Result of FASTA (ccds) for pF1KE1035
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1035, 428 aa
  1>>>pF1KE1035 428 - 428 aa - 428 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7739+/-0.000986; mu= 15.0393+/- 0.059
 mean_var=70.3444+/-14.296, 0's: 0 Z-trim(103.7): 72  B-trim: 5 in 2/49
 Lambda= 0.152918
 statistics sampled from 7446 (7518) to 7446 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.231), width:  16
 Scan time:  2.760

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6          ( 428) 2817 630.9 7.3e-181
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19       ( 427) 2594 581.7 4.7e-166
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3          ( 407)  888 205.3   9e-53
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17        ( 411)  884 204.4 1.7e-52
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 406)  874 202.2 7.6e-52
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11          ( 483)  838 194.3 2.2e-49
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1           ( 824)  782 182.0 1.8e-45
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 455)  732 170.9 2.3e-42
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 479)  724 169.1 8.1e-42
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 478)  716 167.4 2.7e-41
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20        ( 796)  688 161.3 3.1e-39
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 370)  676 158.5 9.9e-39
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19        ( 483)  673 157.9   2e-38
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 347)  660 155.0 1.1e-37
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 448)  644 151.5 1.6e-36
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 453)  644 151.5 1.6e-36
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 483)  644 151.5 1.7e-36
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1031)  646 152.1 2.4e-36
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1032)  646 152.1 2.4e-36
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1         ( 619)  640 150.6 3.9e-36
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 447)  634 149.3 7.2e-36
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 369)  600 141.7 1.1e-33
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6          ( 648)  588 139.2 1.1e-32
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17        ( 938)  578 137.0 7.3e-32
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 881)  570 135.3 2.3e-31
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 882)  570 135.3 2.3e-31
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 729)  566 134.4 3.7e-31
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 731)  566 134.4 3.7e-31
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX        ( 631)  565 134.1 3.7e-31
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  546 129.9 6.7e-30
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  546 129.9 6.7e-30
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5          ( 622)  532 126.8 5.8e-29
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2           ( 670)  526 125.5 1.5e-28
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11          ( 875)  526 125.6 1.9e-28
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 646)  522 124.6 2.7e-28
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 662)  522 124.6 2.8e-28
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17        ( 599)  519 123.9 4.1e-28
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY          ( 660)  518 123.7 5.2e-28
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 575)  478 114.9 2.1e-25
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 690)  478 114.9 2.4e-25
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 704)  478 114.9 2.5e-25
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5           ( 724)  478 114.9 2.5e-25
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 715)  443 107.2 5.3e-23
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 783)  443 107.2 5.7e-23
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10         ( 737)  415 101.0 3.9e-21
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7         ( 507)  409 99.7 7.1e-21
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12          ( 820)  405 98.9   2e-20
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12         ( 600)  346 85.8 1.3e-16
CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7          ( 547)  335 83.3 6.2e-16
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9          ( 585)  298 75.2 1.9e-13


>>CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6               (428 aa)
 initn: 2817 init1: 2817 opt: 2817  Z-score: 3360.5  bits: 630.9 E(32554): 7.3e-181
Smith-Waterman score: 2817; 100.0% identity (100.0% similar) in 428 aa overlap (1-428:1-428)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 HTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 IALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDI
              370       380       390       400       410       420

               
pF1KE1 SSYIEQTR
       ::::::::
CCDS46 SSYIEQTR
               

>>CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19            (427 aa)
 initn: 2585 init1: 2519 opt: 2594  Z-score: 3094.6  bits: 581.7 E(32554): 4.7e-166
Smith-Waterman score: 2594; 90.0% identity (97.7% similar) in 428 aa overlap (1-428:1-427)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
       :::.::.:.:::: :.: :  :  ... :: :::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAEQDVENDLLDY-DEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
               10         20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:::::
CCDS12 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMC
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 HTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALA
       :::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::.
CCDS12 HTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALV
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCR
       ::.:..::..:::.::::::::::::::::::::::.:::::: :::::::::.::::::
CCDS12 RNRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCR
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRC
       ::::::::.::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS12 KFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRC
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 IALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAF
       .:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS12 MALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVF
     300       310       320       330       340       350         

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::
CCDS12 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDI
     360       370       380       390       400       410         

               
pF1KE1 SSYIEQTR
       :.::::.:
CCDS12 STYIEQSR
     420       

>>CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3               (407 aa)
 initn: 798 init1: 411 opt: 888  Z-score: 1060.9  bits: 205.3 E(32554): 9e-53
Smith-Waterman score: 888; 38.9% identity (73.0% similar) in 370 aa overlap (47-415:35-400)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KE1 EVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
                                     : :. ::  :::.:   :::.:: .:.. :
CCDS32 SADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
           10        20        30        40        50        60    

         80        90       100       110       120       130      
pF1KE1 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERF
          : :.::. ::.:: ::::.:... :::::    ....::.  ::::: ::.:    .
CCDS32 IPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILAL
           70        80        90       100       110       120    

        140       150       160       170       180       190      
pF1KE1 SKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILD
       . :: ..   . .:: ..... . :. . ::::::::::.. .   . :. : :: :.::
CCDS32 GDYM-GATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLD
           130       140       150       160       170       180   

        200       210       220       230       240       250      
pF1KE1 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETK
       : :.:: .  .. .. :::.      ::...:::.  ..  : .:::.::..:.:  : .
CCDS32 EADEMLSR-GFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE-E
           190        200       210       220       230       240  

        260       270        280       290       300       310     
pF1KE1 LTLHGLQQYYVKLKDNE-KNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAI
       :::.:..:.:.... .: :   : :: ..: ..:.:::... ..   :.. .  ..: . 
CCDS32 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS
             250       260       270       280       290       300 

         320       330       340       350       360       370     
pF1KE1 AIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRV
       :.:  : :.::   ...:.. . :.:..:.:..::.:...:....:::.: . ..:.::.
CCDS32 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI
             310       320       330       340       350       360 

         380       390       400       410       420        
pF1KE1 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR
       .:.:::: ::.::.::..: : .:: :..  ..... :.:             
CCDS32 GRGGRFGRKGVAINFVTEE-DKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI      
             370       380        390       400             

>>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17             (411 aa)
 initn: 766 init1: 408 opt: 884  Z-score: 1056.1  bits: 204.4 E(32554): 1.7e-52
Smith-Waterman score: 884; 38.1% identity (73.0% similar) in 370 aa overlap (47-415:40-404)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KE1 EVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
                                     :  . :. .:::.:   :::.:: .:.. :
CCDS11 SGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
      10        20        30        40        50        60         

         80        90       100       110       120       130      
pF1KE1 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERF
        : : : ::. :..:: ::::.: ...:: :.  . ....:..  ::::: ::.:    .
CCDS11 KQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLAL
      70        80        90       100       110       120         

        140       150       160       170       180       190      
pF1KE1 SKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILD
       . :: ::.  . .:: .. .: . :  .  :.:.:::::.. . : .::  . :: ..::
CCDS11 GDYM-NVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYG-QHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLD
     130        140       150        160       170       180       

        200       210       220       230       240       250      
pF1KE1 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETK
       : :.::..  ..... ...:. :   ::...:::: .::  .  ::: ::..:.:  . .
CCDS11 EADEMLNK-GFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRD-E
       190        200       210       220       230       240      

        260       270        280       290       300       310     
pF1KE1 LTLHGLQQYYVKLKDNE-KNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAI
       :::.:..:..: .. .: :   : :: :.: ..:.::: .. ..   :.. . : :: . 
CCDS11 LTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVS
         250       260       270       280       290       300     

         320       330       340       350       360       370     
pF1KE1 AIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRV
       ..:  :::.:: : ...:..   :.:..:....::.:. .:.. .:::.:.. . :.::.
CCDS11 SMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRI
         310       320       330       340       350       360     

         380       390       400       410       420        
pF1KE1 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR
       .:.::.: ::.::.::... : .:: :... . ..:.:.:             
CCDS11 GRSGRYGRKGVAINFVKND-DIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI      
         370       380        390       400       410       

>>CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17             (406 aa)
 initn: 780 init1: 405 opt: 874  Z-score: 1044.2  bits: 202.2 E(32554): 7.6e-52
Smith-Waterman score: 874; 37.1% identity (72.3% similar) in 394 aa overlap (23-415:13-399)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
                             : :: : : .  .....  : .: : :. :.  :::.:
CCDS11           MSASQDSRSRDNGPDGME-P-EGVIESNWNEIVDS-FDDMNLSESLLRGI
                         10          20        30         40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC
          :::.:: .:.. :   : :.::. ::.:: ::::.:... :::.:     ...::. 
CCDS11 YAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLA
        50        60        70        80        90       100       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 HTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALA
        ::::: ::.:    .. :: ...  . .:: ... . . :. . :::.::::::.. . 
CCDS11 PTRELAQQIQKVVMALGDYM-GASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDML
       110       120        130       140       150       160      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCR
         . :. :.:: :.::: :.:: .  .. .. .::.    . ::...:::. ...  : .
CCDS11 NRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSR-GFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTK
        170       180       190        200       210       220     

              250       260       270        280       290         
pF1KE1 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNE-KNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQR
       :::.::..:.:  : .:::.:..:.:.... .: :   : :: ..: ..:.:::... ..
CCDS11 KFMRDPIRILVKKE-ELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRK
         230        240       250       260       270       280    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE1 CIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIA
          :.. .  ..: . :.:  : :.::   ...:.. . :.:..:.:..::.:...:...
CCDS11 VDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLV
          290       300       310       320       330       340    

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE1 FNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEID
       .:::.: . ..:.::..:.:::: ::.::..:..: : . : :..  ....: :.:    
CCDS11 INYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEE-DKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVA
          350       360       370        380       390       400   

     420        
pF1KE1 ISSYIEQTR
                
CCDS11 DLI      
                

>>CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11               (483 aa)
 initn: 723 init1: 349 opt: 838  Z-score: 1000.1  bits: 194.3 E(32554): 2.2e-49
Smith-Waterman score: 838; 34.7% identity (67.8% similar) in 429 aa overlap (4-426:49-472)

                                          10        20        30   
pF1KE1                            MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAK-
                                     : ..:   .  .. . :   ::  .   : 
CCDS44 GQLRGPVKPTGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTTIKPGDDWKKTLKL
       20        30        40        50        60        70        

                 40         50        60        70        80       
pF1KE1 --KD--VKGSYV-SIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLC
         ::  .: : : : ... :.:. :: ::: .: . :.:.:: .:.: :: :. : :.: 
CCDS44 PPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILA
       80        90       100       110       120       130        

        90       100       110       120       130       140       
pF1KE1 QAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAV
       .::.: ::......  :..:.    .....:.  :::::.:.:.   . ::.: ..:: .
CCDS44 RAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMA
      140       150       160       170       180       190        

       150       160       170       180       190       200       
pF1KE1 FFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDM
         :: ... :   :  .  :.:..:::::: : ..   .. :.. ..::: ::.: : :.
CCDS44 TTGGTNLRDDIMRLD-DTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQ-DF
      200       210        220       230       240       250       

       210       220       230       240       250       260       
pF1KE1 RRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYV
        . ...:.   :...:....:::.   ..    . .: :.:: . .:  :::.:. :::.
CCDS44 VQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEE--LTLKGVTQYYA
        260       270       280       290       300         310    

       270       280       290       300       310       320       
pF1KE1 KLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERL
        . . .: . :  :.. :..:: .:: .: ::   ::. . . ..  . ::  : ::.: 
CCDS44 YVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRN
          320       330       340       350       360       370    

       330       340       350       360       370       380       
pF1KE1 SRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLA
         ...:..   : :: :.:: ::.::. ::...:.:.:. ..:::::..:.::::  :::
CCDS44 RVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLA
          380       390       400       410       420       430    

       390       400       410       420                 
pF1KE1 ITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR         
       :....  .:   :....... ..:. .:..:: : :. .           
CCDS44 INLIT-YDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP
           440       450       460       470       480   

>>CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1                (824 aa)
 initn: 793 init1: 366 opt: 782  Z-score: 929.7  bits: 182.0 E(32554): 1.8e-45
Smith-Waterman score: 782; 35.2% identity (67.1% similar) in 398 aa overlap (37-426:54-447)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE1 DNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFE
                                     :. .  . . :...::.  .:...   :::
CCDS84 AVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFE
            30        40        50        60        70        80   

         70        80        90       100       110       120      
pF1KE1 HPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELA
       .:: :: . :: .  :.:.. ::::: ::: ::   .:..:   . ....:..  :::.:
CCDS84 RPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIA
            90       100       110       120       130       140   

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE1 FQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLN
        :: .    ..  : ...  ::.::  ...:.  ::: : ::.::.::::  : .   ::
CCDS84 VQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK-C-HIAVGSPGRIKQLIELDYLN
           150       160       170       180         190       200 

        190       200       210       220       230       240      
pF1KE1 LKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDP
          :. ::::: ::.::. ....... :.   :  ::..  :::  . .  .  :.:.::
CCDS84 PGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDP
             210       220       230       240       250       260 

        250       260       270               280       290        
pF1KE1 MEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD--------NEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQ
         . ... .  .: ::.:::  ...        .::...: .:.. . :::...: .  .
CCDS84 TFVRLNS-SDPSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHS
              270       280       290       300       310       320

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pF1KE1 RCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNI
       :   ::..:  ..:::  :  .: :..::. . ..: :. :.:..:.: .::.: :.::.
CCDS84 RAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNL
              330       340       350       360       370       380

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pF1KE1 AFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEI
       . : :.: : .::.::..::::::: ::..:.    .. ...  . .. ..:.  ::: :
CCDS84 VVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPI
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      420                                                          
pF1KE1 DISSYIEQTR                                                  
         :. .:.                                                    
CCDS84 P-SGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNN
               450       460       470       480       490         

>>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12              (455 aa)
 initn: 714 init1: 304 opt: 732  Z-score: 874.1  bits: 170.9 E(32554): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 732; 33.6% identity (70.7% similar) in 375 aa overlap (47-419:26-394)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KE1 EVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
                                     :.:. .   : .:  . :. .:...: : :
CCDS86      MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAI
                    10        20        30        40        50     

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pF1KE1 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERF
       : :. : :..  :..: :::..:.:  :. :  .  .. .::.  :::::::::...: .
CCDS86 PLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEAL
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pF1KE1 SKYMPNVKVAVFFGGL-SIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILA-LARNKSLNLKHIKHFI
       .. . .:. ::. ::. :....  . ::  :::...::::..  :  .:..::. .:...
CCDS86 GSSI-GVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKK--PHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLV
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pF1KE1 LDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDE
       .:: :..:. .:.. .:..:... :.......::::..:... . :  ...:..  :...
CCDS86 MDEADRILN-MDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSK
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pF1KE1 TKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPA
        . :.. :::::. . .. :.  :  .:. :  :. .:: .. .     : :: . .: :
CCDS86 YQ-TVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTA
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pF1KE1 IAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHR
       : .:  : : .::.  ..::   : ::.::.. .::.:: .:... :.:.:  :  :.::
CCDS86 IPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHR
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pF1KE1 VARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR      
       :.:..: : .: :::::. . :..... ..  .  ..  .: . :               
CCDS86 VGRTARAGRSGKAITFVT-QYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRF
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CCDS86 ARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
     410       420       430       440       450     

>>CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16            (479 aa)
 initn: 696 init1: 285 opt: 724  Z-score: 864.2  bits: 169.1 E(32554): 8.1e-42
Smith-Waterman score: 724; 32.8% identity (67.9% similar) in 399 aa overlap (32-419:81-472)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KE1 AENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV
                                     ..: ..   :..:  :... :::.::... 
CCDS10 EEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKS--FEELRLKPQLLQGVY
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pF1KE1 DCGFEHPSEVQHECIPQAIL--GMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVM
         ::..::..:.. .:  .    .... :..:: ::::.:::: :.:.::..   . : .
CCDS10 AMGFNRPSKIQENALPLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCLCL
      110       120       130       140       150       160        

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pF1KE1 CHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILAL
         : :::.: .:  :...:..:..:.:    : .... ... ..    ::.:::: .:  
CCDS10 SPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQ----IVIGTPGTVLDW
      170       180       190       200       210           220    

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pF1KE1 -ARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPV
        .. : .. :.:: :.::: : :.     . .  .: :: :.. :...::::.   .   
CCDS10 CSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKF
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pF1KE1 CRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD-NEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSV
        .: . ::  : .  : . ::  ..::::  .. .:: . : .:  .. . :..:: .. 
CCDS10 AQKVVPDPNVIKLKREEE-TLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTR
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       300       310       320       330       340       350       
pF1KE1 QRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVN
       .    ::  : ...  .  .   :  :.: .  ..:.. ....::.::. .::.:.:.:.
CCDS10 KTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVS
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pF1KE1 IAFNYDMPEDSD------TYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNI
       ...:.:.: :.:      :::::..:.:::: .:::...:..... .::: .:..:. .:
CCDS10 VVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKI
           410       420       430       440       450       460   

              420        
pF1KE1 SELP-DEIDISSYIEQTR
        .:  :..:         
CCDS10 ERLDTDDLDEIEKIAN  
           470           

>>CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16            (478 aa)
 initn: 687 init1: 285 opt: 716  Z-score: 854.7  bits: 167.4 E(32554): 2.7e-41
Smith-Waterman score: 716; 32.6% identity (67.7% similar) in 399 aa overlap (32-419:80-471)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KE1 AENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV
                                     ..: ..   :..:  :... :::.::... 
CCDS10 EEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKS--FEELRLKPQLLQGVY
      50        60        70        80        90         100       

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pF1KE1 DCGFEHPSEVQHECIPQAIL--GMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVM
         ::..::..:.. .:. .    .... :..:: ::::.:::: :...::     . : .
CCDS10 AMGFNRPSKIQENALPMMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVEPSDRYPQCLCL
       110       120       130       140       150       160       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE1 CHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILAL
         : :::.: .:  :...:..:..:.:    : .... ... ..    ::.:::: .:  
CCDS10 SPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQ----IVIGTPGTVLDW
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pF1KE1 -ARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPV
        .. : .. :.:: :.::: : :.     . .  .: :: :.. :...::::.   .   
CCDS10 CSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKF
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pF1KE1 CRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD-NEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSV
        .: . ::  : .  : . ::  ..::::  .. .:: . : .:  .. . :..:: .. 
CCDS10 AQKVVPDPNVIKLKREEE-TLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTR
           290       300        310       320       330       340  

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pF1KE1 QRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVN
       .    ::  : ...  .  .   :  :.: .  ..:.. ....::.::. .::.:.:.:.
CCDS10 KTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVS
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pF1KE1 IAFNYDMPEDSD------TYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNI
       ...:.:.: :.:      :::::..:.:::: .:::...:..... .::: .:..:. .:
CCDS10 VVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKI
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              420        
pF1KE1 SELP-DEIDISSYIEQTR
        .:  :..:         
CCDS10 ERLDTDDLDEIEKIAN  
            470          




428 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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