPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNG-------
       . . :  . :  .. :.   :  .:   .:  .: :   . .:.:  ..:  :       
CCDS47 SLTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQ
            240       250       260       270       280       290  

                     280       290       300       310       320   
pF1KE0 --------------KTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEE
                     .::.: .:..:::: .:::::...::::: :..: ...   :: ::
CCDS47 DTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEE
            300       310       320       330       340       350  

           330       340       350       360       370       380   
pF1KE0 KGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTWHVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEE
       :::..:  ::.  .:: :..:..:: ::.. :::.:::: ::.:.::  :::: .:..:.
CCDS47 KGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLED
            360       370       380       390       400       410  

           390       400       410       420       430       440   
pF1KE0 GVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFSWHDTCFVCAICQINLEGKTFYSK
       : :::: ::  .::: ::::.: :.::: ::::::..::::::::..:  .:::.::.::
CCDS47 GEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSK
            420       430       440       450       460       470  

           450        
pF1KE0 KDRPLCKSHAFSHV 
       ::.::::.:: :   
CCDS47 KDKPLCKKHAHSVNF
            480       

>>CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4              (596 aa)
 initn: 1736 init1: 871 opt: 889  Z-score: 517.3  bits: 105.4 E(32554): 1.7e-22
Smith-Waterman score: 1115; 38.6% identity (63.1% similar) in 472 aa overlap (9-455:127-593)

                                     10        20        30        
pF1KE0                       MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGK
                                     ..: :.:  ... :  ..:   : .::.  
CCDS36 KGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTSTNNMAYNKAPRPFG-SVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHA
        100       110       120       130        140       150     

       40        50        60        70        80        90        
pF1KE0 AAQAGVAVGDWVLSIDGENAGSLTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPA
       .... .. .  .       :.:  : .:. .       :: : . :  :  .:  .:. .
CCDS36 TTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLHANANLSADQSPSALSAGKT-AVNVPRQPTVTSVCS
         160       170       180       190        200       210    

      100       110       120       130       140       150        
pF1KE0 ADPPRYTFAPSVSLNKTARPFGAPPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPR
           . . .   . .  ..  ..::    . . .     :   ::::.::.:.:::::::
CCDS36 ETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPR
          220       230       240       250       260       270    

      160       170       180       190         200       210      
pF1KE0 PGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKS--SQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAP
        :: :::::::::..:::: ... . .. ::.  :: :  .  . ..:: . :    .  
CCDS36 TGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMP---ESLD
          280       290       300       310       320          330 

        220       230       240         250       260       270    
pF1KE0 SPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTSTVLTRHS--QPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGS
       ::::  : ... . :  . :  .. :.   :  .:   .:  .: :   . .:.:  ..:
CCDS36 SPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANS
             340       350       360       370       380       390 

                               280       290       300       310   
pF1KE0 NNG---------------------KTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGK
         :                     .::.: .:..:::: .:::::...::::: :..: .
CCDS36 ALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKN
             400       410       420       430       440       450 

           320       330       340       350       360       370   
pF1KE0 VLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTWHVHCFTCAACKTP
       ..   :: :::::..:  ::.  .:: :..:..:: ::.. :::.:::: ::.:.::  :
CCDS36 TMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKP
             460       470       480       490       500       510 

           380       390       400       410       420       430   
pF1KE0 IRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFSWHDTCFVCAICQI
       ::: .:..:.: :::: ::  .::: ::::.: :.::: ::::::..::::::::..:  
CCDS36 IRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCE
             520       530       540       550       560       570 

           440       450        
pF1KE0 NLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV 
       .:::.::.::::.::::.:: :   
CCDS36 SLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
             580       590      

>>CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4             (625 aa)
 initn: 1694 init1: 871 opt: 889  Z-score: 517.0  bits: 105.4 E(32554): 1.8e-22
Smith-Waterman score: 906; 44.7% identity (67.5% similar) in 295 aa overlap (186-455:331-622)

         160       170       180       190         200       210   
pF1KE0 RPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSS--QVPRTEAPAPASSTPQEPWPGP
                                     :.::.:  : :  .  . ..:: . :    
CCDS58 SLLDALCISPVSKPLAFSYLQSSRKSTGSIHVKKTSNSQEPSPQLASSVASTRSMP---E
              310       320       330       340       350          

           220       230       240         250       260       270 
pF1KE0 TAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTSTVLTRHS--QPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPG
       .  ::::  : ... . :  . :  .. :.   :  .:   .:  .: :   . .:.:  
CCDS58 SLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAP
       360       370       380       390       400       410       

                                  280       290       300       310
pF1KE0 GGSNNG---------------------KTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQ
       ..:  :                     .::.: .:..:::: .:::::...::::: :..
CCDS58 ANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAH
       420       430       440       450       460       470       

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pF1KE0 CGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTWHVHCFTCAAC
       : ...   :: :::::..:  ::.  .:: :..:..:: ::.. :::.:::: ::.:.::
CCDS58 CKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVAC
       480       490       500       510       520       530       

              380       390       400       410       420       430
pF1KE0 KTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFSWHDTCFVCAI
         :::: .:..:.: :::: ::  .::: ::::.: :.::: ::::::..::::::::..
CCDS58 GKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSV
       540       550       560       570       580       590       

              440       450        
pF1KE0 CQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV 
       :  .:::.::.::::.::::.:: :   
CCDS58 CCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
       600       610       620     

>--
 initn: 679 init1: 371 opt: 581  Z-score: 344.6  bits: 73.5 E(32554): 7.2e-13
Smith-Waterman score: 587; 47.2% identity (68.0% similar) in 231 aa overlap (1-207:1-224)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
       :....: : ::::::::::::::::.::.:: :  :::::::.: .:: :::::: :: .
CCDS58 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
       .::.::::::..:   :.. :.::.   . :.   .:. . :  : . : . .. :.   
CCDS58 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRAS---AAPKPEPVPV-QKPTVTSVCSETSQELAEGQR
               70        80           90        100       110      

              130                      140          150       160  
pF1KE0 APPPADSAPQQNGQ--PLRP-------------LVP---DASKQRLMENTEDWRPRPGTG
           .::  ::::.  : ::              ::   ::::.::.:.::::::: :: 
CCDS58 RGSQGDSK-QQNGKIPPKRPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTT
        120        130       140       150       160       170     

            170       180       190             200       210      
pF1KE0 QSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSS------QVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAP
       :::::::::..:::: ... . .. ::..      ..:.. .: : . :::         
CCDS58 QSRSFRILAQITGTEHLKESEADNTKKAKFDSALEDLPKS-GPHPPA-TPQVLTIGSQVA
         180       190       200       210        220        230   

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE0 SPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTSTVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNN
                                                                   
CCDS58 TLSKVATTYSSLSSSTGNVEDSFEGFRNFSTFSSPARYSAAVLSSAAATVSAVIATKTRL
           240       250       260       270       280       290   




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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